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GrainGenes Sequence Report: AA032480

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Sequence
AA032480
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA032480
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GTCGATTTGAGCAGATCAGCTAGGAAACCGAGACGCCTAGCACTGCCAAA
ACGGCAAAACCTCGTCCACACCCCTCGTACCCTCGCCGGAGTAATTAAAC
CCTAAACGATGGGCGCAACCGCTGTAGCCCATCTCGTCACCTTGGTGTTC
TTCCTCCCCGTCCGCCTGCTCTCCCTCGCCTTCGGCATCTGCCTCCCCAC
CTTCCCATCCACCGCCCCGGCGCACCGCGCCGGCCTCGCCGCGGTGCTGT
TGACCACAGCGGCCCTTCTCACCGTCATATGTGTCATACCCGCCGCGGGA
TCCAGCCTCGCTTCCGAAGCCGAGGTCCTCCGGTCGGAGATCAGCGAGCT
CAGGCTCAAGCTCACGCGGTTGGGTGAGGCACTTTCCTGCTGTCACTAAT
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TTATAGTTGTGATTATTAAGTGTATTATTGGTTATGCTTTATGGTGCAGA
AACAATTTCAACCTAATTTTTAATTTGTCACCCTCTCAAATATATACAGT
GGTTTACAAATTATGCATCTTTTGGCCATTTATTTTCTACTTTCTACTTC
AAGAGTACAATTCACAAGCTTCCAAGCTGTACTTAAAAAGATAATTTATT
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TTTGGAAGTGGACAACAAACTTACTGAAGCAATGGAATATGGCGTGCAGG
TTTTAATGAATGAAGAAGAGAGTTCTGAGGTATGTAGTTCGATCAGTAAG
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TGGATGTGATTTTGCTGTCTTGTGCTTGATACCATCAACCATCACTCTTC
AGCACTTGCTGTTATGGTTTTTTATGCCCTCTCATAAAGAAATATTTGCT
TGAGATGATAATTACTCTTGTTTCTGGAACTTTCTTGTCAAATGATGTGT
ATAGTTAATTTACATGATTTTCTTGCATGCACTAATATTTACACTCTCCG
TGTACAGAAATTTCAAAGCAAATTCTACTCTGAAAGCAACATTTATATAA
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TAAAAATTGATATGAAATGGGAGATATGTATGTTTCCACATGGAGTAGGT
TCTTACAGATAAAAGGGTATACTACAGATAATTATGTATGCATCTGTTCC
GCTGGCCATTTTGGAAAGCTGGCTAAGATTGTATACACATTCTCAGCATA
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GGAGAACTCTTCATTCAACTCATGGCGTATATGCTGTACAGGTGGAAATC
CTGCAGCAAGAGGTCAAAAAGATAAACACCATTGCTAACACCATAGAATC
ACTGGCAATTGATGCCGAGAAAAGGGTAGAGTTCCTGAGCTCAGAAATCA
AGAAGGTATGCCCTAACTGATGTTCTTGTGTAGACAACTTTTAGTTTATA
TTTCTCCACTCATGCTTCCTGATGCTTATATTTTGATGGGGGAACATCAC
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TAAAACTATGCATGACATTAGAAGGAAAATACATATGCAAACAATTCAAA
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TCTTAGCAGTCTAAGATCGCCACTGCCACAGCTCACATTGTCCCAGTTGT
TTTGCTTGACGGGAGTGAGAGGAAACTATGTCAGTTAGAGTATCATGATT
ATTAGTTGAAGGGCAAAATTATATGTGTGGTGGGGTACCTTCTATAATAG
GTTATCTACTGAACTAGATTAAAGCGTATTTAATAAACTGATATACATTT
TTCTGCATGATTGATCACCTCAGTTTTTATGTATGTTACTAGGCCTTTTT
AAACGAGCTAAATACACCACAAGTCCCAATAGTTGTCTAATAGGTGCATT
TTAGTCCCACTAGTTGTAAATTAGGGTGAAGTAGTCCTAATAGTTGCAGC
ATGGTGCAAAACTCATCCCATATGAGTCTGGTGCTGACACGTGGCTGTAG
