Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA040235

[Submit comment/correction]

Sequence
AA040235
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA040235
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
AGAAGCTCCACGTGCCACTGACCTACAGTAGGATTGTCTCGAAAAGTCAT
TGCTCTAAAAATATAGTCTAGGTAACTGGTAACGCGGGACCCGCGTGCCA
GTGACAGTATCCCCTCTCCTGACTGTTGGGCGGATCCTCGCCGCGGCAAA
GCATGGCCGCCGGCGGTGGCCGCAAGGAGGCTGCAGGTGCAGCAACGGCA
GGTATGACCTCACTTGACTCTTTCTTCCTGTCCTGACCTGTTCCTCTTGT
TGCTGCTTTTGTACCACTTGTCCAACCAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAG
CAGCCGCGCGCGTACCCACTCTCGTTGACATCGGATTCAATGGCGCTGCT
GCTGAGGTCAGGGGAGACGACACAGACGGGCGCATGCCACCAACCCCAGT
ATTCATCTTAGATCAATCCCCCCCATTAGTCAAATTCCTCCCCGCCTTCT
TTTCTTCCCCTTTACTCACCGCCTTTTTGTCAATGGCGAAACAAGGAATG
GTTCAAGATTCATGTTTTGGGACTGTTGGGTTGGGGAAGAACGGGTCACG
CCTGCCTTCAATTCGGCAGAGATCATGCACGGGCCCCTGGATTCAGCTTG
CCGTCACTTTCCTCCCAATTAAACCCCCTCTCTCCAACCTCCATTACAAT
ACTCAGGCTCCGTGCTGCTTACTACTCCCCACACTTTTTAATTGGTCAAT
CCCCTCACCATCCCTGTCCCCTTCTCTCTGTTTTTGTCCCTCCTTCATCC
TCCCTTTGTCCCGCATCATCGGCCTATCCATTCCTCTTTGCCACTTTGAT
ACTACTTTGCTCTGTCCTGCATATGCTCTGCTGCTACCTGGTGAGTTCTG
CTCTGCTTCCTTTCCCTTCCTCTTCGTTTCCATGCTTTCTTGCTATAATC
GAATCCATCCATCCAGTTTCCTCTTCACAACATAAAACATAGTAGCTTCC
TTCAAGGTATGGAGCCATCAGGGTTAGCCTCCTTTGATGGATACGCTTGC
CCTGCGGTCTGACCATTAATTGGAATCAGATACTTCTTCATTCCACAAAA
ACCTCTCGTGCCATATCGAGTTCATGCATGTCAAAAATCTCATACCCATT
TGAGTTTTTGCTGCTGTTCTTACTGGTTGGCAAGTGCTTCTTGGCTGCGT
GCTATTCTCCAAGAATGGTCCTTGGACTTTTCGCAACTCCCAGATATAAT
CCGGTGCATCACCGGCTTTAGATAATCCTTTTTTTTCCGTGTTCCTGGAT
CTGGACGAATAACTGTACCTCCTCTGCTCCTTTTCCAGGGAATGGACTCA
GCCATCAGAAACAGCCCGCATCACTGAAATCTGAACATTGCTGTCAATTC
AGGGAAATTTTCTCTACAACGACATCATGCCGCGTTCCCTGCTGTTCTAT
CTTTGTTCCGTTATCTTTACATTATATGTTGCCCATGCGCAACCGACGGA
TGCGCAGATCACCGCACCATGGGAAGGTAAGATCCATCTTAAACCCCCAC
ACAGCCACACTTTGCCTAAATAACATTTAATCTAGTTTGATGGATATTCT
