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GrainGenes Sequence Report: AA003355

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Sequence
AA003355
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA003355
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGCATACCTTACTATTTGAAGATTGCATCATTCTACAGTGATCAATTGA
TCGATAATCCTTTGTTTTGCAGTGCTTCGAATGCTTTGGTTGGACTGTTA
GATGGCGTGTTGCAATCTGGAGTTTCAGCTGCACCAAGAAAAAAGATAGG
TAAGCATTAGAGATTTAGATTTCACAATTAATTTCGGAGGTTCTAAGTGT
GAAGCACAAAGTACTAAGATGCTTTCTACATTGCAGAAGTCGGCGAACAG
AAAAAGAAGAGGATGAAGTCTGATACTGATACACCACGATTTGCCTCTGC
ATCTATGAGGAGTCAACTTGACCAAGCTGCAAACCTGAAAGGAGAGCAGG
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TATAGCAGGTTGATTTTTACAACTTAAAAGCTGTAAGTATTGAATAAAAA
TGATTAGAAGATGCACACCCATACCAAGGTCCAAGGTAAATTTGGTATGT
ATTGGTATTATGACATCACACATAAACCAAATCGTTGAACTGACGCATAT
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CTCTCTAGATCTTTTTAATGAGTACTGGTACTTGTGGTGGAATTAAGATT
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AAGAGTATGTATAGGTTCTATTTCCTTACTTGTATTGTGCAAGTTATTGT
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GGGTGTTTGGTAATGCATTAATTGTCTGAGCTGTCTTAGCCCTTCCACAA
TGTGTGTCCACATCGGTGCCATAATCGCTTTTGTGGTATTTGGCATCGGT
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GTGGAAGGCCTTAGCAGCTATTGTTATTTGAAGAGGAGTCCTGATGCCAT
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TAGTACTCCCCTCGTGTGTGCATTTGTCTGCATGCATGTGCATGTGAGTG
ATGATCCCATTCTAAATTGTATGTCATCAAGGTATATGTGCAGCCAACTT
TTTACCGCTGATATGTGGAAATACATTGATTCACTCCATGGAAATAATTT
TATTACATGTCTTGCAAAATTCTTTCATACCATTCACTTTTCTTATTTTG
ATGTAGCATACTATAATCGGTGTTAGACAACTTAATATGTATATTCAGTT
TGCACATCATAATCCCCCCATAATTAGTGCCTGCTGTATAGAATGTAATT
AAGCCATTATGGCTAGGATTAGTAGGGATTCTTTCCTTGTATATCTTGTA
TTTTTGGCTATATATATGAGGTATCAGGAAGGTCACGACTGCGGCCTCAA
TTCCCCAACTTACGTGATATCAGAACCAAGAGTTTAAGACCTGGCTGGCG
CAATGTCAACAAAATAAATTGCAGCTCACTTTGGGTCCACGTTTAGGCCT
GAGGGAGCCACGCGAGAGGGTGTGTGTTGAAGTATTAGTGCATTGCCCTT
CTTTCCCTATAGGCTTTGAGGAACTGCCACCTTCAGTGACCTTAATCCCT
ACGGCTTTCATTGCGTCTGAAGTTACAAATACATTTTATATATCTGAAGT
TTGGCTATTTATGTCATATATGTATTCTAGTACTCCCTCCGTTCACTAAT
GTAAGACCTTGTAGATATTTCAAAATAGACTAGATTCAGACTAAAATGGA
