Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA011000

[Submit comment/correction]

Sequence	AA011000
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA011000
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGGAGGCGGCGGAGGTTCGCCCATCCAAGCAGGCTGAAACCGAAGAGAT CGACCTTATCAGCCTCCTTCCCGACGAAATTCTTTCCACCGTCGTCTCCT TCCTCCCTACCAAGGATGGTGCGCGCACCACCGTTCTCTCCAGCCGGTGG CGTCCCCTCTGGCGCACCTCCCCCCTCAACCTCGACGACGCCCACCTCCC CAGATGGTCCTGGGAATGCATCTCCAAGATCCTCTCCGAGCACCGGGGCC CGGGCCGCCGCCTCTGCCTCCGCAACCTCGTCGGCCGGAACAGCGTCGCC GATCTCCCGGCGTGGCTCAAATCTCCCGCCCTCGACAGCCTCGAGGTGAT CCATCTTGACTACCACTATGAGCTTCTGCTGCCTGCCTCCGCGTTCCGCT TTGCGCCGACCCTCCGCGAGGCCAGCCTCGGCGCCTTCCGGTTCCCCGAG GACGCTCCCCCGGGCCTCGCTTTCCCGCACCTGAAGCAGCTCATCCTCAC GGATGCCCTGTTCTCGGAGGATGCCCTCCACTGTCTTATCTCCGCGTGTC CCGCCCTCGAGATCCTCCTCTTGGATTGGTGCGGCGGCTTCGACCGAGTA GTCATCAACTCGCGACGCTCCGGAGCTTCGGAGTGTGCGCCGACGGTAAC CTGGACAAGCTAGTCATACAAGACGCCCCTCGCCTGGAGAGATTGGTCGC GTTTGATCAGATGGACATCAGGGTGAACAGGGCGCCTAGACTACAGATGG TGGGCTTGCTGGATAGCTACAAGTCTACACTACGTTCTGGACCCATGGTT TCTCGGGTAACTGCTGTCTTCCTTACTTGATCATTCCCTCATTCCGCAGG CAATACACCCGTGTTTACATGTTGGGGGCTTCTTGCAGGGAATATCTCAT GACAATTTGGCAATGTCGATGCGGAGTGTGAAGCTTTTCGTTCTTGATAC TTATGGCCCTGATCTTGATGCAGTTATAATTTTCATCAGGTGCCTTCCTT GCTTGGAGAAAATCTACATCACGGTAACTTCCTTTTTTTGGTGGTACCTT GTACTCCCTCCATTTCAAAATATAAGATGTTTTAGGTTTGTGAAGAAGAT GAATCTAGACTTGTTTTAGTATGTAGGTTCACTAACTTTAGGATGAATCT ACACACTAAAAGAAGTCTATATTTATTTTCTTCACAGACCTAAAACATCT TATATTTTGAAACGGAGGGAGTACCACTGAATTAACCTCATTATCTTATA TTTTGAAACGGAGGGAGTACCACTGAATTAACCTCATTCAGTTCATATAG TAACCAGGTAGAAGCTAGTCCTTTAGTACTAGCAAACGTAGGTACTGTAG TAACTTCTACTGCTCTTTACAGTCATCTCTGGAAGTTGATCTGAAAAAGA AAAACGTGCGACGTCTTAACCCACAAGATCGCATCGAATGTCTCGACCTT GCTCTCAAAGAAGTTGTGGTGAAGGGTTATGAAGGCAAGCGGTCCGATGT TAACTTTGTCAAGTTTTTCGTTCTGAATGCCAAAGTGCTCCAGGTTATGG AAATTGGTATCCTGAACACATCAAGAGTGATCGGTGAGAAATGGAAAGCT GACCAGCGTAGCCGGCTACAACTGGATAGCAGGGCTTCCAGAAATGCTCG GGTTATCTTTGGAGATTCTTATCCGTTTACTAAATTTGCATGCAGCAAGC ACGCTCATGTTTTGACCATGGCCGACCCTGTTGGTTCCTCCTGTGGAATC TGTGGAAATCTCAAGAAAAAGAGGGTGTGGCCATGTTGAATGATCGTAAT CTCCCTTCACATGTAATTCCAAGTGTTTCTCTATGCAGCTTTGCTACTTT TATCATGTACGTATATAATGTAATGCAACACTTGTTTTCTATCTGAAACT GCAAAAGGCATGAGGGCAACCTCCTATGTGCTGCTTTAATTCAGCAATAT