Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA002884

[Submit comment/correction]

Sequence	AA002884
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA002884
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CACAGCCCAAACTAGTCTTCTCCTCAAAGCTCAAACCCTAAATAAGTCCG TCATTATCCTCTCTCGCCTCCCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTTCTCCCC CCGCGTCATCATCTTCCGATCCCCATCGCCGCCGCCGCGGCCGTCCTCCC ATACTCGCCGTCGTCACTGCCCGTCGGCCTTCTCTCGCCGTCCCCCTCGA TTCTCTCCCGTCCGCCCAACCCGTGCTCTCGGTGTCTTCTTGGTACGTTC CTGCTTCAATCTCCGTCCCGTTCCCTTGTGCTGATGGGTTCTACGGGCCT GTCCAATTCCGGTGTCTCTTGCCTGAAATCGCCACTTCCCCTAGGCCAAG TGTATGTCCCGTGTCCCTGGATGTGCCTCCTAGGTAGACGTTTTCTCAAC TCACACTTAACTTTAACCGTCGATTAAACCAACAAGATTATCTAGATGCA TTTTAATGTGTAGATACATGCGGCTAGACAAATTTGCGACATTTAATATG GAACAGATATTGTATCTTTTATGCCATTGAACCATACTGTCGGAAACTTT TTTGAATATACAAATATAATGGTACAATTTTTATGACATATAATCCAGGC TTTATTACTTGTCAAATTGATTGTCAAACTTGAATCTCGAAATGTGTTGG TGCCACATAAGTTTGTACTTTGGACATAGGGAGTCAGAGCCTATTAAGAC TTGACTTGTCTATATGCTGGGTGATGATCTTTTCATCATCACTCGACCAG ATCTTTTGTGAATACCCTTTATCTGGTTCTATAAATTCTTGTAGGGAATT GTACATCTTTGGTGAATACCCTTTATTTGTTTTCATGAATTCTTCTAGGG AATTGTAAATCTTGCCCCTTAGGTGCGTCTTGACTAGTTCATTGTCGTGC TTCGCTCACTAGGCCTGTCTCATTTATCCTGGAACCAGTTTCTTGTGTGG CTTACTGATTCTTTCTCATTCACCATAGAAGCTAATTCTTTGACACGGGT TGGATATCAGTTGATGGTTATATTTTATTTATATAACAGTCATCACTGTG TTGAGTTTGTCAGGCCTTCGTGGGAATGGTCACATGCTTTGTGACTGCAT ATTTGTGCCAATTAACGTTACTGCGTATGGCTAATTTTTCCTTCTCAGCT CATCTGCTATGGTGTATATATAATTAATAGACACTGTGTATGTCTAATTT TCATTTTCCATTTCTTCTACTATGGTGCATAATTAACATATATTATCCGA TTCTTATGCATTTTCATTCTCTTGCATGCGCTGATTAATGGTTGATGTCA TTGTGTGAATAACTGTTGACTGTTACTTTTTGGATAAGCTTGCTGCTGGT TTTTGTTGGTGAATGCTGACTGACTCACTGGAATCCTGGCACATTTTTGC TAGCACATGCATTGTAGTGATACTTGACCCATTTGGTTTTATTCTTATTA TTTTGCTCTATCATGCTTGTTGAATGCATTTGTGCCATGTTATGTATGTT TAACTTAACATGTACTCCCTCCGTTCCTATGGATAGGGCGTATAATTTTT TTCAAACTTTCACCAGAGAATAAGGCGCAGGGTGCGGTCTGGCTGTGCTC TTCCAAATCTACCCCTTCCAGCCATTAACATCTACCTAAATTTGTGCCGC TGCCATTGGCTTTCTTGGCGCATGCGTGAGAGACAATTTATTGCGGTGCT GCTAATTGGTCATGCGTTGCATGCGGGGAGGAAGGGGCACTTAATATGCG TTGCATGCAGTAGAGAAAGTAGGAAACGGTTCCGCGGAAAGAAAAATTAA GCAACGAGTCTTACGTATTAATAGGGGCACAATTGGAAACAATTCATGTC GCCAGAGTCTCTTAATCGCCGAGCCAAAACATTTACGCCCTGTTCTTAGG AACGGAGGGAGTAGCTGATATGTATTTTCATTTTCATTTTTATAGTGTCA