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GrainGenes Sequence Report: AA042625

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Sequence
AA042625
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA042625
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATATGTGGACTGCTGGACATCAAAGGAGAGGATACATGGCTGTAACAGCT
CATTACATTGATGCTTTTTGGAATTTGAAGTCATTCCTTTTGAGGTAGAA
TCTAAAATTTGAACGCTTTTCTCTTATTGCATGTTTGAATTTGGTTTTCT
TGTTCATGCTTACTAACCCAATAATTTATAATGTTGTAGGTTTGTTTATG
TACCAGCACCACAGTCAGCTCAAGTGCTTTGTGATGTTCTACATGAAGTT
CTTGTAGAGTTCCATCTTGAGAGGAAGATATCAACTATTACACTTGATAA
TTGCACAACCAATGACAAGGCAGTGGGCGATCTCCTAGATAAGTTAGACT
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TTCACAGCCTGCTGCTTCATACTGAGCTAGATTTGTATTTAGAAGGGCCA
TCTTTGCCTAGAACTAAAGATTTTGATATCATCAATTGGTGGAAGTTTGG
AGGGATCAAATATCCTACTTTGCAGCTTATTGCTCATGACATCTTGCATA
TTCCGATCACAACGGTAGCATCAGAATCTGCATTTTCTACAAGTGGTAGA
ATCCTCAGCCCTCACCGTAGTAGGCTTGCACCAAAGATGGTTGAATCTAT
AATGTGTATGCAAGCTTGGTCTAATGCTGACATGCTAGGTAATACACTAT
TTCATCACTAATTAGACTTGTATGCAAGCTTGTTAGACAGATGTTTCTTC
TTAGATACTTTACTGCAATATACACCTAATATGTCTATGTTGTATTGTTG
TCATCTAAATTTACATTGTTTAAAATTTTAGGACAGAACCATTCAACACT
CTCTAGTGAGTTTCAGAATTGTCTTGATGATGAAGACGAGCCAATGGTTT
GCTAAACTATCTTGCACTATTGCATATTTGCTTTCTACCTAATATGTCAG
TTGGAACTTTCTAAACTATCTTGCATTATTGCTTTGCTATTTTCAGGATG
AGGAGTTGTCCACGTGCAACTATTACTAGGCTTGTTGCTGTTGGAGATAT
GCCCAAGAGGCAATAATAAAGTGGTTATTATCATATCTTCACACTTATGA
TAAATGTTTACATACCATGCTATAATTGTATTAACCGGAAACATTAATAC
TTGTGTGATTTGTAAACTAAAATAAGAGTCCCTAGTAAAGCCTCTTGTTA
AACTAGCTTGTTGGTTAATATATGATCATGGTTTCCTGATCATGAACATA
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ACATACTCCTATAGATAAGCGTAGCATAAAGATCAAGTCATTTCAATAGT
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GAGATCATGCATATCACCTTTTCCGGATGGATGCTTTGATGTCATCAAAC
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TATTGGTTGAAACACATGGATCAAGAGTGGGATTTGTCCATCCATATGAC
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GAGTACTTATCGGTAACGAGGTTGAACTAGGTATGCAGAGATACCGACGA
TCATAACCTCGGATAAGTAAACTATCGTGAGACAAAGGGAAATTGGTATC
GTATGTAAGTGGTTCATTCGATTGGTAAAGTAATCGTAGAAATATGTGGG
AGCCATATGAATTTCCAGATTCCTCTATTGGTTATTGTTCGGAGAAGTGT
TTCGATCATGTCCGCATAATTCACGAACCGTAGGGAGACACACTTAAGGA
