Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA002278

[Submit comment/correction]

Sequence
AA002278
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA002278
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCCCTCGTCACGAACAAAAAAACCCTTCCAATCTCCAAAAGAGGAGATAG
CCCTCTTCCTCCTCTCAAGCGGAGCGCCCAACCCCCCGCGGCGCTCCGAC
TTCGACCTACCCACCCACCGCCGGGCGGAGCCACCAACGCCACCACCAGA
CCATCCCATGGAGTCCGCCGCCACCCTCGCCGTATCCCACCACCGGCTCG
CCGTCCCGTCCGCGCGTTGGCATACCCGCCCGTCCGCACACCTTATCCGC
ATGCCGCGCCTTATCCGCCCCCCGCGCCTCCGGGTCGCCGCCTCCGCCTC
CTCCTCCTCGTCGCCTCCCTCGAGGCGGGACCACGCCGCCTCCGGTCTCG
AGCGGTGCCTTGCCGCGACCCAGGCGCCGGCCTCGGCTCCGCCCGAGATG
AAGGGCGGGAGGCGCGGGGCGTTTGGGGCCGTCACGCTCGAGAAGGCTAA
GCTCGACCTCTCCCAGAAGAAGCTCAAGGGCGTCCAACCCGAGGTGCGTG
CGTCACGCCGTTAGTTTGTTGTTATTAAGATTCCGCGGTGATTCAATTGG
ATTATCCCTTGCGTGGAATTGAAGGCAACTTCTCAATTCTGATGCTGGTA
TTGTTGGTTGAAGATGAGTCATAACGTTGATTGCGCCCTTTCTGTTTAAG
GGAAGGTTTGTAGGTAGGGATGCCCGATCCGTTCTCAATAGCTTGTGATA
AGGCAGGAAAGCTAGTAGATGCCCTGCCCTCGCATTAAAGCATCGATGAT
GATGCGTTTTTTTCTTTAATGATAAATGAGGTGGGGAAATTAGTTAATCT
CTAATAACTATCTGTGTCTATTCGGTGTAAGTTTCGTCCATGATCTGTGC
TGCCAACCGAGCTCTCATTGGGAGGCGAAGTACTATAGTAGGTGAATGTA
CGGATGAATGAATCTCATGGCCATGCGTCTACTTCTCAGGCAAATATCCT
CATTCACAGATACATTTCCGGGGAATTTGTGCTGTAGCCCTAAGGTAGCT
AGCTTGCTGCTTGCTGCTTGCGTACCAGTGTCATCAAATGTTCTGGATAT
CAAGGCAGAAATATGACTATAGAGTAAAATACTTGGGCAGGGTGTAGTCG
GTTGCTTGCCTTATTCTAGGAAAACTGTTATCTGGACTAAACCAGAATAT
GGGTGCAAATAAAGACTGGTTAACATGTTATCTGTTCATTGAACTTGTGG
ATGTAAAATTGTTAAACTCTCGGTTACTGTTATTTCATTCTTTGTAACCT
TTACCTTGTTTGAGTTTGAACCGAAGATACCGTGATTGCCTTATCTACGA
TTCTATTAGCTAGATACCTAATTCTTACCTTAAAGTACCCAGGAGGGAGG
TATTTAAGTAGTTAGCTGGTACAACTTCACAAATTTGGTGGATGGCTACA
GAAGCAGTCTGATACATCTACCATATTAGAGGGGAACATGCTAAATTTCT
CCATTCCTTCAGTCCAATCGTGCAGCCAACCGCAAAAACCAGTAGAATGG
ACAATTAAAATTGATGTAGCAGAAGATTGAAAAGACTGCTATGTTATGTG
GGGCCAGGCATATACGATACAGGAATGCAGGGCCAGTGATTGCCAGCAGT
ACACCCATAGGAGATGAGATCCCCAAATCACAAGAACTATTTTCTTAACC
GTTCATTAACTACAATGCTGCTTGAAATTGCATTTAATGCTCTGAATGAA
TAGTTAGGCACGTCTAGCCTTTTTTTTCCCTAGAACTGAACATTTGGATG
CTCTGAAATGTGGTATATCTTAACCTCCCAGCAAGGTTCTAAAATGTTAA
TAAAAGTTTGTGATGACAAATTTTCTTAAACATACAGTATATCACTGGCA
TGCCATGAGTCATGAGAGATGGCTAGATGGGGAGACTTGTCCACTGATTT
GGTTTCTTTTCCGAATTATGGATCCACCATCTTTGAAACATTTAATGTTT
