Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA025314

[Submit comment/correction]

Sequence	AA025314
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA025314
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CTTTACTCAGTTCCTGACCGGCCGCTGGCCACGATGATGCCCCCCTCCCC TGGATCCGACGGCGGAGGCTGCACCGATCCAACCCCCGTCGCCGGCGGCC GGCCGTGGTGACGTGTCCCGTCCCGTCCCAAGGGGACCAAAAGAGGAAGA CAGTGAAAGAGACAGACAGACGACACAAGAGAGAAAATAAAGGGACCCGT TAAAACACACCCTCCCAGAGTGGTGAAAAAAAAAAGTGAGGGAGAAATCT CCTCAAGCTCCTCCCCGGAATCGCGCCGCCTTCCAATCCGTCATTCCATC GCCGCCGGCCATGTCCCCGACGCCGGCAAAAACGCCGGCGAAGCCGCGGC CGTCGAAACGGATCCTGGAATCGTACACCATCAAGGGATCCGACGCGGTC ATCAACGGTGCGTGAGCCGCTCCCGGCCCCGATTCCTCTCGCCATGCGAT TCTGATTTATTTCGGAGATTTTTTTTGGTTTGTAGGCCGGATTGCTGCGA TTTCTCATGTTCTTTTTGGGCTGGGGTTCTGTTCAGATTTAGAATCTGCA CTGTCGTGTAATCCCCATGAAATAAAATCTGATATTAATATGTTTAATCC TGAAATGAGCTTTATCTGTACCATTGCGAGTCTTTGACGTCTTAATACAG TAACGGGGGCCTTGTACTTTGCTACAACTTTGCATTTCGAGAACACACTG TTACTGAAGTACTAGGATAAGCTGGATTTGGGCTTTAGCTGGGGTTACTT AGTTTCTTTGTGATAACATTCCAATTAACACTTACTCCTGAGTATGCACG TAGAGCTGAGAACTTAAACTGAACTAATCTCACTGATATATCTCAATAGC TCTGTCAGCACGCGTTTGCCAGTTTGGATGTAATCCAAGCCTTTTTTCTT GCTAAAACCAACTAAAATGATTATGATGGGTTGTTATCTAAAGACTGATC TTATGCTGCAGAGTTTGCATTTCTTACACTAATATTCTTCAGTTTGAGTA CATCGCCGGCAATAGTTCACCGTGAAGTACCACCTTCCGCGAAATCAATC CTGGGGCAATTTGATAATGCTGTCGTAGTCTTGTCATGGTCACTTCCATT TAAGCTTAGCATTTTGAGTCCATGGTGTGGTGATTCTTGGTGTGTTTTGC ATCAGCTGGGGATGCTGTGCTAATGAAGGCGCCTGACTCATCGAAGCGTC CATATGTGGCAAGGGTTGAGGAAATTCAGGCAACAGGACCTCAGGGCTCA AAGGTGAAGGTTAAAGTGCGATGGTACTACCGACCAGAAGAGTCAATGGG TGGACGGCGGCCATTCCATGGCTCAAAGGAGGTGTTCCTCTCAGACCACC AAGATGTGCAGAGTGCCGACACCATAGAGTGCAAGTGCAATGTTTACACC TTCAAGGAGTATACTAAGCTTGATGCTGTCAATGCTGAGGACTACTTTTG CCGCTTTGAGTACAAGTCACTTACAGGCAGCTTCGTGCCTGACCGCATAG CTGTGTAAGAATTTAAAGGAACCTGTAGGCATATGTTCATATTCATACTT CATGATTTCATTACAGCGCTAGATCTTTAGACAATTCTTTCACCACCGAA GGTAGTTGGGCCAAGTGGTAATATGCTTTGATCATGTTGAACCTATGTTT TTTTCCCTCAAAAACCTCTTCTTTGTGCTCCCATGGTTGGCAAGTTATAA TTCATTCTCTCTTTAGTTGTTACCGTGATAGATGGCTTTATAAGAAATAT GATATACCATCTTCTAAACTCCATTCGTCTGCTGGTAGTATGTTGCCCTA TTAGTCTCGTTGTTCCAGATGGAACTTGTGCATGGTTTACCCAGCTTCTT TCACTGTTGTAATTCTGAATCAGGTTTAGACTTTATAAGACCTATTGTAC AGATTGTGGCCAAATTGTATCTGTATTTGTTGTAGTGCTGGTTGATTCAT GTGTATGTTAGTTGAAGGGATGCAAATGAACCACACATTCTTATTTTGTT