Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA031033

[Submit comment/correction]

Sequence	AA031033
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA031033
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGGAAGATGGTGATGTTCCTGACATGGAGCCGTTATACTGCACTCAGGC AGGTCCGGCAAAGTTTGTTGGAGAATCTCCGGATCCAGCGGTTGATGAGA GGGCAGCGACTCTTGGCGGTCAGTCTGATGAACAAAGTGGTAGGGGCCCG CAACATAACAGAGAGTTGTCCCCTGCTGGTGACCATGGTATTCCCGCGTC TACTATTCCTACGGATTCGACCACCTACCCTAACTTGGGGGAAGGTGATG TTGATGGAGCTGGCATGAACGAGGAAGTTGCATCCAGTCCGCAGGAGCCT TTCCTAGGGATGAGGTTTGACACAATTTCGAGTGCAAAAGCACATTATAA TGCTTATGCTCTCAAGCTGGGTTTTTCTATCAAAGCTCACACATCTCAGA AAGGGAGAAACACATATCAGATAGTAAAACAACAGTTTGTGTGCAACAAG TTTCGTAGGCCTAAAACAGAGGAGGAGGAGCAACAAGAGAGAATGACTAT TGTAGAAGATATCAGCCTTGTTCAGCTTGATGATGGCAATGTTGAAGCTC GGAAGAGTGGTTCATCCAAAAAAAGTAGCAGCAAATTTGGGGTTAAGCGC AAGAGGGAAAGTATCAAACAAACAAATTGCCCAGCTAGAATGTTCGTTAA ACTCATTGATAACAAGTGGCAGGTGACCTACTTCATCGCTGAACACAACC ATCCTTTGATAGAAAGGCCATCGCTTGCGAAGTACTTGAGATCGCATAGG GTATCTCCCGTGACGAGAAAGAGTTCCTGAAGTGTCTGCATAATTGCAAC TTGGAAACAGGTTTGTGACGTCTGATTATTACTAACTTGCTACTGCTATT ATGTTAAGTTGTTTCAGGGCATCCTCCTAAGTTGTTCTTCTAATGTGCAG GTCGCATGATCGAGGTCATGTCTGAATTTTATGGCGAGGATGCTTTTGTA CCGTATGGCCCCAAGACAATATCAAACTTGCGGTCAGAATTTAGGAGTGA AAACAAAGAGTTCGACATAGGTGAAACACTTGAGCACTTCAAAGAGTTGC AGGCAGAAGACCCCGAATTTGAAGGGAATATGCCCTAAGAGGCAATAATA AAGTGTTTATTATGTGTATTCCAAGTATATGATAGATGTTTATTTTGCAT GCTATAATTGTATTAATACGGAAACGTTAATACATGTGTGTTTAATAAAC AAACAAAAAGTTCCTAGTTATGCCTCTCTCATAAACTAGCTCGTTGATTA ACAAGATGATCAAGGTTTCCTGATCATGGACATTGGATGTTGTTAATAAC GGGATCACAACATTAGTGTAATGGTGTGATGAACATTCATCCGAAGTATA GCATTACGATCAAAGTCATTGAGTTTATATTGCTATAACAACTTACGAAG TGATCCTAATCCTTAGACCATGAGATCATGTCAATCACTAACACCAGAAG AGTTTCTTGATAACATCAAACGTCACACCGTAACAGGGTGATTATAAAGA TGGATTCAGAACTAATAAAGTGTTATGTTGAGGCTCTTGGATCGAGAGTG GAATTTGTTCATCCCGATGACGGATAGATATACTCTGGGACCTCTCGGTG ATATCACATTGATTAGCTTGCAAGCAAGTGATTTGATCACTAGAATGTTA TATCACAGAAACGAGAAAAGAGTGCATGTCGGTAACGAGATCAAACTAGG TATGGAGATACCGATGATCGAATCTCGGAAATGTAATATATCGTGAAACA AAGGGATTAAGATACTAGCGTAAAAGGTTCCGATGTTCACAAGAAAGTCA