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GrainGenes Sequence Report: AA002076

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Sequence
AA002076
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA002076
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCACGAGTCTCCACGGCCACCCACTCTCTTTCCTTTCCTCTCCTTCCTCC
TCCGCTCCAGTCCACGACCACCGTTCCACGGCACGACCACAATGCCGCAT
GACCGCCAAGCCCCCGTCAATGCCTCCTCCCATTCCCCCACCGTTCCACC
CACTACCAGTCTCCTCCGTCCACCCCGCCTAACACGCGCAAGGAGAGAGA
AAGGCCTCCTCAAACCCTAGGTAAGCTTCGCTTCCTCTGCTCCGACATAC
CGCAGTTCTTCCCCGTTTTAAGATTCTGTAGTAGTTTCCTCTTGTGCGCG
CATACCTTTGGCCTTTTGGTATGATATGTGATTTCATGGTGGAGTTGGAG
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GTCTAGTTCGAGCAAGTTACTCTCTGAACTTCTGATGCTGTGGTTGTGTA
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AATTTGCAGCCTTCAACTATTTGTTATAGTAAGTTAGCAACACAACACAT
GTGAATACTAGTGTTATAGCTCCTTAAGTAAAACGAGGATACATGGAACT
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ATGTAAAGAATGAAGCACTGGTGAAAATTTCATGTTATAACGGTTCTGAG
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GAGCCATCTGTTACCTCAGAGAACATAGTTTCACCGCGCAGACATAATGT
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CAAGATATTCGTGCTATCGTGTATTTTTGCAGTTTCTGTGGACCCATTGT
TCCTCTATATCCCGGTTATCAATGATCAAAATTCTTGCTGGTATTTGGAT
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GCAAAGCGGTATTTGTCAACATATTTTCTGATTGATGTCTGTGCTGTCTT
ACCCCTCCCTCAGGTACTATACTATTTAGTTGGTTAGGCTTACGGTGGAC
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TTTGGGGATTTTCTTGTAATTTCTAATTCCGAATAGTGCACTAACTAAGC
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CCCTCGGCTAATCCGAATAAGACCATTGTATCTTCAAATCACCAGATCTG
CTGGGATAATTACAGAGACAGCATGGGCTGGTGCTGTTTTCAACCTCATA
AATTACATGCTTGCTAGCCATGTAAGTGCCCTGTTCATTTATTTCTGTAT
TGTGAATAATGTAAGTCAGTTATCCTTATTTGCAATAACCGTGAAGTCAG
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CAAAAGTTCTGCATGAGATTATCTATGATACTTTGTCGATGGGGTGGCAC
AGTATGTCTGTTGTACAGCTCAGTTGCTTCCCTTTTTCATTTTTATAACT
TTGCATAACACCCACCGAGGTCTCTAATGTCCTATCTGTGTGAGAACTAT
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ATTACAGATAGGATAGAAATGACTGAGAAATACATGTAAGTATGATGCAG