TATGGTAAGAAAGAATCTTGATTTAAACTATTTAACTGATTTTCACCTCT TGTTTAAACAATGTAACAGGTTTTGCAAGTGTGAGATGCCATACAATCCT GATGACCTTATGATCCAGTGCGACGAATGCTCTGATTGGTGAGTTTCTGC TGATCCGATTAGTTCCTCTATATCAGGACGGTAACAAAGCATATAATATC TTACATTTACATGTTTCAATAAAGGCACTATCTTGAGTCATACTACCTTT ATAAGTCATGTTCCTCACCAGCAGAGAAACAGCTAAATTTTACACAACCG ACAAAAAAAGACCTCATCATTCCAAAAAGCTACTCTACCACTGATTGCTG CAATTGGAACCGAATACGGGAGAACAATATTCGAGCAAGAGTAGTTTACT GTGGACTATAGTGTTCCATGTTCTAATTCATGCGTGATAGTTTGTGCTCA TGCGTGTTTATACAGCGTTAGCAGTAAAGTGATATGGACATAAATTTACT TTTTATCATTGGAGAAACTGCACAGAAACTTCTCATAATAGATAGCAGTT CCATTATATGATATCCACCTGAGAGAGTTACCCTTTTGAATTCTCGACCA GTGGCTGATGAGTTCTTTAAATTTATAGAGTTGTTGCAAAGATCATATAG CCTTTGACATGCATTTAATGTCTGTAAGTAAAAACTGCCTTTCTCTTTTT AGCAGGATGTTAAGTGAACCTTTTGCTTAATGCTGTTTCTAAATTCTAAT AGATAATAATTGAAAATTCTAATAAGATAATAATTGAAAACATTATAAAC CTTTTGTCACATACACCAGAGATTTCATAAATCAACTGAACTGTAGCGCC TTTTAGCTTTTTCTGACCATCGTTGCAAATTCGTATATTTCCACAGTAAA TTCAGAATATCTTGTGATGTCCTGAAAACATTTCCACGCAGGTTTCACCC TGCTTGTATTGGAAAGTCCATCAAAGAAGCAAAGAAACTTGAGAATTTTT CGTGTGAAAGTTGTGCTGCTGAGAATGAAAAGAAGGTTGAAAGTCCCCAT GAGTCTACAGGCCAATCAGAAGAAAAGGTAAGCTGTTCCATGGTTCCACT AGTTTGATCCTTTGGTTTATTACACTGTTGCTGCATCGATTTTTAACTTC TATCACAAGGAATACTAGTGATTCGTGCAATCATCAGTGGAACTAGGCAT AGATGATCCTGTATTCCCCAATATCCATGCACTATATTGTTGGTGGGACT AAGAACAGTTAAACACCGGGGCCTCTATGGACACAAGAAATGGAAACACA TGAATCATAAAGCACAAGAACCGTATCAAAACGACATGACATTTATACCT TTATAAACTCGACAAAGTTGGTAGCAAATAATTTTGTATTTCGTTTGTGC TTACGAGTCATAAATCAACCATCGATTGACATGCCCATTTTCTGAGTGGT AACTAATTCATCTGCACTACATTCAGCAGGTGGAGTCGAAACGACGGCGG AGGTGAATGCGCCCTGGACGAAATCACTATCTCTTCATGCATGGGATGTG GTGGATGTACAGTGTTGTTCCCAGTTTGATCATGTGAAACGACATTTTTA GAACCTGTAACTGTGTCCTCTTCAGATTGTCTTGCATAGAGTATCTTCTA GTGGTTGCATATCCATGTGGACTAATAGAGTCAGTTTTTTGTTTTATCTT TTTTTTGTGTGTGTTGAGCTGGAGAGCAGTAAGCGTAAGATTAGCAGGAT GTCAACTTTCTTTATTTGAAAAAAACCAGGATATCAACTGAATTTTTCTC TGGCTTGGAAAAGCCCATTCCTTTGTCATGTTTGTGAGCAAAGGTGAATG CTCAAACTAAAGCCTGCATGCCGAGGCAACTTGGCCCAGCCCCTATTATG ACGGGCCGAGCCCACGGGCCACAACTCATCACCCGGCACTAAACCCCGCG GCTTATCCCCATTCCCAACCTCCGGCGCTCCACTGACACCACCACCAGTG GCACTGTGGCAGTAGTACCATGGCGACGGTCCTCCTCCCCTCCCACGCGG CCAGCCACCGCCGCGCGGCCTTCTCCGGCGGTTCGCACCACCTTCTCCCC CTGACGGACCTTCTCGGCTGCGCCACGCGCGTCTCCGCGAGCAGGAGGCC CAGGTCGATCGCGGTCGCATGCCGGGCGGCGACCAGGGCCAAGGAGGCCC CGAGCGCGGGCCCGCCGCCGCAGGCTCTGGCCAAGGAGGCGCACAAGTAC