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GrainGenes Sequence Report: AA045081

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Sequence
AA045081
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA045081
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGCCACCAGCGGCGGAGAGGGGAGGCGCCGGAGGTTTGGGATGCCCCG
GTGCCACCCGGGCAGTGACATGGAAGCGAAAAATCATGAATATGATATGT
CAATGGGCAGATTTTTTTCCCACCAGAATTCTGATTATGACATGATGATA
GCCATAATCTTCTTACGTATACACCTTACCTATATTAGTTGACTTAACAT
TGTCTATATACAGATGTATCTAGACTAGATAATTACTAGATACGTATGAA
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CAGCTCATTGAGTAGTTTATAATTATTATCGGCTCTATTTTGCATTCTCG
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TGCTGATTCCACAAATTTCCTTATCTGGAAGTTTATTTGGCCCATTTCTG
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TCAGGCATCGGCCCTGTCTCTTGTGCCTTTGTTGTGACCCTCGCTCATCA
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AAGTACTGACAGCATTGGTCATTTTAGTCTGTTGCTTGGATTCGTTTTAG
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TCGAGGAGACTTGGAGGCAACGCTTCTATTTACTGATCCTGATCACTCTG
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ATTCTTTTAGGAGGGTCCTCGCCATGGATATTTCCAGTTCACTGACTTCA
ACCAGTGATGATGAGACAAGGGCACTTAATGCATTGCTTGATGCTTTCAG
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CACTTCCCTGTATGGAGAAAGCAGCTGAAGAAAGCCATGTGGAGAGTTCA
AGCCAAACAAGAACACGTGAAAAGTTGCAGAAGTCTAGTGCTTCATTCGG
CACTGTGTCCAGCATGTTAGCAAAAGGATCTTCCCGGCCTTATATTATTC
CTGCTAATAGAGCATCAGGAAAAGAAAAACCTCTAAAGGTTGAGCTGCCA
GAGTACATGCGAGACGATCCGAAAACAGATGGATCTGATTCTGCACCAAG
GAGAGAGACTTTGAATAACAGAGATGTTGAGGAATTCCTCTTTTCTATGC
TTGGAGAAGGATTTAAGCTCAGCATGGAAGTGATCCGTGAGGTGCTAGGT
AAACATTACCGTGCTAGTCATTTTACCTATAATTTGTATTTTGAAGCCAC
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TATTTTATGCAGAGCATGGAAGAATTGATTTCATTTTCTGCAAAAGATCT
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AGAGCTGGTTAATTTCTCAGTGCTGTTCAGCTGAAATCTGGTCAAAGATT
GATTGTTTGTTATGTATTGATGTGCACAGTTACCTAGTGTACAGAGTTCC
TATGCTGAAATATTGGGCATGGGCTTTAGTTGTTCCCCTTTACCGTATCT
ATTGCTTTTTTTTGTTCTGATGCAGTTTTTAAGTACTCTGCATTTATAAG
ATTGAAGCTATCTGTCGACTTGATTTCTAGGGTCATATCAAGATGGTAGC
TTAAAATGGTAATTGGTACCCTGTATACAATCGCTTCTGGTCTGTCCAAC
TGTTAGGGTGTGCAAATGGTCCCTCGGTAGACTATATTTGTCTGACAAAA
TTATATTCTATTACCTCTGTACCATAATTATGATACAGAGGTAGTAGAAA
GCAAGGATGTAGTTTCGTTTGTTAAACAATTTGTAAGGTTTTGAATGATA
TTTAGCCCTATATTTCTTTTGCAGGACATGTCAGACGAATCCTCTTTTTC
CAGGGGAAGCAGTCTAGGATCACAATCCACATCTAGGTTAGTCTCCCCTC
TTTTATTATCACTTTATTCCTATGTTCCCATAAAGAATGCGACATTTTAT
TTGGTCCATTTGTCTTTGTGTGGATGATGACAGTGCCCATTCTTTGCGAG
AGGATAAACATAACCCAAGACCACAGATTACTCCAGGAGAGTTGCTAGAA
TCAATGTTCACTGCACCTGAAAGATCTGAGGAGGAACCAAAAGTAAGACG
GTATGACTTGGGTGCAAATCGGAGGAGAGTTCTAGATCAGAAACCAGTCT
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TAGTAACTATTATGCCCCATGCACTCTTAATGCATACGTTAAATCCATCT
TTGATTTTGAGCTCTCGGCCATAATGCTACTTTATATTCACATCTTTGTA