TCGTTGAATGTGTGGGAGTCAGTATGGGTCTCTAGATCCCGCTTCTGATT ATTGATCCGAGAGGGGTCTCGATCATGTCCGCATTATTCACGAACCGTAG GGTGACACACTTAAGAGACACCGACATCCAATTGGAACAAATGTTTCATG CCGAAAGAATGAACAAGCGCAGGAATTTATTTCACTAGATACCGAAACAG GTTTTCGGGTGAAATTGCATAAAGTGGTTATGCATGTGAAATAGAATTCT AGCAAGGGGTTATTTGTGAATGTTTGTCATTAAAGTAATTGACAAAATTC TGAATAAAATAAAAGAGTTTTATTTAATGAGAGTTTGCATTAAATTTGGT GGAAATTTAATGGGAATTCGAGTGGACTTTTGAGTGGAGGGAATTTAAAG GAGATTTGTGAGTGGAGTGTCCACCCACGTGAAGAGGGGAGGGCAAGGGG GCAGCCCCATGCGCCAGCCACCCCCTTGGGGTTCCCCCCTCCTCCTATAA AAGGAGCCCCCCTCCTCACTTGTCTCTCACACCTCCTCATGAAGGATCTC TCTCCCCCTCTAGAATTTATCCCCCATGGTCTCGGACTAGCGAGATACAT GTTCCCGGTGGCTATTCGGCAAGAAAGAGTTGTGCTTCCGCTGCATCGCT GGAGCGAGGAGGCGGAGGTTGCTCGGTGCCTCGAATGTGTGTGCGAGCAC GGATGCGCTGCTGATTTGCGGCGCTAGGACTTCCTCTCGATCTTGAGATC GGCAAGAGATCGTCTACATCAACCACGAGTTGAACTCGTTAAGCTTTGTC GGTCTTCAAGGGTATGTTCTCTACGGATATACATCCGCCCTTGTTTGTAT CTAGTAGATAGATCTTGGTATATAGTTCACATCGTAGGAAAATTTTTGTT TTCTATGCTGCGAACCCTACAGTGGTATCAGAGCCGGATCTATGCGTAGA TACTTTACACGGGTAGTACACATATGAGTATGTGGGCGATGATGATCATG TTGTTGCTCCTTTGTTGTAATTTTGGATATTGGTGGCATAGTGGGATGAA GCGGCCCGGAAAAACTTTACATGTCCTCGCACATGAGACCTGTTCCACGC TTCACATGCAACTAGTTTGCATAAGTGGCTAGCGGGTGTCTGTCTCTCCT ACTATAGTCAATATCTATTTTGCAAGCGAGTTGTCAACAATTTGATTATC CTCGTTGTGGTTCATGTTCGTAGGTAAGAACGGTTCTATCTCGAAATCCC TAAGCCACGTAAAAATTGCAATGGATAAATTAGAGGCGTCTAGTTTAGAT TGTTGCTGGGCTAGTGTTATGATATGGTAGTGTTGTAAGTAGAAGTATGA GATGATACTCTTACAACACACATAGCGTGTAAAATCCATAGACCTTGGAT TTACACATATAGGTATGATAGTGATCATACCACGATGCACATGATAGAGA TCATCTGCGGGAACCATATAATTTCACTAATAAACATATGATGTTTGATA GCATCTTATGTTGCTTGTTTAGCGCTTTGTTAGCATAATAAGATGATCCC TCATTTAAATATCAAGATAAGAATGTGTTCTTCCTTTAGTATGCACCGAT TATGTTTTCGTCGCTCCAAGACATCACGTGATGATCGGGTGTTCTTGGAT CCACGACCATATTTCGGATGTAAAACAGTTACACACGCGAATACTAAGGT TCTAACTTGGCGAGCCTAGCATGTACATACATGGCCTCGGAACACGGACC GAAAGGTTAAGCATGAGTCATATAGTTGATATGATGCCCATTTGATGCTC GCCTTTGAAGCTATACCGACTCACGTGATGATCGGACTTGGTGTAGTGGA TTTGGTTCATGTAATCACCAAAAAGGCACGAGGGATGTCGTTTTTGAGTG GGAGTTCATTCGTAATATAGATTAGTTGAACTTAATCTATCATACACTTA GTCTAAACTTTACAAATTCTGTTGTAGATGGCACCACCTGCTTTTAATTT