Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA031235

[Submit comment/correction]

Sequence	AA031235
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA031235
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CCGGTCTTGCCTTTTCGTTTCGTCCTCCTCGTCCTCCTCTTCTTCCGCTT CCCCTAATCTCCGACAGTTTCCAATTTCTCATCTCCCAAACCCAAACCCC AACCAGAGACCGAAAAGAGTCGCACGCGACTTCGCGAGAGAGAGGGGAAA GCAGCAGACAAGAGCGAGAGACCTCCTCCTTCCCCGGCCCGCTCCAAACC CTAACCCTTCTCCAGATCTCGCGCCCGCCCGCCTTCCCCGACCTACCTCG ATGTGACGCGGCCCCTAGGGTTTGTGCCGGTGCCGCGTGGGGGGTCGGGT CCCGGTTTGCGGGGCGATTTCGGACCCGACGGGTTGGAGCTGGCGGCGCG CGCGCACATGAAGGGCCCGGCGCAGCGCACGAAGGTGGTGCTGCGGCGGC TGCCGCCGGCGATTGCGCAGCAGGCCGTCGTGGACCAGGTCGATGCGCGC TTCGCCGGGCGGTACGACTGGGCCTGCTTCCGCGCCGGTAATGCCAGGTC AGCGTTTTCTCTCCCTCGCTCGCCAAGTCTCCTGTGCGTGCGTTTGCGCG TTAGCTCTGGATTGGGGTCGTGGCTGCTTAACCAAGGAGTTATGGGTAGG CGACTAGCCCTGTCCCATAATTTTGGTAGGATTTCGCGGTGCTGGTTAAA CTGATTAGTTTAATTATTAGCAATTAGCTTGTCCATTTGTGTAAATCAGA TGTATAGCTTAAACAGTTGCCGTTATCTGGTTGCAGTATGTTATCCCTAC CGAGTTATTGAGTTGTAGTTATCTGTGATCACAATGTGGTGCCACTTACA GTATCTTGCTATAATTACGTGAAATCAGAATCAATTGCCTGGTGTAAAAT TCTGTTTAAAATTTGTGCATGTAATTTAGTTATTGCAATTGCAATATAGA ACTTATTGATGATTGTACCTGTAGTATTCGTGACGAATAGAAGTTGCCTT ATTAGTTCTGCAACTTTGTATGCTTTCTTCCAATTAATCACATCTCTTTA GTTTGTCGCTGACCTTTCTGTGGTTTCATGTTAGCTAAAAAAAAGTCTAT TTTAATGGGTGAGTAAAATGTTCATTTTTGCTTTCTCTTATGTTTGATAC AAGAGCCAGAGCCTTTTTTATCTTGTTTTCATCTGTGAATGTGTGGGATT TGCTTAGGATGTGCTTGTTATAACAATTTTTGTACTTACTAGTATTGTAC TTGTTTGTATGATGACTTGCTTAGCAATTTCATGTTAATTTGATGTCCTT GAGATTCTTTTCCTCAAAGGTAAGACTTCTTTAATCATTATACCTAGCAG TGGTAGCTAAACAATAATGACATTCTTGTTTGTCACCGTCTTTTTTCCAA TATGCAAACATGATTTGTCTATCCAGCCGAAAGAATTATAGATATTCTTG TTTCTACCTTAATTTTAAGATTCCAGTAGATGTTGAAACAATAGCGAGAT TCTTGTTTCTCACCATCTTTTTTTCAGTTGGCTAACATATTTTTGTTCCA GCCAAAAGAATCATCGATATTCTCGTCTATATCTTAACTTCAAGAGCCCA GAAGATGTTGTGGAGTTTGCTGATTTCTTCAATGGTCATGTATTTGTGAA