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CATGATTATGATTAGACCTTTGCTCCTGTAGCTCATATGACCACTGTTCC
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ATGTTACGAATGCCTTCCTCAATGGTGAGTTGCATGAGAAGGTTTATATG
CAACCACCACCTAGGTATTATGTTCCTGATGGCATGGTTTGTCGACTTCG
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TGTTCACCTTTCTGCTTGTGGTAGGACTCTTCTTCTATATGTTGATGACA
TGATCATCACTGGTGATGACCCTGAGTACATTGCCTTTGTCAAGGCCCGT
CTCAGTGAGCTGTTTCTTATGTCTGATCTTGGTCCTCTTCACTACTTTCT
TGGGATTGAGGTTTCTTCTACCTTTGATGCCTTTTTTGTTTCCCAACAGA
CGTATATCCAGGATCTTCTTGCTTGTGCTGCTCTTAGTGATGAGCGCACT
GTTGAGACTCATATGCAGCTCAATGTTAAGATCCATACTTCTGATGGTGA
TCCCTTATCTGACCCGATGCGTTATCGCCATCTTGTTGGGAGTCTTGTCT
ATCTAGCCGTCACTCATCCGGATATTTCCTATCCTGTCCACATTCTTAGT
CAGTTTGTTTCTGCTCCCACTACGGTTCGCTATAGTTACCTTCTGCGTGT
TCTACGATATCTTCGTGGGACGATCTCTCACGGTCTTTTCTTTCCACGTT
CCAGTTCGTTACGCCTTCAAGACTATTTGGATGCTACGTGGGCTAGCAAT
CCTTTGGATCACCGTTCACTTTCTGCTTATAGCGTTTTTCTTGGTGGTTC
TCTCATTGCCTAGAATACGAAGAAACAGACTGCAGTTTCTCGTTCGAGTG
CAGAGGCTGAGTTGTGAGGTATGGCTCTCTTGACAGCAGAAGTGACTTCG
CTACGATGGTTGCTTGAGGGTTTTGGTGTTTCTGTTACTACACCTACTAC
CCTCTTGTCAGACAGTACAGGTGCTATCAGGATTGCACGTGACCCTGTGA
AGCATTAGCTCACCAAGCATATTGGTGTTGATGCTTTGTTTGTGCGTGCT
GGTTTGCAGGATCAGGTTATTGCCCTTCAGGATGTGCCTTCCGAGTTATA
GTTGGTGGATTTCTTCACGAAGGCACAGACTAGAGTGCAACATGGATTTG
ACCTGTGCAAACTCAGTGTCGTGGATCCACCATGAGGTTGGGTGTGTGTG
TGTGGGGGGGTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGTGATTAGAGTTATACTT
ATGATGGCCTTTGGCCTCCTGCATATTGGCCTTTGGCCTCCCACATGTAC
TATATATGATGGCTTTTGCCTCCTAATAATATCAAGTTGCATTCCTAACA
ATTTGCTTGTGTATAAGCTAAATAAAGGATCAATTTAATCTGCAAATATG
TACTCCCTCCGTCCACAAATGTAAGACCTTTTAGACATTTCAAAGTTGAC
TACATACATCCCAAAATGAGTGAACCTATATACTAAAACATGTCTACATA
CATGTGGTTTAGAAAAAAGCTAAAAGGTCTTACAATAGTGGACTGAGGGA
ATATCATATTGACTCACACAATTAGATGATAACAGTAGTGGAATCCAACC
TTTGGAACTCAAAAGCTGTGTAAGTAATTAACTTTGGTGCGTCGTGTTGA
TTATTTGTCATCTAGGCTATATCTATTGAGTAATCTTTCAAAAAATATGG
ATCTAGTAGTATATGTATTTTTGAATAAGCATCATCTAAGTGTCCTGTTT
AGTGATAACTGGTGGTAGTCGATTTCAGATTGAGATTTGTCTGTAATATT
TCTAGGTTTTTGAACCCTTCGTTATCGCCCTATGCAACTATATGTGTGCT
TGTGTGTGGCCATTCTAAAGTTGTCTGGTCATATTTGCGGTTAAAGAAAA
TAAGCAATGAACTTAGGTGTATTTTTATCCGTATTAGTGTATTGACATAT