TTCTTTTCCTTCATTGACCATGGTGGTGCTTCTTATGTTTGTGCATGTTC
TCATTTTGAGCATCAACTTGTTAGCACAAATTTATTGTATAAAGTCATAA
GATCGTCTTTGTTTATTTGCTGCATGTTGTTTTCAACTTGTCACAAAAGC
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TCCATTTAATTATATATTTCTCTAGATCTATCAGTCTACGGTGTGCAAAA
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CTGTTGAGTATTGTAGACAATACCTCCTGTCTCATGAGCACAACATGCAT
AAATGTGTAGCCATCTCCTGTGCTAGACTTCACAAGGGACAGCGCTGCTG
ATTTGTCTATCTAACTGTTGTCTATTCCAACCTTCCAATAAGGTTTTGGA
CAAAGTAATCAATTCTGTTCTGGAGATCATTCTGGTTTGCGCTGGTATAG
GACCATTCCAGGCTTCCAACCTGTTCTGGATTTTGTATAATAGTAACATG
TGTATTTATGTTACAGTGCCTTCGTAACATGCCCTTGGTGAGGTCTCCTC
CCTGTTTAGATATATTCTACTCTACCACACATATGCCAATTTCCTGAGAG
TTGCTGAGAGATATTGTTAAAATGGTTTCCACATTTTATAGTCTATGTCA
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ATACATAGCATTGTATTATCTTGTAATTTCTGTTAACATATTATTATTAT
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GGGATGCTGTTGCATTTGTGGAGGAGAAACAGTTTATTCGGCGGTGTTTG
AGGTTGATTGCACTGAGCTGGTCCATATCTGGAAGTTGGGACGGAGTGAT
CGCTCGGTGATCTCGCCCATATTAGATGATATTTGTGAGCTTAGCTTCTC
GTTTGAGTCTTTTAGTTCATGTTCAGTTCGCTGGTCAGCCAATTAGGTGG
CTCACAACTATGCTATGTACACTTGCACTAATGTGGTGTCAGATTGGCTG
GCAGAATGTCCTCAGTTTAAGTTCACAACCTAGTGGCTGATTGTAACTCT
GTGGCTTCTTATTAATAAAGCTCATGTTATTCTCAAAAAAAAGGCAAAAG
ACTCAAGTTTGTATATTCTAGCTCATGTCGATCTTTGAAGTGACATCTGT
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GCTAATATACGGGTAATCTTTAATATCTGCAGGTCCTTGGAGCGGTTTGG
TACTTGCTTTCTATTCAACGCAAAGATGCCTGCTGGAGACTGAAATGCGG
TCATAATGAAGACTGTAAACCTGCATATTTATACTGTGGGAATGGTGATA
CGAATTTAGGAAATGCTTTCTTACAGAGTGTTTGCATTCCAACTGACCCC
ACGAACAATCTTCCAGACCCATTCTTTGGAATTTATGGGCCAGCTTTACA
AAATGTTTCACAATCAACAAATTTTTTTGAGAAATTATTTTATTGTGTTT
GGTGGGGTCTACAAAATCTCAGGTTTGCCCTAAAGATAACTGCAGTCTGC
AGTGCATATATATTTATGGATTGTAACACTTAGTCACTTACATTTGCATT
GATCTATTTAATGCAGTTCTCTTGGCCAAAACTTAAAAACAAGCACTTAT
GCATGGGAGAATTTGTTTGCAGTTTTTGTCTCAGTATCCGGCTTAGTTCT
GTTTTCACTTCTCATCGGTAATGTGCAGGTAATATTTATCACTGATAGCT
AGTAATATTCTAATTCGTTTTCTCCATTTTATTTCAGAAATTTGTAGATA
TCTTGGAACAAAAATAAATAAATACCTTTCTTGAAATTATTGCATCAATA
AAAAATGCATTTGGAAACAGAAACATGATAATGTGCTATTGTTCTGATAC
