Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA035960

[Submit comment/correction]

Sequence
AA035960
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA035960
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
AGAGCCCTCTGCACCGTCCACTGCACGCTCAGATCTCCGTCCCCACCTGG
CAGGGTCGCCTCCACACTGGACCCGCACCCACGGGAAACAGGCGCCGTTA
ATGGCCGCCACAACGGTAAACGTTACCCCTGGGAAGGAGAAGAAGAGCGC
CCTCCCGATCCCCTCCTCCATCCTCCAGATCACACCACCATCGTCTCCAC
CTCCAAAATCCAAATCCCTCACCAGGTCGTGGTTTTTGCTGCCCCGCGCC
AGCTCGTGAGCTCGAGGGCTGGGCTTAGGGCTCTAGGTTTTCACGTGGTC
CCCGTGCCCTTCGCCTCCCGGGGGTTAGGGTTACCTCGCGGTCGTCGGGG
TCTCGTGTGGCTGCGAGGTGCCGCGGCGGATGCGGCGATCGCCGGCGATC
GGGAGGCTCTAGCGGCGGGGATCTGCTCTTGCGGTTTCTGCACCGATGGC
CGCCGACGCGCTCGCCATCATCCCGGGCGCCGTGCTGCGCAACCTCGCCG
ACAAGCTCTACGAGAAGCGGAAGAACGCCGCGCTCGAGGTGAGGGATTAC
GATTGCCTGAGAGAATCGGGATGGGGGTTCTCGTCCGAGCATTCGCGAGG
GATTTGAGGTGGAAATTTGTGTTTTGGTGTAGATTGAGGGGATCGTGAAG
CAGCTATCTACAGCCGGGGAGCACGAGAAGATAGCCGCTGTGATCGGTCT
GCTCACAAACGATTTCACCTACTCACCGCAGGCGAACCACCGGAAGGTTT
GCTTGGATCCCTATTACTTTTGTTTCTGCTGCTGATGGGGGATCAGATTC
GTCGAGTTCAATGGTGTCTTGTTGTTAGCAGGGCGGATTGATTGGTCTTG
CGGCAGTAACTGTAGGACTCACCAGTGAGGCTGCTCAGCACCTCGAGGTT
TGCCAATTGATCATTTTAAATATTGATGAAATTCCATCTAGTTTGTTCTA
ATTAGTTTTATGCAACGCTATCTCTGTGTCTATATGGCCAACCATGGGAC
TGGATTGCTATTGGTAGTACCGCTGTAGCTAATTGGCTTAGTGAGGTTTC
CTAAATGGTTATTAAGTGAATTTACCTCGCTTCAAAGTCGCAGTTGCGCG
TGCACGTGATCAATGTTGAATTGTTGATTGATTTTTAGTTAATACTAGTA
ATGAATGTTGTAATGACTCTGGATCCTGTAGTTTTTCATTAGCTACTTCT
TTTTTCTACATTTATTTACACCAGAGTTCAAGTGTTGGGACTCAGCCACT
TAGGAATGAAAAGATATGCAAATTTTTCGCAGCGTCCTCTCAAAAAGGCA
ACTTAGAACTGATTGGATGGGATTGTATGTAGTCCTTACTAGTGCTAAAG
CGAAGTGTGGAGTCACCATGGTTGCAGGGAGGGGCTGCCCGTTTCCGTCT
GGCAATCATGTCTTGGGAGCAATAGCATTGGATGTACTGGATTTATTAGT
TCTGTATATTTTTGGTTCACATTGTGACCTGCAGGATACGAGAATCTTAG
GGGCATATTGGTGCTGCCTTGCTGTCTGCTAGAGTTTGATTTGGAAGAAA
GATTATTGGGGTGTTTTCTGGCATGGTTCTACCAAATATTTGTGCATTAA