GATACTTTCTAATTTTACCCGATATTCTATCAACTTCCGAGAAGTACAAC
TGCAAACACCGTGGTTATTACTTGCCACACCATGTATACCAGGTCAGCCT
TTGCTACCCAGGAAAGTAGCACTCATTCACTCTTAATGAATTTACAGATT
TGAAGTACTTGATGAGGAGCCTGGTGATGATGAAGAGAGCAGCGCCCAAA
AGTTTGAGAGGTTTGAGTTACAAACTATTTCTTCCTTTGTGGTTTCCTTC
TAGTCTACAGGCGAATAAAGTTATTTTTGGTCTATTTAGAAATGTTCATT
GACATTCAACTCAGGAACACTGCTAATCTGTGAACTAATATTTGATGTAT
GAGCCAGATCAATTTGATTTAATGATTTATGGCGCTGTTCTTCACCACAT
ATTGGGCGAGTTAAGCAAAAAATGTTAGGACCTTTTAAGTCGTCAGCTAC
ACATATACATCTTAATTTTGGGGCTTTGAGCTATTTTGCAGTTTTTGAGG
GCCCATGTTCTGGACAGCTAGCTTATGTATTGCCCTTTTTCTGGTAGCTT
GTATACTTTCTCATTGGCTGCTATGCATCTACAGAAACAATCAAACTTTG
ATTTTTGTTGCATACAGATGTTTATCGCTGTTCCTTTCACATGCGCTATT
TTTTACTGTTGTTTTTTCCCAACTTTTTCTATTTTCTGTCATCTAAAGGA
GAACAAATTTAACAGAATGCCCACTTTTTAAGGCAGTATTGATGCAACAC
CCCAATTTTCGTATTCCTTTGCACATAACCACAACATTTTGGATATTAGG
CAACACAACACCCAAATCAGGGATGTGTCACTCTTTTGCCAGATTTGGTG
ATCAGAGTTGCAAAAGACCTGGTTAGTGTGGTCATGGTTTTTAAGGCGTT
AAGGCGATTTAAGGCGCTCAGGGGGCGCTCAACGCTTAAGCGCTGAAAGC
GTGAAGCGAGGCGACGCTTTATGTTAATCACAACATGCACAAGCAGCCGA
GCATTTTAGTCAGAGAGGCATTGAGGCACATGGAGCTGAGTATTTTAATC
ACAACCTGCAGCTACTAGCCTACTCCTACTATGTCAGAGGCACCCAATTT
CCCGTGGCGCAGCTGAGTATTTTAACCAGATAGGCAGAGAGGCACACACA
GCTGGGTATTTTAATCACAATCTACAGCTACTAGCCTACTACTACTGCTC
CAGAGGCACCCAATTTCCCGTGTCACGGGTAGGCATAACCTGCAGCCTAC
TACTACTAGCTGAGTATTTTAACCAGGGAGCTCCTCTCTCTCTTATTCAT
TCCCGTGACTGGGGTGTTCCATGGCGTCCTGTTTCGACCAGAGCCGACGC
CTTTCCCAACTAAGCAACGACTTGGACGCCTTAGGAAGGAGTCTAAGGCG
AGCATGACGCCTTGAACTTCCTGGGCGCTCTGACGCTTAGGCGTCGCTTA
GGCGACGCTTTAAAATCCATGAGTGTGGTTATGTGAAAAGAAATCCTCAG
GCTGTGTGTAATGTACTCAGATATGACAAAGATTAATGAGTTCCAATGTT
AATGAGTAAACATTATTCTGTACCTGCATTTGTGGTGAGTAGATCAGGTG
TTGCTTCTCTTTTTTGCCACAAAAGTGTTGCTTTCTTTCCAATCTAATTT
TATTCTGTTATTATTTTTTTCTACTAGTTTGTAGAAAACTAAAAGGGAGT
TTACCATCCTTGGAAATGGACGAGACACATAGGAAGCTAAAATAAATAGA
TGGAGCTATGGACACTTTAAATTCGGCAATGCTGCCTTGTGTATTTGACA
ATCTTCAGAGCTACCTCTGAAGAAGTTGTAAATAGTATGATGAATTAATT
ATATTTAGATGAATACACCCGGAACCTTTGGATTTGGCAAACACTGACTA
GTCAGTAGTCAGATACCCATTGCTACAATATTCCGCAGTAAATTCTTAGG
TAGAATGTGGATTTTAAGGTTAGAATGTGGATTTTGTACATGAAATAGTA
GATGATTTCTTGAGCTTAGAAGTTTTTTCAATGTGTATTATGTTATGAGA
CGAGCATCGAGAAAATAATCATGCCAAAATATGATCAAAATATACATGTA