TTCGACCACGCCGTCGTCAGCGTGCGAGCGGGCGACGGCGGCCACGGCGC CGTCCTCAACATGCCGCCCGGCCCCTCCACGGATGCCGCCCCGAAAGCCC GCGGGGCCGGCAGGGTCGACAAGAGCAAGGGAAAGAGGGGCAGCGGGAAG AAGGTGTCGTACAAGAGGAACTACGACGGGTCGGTGTCGCTCCCCATGGG CGGGCATGGCGGCGACGTGGTACTTTACGCCGACGAGGCGGAGGAGACGC TGCTGGGGTTTCACAGCAAGGCTCGCCACTGCGCCAAGAGGGGAGGCAAC GTGGGGGCCAACGGCACCATGAGCTCGCGGATGCACAACGGCTCTGCGGG GGAGACGCTCAGGATACCTGTGCCTGTAGGTTTGTAGTCTTGGTGCTATG AACACAGAGCATTTTTGCTCTGTTCGTCTGAGGATAGTTCTTTGACTCTG ATGCCTGCCTGCCTGCCTGCTGATTGAATTGCAGGGACAGTTGTGAGACG CAAGAAAGGTTCTGTTATTGCTGATTTGGCTCATCCTGGTGATGAAGTGC TCGTAGCTAGGGGTGGACAGGGCGGGGTGAGTTGCTAGTTATTAAGTTGT ATTGTTGTGTTGGAATGTTAAAACTGCAATAGTGTGACCTCCTATGTCCA AAATGCGACTGATATTGCTCTGGGTTCCACTTTAGCAATCACTGAACAAA ATTAGTACTTGCTTTTCCTTTTTTACAACCCAAATCCTAGGAGTTCAAGT AAGCATTTCATGACGATGCACCAGTTTATTTGAGACTCAGGAAAATCGTT GAAGTGAGTTGTAAGAATTATAGATATTCAATTTTAACACTCTGGGATGC ACTTGTGCGGTTTGACTCTTTTAAGTTGAATTACCCTGCCCTGAAAACTT GTATCCAATATTTTTCCCAGTGCATACTGAGGGCTGTGTCGAAGTATATA ACCTGATTGTTGCCAGGCAGGGATTGCATTGCAAATAGGTGGCATAATTG CATACAACCTTAAATGGGTTTTGGAGCCAATTGCAGTTTTCTGTTAGTGT GGCTAATTGAGACGATTGTAACCATGCCTATTCCTTTGAATGCAGAGTTC ACAGTGTAATTCATCTAAAAAACTGTATAATTAGCTTATTGAAAATAGTA GTACAATTGATCATTTTCATTGTTTTATGACATTCTCCTTCGTTTAGTAT GATCCATATGCTGGATAGTTTTATAGTTTTATATGATTTTACAGGTTTTA CTTTATCTCCACAGATCAGTTTGATTGATGCACCTGAGTACAGAAGAGGG AAAGCCATGGCTTTGTCGCCTAATGTCATGCGTGATGTTACTGACAAGGT AAGTTGCCACCTAGAGATGTTCAAATCCTAGATTTAACCAGTACATCCGA AGCTTTACTAACAGGTTGTCTTAGTAGGGTCTTCTGGAGAAGGATTGACT GAAAAAATGTTATGTTTTAGTTACACTAATTCCACATAGATAGTCATAGG ACCAGTCCATCAGCGAGCATGGTGCACTTTAGTGCCTGGTTTGACTCAAG GTCCTCACACGTCTATTATATCGCCAGCTTCTTGCATATCTCTAGTTCAT GTTAAGCCTATGCGCAAATTGGTCATAACTTCTAGAACATGTAGTTTACT TGTTAATGAGTGATAATTGGAACAAGACTTGCTTAACTGCTAATGTTAAC AAGTACGTACAAGATCTTGAACAGTAATGTATATTATATACTAAACTGCT GGTATTCATTAGTGTTTGGTTGTACTAGTATGGTTATTAGGATATGAAGA TTTCAAATAGCCACATTGCTTATAGATTTCTCTGATTCCATTCTTTCTCA TCTCTTTTTTCTGTAGGTATTAACTCATGGTCAGCCTGGCGAGGAAATAA GCCTGGAGTTAATCTTAAGGGTGGTTGCAGATGTTGGTCTTGTGGTAAGT GTGTTTCACTACTAGTCCACTACATACATCTCTTATGGATTTACTCCTAT TTTGGGTTTTGAGAAGAAGAATTTGATCAGATCATTTAGTATATGCAAGA GTCAATATATCGGACGAGTTCAGTTGTTGCTTCTGATGTATTTCTTTGGC ATATTGCATGTTGGTCTAATTGTCTTCATAAACATTTTTAGGGACTTCCG AATGCTGGGAAATCAACACTTCTATCAGCGATAACACTTGCAAGACCAGA CATTGCTGATTATCCGTTTACAACATTAATGCCAAATCTTGGACGGCTTG