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GrainGenes Sequence Report: AA016717

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Sequence
AA016717
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA016717
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GCGTTGTCTTTTTTTTGGGGAGAAAAACACGCGTTGTCTCGTGCATAGTT
CTTGCAGCCCATGCCTGGATGCCATCGGCTTTGCTTCGGCTACGGGCGTA
ACGGTTGGAATTTTACCTCCCCCACTTCACTCTCGGTTCCCCCGTCTACA
GGGCCAGCGCCGACGAACTCAGCTCTCTTCGCCGGCGCCGGAGAAGGCGT
CCCCTTCCACCCCTCACGCGTCACATCCAAGGCGCAAGGATCCAAGGCTT
ACGCACCCCTCTGTAGTGGGGTGGGCAGGAGGCGATACATCCAGGCTGCC
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GGCTTTGTTGCTTGGGTTGTCCAATCGAAGACTCTATCCTCCACCTAGAC
ATAGGAGGATTTTCTTTCCTTTTATTTCCTTTTTAGCAGCCTGTTTTCCC
AGATTTTCTGGGGTTTACCTGGACCATCAATGTACCGTACGTCATATACA
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TTACAGTTTCCATTACTCTCTGCAGTGTTGTTGGGGATTGTGTATGCCTG
TATACCAGCCACTGCTATTGTCGCTGTTCCAAGTTCTAACTGTTATACAT
TCGACAGTGACAGCCACCTTGTTGACTTTGTATCCTTACGATCCTAGTGC
TCACCAGGCATACTTTATTTGAAACCAAATCAGGCTCTTTCGTATCAGTA
TCTCCTAAGCTGTAGCTAGACACACATGGTCGGGACAAATTTTGAGTATA
ATGAGAAGGTAATTGTAATACATTCATTTATAAGTTATTATTCTGAAAAT
TCATACTCTACTTGCATGTATCTAGTTTCACCTGGAGTGTATCCAGCTAT
ACATCACAATACATTGTCATTATCAGGGCTCGATACCAACTGATTTGGTT
GTCCAGTTATGCAAAGATGTGCAGAGAAGATCTCAAGCGGTATGAGTATG
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CTTCTTTTTTGAGTTCACCAAGATATACTTATTGCATTCATTAAAGGGGA
TGTAGTAGAGTGTTGTCCTGCTTGCATGTTGGTTCATTGCACAAACCTTC
CTTCGCTCCAAACTTGACTCCTGATACAGACTCCACATACATCATTAACG
GATGGGCGGGTTTCTTGCATGCTGACACTTCCCTGTCTAGTTCAATGATC
TTATTTTAAACATGTGATAGATCTGGCAACCCCTTACTAACAAGCATGCT
AATAATGCTAACTTGCTAAGTGATGTTTCAATGTGTTTAACGTAAAAAAA
AGTTTCAGTGCATTGTTATTCTTTACACTGTTAAATAAGCAGTGCAATGC
TTCCCATCATCATTGTGATTCTGTCAACCGTTACTCTATACGCAATGGGT
TAGCATTATTTAAACATTTCCCGTATCAGTGCGCAGGCGCGACCATAGTT
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TCTAGAGAGTAGAAAAGTTATGCTGCAATATGGTACGTTTAAGAAATATA
