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GrainGenes Sequence Report: AA009388

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Sequence
AA009388
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA009388
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CAAAAGTGGAAAGTGGAGAGAGAGAGAGTCCCGGGCCTACAAGCCACCGG
CACCAGATGAGATGAACAGAGGGGCCAAGCCGAGGCCGAGGAGCGGAGTT
TAAAAACTTTGCGCCCGCAAAGAGATTCGCTCGCGGCTGGGGAAGGAGGA
AACGGAACCAAATTGGGTCAAATTCCGCGACAGAGAGGAGGCCAATCAAT
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GCATATTGATCATGCATAACCTATTACAAGCTTTGAATTGCATTTGAAAG
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GCCATGTATGCTGCAAGGTGCTTAGAAGTGCTTACAAAAATAAAAAGAAC
TTCTTAAGCACCCGTGCTTATTTCTATAGGAGAGGTGCCTAGTTAAGCAT
CTGCCTTATATGAACAAGCACTAGTGCTTAAGAAAAATAGGTTTATTTTT
CTAAGCACCTTGCATTGTACATGCCCTTATGCTACATTTGTTGTAAGAGT
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AAATGCACATGCAATGGTCGGTGCTTGAGTTTAGGGTTTGCCTAATTGTG
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ATATTTTTATAAAAATGTTATCAAATGTGAAAACATGCTTTCATGTATTC
TCGTACGGTTATACACGGATGCTTTGATCTGAGTTTTACTGCTGGTCTTT
GCAGTTCTATGTTCATGTTCTGTTCTTTCCAGTTTTTGGCTAAAATTTCA
ATTTATATATTAATTTTTTTGATTAATTTTTGTAAGAAGATGATATCCAC
GTCTATTCTACTGGCTAATTAGCTATTACATCATTGCAGATTAAGCCGCC
ACAGTAGCCGCATGCAATCAATAGGTAAGTATTGTGTTCTTATACTTGTG
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GTTGCCTGAATTTTTCATAGAAATGATAAATCTCTTTGTGCTCTGTAATG
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TATTATATGATTAAAATGTCAATATGTACACTGTAGTCTGTACATAAGCC
AAATTTCATATGGTGCTTAAAAACACGTGTTTCATATGGTGCTTAAAAAC
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ATTTGGACGAATGCTAGCTTTATACTCTGTTATTACCAATACCAGATACA
AATAGCTTTTGCAACTCTGTGATGGTATTGTGAAACACTAGAGTCCATTG
TACGTATTACCCTGTAATAATAAAGACTGAAGCACCTGGCCAAGACAACA
GACTGGTAGAGCTTAGATGCACCAGGGAAGACAGCCCAAGATTACTGCAG
TTGTACATGGTGTGGGTCCCTCATCCGGTACTTATAAAAGGATATATAAG
TGGAAATAGTTTAGAAAATTATACTAGCTCATGGGCTAACTTTAACTGGG
GAAGATTAAGATGGATTTGCGTTAAATGTGGGGGAAGTTTCATTGTAAAT
ATAATCATTCCTACATATAAAGATTTGACTAGGTGGTCATCAGTTTACTC
CTTTGCTACCCTTCCTCATCTCAATCTCACAAGTGCGACCATACAAACCT
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AAAGCATCGAAGTAAATTAATTTGACATATAACTTGGGTAACTATATTTG
ACAATGTTTTTTGGTTCCGTAGCGTAGCACGTGTGTCTTGTTAGGGGTGA
AGGATTGAAACATGATTGGGTGCACTTTCCATCTTTGATCTTCTAATAGA
AAGAGATGCCTTGAGTCAGATTTGGTGATGAATTGAGAAAGAAGGATACT
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TCTATTCGAAATTGCCTTGATGTGTACTTCAATTTTCAGATAGTCACAAA