TTAATTTTATTGTCCATTTTCTTGTGTAGTTAGTTAAACCATGAGGCATG CTGCCAAGCGCACCAGTCAATACAGGGATCATGACAGAGAAGAGAGGGAC CAAAAGAGGAGGCCAGCCACACACACCCAGGAAAGCTCCGGTGTTGATGA ATTGGTTGTTTACCGGATACTTTGTCCAGACAAAGTGATTGGTAGTGTAA TTGGCAAGAACGGCAAGGTGATAAATTCTATCCGGCAGCAGACGAATGCC AAAGTCAAGGTTGTTGACCCTTACCCTGGTGCTGACAAAAGGGTTATTTT GGTATATTGTTATGTCAAGCATAGAGACCTCAATCATAGCGACATAGATG TTGGTGATGATGATAGGGAGCCTGTTTGCGCAGCACAAAATGCTTTACTC AAGGTACATGATGCAATTGTTGATGCTCTGGCCATCAATAGTGACTCAGG GGATGAAGAGGCCAACATTCTTGTACCAGCTAGTCAAGCTGCAAGTGTTA TCGGAAAATCTGGTGCTGTCATCAAGAGACTTCGGTCAATTTCAAAATCA TTCATTAAAGTTAGACCAAAAGATCCAAGCGAAGCTACACATGCCTGTGC TATGAGTTTTGATAATTTCGTTCAGGTACATCTTCCATATAATTTGGTGA AGCTATGCCAACATAACATGAGATTACCTATTAGGGAATATAAGTGCAAA TCAAGCAGAAAATTCGTTTGTTTTCAGGACATGCATTTGTGTTATAATGT AAGTATATATGGTTGTTGTCTCTCTAGCATGATGTAGGCAAACTAATTGT TTAATACTGTAGCCATGACTCCTACTGTAATAATTTATGATTTTATTCTT CTTCATGCATATTTATATTATGTCTCCCATATTAAACCAATTAATAATTC TGTTTGTTTTCTGTTTGTGCGCTGCACACACTTACTGTTCATGACAAACA ATTTCAACCATTGAATTCTGATATGTTCTTCAACATCCATTCTTTGTTTC ATATATATATATATATTCTGTTAAGTACTACTATTTTTATCAGATAACTG GGGATGCTAGAGCTGTCAAGAAAGCATTGTTTGCAGTATCAACAATCATC TACAAATGTCCATCAAGAGAGAACATTCCTCTTGAAACATCTATTCAAGA ACTTCCCCCAACCATTATACTTCCTTCAGAACTTCCTGTTTATCCAGCTA GTAATTTATACCCAGTCTCAGATGCTGCTATGCCTTCAGGACATCCAAGT CTAGCTATCTTAGGGGCAACACGTCATGGTTCTCATGCTCCTGAATATAC TGTGCCCGCTGATGCTCATGGCAGATTGCCCATTTATCAATCTATGGTTC CTGCTATTCCTACTTATAACACCCCAAAATGTTCAGGAGAGCTATTGCTG CGTGTTGTATGCCCTGGTGACAAGATTGGGTTGGTTATTGGTAAAGGTGG GGTGACCATTAAGAGTATAAGGAAAGAAAGTGGTGCAAGAATAGATGTTG ATGATGCAAAGAATGACAAGGAGGAAAGTATAATCACCATTGAATCCACT GAGGTTGGACCACACTTCCAGCTTGCTCGCTGAACTTTATCACTTATACC CATTTTTTTTTGTTTTTTTTGTTGAGGTGAGACCTTCCATTTCAGGCCAC CGATGATGTTAAATCTGCAGCAGTGGAAGCTGTTCTGCTGCTTCAAGCTA AGATCAATGATGAAAATGAAGATAGAATGCATCTTCGCCTTCTTGTTCCG GGTAATGTCATTGGCTGTCTTATCGGCAGGGGTGGTTCAATCATTAATGA TATGCGGAGTAAGTGTAAGGCGACTATCCACATATCAAAGGGCAGTAAGC CCCGGAGGGCATCTTCCAGTGATGAGCTTGTCGAGGTTTGCCCTCTGTGT TTGTTTGAGATATTCTCTGTGTGATCTATCTAGGTTTGTTTACATTTTTA TTGCTTATAGGTGCTCGGGGAAGTGGACAAACTGCGTGATGCTCTTGTTC AGATAGTTCTAAGACTTCGGGAAGATGTTCTGAAGGACAGTGTGGAGAGA CAAAACTCTGACAAGGATGGGAAGCTAACTGTTGCCACCACTGAACCGGT GTATTCAAGCAGCTTTCCGATGCCAGCATTATTACCTCCATTGCGCTATG ATCAAAAGAGTGAAGTTGAGCGTGGTTCAGATGTATATCCTCGTAGCAGC