Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA035825

[Submit comment/correction]

Sequence	AA035825
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA035825
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGGCCGCTGGGCGGGCCTTCCTCTGTGCCCCAGCGTGTATAGGAGCCAC CGCCCGTAGATTAGCCTTCGCCTCGCCCCCTATCCGCCCCCTCGCCTCCG CGCCCCACCGCCGCGCCCGCGCCCGCTGCTGCGCCACAGTCTCCTCCTCC TCAGATGCCTCCACATCCGCGCCGCCACCCTCCTACGTGATCACCACGCC GCTCTACTACGTCAACGCGCCGCCGCACATGGGCAGCGCGTACACGACCA TCGCCGCCGACGCCGTCGCCCGCTTCCAGGCAAGCCTTCGCACAACTCCC ACAAACCCGTGCTACGAATTCCGAGTTCATTAGTCAAGATCTACCTGCTG GGACATGACATTTTGATGTGTGACCATATTAAACAGCGGTAATGGCTGGT GCTCTTCATTGTTCTGTAGTCAATTGGTGCGCCGTGCCAGTGCAGGAACG TAACACACTGCATTTCGTATATCTTACTGTCTTAGCAATGCTAAATTTCA AGCTCAGTGATATGTTTGCTAGACTATTTGAGCTACTGGGAGCAAATGCG TGCCTTTTGGTAGTTGGTTAACTGAACACCTTATCTAATAATCTGTTTCG TGGTGCTTATCTGGTTTGCAGAGATTGCTTGAGAAGAGGGTTGTATTCAT TACTGGGACAGATGAACATGGTGAAAAAATTGCCACTTCAGCAGAGGCTA GTGGTAGAAACCCCAAGGAGCATTGCGATATAATTTCAAATTCATACAAG ACACTTTGGGCTGATGTATGTCACAACACAAAGCCTTTTCATTTTAACAA TATGTAGTAAATAAATCTGGAGCTCATGTTTCTCTTCCCACTTTTTTTTT GCAGCTGGACATAGAGTATGACAAGTTCATCCGCACAACTGATCCTAAGC ACGAGGCTGTTGTTAATGACTTCTATTCTAGAGTACTAAGCAGTGGTGAC ATATATAGAGCTGATTACGAAGGGCTTTACTGTGTGAGCTGTGAGGAGTA CAAGGTAAGCTTCTGCTTTGTACCTTCTCATATACCAGTAATAGTACAAT TCTGTAGCTAAATGTATTTATACATAGTTAATCGTGACAATCGTTACCAT GCACATTGTTTTAGGTTATCTCTATATTTATGTACTGGTACTTCTAAAAA ATAAAAAATGTCAGTTTTGTTGATTTGATACAGGATGAAAAAGAGTTGGC GGAAAATAATTGCTGTCCTGTGCATCTGAAGCCTTGTCTACCTAGAAAGG AAGATAACTATTTCTTTGCCTTATCTAAATATCAGCATAAGTTAGAAGAG CTACTGACAAGAAATCCCAGTTTTGTAAGGCCATCACATCGCTTGCACGA GGTGAGGCTTTATCCTCTATATGTTTCGTTCAATCTGCGTGTTTACTGAG TTGTTCCTACGAATTGCAGCGGAAAAGTTTAGAACTGTTTTCTTCTTTCT TATTAAATGGATACTCTAAGTATATTGACTTAACCACTGGCAGATTAAAA GAAATGCACCATATCAACATATGTATTATTGAAGATCTGGCATGATTTTA TCACTATATTTTGTGGTCAAATATTTAAAAAACTGTGAGTTTTGTTGGGT CATCACATCTCATCTTGCCAGGAAATGCTGTTGGCATGTTGAAGAAACAC CCTACAACATTTTCTTTCCAATAACCTGTCAAATGGTCACTTATATGCTT CCTAATTCCTAACTAGGTTAAATATTAGAACCTAGATGTCAGCGTTTACC ACTTTTGAAAAAAGAAAGCTCTCAAATGTTGCTATATATATCGTAACAGT AAAAATAGTCAATAGGCAGTGAAGAGTGTCTTTAGACCACAATCATTCTC