TGGGATTGAATATTGGATCCAGGAACAAAATTTTCACATGCCATTGGTGT
GTCCGTGGCAAATCGTAATTACAGAATTTTCGCATGCCATTGGTGGTCTT
GTTGGGTAGGTTAGCATTCTGATTATTGTGTCACCGTACACACAGGCAGA
ACTTAGATGAAGTTTGGCATTCTGATTATTGTGTCACCGTACACACAGGC
AGAACTTAGATGAAGTTTGCATGATATGCTTGCTGACCTGTGATATGACA
TGCCAGTACGGCTATTAAGTAACTTTGCTTGTGTCCCTGTAGCATCATGT
AATGTGTCGATACAGAAAAGAGAAAACACAGTCATGTTTATCTTTTGAAC
CATGGACGATCCTAATGTATCTATCCTTTTGTACTATGGTTCTGGAAAGC
AGGACAGCTGGGGTTAGGTCATAAGTGCACACATACCTGGGTTAGGTCAT
ACGTAACATGTCAATTTGATCAAAACTTAATCTCATGTGACTTATCTAAG
TAATAGAATGAGTTATAGTTAATAGGCGATACACTGTTCTATACGGCTTC
TCAAAGTTGTATACCAGATAGGTGCATATAATCTTAGACATGCTTTACTA
CAGAATATTCACGAGCAAGAAGACTTAAACAATAACTTGCAGTTTTTATC
TTAGATGGTAAAACCTACCAAACTGCAGCATATCTATTGGTAATTTCATC
CATCTTTAACCTGATGTGTAAAATATAGAGCGTCTTTAAGCTGTTCATTT
ATCCAGCTAAGTTAGGACTGTGATTGATCATGTCCCAGCTCTACATTCTT
TGGGCATGTAATTATTATCCTAGTGTCAATTGTTTGCATAATAAGCTCCA
TTGCTGTGTGTTTCCAGCTAATTGTGCCTCCTGTGCTTAATTCGTTCCTG
GACCAAGATAGCAGAGTGCGCTACTATGCCTGTGAAGCGCTATATAACAT
AGCAAAGGTGAACATTTCATTGAGTAAGGTTACATGAGTGATATGTATGC
TTACGCTAATGTGATGCTTTATCTACAGGTTGTAAGAGGGGATTTTATCA
TCTACTTCAACAAGATTTTTGATGCCCTATGCAAACTGTCAGCAGACTCC
GATGCAAATGTGCAGAGTGCAGCTCATCTTCTTGACAGGCTTGTCAAGGT
ATGGCTCGGTTTATAAACATCCCATATAGTGTGTATTATTTTCTTAATTC
TCCTGATAAATTAATTATTTATTAACCAGGATATTGTAACTGAGAGTGAT
CAGTTCAGGTACACCATATAACTTTTTTTCTATACTGAAATTGTGCTCAT
TTTAATTTTAGCATCCATTCTGATTGTCACCTTTATCTTAATTTTACATT
TTTAGCATAGAAGAATTTATACCACTCTTGAGAGAGCGCATGAATGTGCT
GAATCCTTATGTGCGACAATTTTTGGTGGGGTGGATCACAGTTTTAGACA
GTGTGCCTGATATTGACATGCTTGGTTTCCTTCCTGATTTTCTTGATGGT
AATGCCTCTCTTTCCTCTCAGTATATTACTTGTATTGACAGTTAAGCATA
CATTGTGCTTGCTCCACTCTGCAGGTTTATTTAATATGCTGAGTGATTCC
AGTCACGAGATTCGGCAGCAGGCAGATGCAGCACTTTCAGAGTTTCTGCA
GGAAATAAAAAATTCACCAGTAAGTCTATACTTAGTAAAACTGTCTCTGC
ATTTGTAACTCTTATCAGTTTGGAAACACTGTAAATGTAATAGATGCAAC
ACTTCTAGAGTTTCTGCAGGAAATAAAAAATTCACCAGTAAGGCTATACT
