Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA044677

[Submit comment/correction]

Sequence	AA044677
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA044677
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CTCAGGCATGTAGCCCGCTTCCGTGCAACTTGTAGCAGCAGAGCATAGCA TCCGCACGAAATCCCCCCAAACCCCGCAGGGGTCACGCCGCCGCTCCGAC TACGGCCGCCGGACTCCGGCCTACCTTCCTCGATGGAACCCCAGAAAGAG TCGACTGCCGGCGGCCGCAAGAGGCGTCGTAGAGGAGGAGCAGGGAAACG CCAGAAGGCCTCCTCTTCCTCACAGCAGGCGCCTCCGCCCGCCCCTCCAT CGGAAGCGCCTTCCCAACCGGAGAAGCGGCGTCGCAAGGCCGGTGATGCC GTCGCCATACCCAAGGGACGCAAGCCTACGAGCCTCCTTGACAAGGTAAT GCCCTCATAGGGTAGTTATTCTAGAGCTGCATGGGTACAAGTACAGTGAG GAGTGTGGGCAGCGGGTCTTCATTTTGTTTGCCAGCTAGTGTCACCTCTA ATTGACGTGTGAGTACTTGTTTGTTTCACTAAATTCCCAGAAGATCAACA AACTAAAACATATAGAATACGCGTTCATGCAAAATTATACACGATTATGA TAAGAAGTGCGGGGATTATGGCTATATGCAAGCTGTATGTGCACTGTGCA AAAGGGAAAAAAAGTATAGTATATATAAGAAGTAGACTCGCATTACAAAC TGAGCACGATATTTTTCTGTACCATATAGAAATCGTCATATTTTTCTGCG TATACACATATTTAATATGTTCTCCAGTTCTAATAGTGTGGAACATTCAC GAACTTTTTGGAATGAAGATGTACTTAAACCCAGCAAGGGAGGTATGAGG TCATATTTGATTGTACCAGTTTTTTGGTTGGACGAATAGGTGTATGATCT TCTGTTGATAATGCCAACGCCTAAGCTAGAGATCCTAATATACTTCAATA GTTGGCTGAATTTAATACATAGCTCCATCATACAGAATAAGCCTTTTTTT TTTCCTAAATTTGCTGGATTTGCTAAATATCATTGTTAGTAGAAAGTAAG GTGTGCCAAGTGACATGAGGATGGAGGCCGTTGATGCCATAACTCCAGGG ATAATGAAGGTGTTGAAGAATTGTGATGTACTTAAGGACTAGATTTTGTT GATCTACCAATGGCCGAGATACAAGGCAATGTCATTCGGGCAATGATGTT TAGCTCAAATTGCAACTATGTGTTTTTCAGTTATCTGTTTCATTTGTTAG TTAATTGGTCATGTCGAACTGCTTCTTTATCCGATCAAACCTGTAATAAA CTGTGTTAAGCTCTGGTAGCCAGAGGGCCTGGTTTTTGTTTTTCTGTACT GGACATCTATGATTTCTAGTAATGAAATTGGAAATCGATGGCAACCCTCT TCTCAAATGGGAAAAAGGAGAGAAGCGATTGGTGTCTATATCATTGTGTT GGTTATATCTCTTTTTCTTTTCTTTGATGAGTTAATTTGATGATTTGTTG TTGGTGATGTCCATTTGTAGATGCGGGCAAGGTTATCTGGAGGTCACTTC AGAATGTTAAACGAGAAACTGTACACTTGCAGGTTCACATTCTTTGCACA GACCACTTTGTTTTGTTTAAGCGATGTGTTGGTACCTGGTAGTCCTGGAC TCTTTACTTTCTGTAACTGCCTAGGGTAGTTTTGGCCAGTAATAAAGCAT AAGAACATGGTAACACTTCAGTTCTACATTTTAAAGTATATGGTATTCTG AGTTGTGACCAACTAGATCTGATTTTGTACAAATATTTGCTAAATATTGA TCATGAAAGTTGATAAAAGTTGTGTACAACAATTGTTTACCTTAGAGCAA CTCTAGCAGATACTGAAAAAGCTGGTACTTGTTTTAAAAAAAAAAGCTGG