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GrainGenes Sequence Report: AA019543

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Sequence
AA019543
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA019543
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCGCATCAGACACACACCGTCGCACGCCGGTCCCGGTGCCGGAGAAGATT
TTGCCGCCACCGCCCGCACTAGGCTTCAATCGCTCAGTTTCCAGTACCCA
CATCCCCACCCTACAGAACGGACGCGGAGCGCGTGGCTGGCGGTCTCACC
TCCCCACCACCCCTCCACCGGCCACCCTTCCACCGCGCGCCCGAATGCGC
TGCCGCCACTTCCTAAACCCCATCCTATCCCCCCTCTCCGTCGCGAAACC
CCCTTCCCGCCCCCTCGCCTGCCGCGCCCACGCCCGCGCCGGAGCGACCG
CGCAGCGCCGCGCCGCCCTCGCCGAGCCCGACGTAGGCATCTCCCGCTTC
GCCTCCTCGCTCCCCGGCTTCCGCGGCACCCTCAAGCAGCGCTACTCCGA
CTTCATCGTCCACGAGGTGGCCCGCGATGGCGCCCTCGTCCGCCTCACCT
CCTTCGATGTCCCCGACGAGGTTTCTCCCTTGAGCTCCCTTCTGCTCCCC
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CGGTGATGCTGATTGTGACGCGTTGAGGGAATTTCTGTCGAGGGTTTCAG
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TAAGGATGCACATGACTGCAAATTTAGGTTGTAATTTCTGCTACAGGTTT
CATCTCTACAAGGAGAACAAGGACACCCAGGAGGCACTAAGAGTGATAGG
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CGATCATTTGGGTTTTCAGGGACAAAGGATAAACGTGCTATTACAACCCA
ACAGGTACTTTATTTCTACATTGATTTACGTTGTGCAACTCGCGTAACAT
ACCAACCAATTGCATTTCTTTCCATTATTATGTTTGGAGAATGTGGGCCA
TGATTCAATATAACAAGCATGGTTCAAAATGGAAATTGTAATGAACTTTC
TCAGAAAAAGTTGATGGTACAAGGACAAATGGATGCTATAGTTTGAGAAG
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ATCAGGTAACACTTTTCAGGGTACATGCCAGTAGGTTGGCTGTTCTAAAT
AATAAACTCATTGGCATTAAAGTTGGAGACTTTAAGTAAGTGTTTATGTG
TATCATTTCCTATGTACACCATCGATTTAATGTCATTGACCAAAAATAAT
TGAAAAATAAGTAATTGATTAACCGTTTTTTTCTAGTTATGTGAAGGAGG
GCCTTGTTCTTGGTCAACTCATGGGAAACCGATTTACGATTACCTTAAGG
TGCATGTTCTCCTTGCTATATATTGATGGCACTATACAGCATTGTTATAA
TGATTTTTTTTTTTTGGTCTTCTGCAATATAAATGGTGAACACATGTTGT
CATATATGCTAGAACACAAATTTTGTGGCTATGTCGTGACACAATGTTAT
GCTAATTCATGACGGTTACAACTTACAAAGAATTGCATAATTTGGTGACT
TTATTTTGTAATGCGTACTATATCTTACATTCTTTTCATGACTTTGTTTT
TTTTATTTTCAGTTACATAGTTATTGGAGAATTCACACTTCCCGTTTCTG
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TGTTGATGGATTAATAAATAGTGGGTTTATTAATTACTACGGTCTACAGG