CAATGTGTTCATGGAGAAAGAGAAACTAGCAACGAACGGTAGCAACTTTA CCGAATGGGCCATGAATTTGAGGATTCTCCTCTCTGCTGCACAAAAGCAA TATGTGCTAGAAGCGTCGTTAGGCCCCCCACCTTTAGATGATGCCCCTGA CGAGGAGAAGAATGTCTATCAGACTCGTCAGGAGGACCACAACTTAGTTC ATTGCGGCATATTGTATGGGCTAGAGCCGGAACTTCGAAAGCGTTTCGAA AACGGCAATGCATTTGATACAATGGGTGAGTTGAAAATGATTTTCGACAC ACATGCTGCTGTAGAGAGCTACAACGCTTCATAAAAGTTCTTTAGCTGCA TGATGGAAGAGCACAACTCCGTTAGTGAGCATGTACTCAAGATGTCGGGT TACGCCGATAAGCTTGTGTCCTTGGGAATATCGATTCCCATTGACTTAGG CATCCATCGTGTTCTGCAGTCTCTGCCACCTAGCTATAAGAGCTTCGTGA TGAACTATAATATGCAAGGCATGAAGAAGTCTCTCCCCGAGCTTCTGTCG ATGCTTAAAACTGCAGAAGTGGAGATCAGAAAGGAACATCAAGTGTTGAT GATCAATAGGAACACTGGTTTCAAGAAAGACAAGAAGGGAAAATGGAAGG GAAGTAAGGGCGGCAAGCCTGTTTCCGCGCCTAAAAAGAAACCCCGAGTT GGACCTAAGTCTGATTCCGAGTGCTACTATTGTAAGGGGACTGGCCACTG GAAGCGCAACTGCCCCAAGTATCTGGCAGACAAGAAGGCCGGCAAGGCAA ACAAAGGTATATATGATATACATGTTATTGATGTGTACTTGACTAGTGCT CGCAGTAGCACCTGAGTATTTGATACCGGTTCAGTTGCTAATATTTGTAA CTCGAATCAGGGGCTGCGGAACAAGCGACCGCTAGCAAGGGGTGAGGTCA AGATGCGTGTCGGCAATGGATCAAGCGTTGATGTGATCGCCGTTAGAACT CTGCCTCTCCACTTACCATCGGGATTAGTTATAAACTTGAATAAATGTTA TCTGGTGCCTGCACTGAGCATGAACATTGTATCTGGATCGTGTTTGATGC GAAGTGGTTATTCATTTAAATCCGAGAACAATGGTTGTTCCATTTATATA AATGAATTCTTTTATGGTCATGCAGCGATGTTGAATGGTTTATTTCTATT AGATCTCGATGATAATGTTACACATATTCATAATGTTGATGCTAAAAGGA TTAAACTTAATGATGATATATCCGCATATATGTGGCACTGCCGTCTAGGT CATATTGGCATTACACGCATGAAGAAGCTCCATTCGGATGGACTTTTGGA ATCACTTGATTATGAATCATTTGATACATGTGAGCCATGCCTTATGGGCA AGATGACTAGAACGCCATTTTCCGGTTCAATGGAACGGGCGATAGATTTA TTGGAAATCATACATTCTGATGTATGTGGTCCAATGAGTGTGTCGGCGCG AGGTGGATATCGTTATTTTATTACTTTCACGGATGATTTGAGTAGATACG GTTATATCTACTTGATGAAACACAAGTCTGAAACCTTTGAAAAGTTCAAG GAATTTCAGAATGAAGTGGAAAATCATCGTAATAGAAAGATCAAATTTCT ACGGTCCGACCGTGGAGGTGAGTATCTAAGTGTTTAGCACTCACATGAAA GAGTGTGGAATTGTTTCACAACTCACACCTACCGGAACACCACAGCGAAA TGGTGTGTCGGAACGTCGTAATCGTACTTTATTAGATATGGTTCGATCTA TGATGTCTCCGACGGACTTGCCGTTGGTCATTTTGGGGTTATGCACTAGA AACTGCTGCATTCACTTTAAGTCGGGCACCATCTAAATCCGTTGAAAAGA CACCGTATGAATTGTGGTTTGGAAACAAACCTAAGCTGTCATTTCTTAAA GTTTGGGGATGCGATGTTTATGTGAAGAAACTTCAAGCGGATAAACTCGA