TACTGAAAATCCAGATATCAGTGCACCGAAAAACATTTTACAGTATATGG AGCCTGCAAATTTTTCAGATATTGCATATTGTACAACCATTTCTCCTCTC TTTCTCATATGGTCATGTATATAAACTCTACGTCAACTCTATTACATCAA TATAATTCAAACTTTTCATGTTTCAACATGACGCAATACAACAATAGTTC AAATCCATATTTTCAAATTAAAAGTCAAATTCAACATAAACTACAGTCTG AATGCAACAAAGGATCCAAATAAAACATGAATAGACATAAACAAACAGCA GCAAACTATCTCCCTGTACAGTGGTTACCCTCTTTCTTTTTAATATAAAT TTTACAACCTAGGGGCTTCCCCTATGGTAAAGGTGTAAAAAAAAGTATCT CCCAAATAGTTGCCACTGCTGTTAAATAGTAGCTATTTTTTTTACAGTAT GTCCCCTTCTTCAGATTCTGCTAGAGTTGCTCTAACTCACACAATGGGTG TGCTAATAAAGTAATAATCTTTCATACCAAGTGATAGCCTGAAAAGGTGG GATTGCTTTATCATTAACCAAACGCGGTGTGTGCCTTTACTCTTGGAGGT GGAATACTTGAACCCCCAGCCCCCATAGAAACCACAGCATTGGCATTTCA TGATTTACACTTCTTCTCATATGTGCTTTATCTTTTTCAGTGGAAAGGAT GCATTTGACTACTTTAAGAACGAGCCCAAGCTTTTTGATGTGGTATGTTA TGTTCTCTTCCCTTCAACTATATTAATACCTTCATTTGCTTCCTTCAAAA AAAATCATTTGCTAGAATATATGTTTCATATTGCTTGTTGACACCAAATT TACTATCTGGGCGGGGTGTGGTGTTGCATATGATGATATGTGACATCGCA AACACATAAATTCAGTGCTCGCTGTTTAATCCTCTTGTGCTTCCAACTCT GTATTTTGAGTTTTTTTCTTATTCCATCTGAAAAAATAACCTTTTGGTGA TCAATATGCTGAATAGCTGAAGTCAGGGCAATAATTGACCCTCGGGAAGC AACTCCATATTCACCTGATACGTGGTTGAAATTTCACTCTGTTCTCTTTC AGTATCATGCAGGATATCAAGAGCAGATGTCACAATGGCCAGAGAAGCCA GTCAACGTAATAATCAATTGGTTGAAGAGTCATAATAAATCATGGACAGT TGCTGATTTTGGATGTGGTAAATGCTAAGAAGTTACTTTGTTGAATCTGG CACCTTCTTTCAATTTATCTCTTGTTATTTCCTTGCACAAGCATGATAAT ACCATTCACATTGTACTCAGGCAATGCAGCAGTTGCTAAAAACGTGAAGA ACAAGGTCTTCTCCATTGATCTTGTTTCAGACGACCCTTCGGTGATATCT TGTGATATGGCTCATGTAAGCACTAGTCACATGTATTTTTGTGATCTTTC TATGGTTTAGGATCTGCTCTTTTTGTTAGCTTTCATTTTAACTTCAGACA CACTTCTGCAGTTATTCTCTAGTAGTTCCTCGTCATCCTTGTTTTGGTTT TCGTCATGACTATTGATAAGCTTGAGAACCACACTGGGATATTGCAGAAT GGCCGAAGTATAATACAACAAGCACCGACAATATTCCTCTGCAACACCTT GGCATTTTTGGCTATATTAGTTCCATAGCTACTTGCACTTTCACATTTTA TCTGCTAATATGGTTTCAAGTTTTTACATGATTTTTTTTGGAAAAGAGTA TATATTAATATCAAGAGATACCAATTACACCCAGCCTCTGCAAGTTTTTA CATGATAGAATCCTCATGTAGTGATCTCCCAACCTCTCGAAGTCATCTTT CCCGGCCTTGCTAAGATAGTACTGAAAATTTAGCATCCCCTTCCCTCCAT CCGGTGGCCTTGGTAGTCGTTCACCACAGAAGGAGGCCTTTCTCTTTTAG CTTGCCCCCCTCACTTCTCTCCTGTGGTACCATGGTGGTTTTTGTGACCT TCTCCTCCTTGTTCCTGAGCAAGATGCTGGCTGTGCTAAAGTCGTTTCCT TGGAGTAAAGTGTGCAGTGGCTGAGATTGCTCCATTTGTGGCACCTTTTC