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GrainGenes Sequence Report: AA007943

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Sequence
AA007943
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA007943
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGAGGAGGTCCGGTCACAGATCGGCGAGGCGTTCCGGCTCGCCGGCGA
GCTCATGGACGAGCTCCCGACGGCCCAGAACGACCCGGCCTACCTCGCCG
CGCGCTGCCACGGCGTCGTCCACGCTTACAGCACGGCCATCCGCATCCTG
CAGCGCTACGGCGCGCCGCAGCAGCTCGCCGGGGAGCCGCTGGACCTCCT
CCGCCTACGCAGCGGCAGCGGCACGGAGGAATCCGGCGTGAGCCGGTTTC
CGGTGGAGCCTACTACTCCGGCCCACTTGCGTCACCTGCAGGAGGAGCCA
TTCCACGTGCCGGCCGACGTGTTCGGCAGGCTAGCGCCACCGCATGCGAC
GCGCGCCGCCGGGGCGGACGTCGCGAGCGCGTCGGGCGGCCTGCTGAGGC
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TGCAACTTGCCATGGCACTACTCAGACCATCTCTAACTAATTAGGCAACA
CCATGCATGCATGGCAAATGTTGATTTTTGGTAGTACTATCACAAATTTG
TCTAAATTTAGATGTATCTAGACACTATATAGATGTTCGAGAATTTGTCT
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GGTCCCATATATTAGTATCAGAAAATTATTAATACCTGCGTGCGTGTTTT
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ACTCTTCACCCTACCCGATGCCTCCGCCGCCACCGCGACCACCAACTCTC
CGACCACCGTCGCGACAGGCTCCGCCCTCGGCCCTGAAGACCTCCTCGAT
CACCCGCAGTCTACCGCGCTGTCCACGTCCATCCACCTCGGCATGAGTTG
GATGCCGGCAAGCTTCCAGAGCATTCAGGCCGCCATGGGCGCCGGCGCTG
GGAGCATGCCAATGGATGTGTCCACCGGAGGGAAGGACACGGACTACCCG
GCGCTGGACCTCGCCGACGTCATGTTCAACTCCGGCTCTTGTAGCGGGGG
CAGCAGCATGGAGGGCCTCTTTTCTTCTCATGATCGACGTGATTTCTAGG
ACAACTGCTATATCCAGCAGTAGATGTGGATTATTCATTCTAATATAGTC
TCTCATTAACTTATTGTATGCATATAGCAGTAGGTAAGGAGTAGATATTC
ATGTTTCCTTAATTTGTTCTCTTTTAACCCTTTCCTTCAGTTAGTTCTCA
TGCATGGCTAATAAAGTTGCTTGATCGCATGTATAGTAATTGTGAGTCAA
GGAGGTTAGGATACGGATATGTATATGTGTAGAGATAGACTAGGACCCTC
ATCATCTTGTACTCCAAGTCGCTATCTTTCCCCGTGTATCTTCATATATA
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AATTTCTACAATGACAATTGGGCTATGGGGCGGTCAGAGCGGAAAATCTC
CTTCCCCATAGCGCGTTTTCATCCGGCGAAGGCCATTTTTTGAACCAAGC
CTGAGGAAGGGGGAGCGGCGGCGTCACGAAACGCTTGCCGAACATGTGGC
CCCGCCTTGGTAGTGAGACAAAGGCGTCGTCTACCAAGCCTTGTCCCTTG
GGCCGCGTTTAAGGATGTACCGCCGGTCAGCCTTGCAGTCAATGATAGGC
AGCAGCCGACATGTCCCATCAAGGGGCACGCGACGACTTTATTGCGCACC
ACCACGCCTTTCCCCCAATCCACCACCCCTTCTCGCCCTTTTCCCCATCG
GCTATCGATATCTTGCCCCCAACTCGGCTTGCAGCATAGTTATGTGCGAG