TTCGATGTTGTTTGAGTAGTTATGGTATTATGAGAAAGAGACTGAATGTT
GTTCGGAGTCTCGGATGGGATCCGGGATATCACGAGGTGATCCGGAATGG
TCCGGAGAATAAGATTCATATAAGGAAAGTCCCGTTTCGGAGTTCGGAAA
TGATTCCGGTGTTTTCATCGGGAATGTTCTAGAAGGTTCTGGAATGTCCG
GCACTCCGGGGGGGAAGGGGTACATGAATGTGTTATTACATATTGGAATG
ATTGCATCATGTACTAAGTGTTCTCGCTGTTCCAAATAAAGGATTAAATT
GAATCCTAAAACTGAAAAGTCAAATGGCCAGTTTGAAAGTCAAACGGCTA
AAACAGGAAACTGTGGGAAACAAGCAAGAGGAGGTTGAAACCAACTTGGA
GAGGAGTCCCTCCTCTCCAAGCCGGCGCGCCAACTAAGGCCGACTTGGGG
AGGGACTCCCCTCCCCTTGGCCGTACCTCCCACCTATAAGAGGAGGGGCA
GGGCCTCCTCCTCTAGACACACAAGTTCCTATCCTCTAATCTAAATCCTA
GCCCTAGACTCCGGTTTAGAGACGCTTTGGTTTAGAGCTTCTAATTGCAC
TAGCCTTCGGATTATATCCTTCTAATTGGTGTGTCTAAACCCTAGACCAC
TAAAGCTCTCTCATACTCCACCATACTCGCTCCGGCTTAAGGCGAAGCCC
TGCGGGATCTCCCCTCTACTTCCGGTACCACGCCGTTGTGCTGCCGGAAT
CGCGAGGAGAGTGCTACAACCTCCGCTGCCTGCTGGAACAAGGGAGAGGA
AGGTCTTCGTCGAGTACCGAACGTGTGACCGACTGCGGGAGCGCTGCCGG
AACGCAGCGCCGGAAGGATCGTCTACACGATCTTGAGATCGGAAAGAGTA
CGACTACATCACCCACGAGAATCTGCTCTCGTTAACCGCTTTGGAATCTT
CGAGGGTAAGTTATTCCATCGACTCGTTGCTACAATCTAGTAGATAGATC
TTGGCTTGTTTGTTTGTATGCGATAGAAAATTTTTGTTTTCCATGCTACG
AACCCCTACAGTGGTATCAGAGCCGTGTCTATATGTAGATCTGTTGCACG
AGTAGAACACAATGGTCATTATGGGCGTTGATGCTTTTATTGTCGATTGC
TTCTTCTGTACTTTGCATCTTGCGGTATGTTGGGATGAAGCGGCCCGGGC
TAACCTTACATGACAACGTTCATGAGACTTGCTCCACGCTTGACATGCAA
CTTGTATTGCATAAGTGGCTTTGCGGGTGCCTGTTTCTCCTAGCATAGTT
AAGATCCAATTTACAACGGGTGATCAACAATGCTAGTATCAATGTTGTGG
TTCTTGTTCGTAAGTTAGAACGACACTTATTGAAAGCCCCAAACCACGTA
AAATATGCAAAGAAAGTAGAGGCGTCTAACTTTGTTTTGCAGGGGTGTGC
AGTGATGTGATATGGCCATGATTGTGATTATATTTGATGTATGCAATGTT
CCTTATTGTAAGTCGGCAACCGACAGGAGCCATATGGTTGTCTTTAATTT
CTGTTAAGACCCGCGTGTCTATTCAAAGTAGTTGTAATAGTTGAAGCCGG
TGGACGACAACCATGGAGCAGCGTCATTGACCTTGATGCAATGTCGGTAA
TGATGGAGATCATGTTCGTGCTTGAAGATGGAGATCGGAAGCACAAAGAA
GAAAGGCCATATCATATCACATATTATGAATTGCACGTGATGTTAATCCT
TTATGCATCTTGTATTGCTTAGTAGACGACGGTAGCATTATAAGATGATC
CCTCAAGCACACAATTTTAAGTTCTTAAGTGTTCACCCTTAGTATGCACC
GTTGCTAAAGCTTGTTGTTTCGAAGCACCACGTGATGATCGGGTGTGTTA
GATTCCGCAAGTGTATACAACGTAAGCAAGCCAGATTTGCTTATGCGGAA
GCTAAGGTTTGATCTTGACGAGCCTAGCATGTACAGACATGGCCTCAGGA
ACACGGATTACCGAAAGGTAGAGCATGAGTCATATAGTAGATATGATGAA
CATGTTGATTGTTCGCCATTGAAGCTATATCAACTCTCGTGATGATCGGT