TAGTAAAACTGCTTGTGCTTTTCTAATTCTAATCAGTCCTTAAACACTGT
GAATGCAATAAATATCTTGTCTGGTGAACATTACTCTATTTATGTGTCTG
TATTTATCTGAACAAGCTAACTTGCTAAGTATCTTTTCATTTTTCTCACT
GTTTCGTTCAATGCTGATTATCTGTCCTTAAATGAGAAGAATGTAGATTA
TGGTCGTATGGCTGAAATTCTTGTTCGGAGGGCAGGCTCCACTGATGAAT
TCACTCGTTTGACGTCCATCACATGGGTAATTCCTGTCTTGCATGTTTTC
AGGAATTTAATCTTTAGAGTCTTATTGCAGTACTATTACATTATGTGTGC
TTGAAAGTGCAGATCAACGAGTTCGTGAAGCTTGGTGGGGAACAGCTAGT
CCCTTACTATGCAGATATCTTGGGAGCTATCTTACCATGCATCTCTGACG
AAGAGGAGAAAATCCGAGTGGTACTTCCTCTTTAAAGCCTATATTCAGAT
CATTCTTGAGATGTAAACCGTGTGCTTATTAATTATTGCTTCTTTGTTTG
CTAGGTTGCACGTGAAACTAATGAGGAACTCCGAGCTATAAAAGCTGATC
AAACCGAGGGATTTGACATTGGAGCGATTCTCGTAATTGCAGAGAGGTTC
TCTATTCAAGCCATTGAATAGATTTTTATCTGTTTAGTTTATCTGTTCAG
TTACGTATTAAATGTTGTTTGTGTTATGTTGCATATTATCCTTTATATTT
CCATGTGTTAGTACGTACCGTGCAGTTCAGTGTTGTAAAAACACCCGATA
TGGCTACCGATTAAATGGTTACTGTAGAAAAACTGTCATGCATATGTTAA
TTGGACTAGTGTTAAGGTCCATGAACGTCTTTGTTTAATCGGCAGCATAA
GCTCATTTAATTCCCAAAATCCAGGCCAACAGCCCATTATCCAGTCGCTT
TGAACAGCCCAATAAAAGCCCAACAGTATGTTAGAACTCACTATTTCTTG
AAACTAGCATGTTCTGTTTGGAAAATTGTGTTGGTCTTTTAAATAGTTTT
TAAATATCTCTGAGATTAGCACATCAGTTATATATTATATTAGCTCGAAT
TAATTGCAGCATAATTCTGGTTAATCATCCGTATTCTTGTTAATTGCTTG
GCACTACCCTGTCAGATGACCATATTTTGTTTCTTTGCAACAGTCGTATA
AATGTGCAAAATCACTCTTAACTTGAGATTTCTATTTCCTCGGTGTTTTG
TGATGTGGCATTGGCCTTTTCTGTTTCAGAGAATTGAATAGTGAACATGA
AGCCACTCGGATTGAGGCATTGCACTGGTTTTCCACTTTGCTAGTTCGAT
ATCGTACTGAGGTATTGGAAACTGTACACTTCTTTGTGCTATATAGCACT
ATGCTCAACAGTTTGATGCTTGCATAATTAATTCTTTCAAAACTGTTGCA
AGTGCTTATTTTATCTCCTTGGAGCATGAAAATTGCAATTCAATTTGATT
ATAGAAGTATTGATTGATAACCTTATGATTCGTCTTTCATGTTTGTGTGG
AACAGTTCTTGGGATACCTGGATGGCATTTTTGAACCACTTCTGAATGCA
CTCTCCGATCCTTCAGATGCGGTAAGCTGTTTGAGAAAGCCTAGCAAACT
GCACTACCAGTTTCTAGTATTTTACTGCGTAGAAAAATCTTGGAAACAAA
AACTTGTACAGTTGAAACACTGTGTAAGGTACAGGTTGATTAGTTTCAAA
AGAGGAGGTACATTGATGAACCATAGTTATGGACATTTTGATCCTTAGAC