CTGAATGAATGATTTGGGGTTTTGTTCACACGTACTTTCTTTGAAAATAT
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ATTACGTCTTGAAATAGTCGATATATGGTTGGACTTTGGAATGTCATGTG
CATGCATATGAAAAATATGCTTATTCTAGATGATTTATGGATTTAAATGA
ATTATTGCAACGGCATTTCAAGGGAATCAGTTACTATTAGGTGATAAAGC
TTTGCGGTTTGATACTGACGTTACACTGGGAGTTCTAATATGCCTAGTTT
TGTTTGGCTGAAATATGGCTGAAAAAAACCAGTGAGTGATTTTGTTTGTG
TCGTATGTTTCATGGATATTATTTTAAGAGTAATTGTTACTTAACATGAG
GCCTCTAAGTCAGCTGGTATCAGATTCTAATTTCTTGCTATGCATTCAAT
ATAAAATTCTTATCATTTGTGTATTTTGAGTATATGTAGAACCAGTTGTG
CATAATGAGGAAGACTACCAGAACTATCGTAAGGCTACAAAGCAGCATTG
GGATATGATGAAGCAGTACTATGCGAAGGTCAGGGGTGCTTCACTATGAT
TTTTTTAGGCAAATAGATGTTTGTTTTTCATCTATACTGAAGATATTGTG
CTGAAACTCCAGGCTGCTGATGCTTTTAAGGAGGGTAACCAGACGGAGAA
AGAGTATTTTCTTAAGGAAGTAAGTATTAATATACTTTTGCGGGGAAGGA
TAATGATAGGCGAGCTAGATTAAATAATCATGGAAGGGAAGAATCAAGGG
GACATTACATTTGATTCTAGGTGTTTTGAACCTGGGGTGGTCTGTATATT
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TGATGTCATGGTCAATTGGAGGGATTAATAAAATTGGATGAAACTGCTGC
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AGACAGTTGGCTAACATCCCATGTAATGAGTTCGGTGCATGCCTCTTTGA
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GGGACAAAGAAGAAGAAAGGTGTGCTTTTCAAGATAACTGGCTTGCTGTG
AATTCTGAATGTACACTATAGCGGCTGCTTATCTATATGCATGATTAGAA
ATAAATCCCTGGACTGCAGTTCTTCTGTTCTATCTATACATGCCGATGTT
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ATAGGATGCTTCTGATGATTGCTTAAATTTATCTTTGCTAATTCTGCCGT
TTTTGGTTTTTTGAATTTTCTCCAATTAGGTTTTGTGACTCATCAGTCAA
GCTAATGTCCAGATTCAGCAAAAATTTCATATAAAGTTAAGATAATCTGA
GTGTAATAACAAATGAAAACTTTAGATGTTTCAGTTTATTTATATATGTC
AAGTAATGTGCAGAGTTGTTCATTAGTCATTACTGAATACAAAATTCTCT
GAACCATGCTGCTGCTTGTGACTGTAATAACCTTTGCTTGCATCATTTCT
TTTCTCGTGAGAAACTTTAGTCTCTTATCCGTGCTGGTGTCTTTGTCAAA
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TTTTGTTTGTGGTTGTATTGGCGAGTTTGTTTGGCCAGTATTTTTGAATG
TAGTATATGCAGTTTTGTTAGGCCTGGTAGGTCATGTCAAAACTATTTGT
AAATACTACTCTTCCATGATGAGGTGGTTTAAACATATTTCATATTTACC
ATGTTGAAATATCTATAGATGTGGATTGGAATGAACTTTTTCTCCGTGGG
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AGTTCCCAGAGTTACATTTGAATATCTGATGTTGCGTTAAGTTGCTACTG
TATGTCTTCACACACTAAAATTTAACGATCACAGGTGGAGAAGTTTCTGG
AGAAGAAATATGTCCAGTGGACTGAAGATGATGCCAATCCTGGGACCATC
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AAAGGTCGCAGTGACACCAAACTGACAGAAGATATTCATAGCTGCTAGCT
ATATCATCAAGTGTCGTTTTGAATCTAGGTGCTTTGCGTTCACTTTGGGA
TATGAAAGATGGAAGTTGCCGTGCATTGCATTCTTTGTGTTAGAACATAA
CAGATATTTTCAGCCTACTTGCTACTTTGGCAGTTGACTAAACATGAAGA
GAACGTGGACGATGATCTGGCTGTAATGTTCTAGCAACAATATTAAGCAT
TGAATTGTTGATCCAATGTTTTTGGCATATGATTGTCCCAGCGCAGTAGC
ATGATCTGATCACCCGAGTGTTTACATTTCTGAAAAAGATTGGCTTTTCA
TCCTGTATGTTTTGCCAGGCCTCGGTTCGGTTTCTGTTAGTAACGAGGCA
CGTCTGAAACTTTTCAGGAGCTGTTGATCACGGAGTATGACCGGAAACTT
GGTTACCGGCACATGACCTCTTTTACTATGTACACCACACGCTATATTTA