CTACATGATCCCAAATTTAAAAGGGAAATTTGGTTTTTTGCCATCAATTA
GTCCCTAATCTGGTTTTTGGCTGTTAAAATTGTCCGTATTACCAACATGT
ATCTACGTTTCTAATCCGTTCACTAGATCTACACCAAACAATTGTTTTAA
TTCGTTCCTAGCGATACGCTCTTGTTCAAGTAGTGTACAACTTTTAGGTC
TCATATACATATTGCTTGTTTGGTTTCCATGCCCTTGACCGCGAAATTTA
GTAACTGTAACATAACTCAGCTATCATTTATTTTGCTGCTTAAATGTTGG
GAGCTGGTGTGGTTATAATCCTCCAACGTTCTATGGATTCTATAGCTTAC
ACGAGGAAAATCCTCCCACCTTGGTTTAGGTTGTTTACGCAGTGTAAATT
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TATATAGGAGAGGGGGGAGAGGAGGTGCAGCGCACCGGCCTAAACCCTAA
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GGCTCGATAACGTTGAGACTGAAACGAATCTCTGTAAATGGTGTAGTAGC
AAGTCCTTTGGTAAAAATATCTGCAAACCGGCCGTAGAAGGCACATGAAG
AACACGCACTTCTCCCAAAGCGACCTTCTCTCGAACAAAATGGATGTCAA
TCTCGATGTGCTTTGGCCGCCGATGCTGAACTGGGTTTCCAGACATGTAA
ACAGCTGAAATGTTATCACAATATACCACTGTGGCCTGACCAATAGGTCG
ATGTAACTCAACAAGTAACTGACGCAACCAAACTGTTTCAGCAACTGCGT
GAGCAACAGCACGGTACTCAGCCTCTGCGGACGAGCGAGAAACCGTAAGC
TGACGCTTCGAAGACCAAGAAATTAAATTATTGCCAAGAAAAATACAGTA
TCCTGAAGTGGATCGACGAGTGTCTGGACAACCAGCCCAGTCTGCATCGG
AATATGCTGCATCGGAATATGCTGTCAATGATGTGGGTGATGAGTGGTTG
ATATGCAAACTATGATCTAATGTACCTTTGAGATATCTAATTATGCGTTT
GACATGGTTAAAATGCGGGACTCTTGGATCATGCATGTAAAGACAAGCTT
GTTGGACAGCATATGATATTTCTGGACGTGTAATGGTGAGATACTAAAGG
GCTCCAGTTAAGCTACGGTATAGAGTCGGATCAGGAAAAATATCACCATT
CGAGGAAAATTTAGAAGAAGTATCTACAGGTGTACGGGATGGTTGACAAT
CTAACATTCCAGCCCTAGTTAGGAGATCAACAGAGTACTGACGTTGAGAG
AGAAAAAGACCAGAAGATTCACGAATGACAGCTATACCTAAGAAGTGATG
AAGGGAACCTAGATCAGTCATAGAGAATTCAGTTTGTAGGAGAGAAATAA
TATGAGTGAGAAGAACTATATCATCAATATAAAGTAGGAGATATGCAACC
TGGGTGTTGGAGTGGTAAACAAAAAGAGAGTAGTCAGAACGAGAGGGAAT
GAATCCTATAGTTTGAATAAAGGTAGAAAAACGTTGAAACCAGGCTCGGG
GTGCTTGTTTGAGGCCATAGAGAGATTTTTGGAGAAGGCAAACGTGATCA
GGAAAAGAAGAATCTTCGAAACCGGAAGGTTGTTGAGAATAGACGACTTC
GTTTAAGGAACCATGAAGGAAAGCATTTTTTACATCGAGTTGATGAATGG
GCCAGGAAGAGGAAACAACAAGACTAAGAATGGTTCGGATGGTGCTAGGT
TTAACTACTGGAGAGAAAGTTTCGTCGTAATCGACACCGTGTTGTTGAGA
GAACCCACGACAAACCCAACGCGCTTTATACCGAGAGAGAGTGCCATCAG
AATGAAATTTTTGACGGAACACCCACTTTCCAGAAACAACATTTGCATTA
GGAGGTCGGGGAACAAGTTGCCATGTGTTATTGGATTGGAGTGCTTGAAA