GTTCTTACAAATAGTCCCATCTAACTCTCACCCATATGATTCTCCAAAGC
ATTTTATACATGGGTGTGAGATTATATGCTTGCACCTATGGTCACTGTAA
TGGGACCATTATCCACTATCATTATTACGATTGCCATTGGCTAGAGAGTT
CACTTCTTTAGCTAAAAAACAGAGAGTTCACCTTGTGTTGTCATTGCCCT
TTGTAAGTCTGAAATGGTAATATCCTTTGCTCAGTGAATCTTAAATTGGA
TGTTTAAATCCAGTTATCCATAGTTACCGCAAAATGACATGATCCAGTAT
AGCTGTATATATGGCGAGAACAATTTTCGTGCTGAATTCATTGTATTGTA
AAGTAGCGTGGCATATACTTAGTTACCTTGTTTTGCTTCTTCATTAAAAA
GAACTTGCTAGCTTATAAGCAAGCATGGCAGTTTGATCACAGAATTTTTA
CCTATGCAGGTTGTCCTTTTAGTGTTGGAAGTTCATTCACGCATAGCTGA
AGAGTATCATCACTTCCATCATCTTGTGTCTTACTTAATCCGCACTTTCC
ACAACAATCATGTTCTGCTGGAGAAGTATGCACCTTTTCTTGCTCTAGAG
CTTATTCTGAACTTCCTGCACGAATTTCTGTGGGTTAGGATCGATACATT
AACATTTGATTAATGCCTTAATGGCCTACCAGATAAATGGTTTATTGCAC
TGTGTGCAGGCGTGGTGCTTTGATAGTTCGTCGACTCTGTGTTCTTCTGG
GTGCTGAAAAAGTTTACCGAGAGTTCTCTACTATTCTCGAGAAGGAAGGT
AACCTTGATTTTGCATCCACCATGGTTCAGGTATGTCTAATTGATACAAT
TTTTTAGCTGCTTAGATATTTTAAATGCAATTTTTGTGTGTAAATAAGCA
AATATTTTTTTAGGCATTGAATTTGATTTTGCTCACGTCGACCGAACTTG
CCGAGCTGCGGTCTCTTCTTAAGAAGTCATTGGTGGATTCTCGTGGGAAG
GACTTATTTGTATCTTTATACCCTTCTTGGTGCCACTCTCCAATGGCTAC
AATTAGCTTGTGCCTACTTGCTCAGGTGATAATGATGGATTTGCTATTTG
TGTTGCTTACTTGCACTCCGTTCATCTTTGATGATCTTATCCAATGTTTA
TAGGCATACAATCATGCGAGCTCTGTTATTCAGTCTCTGGGAGAAGAAGA
TATAAATGTGAAGTTTTTGGTGCAGTTGGACAAATTGATCCGTCTGCTAG
AGACTCCAGTATTTGCTTACTTGCGTTTACAGGTAAAGCTGCCTTTTCTG
ACTAATCCATCCCAGTAATTGGATATCTCTGTTCCTTTCTTTCATTCTCC
CTTTCTGATAGGTTCGGCATTTACCAGTTGATACTTCGAATGTAACATCA
CATGATAGGTCCGAATGCATCTTTGTGACATAGTATTATACTTCAGATGA
CCACATCTTTTGGTATTATGTTATCCCGATTCCCGAATTTTTTTGCTCTC
CTGTGGCTTTCGCATTCAGATAAGATTTCCCTAAAGCCAACACAGATATA
TACTATGAAAATTGTGTCGTGAGTCTTAGACATTTTCTTTGTTAGTACAA
TTAGACCTAATACAGAGGTTTGGCTCTTTCAATGATGGTTAATATTTAAT
ATGCTATGCCAGTCCACTAATATACTTCGAAAAATACATGCAGCTTCTTG
AGCCTGGAAAACACACATGGCTTCTGAAAACACTTTATGGTCTCCTGATG
CTTTTGCCTCAGGTATGTTCAAATGTGATCCCTACAGCCTGTTTTAATAG
TTCAATGAGTATGCTGTTTCCGAATTGTGATGTTGGAGAGAGTTCTGATG