ATGTATCTTTAAATTTTACAGCAATATCATATATCAGGATTTAGTGACTT ATGGTGCGAGTTTGGGGTTGGGGAGCCATGTGGCTGTTCAATCCAATCCT GGACTTCGTCACTAATGTAGTTTCTGGAAATTTCCCAGCCCATCTTTGAA ACAGAGTCACCATGTTTTGTCTAAAAAAAGTTACTTAGCACTTGAAACCC GGCCAGTACGTATTTGTTTTCTTTCGCTGGCAAGATGGGATTACTCTGAC CTCGCAATGTACATACGTGCATCACCACATGCCTAAAAAAGTGACTAACC ATAATGCAAATTATAAAGTAGCCTGTATTCAGCTCACAGTTGGACTCTAC TGGATTAAACTTGCAAGAGAAAACACACTTTCGTTCTTTGTACAGTGATA GTATAATATAAAATTTTCTTATGTAAATGTCCAAGATTCATAATCGCGTT CCAATGCTTCATATGTTAGCCACCATTACAAATATTACCTTGCATGCTTC ATTAATTGCCAGTCTTTCAGCTCACAAGTATTTACTATCATGGTTTAGAA TGCTCTTATTCTTTGCTATTTTTCTAATTAAGACAGCTGTAGGTTGAAGG CTGGATTAAAAGTGGACTGAGAGACTTTTCTATTTCTCGTGCATCTGTTG AATGGGGCATTCCAGTGCCCAATGACACCAAACAAACAATATACGTGTGG TTTGATGCCTTATTGGGGTATGTTGCTCTGTTTCATACCTGCTGCTTGGC ATTTTAGTCAGCATGGGCAGGTTGCATGTTCTCAAGTTCTACTGGATAGA TAGTTGCATATGGCTGTATATATTGTGCTATATGATATCGATGTCCTCCA ATTCTACCGTGCAAGTATAGTAGATACTTAACTTCATTAATTTATCGTCA TGTTTGCCAATTGCAAATTATTGGATGGACTGTTCCTTCGTTTACTCAAA ACTGTGAACTTCCCATGCACAAACAAAGGCTGCTAAGAGGCTATTTACAA CCTTAATTTGGAGTGCCTTGAACAGTATGATAATTCATTTCTCCGAGAAC TCTTATTGCATGTATTGTTTAGCATAATATCTTCATAACATTGTCGTAGT CTGGTTGCTTCGAGTTCATCTGAAATGCCTCACTGAAGGCTCTTCTTCAT GATCTCGTCTCACTATAATGAGTCCATGACAATCACTTCAGTTCCTCTTT CTGCTAGCACACTTGTGCACCTATCATGTATGTTGTGTTCTATTTTATTT TATCTAGAGGTAATATATGTTTCTACTAATCCTTGTTTGTGCACACACTT TATCTTCCACATTCTGTTGAAGTCTACAATAATCACTTGTTCATAATTAT ATTGGGCAATGGATACTCTACCAATTATGCATAAAGTTAAGGTCATGCAT GTAATACATGACCTGTCAACTTGCAGACTGGAAATGAGGCCATAGTACAT AATCTGATGTAGTATTGCCTATCACCTTGTTTCGTACTGGTTGTTCATTT TCTATATGTTTGTGTCTGTAGTTATCTTTCAGCGTCCGTAGATGATGGGG AGCAGGCAAGTTTACAGCAAGCTGTTGATCGTGGTTGGCCTGCCTCTCTA CACCTGATAGGAAAGGTCGGTTTTGGGTAATTAAATTTTGCATCTGTTGC AAACATTCATGTTCCTTTTTTAACTTAGAGGAAAATGTCATATGCTTCTC TTAGTCATTTTTAATATGTTCTTTGTCCATGTTGATTAATTTCTTCTCGT GATTGTAAGGAGCTCTCATTTTGATGTTAACTTGGATAGTAACGCTTGCC TGTTTAGCTTAGTTGCTAAGAGAAAGTACTAAAAATATGACATCAGTCAA ATGAATAAACAACCATAAACTCCTTTATCTTGATGTACCAGCTAACATTA CATAACTACTTAGTTTTCATATGACAAAACTCAGGGAGTCTCACTCCCAA TTCTCAAGATTAGACCCCATTCGTTTGAACTTTTTTTGGTTGGCCCCTTT TGCTCAGGCTCATCTGCAGCTACTTGCCTGATAAATTTATCATGTGTGAT