Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA027501

[Submit comment/correction]

Sequence	AA027501
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA027501
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CCAGAGTCCAGACCCACTCAGAGCCGAACCCCCCTGCGTCCTCGTCTCTC CGTCCGTCCCCATGGCGCCCAAGGTTTTAATGGTAAGAACCCAACGCCGC CGCCGCCGTCGCTCAGCTTACCGCGGCGCGGCGCCGTCGTTTATGGCGGC CGCGGTAGCCCCACTCTCCAAACCATCTCACGCTCGAATCGCCGTCGCTG CAGGTAGCGGAGAAGCCCAGCATCGCGCTCTCCATCGCCTCTGCCCTCTC CGGCGGCCGCGTAAGTCTCTGTCCCTCTCTATTTCCCTCGCAGAATCCTC TCATGGTCAGGTTCTCAGGGACGAGCCCTAATGGCAAAAAATTTGGTTCA CAGAAGCCGGGTAGAGCTTGTTTGGTCGCAGCCCAGGTTTCCCCCTCTAG GAAAATGGCCTGCCCCCTCCCTGTACATGGCTCGGTGTTTGAAAGTAGTT GAGGTCATTGTATCTGTAGAATAGCTAGCTCCAGGAAGGTTCAGGGGATG CTAGAGAACTGATAGGAGTGGTTGCACTGACATGTAAAATTATGCAGCTT TAATGCTCCCATTTTGCAAATTGAAATAATACTTACTCCCTCCATCTCAA AATAGATGTATTTATTCATCCAAATTTTGACAAACCCGCGACATTTATTT TGAGACGGAGGGAGTAGTTTGATTTTTTCAATAATTAAATCATCACTTCT GGGACGAAGGGCTCTAAGACTTTTACGGTAGATGCTACCACACTGCATAT GGTGGCTTGAAGAAAAGCAAATGAGCACTCTGTGCTGTAACATTTCGCTC TCACTGCACATTTCAAAATATTCAACATTTCTGCAGATGTATACGCGCAA GGGAAGTACCGATGTCCACGAGTTTGATGGGATGTTTCAGGGCTCTCAGG CATCTTTCAGGGTGACATCAGTCATTGGACATGTCTTCAGGTCCTGCATT TCTTCAACTCCTTTAAGAGCTTTTGTTAAAATTACATCACTTGATACTAT ATATATAGTTCATGTTAGTTATGAACTACGCAATGCATTTGAATTCATGT GCATTGCATACGCTTTCTTCATTTCAGCCTTACAGACATGAACACATTGT GGGCCACTGCATATCTGCAAAGTGCAAAGTTGATACAACATCAAAGCCTT TTGTCCCAAGCAAGTTGGGCTAGGTTATGGAACCTAATAGGAAGTGCAAA GTTGATACCTTAAACAAAATTTATATGTACTTGTACCACTTTAACTGAAT GCATACTATTGCTTTTGCTCACTGCAATTCTTACCTTGGATAATAAGTTC TTTTGTGTGCATTTTTTAACTTGATGTTTTTTCTTTTGCAGTGTTGATTT TCCACCTGCATATCAAAACTGGGAAGGGACTGATCCCATGGACCTTTTTA ATGCTCCAGTTCTGAGATCTGAGTGCAACCCGAAGGTAATGCATTCTTCT AAAACTCTAATTAGCGAATACAACTTGGTTAACAGCAGGACCCAGGAGTA GTAAAAAAAATCAATTATGTAAGAACAATTTCAATTAGTTCTACATATGT ATTGCACATTCATACACGAATTCTACTCCAGCTGTAGATAGTACTATCAT AGATATACTACCCAGTTTAACTGACTCTCGGACATTCTATTTCATCGTAT TATCTGTTCAGTGTTTGCATGGCTTTCCGACATATTTTCTATTTTCCATA ATCTAAACTGACAGTTTTCCTGTCCTACCACGAAAGAACTCCCAATTGTT GTGCTTGGATAAATTTGTAGGTTTATGACAATTACATACAAGCACCACCA TGTTCCATATCTAAATACAGAACTGATGTATGTATCTCTGAAAGGTTCAT ATCCAAAGGCATTTAGCCCAGGAAGCTCGTGGCTGCACCTATTTGATACT