CTCACCGCGCATGGCAGCGGACCAGTTCGGATCAAGAAGAGCAGATTTGT
ATGTTTTGGGAAGAGGTGAGAGAGTTGGAGAAGCATGAAGATTGAGGCGT
GTTTTAGGAAGTCGAAAACCAGACTTGGCACGTGTGCGCATGGAATGGTC
GTTGTTAGGTGCGATAATGGGAACGGCATGTGAAGGAGGAGCTGCTGCAT
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GTAGTTTGATTGTCGGGGGCAGGAGTTTTGGGGCGGCGAGCGTAAACCTG
GGTTATGGGTGGTCGAGACACGGGTGCTGATGGGGCTGTCGAGGCAGCCG
AGTCGGCCGGGGCAGGGTTAGGGACTACCGTGGCAGGAGAATCGGGAGCG
GTATTGGTCGAGGCAGGATAGTGGGCAGCCGTGGCAGGGTTGTAGGGCAG
GTTAGGAACGAAAAAGTGAGGTTTTATGGAATTGGCTGGGCGAGGGGTGG
ATGTGGTGGGAGTAGATGTAGGGGTTCTAGTGGCGAAAGGAAAGGTGTTT
TCATCGAAAGTGACATGCCTAGAGATGTGAATGTGACCGGTCACAAGATC
AAAACACCGGTAGCCTTTGTGTTCATCTGAATAACCTAGGAAGACACAAG
GAAGGGAACGTGGAGAGAGTTTGTTTGGGGAAGTTGCATAGACATTGGGA
AAGCAAAGGCAACCAAAAACGCGAAACTCAGTGTAGTTTGGGTGAGAGAG
AAAAAGGGAGTAGAAAGGTGTGGTGTTTGGGTTAGTGCTAGATGGTCGAA
TATTGAGGAGATAGGTTGCGGTTCTAAGAGCTTCAGCCCAAAACGTGGAG
GGCATAGATGATTGAATGAGGAGTGTGCGAACTATGTCATTGATGGTGCG
GAGTGATCGCTCAGCCTTGCCATTTTGTGGGAAAGTGTAAGGGCAAGAGA
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TTAAATTCTTTTCCATTGTCACATTGGATAAATTTTATGGGTAAAAAGAA
GTGTGTGTGGACATAGGTTTTAAAGTTGATAAAAAGTGAGTGGACATCAG
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ATAACTAAGTAGTATTTGAAACCGGAGAGACTCATAGTTGGAGAGGTCCA
TAGATCACAGTGCAAAAGTTCAAAGGGATAAGTACTATGAGAAGTAGAAT
GCGCAAATGGTAAACGAACATGTTTTCCTTGTTGACAGAACTCACAAACG
GAAGAATTATGAACCTCTGTATTACAAGGGATCGAAAAATCACTAAGTAG
AGAGGATAAAGTGGCTTTATTCGGATGGCCTAAGCGTTGATGCCATAGAT
CTACGGAGGCGAGCATGGATGATGGAGACGAGGCCACAGGAGTGCCATGA
ACAGAGTAGAGGTCGCCAGAGCTATCGAAGCGAGCGATCTCCACCTTGGT
CATGAAATCCTTCACAGACAAGCCAAAAGGGTCAAATTCGACAGAAACAT
AGTTGTCTTTAGTGAAACGACGAACAGAGATTAAATTTTTAATGAGGGCT
GGTGCAACTAAGACATCTTTAAGTAGGAGTGGTTTGGAAGTGGAAGATGC
AAGGTTTGTATGACCGACACATGAAATTGGTATGGAGGAACCATCGCCTA
ATGTAATGGATGAAAAATGAGATGGTATGCAAGTTGACAGCATAGTATTC
GATGAAGACATGTGACTAGAAGCACCAGAATCGAAAATCCAATCAGTACC
TGAGTTACCTTGAGCAGCAAAATTATTCATGGCCTGTAGAAACGCAACTT
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GGCGCAGGTGGTGGCGGTGCAGCAGGAGTCGAGTACATGGTGTATGGCGA
GTAGTAGCCTCCAGGATTATAAGTGACCGGTGCCGAAGGGCCATAAGGAC
CCATAGCAAAGGGCATCGGCGAGTGCATCGGCGAGGCATAGGGAGCCGAC
