Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA006380

[Submit comment/correction]

Sequence
AA006380
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA006380
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CGCCAATCTACAGAACCAGTCTTCTCAGTAGACGCCCACCCACAAAGCCT
AGCCGCCGCAGCGGGAGGAGGAGAAGGCCCTGGCCAAGAATTCCCCAATG
GCTTCTGCCCGCACCGACGACGATCGCCGTCTCAAGCCTCATATCGAACT
CGTCCCCGAGCTCGCCCGCGCCGAGCAGCAGCGCGATGCCCGCCGAAAGC
GCCGACAACGTCGTCGAGCGCGACGCAAGGCCGGCTCTATTCCACCCCCT
TCCGGCGAATCTGGGTGAGATTCCGCCGCGCCTCCCCCTTCCCCTTGTGC
TTTCTGTTCCCTCGGTGCGGCTGTTGAATCAATGCTAAATAAGCAAGTCT
TTTTAGGGCAGAAAGAATTATTCTTTTTCTGTATGACAAGCGCGAATACA
ACCCCAGCTCATAGCTTTATTTCTTGGCTTGCGAGTTAGCTCAATCTCGA
GGCATGCTAGGTGAGCCTCGGAGAAATTTTATGCAACAGCATGCTTTTGC
CGTGGGGAATGTTACTAGCTTTCAAACTACTACTTTGAAATTGGATTCAA
CATTCCTAATTTCAACCAAACCGCTCCATGAATGAGCCCCAGAATCTTCA
ACTTTTTCTATCCATTTATTATTGATAGTACTAGGATTTTAGTTTCCTAC
AGTGGGTGGCGGTTCGACCACGGGAGGTGGTTAGGGGAATCAACATGGTA
CTGATTATATCTCAAATAGAACTAAATTCGTGGATTAATGCCGGGAGAGC
TAGCACTCAATGTTGTGCATATATTTTTTTAGAATAATAATGCTTCAAGT
TAGTACAGATATCTGGCCTCTATCAACTTGGTTATGCACAATCATTGTTC
AGATTGATACATGGATTGTTCATTAATTAGCTCAGTTTTTGTCTCTGTGA
TCCGCCTCCTCTGAGGCTTGTAACAAACTCTTCTATGCAATGAAAAGAAG
CACAAAGTCTTTGCGTTTTCCCGGAAAAAAAAGATAAATTATCTTACTCA
TCGAGCTTGTTCCCGTCCAGGTTGGAGGAACATGTCGGAGATATTGCTAA
AAAAGAAGCTGATTCATTCTCAGAGCAACTACCTGTGACGATTGGCGACA
ACGGAAAATCACCCCTGGGTATTATTGTGGATGAGAAGGACCTGGTTTCA
TACCGGCGTGACTGGGAATCCTCTTGGGGCGGCAACTACGGCCTCTTCCA
AGACTACAGTAATCTACTTCACCCATCTGGTTCCTGGTTTGCTTATCTTC
TTCCTATTGCATGCCTCAACTTGATAAGTTCCCTTACTGACGCTACAAAA
AATAGATCAGTTTCCCTGTAGCTAGCTTGTATCCTCTATGTCTGAACCAG
AGTTTGACTTCTTGACTGATTTGAGACTTTGTTGCAGCTTGTGTGAGAGC
CATGCTCTTCACAAGTAGACCCACCCCACCACATGCAGGCGTCAAACCTT
GTTTGCAGATTTTCTCCATCAGAGTCACAGAGATCGATGATGGTATCGAG
TGGCCACTTGAGGTCTATGGCTTGGTTGCCACCCGAGACTCTGTGGATCA
TAATCGCAACATTATCTTCAGACGCGAAAGAGATGCTTGCCAGTGTCTCA
CTGAACAGGTTTTTCTTCTTAATTCTCTTGCTCATGGAGGGGAGGAGAGG
AAGTTACCACTAGATTGTTTTCAAGTGTACGGTGTCTCGTTATCTAATTT
AACCTTGAACTACCAAAATGACTACTGTGCTGCCTGCATCCTCCTGCTAT
TGAAATGAGAATATATAGCTGTAGGAATGATTCATCCAACAATGGTTGTG
CCAGTTTTACTTCTGCAAAGACATAGGCATTAGAATCTAACTTCTCCGAG