TTGGCTTGACTGCGACCGAGAAGGAGAAAACATATGCTTTGAAGGTATAA CTTCCAGTCCTGTGATATATGCGTGTGTTATCCTATCTACTTATGTATTA GAAATTCAGGCAGTGTACAAAGAGCTCTACATGAAGTTTGTTTTTGTAGG ATCTGGAGTCTATAAAATTATAAAATAGTAATTTCAACTACTTGACCAAG GTATAGAGAATGCCAGATGGCAAAGTGCTATGCTGGACTATGTTCACAGC TGGATTAATTGGATTCTTTTGAACTTCTTGACATTATGCATATTTTTTCT TTTCCCAAGGAACATCTACAATTCTGTTTAACCCATGGTTTTAAAGGCGA CGCTTAGGCGTCCAGGCGCCCCTCCTCCGCCTTGAAAAATTGACCACTTT AGGCGCCTAGGCGTCCAAAGCGCCTGCCTAGGCGTCAGAGCGCCCCTAGA CCTTAAGACGCCTTAATGCCTTAAAAACCATGGTTTAACCCTTTGAATTT ATTTGGTGGACATGAGATTTTACTTTTCCCTGACTAATGTAATTAATGTA AGAGTTTTTTCATTTATTACTTCTGTATACACAGCTTGCTCAGTTCTGTC TTAGTCTGTTCAATCTAGTAACAATGCTAATTGTATGTTCCAGTCATTAA TTGCACCGGGATTCCTGAAAATGAGGTTGGCAGAAGAATATTCCGAGCCA AATTTTCATCTGTTACCGAGAAAGATATATCGAATGCTATGGATAATCTT GTCTTGCCAAACAAAGATGAGGCACTATCGGTGGATGCTCGACAAGAAAT AGACTTGAAGGTAGGGGTAGCGTTTACTAGATTTCAGACCCGATATTTTC AAGGAAAATACGGGAATCTCGACTCAAGAGTCATTTCGTGAGTTCTCTAT CTCTCTTAAGCTATACAACTTTGTTGATCAATTGCATAATAAGTTAGTTT TTTGAAAGGAAAACACCATCTATATTCTTCAAATACCAATTGCAGGTTTA GTACAAAACTATCTGTAATGTCAATGTTTATCACCTTTTCCGGGAAGTTC CTTTGGTTCAATATTTTGAGCTTTGTAACCACCTTCTCAAATGTTCTGCT TTTGATACTTCCATTGATTTGATAGCGCAAGTAATGTAAGTACGCTTTGA CTGGTATTTTCATGTTGGAGAGTACCATGTTTATGCTTTTCGTGTTTGAA TGATTCATCTGGATTTAGTGGATTTACCCCTGTTTTAAGAATCCCCTGCA GGATTTGGTCTTATGATTTATTTTTTTCCTTCTAAATTAGGTATGGCCCC TGTCAAACACCTACGCTTGGATTCTGTGTACAGCGCTATCAGCAAATTAA CACATTCAAACCAGAGAAATTCTGGTCTTTGAGAACTTACATTATCAAAG ATGGTGATGAGATACAGCTAGAATGGGACAGGAAAAAACTTTTTGATTTT GATGTAAGATCACATGCCTTAGTGATTTGACTTTATCCTTCCAAGTAATC ATGGCATGCTCATCATTCAATTTCGCAGGTTACTGTAATGTTCCAAAAGA TGGTAGCCAGTGATGGAGCTCTAAAAATAACAGATATATCAGTGAAGGAA GAGTGCAAAGCCCGACCATCTGGTCTTAATACAGTGAATTTGCTAAAGGT GACAGCTCTAAGACAAGCAGCTTTTTTCGTTGTTTAAGCTACAACTTAAT TGGATAATGATGTTTGTATGGACTGCCATTTCACTTTGTTGCCTACAAAG CAAGGTTAACTTTGTATTTACCTGTAAATGGTGCATTGCTCACTTCTGTT TGGACCTTAATATTGATATTGCGTGTTTATATTAACATATATGGTTACAA TATTTTGCATTGTGATGGCCTTAAATGGAATGCAGTACCCATATTATGCT GTTGGGTATGACCTTAGTTGTATTGATCATAATGTGGACCAGGGCATCCA TTTGAGTACAAAAAGGGCTTCTAGGATATGCTTAGATAGGGTTTCTAAAT TTAGTTGAATGAATTTCATATTTTAGTGTACTGAATATTGCTCTTATGTC ATATCTCAGGTTGCATCAAGTGCGCTAGGCATTGGACCCCAGACAGCCAT