Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA001272

[Submit comment/correction]

Sequence	AA001272
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA001272
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	AAGTCTCTCGCAACAATAAAAATAAAATCCCCTTCGCCAGCGCCGGCAGG CCGAAACCTCCATCAGCACGGTGGCCACAGCTCTTCCTCGCCGCCGTCCG GCGTCCTCCTCCTCCGCCGCCCACCCCTCCCCCTATCCGTGGGCTGGCGT GGAGTGAAGATCTATCCGGACGAGGTTCCTTTCGCTGGTGAGGAAGCCCT AGCTCGCTCCTTGAATTTGTTGCTGCTTGAATTATTGTGTGTTGGCTATG CTCTGGTGTTCTATTATCCGTGGAACAGTCTAATCCTGCCGGATCTTTCT CTCCAAGATCTGTCTCGGCCTAGCCCCCGTGCAATTTGCAGGTGCGGCTG CATCAGCCCCTGTCAATACTTTGGTGGTCGGTTTTCATCAGCCTAAAAAA CAAATTTTGGGGGCGGGAGGTCAGCTGAACCCTCATGCCCATGCGTCGAG TTATCAGATTGGTTGTCAGACATAATCTTTCTTTCGAAAGTCCATTAGCT CGTGTGCATGGAGATGGGTATTTTAGGGTTTTGCTGCGAAGTTCTTAGCC TGTGGAATGCTATTCTTTGCTTGCTGCTATGTTCGTTTTCATGTTGTCAT GTCGTGAAATGGATACACGGGAGATGTTAGATTCATTTCTCCTGAAATGT TGAATGCCATGTACTGCCTCGCTTTGGGGGTTATTTCCGTAAATTTCATT CCTGAGATGCGTGTTACGATTGCTGAGTGGATATAATACGGTAGAGTATC TTTGTCATGGAGTTCTTTTGATATTATTGGATGATTGGTGTTGTAAGCCG CCTGTTTTCTTATGTTCAACTGAACCTGAGCCGTGCACACTGCTAGGCGT TGGGACGCTTAATGGAGCACATAGAGTGGGCAGTGGCAAAGCTTTAATCG CCCGTGTATGTATCTCCACCCTGAGAAGAGGAACGCACAAATATGATTTC TTGGTCCGCAAGTTGTTGTATGGGTAGTATTAATTGTTTCCTAAGGCAGT GGTAAAATCGAAACGCCATGCAGTTTTACTAATTAGAAAGATTACGGTAT CTTTTTTGGATTTGGCCATTGTCTCTATTCGAGCGGTAACGGTTGTATTT CCTTCTGAATTTAGTTGGATGTAGCTCGTGGGGCGATTACACCTGATATG TTGTCATACGCAGATGTGTATTTGGATAGTTGCATGATGTGCAGTTGCTA ACATTAAATGATTGTTTTTGCATACTGCTTCGTGGTGTACAATTAATACA AAAGGAAACGGGCAGCTTTTTCTTTGGAATGCTTGCAAACTATGTTGTTT TGTGATACCATTTCTGTTAGATCCAATTTGCCTGACCTGTTTCACTTGCC ACGCGGATAACGCACACAGACACACTATTGTATCATTAATTAATGCAGAC CAGTGTTTACATGTTAGATGATTTGTGTTGTAATCCTCTTCTCGTCTTAT GCTGAACACATGCAAAATGATTTCTTGGCCCACAAGTAGCTATATAGCCC TGTTAGTATTATTATCTAAAAACTTCAATTGTATAGCTTAATACAAGGAA GACCGGGTCAAGATTATCTTGTATTTCTTGATGTGTATTTCTACTTGTAT AAAAAAAGACATATTGCTTAGCAGATAATTCTTGAGAAGGTTGATGTGCA AGAAATTACTCTTATTGAACTATCATATGATAGACTCTCGTTCATTACCT CATACAGGTTCATTCTCTACCGCTGTGAGGTCAAAATGAAGGGAGATCTG TAAATTGTGTACCATATTAGGGTTAGTTCTTTTTCTCCATCTGTTCTGGC AGGAACAAATCCAGCCCATGGCATCGCCACAAGAATCCAAACCCTTGTGC TTGAAGCGCAAGCTCGTTGACGACTGCCTGTCAAAAGAGTGCAAGTCTCG TCGAGTCAAAGTTGATGATGGACCCCATGATCCATCTGCTAAACTGTGCA