GTGGAGATCCTTCTTTAGGCGCGTTACAGTTTTCCTCAGGAGCAACATTG GCAGATTTGCCAGGTCTAATTGAAGGTGCTCATCTCGGAAAGGTATTATT TTACTTTATATTATTTGCTTGCTGTATACAGAGTATTTGTGTGAAGGTGT CCTGATGTTGCTTCCTGTAATTATTCTCTGGATCCATCATGTGGATTAAT TGCACTGCAGGGTCTTGGTCGCAATTTCTTGAGACATTTGAGGAGAACTA GAGTAATAGTCCATGTTGTTGATGCTGCTGCTGATGACCCTGTGAACGAT TATAAGATTGTCAGAGAAGTAATGCCTCATTGCTTTCATCATTCCCAACC TTCTATTATCCTTTAGGTGTACTATCACATTCACTATATATCTTGTCTAC AGTTATAGGCCTATAGCCCTGAACCTTGAAGCTGTTACAGTAGCATCAGT GATGGGACATTTTGATATGTTATTTTTCCTATGCAGTTGGGAGATAATAT TATTACCCATCTGTAATTCTGTATATAGGAAGTACAGCCAATAGAATCAA AGGGAAGGGACTGATGTGAGTAATGTGTCACGAGGGAAACTCTGTTGGTC TGTTAAGTAAAGAGAGGTTCAGAATATAGGATCTGTAGAAGCTGCTTTTT TAAGGGCCTGTAAAATTCATTTTTTTGTAATGTAAGGCTTGTGAAAAACT GAATCGTATGTTTGTAACTATGTTTTTTTCTCAAGTCTAGGTGCAGTGTT GAACCATGATCTGACAAGCATCTATTTACAGGAACTAAGGATGTATAACC CTAAGTACCTGGAGCGGCCTTATGTTGTGGTCCTAAACAAGATTGATCTT CCTAAGGTGCAATTTTATACTCCATCCCGAAAAGGATGTCACGGATTTGT CTAAATTTGAATGTATCTAGACACTATTTAGTATATTACATCCGAATTTA GATAAATTTCTGACATCCTTTTCGGGATGGAGGGAGTATTTGATTTGAAT CAAACTATGGCATCCCTAAGTTTTACCTTTGGTTTTTTGTTTCAACTAAC CTCCTGCAATTTCATACCTTGCATGGTTGATGTTTTAGCAACTTTTAACA GTTCTTACTAGTTGTGTGTTTATTTTCCCTCTTGTAGGCCCAAGATAGGT TATCTTCATTGGCATTTGACATATCTTCAGTAGGCTGCGAGGAATGCCAC GACAAAAATGGTAGCATAGAAAAACTAACTGGAAACAACAGCAGGCACCA TGCCTCAGAAGGCGATGATAAGGATCTTGGGGACTATCCAAGACCTCAAG CTGTAATTGGTGCAAGTGTACTGTAAGTATCCTCACTTAACCCACTAAAC ACATGTTTTTACTGTCTTAGCTTAAACAGGCCATAAAATCTGTTTTTCTG TCGACCAATGCATAACTGTTGCTTTGCTTTAACACTTCATCTCTTCTGGG GTCAGGGGTGCTTAATATATTGTATGATCCAATCCTCCTAACGTAAGATT AATATCTGTTGTTCCTATAGACCTGTACAATGTTTGTTTGCTTGAGTTCG TGTTTCATTCTTGTTCATACAGTGAGTTCTCTAGGATAGTGCGTCGAATG CCCTCTAGTTCTACAGACTGAACACTTTTCCCTTTCTTATCCCCAGCGAT GCAAAAAACTATCCATAGACCTCATTTCCTTCGTTTCCTGCCCTTGCAGA AGGCACATCGGGATTGATGAGATGCTGAAAGAGATAAGGACAGCCCTGGC AAAATGCTCTGATCGCATGTCACTAGAACCGTGATCTGGAAGCCAAAACG TCGGAGCTCTTGACATCATAGTCCAACATCCAGAAAGGGTCAAGCTGCAT AGGTTCTTCAACAACAGCTGCAGGCAAGGGTGTCCTTGTTTCGCAACACT GTTGCCAATTTCTTGAAGGACAATACCATGCGTCTGGTTGTCTAAAATCA GGACTCTAGTGCAAGTGGTTTCAGATATCTACGTTGGTGGTGCCGATATT AGAATTGTTACACCTCCATATGTATTCAGTGCTAGAGAGATAAAGAAACC AGTCTTATGGAATATTGAAAACTAATAGCACTCGTGTATTTGTGTGCACA TATTACACAGGAGTTGATATGCATATCTTCAGTAATAAATGCCTTGTGAA GACTAATT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.