TGAAAAGGGTAAGGTTTCCATTCCTGAGCAATATCTTTTTTTTCATTTCT CAGTATGCAGAACTTGTATTCACATTATCTCCCCTTGTTTCTGTGCTAGC TATGTTAGATCTTTGCAACAACAGTATTATTATGTACAAGATTATAAACA TCAAATGTTGATGCCATTCACATAGCCATTGAACTTGCATCACCTTGATT AGGCTAGCTAGCAAATAAATATTGGCACATTGCTTTCGTCCTTCTAAGAA GCAATGCTTACTCACCCAGTTGATTTTCCCTTTAATTCATAAGCAGCGCA AAAACAATACAGAATGAAGTATGAAGAGACTAGTGAAGTACGATATGAGG CACTGGTTTCAGTTGAAAAAACTCCTTGTTTAGGCCATTTAAAATTTAGA AGTGACACCACTGTTGCTTTAAACTGAGCTTCTCCAAATATGAAATTAAC CATCAATTTCCTCTTTATATACGTTTCCAATAGTTTCATTCCTACATATA CCAAGCTAAGCCTTCTGTGCTCATGGGTCGAGACTTGTTGGTCAAGTATT GGAGGTGGTGAATGAAATCAAGTGCTACCCATGTTAAATTGTTGGGATGG GGGTATTTAATCCATATCCTGTTAGGCTAGAATTGATCAATACCTTTGCT ATAAATTTGTAATTGATTTACAATTTTTGTAACACTCGATTATATATTTG GTATCCATGGTTCTCTGCCAGGTGCTCAATTTAAAGCCCTTGTGGAATAT GCACCATCACAACAGGTTCCGAAGTCAAATATCAAGAAAGACGCTCGTCA AGGAACTATAGCGAAAGGTCTTAAATAAACTTTTTTCCAATATGTACCAT ACTTCCATTTTTTTATTTTTTTACGGAGTTAATGTATTCTGTTGGCAAAC AATTAGATCCAGAATACTTGGAGTTTCTTGAGCTTATATCAAAGCCTACC GAGCATTTGCCAAGTGCTGAAATTCAGCTTGAAAGGAAAGAAGCTGAAAG AGCAGGTAAAACATGTCATTATTTTCTATTTGTAGTAATACATTCTTGCT TCATTAGTATACGTATTCAAAGATGCCAAGTATAAAAGAAAGCCATGCCT TTACTTGGTTACTATTGCAGCTGCTGGAAAGGAGCCACCAGTAGTGACAC CTCTCATGGTTTATGTTCGTCAGCAAAGGGCAGCTAAGAGTATGGCTCAG GTACATTAGTTCAGTTGATTATGATATTGGGTTCTATAATTGTTTATCAA CTATAGGATGTCTACTAACTATCATATCATACACCGCAGAGGTCTGTAAG CAGTAGACTAAGCAGAAAAGTTGCAGGTGTGGTAACCAGCAGTTCTAGTC CTTCTAAAAGGGCCTCTGAAAGGCGCAGGGCCTCCACTTCATCGGTAATA TGCTTGGTTGGAACTTGCTGAAAATTTCTATTGTCAATGAAATGTATCTT ATCATTTCGTATATAAGCTTTTGGCAGGCCTACGAATTAATTGTTTAACT TTGAAATAGTAACATGTATAGACCACTTTTTTCCAAGCTTGGATATGGCA ACACATACTATTTTTGTATTGACCATTTGGATTGTAGCAGTGGGACCAAA TGACAGCACATTGCTGTGTCATGTGTTACAGAAATATGTTTTGTGTAGTG TACTCTATGCCTAGACAAGTAGGAATAGATTAGTTCCTTGCTCTATATTT TCATTTTGTATTGCAGCCAAATTATCCAAAAAAGAATGGTGCTCCCTGTT TATACTTTGGTTTGACATAATGAAAAAAAAAGTAGGAATAGATTAGTTCC