TGCTCATCCTACTTGTTCCTGATAACCATGACTGTCACTTGAGGAGAGAT
GCAACACATATCATATTTCCTGTATCCTGCCTGCATTACGTAAGTAACTT
GCCGTACATTTGGTTCAACAGTCGACGCTTTGAGAGAGATCAAAAACAGC
TTGGACGATCCGCTAGGATTTCTCAACAACTGGAACCGTGGAGATCCATG
CATGGGGAATTGGACCCGCGTCATCTGTGATAATGGAACGGCGGCAAACG
ATGGATACTTTCATGTGAAAGAACTGTATGTGCACAAGTCATTTCCTTGT
CAATCGTGTCCGTCACATTTATACAACCCTTCTGCTTTAAAGTATCAATA
TCTTTGATGGAGCTGCTAATGCAAAAAAGAAAATGATGCAAAATGTATTT
TTGATGGACTACTGAGCATTTGTCCCTCTGATATCACTTGATGGTAATCC
TCGTATGTGATTACAGGCAGCTTCTACGGTTGAATTTATCTGGAACTTTA
TCTCCTGAGCTTGGCCGACTTTCTCAAATGAAAATTATGTAAGTAAATTG
AGTTGAGCTGGCTAGTTATCGTGTCGATTGTCTGTCCTATTAAATCCAGA
CCGACATGCACCAGGCCGACTGAATACTTCTTTTGTTTCCTTTCAAGGGA
TTTTATGTGGAATCAAATTGGTGGGAGCATTCCTAGCGAGGTTGGCAACA
TTACTTCTCTTGAACTATTGTAAGTTGAAGCATTCGTGGTCTACCTGAAC
TTAATAGCCTTCTTGTTGGACATGGAGTTTATCGTTTTTCTGTATATATA
TATTAACTTATTTATTGCTTACAGTTTTTTAAACAAATAGTTGTTTCTTT
GAGATGATTTGACAGTTGCTTTAGCTCATGTAACAAGATCCCCGTTTTTT
AAATTTGCAGACTCTTGAACGGGAACCTGTTGACTGGTCCTTTACCAGAC
ACAATTGGCTTCCTTCCTAATTTGAACAGGATTCAGATTGATCAGAACCA
TATATCTGGACCAATACCTAAATCATTTGCTAACCTGAACAAAACCAAGC
ACTTGTAAGTACAACATATTTGTATCTCTCTGTAAACAAGTGATACTTAT
CCTTATACTAATGGATTTCCAATTTCTATCCAGTCACATGAACAATAATT
CGTTGAGTGGTCAAATTCCACCTGAATTGTCCAGATTACCTTCACTTGTT
CACCTGTAAGTACCTGACTTCTGCACCTATCGTAATATTGCTTTTCATTT
ATACTCTACTGACCGTGTAATTTCTTTTCAGATTGTTGGATAACAATAAC
TTATCGGGCTATCTTCCTGCAGAATTAGCACAGCTACCAAACCTGCTCAT
CATGTATGAAGCCTACAATTGTGCAGTAGTTCGAATAATGTTCACTTTTT
GGTTATCTTGGTTGGGTGGGTTGGGTATCATGAAATGAACTTAATTTCTT
GGTATTACATGAAGTACATAATTAGTTCCTCTGTATTTGTTTTTTCTAGC
TTGAATGGATTTTAACTGTAGTTTTTATGGATATCCTCTGTATTCAGTGA
GAAACACAATCAAAGAACATCTTCTCCACTCTTCTCTTTTACTGAAAAGT
ATTTGCTGATGTGTGTATCCTTGCGATAGCTTATTCAATCGGAACACTGC
AAACAGGCTTTAACTGGCATTAGCTCAGTTAGTTGTTTAGGATTACTTTT
ACCCTGATCTTTATGGCGTTATTTCTTGCCAGTAGTGAACCACTGGAAGT
TGAAACAATATAAGTGCTAGCCTTTTGCTATTTTTCTGTCATCTATATAT