TTTGATGTGGTGGATTTGGTTCGTGTGATCACTAAAACAATGTGAGGGAT
ATTGTTTTGAGTGGGAGTTCACCTAGATTAATTTAATTATTAATTAGAAC
TCAATTTATCATAAACTAAATCAAAGTGAATTTGCATAGTTGTTGTAGTC
ATTGGCATCCGTCTACTACCTTGCGCTTAGTTATAATTGAGATGATAGAA
CTATAGAATTCTGGTTAGTTACTTTATGAACTGGTATCGTGTTGTTTTGA
AGTGTTAATCTAAAGTTTAAAAGTCCTATTGCAAACTTTCAGTAAGTTCC
GGTTACTCCATGAAGTTTAATAATTAGTATTAAATCAAGAGTAACAATTC
CAAGTGTTAGTATATAAGTATCATGTTTGTCTCCATGATTCTTGATATTC
AAAGGATTCTCTTAATATCAAGGTTATCTAGGATCTGAAAGAGTTGTTTC
AGAAACCATGATGTGTGGAAGATATTGTGATATCTGAAACGAAGTTTTGG
TTACAACATGATAGAGTATGATATGGCAAAGTTCATGTTCTCATATTTTG
ATGAGAATTTGCAAAAGGTTGGAGACACTTGTTGTCCTAATCCTCCAAAA
GGTTTTGGATAGCAACATTATACTCATAATTCATCATTATAAGCTAAAAG
TAGTTTGATCATGGACGATTCCATGATAAGGGTGAATATTTGATGTAGGT
AAAATGTTTACTACACCAATAGATTACTAAAGAAAGGAATTTGAAAGAAC
ACCAAACATTTGATGATGGTGATCTACTTCAAAGTGCAAGTCCAAAGACA
TTGGTATTTAACTATACACGCTTTGGACTATATGTCATATGTATGACTCC
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AAATCTCATAAGTATATGGCAGAAAGGAAAAGACTAGAATTGTTCAGCTT
AAGTATATAGATGATATACATGTTATGGCTATATTTGCTTATTAAACAAT
GTGGTTCTCAAGTATTTGATACTGAATTTGTTGGTGTGAATCGTCATACG
AAACAACACAATTCATGAACTACAATGGCCTAAGTAACTAGCAAAAGAAT
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AAACATCAAAGCTTGCCTTCAATTGTTTTATCAGGTATTATGAGAACAAA
AGGGTTGTTCAAATAATTGTCGTAATCCATAAAAGATGGATTCGCAAATC
TCGTTGGAGACATCACATCCATAAAACTAGTGCTAAAGATGTCGAAAGAC
AAATTGATTGAAAGATCACTTAGGAAGTGACATCGCCGTTTAAATTATAC
TGGAAAGAAAACATGAAGAAACTCCATGTGGATGGAATTTTGGAGTCTTT
TGATTTTTGATCAAATGACACTTGTGAAACTTTCCTAGAGATAATTGAAA
CTTCGTTCATAGGCCAAAAGGGAACGAAAGACTAGCTTATTGGAATTTGT
ACATATTGTTGTACGAAGTCCATTATGTGTAGTCAAGAGCGATGGATTTT
AACTTCATTTGCTTTTTCCGAAATTTTGAGTGAATATATGAATATTTACT
TAATAAGGATGAAGTATGAAACATTTGAAAAGTTCAAAGACTTTCAAGAT
GAAGTGCAAAATCATTGTAACAAGAATATAAACAGTTTATGATAAAGATC
ATAAAGGAAGATATTTGAGTTACAGAGTTTAGCATAATACCTAAGATTTA
AGGAATCGTTCCGTGGATTTGCATTTCCCGAAACACCATAAGGGTATGGA
GCGTTCGAGGTATGTAACTAAACCTTGTTTGACATGGTAAGATCAAAGGT
ATAATTCATAAAACTGCCATTATATTTTAAAGATTAAAAACTTTAGAGAT
TACCGTTTTTCCACTGAAAAGAGCTTCATCATAATCCGTTGAAATGACAC
CATATAAGGTTATGGTTTGGGATAAAACCCAAGTAGTCCTTTCTTAAAAC
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CTGTCTTTGTATGACTACTAAGTATTCCTCCATAAACACCGGAGACAAAA