GTTGATGTTTATTTTCATTTAGTTTTTATATAGATTATGCTCTTTAGCTG
ACTTTGCTGAGGTTAATTTTTATTTTCATTTAAGCGGGATGGCTATATCC
TGCGTCCTTGCTTCTGGGCGTAGTTAATTGATTCCTTAATGAGTACAGAT
TATCCTTGCAGGGTTCTTTGATGTTGACTGGACCGTCTCGTGCAGTTGTG
TTTACCGACCCTGTTGACATTGAAATTCAACTAAAATTGAAGGGCAGAAC
AGAGCCTGAAGATAAAGATTTGATCTCCAAAGTGTTGGTATACGGACGTG
ATTTTGGAAGTGACAATTCTGGCGGTGCAGGTTACCTTGTGCGTACCACT
TGCTCCAGCGAGTTCTGCTCACTGGAGCTCACCTCAGCACTAATCGCCGG
AGCAGTCGAGGCCACCATCATCTCCGTTGAAGTTATCCAGGGCCGATGGC
CCAAAAACTTGGGAATCCGTGTTGTCTCCGGTACCGTTGGCACAGATGAG
GATTTCATACTGCTTGATGCTCGAGACAGAACGTTTCAGGTTGATCTAGC
TGATGGTCTCATACGCCATTCCAGACACATTGTGTGTGTGGAACAAGATG
GAGGACTGAAACTTTCTGTAGAGGCTTACATGAGAAACGGAGATATCTAC
GAAGGATCCGCCGTTACAGTCTTGCCACCCAAGAGATTCTCTGCTAGTCT
TGGTATATGCAAGCTTAACTTCTGCACTGTTCGGTTCACTGTCGCTTGGT
CCTGCCTCGCGAATGTGGGTGATATGAAGTCCCATGGTATTTGATGCAAC
CAACCATTGGTCGTGTCGTGTCGTGTCATCGTGTGGAACTACAACATACC
ATTTCTCTGCCCTGTCTAATGTTGTTTAGCTGTATCTAGTTAGCGTTTCG
AGCAGTATGCTAAGTGATGTAGAACTAGAGTATTTACATAGTATCGCAGA
CATGTCATGATATATCTGTGTCTAGATCAACATTTAAGTTATGTTTGGTG
AAGTGCCCAGGACACTATTTGTATCTCTGTATCTTGGTGATGTTCTCTAC
GGTAGCATAATACTGGGTCCACATGTAATTTTCTTCTATCTGTGCATCGC
TGGCTCGTGGAAACAAATTGCTACTTTTCTAAAAAGCATGACCATATGGC
TGCTTGAGTACTGCTGTTTGTACCACGAATTCCTTACATATTTAGGGGGT
GTTTGTTTGGGCTTTTGACCACTTCTCCACTGAAAAAAGCCAGAAAAACG
AAACAAACGGCCAGCTGTGCGTCAGGCTTTTGACAAAGTACTTTTACAAA
ATAGGCATTGCGGGCAAAGCACATCACTGGGTGCTTTCCGCAGCTTCCCG
CAAAGGCCAGCGAACCGTTTTCTAGTTTGGAGCGATATTTACAGCAGATG
CCACCCGAAAAACACCCCAACCCATCCCAGTAAAAAAAAAGACATCGTCA
ACCCGTCCCCGCGATAGGCTTCTCTCCCGCGACAGACCTGCTCCCCACCA
GCGCCGCCAGCCCGACTCCCCCTCCCCGCCGCCCTACTCCCTGCCAGCGC
CGCCGCCAGCCAGACGTGCTGCCCGCCGCCTCCAGCCCGACTCCCCTCCC
CACCGCCCTACTCCCCACCAGTGCTGCCGCCATCCAGACCTGCTGCCTGC
CGCCGCTAGACGTGCTGCCCGCCGCCGCCAGCGCGACTCCCCTCCCCGCC
GCCCTACTCCCCGCCAGCACCGCCGCCACCCCTCCCCGCCGCCCGCCGCA
GCCAGCCCGACTCCCCTCCCCGCCGCCCTACTCCCCGTCATCGGCTCGTA
CGCCGTTTCTGTTCAGGTAAGTGGAATTGGGATTTTGAAATAGTTCAATT
CGAGCTCAGTGGTTTGGTAATTAGAAGTGGTTAGATGTGTTTGTTAATTT
CTACTAGTATGTGAACTTTAAATCTTTGCTGGCCGTGGTTTGAGATTGTT
GCCCCAGTACCAGGAGTCCCATTAAAGCGTGGGTTTGTGTTTGTCTTGTT
GGTCGTTATTCTCGTCGTATTGTGGCAGCAATTGTAGAAGAGCATGCAGG
