Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA030024

[Submit comment/correction]

Sequence	AA030024
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA030024
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	GCGTCGCCTGCCTCGTCCCCGCCGCGGCTCCTGTCCTCCCCCCGTCCCGT CGGTCGCTTCCTCCACCCCCAGCCTCGCAGGCCAATACTCTCCCGTCCCC CATCTTTGAACCTTCCTCCTCCTCCTCCGCGCTGACCTACCCGGCAACGA ACCAACCCGGCCCCTCCTACATAGCCAGCCACAATCCATTCCGACCTCCC GTCAGCCCGCAGCAGCGCACAGCCTACAGCCCCCGCCACGCCGAGCCGGA CCTTCGGACGGACGGAACTACCGCGAGCGCGCGCGGGACGAGGAACGGGA GGGCAGGGATTTGGGGGCGGATCGATGGCCAAGCTGTACGTGCAGGCGGT GCCCCCGCCGGATCTGAACAAGAACACGGAGTGGTTCATGTACCCCGGGG TGTGGACCACCTACATCATCATCCTGTTCGTCTCCTGGCTCCTCGTCCTC TCCATCTTCGGATGCACCCCAGGCATGGCCTGGACAATCGTCAACCTCGG CCACTTCGCGGTACCGCAACTTCTCTACTTCCCTTACATCTTTGATTATA TCTTCAATTAGGGGGATTGCGGTTGGGACTGGGATTGGGATTGGCTCCTT GCTTGGATCTGAAGGCTGGCGGCTCGACTCAGATTACCTCGATTTTCCTG TTCACGACACGAGGCCTTGAATTAGAATAGATTGCCTGCATCCGCCCACA TATCGCCTCCCCTAGCTACAAATTTCTGTGTAGCAGCGCCAATTCGGCCA GCTAAAAGCTGGTGCCAGTGTTGGCTTTGGCTTTCCCATCCTACTTGGAC ACATTCCTTCTACTCAATGGCTGAGCTGGTCATTCGGGTACCGTCTAGTA GCACCATCAATAGCTTGAGCTGAATGGAACTAAATACCTCGACGGTACCC TGTATTCGACCCAGACATCCTAATGTCCAATCATAGTCTCTAAACATTAA GGTTTCAGCTTAACGTCATTTTGTTGTCATGTATTGCATGTAATGGCCTT ATGGGTAAGCAGGCATGGTCTAGTAGCACTATCAGTAGCTTGAGGCGAAT CGAAATCCAAACCTCAAGGGTACCCTGCATTTCAACCCATGCATCACAAC GTCCTAGAATTTGTAATCTCTAAACATTAAGGTTTCAGCTTACTCCCTCC GTACCGGTTTATTAGGCTATTACGCATTTTGAGGTTAAACTTTGACTAGT AATTTAAAGAGGTTTCCAATAATATACTTTTTGTGACGCATAACTAACAT TTTGTTGGCTAAATTACTGGTCAAAGTTTTATCTTGCAATGAGTATAATA GCCTAATAAACCGGCATGGAGGCAGTAACATCATTTTGCTGTCACATATG GCAGCTAATGGGCTTATGGGTGTGCGGACATGATTAATTATTGTCAGTGA GGATCCCTGCATGCCATTTCTATCCACAAAGTGTTGAAGTAGTAAGATAC AGGTATAATGCCCTTGCTGGTTGAATTGTAGATGAATACTATGTTGGAAG TATTCTAAACTCACAAAAAATAAAAGATGTGTTTGGGTTAGTTTCCTAGT GTCTACGTGCTCCAGTCAGATTAGGAGTTGAATTAGTACTTAGGTAGTCT GCACGTCCGGCTTGTAATCAGCAAGATGTGTAGTTAGCCTGCATGCCATA CGTGGTGTTACCTAGTTTGAGTCAGCTTAGGAATCGTAGTGTCTGATTTG GAGTCTGAGTAGTATTAGTCTACTCCAATACAGGTCCTATTAATTTTGAT TTGCCTTGGTCGTGTGGGTATATAAACACACCAGGAGCATCGTTTTGTAA CATGAGTTGGAAGTTGTACCATGGGATTTGAGAAGAGAAATAAAGAGAAA