ATGAACTGTTTATATTTTTTGGAGAAGTGGTCGTTGGTTGTTGGAAATTC TGAGGGCAACTGCTCAATCAAATGTGGTTCTGCTCCAGAAACAATAATTT ATTTTCCATTTCTTTCTAGCTTCTTCAAAGGAAAACTAACAGCGTTGTTA GCCGTGCGTTTTTTTGACAATCTTTTTTATCAGTGCGGGACGATGTAATA GCTGTGCGCAACATGTGGTCTCACTCCGTTTAGTTGTACAGAAGGATATC CCTTTCGCAGTTTCACGGAATTTCACTGAACCGTACGAAACAATTTACTT AGGACAGTACAATAATACAAAACACACAGTTATATAGGGATGCTCTGCAC ATTCATAAAGTTTTAGCAAGGAATCTACTAATTCTTGAGCTACGCGAAAA AGAATTGTGGCTAAAAATGGAAAAGATTATTAGAGGAGAACATGATACTC CCTCTGTTTCAAAATATAAGATGTTTTAGATTTTTGAAAAAATATATCTA GACTTTTTTTAGTAGTAGGTTTATTCCAAACTTGAGTGAACTTATACACT AAAAAAAATCTAGATACATTCTATTCATAAAGCTAAAACATCTTATATTT TGAAACGGATGGAGTACAAGTGTTTTTAAGCTTTATAATTTACAATGGAT ATAACTAAATATAATTAGAACACAAAATATTCCATCCGTATACAATTATG AGATGTTTTATCTTTTGCTTGAAACTAATGTACCTAGACTCGCTTTTGGG TAGGTTTCGCTCATTTTGGTCCGTAATAGTCCATATTAAAATATCTAAAA CATTTTATAACTAGGTTGTACTATCTTAAAGCAACCTAATATGAAGTAAA AAAATTGTTCATTACATATTCAGTTTATGTTAGTTCTTCGGTTTTTCTTT ATCTGAACAAACTTAGGGAGCATCTCTAGCAGATCAAGTAAAACTCCCGG AACTAAGAAATAACCACTCTTTTTCGGTTTTCAGAAAAAACTTGCCAGAA TAGATCCCTAAAACCGTCCTGACTAAAAAAAATTGGCACACCGAGAAATC CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCACCGCTATATGCCCAGTTTCCGCGGC CGAACCGAGGGGTGCCCCGCTTCTGCGTGGAAAACTTGGCGCGCTGAAAT TTCCCCGTGCGTGTTGCCGCCGCTGACTCTGGCCTCCGTCTCGGTCGCTA CTAGCCACGCCAAGCCGTAGCCGACCTCTCCGCCGCCTGCATCTTTGGAT CTTGGAAGGTTTGTTTCAAATTGGCAAGGAACAAATATTTTTTTAACAGG AACTTATTATACCTTAGTAAATAGTAAGATGATTCAATCCATAATCAAGA ATAATTAGGATTTCTAAAAAAAAGGGTGGTGGGAGTCATATAATTTGGCG ATTTGACCCATTCCTCTATGTCGTCACGGGTTGCCGAGGTCACCGCCATG GATGCGCCAACGCCGAACAATTGGGTCGCGTTGTTGACCTAGGAGGCTTG ATTCCGCGGTCCCGCAACTGCAACTGCCTCTTCTCCGAGAATCTACAAGG GTACGCTCCGAATCGAGTGGCGTGGGTCGCCGAGGTCGCCACAGTTGCGG CGGCCATGGATGAGGTATCACTTTGACTCCTCCCGTTCATTCGTTTCATC TTGTCCCCTCGCGTAGATTTTAATCTTTAAAAATTGTAGATGACCTCGAG CGAGAAGTTTGTCCTTGAGGATTTATTGTCGTTGTCCGATGATTCAGAAT GGGCAATACAGCGGGAGAAGCCGTGATCCGACCATTGTGGCCATGGCGCC GGAGGACTTGTGGATTTAGCATTTTTTTTAGGGTTGCCGGGATCACTCAA TGATTTCAATGTCTTGTATAGGTCCTATTTTTTTACTAGGCTGGCAAAAG GAGACGCTCCGGCTTGCAACTACAAAGTTATGAACCATGGCTACACATTG GGCTACTATCCTACCGATGGCATATATCTAACTTGGTCAACATTTGTGAT GACCATTTCGGAGCCAAAAACTAAGGCCCAGACTGTTTTTGCAGCGGCTC AAGAGGCATGACGCAAGGATACCGAGAGGGATTTTGGGATGTTGCAAGTT AAGTTTGCTATTGTCGAGGTCCTGCTCGATTTTGGGATAAGAAATCACTC