TTTCTTAAGCAGAGGAGCAAAAAAATTTCCGAATTTTAGTATCTTTCAAT
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CTCCTTTTAGTTTGGGCCTCCTTTTGTTCTTTCTTTAGAGTTTTGTATAT
GCACAATTTCTCGAAGCAACGACTGGAGCGGGGGAGTCAGTCGAAAGAGG
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AAGATATGTGCTCCCTCTGTCCCGAATTAGATGCCGCCAATTTGTCTAGA
TTCGCATGTATATCTGTCTAAAACGTGTCTAGATATATCTAGACAAATCT
GCGAAAAGTAGTTCAGGGACAGAGGGAGTAGTAATAATACATAAAGAAAT
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ATGGCACAGTTCAACAGAATGCTATAGGACTGTGCAGTCATACAAATAAT
TAAATTTACAATTAACGAAATATCAGTAGTCATGAGTTGTGACTCCTGTC
CTTTATAGTTTGATAGCATTGTACAGAAGTGTACAATACAGATACCATAG
GTTCAGAAACTATACAGATTTTATCCTTTCCCAATTACCATTTTGATCAA
TGTAACCACTAGCGGCATGACCTGATTGTCTTCTACAACATGGCTCGGTC
ATTATAATATGTGTGATTCACTTCTCTCTAGAAAAAAAAGAGAAACGTTA
ATTTTATATTATGCGGCAATGGTGTATGTAGCCAAAAAAAGTCTTGGATG
TCTTTCTTCGTACATCAAAGTGGAGTAGATTGAAATTTTTCTACAGCAGA
TTACACAGATGTACGAGTCAGAAAAAACCGATGAGGCCATGGTGCAATTC
TGAGGGATCTTTGTTAATTTTATTGTTTTATACAGCACACATTTTTGTTC
ATATTATCAGACACAGTGATATGATCTGTTTGTGTACGAGAGAAATAATA
CAATAAACTTAGCTAGCCACACATTTGCGTGGGTAAGCAAGATAGTTATC
AATGAACTTTCTGCTAAGTGCTAACTTCCAACTTCCTGGCATTTAGGATT
ACGTTTGTTTACCGAGGCAAAAGATGGTGGCTCACGTGGGAAGGTACTTC
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CTGCCCATTTTCCCAGTATTGGGATGATCATCCAGCTATAATGGCAGTTG
GAGTTGTTGATGCGAATACTGAGGATATCTTCCAGACTTTAATGTCCCTT
GGTCAATCAAGATCCGAGTAAGATAGATGTTCTCTATTAATAGGTTCCTA
CTTTTCCTACTTCGGGGCTCTATTTTTTTTGTAACTCTACTCCGAACAAA
TGCATAAGCGCTCCAGAGTAGGAAAGCTGGTCGTATGAAAAAGTATTAGT
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TGAATGTCGTGTCACTAAATGCATGACATTACTACATGAACATCTATGTG
AATTTGTTTCTTTTTCCACCAATCAACCAGTGAGATTTTTGTAGGTGGGA
CTTCTGTATGAGGGAAGGACGTGTGGTTGAGCACCTAGATGGCCATTCAG
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GGATCTAGCCTGTTATCTGTATGCGCGCTTTATCGTTAAGTTATAATAGT
TTATATTATATTTAGTTTTCAGGGGAATGGGAAAGAGAGATCTATTACTT
CGACGGTATTGGAGGAGAGAAGATGACGGAACTTATGGTACTATTGTTGA
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GTTTTTTCAGTTATCCTGTACCACTCTGTTTTCCACAACAGATGCAGTCC
AGAGAAAGGCTACATCCGTGCATGTCTTAAAAGTAATGTATGCTTGATTT
TTCAGTTATCTCTGTGAGATGGTGTAAAACTGATTATTATCTTCTGTTTA
TCATGAACTAAGGTCTGGTTTTGTATAATAGGTGGAGGATATGTAATATC
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ACTGGAAATTCTGGAAGTCTTATCTCCTTGCGTCATCCGCAAAATACATC
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AAGCTAATTTACATTTGTTTCCAGCCCTACGAGAATTCTTCCGAGCAAAA