AACCATTATAAGATGCACTCATGTCCATGTGCTCCATAAATTTGCTAATA
ATATGTGCTTGATTCGTAGGTTCTAACAACTATTTGTAGTGATCCACACT
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TTTCAGGCCCAACAATGTCAGTCATCATTTATCTGCTTATCTGTGCTTTC
TCTTTTAGACTGTTATGTAAAAAAAAGGTACCTAGTGCTGAAAGCTCCCA
CACATTGCGGGGTCTGGGGAAGGGAATTTCTAGGCATCCTTCCCTTGCTT
TTTATGCAGAGAAGCTGATTTGAACCCAGGACCTCCAGGACACAAGTGGA
GGTGTTCTACCACTGTGCCAGGCCCGCCCTTCTAACTTGACTGTTATGTA
TGTAAAATATTTGAAATTCAATGTATGCAGCATACATTGACTTTATCATT
TGGTTATTGTAACATATACCATGTTACAATGAAGGAAACTTGTTCACATG
AAACGAATAGGCATATCACTTACATGTGGGGAAATATGTAGGCAACCCTT
TATACAATCAATGGGGATATTACACAGATAAGATATACATATCTAATGCT
TTTGTCCTCATCATTATCTCAATAAGGCATCTTTTCCAGGGTTTCATTGA
CTTTGGCCGCTTTACCAGTCCTCGCTCTTTTCTAATCGGTTCAAAGCCTG
TTGACTACATTCAGGTAACACTCCACAGTTTTATCAACTTTGTCTACAAT
AAAATAGTGCCTGAGATATATTATCATTGCTATTTGGCACATTGTTCAAG
ACTTGGTTACATCTTCAATAGAAGGTCTTTGATTTTCCTATAATGAGTAG
GACTTAGGTGGGAGGTATCAGCTAAGAGCTGGTGATGTCTAACTTTCAGT
AAATATCTCGTGTAACCTATATGCCGTATATTGCTGTATGGCATATGGAT
CATAATGTTCTACTATATTAATATTCCATCCCACGCGGTTACAAGCTGGT
CGAATTATCCTTCCTTTCTTTTTTTCACTCTACTGCATTGTTGAAAGGGA
AAAAGGTATATGGAAGTAAAACAGTAGAGCACATTTGCGAAACTTAATCA
CAACAGTAAAGAAGTGTATTGAGTTAAGGGGGAGAAAAGCATACAAAAAA
CCAATGCATTGTAACTAGGTCTACTAGGCCGTGTGCACTGGTAGTAGGTA
CTCTCATTGATTACCGGAAACGAGTATAAGGCCGATTACCTTGTATAAGG
AACATAAACTGTTATAAGCTTCAGTGACAACTTCAAAATACATGATCATT
TCATAAATGAGTGATGACTTACAGTCTCAAGTTTTCTGTTAGTCATTCGT
GGAGTTTGTGTGCCCCTCTCTACACTGAAAGGAAGCCTACACTAGGATCT
TGAACTGCAGGGTATAAACTCATGTTCAAGCTAATGTTTTGAACTTGCTA
TAGTTTATCTAGACCAAATACACTTCACATAAAAGTTTTTCCAATTCATT
GCGGTGTTTATCAATGCAAACGTTTCCAGCATTGTACTTCCGAGCTTTCT
ACATGGTAAAGACTGCTGAGATATGAATGTCTATATGATATGGCTTCATT
CACTGTCATCTGTTTGTCATCTGTTCTTGTAGTAGGTCCTTGAGCTTCAT
CATTCTTTTGTCTGTCACAATTTCTTCAGAAGTTCCAGAATGGAGATTTG
GCGAAATGCGAAACTACCTTTGAGGAGATGGGCCGCACTGCACAGGTTTG
TTCGAATTTCGATGAGATACCCTGCTGTTTTCACTAATATTAGAATTTTG
GACTTTTTGCCAAGTTTATCTTTAGATATGTGGACAAACATCAACGAGTG
TATTGACATTTCAGGTAAACATTATATGTGGACGATGCTCAAATAAAGTA
