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GrainGenes Sequence Report: AA021780

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Sequence
AA021780
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA021780
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GTAAAGGAGTTAACCAAGGACCATCATCCGGATAGAGAAGATGAGAGAAG
GCGCGTAGAAGCTGCTGGTGATTGTGTTCTTGAGTGGGCTGGTGTATACC
GTGTTAATGGTGAGCTAGCACTATCTATTGGCGATGTTCCTTTTAAACGG
TCAGTATATAGTCTATTTAGTTTTTCTTCATTTATATCTTACCTACCCCA
AGGTTTTTAATGTTTAACCGTTGTATCTTGAAAAGAAGAAAGTTACATAT
AGCCCTATTGCTTTTTAGTAAAGAGTAAATTTGACCAAACTGCAAGTACA
GTGTAGGAAGTGCAAACTCTAACAAAACTACGGATCTGGGGGTTAATATC
AAGAACTACAAATGAATCAGTTTTATGCACACAACATTCCATTTCGGCCC
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AGCTGGTCAGCTGAAAATTACTTGCGAAACCAGTGCACAATTCCACAAGG
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TCCCAATTCAACATGTGCAGCCTCCACATGACATCCCCCTCCCTGGGTTG
AATGTGGTCGATGCAGTGAGAAGATTTCCATGCTGTTCATCCTAGTATTG
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GGACCAAGCACTATAACATTGGGGTTGGTTGTGTTTGAGTTAATCTTGAC
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GTTCTTGGTATTAGTGGTGCATGCATGCACGTGAGTCTACCAAGGTAAGT
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TGATCATTGATGAGTGCGGTGGTACCGGGGTGCGGTGCTAGAGAATCTTG
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GGTAGCATGTCCGGTCGGTGGTGTCCGTGAGTCGTCGTTGTGTCCAAGTG
CTCGTCTCTGTGAGGATCCGTTGCAGTTGAAGCGAATGAAGGTTGAGGGA
TTGTCCATTGTATGGACGAAGACGCAATTTGCGTTCCTTGACCAGGTCAT
CTATGTGTCTCGACGAGAGGATCAAGTTCAAGTGTGAAGGGGGCGGTAAA
CCAGTAAAGGTGAGTCTCTTTAATGAGGTCATGTCTCTACATGAGGCCGA
AGTGGATGGTCTAGTCCACGCCAGGAGGTCGGCATGTATTCGGCATGTAT
TACGCTAGGGTGGACGGTGTGTTCCACGGGTGGTGCGATTTCACAAGGTT
GCTAGCGTGGCTGGGTAGTCTGGATCATACTTGAGTTGTTCCGTAAATTC
GCCAAGTCAAAATTAGGGAGATCCAATCAGACTTATCGTGGTGCAAGACC
TAGACAAGGCGCGGATCTATAACGAGTCAAAACCAGAAGAAGCACGAGGA
TGACAAGTTCAAGATTAGGGGGAGATTGTTAGAGTTAATCTTGACCTAGT
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TGGTATTAGTAGTGCATGCATGCACGTGAGTCTACCAAGGTAAGTCAGAG
TTGGATTCCAAGTACTGATCGATTTAGAGTCTGAGTTGTACTAGGAGGTC
ATGTGCGTGTACTCTAGTCATGTTTTAGTCTAAATAGAATTGAAACTAGC
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CCCAATTACTTGACTAATCCTATGGTAAACCACTGTTCACCAATAGAGAA