CAGTTCTTGGTGATCCAGTCTCTGATCTATCCTCACAACTGCAAGCTGCC AGCTCATGGTACATAAGTATATGTGTGGAATTCCTTTTCCCCGCTTTTTT CAATGGTGTTTACATTATTGATCTTTCAGCACTGAAATTTCCTGATGTTA ATATGGTATATATTCTTGTTTTGGAAACAGGAGCTATTATCACTCATATG CAATACATAGGTGCATGGGTTAAATGTAAAGTTTGAAGCAATGCAGTTGG TACTGAGAGGTGTATTAGTTGACAAAACTAGGTTAATTTATTCTTTAGTA TTTCACGGCAGCATCCTATAGGAAGTACTCCCTCTGTTTCTAAATATAAG ATGTTTTGGCAAGACAAATTGACTTGCCAAAACGTCTTATATTTAGGAAC AGAGGAAGTATTAACTAACTTTTAGGAAATTGAAGTGGTGGTAATCCCAA TCGTCAGCAATACAATTCACTCTCGTGTTTTGTTGTTCTCGTGATGGTTA TGTACTGAGTGATTTTATCCATTATATTCCTGGGACATTCTTTTTTCTTT CAATGCTATGCAGCGCCCCCTTTGAAAGAAAAAAATAGACCTCAGGCATA TAAGATAAACATGACTGTGTCTCTTTTGGTACCCGACTTGTTACTTAACT AAATGTCTAGTTATTTATTCACAGACCCCTTTGGAGCCATCCTCTGTGGA TGTTGCAATATTTTGTCTTTCTTTGATGGGAACCAACTTTCCGAGTTACC TACAGGAAGCGAATAGAGTCCTCAACCCAAGGTTTGATTAATGATTAGCA GCTACACTTTTTGTACAAGCGGTGTTTGGCTCGCCATTTAGTACTCACAC ACTTGTATATGCAGTGGTTGGCTTCTTATTGCGGAAGTGAGGAGTAGGTT AGACCCAAACACCGGAGGTGCTGATCCTGATAAGTTTGCTGAAGCCATCA GCCAGCTTGGGTTTTCTCTTGTTTCAAAGGTTTGTATTTACTATCCTCAA AGATTTCCTCTGCAGGTTCTCAACTTGATAACCATGATAACTTAATTCTG TATAGTGAATGCCCAGAAGGATTTTAACATGATATGGTGCTCGGTTGCTT GCTAACTTCCTTACATACCCAACTAGCTTCCTTATGTACCCAAAATTAGT CTAAACTCCCAGAGCTTATATGTGAAAAAAGATCACATGCACTGTTTATT AGCCGATGAAAAAGCAATTTAAATCATGAATTTCTTATTTTTGTTGATTT TGGGTTGAAAAGTAACTTCATATCAAAAAGATAAAATTGTTGCACATACC CTGTTTGTGTTATACAGCACTTGTAGGAAACTTGATATATTCTACGCACT GCTTTCTGCTGGATGTAGTATGTGACTATGGCCTCAAAATTGTTCCCATT GACGCATCATTTTTATGGTCCATGTTATAAAGGCCGCATGACAGATTTCC GTTTTGCTTGGAATTTGGAGCCTTCCAATGTATAATACGTTCATAACTTT GGACATACTGGTGTAGTTATATACATATGAGTTTGGTTTGTATTGACAAA ATGACACGGGCATCATTTATATGAAAAAAGGTGTGTGCTCTAGTACTTCT AATTGATAATTGGTCCCTTTCTGCAGGATATGAACAACAAAATGTTCGTC CTGTTTTATTTCAGGAAAAAGGTTGGTCGCTCTACTTCCTATCTTTCTCC ATCCATGAATGTCAATTAACAATTGCATCATTGACATAGTTGAAATATGT TGTAACACTGTATTCTGTGGCTTGACTTGACTCCACAGGAAAAGAGCAAG GCGGTGGAAAACATTGATTGGCCCCAGTTGAAACCTTGCTTATACAAACG GCGATGATGTCATAGTATCTGATAGCTGTAGTCGCACTAGACCTCTTCGG ACGTCTGGTTAAGTTAATTTGTATTGGCCTTCTGTGTGTCGAGGTTTTCT GCTCCTATTTTTTGTACCTTACCGCAGCTGTATGTTTTTTGGGTATCATA CCTCACCAGAGAGGACCTAATGGCTTGTGGCAAGCGTTGTGAATCCAGGC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.