GCACTTGTCCGAGCGACTTTACATTCAAGGATACATCAGGTTCCAGAAAC GGGTCTCCCTTTTTTATGGAAAATGTTAGTTAATTTGAAGTTGGCATGAA ATTGTTAAATTTACCCATAATAGTAAGGAAAATTTGTCCACTTCCTGCGT GAACTTTCTCCGTATATCGAGTTTATGTGCTGTGGCCATTTTAGGTGTCA TTTAAAGGTTACCTTGCACTATTCTCTATGATGCCTCATGTAGTACATGG GATAATGTTTTAAATTTCATATGGAAATTGTGCAAATCTACAGTCAACTT GATGTAGTTATGGCTTTAGATTGTAAACTGACTTACAAACATTTTTTTTA CTACAACTGAAAATTGCGTACACAGGTGTGATGTATAGTTGACGATAATG TGTGGTTTTCCAATTTCCTGCTGAAGTTCTAATTATTATCTTTGTACAGT TATCCTCGTACAGAGAGCACTGCCTATCCTGCATCATTTGATTTTAGAAG TGTACTGTCTGCACTAGCACATAATCCTTTGTGGTCGAATAACGTCCGGG CGTTAATGGATGCTGGTTTTGTTAAGCCTCGTCAAGGTCAGGATGTTGGG GACCATCCCCCTATTACTCCAATGAGATTAGCACCAGAAGAAGCTTTGGA AACTGATGCGTGGAGGCTGTACCAGTACATATGCCAGCATTTTATTGGCA CTGTCAGTCCTGATTGTAGGTATACAAGGTAATACACAATATCCATGTCT GCATTTGATGCTAAATTACTTGTATTGTTGTCCCATCGGCCATCACATGC ATTTTTCCGGCTCCCTGGTATCTAAATTTATGTTTTATTCCTTTGTATTG TAATGTGAACATGTCAGTCCAGCTCTTGAATTATTAATTATCAATGAAAT TATTAGGAGATCAACATCTTCCTTTCTGGAAAAAAATTGGTTTGCAGGAC TGCAGTTGAGTTCACTTCAGGTGGAGAGGTTTTCCGTTGTGTTGGTCACC GAGTCACGTCCAAAGGTTTTACATCTATCATGCCATGGCTGGCTGTGGGT GAGAATAATCTTCCAACATTTAGAAAAGGAGACACAGTTAGCATTCATAA GGTTGACATACATGAGGTAAGGCTTGTGATTTTGCTCACATCACCTGAGC TTGCGTTTATTTAGATGCGGGATTGCTGACAAGTATTTATTCTTCTCTAA GGGAAGCACCACAGCTCCTGATTACCTTAGCGAGAGTGAATTGATCTCTC TCATGGAGAAGAATGGCATAGGCACAGACGCATCAATTTCTGTGCATATA AACAACATTTCTGAGCGTAATTATGTTCAGGTTAGTTGAGGACTTTTTTA TCCAGACAGTTTGATATCTTCTGTAGTGAACTTGTATGACTGCATGTCCG CTTAAATATGTAAATGCACAATTTCCTAAAAGCAGCTACTTATCTTTGTT GAAGGTAAACTCTGGAAGAAGATTAGTTCCAACAGCCCTAGGAACTACCC TGATAAGAGGATATCAGTGTATTGATCCCGATCTCTGCCTGCCAGATATC AGAAGCTTTATTGAGCAACAGATCACTCTAATTGCAAAAGGCAAAGCAGA TCATCTTCAAGTTGTTCAGCATGTTCTTCAACAGTTTATGAGAAAGTACT CTTATTTTGTGAAGAAGGTGCTCTACTGTGTTAATAATCTCAAAAACTTT AATGTCTAGTTAATTGCATTCTTATTGTTAGTTTTGTTAGCTCACAGGTA GTGTGTAGGAAGGTGGTTTGTTTGTGGCTGCCAAAAGCTTCAGCAGCTTG TATTGCATAGTGCTATATATAGGAGTACAAGGGCAGGTCGGTTTGCTCCC GAGAGTTCTAGAGCTTTCTACTGCTATCTAGCTTGCCGCCTAAGATTTAC ACACCAAAAGCTGCTTCTAGAACCTACCAGTACTGTACTACTAGAACCTA CCAGAGTACTAGTCCTAGGACCTAGCTTAACTCCTAAGCAATGATTACTC CGACACTTATATGTTAGTATATTGCCCCTGAGCATACTTACATAATATTC CAAAATGTATCTGTTTAGTGATCTGATTGGGTTCTTAAGCTTTTCCCAAA