TACAAAATACATGCCCTCTTTTTTATTTTCCCTATGCTTCAAACTTTTTG
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AGGAGAGTGGAGAAGTGCAGTTAGCTTGATTCTTGATCCAAGAGAAGGAG
ATATCCTTGAGTATTTTTTGCTCTTCTACAACCAGAAATTTTAATATTTT
GTAGTTTTAATTTTTGGGGTTAAAATTGTTCAACTTAACTTAGCTGCGTA
CAGTGTGATGACATGAATGGGGTGAGGGAACATTATAAGGAGCATGGTGA
TATTGACACTGCAATTAGAAATTTCCCTCGGCGTCTCATAGCAGAGAGGT
CTATAGTAAGTGTATTCAATCTTCCTTTTCTTGGATTATATTGTTATATC
TGAGCACTTTTATTGTCATGTCACAGCTATTGGTTATCTTTGTAATGATC
TAGCTGGTTTTGGTGCAACGTCTTCTATTCATATCAACAGAGATTGATGT
GTCCCACACAATATTGAATTAGTGATGAAAAATACTTGTGATGTTATTGT
TATGAACCAACGGAAAGCAAAATGATGTCACAGATTTGTCTATGCCCACA
AGTTGACATTGACTCGAGTTTAGTAGATGTTGTGTGAAGTGTACTGTAAT
GGAGAAAACTTACCAACTTATGCTGGATGAGGTTACAAACAAGAAATTCT
TACGTTGATGTCTTGATTCAAATATATTAATTATTAACTAAGTTATAATA
AGGCAGCTTTCTTATCCTCCATTTTATCATCTAGTTTGACAGTCGAACCT
TTAAATCTGTGCTTTGTGTCTTTTTCAGCTTCAGCGTTTGAAGAAGTATC
CTGGCAACTATCTACAAGCACTAATGGCTATACCTAGAACACTGAGACTG
ATGTATGTTCCATTGCATGATTTAAGTTTTCAGTGTGGCTCAGTGATGTT
AATTGGGAATGTAGCATCTGTGATGACTGTAGTGTTTTTCTAGAATCCAT
CATGCCTGCAAATTATTCACTTTCTTCTTATTTACCACGAAGTTTTAAGT
TCTACACATGTACATCTACCTATTAAGCGGTGTTGAAAATTTTATACAGG
TATGTACATAGTTACCAGAGTTATCTATGGAACCATGCTGCGAGTATGAG
AGTTGGAAATTACGGTCAGTATACTTTCTGCTTCTGTTGATTTTGATCTA
ATTAGGTTCATTATTTTGAGATAAGTACTGGAGACTTTCTGCGGTTACTT
CAAGTATTATAGTACATATTATCGAGTAGCATACTAGTGTAGGAGTTCTA
CTGAATGAAAATCCGTTCACACTTAGAAAGCGATTAAATAAGTCCTAAAT
TGCAGAATTGTCTTGACACCTTGGCCATGTTTAGAGCACGTTTGTACCAA
TGCTGATTCGGATGGGTGTGTCTAGTTGACTCTTGTTTATGTTCATTCTC
ACCTATGGCTTCTTCCAAGGTAGCATGGGCATTGCAATATGTTTGAGAGA
CTTCATTCCCAAGTGTACTGTTGAGCAAAGTGGAGGTGTCAGTGCTGTAA
TCTGGAAAATAAAAAGTCAGGCGTGTTTAACTCAATTTCATTCGCATGAA
CAAAATATTTGAGGTGAAACTCGCATGCTTTATATTCCCATTAATTTGCA
TATTTGCAATTGGTGATTGTCTCTGTTGTTAGTTCTTGCTCATGTTTCAT
GATTTTCTTGAGTATGCCTCCTTGACTGGGACCACAAGTGTATGTTGCAA
AAAGATGGTTGCATTGGCTGAAGTATTTCACAAATATGCTTTGGATAGGC
TTGAGAGGGGTGAAATGTTTCACAAATATGCTTTAGCACATTGTATTAGT
ATGTTCCATGATCTCGAATGTGAATATGTTTTCTCTTTTCATGAACATGA
ATTGCTAACCCTTGTGCTTTTCTTTTATCTTCTAAAGTATCTTTTGGGTG
TGTGATTTGGAAGCTGAATATTTATACTTTCGTTGATGACTTTTACTATA
ACATGTATCTCATTTTATTTTCTGTCTATAAACATCTATAAGTGTTCTGC