TTGTTTTGCGAAAACAACCATACAATTGTCTGACTAGCAACTGTGACCAG
CGGATGTGGGCTCCACCCGTCAGAAGAGGTGAAAAAGGATTCTAAAATTG
TAGGGGAGGATGAGGATGGGTATCGAACTCGTGACTGCAGCTGCACCCGC
GCGTCTCTCTCATTACAACAAACACAGTTTTCTGTCAAAATAAGAGACAA
CGTTTTATTATACATGGTTGTCCCGCCCAAAACCAGCGTGTCGACTCGGA
ACCCGGCGCATGACGTTCGTGGCCAGGCGCGCGTGACATTCGTGGCCATG
TGCACCGGCGCTCCAACTACTGAGCCCAACCTCTGTCGCGATTTGCTCAA
TCCGTGCAATGACGAGGCCCACATTATCTTGGTCCTGGACCAGTTCAACC
GTGGTGGAACGAGTAGTACATCTAGGACGTGTTCGACCCCTGCTCTGTGC
TCTCCATGACATTCTTCCACACGTCGGGTAAAAAATCTCCGACGCCGCTG
AAGTTCCTCTCCACACCGGCAGGCGGCAGTAGAAGCTAGCGCGACGCACA
ACAGACAACAGAAGCTGGTGCGTACGAGCAACAGCCAGAAGTAGTAGGAG
GAAGAAGAGGCTGTTCAGGTCGGCCCATGCCCTCACCGCTGTGTACTGTA
GCTGCTTCTATTTGTTTTATCAATATATCCTTAGCAGGTTTATAATCTGC
CAAAAACATGTGAGTTGCTGTTTTTTTTCTTGACCTGGAGTTTCTGTTGT
TATTACGTCGTGTCTACAACCTACAACCTAACGATTGCTGGTTCCAATCT
TCCCTAGCGCATATAGTTTTAATTGTTTGTACCTTCCTTAACAGGTGGGA
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AAAGGGCGTTCTTGCAAAACAACCACCACCACATGTCACCACCTGAGTCA
TTTGGGATGAGTTTTGCACAGTGTTGCAACTATTGAGACTACTCTACCCC
AATTTACAACTAATGGGACTAAAATGCACCTACTGGACAACTATTGGGAC
TTATGGTGTATTTAGCTCTTTTTAAACAAATGACGACATCTATTTTTGCT
ATTTTCAAACCAGATTGATAATATAATTGCAGAGCAATGGATCCAAATTC
GGCAATTTGAACAAGCATTTGTGTTAACTAAGGTATTCATGATTTGTTTT
CTTGTGCTATACATATTTTGAAAAACTGTTCATTTGTTGAGTGAAAATAA
TGCAGACGATGACTTCAGAAGTTTACGCAAGAAGGTTATCTGCGAATGCC
TACAAGTTGTCAGCAAAAGACATAGTTTTGAAGGTACTTTTGCAGTTTGT
ACAAATTACAGTTATTATAATGCATGATTTCAATCCATTTGTAGACAGTG
GCTGCTACATCTTGGATCTCTACTCCAATCTGCATGATTTGCGAAAAATA
ACTCCAATCTGTATGTATAATAGTAGTATAGTATGTTCTCTTTGCTGAAT
TTTGTGCCTTTTCTGCATCATTTAAATCCTGTAACTATTTCAATAACTTA
GGTGCAAAGAGGCTGAAGGAAGTTCTCTTTCCATTCCAACTAAACTAAGT
GAAAAAGGGTCCTGAATGCGTCTTCTTGCTCCAGCATTCAAGTTCCATTT
CAAGGGAGGATGTCGTACCATCGTACTTTCTGTTTTGTCGGGTATGAACC
AGTCTTGCGAGAGTAAAATATAAAGTAATATCTTGAATCATGTTTAACTG
TTTCAAAAAGCATGATGAGCATCACAGACGGACACACCCCCAAACAAAAC
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AGGGACACGGCCAAGCACCACAATCAAGGACACCCTTGCCATGCTGAGAC
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GGCAATGGAAGCTCTGTTGGACTCTGGGACTCTCCAACACCTACTACAAA
AAGTTCTTCCACCACGAGGCACCAAAACCTCCATTGGAACTTCCAACACC
TATTGCTCCCTTGGCAAGGCCTCGAGCTAGAGCTTTACAACAAGAGGTTG
ATCTTTTCCCTGAGGTTTGTGCATTTCACATAGAAAGGATGGTGGGCTAC
CCAATGGATGGGCACTTTCTTTGCTCAGGTGTGAAGGAACACACACGGGG
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AATTATCAAACTCGACTGTGAGCCCCTGCATCTCCAAGCCTACTTCGGAA
CCTTCAGGCTGCGCACCCGGAGCGAACGGAATAAACAGAGGCCCTCCACG
GCCAGAAGCCCCCTCGGAACCTCCGAGTCGTCTACATGGAACCGCAAGAC