CTGCAGGCACCATCGCCACCGCGCGACATCCTGCGACCTCCTCAGGCCAA
GAAGGAGCCTGAATCTTCGCGGGTGAATAAGAAGTCAGAGCTGGTGTGGA
AGCCATCGCCATAGTACACCGCCCGCCAGCTGCAGTTCCATGCCCCCAAG
GACCTGGACGCGTTCCCCCACCAGAGGATGGTCGAGAGCGCCTCCTTCGA
GGAGGTGCCACCATCGTTGTTGGAGTTTGCCATGGCCTAGTCGAAGGCTG
GGGCATAAAAGGAGAAGGTGGATTGACGATGCCAGGCGTCGGAGCGCATT
GCGCTCACTACAAGGAATCTGCTGATACATGACCCTCCATTTTCGTCACT
GAATCGTCATTGTCTACAATATATGACGATCTTATGACGAAAAACAGATC
GTAAAAAACTGAGCGTCTGTAATTGCACACAACGACGTTTTTCACGAAAT
CGTCATAACCGTCTACAACGATATTTGATCGTCATAACCGTTATGACGAT
CCGATATCGTCACGGGCAAACTGGCCTGGCCAGGTCAGATCCTACGTGGC
AAGAAATCAGCCCAATCCACTTCAGCTATTTATATGGACCAAGCCCAATA
ATTCAATCTGTTTTTATTTTTTCATATCAGTTCTCTTCAACATACTACAT
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AATAAGAACACTAGCCGCCCAGATTTGCTTGGTGATTCCTGGATCGGGGT
TTGGCAACTCCATCAAGTGGATCATCTCGGAGCCAACCCAGAGCCAAGCC
CCCTTGTATGGAAGCTTGTCATTTGGCCTAGCAAGATTCACCTTAAGACC
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AAACATATACAACTTACAGTAACTCACCAAGGATGTCCTGGTACAAGGCT
ATCGACCTTTCAAGATTTTCACATAGTATTCCAACATGGTGAATACTAAC
AACTCCATAATCAGGTTCTGCATTGAACATCAGAATCATTTTCATTCAGG
CAGAGGAAAATCATGGAACTTTGACCCAAAACTTGGTTGTGACAGGTAGG
AATGCAGTATGCTCTATGACATTGTGCAAATTAAGCTTTTGGTATTTTTT
CTTGTACTCCTATAACTTTTTTGATGCTACAAGTAGGCCTACCTATAACT
TTTTTGATGTTGCAAGTACTAACATGGTATTGTTAACATGCAAGCAAAAT
CTAGTGAGCACAATCTAGTGAGCACTAAAATTTCAGAGAAAATGGACACC
CTGAATCCAAATATATTGACCAAAGTCAGCACTATTAGCAACCCGGCTAC
TCTTTTCTGTTGAGCAAGAATCTAGTGGATGTAGCTACAATATTGCTAAT
TCCCGTTGGAGGCTACATATTACTTTTCGGTCCTTATCTAGACTGGGATT
TGGCCATGGTTTCATACACTACATTACTTTTTGGTCTTTATGCGCGCGGA
TCATTGCCTGATTCACATTTCACATCAGTTTGCCAGCCATTTTTTTCTTT
TTCTCCATACCCTCGGAGCACACTTGCAACTTGCCAGGGCAAATTTGTCT
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GAATAATCAATTTTAAGGAGTCCACACACCTATGATGGGGCACTGGCGGC
AGCGCGCGCTCAGGCGGAGCGCGAGAAGCTGACAGTGCCCCAGACCTCTA
GCAGCGTCGGCTCACAAAGTCGGGGCACTAGAGGGAGTGGTCCTTCTAGC
CAGGGGAGCGGTGAGGCTCCCTCTGTCGTCCCCCAGGTGGGGGGACAGCG
AGGGAGGCCTCCTAAACCCGTGTCCAAGTCCTCGACCTCTGGTAGGGCTC
GCTCGGCTCTGCGCAGTGGGCCAAACCCGACGGTGTCCCAATGAGTGAAG
CAATCTTTGCCTTCATCTGGAACATCCGTGGTTTTGGCCACGATGGGCGC
CGCCAACAACTTCGTGACTACTTGAGGCAGGAGGATGTGGACATTGTGGG
CTTGCAGGAAACGATTAGGCAGGACTTCTCGATCCCGGAGTTGCAGGGAT
TGAGTCGTCATAGTTTCGTCTGGCACTGGCTGCCGGCGATTGGTCTCTCC