ATCAGTTGTTTGACTACAAAACTATTTGTGGATTTGTGGTTCTCAAATTT
ACTTATAGTTATACGGTGTGTAGCCAAGTATCTGATTTCAGTTCTCAAAT
GTTTTCCTCAGTTTGCGGCTTGTCCATGCTTCACATTTTTCCTAGCTCTG
CCACCAGATGCGACCATTCATCCCAAAACTGATTAGCACACAGCCACTTC
ATCCACAAGCCCACATTGGATTTTTTTGGCGTGTTCAATGACCCATTTGT
GCATTTTGTTGCACTATACTTATTCAAGGTGTTGAAAGTCTGCTTTCGTT
TTTCAAGGGTATCATTTACTCTTCTATCTGTTGTCTTTATATGCTAATGA
GTATACATCACAGGTTTATTAGGAGTAATTGAAGGTGACTTGGTTTACAA
AAAAGAATGCTCTTTTGGAGAAGGACCTGTAACAGATGCTTCAAAAGATG
ATGATGGCTGCACTAACGCATCTGAAATGGACATATCTGCTGAAACACTC
CTGGAAGAGACGATCCAGTCAGTCAAGGTTTACTACAGACAATCAATCTA
AAGCGTATTTACACGCAACGCTGTGTGAAACTTGTGCATGAGAGGTGCTG
TTTGTCGAATTCCCTTTCACACACTCTTCTTGTAGATAGCTGATTCTGAA
GATTTATTGAAGGCGGTGTACACGCTTGAGGATGTTGTCCTTCCTTTGCC
TGGGTGATCACTTGTATGTCCTTTGTTATACAATTGATTGCTGAAGTTTT
ATGCTTACTTTTTTTATGTGCAGTTCAGAAACATTGTTTCCTGGGAATGA
AGTTTCTGGGATTTACCATGAAATAGCTAACAAGGTAATGCTATCTTTTT
AGCATGAATTCGATTGAATAACCATAGTTGTAAGCTTCTTATTTTTTCTA
CCGAACAATAGGGTGTATTTGGTTTTCCTTCCTTTTCATAATATTTTTAA
TAGCTACCGATGTGCTATGTATACCTTACCTGAGTACTTCCTCCGTTTCA
GATTAGTAGGTGATAGTTTCTGATTTGGTTTTCCTTTTTACAAGGCGCAT
GCTTCTACCAGAGCATGTACTAATTTATGTCCTGCCATTATACCCTCCTT
TTCTTTTCTTGGAAAACTGCAGAGTCAGTGGCGGTCCTACATGCAAAGTT
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TCTTATACAATAATCTCTAGATGTTTAAGACATTACGATACATTGACATC
ACAGCTCAGCGCTGAGGTCCTAGCACCGCTACTGTGCAGAGTGTCAGAGT
GAAGTTGCCCATCAATCACGCTATTAGCTACTCCCGTCCACCCTTTATAC
CTTCCTTTGCTTGGCTCGGAAACCTGCAGAATGAAGTTTTCAACCAATCA
CACACTGTTAGCTAGCACCCAGCCTTTTGTTTTGGCAATAAATTCAGCTG
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CCACTTCCTGAATAACTATTCACGTGAACACCAAGAACTCTCTGTTAACT
TTCAGGCGAGCACGAGTTAACTTCTTTTTCTTTCTAAGTTAACTTTCAAA
ATGTAACAGTAATAGTGAATGTTTACTTTCACTGTGTAAGTTAACTTCCG
CGACCATTCTTAACTACCTCATGTGCGCAAGTTAACTACCTCTTCTATGC
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TATTAACTTCCGCGACCATTCTTAACTACCTCATGTGCGCAAGTTAACTA
CCTCTTCTATGTGTTAAGAAATTCATTTATACGTGTTAGTTAACTTCTAG
CCGCGATACATCTTTTTAAAGAAACTTAACTTCAATGGTTTCAATTAGAA
GTTAAATTTCTGTTATATCAAAGGAAGTTAACTATTCAGGAACTCCTCTT
AACTTCTCCGTGTGTGTAAATTAACTTTCGCCTAATGCATTTCTTAACTA
AACATGAGCCTTTTTGACTTTTAGGCTACGAAGGAAGTGAACTTCAGGAT
