Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA038987

[Submit comment/correction]

Sequence
AA038987
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA038987
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGAGAAGTTTTATGGACGGGTCGTCGTCAGGGAGGAAGGGGGTTGTGGA
TCCACCGGAGATGATGGAGGCGCTGGCTCAGCGGGTGAGGGCGCTGCGGG
CCGCACTGGAGAGCAGCGAGGGGGAAGCGGAGAGCACGGTCGCCGTCCTC
GGCTCCTACGAGCGCCGCCTATCCGAGATCGAGGCCGCCATGCGCCCCAT
CCAGGTCGTCTCGCGCCCATTTTCGCTTGGTCTCGACGTCTGTTTGAATT
CGAGGGAGAGCCGCGGGAGCGTGCGGTTTCTGATTTTGGGGTGGTGGTGG
TGGTGCAGGTGAGTAGGCAGGCGGCCCAGATGGCGCACGACAACATCGAC
AGGGCGATCAAGGCCGCCAACGACATCCTCGCCCAGGTCGTCATCGCCCG
CGAGGTGCGTGCATCTGCTCTGCTCGCCCCCTTCGTTTTTGCATTGGATG
CTCTCGGCATGCTCATGCAGTGAGATTACCGAAAAATATGCAAGGTTCGA
TTAGGTGGTGAAATCTATGATCACAGCAGAGGTTGTAATCGATTCTCCCA
TTATCTAGAAAGGATGGTGATGTTTTTTGGTTGGATCCGCAAGGGGCTGG
TGGCATCGCACGCGTTGGGAGAGAGTGAGGCGTGAGGGTGCCAAATTTGG
ACTGCTTTGACATTTGGAGAATGTGCTTGACTAGTTTTTAGCCTTGGTTA
ACAAGGATGACTACATGCAAATTTTAATTATGGAGGGGACTAAAGGCGCA
TAGATGGGTGGTGAGATTGCTTCCATGCTGCTGTAGTCGTGAAGTGCATT
TGTTTTTTAAGTACTGACAAGGGTTGCATAATGATTAGCTTATTTTAGTT
TTGTTTACTAGTGCTTTATCAATATTTCAGAGGATGCAATGATAACTTGT
ATAGCAGTAGTGTAGGTCTCACACTGTGATGATACAACATTTCCTGTTCC
GATGTCACTCTCTGTAGATGGGTTTGCACCGTTAAAATTTGGGTATATAG
TTGCAGGTTTGCACCTACAATTGGGATAGGGAAGTTTGAACCAAAAGTTT
GCTTGGAAAATTTATTTGCATGTTATCCTTTTGATTAGGCTGAAGCTACG
ATATTGAAGGGTCCCCATCAGGATCTGGAGAGCTACCTAAAAGCTGTGGG
TCATCTGAAAGAAGTTGCTGATTTCTTTTCCTTGAAGGAGAACTTCAAGA
GTTGTGAACGGTTTCTGAATGATATCAACATTCTTTTATCCAAGTCTTCA
CTGATGATTGAGGGGGAATTCAAGAAATTGATGATTACACACAGGTTGAA
TTTGCATATTGCACCCTTTCTGAACCATCATCTTGTTGGTTTCTTATATA
TTGCTAGAGGATCAGTTCCTGCATTTGCTGGACCTCTCCTAAATCCCAAC
GAAAATATATATTAATGCTTCTAATATCATTTCCCCGTCTTTCTGTTGTA
TCTTTCCTTTCAGCAAACCTGTTGATCCTGATCTCCTATCGTGTTGGCCT
TCAAAGCATCAGTGGGCATCAGATGGCGACGCTGAAGCAAGTGGAGGAAA
TTCTGGCGACTCTAAGCATCCATCCAAAAGCTTGGCAACTGCTATTTACA
TGACTCCAATACTGATCATCCCTAGAATATTATCCCGTTTGCATGCTTTA
GCTCAGCAATTGATCCAGGATGGAAACCAGCAGTCATGCTACCGAATTTA
CAGGTAGGCTTTGAGCTGGGGTTTTAAAATGAGATGGTTCTTATCATTGC
CAGAGGAGTATCTGACAATGTGATTATGTGAACGCTGCTTGCAGAGAAAA
AGAGGGTCAATGAATATAGACAGTACCCGAGTTTTGGGAAATACTAATAG