CATAAGCAATTCTAAACTAACTGGAAAGAAGCAAAGCACAAAATACACTG
AGATATCCTTAGCACCTTGTGTAACTTCCAGTTCATTTTCTTAGCTTTTT
TATACGTCTTTGAGATATAACATTTTAAGGATATATGCATTTGCTCTCCA
TCTAATTACATCTTTCCAAAATGATGCCAGTCAGCTAGACAACAACAACT
TCTCAGGAAGTTCAATTCCTCCATCTTATGGCAATATCACCACACTTCTT
AAATTGTAAGTTCAAGTTTAGTCTTCTGATCTGCTTTTCTTTTAAAGTAT
TTATGGCAATTGCAGATTAATCTAATTGATATGGTCTGCATCAGGAGTTT
GAGGAACTGCAGCTTGGAAGGTCCTGCTCCTGATGTCAGTGGAATACCAC
AACTTGGCTACCTGTATGTAGAATTCTGAACTGCATATTACCTTATATGG
AACAGCATATGGCCTATTTGTTTAGGAAAAAAATCTTACACATGACGCTT
AGAGGAATTTGGCAGCTATTACTTACTCTAATCTTTGTTGTGTTGGTGTT
TCAGGGATATTAGTTGGAATCAGTTGACGGGTCCCATACCATCTGGCCAA
CTAGCGAGCAACATAACTACAATGTATAAAACGAGAGAACTCACAAAGCA
CTCATGTCATATTGTTTTTCAAGTGTCATCAGTTGATCTCTTTTTACCTA
GGAAACATTTCAGTTTACACTCACCTTTGCAAGTTGTGCAGAGACCTTTC
CCACAACCGTCTCAATGGCTCCATTCCTGGAAGTTTCTCCGGCCTTCCTA
ATCTCCAGAGATTGTAAGTAATGATATTACAGTCTTCGTGCTATTACATC
CAATAAAATTTGATAGGGGATAGATCTCTAGAAAGGAAACCTTTAGATTA
GGGATGCTCTTACTTCATTATTGCTCAATATCAGGAGTAGTTTGAATTAG
TAATTACAGTATGCCTCCTTATATATAGGTATCGACGCGGATTTGCTACA
CACGGGCATAGCTGCGCATAGGCTTAGGACCGTTGGATAAAGAGATCACA
TACACTACTAGTTTAGATGGTAATGGCTGGCTCTTGAAAGTAGTAACGGT
CCCTAACGGCGTTTGCAGCACCGCGTGTGTGTACATGCATGCTTGTGAAA
ACCCTAAAAATTTTAGCTCGCTGTTTGGCAAAGAAACTTTTAGCATCTAA
AATGGAAAGATAAGTCAACAAGGCTTAAAATGAGTTCTACATAGTATGCA
AACCCTAGTGAAGGTTTGTGGTACTATGCAAACCCTAAATTTTCATCTAA
GTGGTTTAGTGTCTTGTTTTTTTGGCGGGAGAGAGTTACTTGTCGCGCGC
ATCCCTCCACATTTTTTTGTAAAACAATAACCGGTCCATAATAACGATGT
AAAACAATAGCTTGTGATTAGAGAAAGCAATGGTATGTACCAAACAAAAG
TGCACGAGGAGGGATGAGGTAGAGGGAAGAAAGCAATAATCGGTTCCACC
TAGTTTTTCAAATGAGCAAGGAAAGTTGAAGAGAGACTAAGTAAGTTAGG
GTTGACTAAATAAGTTAGGGTTTCTCAGCATGTTGTTCGTTAGGGTTTGC
CTCACCTAAACGAAATTAGATAAGCTTTGTTTTGCATGTTGTTCGTTAGG
GTTTGCCTCACCTAAACGAAATTAGATAAGCTTTGTTTTGCATGTTGCTC
GTTAGGGTTTGCCTCATGCAACCGAAAATAGACAAGCTTTGTTTTGCATG
TTGCTCGTTAGGGTTTGCCTCATGCAAACGAAATTAGACAAGATTTGTTT
TGCATGTTGCTCGTTAGGGTTTGCCTCATGCAAACGAAATTAGACAAGCT