TGCAAAGGTCTGCTGTCTTTTCACATTTTCTGTTTACACTATTTTGTTGA
TAATCTTCCACCAACTACTTTCAATCTAAATAAAGTAAAATTAGCATTTA
CTTTGTTGTTAAATCTTCTTGGTTACAAATGTATTTTTATATGATTATGT
GTGTGCTTACTGCTTAGTGCTTACAGAAGTCTTATGGCATAAATCACCTT
TCTTGGTCACAATACTAAATCAATTTGAGTTTCTTTGAACTTGTACCAAG
TTGTATTTAAGACTAACTAGATTATCTTATTCACAAACGCCAAGTTTTTA
TGTTTAGAAAACTTCAGTAGTAAATAGTCCCTCTATCTTGAAGTAAGAGT
TGTTTTAGACTTTCATTCAGTCTCCAATATGCAGTTTTCATGATTTAATC
ATGATAACTTTAACGAAGTTGTTTTGATTACCAATATTTTTCATGTGGCC
TATCCAATGTTCTGCACATTTTAATAACTAATCTCTTGATAATGGAATAA
GATGCACAGTCGTAAATAGCCATTTTGCTTCTACCAACTATTACCTTGGT
GTGATCCAGTCATGCTTAAAAGCTACGCAAAGCTTATTTTTCTGGTTGCA
TGCGTTTACTATGGATACCCTGATGCTCATACGCGTGAGTAGATATTAAA
TTCTTATTCTCTTCATTGCAAGTACCGTCTATAGTTATCTTGTTGCACAT
CACAATGCCTAATATGGGGGTGCATTTATGATTGTTTGGTTCCTAGTTTA
TCCTTTATTATGTACAAGCAGAAACTCCATGTCCCATTCCCAAGAGCCTT
ACAAGGTGTAATTCAGTTGCTTGACCATGGTGAACTCTCATGACTTAGTG
GGTATTGCAAACTTGGGAGTACAAGGTTTCTGGTGGTTCTTTTAATCGAA
CTTCATTTCTTTTCCACTTTTGGAAAAAGTTGAGCATAAGTAATCTTTCT
TGTTGTCATGTCACTCATTTTGCCATTCTAACCCAACAGAGGGTTCATAT
AGATACCCTGTATATATTTGCATATGCCCAAGCAAGGTTAATACAGGAAA
CAGGTTTTATTGCCAGAATCATCTACCTTGTTGGTGCTAAACCTGTCAAT
TTCTGTTGACCACATTCAAAGAACAATGAGTTGATTCTTTTTGGGTGCAT
ACTTCTTGCGAAAGCAAAACTAACATTGGTGAGTTCGCAGATGAAGATGG
ATGCATTTGCAGCGTATCCTATGATGAAAGGATGTGCAGGTAACCATAAG
GACTTTATTTGTATTTTCTTATTTTTAGTTTCTTAATTCTTTCTATTGAT
GTCAAAAAGTTCGAAGAAACTGCAACTTGTTTCCTAAATTTTGTATCTGT
GCTACAAAACAGAGCTGTGCACTCGTGCCGTTAACTATCTTACTATCAAG
TTTTCCATCTATTTTTGTATGTAGATCTGATATCCATGTGTTAACATGCT
CATGGTAATTTCTTGCATCTTACACAAATGGGTGGAATAAATTTAGGTCA
AATATGTGTCTAGGTTCCTAGAACATCATTTCAGAAAAAAAGAGTAATGT
GTTAATTTTCGTACTTTGCACACATGTAAATATCTGAAAGTTTGAAAAAC
CAACTTTGGTGTACAATATATATAAAAAAAAATGCAAAAACCATGTAATA
AGTAGTCACCAGTTCATTGCCAATTTTGATTCTAAAAATATCTCCGGCTT
TTCAAATAGCAAATCAACAGTCTGTTTTAAATTATAGTTAGATGCCTGAT
TTCTCTTTATTTTTGGTACAAGGAAAAGTGAAATGAAATGGAAAAGAAAT
ATGGAATGGAAAATATAAATGAAATTGAAACAAATATGGTTCTTAATTTT