GATGGTGCAGCATACATGGGCGGTGAAGGAGCGGCGTAATGAGCTTGTGC
AGGGACCCGTGGTGCAAGGAGGCCAGGTGAGCCTGTATGAGGATGCACGC
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CCGGTGCTGTTGGAGGAGGCCTTGGTGCAGGCGGCCGATAGATAGGCCGG
GTGCCCCTATAGTTGGGGCTAGGGCGCCAACCTGGCGGTGGAACAGGCGC
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AGCATGGAGCGGACTTCTGCAAAGGAAGGAGACGGCCGCATCATGGGGAT
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GCAGCCCTGAAAACGAGATTGAAAATCTTGGTGCTCACCCGCTGGTAGAT
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ACGGCGGGATGTTGGGGTCGACGTGCGCCATGAGGTTGCAGCGGCCCAAG
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TGATGGTGGTGGCGATAGGAGGTGGGGTGGATGGTTTGGCAGCCGCGACG
GCGGCCATGGCGGCGCGCCACTCGAAGAACCCCAGAGGGGGCGGTGGCGG
CGAGGTGGGAGGCGTGGGAGCCATGCCCTAGAATCTAACCTTAATCTGAT
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TGTACAAGAGCGTATCGCCAGGAAAATACAATTGTTGGGTGTAGATCCAT
TGGACGGTTTAGAAACATAGATATGCGGATGGTTTTAACAACCAAAAATC
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GGGAGAGGGGGTTGTGCTGGAGCAAACCTCAGGGTGCAGGTGGGAGTGGG
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CCCGTGGGTAAACAAGAAAAAATGGTGGGTTTTCGTGGGAAGCCGACGAT
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TGTCTAGATTTGAATATATCTAGTCATATTTTAGTGATAGATATATCTGA
ATCTAGCCAAATATGAGAACATTAATTTGGATCGAAAGGAGTAGGAATTT
CCCAATCAAACAAATATTATGTCTAGTAAAAAGAATGGCGAGTCACTTAA
AAAGTGGAAAAAACAATTACTACATTGAAGTGCTAAATGTTGATCGTATT
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GTATTTGTGGGTATATGTGAACATATGTGGGATAGTGGGCACCCGCATAA
GTTTCGCGGGCTCCCGTAGGACACCCACTTAAATTATGTGGGACTGCGCG
GGCATATGCGGGCCTCCCGCGGGCAGTCCCACCTACACCCTGAAGCAAAC
CTCTATCTTGAATGATAGACTGGTGCTAAAGTGTATCCACGCCAGAAAAA
AAATTCATGATTGAGTTACGCAATACCAAAAAATTGTATTTTATGATCAT
AAAGCCAGAAAACTGTCCAACTGATCTTGAGAAAGATTGATGCATATTCT
TGTACTCTCGGCTGTGATTTGTAAGTGCTAACCCCATGGAATTGTGTGAC
ATTCCATACCATTATAACTTTATTAGTTCAAAAGCAGTATAGTATTGGCG
GAAAATTGGATCGATTTAAGTACAACAAGATGTTAATTTTTTAAATCATG
GAAGAAATAATACTCCCTCTGTCCCGAATTACTTGTCGCAGATTTGTTTA
GATACACATGTATTTAGACACGTTTTATTGTATAGATACATGCGAATCTA
GAAAATCCGTGACATCTAATTTGGGACAGAGGGAGTACAAAACAATGTTC