AATAGAGGGCACGATACGTGCCCCCCTGACCACAATTTTTGCGTGCGTGC CTTTGTTGAGTTTTGATGTGATCGATCTGTGGGAAAAACCCAACATACCA GAGTACCAGATTACATTGAAACTTTGAAAGAACATGGTGTTCCAGGTCTG AGTACCGCATATGGGTTGTGCATGACAAACTGTGTACATATATTAATAAA GGATTAAAGTGTGTATTATTAGGGCTTGTTTGAAACGTAGGATAGGAAAA ACACGGGAATAGGAGAAACACAGGAATAGGAAAGGAATGCAAGTGCAAAC CATAGGAATGCAAAACACAGGAAAGGATCAGACGAGCTTGTTTGAAACGC AGGAAAAATACCAGAGGAATCAAGATTAAAACCATTTGCCCTTTGAATGA TATACTTGATAAAAAACACACAAATGTTTGTTTAGCTACCTAGCTTACAG ACTAGAATAAGTACTGCCCTTTGGTTGGTCCTATGCACGTGGTCGTTCTT CTCTTTGGCACCATATGTATTCTTCTCTCGGCTATCTGCATGATCCAAAG CCGAGGAATGCAACCCAAAATTGCATTTCGATTTTCCTCTCATCTCTCTC CTGCATCTTGCCTACGGTCCAATGCTTCAAGAAGTTTTCTTCAACTGTGG TCTGGGGGCTAAGGAGAAGTCTGAGCTATTTGTTGGCGGTACCCCTTGCA GCATTTCCAGTGGCTGCAGAATCTCATGGTGTAGGTTGTAGAGTTAATGG AAGTATTACGAGCAGCCATGTGTTTGATTTGCCTCCAACCATCGCACAGG AATGAAAAAATGAGGTCAGAGCCAATGTTTCCTTTCCTGTGATTTTCCCA CGACAACGGCTTCAAAGGAAAGTTTCCTCCACTTTTCCTACGCTCGATTC CTGCATTCCAAACGATGCTACGGTGCCAATTCCTACAGGAACCGAAATCC TGTACTTTTCCTGTAAAAATCCTTTGAACCAAACGGGCCCTTATTTCTTT CTGCTGACACACATTCCCAAAGACTTCTTATTCAGAATTCACATAGTTAT CCAGTCCCCCTCCATATGCCTTTGATTTGATGTGGTTCTTGCTATCCAAT ATTCATGTGTTCATAGGTAGTACCAAAAGTGAGACTAATTTAGAAGAAGT AGACTATTTGTCACATTTCCAAGCTTAGTGTATTCTGTTTAATGTACCCT AAGTCTGTGTGCCCGAAGCATTTCCCTCTTCGTTGTGGAGCAGGAGCATT TTCAAAACTCAAACAGAGCTGGCACATTGTGTTAGAGAATAAATTCAACC AAGGGTGCATTGGCGCAGAGATTAACCATCCCGTGAAGTGCAATCTGGTT CAACTGGTTCTGTTACATTTTGGGCCAAATAAACAACTTGCACTTAGTCA TTTTTTTGCTACGCTATTAACATAATAACATAATAGCTAATGAGTCAGTA AAAATGTCTAGTTTATAAAGGGAGTGCGAAATTGTAGCTCATTAATTTTC CCTAACCCTCAATTCTGGAAATAAAAAGATATTACTCCCTCTGATCCAAA TTAATTGTCGCAGATTTAGGAAAAATGTTGGCTAAATCTGTCTAGGTTAT CGAACCTGTGGCAATTAATTTGGATCAGAGGTAGTACTAATTTTCTCATA AGCTTAAGTGTCATATGCTTTAGCTAGAAATTCTTTTTCTATCATAACTT TGTGCCTAATTGTATCTTCTTTCCAGATGACATACCACTTCTTCCACTGG AAGAAGGGAACACCATTTGCTGATGACCAAGGGATGTATAACAGATTGAC TTGGTGGGAGCAAATGGACAATGGCAAGCAGCTTACTCGCAACAGAAAAT TTCTTGTTGTGGTTCCTGTTGTCCTGTAAGTGTTATTTCGTTGCTAATAC TGTTTACAGGGCTTCATTAGGCAACTAAAAGAGCAAATACTACATCGCTT CATTAATTATGCTGGTTGCTTATTTGACATCTAAATCTAACTACCATATT CGCACTACTATACATTTGTAAGGATTCAGCATTGTTCTTTTTCTCTTAAG