GGAGGGATCCTCCTTGGGGTGAAGGAGGACACCTTTGAAGTTGAGGATAT
GGACCGGGGGGAGTTCTTTGTGAGTATGTTACTCACCCACAGACGGAGTA
ACCTCAGTTGGGAGGTTATTATTGTCTATGGCCCCGCGGACCATAGGAGA
TCCCCAGCTTTCTTGGCAGAATTATCTGCCAAGGTGGAGAGCTGCTCCAC
CTCTGTGGTCGTGGCCGGGGACTTCAATTTAATTCGATCTCCAGAAGAGA
AGAGCTCGAATAATATTGACTTTCCTCGGATGCGGCTGTTTAATGATTGT
ATTGCTGACCTTGCCCTCAGAGAGATCGCTCGAGTGGGGGGGGGGCGGTT
CACGTGGACCAACAACCGGGTTGACCCAGTCCGGAGCGTGCTGGATAGGG
TCCTACTCTCGGTTGATTGGGAGCTTGCCTATCCTCTATGCTCGCTGCGG
GCGATTACGAGGATCGGTTCGGACCATTGCCCACTCCTGCTCTCCACTGG
AGGGGGTTCGCCCCCGCCCCTGAATCGGTTCCACTTTGAGAACTTTTGGC
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GTGGCCTCAGTTCCCCAGGTGCGCTCGGCCATAGACGTCTGGCACTTTTG
TGCGATGATGGCTCGCCAGTTCATCCGGGGGTAGGCTGCTAACTTGGGGG
CGGACTTGAGACGCAGGAAAGGTGGTCTCATATCCGCTCTAGAGGCCCTA
GACCGGGTGGCTGATGCCGGGGGCTTATCGGCTGAGGACTGGCTCCAGCG
ATATGCGCTTGAAGACTCCTTAATGGAGATTTTTCGAGGCGAGGAGACGT
TTTGGCGACAGCGGAGTCGGCAGAACTGGCTCCTTAAGGGGGATGCGAAC
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CCACCCATATTTATTCCTTCTACAAGGAATTATTCTCGGCAGCACCCCGT
TCAGGGGTGGCATTAGCTGCGGACTTCTGGCCAGTTGGGGCCATGATCTC
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CTTCCGGTTGTCTTCTTCCAGAGGTTCTGGGAGAAGATACAGGGGTCCAT
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TGAACTTTGGCGTTATTACCCTGATCCCCAAGATTGTGGGGGCCACGGAT
ATTCGCCAGTTCCGTCCAATCACTGTTATCAATGTGATCCAGCGGATCAT
ATACAAGGTGTGCGCGCGCAGGCTTGCTCCCATTATGGAGCGTCTGACGC
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CTGGCTCTGCATGAAATTATTCATGAGGTCAAGGTGTGTCGCTAGCAGGG
TGTCTTTTTGAAGCTCGACTTTCAGAAGGCCTATGATAGGCTAGACTGGG
CCTTCCTCCGCCAAGTCCTCCAGCGTTGTGGGGTGGATGATCGCATGATC
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TGGGGAGGTGGGTCCCTATTTCAAACCCTCCTGTGGGGTTCGTCAAGGGG
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ATCTTGGAGCAGGCCAAGAATTCCGGCCACATCTCAGGTGTGGTTCGGCA
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TGATTATGGTGGCGGGATCGGAGCAGGATATCATTAACTTGAAGTTCCCG
CTCCTGTGCTTTGAGGCTATGTCGGGCCTCAAGATCAACTTTGATAAGAG
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ATAACCTTAACTGCCGTTTGGCGGTCTTCCTCCTAAACTATTTAGGGATG
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GGAGCTCTCCCGGTTCTTTTGGATAGCCAATAATGGTCATCAAAAGTATC
ATATGGTGAAGTGGGCTGATATCTGCACCCCCAAGGAGCTAGGGGGCTTA