GTGTTTGTTGCTTAGAACGTCAAGTTTCTTTGAGAAGGAATTTTTCGTGA
AAAGTTAAGTGGGAGGACAATAGAACTTTGATAAGGTTAAAAGAACCTTA
GCTATATGTGCAAAGTTGCGCAGCGCCGAAAAGTGTTCTGGAGTTAGCAA
ACAATGCTCATGGCTCGCGTACTTCAAAGGTTGTGGTCACGGAGATCTAA
GTTCCTATTAAAACAAGTAGGTCAGATGAACAATCAAATACCAAGATTTG
AGAGTTAAATCATTATTTGACAATAATGATCCGACTACGTGCAAAGAAGC
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AGGTGTAAGACCTTACAGTTGTGTCTGGATCTATAAAGAAATAGACATGG
ATGTTTTACATTTATGAAATAGTCGACATGTTGGGAAAGAGTTCACAAAA
TGTTCAAAGGTTGACTATGACAAGATTTGATCTTTCATAGTGATATTTAG
TCTAGACGGATTAATGTAGCAACCACTACATATAATTTGTTATATGGTAG
TTGAATAAACAAAACAAGTTCTTCTAATAGAATCGTTACCTAGGACATGT
GCATAACACGGTCCATAGGGTTTTGTTAATTCAAAGGATGTTAAAAGCAT
ATGCAAACTTCAATGGTTAAAGTGAGCATCGCGGAGTTGGAATCTTCACT
GTGATGAAACTGTTAAAAGAGTTTAAAAGTTCATTAGAGACGATGAAGAT
GCTTGCATTTGCAAGAAATTAAGTGGGAGCGCTAAGACATGTTTCTAATA
CATTATGTGGAAGACATATTGTTGATTGGAAATAATGTATCTTTTATTAA
CACATATTAAGAATTTCATCCCGATGAAAGACTTAGGCAAAACCCAAATA
TTTGGCATCAATAGACGCTAATATAGTTGTGCCAGAAGTACATAGACAAG
ATATTGAATGAGTTCAATATAGAAACTACAAGAGAGGTTCTTGTCGCACA
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AGATGATCATTGGACAATAGTAAGGATATTCTTATGATCTTTTGGAAGAA
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ATGGATTTGGATGAGTTCCAAAGTTAAGACATTGTGACAGATACTACAGC
AAAAGGCTAAGTATATGACTGCTATTTTAGCAGCAAAAGAGGGCATTTGT
GTCAAGTAGTTTGTTATCAAACTAGGTGTAGTTCACAGTAGGATAATACT
ATGAAGATATATTGTGCGACAATATTATCAACATGTTTTAACCCCAAAGA
ACTAAAGGTCACACCGAAAGACCAAATTTATACAAAGTCATCTCATTAGA
GAATGAGTGATGCGTAGAGACGCAAAGACATGCAATTACACACGGACCTG
GAAGTGTCAGATCCGGAGATCAGTTGACCACTAGCAATCGTGTACATACA
ACACCGGAAAGCCATAGGTGTTGAATACACAAAGGTTTGAAACTAGATTA
TTGACTCTAGTGCAAGTGGGAGACTGTTGGAGATATGCCCAAGAGGCAAT
AATAAAGTGGTTATTATCATATCTTCACACTTATGATAAATGTTTACATA
CCATGCTATAATTGTATTAACCGGAAACATTAATACTTGTGTGATTTGTA
AACTAAAATAAGAGTCCCTAGTAAAGCCTCTTGTTAAACTAGCTTGTTGG
TTAATATATGATCATGGTTTCCTCATCATGAACATAGAGATGTTATTAAA
CAACAGGATCATATCATTAGGAGAATGATGTGATGGACATACTCCTATAG
ATAAGCGTAGCATAAAGATCAAGTCATTTCAATAGTTCAATTGCTATATG
CTTTCTGATACATAGTAACCTAATTCCTTCGACCATGAGATCATGCATAT
CACCTTTTCCGGATGGATGCTTTGATGTCATCAAACACCACACCGTAACA
GGGTGGCTATAAAGGTGGCATTGAGTGTTCAGAAAGTATTGGTTGAAACA
CATGGATCAAGAGTGGGATTTGTCCATCCATATGACGGATAGATATACTC