TATGATGATTACTTGTTACTGCAGCATTTAATCAAGTAGCTATAATTCAT CAGCATAAGTTCTTAAATATTTGGATACGTTTATGTAGGCCACCCCGTGC ATTTCAGTGTTTCAATGTCCATGTATCGTGATTTCTTTGTGGCCTCATAT TCACACATAAATGATTTGCTGAAAATTTTGTACTATTGACCTCATTGTGA TGGATTATCCTCATCTGGTGAGTGGTGGCTAAACTTTCTGACAAACTGGT TAAGTCCTTGGTTGTGACTTCTCATTTTTACAGTTGTGCTCGGTGTTTAT AGCAAACTTAATCAGATGTGATTACAACTGATTTGCTGATACAGTGTTGC AAATTATTCGAATGGTTCACCTGCCATGTGAGAACATAGTTATACACCCA TGGTCACACTCCCTTTGATTAAGCTGCCTTGTTTAGACTCTTCTTTATGA GTGGATTATCTGTCACAATATTGTTTTTTCCATATGAAGTATGGTGGAAA ATCAATACCTTGCACGCAGAGACCATTTTTGGTGAAGACAGAAACTCACA TTCTTGCCATATACAAGGAAATCTGTTTCTAGTTTAGTTCATAGAGAGAA TATCCAGTAATACCAAGCCTCACGTGGTACCACGATCCCACTCTTCACAA TTCAAATTTGCAAATTTTAGAAAATCCAAAATAAATTTGTGGATGTTCAC AAGATGCGTATTTTACAATTCCCATAATTTGCAGAATCAAATTTAAAATA CCGGCAAAGAAACAAAAAAGACAAATCCAACATAAATAGTGTACAAAAAG ACAAAAACACAAAATGATACTATTCACATAGCAATTTATCTTTTGCGCTT CTCTGTGCATACCTCGAGTTTGGTTCTGAAAATTTTAGGAATGTAAACAA ACACCCACAATTTTATTTCAAATTCTTTTTACACTTGTAAATTTGAATTT TTCCATGTGGTATCATCATGGCATCATGTGAGGGGTGGTACCACTGGATA TTTCCCCTTAGTTCATATGCATTGCAATGGGGGGGGGGGGGGGGGGGCGT GCACTGTAAATATTAATTGCCATCAAAGGAGACACCTCGTGAGACACCAA ATAAGTTTTGGTCGTGACTAGCGTCATTTCTGCTTGTCACATGGTATTAG TGCAGGATGGATGATCGTTCCAAGTGGGCCCTGTATTTTCTGTTGCCAAT TTTACCTAGCTGAACTTCTCCATAAATATTAATGTTCTATTTCTGTTTAT TCAACATGCTTTTCTTGTGTTTAGAACCGGCTTGCTAGGTTGCACCTGTT CTTCAGAAGAAACATTTATGCTTTCGACGTGCAATTATTATTATTATTTT ACTATGATACTACTGTGAAATTAAAAATAACCGTCCTTTATAACCACGAT AACTACAAGGGAAAGTTATCCTAAATATATTTTTTGCTAGGCTGATAGTT TGTCGTCAAACTATTATGTTTTGAGAACACTTCCCTGTTGTTTGGCATAT TACTTTAGGACTGAGTGTTTTCTTTAAAAAATAGTTTGCTATCCAGTAAT ATTATAAACAATGAAGTTATGTGGTTTAACTATGTTAGTTTCCTTGGCTG AAATATGTGAATCTAATCATCCAATTAAATATGGAACTCTTTAGCATTGT ATGAAGCATGAACATAATCATCATTTTCTCATATATACATAACCTCTTCA TGGGTTTTGTCCACTATATGTCTGAGCGGTCATCATTATTTACGGGGGAT GTCTATGTTCTTTTGCAGGTACTTGATAGCTTCACACACCACAGACTATC AACATCCTATGCTCTTTTTCAACACCATCGCTGTCACTATACTGGTTGTC GCCAAACTACCGAACATGCACAAGGTCCGGATTTTCGGAATCAATGCCGG TAACTAAGCGGCGGCAGCGTGTCTCAGGGAAGACAGCACTCTCAGTATCA TGTTCCATTCGAATGGCTGGATGTGTTGCACCTAAGTTCTGAATTTGCTC ATGGGAGTACCAGCATATGTAGTGTTTGAGCTGT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.