ACCCAAAGCGGAAAAATGCGTCTTCATAGGATACCCTAAAGAAACTATTG GGTATTCCTTCTATCACAGATCCGAGGGCAAGGTTTTTTGTTGCCAAGAA TGGATCCTTTCTAGAGAAAGAGTTTCTCGCGAAAGGTGTGAGTAGTCGGA AGGTAGAACTCGAAGAGGTTGTGGAACCTTCTCTTCAAAGTATGGCGGGT AGCGCAGCGCCGGAAGTTGTTCCGGAGTTGGCTCCACCTGTTGAAGAGGG AACTAATGATAATGATCATGAAACTCCAAAAGAGAGTACTACCGAACCTC GCAGGTCAAACAGGACGCGTGCAGCTCCCGAGCTGTACGGAAATCCTGTC ATGAATTTCATGGTTGATGAAAATGATGACCCTGCGACGTATGAAGAAGC GATGATGAGCCCGGATTCCAACAAATGGTTAGAAGCCATGAAATCCGAGA TGGAATCCATGTATGAAAATCAAGTTTGGAACTTGGTGGAATTACCTCAC GACCGAAAGGCCGTGGAGAACAAATGGATTTTCAAAAGGAAAACTGATGC TGATGGTAATGTGACCGTCTATAAAGCTCGACTTGTCGCAAAGGGGTTTC GACAAATTCAAGGAGTTGACTGCGATGAGACTTTCTCTCCCGTAGCGATG CTAAAGTCAGTTAGGATTATGTTAGCAATTGCTGCATATTTCGATTATGA GATATGGCAGATGGATGTCAAAACCGCGTTTCTCAATGGTAATATTGAAG AAGAGTTGTATATGATACAACCAAAGGGTTTTGTCGATCCTAAGGATGCT AACAAGGTGTGCAAGCTTCAGCGATCCATCTATGGATTGAAGCAAGCATC ACGAAGTTGGAATCTCCGCTTTGATGAGGTGATCAAAGAGTTTGGATTTG TCCAAACTTATGGAGAAGCTTGTATTTACAAGAAAGTGAGTGGGAGCAAT GTGGCATTTCTGATATTATATGTGGATGACATATTATTGATCGAAAATGA TATAGATCTTTTAAACAGTGTTAAAAGTTATCTAAACAGCAAATTTTCAA TGAAGGACCTAGGTGAAGCGTCATACATATTAGGCATAAAGATCTATAGA GATAGATCTAGGCGCCTAATAGGGCTATCGCAAAGTACATACCTTGATAA GATTTTAAAGAAGTTTAAAATGGACGGAAGTAAGAAGGGGTTCTTACCTA TGTTGCAAGGCAAGACATTGAGTAAGACTCAAAGTCCGGCTTTGGCGGAA GAAAGAGAGATAATGGACAAAGTCCCCTATTCTTCAGCCATAGGCTCTAT AATGTACGCCATGCTATGTACAAGACCGGATGTGGCACATGCTATTAGTT TGACTAGTAGGTACCAATCGGATCCAGGTTCGGAACACTAGATAGCGGTC AAGAATATCCTTAAGTACTTACGAAGAACTAAGGATATGTTTCTTGTATA CGGAGGTGAAGAAGAGCTCGTCGCTAAGTGTTATGTCGACGCTAGCTTTG ACACCGATCCGGATGACTCTAAGTCTCAATCCGGATACGTATTTCTCATG AATAGCGGAGCGGTTAGTTGGAGGAGCTCCAAACAACCTGTGGTAGCGGG ATCAACAACGGAGGCCGAATATGTTGCTGCTTCAGAAGCGGCTCAGGAAG CAGTTTGGATGAAGGAGTTCATATCCGAACTAGGAGTGGTGGCAAACGCG TTGGACCCAATGGTGATCTATTGTGACAACAATGGTGCCATTGCGAATGC CAAAGAGCCAAGGTCTCACAAGCATTCCAAGCATATTAAGCGCCGGTTTC ACTCCATCCGCGAGCATGTCAAGGATGGAGATATAAAGATTTGTGAAGTA CATACGGATCTCAATGTAGCAGACCCGTTGACTAAAACTCTCCCTAGAGC AAAACATGATCAACACCAGAACTCAATGGGTGTTAGATTTATCACTATGT AACTAGATTATTGTCTCTAGTGCAAGTGGGAGACTGAAGGGAATATGCCC