TTGCTCTATATTTTCATTTTGTATTGCAGCCAAATTATCCAAAAAAGAAT GGTGCTCCCTGTTTATACTTTGGTTTGACATAATGAAAAAAACAATGTTT CTTCAGTTTCCTTTCATGTTATATAACCAACTCATGACAAAAAAATCAGA TGCTCTGTACTTTGGCCTAAGGTTATGTTTTCGTTAGCATGTTACAAACC TTGTGACTACTATCAGCCTGTCACTTACTCCCAATGCATAGCTGTGTTGC CTTGGTGTCTACGAATTGTATGGTCCTATATGTTCTTATGTATTTCATCC ACTTCAGAATTGTTTTATTTTGTTGTTATGGTGTGGAGTCCTCGTCGTTT CTTTTTGCCATAGACAGGCATGTATGCTGTTGTGCTTAGCTGAAGCACAC AGACACTATCAATGCTCGCAACTCAGCTCCGTTACTTGGTCAGAATGATT ACCTGTCAAAACCAAGAAAACAGCAAATGCTACTTTCTGTAAATTATCCG CAATGAATTATGACTGGAATTTTTTAACTATCTGCTTTTCTGTGATATTT TTCAGTATGTTGTGCGAGAAAATGCTAAGGAGAAGCCAACTTACATCTTA GCGCCGAAGAGGGATGATCATACAAGAGAGAAAATTATTGCTGGAACTTC AGGTCGTGTCAAGGAATTGTCAATTGCTATTAGCTTGTTATAACTGTTTT CAATACTCAACAGTATTCGGTTGTTGTAGTCTATAACTAAGTGATCTTTC TGATATGATCCTCCTTGATTAATGTTGTTAAAATGCTGTTTCGACTAACC ATGGTTTTAAACGCCCAAGGCGTCGCCTAGGCGATGCCTAGGAGTCAAGG CGCCCCCTCCGCCTTGGAAAATTGACCGCTTTAGGCGCCTAGGTGTCCAA AGCGCCCGCCTAGGCGTCGCTTAGACGTTAGAGTGCCCCCAAACCGCTCT TAAGACGCCTTAATGCCTTTAAAACCATGCAACTAACGAACAGACAATGG TTCCCTCACTTGAGGCACACTATCAACTTGACCTGAATTTTAACATGATA ATGGCGCACGGTTCTAGTTTGTAAGAACTGAGTTATGGAGTTGGTTAGTA AACTGCACTATGCGAAAATGTAGCTAATATGGGAACCTTTACTACTGTGA CTAAAATGTGGTATCTGCTAGTTAATATTCTCCGCAATGGCAGAATAAGT ATGCTTTTTAAAAGCACCTTTAATGCAAACACACATCGATTGTGTGCTTC ACTTGTTCAGTTTGATGGCTGACACGTGGGATGCGGCGGTAGGCCAAGTG GATGTCTTGTATATCTGTACTCTTGTAGTCTGTTCATGGGAACGACACTT GTCCTCCCTGCATGATGTCATCCACTTTTACGTTATTTTTGTATTTGACA AATTAGGTTTTGTATTTTCATTTTTTTTATTTTAAGCATGGAGCCTGTAT TTTCCTTTCTAAGAATGGTAACTGTCTAATTCTTTTTTTTGCCCAATTGA ACGTTTCTCTTGTGTTTTGTGCTTCGCTCTTTCCATCCTTATGATGGAAT GCAACTTCTTGGTTCTTCTATGATGTTAAATATTGTAGTTTTCTTTTGTC TCATCTTGTAGATGGTACAAGTGGAGGACCATCTGGGTCTGCTCAGGTTG TTGATGGTAAAAGAGACAAAATTGTCCTTTTGAAAGGAAGAGCAAGGGTT GATTCCAATGTAAGCATACATGTTCCATGAGGATTCCCTCCATTTAATTA GTATGGACTGTCATTTTATCTGCTGTTGTTACAGATATCTGATAGCTCAA CTCCGCAGCAGTCTGTGCCCCCTTCAAGAAATACACCCCCATCAAGTTCT