AATGGAAACTGTGCTTGTATTGAGTTCTCATCGGGTGAGCTGACAAGGGA
TATGGGACTGCAGCAGGGTGAAAATGAGCGACTAAAAATAGAAATGCAGT
CGGCAAATGAGAGCAAAAGGTTTGAGGATACTACAGAAGGATCACAGGGT
GGTTCTAACCGGCACTTAAGCAGTGCTGGTTCCCTTGTTCAACTTAATGA
CACAACGGATGAGTTCTTTGATATCCCTGATGAATCAGAATATGATCAGA
GAGAAGCCATGTGGTCTTCTGATGAGAGCACACATGCTCCGGTGAGTTCT
TTACATATAGAGGAATTTGTGTTTGCATGACAGAAGGTTCTTATGTAATT
GATTTACTGTTCTTGCTGATTAAGATGGTTTTTTATTTCCATTTCATCTC
TAGAATGACTGGTTATTGATTGTTGTGTCCGTATTAGTATGCTTTAACCC
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GTGTTTTTCAATTGTTCACTGTTGCGTCGTCACATTGACTGTAACATGTG
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CGTTTCGAAATATAAGATGTTTTAGGTTTGTAAAGAAGATGTACCTAGAC
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AAATGTTGGAGTCTAGGTTAGCATAGTAGTATTGTCCTAGGAGAGTCTAG
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TCTGAGTTAGTGTAGTAGTACTACTCTTGTAGAGTCTAGAGTATTCTAGG
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TAGTCACCTAAGCGGCGGGAGGCCGCATCCCGTTGCTCTCTACAGGCAGT
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GAGAAACTGGATGTTGAGGAGGACCTCTGATCTGGTCAGAGATGGGAAGA
TGCAGAGGTGATGCTGATGGCTGGAGCTGTGTGGTGCTGGGCTGTGGTCA
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GGAAGAGGTGAGCTGCAGAGCTGCAAGGTCTGGAAGCCTGAAGCGGAGGT
ACAACCATACAAGGGAGTGCTCCCTGCAGGTGGTTGCTATGATGTTGCTG
GAAAAGATTCGGTTTCAGGAGGAAGAAGGTGTTGCTGCTGTGTTGCAGCA
GAGAAAAGAGGAGTCCAGGAGGGGGCAGCTGCTGAAGCTGGTGTGAGAAG
GCGTATGGTTGGAGAGGCAACAGTGGACCAACGCGAGAAGGATTGGAGGT
GGCTAGCTTGATGCAAAGTTTGTGCATGGTGATGTTGATGGTGAGGCGGT
TGTGGCTCTCTAGGAGTTGTTGTTGAGGTGAGGCAGCTGTGGTCTGCGGG
AACCTGAGTTGATGAAGAGGCAATGACGATGCTCAAGCTGATGATGGAAG
GCGTGTGGTGCCGCCATTGTAGGCGCCGGTGTGAGAAGGCGCATGGTTGG
AGAGGCAACGGTGGACCAATGCGAGAAGGATTGGAGGTGGCCAGCTTGAT
GCAAAGTTTGTGGATGGTGATGTTGATGGTGAGGCGGCTGTGGCTCTGTA
GGAGCTGTTGTTGAGGTGAGGCAGCCGTGGTTCCGCGGGAACCGGAGTTG
ATGAAGAGGCAATGACGATGCTCAAGCTAATGAGGGAAGGCGTGTGGTGC
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ATGGACCAATGCAAGAAGGATTAGAGGTGTCTAGCTTGATGCAGAGTTGT
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TGAGGGCGAGTGTTGGAGTCTAGGTTAGCATAGTAGTATTGTCCTAGGAG
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AGATTGTGCTATATATAAAAGAGGATGTGGAGGTCCAAGGGACCAACCAA
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GTACAAGAAATGTTAATGTCACGATGTTTGCATAATTCAGAGTACCAGGG
CAGAACTCTCACATAGGTTTTCTACATTCATGTGATTAATATTTGGCATG
ACATGGCAGGACCAACGGCATGCTAAATTATCCGGTGCTGCTGTCTTCGT