CTAAAAACAAAGGAGCTTAAGTAGCATGAACTTTGAACATGATATATTTA
AAAATATGTTTACTGCTTGTTTTAATAATTCTTTTCCTGACCCCTATGTT
CTTATGGCATTATTTTCTAGTGTGGTCTGCAGATAAACATGTTCCTTTTT
GTCAGGGTGGTTGTTGAACTTTCTATTCCTTGTGCTAAAAGTGGTCCAAG
AGTTTTTAAGGGTTTCACTGTGGGTTTCCACCCTCGATCATCAGAAGTGG
TAAAGCTAGTTCTTTCTTTTGCTGTTAATCAATGACTGAGCTCATGTTAC
AAGTCAGCTTGGTTTCTCCAGGTTTACAATGGATTGACTCAGCTGGGATT
CGAACAACCTCATCATGGATTTAGGTAAGATCATGTCTAATTTTTAGCCA
TGTTTAATAAGATTAGGGAATTTGTTCAGCCTAATTAAAATTTCAGCTTA
TCTAAATAAGCCTAATTAAATGCCAACTGGTAAGCATAATTGTTTTCATG
TGAAGAATGGATTTTGAATAAGGTTCAGCTGGTTAGATGGGGTTCACTTG
GTTGTAGCAAGGTTTCTGTAATATGCACTTTCTTAAAGATCATATTATAC
ACAGAGTGTGAAACCACCATTATGACTTATCCACAAACACAGTTTTATGA
ATTTTAGCTTGGAAACTGGTAGCCATGCATACTGGCTGATGGAAGAACAA
CAAGGTTATGTGTACTTATCTCTGTGGTGACTTTATCATAGAGAATAAGG
ATTTTGATGCCACTCATTGTACTGTCAGCAGGAGCGTATAGATGATAAAA
ATGTTTTAGGCACTAAAGCCCTTGATAGTATAGTTCGTACATTGATGGTG
GATGCAAATAATTTCACACCAAAATCAGAACATTGCACAGTTAGACAGTA
ATACCACACAGCACACACGAGTGGCAAAATCAAAGAGTATACAAAGTTCC
AGAAAATATTTTTTCTTCCAAAAACGTACTATTTATTTCTAATTTTTGCA
TGAGAGAGAATTAAATTATTTTAGAATTTCTGACCCACCTGGTTCAGTTC
CTGATTTTTCGAGAAAATGCAAAAGAAATGCTTATCATTTCATTGAATAG
CCAAGGCTAATCCCTGACTTATAATTAGGATATTTGCTTACTCTTTCATA
TGGACACAATATAAATCATTGCAATTCTATTCTCTGTGCAGCTTTCCAAG
TGAGCAGATTCACGTCTCTTTATATCTTAGCGCCATGTCTTCCCTTTCAG
TCCTTGTTGGACAACCTACCTTCAGGGTAAGGAAAGACTGAGGACTAAAA
ACTACTACGTCCGTTCCATATTAACCATTGCAGATTTGTCTAGATTCGCA
TATATCTACACACTAAAACGCGTCGTATCTAGACAAATCTGCGACAGTTA
ATATGGAACAGAGGGAGTAAAAGCCTACACATTCCATGTCCCTATGTTTT
TCTTTATTGTATACCTCAATTGGTGCTGGTTTTGCACATTATGTTGAAAC
AGCAAGGCAAGTTGTGATCTTTAATTTTCTTATCGGTGTTGGTGAATGGA
CGCACTGCTGTTCTTGCAACCAGAAAGGAAAGTATATCAGCCTACAAACA
AATGAGTGCACTATTTTTTAAACCAGCAGTTAAGAATACCATGTGTCTCT
TAAGAGACTGCCATTATCGTTGGTGCTAAGTGCTAACCCTTTTGTGTTGA
ACTCCATATACTTTTCATTTTGTTTTTCTGCTACACAGGTTAATCCGACA
AAAGGTCTTGGGGTTATGCTTACAGGATCAGGGGCCAACGGTGCCAAGCC
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TTTTTTGTCTCTACATAGTGATGTCTTTTAACCTATCTACAAATGAGTTC