GCTGAGTTGGTGACTTAGCACTGATAGGTCAAAGTTGAAGGCTTGAAGCA ATTTGACAGAACCATGCCTTAATTTTCAAGACTGAGAGACGTGCAACTCA GCTAAGAATTAGAAAAGAACAACACATCTCTTGTCATATGTTAAAGCTGA TGACTTTTATCATGTTTCCTATTATCTGGAGATGCCAACATCATAAAGTG TACTTTTACCTCGATTCTTTGTTAGTATTAATCTACTGCTTTGAGTACAA TTATACTTTCTGTTCCACTGCAAACTGGCCGATTCTCACAGATTACTTGG AGTTGGTCACTTACTGCTATAGATATTGGCATTTTTTCCGTGTACAAGCA AGAATGTTGGATGAACTTCTTTGTTCATTTGGTCTGTGATGTTTTCTTGT GCATGTACCTCAGGACATATTGCGGTTTCATGCAGTTTACTGGCCAGCAA TGCTAATGTCAGCAGGGATAAGCGTTCCTGATGCAGTTTTTGGTCATGGA TTCTTGACAAAGGTGACCTTTACATATTTCCAGTGTTCTTGTTTCCACCG CAACAAATCTTGCAAAAATATAACACCGCATAGACGCATAATACATAGTA TTTTGACAATGCTTATGTGAAAAATTAATGCTAGTCGATAGTGCCTTTTG GCCTTTTCCTGCCACTATATGTGCACTTCTCGGTCTAGACATTTACACAT CGGTTGCTGAAGGGTCAAATTTCCTTGGTCCTATTTTATGGCTCTAGCCT TCCCTTCTGCAAATTATAATTTTCTAGAGCTTGAAGAAATTTTATATCAT GTTCACAGTCCCATGGTATTTTCACTCAGTATCATTTCTGCCTTGAATTC ATCGCTTTTTACGATGTTAATCTAACTTTTAAGATTGTATTGTCTATGAT ACCTGTCAATAATGGTACCGCACATGCCACAAGTTAACACACTCATGTTA GTATACGGTATATCTGTTTAGCATCTTCCCTTAGCTGTTGGTGTATATCA CATATTGCCATATAGTTTATGGCTTTGTAGCTAAGAAATTATTGTATTTC TTGGCCACCTGCTTTCTTCGTTTTCAAGTTTGCAACCCTCTATTCTGTAT GCCCTTCAAATTTTAACAAACTATATTCTCCTTTTTTGTTAAAGAATATT TTTCTCCCCCCTTCTTCATAAGATTTGTCCATTTCCTAGGGAATCTATTC CGCAATATTTTTTATCGAGGAATTCTCTACCCTTACTTTTTTGTTGTAGG ACTGGTTAGTAGTAGCACTATTTCATTTTATAGGGCTATATATGGTCCAA TGGCACGAACTATTCATACATCTTGTGCCTCATTGGTGTGCATGGTTGTC TTGGAAAAATATTGCAAAACACAGCTCTGATGAGCAACAATATAAATTTT ATCAGGGCTATCAGCCAGTTTTTTCTCATAAATCACTTTTACTTCATGCA GCAATACTTTTTATTTTGCAATTTTAGGATGGCATGAAGATGGGGAAATC ATTAGGAAACACACTTGAGCCAAAGGATCTGGTAGACAGATTTGGAGTGG ATGCTGTTAGGTACTTCTTCTTGCGAGAAGTAGAATTCGGGAATGACGGG GACTACTCAGAAGAACGCTTCATCAATACAGTCAACGCACATCTTGCTAA CACAATTGGTATTTCTGTGCGCTAAAACTTCTATTTATTTATTTCTGTAT GTTTTGGCTTATGCTTCAGCTGGTGTTTTATCTGTGTTAACTCTTTTACT AGTGATGATCCTGTTCTCATCTGAACAGGAAACCTCCTCAATCGGACACT TGGTCTCCTAAAAAAGAACTGCAACTCTATGTTAGCTTTTGATTCAATTG CTGCCGTAGATGGCAATTCATTCAAGAATAATGTTGAGAACTTGGTAAGT GGGTCTTGTTGGTATCTTTGTAAATTACGATAGCACGAGTATGAACTGAT ATAAACAATTGATGTGTGACTGTTATTTCTGATGGGTTATAGGTTGTGTG AATTGGCTTTATAGCTTCTAGACAATAAAAAAATTCATGAGTGAAATTGT