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GrainGenes Sequence Report: AA003590

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Sequence
AA003590
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA003590
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTTTCCCATTCGACCCCAAATTTTGGAAACCCTAAACCCTAGACTCCGCT
CCCCACCCCTATGACGCCGCCGTCGCAGCAGCTGGTGCTCGCGGCCTCCT
CTGCCGACGCCGGCGTGGCCGCGTGGGATCTCCGCACGGGCGCCGAGGCG
ATCCGCCACCGGCCCTGCGCTTCCCGGCCACGTGCCATCACCGCCGTCGC
CGACCGTTTCCTCGCTGCCGCCCAGGCACCCGCCGGCAACTCTGCCCCCA
TCCACTACTACCACTGGGACAAGGTAAGCGCCCTTTTGCAAACCCGACTT
CGCTTACTTGAACTCCAAGCGTAGCCTGAGCTTATGTTCTTGGTTCCAAG
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GGGGGGGGGGGGGGGGGGGAGGGGGCTAACTAACCTGGAACAAACAACTA
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TGGAGTTAGTTCACATCTTATCACTACTATTAACAAGATGGTTAGATGGC
ATGCCCTTATTCTGACGAGAGGACTAGAAGGGTTGATAAATACCATACAT
AGATGATACTAGTTAATAGCACGTGCTTTGCACGTGAGACATTCAGCAGA
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TTGTATTGGTCATTGGCTAACCTTTTACACCTAACTATGAGACACAGCAA
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AGAGATTATAAGTATTTTTGTCTTGCACCGTAAAAGTGACACTGAAGACG
ATACCCTTTTCACCGCCTCTATCTTCTTATTTATATTCTCCAAAAAAATG
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TTTTGAAACTTTGGTGTTTTGCTGTAGCCAAACGGCTCAAAGTTTTTAAA
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ATTCTAGACATAGTTAATGTTATATCCCACAAGCATGCAAAATTGCAACA
TGGATTTTTTTGTTATTGTGGGCTACACAAAAATTATAAAAGCTCATAAA
ATTTTTGGGTTTTGAAATATACATGCACAAATCCACACTTTTGTCGTTTA
TGTGTAATTCAGAATATAAAGAATTGAAATTGATATTTTGCATGTTTATG
AGATATATCGCTCGTTACATCAGGATAATTTTATCATGTTTTTTATAAAT
TGTAAACATGTTTTTTGTTTTTTAATAACAAAACCACTGGTACTCAGGAG
CAGGGGCGGATCCAAGTGCATGCTGGGTGGTGCACAGGACCCAGGGTAAA
TAAAAAAACCTTTATAGATTAGCTATTTATCACCATATGTGCCACCCCTA
AAACAAGTTTTTTTAAGTTGAGACACCACCGGATTGTTATGACCCTAGCT
CTGCCAATGCTCAGGAGCCAAAAAAATCTCCACCATTTTGGTAACGGGAA
TAGGTTACAGACATGCCAACAAGTAGACGCAAGGCAAATGAATACTTGTC
AATGCCCAAGGCAAATGAATACTTGTCAATGCCAATGCAGAATTTACGTA
CCAATTGTTTGTTTTCTTACGGGATTTATTAAGTACCTAGTGACACATAG
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AATGGAATAGTAATTGTCTATAGCATTTACTTTTTATTTAATTTCTTGCT
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TGCAGCATGGCCCACCCAACATGGCACATGCATGTGCCTTGTTTCAGAGA
AGGACGACGTGATGTTTCTAGACCTGCGTGGAATCGCCAGCTGCGACGTA
TGAGCACTGTTCACAACGAATCCCGCTGCACTCAGCCGTTCGATTTAGCA