TGGGCCCTCTCGGTGAAATGTCATCCAATTAGCTTGCAAGCATGTGACTG
GATCACAAGGGATCACATATCACGGGAACGAGAAAAGATTACTTATCGGT
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CATTCGATCGGTAAAGTAATCGTAGAAATATGTGGGAGCCATATGAATTT
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CATAATTCACGAACCGTAGGGAGACACACTTAAGGATTCGACGTTGTTTG
AGTAGTTATGGTATTATGAGAAAGAGACCGAATGTTGTTCGGAGTCTCGG
ATGGGATCCGGGATATCACGAGGTGATCCAGAATGGTCTGGAGAATAAGA
TTCATATAAGAAAAGTCCCGTTTCGGAGTTCGGAAATGATTCCGGTGTTT
TCATCGGGAATGTTCTAGAAGGTTCTGGAATGTCCGGCACTCCGGGGGGG
AAGGGGTACATGAATGTGTCATTACATATTGGAATGATTGCATCATGTAC
TAAGTGTTCTCGCTGTTCGAAATAAAGGATTAAATTGAATCCTAAAACTG
AAAAGTCAAATGGCCAGTTTGAAAGTCAAACGGCTAAAACAGGAAACTGT
GGGAAACAAGCAAGAGGAGGTTGAAACCAACTTGGAGAGGAGTCCCTCCT
CTCCAAGCCGGCGCGCCAACCAAGTCCGACTTGGGGAGGGACTCCCCTCC
CCTTGGCCGCACCTCCCACCTATAAGAGGAGGGGCAGGGCCTCCTCCTCT
AGACACACAAGTTCCTATCCTCTAATCTAAATCCTAGCCCTAGACTCCGG
TTTAGAGACGCTTTGGTTTAGAGATTCTAATTGCACTAGCCTTTGGATTA
GAGCCTTCTAATTGGTGTGTCTAAACCCTAGACCACTAAAGCTCTCTCAT
ACTCCACCATACTCGCTCCGGCTTAAGGCGAAGCCCTGCGGGATCTCCCC
TCTACTTCCGGTACCACACCATTGTGCTGCCGGAATCGCGAGGAGAGTGC
TACAACCTCCGCTGCCTGCTGGAACAAGGGAGAGGAATGTCTTCGTCGAG
TACCGAACGTGTGACCGACTGCGGGAGCGCTGCCGGAACGCAGCGCCGGA
AGGATCGTCTACACGATCTTGAGATCGGAAAGAGTACGACTACATCACAC
ACGAGAATCTGCTCTCGTTAACCGCTTTGGAATCTTCGAGGGTAAGTTAT
TCCATCGACTCGTTGCTACAATCTAGTAGATAGATCTTGGCTTGTTTGTT
TGTATGCGATAGAAAATTTTTGTTTTCCATGCTACGAACCCCTACAGTTG
CATTGAGCTCCATTGAGTCGAGAATGAAGAAAATTGAAGACCGTGAAGAA
TGCAGTCACCAATTTCTTCAAGTCTTCATTTCATTCATTCTGCCTAGTGC
CTACCATGCAAAACCTTGAGATTTTTAGTTTGTAATAATCATACCAAGTA
TTTTTGTTTGTTGATGTTTAGACTCAGTAGATCAGTTGTATGAAACTATG
AATCTCTGTTGATGCCTTGAACTGATACTATATGTAGTGTCAACTTTTGT
CTTGATATGTACTGCCAATATACTTGTGATGGCTTGAACTTGAGATTATC
AGTTCTCTGTATACTGCTGATGCTATATGTATATTGCTGATGCTATATGT
AGTGCCAACTTTTGTCTTAGTATGTACTGCCAATGTATTTGTTTTTCCTG
TTGTTAGTCTCCATGGGGATATCCATGGGGATCGGGTACCCTCTATTAGC
GGGGATGGGGCCTATTTATCCCCCGCGAATGTTCGTGGGTCTGGCGGGGA
TGGGTATTGGCGGGGATTGGGGCGGGGATGGTGGCGTGTCCCCCGGTGAT
CCCCGTCCCCATCGTCATCTTGATTCTCAGGGTCGAAGTGGAGATGGAGA
GCTCTCGAGACGCGACACGTCCCGTGTCTGTGCCACCGTAGTTTATGGAG
TTGCCATTGTCCTCCAAGGAGTAGAATACACAATATTTGCATACTCA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.