TTGTTTTGCATGTTGCTCGTTAGGGTTTGCCTCATGCAAACGAAATTAGA
CAAGCTTTGTTTTGCTAGGGCTTCATGCATGCATGCCAAAGGAACATTAA
CGGCGTTAGTTCTTAGACAAATCCTGGGTCTGGATACATGTGCTCCCTAT
ATCAAAAGAGGATAGAATCAACGGTGGATAGGCTATGCGCAGCTATGCCC
GTGTTTAGCAGGCTATTTCCCATATAGGTATATCTGTTCATATAGGTAAC
ATTAGTCTAACAGATAAGCTGACTAAATGTTATTAAATTTCAAATAAAAT
ACTCCCTCTGTTTCGGTTTACAGGTCATGCGCGTATACCTAGGTCGCTAA
TTTGAACATTAAAATGTAAATTAACAACTAAAGTTTCTAATGGTATAATT
TTTGTATTATACAATTTATATTTTAGTGGTCAAATTGACAATCTAGGTAT
GCGCGTATGACTTGTAAACTGAAACGGAGGGAGTACCTATTAAGTAGAAA
CCAAGTGCCCATAATCTTGCTTTTGGGTCTTCTCACATGGACAATAACTG
CTTGCTAGAGTACTTACTGCGGGCCTATGCCATGACAACAACTTCAATTT
GAGCAATCAAAAAACAGTTGCATGACAGTAATGTTCATGAATGATCAGTT
GAATCAAACTGAGCTGTTTCTTGTTTTCATTCAGGTCACTGGACAATAAT
CAACTGGATGGTTCTGTTCCGTCTGATGTCTGGCAAAATATCAATTTCGA
TGGAAACAGAAGCCTGATATTGTAAGACCATCATAAGTTGAACCTTTAGT
TTCAATTTCTTTGAGAGTGTTAGTCTAATATTCTCTGTTGAATATTTTGC
AGGGATTTCCATAACAACTTACTCACGAATCTTTCGAATCCTCTTACACC
CCCTGCTAATGTTACCATCCTGTAAGCATTTGTATCGAACAATTTCCTTG
TTAATTTAAATAAGAAAAATCTTGACCTACTTATACTGTTAGAAAGATTC
TATATTGACACCCAGGAATATGTACAATCTTTGTTTGATAAATAACCTGA
TGTTGACCAGTACAACAGCTTGAGTAGTAGTCTTTAACTTCCATATGGTA
TATAGGAATGATGTATGCTGCAGCTTTCTTGCTCTTATGCGAACATATAG
GTAGACTAGCTAGTAGTCAACCTAGTTTTTTCATCTCAAAATAGAATACA
TACTGGATAATCAACCTAGTTTTTGTGTTTGTTATTGAAATTCCCCAAAT
TTACAAATTAAAGAAAGAATGACATTCAAATACGGAAGGGGAGAAACAAT
GGTGTTGAAGTTTACAGATATTTTTGCTACTGCCAGTACCCTATATTTAC
TTTACTAACATGGCATGTTTAGGTTATCTGGAAACCCCGTATGCACATCT
CAGAACCAACTGAACATATCTCAGTATTGTGGATCACCTTCATCAGTTCT
TCCTGGAGGAGGTTCCCTGGATAACAGCACACTCTGTTCGCCATGCTCGA
CCGACCTTCCTTTCGAAAGCATACTCAAGTCACCAAACCCATGTTCATGT
GGCATTCCACTCTACGTCGATTACCGTCTGAAGAGTCCAGGATTCTGGGA
TTTTGTTCCGTATGAAGCGCAATTTCAAGAGTACCTATCATCGGGACTCT
TTTTGTCCTCATACCAATTGGAAGTTTCTACTTTCGAGTGGGAAGAAGGG
CCAAGGCTGAAGATGGAGCTGAAGCTGTTCCCAAACAACACTGGTTTTTT
TAATGCGGCTGAAGTGCTGAGACTGAGAGACATGTTCACAGGGTGGTTGA