TTCGAATTATGATTTCCAAAGCTTGAAACCCTTAGACCTGTACATGTGCC GGTTGTTCTTAGTTTGGTTACTATCTCCATAAGGTTTGGAGGCTGTGCTG AAGTCTGAAGCTTATGTGTGCCATTAAGAGTTTAAGGTTTATTACATCAA GACCAGAATAGTCTTTGTTAGTGCTCCTTTAAGTTCTGTTTCTTAGCCCA CAGCAAATAAAGACAGCGACCATTATGATCGTAGCCCAACTGTTTTATTA TTTCCCTTCCTGAAGCTGTAGATAATGGATGCGACGTTTGCTCAGTTAAT ATTTGGTAATAAGGGCTTCAGACACTGTCAGAATGTGTTGTCAGTTATTG CTTCCATTAATATTTCAATCACATGTTGCATCTGAATATTTCAGATCACC ACCTGCTATTCTTCTGCTTAATAAAGAGGAAAAATTTAATTAAAAATACA TGCTTGCATGTACTGCACTGCTGTTGTATCTGTTGGTGTTACAGTGGTAT AAACTGTCTGTACAGGTGGACAAGGCGAAGAGCCATTATGAAAATCTATC GTTGACATCAGCATGTGAAACTATTCTAGAAATTGGTAACTTAGGGAACT TGTACATTGATGAGCAAGCACCATGGTCTTGTTTCAAGCAAGGGGGTGAG AGTGCTGAAAAGGCTGCAAAGGTAAACACTTGAAAGTTGAAACTATATCC ATTTCTCTTCTTCTTGGGCTTGCTGTGTTTGTTTTTGATTTTACTTGTCA AAATCTAATGCTCATAAGGTCAAACTGCATATGGCAGCCTTTGCTTCTAT TCATGTTTGTAGAACAAACTCAGTGTCAAACACAAGAGAGCTCTGCGAGC TTCAAAATTCTTTATTTTCTACTATCATCAGTGCACCTATTTCAATGTAA TAATGAATTGTTCGTTCTGATGAATTGGTGAGATGAACTTTGGGTGGTCA GTGGCCTTGTGTTATTTAATAGATGTGTGATACATAACATATTCACCATT TGTCTATAAACTGAAATCCATTGTTGGTGGTATAAATGATGAAACTGTTT ACGCACACGTAGTCTAGACATTAGAATATGATTGGCATGCTATTATTTGT TTTTATTGTGTCGTTTGGCTTGTTCATTCAATTTTCTCCACTTGACTGCA GGATCTCGTAATTATTCTAGAGACAATGAGAATAATTGCAATAGCCTTGT CTCCAATCACTCCAAGCCTTTCCTTGAGAATTTATACACAGCTTGGCTTC ACAGAGGACCAGTTTAGTACATTGAGATGGGTATGCTCTTATGACCAGGG ATATGCTGTTTAATTCTACCCCCAATTCTGCATAATATTCGGCGGTCATC CTCTAGTATGCATATATAATCTAACACCCTCATAAAACACAATGTTCAAA AAGTAGATAGCAAGTCTGCAATCTCAGAATTTTCCAGTGACACTACTTGC TTATAATCTCTGTCAACTGTCCTGTAGGACGATACCAAATGGGGAGCCCT TAGAGCAGGCCAGGCAATGATGGAGCCAAAGCCCATATTCGCAAAAATAG AGACGGAAGTTGAAGAGAAAGGCCAAGCAAGTCCAAAGGAGGGGAAGGGC GGGAAGAAGAAAACACGCAGCAAAGGACTCGTGGAGGCATGACATGAGCT ATGTTTGTGTGTGATGAACTACTGACTGAATGGCTCCTCGGCTTCTAGCA TCCTGGATGCGTGCTTTGCCAAACTGTGACATAATATTTGCTGGTGTAGA TAGCAGAAATCGTTCGGTGGCCTTGATCGAAGCCTGGTGGCAAGGAAGGC TCACGTTTTATTTTTGTAGAACTGAACTCGGCAATTTTGTTCTCAGGCTT TCTGATTCAAGTACTAGTATATGTGATGATATGCCTAAACTGGTATGCCA TCTCCTTTGGAAAATATAAAAGGCGTCCGTGTTTCCAGCAACCAAGTTCA GTGATATGTACTCCATAGGTTACTGAGTATTATACTGTGACGATGTTAT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.