TCGTATGGATATAGCTCCATGCAGGTGCAATACTTTGCTTCAACATATTT TTTTTCTCTTTTGATCTTCAAAATGAGATCTAGATATAAGTTTGTGGTAT TAAATTGACCGATGATATCTTCCATCAGGCTGTGGATGATGGGTTTGGAG CACGCTCATATTCTTCGAAGGCTTATGGAAGGTAGGTTGCAACTGAGCTC ACCATAAGCTGTTTCCCAAACTGTGATCCTTCTGTGCAGGCTTCCTCATA TTTCTAGTTATTACTTGAACTCTATTTTAATTCTTACAATTGTATTTCCT TTTGCTGATTACGATCGGCCAGACGCCTCCCGGATATGGAAATGATTATT CCTTCTAGTGGCCTGCCAAAAGTAATGGGAAAGCATGGCACAAACTTGGA CAATATTAGAAAGGTTAGTTATTTCATATTACTGGTGCTTGCACTTTGAA TGAAGATACTAGCTTTGATGCGTTCAGCATCTAGTAAAGTAGTGGAAAAG AGGCCCGGTTGGATAGCAGAAAACTTTAATAGGAGATCAGATGTGGCTGC CTGAAATATTTCCTCGAACTGCAGTTGTTATGGGTGGGGTTACTTGCTTT CTCCTGTAATATTAAATCCAGTAGTACACGAGTCCTAAAATAACATTACT TTTCTAGCATATTAGATCATATGATTGTCTTACTAATTTTATTTCAATTT AGGATAGTAAATTTATCCATGACTAAGATGGAATGTGTAATGTAATGTGT ATACAACACTAAGACTGGGTTGTTCTCAAGCAACATTTGTAGAAAGACTA AAGTTTGCAACGTTAACATTCTTGAACATTTAGAAAAAAGAACAAGTTGT AATCTGACATCCTGAATGGTCTATTTTCTAAATTATACTCCCTCCGTTTC GAAACCTAAGATGTTTTAGGTTTGTGAAGAAAATGTATCTAGACTTGTTT TAATATATAGGTTCACTTATGTTTCTAATGAATCTAGACACTAAAACAAG TCTAGATACATTTGCTTCACAAAGCTAAAACATCTTATATTTTAAAACAG AGGGAGTACTTTGTACAATATGTTTTTCCTTACCATTGACGTGCGATTCT TGGGTATCACTGCAGATTTCGGGAGCTGTCATTGAAATTATTGAGTCAAA ATCATCTCGTCATGACCATGTTGCTCACATATCTGGCACCTCTGAGCAGA GGCAGTCCGCAGAGAGCTTGATCAAAGCTTTCATAATGTCTACATAAGGT TTCTGCTGTAGTTCCAAGGATATCTGTTTGGACTTCAGTCTGTTCTATCG GACCCCTCTTGTCATCCCGTAATTTCCTTTGGTGGTAGATCAAAAAGTGT TCTCCATCCCTTCAACTCTGGAATGAACCTCATGCTTATCTGGGAAAGAC AAACCACTCTATGTTCCTTAGGTTCTTGACCATGGCTTATTTATGTAGAC TTGTCCATGTTAATTATTGGCATGTTCAGATATTCCTAGTTAATCTACTT CAATCTTTGCTTAATCATAGCCGATTCTTTACCCTGCTTCAATCTTTGCT TAACCATAGCCGATTCTTTACCCTGCTTCAATCTTTGCTTAACCATAGCC GATTCTTTACTGTGTCAGCGATGATAGCTGATTCCTTCTCCCCCCAGCAT GGGGAGCCCTTATACTCTTCTGGTACTTGCAATCATGCAATGATAGTCTT GAATCAGAACATGCAGTGCACGTTTTTTGGTGTTTTGCATGGAGGCAATA TCATCCTTTAGATATCTTAGGAGTGTTCAAATATTTCAATCTTAGATATC TTCTCATCATTACTAAGTATACTTATCCCTTTCCCGTTTCAAAAATTCTT CTTTTCAATCAGGTCTAGTTTTTCAGAGTAATGGCCTAGAATTATGTATA ATCTGAAAGAATAGGTTCTGTACTCCACTTCCCATTCATCATCTCAACTT CTGCTGCCATTCGTTAACCATCTGTGCTGTAGATATGATTACGTTTCTGA TATCAACTGTGAAATAGTACTCCTAGGTAGGTAGTCATGGCAACCTTTTG TAAATAATTTCTGCTTATGTATTGCTGCTGCTTGGCAGCTACTGTTAGCG CAACACCATTAGTTGGTTTCT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.