AGACAAGACCAGCGGCATGAGGCCAGTGGCAGAATTATTAAGACTATACT TTCAAACAAGGAAGGACGCCATGGAATAGCATCTCAGCATGAGCAAGATG GTCACATGATTAATGCTGACAAGGATAAGCGTCCGCCACGGGTTCCAAAC TCGCGTTCCATTGTGAAAGATCAGACTGTTGAAAATGCTGAGAAAAGCTA CTATGATGACAAGCATATTCATCTGCATAGTTCTGGACCCAATAGTGAGA AGATTGAAAGACATGCCAGAAATAGAGATAGGCCTGACCGTGGTGTATGG GCCCCTCGTCGCTATGACAAGTCTGCGTCAGGAGGAGGTACACAAGCCTC GTCGTCTGAGTTCCCGCTAATTCAGTCACATCCTGAGGACAATTTCTCTC AGCAAGCAGATGGTACAAGTCTTAGTTAAATGGCTTTATTATCAGTCATT CCTGATGCTTGAGTCACCGTATTAACTGAGCTGATTATGTAGGCCATGGA GATAGAAAAATAGACACAAGGAGTCCTGGTGGTCGTGGTGGTGTTGTGGA GAATGGTTTGTTTCTTATCTGGTTATAGTTAGTGGTTAGCAAACAAGCTG CGCAAAGTTGTTCTAGATCAGTTTCCGGATTACCGCTCATTGTGTGTTGT TATTCAGGAAACAGGCACGCCAACCGCCGTGGTCCGCCACGTGGGCTGAA GGAGATGGAGATCTCTCCTATTACATCCGATGGAAAACCTTCGAAGAGGG GCGCTGCTAGCTATGGGGCTCATGAGGTATGATTAGTTTATAATCTCCTA CTTGCCTTGGCTGGTTCCAGAAGTCTAATACCATAAATGCTGTGTGCAGA GACAAGTATGGGTTCAAAAGTCAAGTTCAGGATCGTGACTTTGACCACCG ATGGTACGTCTATGTTGCTGTAGTTTATTCAACTTGTATTTGCGTCTATA ATTGTACGTAATCCTCGTGTTTCCAGCATCATCTGTTGGGTGTTTTTGCC TCCAGGTTTTATCTGAGTTCTTGCTGGAGAACACATGTCAGAAATGCCTC CAATATTTAATAGGAAGTTATCACAAAATACTAGTAGAATAGATTTTGTG CTTTCAGGTGCATGTGAAACAGGGAATTTAGAAACACTTCACTCTGAAAA CTATGTGATTTTATATAGATGTACATTGTGAATAAGTATGTACTAGCAAA AGTTTCTGCAAAAATATGTGCAATGTTTGGTTAATAAAATAAGAGGGGAG ATGACATGGCAAATACGTACTCCCTTCATCATGAAAAGGATGTCGCAGAT TTGTCTAAATCTGGATGTATCTAGACACTATTTAGTACTCCCTCCGTCCA GATTAAGTGACTTGTGTCTAGATTTGTATGTATCTAGACATATTTTAGTG TCTAGATACATTCGAATCTAGATAAACTCAAGTCACTTATTTATGAACGG AGGGAGTATATAGATACATCCGAATTTGGACAAATTTGCGACATCTTTTT CTGGACGGAGGGAGTAGTATAAGTGTTCATTTTGTTAGTATATTGTTTCA CAACATATTTCTGTGGTATGTTTTTGAAGCAAGTGTTTTTCCCTACCTGG GAGTACTCCTGTGTACCTTTGCAATTTGCCTGTCAAATATACACTGATTT ATCAACTTACCTATCTTGCAGATACTTTCATCAAAACAGATGTTGCAAGT TGTGCAGAAGTTTCTGGATTTTGCAGCTCGTTCTGAAGTTCGTGAATGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.