AACTACGGATGTATAATATTTGGACGCTCAAATGGCTTTGTGATGATACT GAGCCAGCTGGACAACGCATTATAGGGCTCGATAAAAGAACCATTCCAAT CTGCACCCCGCACTACCCCACGAGCCGCCGTTCCAGGGCTTAGCGTGGTT GCGAAACCCCTCCTCCTCCCGCCGTTCCGCCGGCTCCGGAGGAGACGTCG TACATGAAGCCCTCGTGGCTCTCCCCGGAGATTGCGAAGAAGAACGCTGA AGGTACGCCTCCATTCCTCAGATCCCGGCTCCCTCGCGTCTCGCGCGCCC TCCCGGCCCGGCTGTTCCCGCCGCTTTTTGCGCAGGGATTTCTCTTCCGG TCGTGGCTCAAACGTCGAATTGATTTGCCCGCAGATTCGTTCGCCAAGGA CCAGCCGTTCAACATCGCCGCCTACATCTCGTCAGGAGCGGTATGTGTGT CCAGCCTTGTATGGTTCGTATTGTGAGGTTTCACCGTCGTCGTTGTGGGG TGCGGTTAGAATGTGGTTCAGTTTTGGGCAGTGTTGATTCATGTAGATTG TAAATGATGCTAATCTGGCTGGTTTTCTGTGCGAGTTTAGGGTAATCAGC CAAGAGCGTGGATTGAAAATAGTCGGTTGTTTCTCATTAAGACACTGCGT CAGTTGATCAGTTGCTGCCTCGCGTTGGTGATTTTCGTCGGTGTTGGTAA TTGGAGTATGCGAGATTTATCATATTGTTTTGTTTGTGTCGAATCAATGC GTTTGGGGCCTAGAGAACTGTTGTTCTGTAGCTTCCCGCACACTATATGT TTGGTTGAATACTTGATGGGGTGCATGAAGGCGCCGGCTTGTCAGATACT CCTCCGTCCGTAAATAAGTGTACTTCTAGTCTTGTCCTAAGTCAAATTTT ACTGTGTTTGACTAATTTTTTTGAACAACGTACCAACATTTATGATACGA AATTGATATCATTAGATTTATTTTTAAATCTAGTTTCATAATATGTCAAT TTGATATAATATATGTTTCTATATTTTTTTTATAAAATTAGTCAAATTTG ATTATGTTTGACTTAGGCAAAAGCTAGATGTACACTTATTTGTGGACGGA GGGAGTAGCATTAATGTGTAGTATCTTATGGAGTAGTGGGGGAAACAATG TGAAGTGGATACTTCACATGTATGCCTTGTGTTTTTGAGGTAATTCAGAA TAAATGGTATCCATAATTTTTACCTTGGGGGTTTATTTGAAATTTTAGCT TCCTGGACGATCTTAACCCCATACTCTTTATGTTAACTGTACTTCTGTTT ATTTAAAGCGATAACATTTTCGTAGTTGGTATACTTTGTTGGAGTCTACA ATAGGATGTTATTGCTGCTGCCTTGCGGACACATGTTGAAGAGGAAGCAG CTCGAGAGCTCAGCGGTGAAGGTCTTCCAAGGGTTATGGATCCGCTCTAT GCGCAAATATCTTGGTTACTGCAAAGCAATGATGCCACTAAAAACTTGCT GGCTCTTCATGCCATAGATGCCTTGATTGATTTACCCGTTGGAGGTGCTT CAAAGGCTGCCAAGCTCGCTAATCTCTTAAAAAATGTGTATGAAGTCAAG CGTGACCCTGAAATCCTAGTTCCAGCCAGCACAGTGCTTGGTGAACTGCA CACGAAGTTGAGCGACAGGTAAGTTATAACTGGTTAAAATTTCCATTAAC ATATATGTGTTTTGCAGTTCTCTAACAAGCACTTCTTATAGATTATTACT ACTGCGCTAGGGTGGCTTGGTGAGGATCGAGTGGAATATCGTCGCTTTGC AGCCCTCCTTATTCTCAAAGTAAGTTGAACCGATCAGCTTCTTGAGTGTT TAATCAACAATCAAGCTCGTGAGTAGTCTGTACCACTGATTTGTATTAGG TTTAAGATTTTTTTCTCTGCATAGTATTTTAAGCAAGTAATTGTCAGCTA TTATTAGTGGATGACTAATCATGCCTAGTCATGACTGATCTGCAATTCAG TACCCTGGTGAGTTTTACTGAGTGTACGACTTAAATAATACTATTGGTTA GCGCTGGCTGTCTTATTAGGCCATGAGTACCATTTCCTGCACTCCAAGAC GCGCTGAAAAGAACCCTATGTACAAGTAGCATCCTGTGCAATTTGTTAAT