ACGAAAGTTGCATGATCTTGCAGGTGCATCATGGCTGCTGTATGTCTACA
GTTTTCAGTATTTTCATTTATTTTTGGTTCTAACTATTCTCATTTCTTAT
ATTCTAGTCCAAAAGAGAGGGTATGTTGATTTACAGGGAGCTGCAGATGC
TGATAATGGGCCATGTTACTATGGAAATACTCTCCCTAAAGATTCTAGCT
GTACAATGCCTTCTAGTTGGTCAATGACAGATCCTACAACATTCTTGATA
CGGGGAGAATCATATCTGCTTGATCGTCATAAGGTGGCTTACTACTGTTT
TATTCTAATTTACTAGGCTGGGATGCAAGTCTTTGGTCTGCAGAATATAA
GGGATCATATATTTTACAACGATAGTCATCTTTCACTAATCCGGTCAACA
TATTGACAGTCTGGGTTTGTGTACATCACTGTCCATAATGATGAAATTAT
CTGTAATTTTGACAGATAAAAGCAAATAGTACACAAATGCAAATGGTAGG
TGCTGACTGGATAAAATCTGATAAGCGTGAGGATAATCTCGCTGGTCGTC
CTGGGGGCCTAGTCCAGGTATATTCTACTGGAACCAGTAATTTCCCTTCA
AATGAAAAAAAAACAAAAAAAATCACAACCAATTTTCTTGCAGAAATATG
CAGCACAGGGAGACAACAAATTTTTCTTCATTGTAAATATACAGGTGGGA
TTTCATCAGCTTTGTATGTGTATGGAGGCTTCTTATGTCTTTTACTTATA
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GTATTATATGATGGATACTCCATTGGAAAAGGTTCCCCTACTTGAAGCAT
TTGTAAATGGAGATGATACATTTAGAAATTCGAGGTTCAAACTCATTCCT
TATATATCAAAGGTATGTATTTTCTTCCACAAGACCTTTTTCGTTTTAAA
CAGAAAGCCATGATGGTTTATGTTTGGAAATTCTGAATGTGTCGATTCAG
GGATCTTGGATAGTGAAGCAGAGTGTGGGCAAGAAAGCTTGTTTGATTGG
TCAAGCGCTAGAAGTCAATTATTTCCGTGGAAGCAACTATCTGGAGGTAC
GTCCTTTGCATGCCACTAGGATTCAGTTTCTTTGATTCGATTTCTGTGGA
TAGCTGGCATATTTTGCGTAGCTGGCGTATTTTGCACACTTGTTGTGTTC
AAAAAGTCCGTATATGTCTGAGTTATGTTCTCTTTGAACGGTGTAGTCGC
TAGTAATAATTGCTTCAATACTGGTCAAGATTATTTTGCCTTTTACTTGT
CTGATTTTGTTTCAAGATTTCTCCATGGAACAAAATCTGACTGTACTACT
CCCTCCGTTTCAAAATATAAGATGCTTTAGGTTTGTGAAGAGAATGTATC
TAGACTTATTTTAGTGTGTAGATTCACTCCAAACATGAATGAACCTACGA
AGTCTAGATGCATTTGCTTCACAAAGCTAAAACATCTTATATTTTGAAAC
GGAGGGAGTATTATGAAAAGGTAACTGTTGGTTGTTCACACCATAACATA
GATTGCAGTGGTCTTTTGCAATCATAATCTGCTACGTGACATTTTGTGTG
TGATTATTTAAAAAAAACATTTTGCGTGTTTTTGTGTTCCGCCCAGAAAA
CGAATTTTGTTTACTGCCCAGTAAAATTGAAATAATTAGCACTGAACATC
TTGAAATGCAACCCTTTCAGCTTGGAGTTGATATAGGCTCATCAACAGTG
GCACGAGGTGTAGTGAGCCTTGTGCTTGGGTACTTGAACAACCTGGTGAT
TGAAATGGCCTTCTTGGTACAGGTACTTGTCGCATACCTTTCTACAGTAG
TTTGTTACATACATTCTTGTTCTACTCAAGATTGAAAATGGATCTTGATT
ATAAGCATCCTTTCGTCCCTGCCTCATGCAGGGCAACACACAAGAAGAGC
TCCCTGAGTTCCTTTTAGGGACCTGCCGACTGAATTTTCTCGACGCCTCC
AAAGCTATATCTCTAGACGAATGCTGATATCTGAAGGAGGCGTGAAGCTG
ACCCAACTCCTTTTCGAAGCCCAAGTACAGCAAAACAAGACCAAAAAGGC
TCAAGTCATTTCTTGAGCCGGCCACGAAAGTATGGGCCTGGATTTGCCGC
AGCATTGTACATTCATTCATTTCTCGTTTGCTGAGAGAGAGGTAGTATTA
CGTTGTAATGATGACTGTAGTCTACTACTACGATACAAAGCCTTCCACTC
TTTGGCCGACAACTCGTCATCAAATAAAGATTCAGGCAAAAGAAAAGTGT
ATTCTAACC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.