CTCCCAACGGTCATGATTGACACTCTAAACACAGTTCAAAATTGGTACAC
TATATAGGAGTATAGAAATTTACTTCAGGCTGAATTACATAATGAATTGA
GGACACCTGAAGTCCTATCTTGACTCACTTGGACCTAGTGACTTAGTCTT
GACACCTCTACTAGACGTGAACTAGCCCTGAAACAATGCATCATCTAAAA
TATACTCATCCTACTGCCATACGAAAATGTCAACTCATATAACTGGTAAA
AGTGAGGTGATATGCTGCATGGTCCATGAACTCGAAGATGTAAATGATGG
TCCCTTGATCACAGAGAGTATGTCCTGTTAACTTGTACCAGATTGGTGTT
CCTGTGCTGCTCCCAGGCACTGGTATAGGCACCCAGGAGCAATAAAGTAA
TATGCAAAAACTGTTATTCACTTCCATTCGATCACTGCTGGTACTTTTAT
GTGTTTTTTTATTTATCTCATTCACTAATACTTCATAACTCATATAGTAG
TCTAGTTTGCTCTTTAAATGGAGATATGTACTTTGGTTCACAAATCTAAG
TTAAAGAAAGATGTTAACAACTACCTTTGCAGTTTAGTTCGAGTCGCTTC
AATTCAAACCTTCTGTTATTTGTTTTGCATGCAAGACTTCTTACATTAAT
GGTGATTTGTGTAATTTGTTCAGCAAGGCGGTAACGAGCTTAGCATCAAG
CACAGATGGGCTTTTGCTAGTCTCTGGATCAGAGGATGGTAATGTACGGG
TTTGGGATACCAGAAGTCAGCAAGTAACCCGGAAATTCAAACATTCCCAA
GGTTCATAGTTTTTTTCCCAAACTGGAAGCTTTCTCTTCAAACATTATGT
AGAAAATAGGTTAAAAAGTTGAAACCTGTCTTATGTATTTTGCATTATCA
TGGACTATGTAGTTGATATTTTATCCACCTTTTCTTTTTTAGAGAGAAGT
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ATCGTAAATGCAAACGAGATGATATTTCATGTAGGCACCTTGGATAGATT
GACTTGAGTCTAGTTCGTTGCTTTTCTTATTTGTGAACATGCTTGATTGT
GACTAGAAAGTGGAAAAATCCTATTAGAAAAAGCGGAGGAAATATTTCAT
GCTTGTATTAATTCACCTTGGATGATATTTCATGCTTGTATCTGCATCCA
AAGACATAAATAGCTGAAGTTTGCATTTGTATGCACAATTCATTACTGCC
CAAGGATACTTTACCTGAACCAAAGTGTATTAATTCATCCTATAATAAGA
CTTGTTATATTGATTCATAAGCTCAAACACCTTTCTCTTTCGTAAGTTTT
TCTTAACTGAGGAAATAATTGTAGCTGTATGAAGAGCATTGTTTATTATC
GAAAAGTTGACCTGTGGACAGCTGATGTAAGCATAATCAAACCTTTTGTT
TGCTTGAGTACTCACTAGTTTTCATGGAGAACTTGGGCATCTTTACTTTA
AGGTAGTTATTATTATAATATATATGGGGAAATTTGTATTTTGATGCTTC
TGTATTTGAGTGCGATTCGAGTTAGTCTGCTGCTCGTCAGACCCAAGCCA
ACTCCTACCTTTTTTTAAATGAAACACTGTGACTATGTCTGTTAGTGTTC
CCTCTCTGTTCTCTCTTTTGATTAAAAGCAGAAAGTGAGGCGCTAGCACT
ACAAAGGAGAACACACAGAAGTTTCAGGAAACAAATGCCTTCTATTATCT
TTTGCAGCAACAGATGCTACACTACTCAGCAACAAATGCCTACAGAACTT
AGCAACCCATGCTTACACACATGTGTGACACATACATATGTGCTTCAACC
TGACACACATGCTATCTACTACATCTTGGCTTGCAACTTATGCTTGCCCC
AGCAACCTATGCTAGGACCTATTTATACTTATATATGACCCTTTAGATTG
TTGCCATGTGGCACAATCTAAACCCTACACCATATTTATAGAATACTCTA
CAAACTCTAGAAATTTCATACTACTAAATATCCTACTCTAGAACATTCCT
AATTCTAGAGTTCTCCCTACATACCCTGGATACTTCATGACCTAGCTAGC
TCCTACTAGCCAACTACATTGACAAGATTACTTCTAACAGCAAACACACA
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CATGAAAAGATTACATTGAGGTTAACAGTCGCCCCCAATCTTGTCATCTT