CAACAAAATATGCAGCAATGAGTCATACTTAGTGAGGTTTTGGCCAACTT
CCTGTTAAGATAGAAATTTGTTGACCTGAGAAAATTCCCTATGTACAATA
ATAATTTACTTTATTCATCCTTGAGCTGGAACTATCTATTTAGAACCCAC
TGCTAGTCTTACATTGAAGTGTGGAATGCCTTGCTGAATGATCCTTCCTT
TTTTCCTTCCCAATTTCAGTTGACATCTGTTCTGAATTCTGAATTTATAA
CACTAGTATGCAAAATCAACCTGAGATCTGTTTTCTTTCTTCAGAGATGC
TCGTAGTTCGGCATTAGGAATGAGTCTGCAGAAACTGGGAGTAGAAAAGC
TTAGTAATGATGATGTAGAAAGGATGCAGTTGGATGCTTTAGAGGCTAAA
ATTGGAAAGTGGACCCAGTTTATGCGAATTGCGGTGAGGGTCCTTCTTTA
AATACGCAAGTAGTCTGTCTCTTCACATATCCAGTTAACTGTCTATTTTT
CAATAGATGAGACTCTTGCTTCCTGGAGAACGAAAACTTTGCGATGAGGT
TTTTGACGGTATCAGTTTCAACAAGGACCAGTGTTTCGCTGAACTGGCAG
GAACTGGTGTTCTAACTCTTCTCAGCTTTGGAGATGCTTTTGCTGAAAGT
AAAAGGTCTCCTGAAAAGTTATTTGTACTGATGGACATGTATGAAGTAAT
GCATGAACTTAGACCCGAGGTATGCTAAAAGCACTGCCTTCTGCACTATG
ATGCTAAAATTACATATGCAGTACATTATCAAATTTTAATCAGTAATGTA
GTAGTAGTATTGCCCATGTATACGCAACTATTAGAGCACCAGCTATGGGG
GCAGTGGTATGGTGTGGTTTCCAGCTATCCACGTAGACAGGCCACATGTG
TGAAATATATATCCCAATGGAAGCTACTCTATGTGAGGTCATCCTCATAC
TTTTTTCTCTGACTCCCTGGGGCGATTGATTCCCACATCGCGATGCCCAG
CGGTTGCCTCGTCGCTTTTGTCAGTGGAGAAGCGATATCATCTGCAAGAG
ACCGCTTTTCTCTGCCGTCGGTAAGTTTGGTTGAGTTGGCAACTAGAGTC
CTATGTGGGTGCCTGAGGCAGTGGTCCACCGTGGCGCGTTGGCCATGCCC
TTATAGTGCTGACAATTGGAAAATGATGTTTTACTTGGTTTTTCTAGTTG
CAGCACTGTTAGTGTTTGCAGTTATAATTGATGTGAAGTAAAAATTCTCC
TGGAAAGAAATAATGCATGAACATAGATCCGAGGTGCGGTAAAAACAGTG
TTCTGCACTAGAACACCAAAATTATATATTTTTTCGATAAAGACCAAAAA
TTATATATGTAGTACGTTATCAAAATTTGATCAGTTATATGTTAGTTTTG
GCCATATATGCGCAACAATTCTAGCTGCTGGGAAATTGGAAAATGATGTT
TTACTTGGTTCTTCTAGTTACAGTACTGTTAGTGTTTTTATGGGACTGTG
CTGTTACTTTAACTTTGTTTTATTAATGCTGTCAACTTTAATTATGTTGA
TATTGTCGACTATGGACACAGTAATACTAATACCTACCTTCTATTGAACC
TTATTTCCAGATTGAAGTAATTTTCAAAGACAGCTTTTGCTCTGAGATAC
GTGAGGCTGCATTGGGCTTAATGAAGCTCTTGAAACAGACGGCCCAAGAA
ACATTTCTTGGTTTTGAGGAAGTAGTTGAGAAGGATACTTCAAAGACTAA
CGTCCACGATGGAACTGTCCATCCTTTGACTATCTATGTTATCAATCATG
TTAAATTCCTATTTGAGTAAGCTTCATCCATTTCACCCAGCTATTACATT
CGTGGGCATGCAGAGATTTATTTGATTTCCATGTTAACAAATACAGGGTC
AATCAGAATGGGTTCTTACTTTTTAAACTTTGAGATGTGTGGTCATATTT
TACAGATAGATATTTTCAACTCTCTCTCCCTCTGCTGCTTGCAGTGAAGA
GTTCTCGAATTCACATTTTGTTCCATCAAGAAAACACTAATTAACTGTAA