TTGCGGACTCAGATATATTTGGGCCTTATGAGCTTATTGACTTCATCCCA
GGGTGGTACGAAAATGGTATGTATATATGCTATTTTATATTCACTCCACT
CCCATATTCAATTATGTCGCAATTTTTGTCGCCATGTTACAGATGTTTGT
GTTAGTGATCACTGATCAAACGTGCAATTATGTGCGTACAGTAGAACAAC
ATACGGTAGCCAGATTTTTTAATCTTTTGTGGGGTAACGTACCGTAGCGA
GCTCTTTTCTTTTTGGTGGAACAGATGGTAGCTAACTAGTCCTGGTCGAG
TTGGCTCCCAAACATTTCTTCGGGCCCAAGGCCAAGTGAGAGTGGTGCCT
GCTTCCTACTGCTCAGTCGAGTATATCAGATCACATCGAGCTGCCGAGGC
CTCCTCTCTTTATCTTCCCTGATGCCTATTCCCAAACCCACGCTCCCTCC
CTGATCTGTTTCCAGTGACTCCACTGTACCGAGGGAGGATGCTGGCACAC
ATGTCCCTAAACTTAGTCCCATTCATTGTGTGTCTCTGAACTTACAAAGA
ATTTTCACTTGACACCATCAACTTAACATGTCCCTAAACTTTTTCCTGTT
ATGAAGTTTACCCTCATTTATGAGATTGTGCTCTCATTGTCATAATTCCC
CAGTGGCTTGGTTCTCAGTGTCTTTCTAATTCGTCAAGTTCACCCTTGTA
TTGCAACCTTGCTGTATTCCCTGGGCCAAAGGCCAATATATGTATATGTA
CATGCATATGGCAAAGAAGAGACTAATACAGCATCCAGCAGTTTTCTTGG
ATCACTATAAAGAATAAACATTGGATTGAGTACAATATAGCTAGGTCTAC
AAATAATAATATGACACCCTTTTTTGAACTCTGAAAAAATATGAATATCT
TAAAGGAATAATTTGGGACCGAACAGGATTTTGATGGCACTGTTGTGGAA
GTATCCATCACATATAGTGCTTTTTTATCAAATGAACCACTACGAAGTGT
TGCCAGCTTGCTATCCAGCAGTTGTAGCAATTATTTAAGAGAGAACTCAC
ATTTTTTTCCCATGCTTTCTTTCCAGTACTGCCAGGTCGTGCAAAGTCTA
GTCTCAGTACAGGTGCCATTGTTGGTATTGTCATCGCAGCATTTGCTGCA
GCGGCAGTCATTTCATCCCTTATTACTCTCTTTATATTGAGAAGGCGATC
AACTCAATCTTCAAAGAAACGCAATGGTAAACCCTCTATTTCTACTTTCG
ATTGTCTAAAACTATTAGATGATTCACCTCTTTATTCAAATACAGTGTAT
TTTTTCAGTTGTCCACTTTTATTTTTTTAAACAGTTGTCCACTTTTATTT
TTTTAAACAGTTGTCACTTCTTTTGCTTCTGATTTTGTTAGTACAGAGTT
GCAGCATTGTACATATTTTTTTTTAGTTTTCGGTATGAGTTGCTATTTAT
CTGAGCTTGCTGCAGAGAAATAGTTATGGTTATTTGATGACAATATTCTA
CTGGCTTTTCAGCAAAAAGAATTCCGATGAAAATTGATGGTGTAAAAGAC
TTCACTTTTGAAGAATTATCAAAATGTACAAGTGATTTTAGTGATTCAGC
ACTAATTGGTCAAGGAGGGTATGGAAAAGTATACAAGGGGGTGTTGGCTG
ATGGAACAGTAGCAGCAATAAAACGAGCACAGCAGGGATCTCTTCAGGGT
TCAAAGGAGTTCTTCACAGAAATTGAATTGTTGTCCAGGCTGCATCACAG
AAACCTGGTTTCTTTGCTTGGTTATTGCGATGAAGAGGATGAGCAGGTTG