TCATAGCTTTCATTTTAATTTATGAAGAAGTGTTCACATTCAATTGCTAT
CATTTCTGATGGGTGTTTTTAGTTCTCTCAGTTGCTGGTCTCTCATAATT
TCCTACTAGTCTTGTTTTAGGGCTGTCAAAATGTTGATTGTAATGATTTT
ATATGCACTTTGACTCTGTATATTCACGAATTTGGATGCTTATTCTCACC
AAGAAAATTTTAGTGTCCTAAACATTTTTTTACAGTAAGATGTAAGTTGG
TAGAGATCTGTTTGATTTTCAAATAAAATTTAAGGGCATGCAAATGAAAA
AAGAACAGGTGTAGTTTAAGTTCTCCAATATGCATTTTGCTATTTTGGAG
ATTCCACTTTGCTATGCTCAGTTGTCTGTTTCTACTTATATATTTCTTCC
TGTGCATATGCTTTTGGAGGTTCCACTTTGAAAATATTATTTTGGCATTC
TATTGCCCGTGCATATGTTGTGGTTCAGTATATTATCTCTTAGGAACTGA
AATTATGTACACCTTTGTTTATTTACGACTCATGTCTTCACAAAACACTA
TAGCTGGCAACCGGCAGTGGTGGCGGAGACAATGGGAGACGAATTGGTTA
TGGCGGTGGTAATAGTGGAGATGACGATGGTGATGATGATGATTACTTTG
AAGACTCTGAAGATGGAGATGAAGAAAGTGGATTTTTCAGAAGACGTATT
ATTATACAAGAGGTCCAACTCTCATTAAGAAGCCCTCTTACCCATGCTCC
TTGAATATGATCGATGTTTCAAATTGATGTCTTTTATGTTTCTCTGTTTG
TACAGCTTTTTAAAAGAGAGTTTGTTGATGCTGTTCTTCAAGAGTGGTAC
AAAACAATGAGTAATTTGCCTGCTGGGTTGCGTCAAGCTCACGAGATGGT
ATTGAACTATCTGCATTCTCTTACACATACTTTGAGCTTTGATCCTAAAC
CATGGAACCATATCAACTGGACTTGTTTTTGTAGGGTTTGGTCAGCTCTG
CTCAGATGGTCCAATATCTATCAAATTTTGGAAGGCCTACAAAGGCTAGA
TATTTCTCTCGAGCTTTTCCAGGCTTCTTCTCAAGTGGCCTTGTTGGAAG
GTACTATCTGAAAATTATTTGTTTGGTGATATCTGTGCAACATGTGAGAT
TTTCGTTTTTAAGTTATTCCCATCTTGTTGAACGTGGTATGCTGAGCTTT
CTTACATGGAATTGCTTACTGTCTGTAAAACTGGAGGCTCTATGCTGAAT
AGTTTGTCTGCCATCGCTATACTTCCTCCGTTTCATATTACTCCGCATGT
TAGCTTCGGTCAAGGTCATACTTTATAAAGTTTGACCCATTATATTGAAA
TATATATTAACAATTACAATATCAAACCAATATTAATTGAAACATGGTGA
AATATACTATCATATTATATACATTTGCTATTATAAATGTTAATAATTTA
TCATGTACTCCCTCCATCCCAAAATGTAAGGCGCCTAAGCTTTAGTCAAA
ATTCAATATATTTTAAGTTTGACCAAATTTATATGTAAAATATAAACATC
CACAATATCAAATCAATTTTATTAGATTCACCATGAAGTATAGTTTCCTA
ATATGTCCATTCGATATTGCAGATATTCGTATTTTTTTGTATAAACTTGG
TCAAACTTAGAAGATGTTGACTTTTGACTAAAGCTAGCCTTACATTTTGG
GACGGAGGGAGTATATATTTGGTCAAACATTATGAAGCTTGACTTCTACT
ATTCCTATTGTGCGGAGTAATATGAAACGGAGGTGGAGTACTCCCTCCGA
TCCATATTAATTGACTTTGATTTGTCAAAATTTGGATGAACCTATATACT
AAATAGTGTCTAGATTCATTCAAATCTAGACAAATTTGAGTCAATTAATA
TGGGCCGGAGGGAGTATCTAATTATATTACTTGAAGTACCTGGAATCCTG
GATCAAAACTGTACTTGTAAGTTGTAAAATTAGCAAACTTCAATCATATT
CTCTCGCAAAAATAAATAAATCATGCTTTGTTGTATAAGAATTAAGAAAT
GGTGATGAAACCAATGTTTGGACATAATCTTTTTGTTAATATTTGCTAAA
ACGTTTTCTAGACAGCTGGTAGTCAACACATCAGAAATCTGAATGAGTGG