GTACGTTTTGTAGGTGAAATCACTCGAAGCAGTCCATATGAGGTCAATGT
TTCAATCCCAGTGGCGGGCTATGATCCAATCGAATTCACACTCACCAAAG
AATGTGGTTGGTTCTAGTCAGACAATCACCAACTGTGCATATCGATTTTA
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TACTAGCTTAGTACAAAATGAACGGTACTTATTATGGATCGGAGGGAGTA
TTTGAAATTATCTCTGTAGGACCTTCACTATATATATCATAAGCATTTCT
AAAGATTTAAGTTGTGGATAAACATGTTGCAATCCTAGCCCAAAGTTTGA
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CCATATTTCAGAGCAGTTTTACTGTATTCAATCGTTTATCGTTTGTGTGC
TTTTATTCACATGACATACAATCCTTTCGGTCACTTTTGGTGGACTTGTA
AATTTCGGCCTAGTTATATGTTTTCTTTGTAATATCTGTTATATGTGTAG
GTTACACGCAAGAAAGAGAGAATGATTCCATGAGAGGCTGGGCAACATTT
GGAATTATTTCCTGCATGTATGTGTATTGTCAGTTATATCATGATTTGTA
ACGTGTGTTTACTGAAGTAGATTTCCCCTTATATTACTACCATCATTGCT
GTGTTGCTACATGTCCGTGTGTTCCTTCTCATTGTTGAGTTTGCAATTCT
GAATTCTGTGCTGTTTGCCTGTAGATTCATTGTCTTGTCCAGTCTACTTT
GTTGTGGGGGGTTCATCTACAAAACTCGTTTGGAGCATCAGGTTATTTTT
CCCCTCCTTTGTTGAACTTTTAGTTAAGCTATTGAGCAATGCTCTTCAAA
AGTTCTGTTGAAAACAACTCTACCAATTTCAGTATGGTTTACATGCACTG
CCTAGGATGAATACCATGTCTGCCTTTTTGGATGTTGTAAGCACTTTACT
TTGAGTTCGGAACCTCACTATTGCCTGTTAAAATTGTTGACGATGCTGCT
GCTTGGTATGACCTACTACTTTATAACTGAATAATCCATCAGGTTGGAAG
ACCAAGATGCGGAAATCATGCAAGCCAAGCATCATGGGAAAACGGTTCTG
CTTCTACACCAGCAGCACAGAAGACAAATGATAGAAGATATGGGACAGTA
TGAGCTATGCTTAGTTTTGTGGATTTTGTGATGTAGGTTTGCATTCTGTA
CTCATTTAACATGGGCTTTATTTTAATCTTATATCTCGCACATATATAAT
TGTGTCTGGCATCAGCTCTCCCAAGTTTTTCTTCTTCTTCCATTGAAATA
AATTGAATGTTTCAGAGCAAAAGAAGATGGGATATCTTTCATTGAAAGGG
CAAAATTACATTTCGGAATGAACAAGCAACCTGATTTTACATTACAAATC
ATGTCACAAACTTTAGCAGGAGGACATTTAGATGACCAATCGTGCAAATC
AAAATCACAAGCAAAGAATCCATATTCAGATGGATTTTGTTGTTGACTAG
AGGACCTGATTAACCCTGCGACAGTTCTTGCGGATTTCTCCATCGTAACC
CAAGAGGAGATTTCTGTTACCCATCTTGATTATTGAGTTCACGTAGTGTT
CAAAGAACAATGATTCATTTTCTGCGTAACTTCTTACTAAATTTGCTATT
TCTGGGTCTTTTCCGGTCCACAAAACCTGATCTGAATTAAGAAGACCTTT
TCCCTCCACTATCAACTTGTAATAGCTGTTGTCAAACTTTGGAGGGCTGG
CAAAGTCTAGTGGGATTATGTTGTTGTCTCCTCCAGTGCGTGGGCAGACT