CCACCAGGCAAGCGATGGGGAGATGGCAAGCAGGTAGGGAGCATTGCTAT
GGCGTCACGATTAAATCAAATGAACAATATTTTAGTATGTTAAATCCACC
CGTTAGCCGATTTTAAACTGCTGGGAGTTTTGATTGACATCTCTTTCATA
CTGTGTAATAGTAAAAGTCACGGAACATGTAACTGGATGTACAAGCAGAT
GGATGTACCTAGTTCAGCAAAGGGATGATGCCAATGAAAAGGAACGCAAT
AGAAGAAATGAACATGGCAGATATTTTCCTTTACTTGCAGAGAGACAAAG
AAAAAAAATCCATGGAACCAAGGATTTAGGACCTTCCGTGCACTTCAGCG
ATATTTATTCATTTCCGCTGAAATAGCATTCTTAACTCAATGAAGCAATG
CCAAGAGAAAAAAAAAGAAGTTGAAAGGGCAAAAGGGTTGGTGCCTACTG
TCTGCTACCTGGACTTCAGAAACTGGTGTCGCATTGAGGCAGTTGACTCT
ATGTGTTCATATGGAAAGAAATTTGGGGATGGTATGGTAGCAAAGGAGTG
GGTTTCCTTTTATAGAGCCACAATGGTTCGTTTAGTTAAAAGAGTTGGTA
TTCAGCAGATCGATATTGCTGCCATATGGCTTTTCATTAGGATCCAATCA
ACTTTGGAATATTTCCTTGTGTCCACCTATGCTAGAGAAATCTCAGATAT
GCCTATAGGGCATCTCCTTTTTTTTACATGGATTTGGCCAGTTAGGCCAT
GCATCTAATAGCTGCAACCTGGCCAACATTGAAGATTGTCTCTTCTACAA
ATGTGCTGTTTCTAATCAATTGTAGTTGCAGTTTTGCAAATTTTATTGAT
TTTGGATGCGGTACTGCTAATCTGTGCTATGAAATTTGGTATTGCTAGAT
GTTGTACTGCCATATAATTTCATACATGTATTTCTTGATGTGGTGCTGCA
TAAAAATTTGATGTCATTTGTGGTACTGATGTACAATTTGATGATGTTTG
CTGCTAGTAATGTGAGGTTATTTGCTGCTAATAATGTGTTGGTCTTGCTG
AAATTATGTTGCTTGTTGTAGTATTGCTACGTGTTGGTCTTGCTGAAATG
TCGAAGATGGTTTGGGATCCATACCATACTAGAGTTTTCTGTGACATTTG
TATGGAGGAAGTGAACGACAATAATAGGGATGGGGGTTGCTTGAGTAGAA
AGGGGTACAAAAATCTTGGAGACAAATTTGCTGAAAAAACAGGGGAAAGA
TTAACGCAAAAACAATTCAAGAACAAATGAGATTCTTTAAAGAAGGATTA
CACGGGGTGGATGGAACTGCAAAATGCGACCGGGCTTGGTTGGGATCCTA
TAACAAAAACTATGGATGCAGATGATGATTGGTGGAAGAATCACATAGCT
GTAAGTTACTATCTTTTATACTCGTCTTTCCTTTGTATTTGTTATTATGA
TCATCAGACTGATCTCTCTATTATGTTCTTATTTACAGATTCGTCCTGAC
CATGCAAAATTTAGGAATGGACCACCTCCCAACTTGGAACAATAGGATGT
TATGTTTAGGAAGGCACATGTCACAGGACAATCAACTGCCATTGCAGGTC
AGGAAGAAGGAAATGGCAATGAGGCTCCAATAATGCTTGATGATGATACC
TCGCCTTCCAACAATGCAATAGCGAAACACAAGCATGTAGAGAATGAAAT
GGGAACTGGGAAACGCAAGCATGTGGGCTCGGATTTTTTCTCGGCTTACA
ACAATGCACTGAACACAATTGTATCAAGGCACACCGAAGGAAGTTCTAGC
AGTAAGGATGATCAGGTCCCAACTATGAAAGAGTTTTTAGGAATGGTTCG
AGATTGTGGAGTGATTGAAGGAACTGCTATCATGTACACTGCTGGCAAGC
TAGCTATGAACAAGGATCATAGAGAGGTGTTCGCAGCATTTGCAACAACT
GCAGGGAGGCTCGATTGGCTCCAGAGGACACATGATGAGATGGACAAGTA
G

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.