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CCTCCATGTGCTGCCGTCTCAGCCTAGGGCTCATGTTTTGCAGGGAGGCC
GACTGGTATGGGCTAGAGTAGTACCTACTGGGCGCCAGCACCGCCATTGC
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GCCCGAACGGTGGAGGGTATAGGAAGTCGAACCGCGGAGCTGCACCGGCA
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TCGGACAGGCTTCCGCCACGGCCGTAGAGTGGCACGAGCGAGTCGAGCGT
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GATGTTGCAGTCGAAGCAGCCGCCGCGCGCCGCCGAGGGCACGTCCCCGC
CGCTTGTTCTCTTGGACGGATCGCTGCTGGGCTTGTCGCTCGCACCTGTC
GTGCCAGCCTGATTCATCTCGCTCCTCTTGCACCTTCAACGATTCCCGGG
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GAAATACTCCTACTACTCATCAGCAAAGAAGTGGCGGAGAGAAGAAGCAA
GCTCACAGAAGAAACCGCTGGGGAGACGATCTCAACCCGACTAGAGCAAG
ACAAGTAACGAGACGGGCAGAGGAAGCTACGCAATCGCACATTTGTGGCG
GTGCCGTCCGTGGTTCATGTGCAGATGCTGTCAGAAGGTGACAAGCAGGT
GGGCAGCAGTAGTATAGCACCGAACCCAAAAGGGACAGATCGCTACAGCC
GCAAGAAAAAGGAGCCACGGGATTGATTGGCCCAGACGGGTGACTTTCAG
GATATGATATCGTTCAGTCGTGATCACTCTATCAAAGTTTCGGAGGCCCT
GTGCTAAACAAGGTACTAGTACTACTACTTTGGATAATAAGAAGAATAGA
AAACGTCACGTAATGCACTAGAGCTCCATGCTTCCATGTCAGTGTACGCC
CACAGCAAAATGATCCGACACGAATAGCAAGTCGTTCGACATCCACTAGC
TCCACACTATCCTGTCCTTTGTACTGTAATTATATTCTACCCAGCTCGGA
GAGCATGGCTCCAAAAGTCAAGACCTGTGAATTGATAGCCAGAACTTGCC
TGTTGGAGAAGGCAGAGAAGAAAGCAACTTGCACCTGTAACCCTGCTCCA
CAGCGGATTAATGTGTGTGGCCTAGCTCCTAGACTTTACTTTGGATAAGG
CCGCCAGATCACCGCAACACTGACCTGGTGTGTTATCCTCGTTTCCTTTA
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GTGATAATAACATATAACCGTAAAGCAGCAGTAAAGCGTGGTGGTGCTGA
TACGGAACACAGTGATAATGAATGGACTAAACAATGTTAGAATCTTTTGT
GGAGCATATTCGACGGGACTGAACACAATAAAGCATTCGCCTAATCGTTT
TCAAGCATATCTAGTGATCCGCGAAGACAGGAACAATAGAAAAAAGAGGA
TGGGGATGGGAATATGGGAATGGGAATGGCTCTAACTTGTGTGATATGAT
TGGTAAGCAATGAAATAGTATTGGGCCAACGACTTTTATCCTTTTCCTGT
TGCATACATACAGGTCCTACTACTTCTTTTTTTTTTCCTAATTATTACTA
TGCATTTTTCATTGACCGAGTAGTGTCAGTCCACGGCACGTCGCTGTTAC
ACGGTTGTTCAACTAAATATCTTGTGGCTAGCAAGAAGGCTGTTGGCACT
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CGGAGTTTGGCACCCAAATTAAGCACGTTTGACGGGCAGGTTCGTGGACA
GATTTCGGGTAAAACTGCGACATGTAATTTGGATCGCAGGGTACAATATA
TTATGTAAGATATGGAAAGCGGTAGCCACTCTGACTGAATCCACCGACCT
TAGACCTTAGGGCAGCCAAGAACAAAGAAAACCACTACTAGTCGGTAAGG
CTGGCATGGTAACAGCAAATCAGCAACTACAGATTAAGCCGCAAGCTGAC
ACGTTCAAGAATCTGCCTTGAATGCGAATCGTAGCACCGAGTCCGAACAT
CATCAGCTACTCTTCCAGGGAAATAAGTGTAAGAAATTCAACAGCAAAGA
GACCGTTGGACATACCTGCACCGGCGGATCGCGCACGGCCGATCGACGTC
CTCCTCCCCCGTTCTCTATCGGGGCTCCTCGATCGTTGGGTTGGGGGAAG
GGAAGCGGGGCAGTAGGTAGCAAGCTAGCTAGCGTTTATATAGGCAGAGC
AGGAGAAGGGGCCGGAGGAGGCGACGAGAGCGCGCCGTCGACGTCAGCCG
CAGGCGGAAAGGAAGAAGAAAAGAGAGTTCCTGTGCGTGCCGGGAGTGAG
CGACGGGCGGGCCTCATCATATCATGGCCGAGGGGCGCGGCTGCTCTTGC
TCTGTTTTGCTCCGGCGTTTGTTTGTTCGGTGGGTGCTACTAGATTTCTT
CCGCTCGGCTCCTTGTCTCGCCTTATAGATGATGAAAACGACGGGCCTCA
TACAATAATGCTACACCTACGGGATTATTCTTACGGGAATAAAAAAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.