TTAGAGTCGAACCCATGGTGTAAATGACGGTGCCACATACAACTCTTGGC
TGGCTTCGTCCCTGGCTTCTTCCATCGCACTCAATCCTTATAAGCCTCCG
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GGACTATTTCCTTTACATGTGATGGTGTGACACCCACATCTTGGCCTCGC
TGCTAGTTGGCGGTGCACCCATCTCATGAGGTGGGCAACTAGTGCGTGGT
GGTGCTAGAGTTTTAGTGTGTGCAGGGTCACTTGCGGCAGAGGGTGAGGG
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GGGCTTAGTGGCGAACTGACGATAGTAATCTTATTTAGGTTAAGGACTGG
GAAGAGAAGTGGAGAGCTATAAAGGAACGCCAACTTGAAATTGAGATCAT
GTAGAGCAACACACTGGGGCTTCATGTTATAGGTGTAATGCATGGATGGC
CCATCTGTCGCATCACATAGGACGGATAGTAAGAGACCAATCTGAGACAG
ACAGGAGATTGAACTTTTTATAATAGAAAATCCAAATCTAAACTTGAATT
ATTTGATATGCTGCTCTTTGTACGTAGTCCATTCTATGGTGAAAGTTCTA
AGCTACTATGAGAATTTGTTTTTGTGGCGTGTTGCATGTGACGTGCCATT
GTGATGTACAAAACTCTCTCTGTTCCTTGATATGTTAGTTGCACGGACAT
GCTGAATCGTTCTGGCTCATTTACCTTATAGGTATGGTGTAATATCGACA
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TGCTTCATCTGATGGGGTCTTTGAGAAAATGGCTATGCAAGATGTGTGTG
ACATGATGTTGCATGCGAAGCTTGGTGTTAACCAAGACTTTGAATCCTTT
ACCGTTGCACAACAGAATTTGGCGGATTATGTAGTTCATCTTGCTTTACA
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CTAGTAGCTCTGGAGCTACAATAGAAGATTGGCACCATCTTGAAGAAAAT
TCTGGGACATCTCTTTTTTCCTTTACAGTCCATTCCGTACCAAGATAAGT
CTGGTAGGCTCAGTGTCCAATTACTTCTATGTTAATTGCAACTATTCGGT
AATTTTTACATTACCATTTTACTTCAAAGAATTTATGATTTTTCTTGATT
TTTGCTGATTGAGGATGATGGATATTTTTCTAGTTTCGTTGGTTTTGTAT
GTTGGACACCCAAAAATGGGCATACATAATCTTTACATGAGGGGAAATGC
CACTCATTATACAATGTTATTCTCTTCTTGATCTGCCCTGTTGCTGCATG
TTATTCCATTCAAGTGATTGTCCATTATTTTAGTATTAGAGAACTTCATG
GGTTCTATGAATCTAAATTACAATTTTTTTCACATATATTAACCATTAGC
CCAACCATTTATCTTTGTTGCTTGACTTACTGCACTCAAACGTAGTTCAG
GGTCTCATGCGAAGTCGTTCTCAGTCCTTAGTTTTGCTGACATCTATTTC
CATGTGCTTCAGATGATGGAGTTAGTTCAGCTGTTATTGAAATGGAATAT
TTTAAGCACTCATCGACAAAGTTCCAGAGGTTCTTGGTACGTGGGAAATT
TATTGGTTCAATGTTTTTCCTGAAAGTTTGATGTACCAATTAAACCAAAG
GATTTGTACAGTACATGTTCTGTTTGAATGTGAAATATGTTTCACTTGGT
ATGTTAATTCTCTGCTTTAAGTCTTTGACAAAAGTCCCTACTGCCCTTTA
TTAAGCTGCATGTTCACTGTCTGTTGGAGTGTATTGGAGAATCTTTGGTT
CTATTAATAGTATTAATAGTATTTTTGCTTGATCTGGAATTAGGTTGATG
CAAAACTTAAGAGACTGGGCTGCTTCTACTTATCTGAAAGTCTTGATGAA
GATATGGACTATATATTTAGGGTACCACAGGACTATCAGCATGGAGGAGT
CCACGATTTCAATCACATGCCAAAAGAAAACGTGTTATCTTCTGATGGCG
AGGTTAACTATTTTAGAATGCTTGCATGTGGGATCTTTTTCAGGAACAAG