CACAAGGGAAAGCATAAAGGTAAACATGCAGTGGACCTTGTCGTCGTTAA
CGTCCGAAGGTTATATTACTTCAATTTTGGAACACACCTGGTGTTAGACT
ATGGTGCATATTGCTCACACAAGACCTATAACATTCCTCTTCCTCTTCAC
ACAGTTTAGTAAACAACCGTTTGTATGAAAATCAAATAAACAAATCCCCA
GATTGCTGTGTCCACCTTCGCCTCTCCAGCTGCTCAGTACATGAATTACC
ATGAATGAACTTTTTGCTCCTTTTGAATATTTAATTCTTCTAAGAACGAG
TACCACAGTGGATGCCCTTTTAATTACAGAAGACCAGATCTTGTTTGAAG
GGTTGTTGGCTGTTTTCACACATATCCCTTTCTGAAAATTTGTACTTTGG
AGTTATAACCATTTAATTGGTTTAGAGTATATTTTATATATTATATATGT
ATATGCAGCAAAGTGCGGCCTTCAAGATCTTGAGGACTCGACTGAAGACA
GTCCCTTTCAGTGAAAATCTCAAGCGCACATCTTCCGCAAATCCATACTC
TCAGATTCTACAAGTGACGGAAGATGGCAATCGAAATCAAGATACACCAA
ACTATAGTGCAATCAATTTTCCATCTCGTCTCCAGCAATTCGAGATCATG
CAGCAGCATCACCGAGACCATTTTAAGAATCAACTGCAATCTCGAAAATC
CGCTTCGGCAGTAATGTTATCGCAGGTACTGTTTAGCCTTACATTCACAC
ATCCTGTTACTACCTTTGTTTAGACAGTCCTGGAACATGTAATGAAGCTT
CTCTGACTTTGATAAATCATTGCTAATTAATTTGTAAACCATTATTTAGA
TTCAAAAAGTCAAATTGGTGTTATTCTATTCATCCAAAATATTTTACAAT
ATAACAATTTTGTAATATATTATTAATATTCATATGACGTAACGGTGACT
ACCTGTGTTCAAAACGATGCCTGTTCTTAAACGGAGGAGTATGTTATATC
TAATTGAGTAGCTAGAAATCAGGATGCTTATTTTTAAAAGAAGGTTCTTC
TGATGTAATTAGAGTGTTTAGAAAGTCAAGCATTTATGCAATTAGGAATT
GTGTTTTCGTTAGGTTTGACTGCCTTTCCATAATTGTTCCTTGACTAACA
GTTATAACATTACCCCTTCATCCCTGGTTGGTTGGTTATGTGAGCCATCT
CATTTCCATAATTTTTTTTTGAATTGTATGCAGGAGATTCAAAGATACGA
AGAATCACTTTCCTCCCCAATACCAGAGATAAACAGGCCCCCTTCTAGAA
CATCCAGAGTCATTTCATGATGCATATGGATGGATGGTTGTGGTATGATA
CATTTGCAGGACGGATGGTCACAAATTTGTTGGGGCTTGGTTAGTCTCCT
TTAGTTTTTTCCAAAGGAGGTTGCATAGGGGGTACATAGAGTGTAATCTT
TTTTGGTTTGTTCCTAGATTTTGTCATGGGACGGCAATTATTTGTTGGAG
AAAGCTCGTTTCCACTCTCTTTAGCCATTCTTATTTTTTCCTAGCTGTTT
TACTGCTCATCTGGTTTCTGTAATTTTTCAATTGAAGGCCAAATGAGCAT
AGTAGTATTTGGAGATATGTTAACAATTGTTCTGCTTATCAGTCTCCAAT
AAATTCAGCGATGCGGTGTAAATTTCTGTCCTTACCTTTGCTACCTGGCA
TATGTACTCTTCTGCCATTAAATATGCATTTTCGAACTTGGCC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.