TTCTACGGCTTAACTCCTATCGGTTCGAATGTTAACTTCCCATTTTTAAG
AGCTAACTTACACGATTTTTAGTCGGATTAACTTCTAACTTTAAGAAAGT
ACTCCTATAGTCTTTATTAAATTTAGCTTCCATATGGTTCATAAGAGCAA
AACGCCATGTTTTTATGAAAGTCAACTTCCATTTTTTAAGGAAGTTAACC
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TTTTCCGTGCACGACAATTAACTCCCTCTACAATGCAAGTTAACTTCCTT
ACGAAGAAGTTACCAGAATGATGCATCTGCACCTTCGGAGAAGTTAGGCT
AGGCCATGGCGCTCCGCTAGAGGATCTAGACCGGGGCCAAGCCACGCCGC
GCGCCTAGAGGTAGGTGTTGAGGGTGGGGTGATGACGTGCTGGAGGAGGG
AGGAGATGGCCGGCGGCCGGGGAACCGGGGGCGGAGGAGGCCGACAGCGC
GCGGAGTAGGAGGGCGCGGCTACACGCGGGTGAGATGGCCAGCGGCACAG
GGCAGGGACAGAGGAGGCCGGCAGCACGCGGGGGAGGAGGGCGCGGCGAC
GCACGGGGGAGATGGCCAGAGGTGTGGGGACGGGGCCAAAGGAGGCTGGC
AGTACGCAGGGGAGGAGGGCGCGGAGGCGCGCGGGGGAGGAGGGTGGCCG
GCGGTGTGCTGGGAAGAGGAGGCCGGCCATGTGCGGGAAGGAGGGTGGAC
AGCGGCGCGCGGAAGAGAGGAGGCCGACGGGGGGTTAGATGTGACGAGGA
AGAAAGTGGTTAGGTGGGGGAGGGTAGTTAGGTGGGGGGGTTCCTGAATA
AGCTTACCTAGGAACCTCTTAAGGGGGTGTTTCTGAATAGTCCTGTCGTA
TATATATATATATGTATATATATATATATATGTATATATATATATATGTA
TATATATATATATATGTATATATAAGCAAGATATTTACAAGAGAGGCTAC
AAGGGCAAACTTAAGGTCCTCCATTCTTGTGAAAAAGAAGGAAAAACTCT
CTAGAAGGACCAGGAGCTAAAGCTAGGATTTACATAGTCAAAAATTTGGG
CATTCCTCTTCTTCCAAATGGTCCAGGCAGCACTAGCGATGATCTCAAAG
ATAAACGGTTTGACGAAAGATGATTTATCAGAGGAAGCATGTGGGCAAGG
TCCTGGCTAACATACAACCCAACATTGATCTAAAGCAGCAGCGTTTGCTA
AAAGAGCAATTCCAGAAAAGGTGACCTCTTGTTTCAAGGCAATTATCAGA
GGCGCAGCGACCATCGTCATCAGTCCAGAAAATTTTCCTTTAGTATATTT
CCATCATGGCCTTTGTTAGTTTGGACCCATATTCTTTGTGTCCAACACAA
AATTCTTTGTGTCCAACACAAATATGCCGAAATGGAAGTAATATTATCTA
ATTAGTTTTGTGGATTCTCTTTGTATATATACTAGAAGTAGCGGAGTCTA
AGCATTTTCTTATGTTCGGATTTCTGAAGTTAGTTTTGCTTAAACGAGAC
ATGAATATCTCCTTTTTTTAATACTTGTGGAGCACAATTTTAGTCAGACT
GGAAAAGAGATAGAGCTTCAAGCATTAAAATAGTTATATTTATTAGATGT
GTATTTAATGTCTATTTGGTTTTTGTCTCAGGATGGTATCAGTTTGACGG
AGAGCATCCATGGGGTCGAGTAAGTTAGTTTGTTTCTATATATGCATGTT
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TACAATATTCATATTCATGCAGTTATTGATCTGTTTATTTTAATATTCAA
GTCTGCATACTAACTGTTGTGCTGGGTGACACAATTTCCATTTCTAAGGG
AATTCTCCATTACAAGCATAAGAGGAGGTTACCGTCGTGTAATACAACGA
CCCATTGATTGTGAATGGTACGTGCAACTTAAACAAAATTGTACTGTTCT
GTTCAACCAATTGCTTTGTTTACGTTTTGGTTTGTTTAAATCTTAACTAT