TACGACAGTAGTTTAACTTCATGCCAATATTTTCCTAGATGAACTATACT CTATAATTTGTCCTCTGTATTAAGTTTTTCGTTTCTTGTGTAGGAGATGG CTGAAAATGCATTCACAGTTTTGAAGGATTATGTCCCTGAATTCTTTGAT GCTATACTAATAGCATCAAACGACCCCAAACAGGTTATTCGTGAACGAGG AGTTGAAGCCTTGCGTGCCTTTTCGCATTCCAACATGAAGGCGGCTGCTG TTTGCGCAGCGAAGAAGGTGAAACTGGAGGGAATCGATCTGATCAGCCTC CTCCCGGATGATATACTCGGCACCATCATCTCCTTCCTCCGCACTGATGA TGCCGTGCGCACTTCTGCTCTTTCTCGCCGCTGGCGTCACCTGTGGCGCT CTGCTCCGCTTAACCTCGACACTGCCCATATCCGTGGGTACTGTCCCGAG CAGATTGAGGTTGTAACCAAGATTTTCTCCCAGCACCAGGGCCCCATACG CCGCCTCTGCCTCCACAGTCTCTACTTTGCTGACCTTGATGGCTGGTTCA GGTCCCCGGCCCTTGATAAACTTCAGGAGATTGACATCTATGTTGCTAAA TTTCATGATCCACTGCCGCTGTCTGTGCTCCGCTTTGCGCCGACCCTTCG CGTGGCCCTCTTTGCTCACTGCAGCTTCTTTGAGGATGGGGACCCAGTAT TTAATTTCCCACACCTCAAAACACTCGCCTTGGGCTTCCTTACTGTATGG GGACGCACCCTCCAAAACTTGATCTCTGGCTGCCCTGTCCTCGAGAACCT GCTGATTAACAGTTGTGATGGCTTCAGTCGTCTGGTGATCAACTCGCTGA CACTTCGGAGCATCGGAGTCCTTGATGTTCAAGGCCAGATGAAGGAAATA GTCATAGAGAATGCCCCTTGCCTGGAAAGATTCGTCAGATCAGATTTATT TCGTACGAAACCAGTCATCCGAGTAATTCGCGCACCGAAACTGGAGATCT TGGGCTCACTGTCAGATAACTTCGATAAACTCAGTATTGGAACCGCAATT TCACAGGTAGCTTAGACTCTGACATCCCGTGAGGCATACACCGATATTTT TTGTAATGTTTTTTCATTTAGCAGGTAAAGGTTGATGGTAACATGGAAAT GTTGATGCCCACTGTGAAGGTTTTACATCTAAAGTCTAGTGGCCCTAATC TTGATGCAGTTCTTTGCTTTCTAAGAGTCTTCCCTTTCTTGGAGAAGCTA TACATCATGGTGAGTTGGTGAATCTCATATTTGGTTGCATTCTAGAGTTA AAAATGATTTTCATTCTTTTCTATATTATATCCAATCAGTAGTTGTTTTA CTTGCCAGGTAGTATTATTTCTTTGTTTTTTAGCTTGGTAATAACTGTAT TTTTTAATCGTTTATGCTCTTTTCAGTCATCTCCGCAAATGGATGTGGAA AATCTGCACCATCTTGACCCAACATATCCCATTGAATGTCTTGACCATCT CAGATATGTAGAGTTGAAGTGTTACATGGGCAACAAGCCAGATGTTAATT TCGCCAAGTTCTTTGTTCTGAATGCTAAGGTGCTCGAGTTAATGAAATTC GTTGTCGAGGGCAAATGCACTCGGAAATGGAGAGCTGATCAACTCAAGCA GCTACAGTTTGATAGTAGGGCATCTCAAAATGCTCAGTTTGAGTTTGGAT CTTATTCTGGTCGTGCAGAAGCTATTGGGTGTTTCCGAAGCAGTGGATTT TCGTTTGGATCTGATATTGGCTTCCGAAGAAATGTCTATCACCATAATGA TCATGTGTTGTCCATGGCCAATCCCTTCGATAGCTCTTCTTGTGGATTGT GCAGAGTAGACTGACCAGGTTGATGCCCTAACGGGGAGCTCTCTCTTCAT GTCTTCTCGTATGTGCACACATTGCAGTACGTCTCTCGTATGAATGTTTC GCACCTGTTGATGACCATGTTATCTGTACTTAAGTTACGTGCCATCAAAA TACATTGGCAGTTTGGTGTTAGGTTTAATGATATTGCTCTTTGCTGGTAA AATTATAGATGTTCTATATTAAAAAATAGATATTCCGTTACGGAGACACA AAACGTGG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.