GTCCTTTGTTTTCCTTTTCTTGGAGGGGGTTAGCTTGTTGGAGGGTGTAA
TCTTATTTCGCTGGCTTACCATCAAATCTTGCTGTCTTGGTATAAGACTT
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AGAGATGTGGACTTCTAATGTAATGCTTGGTAGTGTTTTCTATCTTGCTC
ATGCCCCCAGTTGTCATTTCCCTCCTACATTTGGGTACAGGAAATCTTGA
AAAATACAAGGACAGAAACTTTTGCTGGTACCTTAGCCATCAAGATGATA
AAATGGGCCGGTGTAGTAGTCCTGAAGGGTTTGCAAATTATTTTGGCTTG
CTTGATTCTGTTTCGCATAATCAAAGCAAATGGAACAGTTCACATTCATT
TGGCTACAAGATAGCTGACATGAGGTACCACTTCCATTGTTGAGCAACTT
CCTGAGTACCTTTTAGCATGTCTGGACAACAGCCTGTAGATGTTTGCTGA
AGTTTAGATTTTTTTATGTAATTACTTTATATCGTCATGCTTCACATCAC
TTTAGGTTCATCTGAATGTACCATCCAGCCCATTTATATTTATTTATCTA
TAATTCTGATTATGGCTGCATTTCGTCCATATATGTACCATAGGGTGAAA
TGAAGAATTAGGAAAAATAAATAGAAGAGTTACTTGCAACATTGACTTCT
TATGGCATAATTTATTGGTCAGGTGATTTGTGAGCATATAGTTTGAGAAG
GGCTGCCTTACATCAAGTAGCATATATAATTTCACTCTTTCTTTATCAAC
TACAGAGGTTACCATATTCTCATTTTCATGGTAATATTTCCAGTCATGTA
TTTGTAAGTGTGGATTTTTCTTTTGTTCAACAATTTCAGGTACAAGCTGA
AGAGAAGATTTGATCGTGGTTCATATGGTGAAGTCTGGTTGGCATTTCGC
TGGAATTGCTCTGATGATGTAGATGTACATAAAGATTCTTCTCACTTTAG
CACTATACTTACACCAGACTCATATAATTGCACAAGTTCAAACACAACTT
CATCATCTGAAGAAAATCACGTCTCAGACATAATAGATGGTGATTTATTC
ATACTGAAGCGCATAATGGTAAGCCAAGTATTCTTCCAGCGAACTTCTGC
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TCTATTAGATGTGTTTAATATTCTGGTTTTTGACGTGGTCAAATGATCAT
ATAGTCATATTGGGCATCTCTAGCACTTTGGAGTTTTCTGCGTTGTATGT
GATACATTTAAGAGCAACTTCGATTTTCCAAAATAAGGAAGATTAGATGC
TAGAAAGCCTTATTACCCTATGTTCTTGACTCTGGAGCATGGAAACTGCA
GGTTGAAAGAGGAAATGCTGCCTACCTGAGTGGATTGCGTGAGAAGTATT
TTGGACAATTATTTTCAAATGCTTTGAGAACTCTTGAAGGTCTGTCAAGG
ATGGAATCATCATCTACAACGTTTTCGGTGGACATGCATTTCATTGAGTA
TACCTTTCCAGAACAGAACATTTCAGCTATTGAAGAATCACTGAATCATG
TGGCTAGGTTTATAGAATCTTTTGAATCAGAATCAAACGAAATATGGCTT
GTGTACCACAATGAAGGAAGCTCATTGTCAAAACTAATATATGCAGCTGA
AGAAACAAAGTTAGTTACTGGTAATGATAATGAGAGGGTCAGACATATTC
AAGTTTTGCAACCATCAAAGTGGTGGTATTGGTTAAGGACAACTATAGCT
GGACAGGCAAATGCAGAACCTCTTATGGCAGCTGGTATGCTTATGCTTAT
GTGTATGGTTTTATAAATCATACTTCTCGGTCGTTTTTCACATAGTCCAT
TGTGTTCTGTTCATTATTGAAATTGAATTCGAAAGAACAAAAATTCTAAC
ATAGTTTGTTATATCCTTTTCTCTTGTTAAATACAAAATTAGGAGAAATA
TTTTATAAGGCAGCTGGCTTGTTTTTTGTATAATGGTTAATACATTGATA
TTTGTTTCTTTTATTGCTTCTTGTTTCAGCTTATGGGTCTAAAGGCTTGT
CA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.