GCCGCATCCAGCATAAAACCTCCAAACATTACCATGCTTTCTGATGTAGT GAAAACAGAGGAACTCGAGATCTGCAGATTTAACTTCTCATTGTGTTGCT TAGTGTTGTTCAGTATCCCAACCTGTTTTTAACAACTGATTTTTATTGAT ATAGCATGAGAGAGCAGGCCAACATGTGATGCATTGTTAGATGAGACAGC GGCCATTTGCCACCATAAAGATTGGCAATTCACATTGCTACTATTCCAAT GTAATTTTGGTCTTTGGAGTAACAAAACCTCAGTTACAACGAAAATAACA ACTCATTGGCAAGTGCCAACAGTTGGAGTGGAAAATGACCAACTCTCTTT GTTAGATTTGCTTATTTTACTATTAACATTTTCATTTCTTAACAGTAATG AACAACTCATTAAATCCATTCCTAAAAAATGTTGGCAAATTTTAGTTAAA GCACAAGCGCAAGGTATGATGTGTCAGCCAATTTTCTAGTATTCCAAGCA AATCGTTTTAATTACATCCATCTGCACAATTGACTATTGAACTACTCCCT GTGCATGATGACAATGATTGACATGGATGCTTTTCTTCCAGTTTATTATG TGATTGCAGTACCGTTTTCTTCTAGTTGCTTACATTGAACTGTGTTGCTT GCAGATTGAAAACATGGATGCTTTGTTCGAAGCACAATTTTCACCTCTGG CAGACTCTGGGCGTCTATTGAGCAAGTGTGGAAAATGTGGTCGGTATATG AAATATATTTCCACTCAGCCAATGAGGATGTATTGTGTAACTTGTGAGGA GGTCTATTATCTTCCCCAGAATGGCTCCATTAAGGTGGTTGCTTCACTAA ATTCTCTTTCTTTTTCTCTGGGTAATCATCATGTGTTTGTTATTTTACAT TTAAGCATAAGATCATACTATGAAAGTATCATTCCAAGACCACATTATAG ACAGAATCATGCGATTCATGGGCCTTGATAAATATTTTTGTTCCCCAGAT TGATTCCATTCTGTACCATTCGTTTTGCTTTATTTTGTGTTCAGTTGTTA AACACTTCAGCGTCTCATGCTGAACATTTTATTTACCACATCTCATATTG TACATAGCTGCTGCATTGACTTGTGTGCTATCGTCAAAGGTTAATCACAA AAGCGCTTGATTTTTGTTATGCCAAGTGTCAGTTCACGTATACTCGGTGA TTAATAGTATTATCCTTTGCAGCTTTACAAGGAAATTATTTGCCCCCTTG ATGGTTTTGAGTTGCTTCTGTTCTCGATGGTGGGCCCTGATGCAAAATCT TTTCCACTATGCCCCTGTTGCTACAATAGTCCTCCATTCGAAGGCATCGA CAAGCTTTTTGGTGCGCTCAAGCTTGATGACACCGGCAAGGTTGGGAAAG GGGCTGGCATGCCGTGCTTCCTTTGCCCGCACCCGACATGCAAACAATCA ATGATCACCCAAGGAGTCTGTGCTTGTCCGGAGTGCAGCGGTACCCTAAT TCTTGATCCAGTCAGTGCGCCGAAATGGCGGCTCCTCTGCAACACGTGCA ACTGTGTCGTGCTACTCCCGCATGCCGCTCACAGGATCACCACTACGGAT AAGAAGTGCCCGACGTGTGAGTCGACCATCATCGAAGTTGACTTCAACAA GAAAGCTACCCCTCTTGCAGATGGAGCTACTTTGCATGAGGGCTGCATCT TGTGTGATGAGCTGTTGCATTCGCTCGTTGAGATGAAGCATGGGAAGTCG TTTTTTATGCGGAGAGGCAGAGGGAGAGGTAGGGGCAGAGGAAGAGGGAG AGGCAGCCGGGGTAGGGGAAGACGGGGGAGCTCAAGACATGATGATCCTA AGATGAGCTTCAGAGATTTCTAGATCTTCCTTTTTTTTTTGTCTTTGACC TGTAACCCTACTCTGTATGTCTGTTAAATACTAGTCCGAAACCTTTCGAT TTGAAACATATCCATATAGTGTTATCTCCTGTTGCTTGTAGCAAAGATTA TGTACAGTGATGCACAGTCCATCTTTCAGAAGCAATGCAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.