AGTGTTGTTGCACGCGACCTAATCTTGCCAGTGATTGCGTCAATTACCTG AAAAGTGGAGTTCCGAGCCGTATCGTGTTCTACAAACAAGGTTCTTGGCA CAATTTTTGCGAGGCAATAATGAAGTTCCTGATTGGAGGGTTTAAAGGCG GCAAATCTAGTGTTGTGACTGTGATGGATGATGAAGCTGTCCTTGTTGAT TTCTTGTCAATGACTCTGGTCAACCTAACAACCAGAAAGCAGCGATCTGT AGCATGGTATGATGATACCGGAAAGGGCTTTTTTCCTACTCTGTTCTTTG ACGAGGAAGCTGATGAAACGACCAATGTTGACTCTGGTAAAGTTGACAAC AGTGCAGCGGGAATAATGTCGGATAATAAGGTTGTAAATTCTCCACCGGA GGTGGTGAAGCAAGTTGTTCTTGAATCTAGCCCTCCGGGTCCACAGAAGC CTTCCACTTCAGATGTGTTACGCAAAAAGATCACATCTGTGGAAAGAGGG AGCGAAGACTTTTTAGTTGTCCAGGATCTTTTTCTCTCTGGTATGGGTCC ATTTGCAACACCACATAATATACTTCATATCCATCGGTACTCTCCGAATG ATATCACTGCACAGTGTCGACTTCAAGCTTTTGAAAGGCAAATGAGCTGC ACGAAAGAAGATCGTGGTGATTCAAATGTAAGATATGGATGGCTGGGATC TACTAAGAGTGACATAGTTAGGATTCTGATTAATGGGTTTGGTAGCACTG GAAAACCTGCCGAGAAGGCATGCTTGAGTGCTGGTGTTTATCTTTCACCA GAAGATCGAGCCTTTACCAGGTATTCTATCTTAACTCAAATATTCAGACT TCCATTTATTTATTAATATTTGACCATATGTGATTGTTTGGCAGTGTCGG TCTTTGTGATGTTGACGAAAAATCGGTGCAGTATATGTTGTTGTGCCGAG TGATATTGGGCAAGATGGAAGCTATCACGCCTGGATCACAAGATACTTTT CCAAGCAGCGAGATATATGATTCTGGTGTTGATGATTGCTCCAACCCGAA GTGCTACGTTATGTGGCCATCCCATGTTAATACTCACATTCGTTTAGAAT ATCTCGTTAGTTTCAGACTTCCCCCAAAAGTTCGACGTAAGATGGTTAAT AAGTGTTAAGACCTTTATTATGTCATATCAGGATAAGTGGAGTGAGTCTT CGTCTTTCTGATGCACTTATTTTCAGATTATTTACTTGGCTTGAAGGGTT TATGGTTTCACCCATCACCAAAGGAAGTCGTCATGGATATTTCTACTCTT CAACCTGTGAGGCACCTTAATTTTTGTCACTTGTTTTCTCGGCATGCTTG ATCTTGTAGAAGTCCAGCTATGCTGCTCTACATTTTAGAACTTCTGCTTC TTGAAACATTTTTAGCTTTGGTTCGAACTACTCAGCTTATGCAACTAGAC CTATCTGCGTGCAGATAATGGGTGAAGCTGGTGAAGCACCAACGTCCCCG TGGATATCCTTCAGAGTTCTGTTTGCAATGATTCAAGATAACATATCATC TGTAGCTAGGGAATTGCTCTTCCATCATTATGAAGAACTAAAGGTACTAT TGGGTCAACAAGTTATCTTGTGTCTATTAGGTTTGATTTGTGGCTGGTAT GATAGGCCATGGAACATTTCATTTTCTTCTACTTGGCAGGAAAACGAAAT AACTCGTGAAGAGATGGTGAAGAAGATGATAATAATTGTTGGAGAAAAGT TACTTTTGGAAACTTTAAAGAAACTTCATTATTGTGTAAGTCACCTGTAG TATCTTTCTTCCTTAAAACGCCTCTAGTAATATGCATGTTTGTCAATGCC TCTCCACATGAAATCCTGTTAATGCTCATACTAGGGCCTTTAAATGGACA CACACACATAGAATAGCATCTGAAGTATAGGCCGACATATGAAGTTTGTG CATTTGTTATGTGTTGCATTGGATGTTACTACTTGATGCACACTGTTTGC ATTATATTTTCATACATGTATACTACATAAGACCTACAGTTTGCGATGGT GCAACATGAATGCAAGAATATGGCTTCATGACATATACTCCCTCTGTCCG GAAATAATTGACTTGGATTTCTCTAGATTCGCATGTATCTAGACACGTTT TCCGACATAGGGAGTATATGTCACTTATTTCCGGACAGAGGGAGTATTAG