ATTAGTGAGCCTCCCCACCTCCCAGATCTTTTTAGAACTTCCGATCCACG
CAATTGGAATCACTAACCACATCTTTGAAGAATCCCTGTGTCAAGAACAA
CCGGACCACCGCCAGGAACCTCCAGATCATGCCCTTCCACTTCTTCCCTT
AGACACAGATATGATATTTAAACTTATGAGAGCCAAGTACCTCAACCTCC
AGGACTAAGACCTCTAAGGAGAATAACTCTTCCCCTTGTTCAACCTTCGA
TCTTGAATTTGATTGGATAAACCGATTGGTTGAGGGGATTTGTTTTCAGT
TAAGAGCTTTTCTTGACTCGACTTCATCTCCGAGAGGCTATCGAGTTGGA
GTATGTTGTCGGTCGTTCTTGATTTTCTAGGCTAGTTATCCTTCCAATTC
GTGAAGATCAAGAGCCCCTCCGTAGCATACAACGTGACCCACACAATGAC
AGTTATAGAGGCACCGACAAGCTGGAGCCTGGAGGAGGAGCACAAGGGAC
ACAAATGCTGTGAAAGCACCTGTTAAGTACCTCAAAAACCCTTTTATGCC
CAAGAATCTGCACGACCAAAACAACCGTGGCCGCCACCATGACGAGGAGA
GAGAATTTGTATACCATGGGAGGGGCGATCTCATCTCCTCTATTTCTGAT
GGCGTTGACAACACACCACTTCTGTTTTGCCGTTAAAAATCGTCGATATG
TCGTTGATGCTGCTTTGGACCGCTTTTCTGGTTCCCACATGACTCACCAA
GCACATATAGACTGCCTTACCTTTTGGAGCTTCAGCTCCAACTTCCACTA
CCTGCATGCTAGCGGCAACGCAGCGTGGCCAAGCCACCCACAACCGTAAC
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CAACCGTAACTAAACACAATCCTGGAAACACTCAAAATAAATGAGAGAAA
CCACCAAAAAGGTAATCTATGTGCTGTTGATATACAAATTTCGTGGCCCG
GAGTTTGGCCCAGAGCCTCCAGGTGACTCTAGCCAGAGCCTCCAGGTGAC
TCTAGAGCCAAATTAAAATCCTCCGCCAAGTTCTGCATCGTGCTTGTTGC
TCTTGGGGTTGTGGCCATTCCTAGACTATACACCGAGAGCTTCCAATATT
GTTAATTTTCTCCGGTGATGTTTGTAAAGGACTGAGATTGTATCTATGCT
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AGCTCTTTGGGTCCGTTTGGACCTCATATCCTCTCCAATGGCCCCAAGTA
TTTGAACTCTGGGCACAAATTGCCTCGTCTTTGAGTGGTGCCCTTTGGTT
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TCTTGTTTGCTAGTGTTATCACATTGTTGTATTTTTTAAAATGTATATAT
CCGCACTTACCTAATATCAACAAAAAATAAAAAATGTAATCTTATATTCC
TCATTCTCCCATTTTAATCGACATCCTTGATCCATTGCCATCCGACCTGG
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TTCAAATGTTGGGCGTTTGACAATGTTCATAGACCATCATACTTGTGCTT
AAATGGAGTCCAGTGGCTAGTTTGGAGAGTGTATATATGGACTGACACCT
GCTTGGACCCAAAACTCTTTGCCATTTCTAGGCCTCGTCTCTCGTGGTCG
TTGCCCGAGTGTTTCTGTTGATAGGTTTTCCATCGCTGTGAGAGAATCTT
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TATTGCTCCCAGTCAAGCACGATTAACTGAGAGGTTCTTAGAGATGAGCT
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TCGAGCCTTGGGCCAGGATGTCACAGTTTGTGCAGACAAGGAGATTGATA
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GTTAATATAGAGTTCAAGACTTGGAGGACAAGAAGCCTCTCTTAGAGAAG
GTAGGAGATGGATTAGAAATCCTATACTACCAAATACACATATCTCAAAT
ATACTCTAACACAGATTACATGGGGAGTAAGCATGTGGGGATTTAATACT
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ACAAGTTAATTGTGCGCTGTAATGTGTTAGTTAAATTATTTTGAATTTGG
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GTACTGATATATCATATCGACGTGTCATTTGTTCCTATTCTAATTTTTCT