ATTTGTTGTGACTTCTATATGTCCAATGACGTTTCCTAATGACTGCAGGG
ACCTCATAACTTACACGGATGACAAAATACAATTAGTGAAAACCGATTTA
GATGTTCTATCCAAAGCCAAGCCATCAGAAACAAACAAACTTTTATCTAC
TGGGACATCATATGAAAATTCGTTGGAAACCTCTGGAGCAACCATCCTGG
AAGAAACCAAATCTATTGGCAGCTCAGATGTTTTACCAGAGCTTGCCGTA
AAACTAACTTTTACTCTACCGGCATCATCTTATGCTACAATGGCTATCAG
GGAGTTGACGAAGACTTCAACTTCGGTATTCCACTAATTCCCAGATCATC
TTATGTGGTTTTGAACTTTCGATTTAAGATAGTTTTATTTCGCTTTGCTT
CTGCAACATTATATCTTTTGGTTCTTTAATTGGCATTTAGGATATTATAG
GGCATTTCATCCAAATGCATCTCTTTGCTGGACCATTGATGCCACCGAGC
TAGTTGTACTTCCTCTGTTTTAAATTATAAGATGTTTTAGCCTTTTTCCG
AAATGCATGTATCTAGACGCCTTTTAGGCCTTGTTTACTTCTAGGGTATT
TGAGGGGATGGGGAATGATTATTTCGTATCCCAGAATTTCTCCGATAGAT
CGTTTACTAGGCCGGGTTTGGAGGGTATAATCCCGGAATATCCTCATAAA
TCCCCTTCACACTAGTGTATTTTTGGCTAGATTAAAAACTCTACGTCATG
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GATAAGTAAACAAGGCATTAATGTGTAGGTTGGGAGCAAAATGAGTGAAC
CTACACTCTAGAAAACGTCTAGATACATGTGTTATAGGAAAAAGCTAAAA
CATCATATATTTTGGAACGGAGGGAATATATCCAAATGCCATTCAATCTT
GAATTCATCTGCAGCCAGTCTAATTGAGGGTTTTTGACCATCGAGTCTTT
CTTATCATTATGCCAGTGCTGTTATTGATTTACAAATAGTGTCTGCTTAA
GTTAGCGCTTGTATATGCGTCAGTGGATCAATAGAAAACCTAGCATAGTT
GTCGAAAGCTGTTAGCATTGTTTGCCAAGTTCCCCACTCATTATCATCTG
TAGAGATGCAAGTTTGGAACCTTTAGGGTACCCTCTTATTTAGTCTAGTT
CAAAGAAATGAACTAGTTTTCTCAAAAGGTTATGATATGTGAAAATTTAG
GTAGATGGTACCCTGAAGGTTACCCACTTGCATCCTTAATCATCTGACAT
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GGGTTTGCACTCAGGTTGATTGTCAGAAAGCATTGAGCTCGTGAACCTAC
AGCAACGTGCATCAGTTGCGAAAACTGATCTCTAATGTTGAACACGTGGA
AGCTACGTGCGTTGCATCAGTAAACATTGCCCTGCAATGTAAGTATTTTT
CTTGAGGCCATTATATTTGCTACAGCATTTGGACTGTACTAATAACATGC
TTTTTTTGGCAAATGGACTGTAGTAACCGGATGTTTATTTGTGTTTGCAG
CGTTAAACTTCCATACAGGGATTCTACGCGTTGACTTCTCTTGTATTTCT
GCATGTCACCTAACCAGAAAAACCGACCATTGTACAGGATGCCTCACTGA
GTAGCTCTAGCCTGTAGGCAGTTCACCCCAGAAAAACAGAAGAGTTACAG
TAGTAGTTTTTGTACTCTCTCAGTCTAAGTCTCAAATTAGACGTCGGAGA
TTTGTCTAAATTCGGATGTATCTAGACTCACATGTATATACGTACTAATT
TGAGAAATGTGCCAGAAAAAAACCATATCCGACAACCACATACAAAATTT
GTACTAGATGAATAGGACCTAAGGGTATTGTGTCATGTTCACAGGGATTA
TTTGGACGGAAAGAACTTATTTTGGGAAGTTTGTCG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.