GATGCCAACTTGTAATAAAACCTTTTCTCCAGTGTCATGTCTGGTTTGTT
ATCTCTATGCTGATTGTAGAGCCGTTGTTTGAAGCTGACACATCTGGCCA
TTCCAATGGTGTGACTACCTGTTGGAATGCAAGATAAAAGTATCCTTGAG
CAGGAGAACATGCTGACCCAATAGTGACAACTATATATACATGTGGAATT
ACATTTGAAATTGCACTGTTAGTTTCAAATTCTACAATGATGATTGAATT
GAAACATCTAACACAGTTATGATCTCAAGTATTTACTCCCTCTGATCCAA
ATTAGCTGTCGCAGGTTCATTGAACCTAGACAGGTTTAGCCAAGATTTTG
CCTAAATCTGCGACAATTAATTTGGATCGGAGGGAGTATTACTTTTATGC
CGCTCCAATCATCTTTCCAAGCAGATACTATTATTACTGACAATATTATG
CTTTTTCTTTATCAACTACTATGTGATACCGTCTTTTCAAACTCAAGTTT
ATGACAATATGCCAGTGTAGAGTATGAACAGCTGAGCCACTTCTAGGCTA
ACTAACGTTCCTAACAAACCTTTTTGTTTTACTGCTTTACCTCAGATGTG
TATACTTTGAACATTGAAGAGGTGTCATACCTGATAGTGCTACGAGGTCA
ACTTTATCCAGTCCCTGCCTTGCGAAGAACTTTATAAGACGATGCAGTGT
TGCATTCGGTGGAGGAAGGTTCTTATTTGCTAGCTTCATATATGCTGTCT
TGGAATCCCTCCTTCCTAGCGGAAGTTCCCAGTACGGGCCACCACTCTGA
CATGAAGATATATGGGGGTGACATTATCAGGTTTGTGCAATATGGTCCTC
AGTTGCTCTAAATAAGATAAAATAAAGTAGTAATTCCTTTGAGAAATTCA
CTATTTTATCTGTAAGACTATCAAGCCTAGAACATGTTTATATATACAAC
ATGAAGAATAGACATTTACCAGTACTGTTGAGCCTCTGGCTGCTAGGGCG
ATAGTGTCAGCACAAGAGACTGTGTGTGGACATTTTTCTTCTAGTGCAGC
TTTGATCTCATCTATGACTTGGAATCCTCTAATGGAATTCTTGTTGGGAA
TAGCGTTTTTCTCGCTTACAACTCCCTCGCTGTCATCCAGCAGCACTGAC
GCATCACACCCCTGAAATGTGAGCGAAATTATTATTTTCTATCTTATTAA
AAATACAATAGTTAAACTGATGGCGAACCATGTTACGTGGCTGTGGACGC
ATTTGAACTCTGCCTACCTGAACAAAGCAGTCATGGAAAAGGAGCCTCAG
AAGGGAAGCGGCTATCCGCTGCTCCTTCACAATAGCCTTCTTCAGGACAG
ACACCACGATCTCATCAGCCTGTGGGCACGTGGACCTGTAGAAATCCGGA
GAAAGACCTAACTTCGGACCGTGTCCAGCTGGAACTGGATGGGCAGTCTC
ATGGTGATCGGCGAAGGCGAGAGGGGTGAAGAGGCAGAAGAAGAAAGCAA
CGAGGGTTGCACCAAGGAGTCTCTTGTATGAATCCATGAGCTCTGCAACT
GCAATGCTGTTGTGATGATTTAGCTCTCTGAGACATTTGCTTCCGTTTTA
TATATAGATATACATGTACAGTAATGTGATTCAGTTGCGTGAGACTGTCC
AGTATCCACTCCACTTGTGGTAAGATTAGGAACCATGTACGTACGTATGT
GCTTCAGGTGTACCTGATCTTTCCTTCCACGGTCGATCTGTCTCCGCTGT
CGCATATGCTGAACTGCTTTACCAATTTGCGACGCTTGACCTACCTAAAC
CCTTTTTCTCCTATGATTGAGGTTCAGAAAGAAGAGCAGTGGGAATGATA
TTTTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.