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ATAAGATAGAACCTGTTAAGATTGTTGGATAACCTTGAACATCCTTCTAT
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TTGCAAAATAGTTTTGTTCTACTCTTTTTTGTGGGGATTGTGCCATGCTT
TCTGAAATATCTTTACTCCTTATAGGCTTCCCAGTTCAACAAAGCGATAC
GGCGCCAGTGCTCTGCTGATGTTGATAGGCCGAATGCCTTCTTCTTGGGT
GGATCCATCTCAAGATCATGCATTTCTCTTCCTTACAAGCAATTCAAGAT
TTCCATTTCATCAGCACAAAAGTTCCACCATAAGGTGCGAGTTTCTTTTT
ATTTAAACAAATACCGTATGTGTTGTGGCATTAGCAGCATAGAAGTTGCC
ATAGCTATTACAGTCCAGTCCAATTATTACTGCAGGATTAAACAATTAGG
GAAAATAGTAACGTGGGTTAGTTTAAATAGAGTCCTAGTTGTGTACTACA
GGTCTTGGAGTCGGTTATGGTCACCATGTCCCCTGGTTACTGGTCCTCCT
ATAATAGGATGTGTATCCTGTGTGTTTAGGGCAAGCAATAAACAATCTAT
CTATCTTTCCTGACCCCTCTAATTTCTCTCGATCTATCCCTGCTACCTTT
CTAATTGCCAGCAACAGCACCAGGACGATTGTGACCCACCCCTATTACCT
TCAAAGCTCCAACTGGCTACAACAGAATGATTGTGCCTTTCTTTACCTGA
GTTATATACATTGACTTTGGTATATTTTTAAATATTCTACTTCTATTTCT
TAATTAATATGTGGGATGTATTTTTGCTAATAGAGTTGTTTGGTTTCATC
ACTTGGTTGCCTGTATGCATCCTTTTTTTCAGTATATGAAGAAAGGGCGC
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TCCCTATCTGGAGGTTTACCCTGCTCTACCCTCTGGATCATTAAGATGAG
GTTGAGGTGGAGGTGTTCCGGGGAGGGACAGGAGGATCTCTTCAGGTGCA
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AAAAAGTTCACTTATTATTACACCAGAAAGACCTGATCCTGCTACCCTCT
TTCTTCCTCGAGCATTGTCCTGGTGCTGCATCTCCTCGTTGCCCACCATC
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GTTGTTTTAGTTGCTCCGACATTGTTGTTTTTTCGCTCTCATTTGCTCAC
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CTCCTTGCCTTTTAGGTGTTCTTTTCTAGCAACGCACATAATCCATGCTA
ATACCAATCAAACGGAGGAGTATGACTTACCTGCACAATGGGGCTTGAAC
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GTACACTCTGGTTTCCAAATTTAAGTCATCCTAGAATGCATTTCTTCAAA
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TATTTTTGTATACTATTGGTGTTGAGAGGATTACACCTGGAATACGTTTG
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ATGCACCTGACTAATTACACAACATACAACTCAGCCATCTGGTAGAAGTC
ATTTGTCATATTTTATTTTTATTTGTAGGTCCAAGTGCGTCTTGAAGTTG
CAATGAGATCCAACAGATATAGCAGACGTTTAGCAAATGAGCTGATCACA
TCCTTGTTGGTGAGTACTTTGCATCCACTCTGGTTTGGCGTATTCTGTTG
AACCATAAAATAAGAGTCGTTGATGAAACTGCAGGCTTATCTCGTCGTTA
TATCTCCAATCTGGATTGCATGGTTCCTTTTTTCACGGCGATTTGGCTCA
AAGATGTGAACAACTTGCCAGAGTTGCGCGGTTTTGTCTCTCTACTTTGA
CCTTGGATAGGTATAGAAACAGAGTTGAAAACCATGTAAACATGAAACAT
AGGTTGGCTTGTTCTTGCAACTTTTTTCTAAATCCTCAAAGAAAAGAAAA
CAATTCAAAGTAAACTGTGGCAAAAAAAATCATCCTAGTGGCTTCTTGGT
CCTCTCTGGCCCAGCCTTCATCGTCTCCTACCCTCGATGTCGCGTTCACC
GCGCTTCAGGTGCTGGGCAATGCTGCCCTTGGTGGGGACCAGCACGACGA
TGCCGTCTGGAACGCGCTGTTCCCCGTGGCCGTGGCCTCATCATCCTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.