CTCAAGCACGCACCCAGCATACACATATTTACCTTTCCCTTATTCGGTAT
AGGCTTGTCTGATCATTTAGTTTCTCAATTCCACACCAGGTTTCATATTG
TACTGTTTCTGTACAATCTTGTTATTTTTTTTTCTTTTTCGTGGGGACAA
TCTTGTTGTTTTCTGTATGTACGAACTTCAGTGGGACTACAGCTAAATCC
TACTTGGTACACTCTGGGCTAATCTGCCTTATCCTTATTGTTTGCCGCTC
ATAAACTGATGCTGCTCCACCCCAACCATGTGTACAGGAAATACAAGTTG
CCTATGTCATATATTATTCCGTTTCCAAAGAAGGGAGATCCTTCTAGTGC
TCAGGATTTTGGACAGGGTCGGCAAGTCTTAGCTGTTTATCCTGGCACAA
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CATGCACATGAATCCTTAGATCATTAATTCTTCATAATAAATGTGACTTC
TTCTTCTCTGTGCTTGGGTTTGACATTCGTATATGTGGATGTATTCCCTA
TTATATGGTCAGTTACTCAGCTTCATCAGGTTATGAATTCAATGGTACCA
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TATTTTCTTACCTAGGGTCATCGTCCACGAAAGCAGTGGAACTGCTAATA
ATCATTGGTTGGTGCATAGTGTACTGTTTGTTACTCCCTCCGTTCCATAA
TCTAAGCCTTTTTAGCAAGCTGTTTTAGTTTGCTAAAAAGGCTTACATTG
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ACACAAGTAATTTGTTCGCATGCCTGAAGTTTGTGTAAGCTGTACACTCC
TTTCTACAACTACCATACTGCTGTTATGGCTTTGTTCTACCTTTTCACTT
TTTTGCTAAGCCACTAATATTCTTCTCTTTCTGTCATCATGTGGTGAAAC
TGCACCGCAAACAAACAGAGGAAGTCTGATGAGTACGTAATCTATGCTTT
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CCTATCTGTCCAATCTCATAATTTTTATTTTGGAAGTGTCTATTTCTATG
TAGACTTGCGAATTCTTATTTCTTTAGTGTTAATTCTTTGTCCAATGGAA
ATTGAGTAGTTGCACATGTTGGAAGTTGTAGACTGTCAGGCTTCATGCAT
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ATAGAACAGGCCTATATGTGGACATAGAGGAGGGGGGGGGGGGGGGGGGG
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AACCCGAGACCTCATGCTCTGATACCATGTCAAGCTTCATGCACTATCCA
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GCAGTACCAGCCAATTGTATAGCTTCGTCTGGTAAATTTGGATCAGTTTG
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TTCAGTAGCGGAACCGTTTTTCCTCATGTATTCTCAGTAGGCGTTTGCAT
GTAGACAGTTCTTACTTACAAGTAGTACACCATAACATTCTTGCTTGCTT
TCTCTAAGCATGGAACGGAACTTTGATTAAACATAGCTTAAGTGGTAGTA
GTACCGAAAGGGAAAAAAGCAAGATGAAGCATACATATATACATACAAGA
CTACAATTAAAGCTTCTGATTACATCCTTTAGACTAATATGGAATTAGTA
GCATTCACATTTTCTGGAAAACCAATTGTTGTGACCGCTACCTTAATTTT
GACAGTTACCATCTCTTATTTGATGACGACGAAGAGGATGGGAATCTACC
AGAGAGAGCTGTTCCATTTTACAAGGTGGTTGCGCTCCCAGAGGGCCACC
GGCAATGAAAAAGCTCAGACGCCCATCTGCCTTGCACTAGCA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.