TTTTAGCCATGGTACGTCAGTACCTTGGTAATGTCAAATATTGTAACTTT
ATAATATGTTTATCTACCATTGCTATTGATTAACATTTAGAATGACCGTT
AGAGCTTCCAGCTTCATCGGTATTTTTGAGTTGTACTTGATCTTGAACTT
GTTTATTTGAAAATATATTTAGAATAACTAACGTTATGGGCCTAAACATT
ATATTCTGAGCAGTAAATTGTATTACTTCATTGCTAAAATAGCATCAGCA
TGCACTCTGATTGCATTCGTAATCTTTGCATGTCCCTTGCGTTGATTTTA
CAACTTAGCAATAACAAGTTAACAATTGGCATATCTTCTCCAAATTGCAG
AATGCTTGCAGATCCATCGTTCCTGCACAAGATGACCTTTGAGTTACTAG
CTACAGCCAGTTCTTCTGTTTGGTGGGAGATGCAGAATCGCAAGGAGAGG
TATGTTGTGGTTTCTAGCTGTCCAAAACCAGAATTTTTGTCATCTATCTC
ATCCGATCCTACATTTTTTGGGGTGTTAGGTTCCAACAAGAATGGGATTT
GGTTTTCCTCAATGTATTCAGTGCTACAGTTTGCAATTTAGCAGTTTTCT
GTTCACTTGCACCATGCCGTTCATATATGATCCAGAAACTTCCCAATAAT
ATATTCGAGAAGAGCTATCCTATGAGACAGTTTGATCTTCTAACAAGAAC
CCAGTCCTTGTTTAGCAAGGCTGCTGAGCTTTGCCTAGGTGGGCTACTTG
TTGGCTCCATTCAAGGTGGTCTATCCAATGTCCTTTCTGCTGGAAAAGAA
AGAAGGTGAGCTACTATGTGCAGTTTATCTCCATGTTCATGAAATGGCTT
CTTCTAAAGTAACTGTCCAATTCTATCAGTGCATTTTTAGAATTTTAGTT
TGACCATTCTCGCTCCATGTAGGTTATCGATGACTGTTCCTTCTATCAGC
AACCATGCTCTTAGTTATGGAGCTTTCTATGGGCTTTATGCAAATCTGCG
GTATCAAATGTTATGTGGTCTTGAAAGATCAATGGCAGACCGGTTTGATG
TTCTTGGTGTTACAATCATGTTCGGCACAGCAATAAGGTAGATCTCTACA
GAATCATTTTCCCTGCAATTTCACCAAAAGCTTACTCACATGGTTCATTA
TATGTAGATACAGCTGCATGTTTAACTTAACCCAAACTTTATTTTTTCAT
TCTGAATTGAAGCTACTGACTCGATTTGATTCAGATTTGCGGTGATATCA
CAAATGATATCCACAATATTAACATTTGGTAGCTAATGCTATACTTGATG
TGACACCACTTCAGCGATCAAATGATTTTGTTGTGATAGAATGGTTACAT
CTTGCAATTTCTACATGATAGCATGTTTTGGAAACCCATCGCATGTGAGG
AATTACCAGTTATGTTGTAGGGTTATATGTTTTTCACCTCTATAATTTGG
CATGGATAATATCTCCTATTCACTGAACCACAAAGTATATTAGCGAACTG
CTCCTAAAAGGTGCCAATTTTGAGAACATTCCGTATTAACCACTCAATTG
CAACTGATTGCACATGAATTACAGGTTGATGAATATACAAATTGGGGAGG
TATCGAGACGTGCCTGGCTTGGTGAGGGAGCAGATGTGCTTAACTCGGAT
AATCTGCTGAGAACTTACAGCGGCCCAGCAGCAGAGCTTGTCATTGATGA
ACAACAGCCAGGGTGGTTTATTTCCAAGAAGGCAATCGTATCTGGCTTAG
AACTTCTAGGCGTCAAGCATGGTGCACCTGAAGATGCCTCTCCAAAGCGT
CGACGGAAGAGGCTTGTCCAAAAGAAGTAGGGTGAACGAGGAAAATTTTC
TAACTGCTCTTTCAACGGAAGCTGAGTTCACTCGTTCTGATACCCATTCT
GGAACATTTTCCTTCAGTTCCACTATGTCTTGTGTTCCCTAGTAGGATGG
CTGAAGAAAATTTGTAACTGGTATTTCGGTTGCATTCTGAGGCAAGATTG
GAGGCTTGCAACCTTTTGCTCTTGAGGCAATTCATCTGGTAGCCTTTAGG
CTTTTACGTTTCTTTTGTGCTGTTTCGAGCACAGGTATACC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.