AAATTCTCCCTGGTATAGAAAAACAATATGGTATTCTTTGCTGACATGTG
AGTGGGTGCTATTTGGGTAATAGCTAACGCATGCTCAAAGCCTTAACTGT
TTTCTTTTGTCTTTTTCTGTGAGTTTTACAGACCTACTTGCAGTCAGCTT
CTTTGAGAATAGAAGAAACAAGAGTGAAAAGCCGTGACACAGATCAATGG
ATGTCATATCGACTTCTTCCTGAGAACCTCAAGGAGAGAATACGGCGTTA
TGAACAATATAGATGGCAAGAGACAAGTGGGGTTGATGAAGAGAACCTCC
TGATGAACCTCCCCAAGGATCTTAGGAGGGATATAAAACGGCATCTTTGT
TTATCACTTCTCATGAGGGTATATTCTTACAACATACAAGTTTCTGATTG
CAGAGTAACTTGCTGTGCTGGATATAAATAGCAATGTTGGTCTCAGATCT
GAGGGAGTTTTGGAAAAATCGGTTGGTCAAGCAAACAGTTAAACTATTTA
CACCCAGTAATAAAGCTGTTGCGCTTGCCTTTTTCTGAACAATCGTATTG
CTTGAGCAGTAATTGTTAATCTTCTCTTGAGCCAGTTTAAGAAAATCTTC
TGGTCCAGTGAACAGTTGGGGTATTTTTAAGACCATATCATCTGAGTTAT
GACTTGTGAATGATTCTCCTGTTGCGGCCGTGAGTAGTCAGTAGTCAGGA
CTCATCACAGATGACCTAAACTGACCTAAACTACAGTCAAGATATTCCAT
CTATTGGTTACCCTTAATGTATTCACCTTGTTGGTTTTTTCATTTTCAGG
TTCCAATGTTTGAAAACATGGACGATCAACTCTTGAATGCCTTGTGCGAC
CGCCTAAAGCCTGTTTTATACACAGTAGGTGGCTGCATTGTTCGTGAAGG
CGATCCAGTAAATGAAATGTTCTTCATCATGAGAGGAAGCCTCATGAGTA
TGACGACAAATGGTGGAAAAACTGGCTTCTTCAACTCTGATGTTCTGAAA
GGTGGAGACTTCTGTGGTGAGGAGCTTCTTACCTGGGCTCTTGATCCCAA
CTCAACATCCAGTCTCCCCAGCTCAACCAGGACAGTGAAGCCGATGTCTG
AAGTTGAAGGTTTTGCTTTGATGGCTGAAGATTTGAAGTTTGTGGCGACT
CAATTCCGACGACTCCACAGCAAACAGCTCCGTCACACGTTCAGGTTCTA
TTCACAGCAGTGGAAAACCTGGGCTGCCTGTTTTATACAAGCGGCCTGGC
ACAGGCGCTGCAGAAAGAAGATTGAGGATTCTTTACGTGAGAAAGAGGAG
CGGTTGCAGCTTGCGATCGTGAATGATGGCTCTACTTCGCTCAGCTTTGG
TGCAGCGATACACGCTTCACGCTTTGCTCGCAACATGATGCGGATCCTAA
GGAGAAATTCCGCCCGAAAGGCCCGGTTGCAGGAAAGAGTGCCAGCAAGG
CTGTTACAAAAGCCAGCAGAACCTAACTTTTCTGCAGAAGAGCAGTAGTC
TTACGGAGTCGCCACTTGCAAGAACGGATAACCCGAAGAAGTTATTTTTT
TCTGCATGATTTATGCGGTTGCACTCGCTGATGTTGCTTAAAGTTTTCAC
CGGTAGTTGGAAGGCGAGGTGGGAAATTCCAATAGCATGGCGATTGAATG
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ACGTGTTCCGGTGTGATTACTACTCTGGTCTTAATACTTCCTCCGTCCAA
AGATAACTGACTTAGTTTTGTCTAAATTTGAATGTATCTAAACACATTTT
AGTATAGGTACATTTGTATCTAGACAGATTCAAGTCAGTTATTTCTGGAC
GGAGGGAGTATATAGAATGTGTGTATAGTGAGTATTTCATTTTGTGTTCC
CATACGAGAATGTAATCTACGGGGTAGATGATAAGTTTACTCTGTGAGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.