TTGTGTTTAATACCAATCAATGGTAACTTGTCGGTCCTTTAAATACCTAT
ACTCAAGTTCTTAGTTCCTCATTCTTTTCCACTTAGCTCCAGAGCTCTTT
ATGGTTATACTTCAATGTTTACTATTTCTTAGTTACGTGTCTACACACCA
CATTTAGTGATTTTAATTTAGAAAAATATGCTGTTCCACCTGTAAATTTT
ATTTTATTTTTTCTTTATCGAAGTGAGTTATAGTTTGTCAGTTAAATTTA
CGCATTGTTTTGGAAATAGCATTCTAACAGATATTTGTGTCTAAAATGGA
CAGTTACCAGTCAACAGTGAAGCTACTGTTTCAAGATTTTGGAACTGGAA
GTGATACCGAATTCGAACTAGGAGTTGTTTTGACAAAGATAATGCAAGCC
CTTCAAAACAACTTAGATGGGAAATCTAAGCAGTACAAGGATCCTGCACT
GATGTGCATATTTCTTGCAAACAACATTCACTATATGGTTATGTCAGTTC
GCAGGTATGTTACATTTTGTGTTTCATGTCTACGTCATGTTGTCCAGACA
GTGTGCATGGCCAACAATATTTTTATCTCACCACAGATCAGAAGCCAAGG
ATGTACTTGGCGGTGACTGGATTCAGAGACATCGTAGGATTGTACAGCAA
AATGCCAATCAATACAAAAGAGTGGCATGGGGAAAGGTTAGTATTTCAGT
GAAATATTCCTTAATTGCATGTACAGTTTTGCTTTTCTAGTTTACTGCTG
AGTTATTTTTTCCCTGGCTAGGATGTTATATTTTTTTGTTGAGCACGGTG
TTTAGTTGGATGTACTGTTTTGATTTTTCTAGTTTACTGCTCGATGTTCG
CATTAATGAGTTCTTTTGCCTTGATTAGGATGTTGTATTTTCTCGTTGAG
CACAGTGTTTGCTCTGCAAATTTGAATTTGTTAAAACTTGTGATGAACTG
TAAAGGATACAGTAAATTGCCGCAGCTGTTGATTTGCAAAGGTTCACTAC
CCTCTTATCCTGTAGATTAGATAATTCACAACTTATTTCATGATTTAATC
TTGTATACGCATCAATAGAAATATTGAATAGAGATAATACCTTCGATTAC
TCTGATTTCGTCATTTAGGTTGTTCAGACGCTCTCTGTTCAAGGTGCCAG
CAGCACTGGTACGTCAGCACCGTCTGATCTTAGCAGCAGTGGAGTTTCAA
GAGCTATGATCAAAGAACGGTCAGTACAATGGCAGCTTGTCGTGTTCATT
GTTTTAAAAAATAAATTAATACTGGATGTCACCAAACTGTATGTTCTTTC
CTTGCTAGGTTTAAGTCCTTCAATATGCAATTTGAAGAGCTTCATGCAAA
GCAATCTCTATGGACCATACCTGATCAGGAACTGCGAGAAACTCTGAGGC
TTGCTATAGCTGAAGTACTCTTACCAGCCTACCGGTCCTTCGTTCAACGT
TTTGGGTATGTTAGCCAGCCTTTTCCTTATCTTCATAGGCACTTCAGTTT
AAATGTTTACAAATGCCCGCAAAAAAATGTTTACAAATGATAAGGATGCC
TATCATAGCTGTATTTGGGAAGAGAGGTGCAAGGATGTATTGTTTACAGA
TGATAAGGATGCCTATTGCCCTATTTAAGTTGTCGAATACTCACTCCGTT
TAGAAATATAAGACGTTTTAGCTTTATGAATCAAATGAATCTAAACGTCT
TTTAGTGTATAGGTTCCTATGCTCTAAAAGGCGTCTAGATACAAAGCTAA
AATGTCTTATATTTCTGAACGGAGGGAGTACTACTTAAAGGAGAAGATGG
GATACTGGTTAATTATCGTTTGCTCCCAGTCATTTCCCCCCTTCTATTTT
GTATCGTTTCCCTTGCAATCCTTCATGATGATTTCTGTTTTATATGACCA
TACTATTGGTTTTTAACTTTCAGGAATCTTGTTGAAAATGAAAAGAAGCC
TCGCAAATACCTGAAATACTCACCAGAAGGGGTCGACCAGTTGCTGGGTG
AACTCTTTGAAGGACAGCAATCTGGTGAACAGAAGCAGTAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.