TTTTCCGAACACCACTGCCGGGTATCTATTCAGAAAGGGAAGTATTAGAT ATGCAACTCCAGTTTGTAGGAATTTTGATTTGCAACCTGAAGTACTGATA GTGTACAGTTTGGAACATTTTAACTTTACTAGCATGGTCATCAATTTTTA TATGATGGCTTGTAAGCACACAACTACTCGAATGAGGCTTCATGATTCGT TATAAAAAAATGATGCATTCATAGCACACGTGCATATAGAAATCTTTCAG ATATCCTTTCTTCGCCCTTCTCAGGCACTGGATTACGTTTGCTACACGAG TTATATGTGCAGTTTTTTTTTCCTGAATGACAATATGTACAGATATTACA AGTTGCTATTTTGTTAATTACCTTCTTTTCTGGTATGGTTTGTGTTTAGC ATCACTTTATTCTTGGATCTGTTGCAGCCATCATTATGGTATAAATCTTC AGTTGAAGTGATGCCCAGTGATCCTGCTAGGATAGCAGCAGAGGATCCTG CAAGGACAACAGAAGAGCACTTACCATTGGACAAAACAAGCGGGAACTGT GCACTAACTCTTGGTAGCCTTGGTGATTCCTGTGCATTAAATACATTGCC TGAAAGTTCTGCAGCTCTTAGCACGAAAGGATGTGATACTCTTGCAGTAG GTTTGGTGCTCAAAAGCCATGATTCTCTGGCACCAAGTGGTGTGCCTGAA ACATCTACTTCTTCTGGTACCAGATGCCGGGCTTCCCCAAGTGTGGAACC CAAAGCTAGTGATTCTCCTATACAAATCATGTCACCTGAGAACTCTGCAA ACCATGGTGCCAAAAATCGGGATCCTTTTGCAGCCAGAATTGCACCTATA GTTCATGATGGCCTTTTGAGGACGTCTTCTGGAAAATCTGCATCTCTTGG TGCAGAAGGTTACAATTGTGTCGCACCAAGCATGCCACCCTGTGGTTATC CTTCTCTAGCACCAGCTAATATCCCGAAAATGCGTGGGGCTGTTAGCTCG AAAAAAATGCGTGGGGCTGTTGCTCCAGGTCGCAGTCCTAAGGGCTCTGA ATCTCCTGGACCAAGTTTGGCACTGGGAAATTCCAAATGTATAGGCGTGA AAAGTCCCAGCTATGTGCCAAGAATGAAATCTGAAGGTCAGGAATTTCTT TCATTGAGTATTGCACCACAAAGCCCAGTACTTTACTCGAGCAAGGGCCC TGGTGATTTGATTTCATGTGCCACCCCTCCAGCCCATGTGCCAGGTAAAC CTCTATGCTGCGGTTCATGTGTAAACTGATTATTTCTTACGAAACGAGAG TCATCAAGGCTGTTCATTATCACGCAGGACCTGTAAACTCTTCGGCTTTG AGCACTGAAGCCTGTGATTCTCTAGCACTGAGTATTGCACCAAAATGCCA TGATCCCCCAGCACCAAGTAATAACGAGCAGAAATGCCTCGGGGCTCCAG CAGCAGATGCAGTGCCGGAAAGCCATCTCTCCCAGGCTCCGCCAAGCACA GCCACCAAAGGGTATACTGCTCACACGCCGAGTATGAGTATGGTTGTCGT AAACTCTGTTACCATGGAACACCATAGCTAACATCATTCCTGTTTTGTAG CACCAGCGCTTCTTTAGCAACTGCAGCGACGGTGGAGCCTGAAGCCCAGG CTGTACAATTTGGACAGCACAATAAGCCCTCTGGGCCAGCCACCACCGAG CTGGGCAGCAACGTCGCTCAGGTGGCTGATATCCTCGTCGCCCTGTCAAC TCCGCGAGAGAAGGGCAAGTAGAATAAGAAGAGCTGTTTGCGCCGATGAT GACCCCTATGGCTCCCGTTTTGGATCTCTTTTGCATGTACATGTAATGTG CCATGTGCTGGAGCCTAGGACGACGGGTTTGGCGTCGTTGTACAGGCGGG TGCTCGTGTGTAGGTTCAGGTGTAAAACCAGTGGGATCTGCTACCTAGTA TGGCTTAATATGTAGGAGGATACATACCAGTCACCCTGTCGACTCTGAAC ATGTAGGATTTTTTATGTGTGGAAGTTAACAACTTATCATCTCCTGTGTG TTTCAGCCCCTGTGGACATGTTGGTTGGTTTTAGTCTCTGTATGGTATTC CCTATGTTCCAAAATATAAGATGTTTTA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.