TCCCAGCAACATTTATTTTTTTATAAATTAATTGAAAAATACTAATTTCA
TCACATGCTTTTTGTTTGTTATTCAACTGGTTTCTTTGTTGAGAATGGGC
TGCGGAAATTTTGATGTACATGCATATGTTGAACTACATGTACATCAACA
CATGTTATCAGCCTATTTCTACACGTCAACACATGTTAATCAGCCTATTT
CTGCTAGAACAGTTCAGCATATAGTTCATTGTCTAGTGCAGAAGCGATTC
CCTGTAAACTCATTTTTTGTTGAATGAAGTGCTGAACTGTTGCCTATATT
CTTCATTTTATGCCTAATGGTTCTCTATATTTTGTCCAACGTTATGATGA
CATGAGCTCATACTGTGAATCCTGTATTGCAGATGCTGGTGTATGAGTAT
ATGCCAAATGGTACTCTGCGTGATAATCTTTCAGGTCAAAACTTCATTCT
GTACCCAACAAAGTCAATCTATGCCTTTTGGATATCTTTGCTTTTTGGAC
ATCTATACCTTTTGGATTTTTAATAGCTGGGCTCAGGCCAATGAAGTCTC
CATGCTATTTTGGTTGCTTGCAAATTATTATAGCATTCGTGCACGTGTGC
TAAAACTGTTCACTGGTATTCCTGTACCGTAGTTTTGACGTGTTCCCTGT
CTTAACAGCGAAAGCTAAAGAGGGTCTAAGTTTTGCCATGAGGTTACGGA
TTGCACTGGGATCATCACGAGGCATCCTCTATTTGCACACCGAAGCGGAC
CCTCCGATATTTCACCGTGACATCAAGGCTAGCAATATTTTATTGGACTC
AAAGTTTGTAGCGAAGGTTGCTGATTTCGGTCTGTCGCGGCTTGCTCCAC
TGCCGGAAACAGAGGGGAGCGCTCCTGGTTATGTTTCCACAGTAGTAAAG
GGTACCCCGGTGAGTAGGCTAGTTGTGCATAAGTAAGCATGTGGCACGCG
TGGCACTGGTACCCCATTAATTATTGATGGAGTTGGCTATTTTTGCAGGG
CTATCTTGATCCGGAGTATTTCCTCACTCATAAGCTGACGGACAAAAGTG
ACGTGTACAGTCTCGGCGTTGTTTTTCTGGAACTGCTGACAGGGATGCAG
CCTATTTCTCATGGGAAAAATCTAGTCAGAGAGGTAAACTATCAAAGTTC
AGTCTTTTCGATCGAGGAGGGAATGAACTAGCTGTGGTGCAGTGATATCT
GTGATGAGAACTGTGATAAACTGAAACGCAAAATGCAGGTGGTGGCAGCG
AACCAGTCAGGGATGATACTGTCGGTGGTGGACATGCGGATGGGGTCGTG
CCCTGGGGAATGTGTGGAGAGGTTCGCCGCGCTAGGGCTCCGGTGCTGCC
GTGACGAGACGGACGCGAGGCCATCCATGGTGGAGGTGGTGAGGGAGCTG
GAGACGATATGGCAGATGACACCGGAGATGGATGGCGTGCCGTCGGAGTC
GGTGGCCATGGACCCTAGCCATGCCACCAGCAGCACGGCGACGTCGTCTG
GGTCGAGGATGGTTTCTGGCGGGAACGACCAGTACATGTCGTCGTCCGAT
GTCTCTGGCAGCAATCTTATTAGCGGCGTTATGCCCAGCATCAACCCTCG
GTAGCTGAGAGATTAGCATGAGCTTAGTTAGTTGCTGATCGATGTGTGTT
TTGTCAGTTTGTGTGGTGTAGTTGTTAGTAGAAATTTGTGAGCGCATGTG
TCACATGTTTGTAGATATTAGAAATTTGTGGTTGTTCACGTTTTCCTTCC
CTTGTAAATAAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.