TGAGAGGCAATAATAAAGTGTTTATTATGTGTATCCAAAGTATATGATAG ATGTTTATTTTGCATGCTATAATTGTATTAATACGGAAACGTTAATACAT GTGTGTTTAATAAACAAACATAAAGTTCCTAGTTATGCCTCTCTCATAAA CTAGCTCGTTGATTAACGAGATGATCAAGGTTTCCTGATCATGGACATTG GATGTTGTTAATAACGGGATCACAACATTAGTGTAATGGTGTGATGAACA TTCATCCGAAGTATAGCATTACGATCAAAGTCATTGAGTTTATATTGCTA TAACAACTTACGAAGTGATCCTAATCCTTAGACCATGAGATCATGTCAAT CACTAACACCGGAAGAGTTTCTTGATAACATCAAACGTCACATCGTAACA GGGTGATTATAAAGATGGATTCAGAACTAATAAAGTGTTATGTTGAGGCT CATGGATCGAGAGTGGAATTTTTTCATCCCGATGACGGATAGATATACTC TGGGCCCTCTCGGTGATATCACATTGATTAGCTTGCAAGCAAGTGATTTG ATCACTAGAATGTTATATCACAGGAACGAGAAAAGAGTGCATGTCGGTAA CGAGATCAAACTAGGTATGGAGATACCGATGATCGAATCTCGGACATGTA ATATATCGTGAAACAAAGGGATTAAGATACTAGCGTAAAAGGTTCCGACG ATCACAAGAAAGTCATCGTTGAATGTGTGGGAGTCAGTATGGGTCTCTAG ATCCCGCTTCTGATTATTGATCCGAGAGGGGTCTCGATCATGTCCGCATT ATTCACGAACCGTAGGGTGACACACTTAAGAGACACCGACATCCAATTGG AGCAAATGTTTCATGCCGAAAGAATGAACAAGCGCAGGAATTTATTTCAC TAGATACCGAAACAGGTTTTCGGGTGAAATTGCATAAAGTGGTTATGCAT GTGAAATAGAATTCTAACAAGGGGTTATTTGTGAATGTTTGTCATTAAAG TAATTGACAAAATTCTGAATAAAATAAAAGAGTTTTATTTAATGAGAGTT TGCATTAAATTTGGTGGAAATTTAATGGGAATTTGAGTGGACTTTTGAGT GGAGGGAATTTAAAGGAGATTTGTGAGTGGAGTGTCCACCCACATGAAGA GGGGAGGGCAAGGGGGCAACCCCATGCGCCGGCCACCCCCTTGGGGTTCC CCCTCCTCCTATAAAAGGAACCCCCCTCCTCACTTGTCTCTCACACCTCC TCGTGAAGGATCTCTCTCCCCCTCTAGAATTTATCCCCCATGGTCTCGGA CTAGCGAGATACATGTTCCCGATGGCTATTCGGCAAGAAAGAGTTGTGCT TCCGCTGCATTGCTGGAGCGAGGAGGTGGAGGTTGCTCGGTGCCTCGAAC GTGTGTGCGAGCACGGATGCGCTGCTGATTTGCGGCGCTAGGACTTCCTC TCGATCTTGAGATCGGCAAGAGATCGTCTACATCAACCACGAGTTGAACT CGTTAAGCTTTGTTGGTCTTCAAGGGTATGTTATCTACGGATATACATCC GCCCGTTGTTTGTATCTAGTAGATAGATCTTGCTATATAGTTCACATCGT AGGAAATTTTTTGTTTTCTATGCTGCGAACCCTACAGAATTCTACTACAA ATTTTCCTTTGATTCAGAGAACAGAGTTGAAAACATATTCTGGGTTGATG GTTTGGCAAGAAAAGCTTATGTGGAAGCATATCACGATTGTGTGTCGTTT GACACAACTTTCTGTACAAATCGTTTCAACATGCCTTTTGCGCCGTTTAT TGGCATAAATAGGCATGGACAGTCTTTTTTGGTGGGTTGTGGTTTTCTCA GAGATGAGAGAGAGGACAGCTTTAAATGGCTTTTTAGACAGTTCCTCGAA GCAATGCATGGGAAGCAGCCCACCAACATAATCACAGACTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.