GGTATCATAGCGTCCCGCCACATGAATGTGGCGTTGCTGCTTCGATGGGT
GTGGAGGATCCTGAAAGATGATGGAGGCCTTTGGCTACAGTTGATTAAGG
CGAAGTATTTGCGGGGCTGGCCGCCGCTGGCTTGTGATCGTCGGGAGGGT
TCTCAGTTTTGGAGAGCCATCCAGGACATCAAGCCAGCTATCCGGAAAGG
GTTGTCTATTTCCATAGGCGATGGTAGGGATACCCTATTCTGGCTCGACC
CATGGCTCAGCCATCTCCCTCTGCGCCACGAGTGTCCCGAGTTATTTGCA
ATCTTCTCTGACCCTACTATCCTGGTTGGGGAGGCCTTCCACGGTGGGTC
GTGGCAGGTGGCTTTCCGGAGGAACCTGGGGGAGGCCGAGCTGGCTTCCT
GGGAGGGGCTGAGGGACAGTCTTCCGCTGTCCCTGGTGCAGTCCCCGGAC
TCCCATGCTTGGCGCCTCTCTCCCTCGGGGTTCTTTTCGATGGGCTCGGC
CTACAGGGCCCTATTTAGAGGGCCCGAGAGGCCATGGGTCTCACCATTGT
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GTGACCGGCTTCCCTCGGGTGTGGAGGTGGCCAAGCGGCAAGGGCCTGGT
AATGGCCTTTGCCCGTTGTGTGCGGTCCCAGAAACGGGTCTGCACATTTT
CTTCTCGTGCCCCGCTGCTCGCTTCCTTTGGAACTTTGTTCACGAGGCCC
TGGGGCCTGAGTGGCAGGCCTCAGACCTTGGAGAGTTCCTGGAGGCCGCC
GCAAACCATACTGGGAGGAGGAGGCGCCTCTTCTGGTTGATGTTTGCGGT
AATGACCTGGGCTTTATGGAACATTAGGAACAAGATGGTCATTGAGTATA
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GATGTTGGAGCACCTGACTGCGGCGGCTCGCCGGCTTGCTACTTCGTCCG
GCCCCTGAGGGCCCTTCCGGATGGTGGTTTTTATCTTGCTTTCGCTATCT
GTGTTTGTGTTGGTTGGCTTACGCCAGACTTAGGCCATGCCTGGTCCGAC
GGTGTGTGGCCATGTGTGTGACCGAATGTATGTGAACTTCTGTGTGGTGT
GGTTGTATGAACTCTTGTATGGATGTTGCTTTATCTATAAAGCTGGGCGC
CAGCCTGTTTCGAGGAGGAGTCCACACGTACTAATGTAACACTAACGCAA
AACAGCTATGTGCATTTCTGCAATACACAATTTAATATTAGTTTTTTTTC
ACAGACGTAAATTTGTTTTAGGTCGCCACGATATTAGTATCAGAAAATTA
TTACCACAAAATTATTAATACCTGCGTGCGTGTTTTAAACAGGAGCTACT
ACCGGTGCACTCACAAGAACTACTCCCTCCGTTTCGGTTTACAAGTCCTA
CGGGTATATCTAGGTTATTAATTTGACCTATATAATTTAAATTATATAAT
ATAAAAATTATATCATTGGAAAATACAAAGTCTAAAGTTTCCGGTGACAT
ATTTTTTGTAATATATACATCATACTAAGTTGCTTAAATTGGCGACATAG
AACTACGTGCAGGACTTGTAAACCGAAATGAAGGAACTACTATGGAACGC
GAAGAAGAAGGTGCAGCGCCTGGACGACGACCCCTTCACGTACGAGGTCA
CCTACTGTGGCGACCACAGCTGCCTCACGTCGACCACCCCACTCTTCACC
CTACCCGATGCCTCCGCCGCCACCACAACCACCAACTCTCCGACCACCGC
GACAGGCTCCGCCCTTGCCCTCGCCCCTGAAGACCTCCTCGATCACGCGC
AGTCTACCGCCCTGTCCACCTCCATCCACCTCGGCATGAGTTGGATGCCG
GCGAGCCTCCAGAGCATTCAGGCCGCCATGGGCGCCGGGGTTGGGAGCAT
GCCAATTGATGTGTCCACCGCAGGGAAGGACACGGATTACCCGGCCCTGG
ACCTCGCCGACGTCATGTTCAACTCCGGCTCTTGTAGCGGGGACAGCAGC
ATGGAGGGCCTCTTTTCTTCTCATGATCGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.