CAATCATCATGACAGTGGCGCTGGATGTTCATCTGCCGACACAAACAACA
CTTCTCTTTCTTTAGATTGCGGCACTCGGACGAGTAGTGGCCACGGACGC
CACATTGTAGCACTTCCCCTTCTTCTTCCTAGCCTTGCGCCCACTACGCA
CACTAGTGTCTCGCTGCTATTGTCCTCGTCATTACGCCTAATGCCATGAC
CGCGGACAGCACCACGGTCACCCTTTCCCGACTGATATTACCTTCATTGT
TTCTTGGACAACAACAAATGTTGCATGCCAATAGGATAACCAAAACGCAT
TCGCAGTCGCTCCTCATGCGCCTTTCTTTGCCATCTCCGGGATCTCCTAA
CCTGGCGGCTCTCAGATACCAATTGTTAGTGTTCCCTCTCTGTTCTGTCT
TTTGAGTAAAAGCAGAAAATGAGGGGCTAGCACTACAAAGGAGAACACAC
AGAAGTTTCAAGCAACAAATCCCTTCTTCTATTAGCTTTTGCAGCAACGG
ATGCTACACTACTCAACGACAAATGCCTACAGAACTTAGCAATCCATGCT
TAAACACATATGTATGACACACATACATATGTGCTTCAACCTGACACAGG
CTATCTACTACATCTTTGGCTTGCAACTTATGCTAGCCCACAACAACCTA
TGCTTGCCCCAGCAACCTATGCTAGGACCTATTTATACTTGTACATGACT
GTTGTGGCTGCTTAGAGCTGCGAAGGTAGTAGGGGTGAATCACAGGAGGA
CGAGTTCGTCCTCTGCGTCTTGGTGCCGTTGCCAGCGATTAGATGGGACA
GCAAGGGATAGGTCGAGAGAATTCAGAGGGGTAGGGAATAGCACGTAGAA
GATAGATTGTTATTGCTTGCCCTAAACACACAGGATACAGATCCTCTTAT
AGGAGGATCAGATGCCAGGGGACCTGGTGCCCAAAACTGACTCCAAACCT
GTAGTACATAACTAGGACTCTATTTAAACTAACTCATGTTGCCTAACTTT
CCTAATTATTTAGTCCTGCAGTAATAACTGGACTGGACTCTTAACTATAG
CTATGGCAACTGCCATGCTCCTAATGCCACAACACTACTCCCCCTCTTCA
GATACAGCTCGTCCTCGAGCTGTAATTCATGGCGGCTCTTTCTCCTCAGC
ATCATCAATAATTTCAAGGTAGAAAAGACGTTGACAACGATGGCCTCTTG
AGAATTTTTCGTCGCAGTTGAAACAAAATACCTTCTCCCTTCTTTCTGCC
ATCTCCGTGGTTGTCAATTGATGAAGCGCCCGTCCATCCCCAACTGGAAC
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GGTCTCTAGAGGATGCTTCTATGATGGAAGCAGCTGTGACTTTAGCCCTC
AGTTCATGAGCACGGGCAAGGCTCATTGCCGTGTCTAAATCTGGTGAATT
ATGCAGCTCCACGTCGATCTTCAACAGGTCGATCAAGCTAGAGGTGAAGA
TGGACACCTGTTGTGCCATGGACAAGGCGTCAATGTGCCCCAGAAGTGCT
AAAAATATTTCTTGGTACTCTGCAACAGTCCCTGTCATCCGAAGCCTTGT
TAATTCACCTAGACAATTGGATCGAACCGGAGGGCCGAATCGAAGATGAC
AACGATTTTTAAAGTGAGGCCACGAAGGGATGCCTTCATTGCGCTCTAGC
TGCATGTACCACGTCTGAGCAGCTCTGGTCATGTGGTATGCAGCCAGCCA
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TGTTTAGCCATCCGAGTGGATCTTCCTTTCCATCATAAGTTGGAAAATCC
AGCTTGTGATAGTGTGGTACGCCGGCGGTGTCAGCGAGGTGAGGCACAGC
TGGCGGCACCTGCGGTGGGACAAACGGGGGCCATGCTCCCATCGGATGCT
GCTGCCCTAGGGGTAGTGACATTGTTGGCAACTCAGAGTTGGACATAGCT
GGAGCTGAGGAAACACCAGTAAGGAACAAGGTTGGTAGCAGCCGATGATG
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CTCGAGCGCGGTGACGCTGTCCTGGATGGCCTTGTTGGTCTCTTGGATTG
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CTGTAGGTTGTCTGCTTCGCCTTCTCCACATCGGTAGCCATGGGGTCGGC
TCTGATACCAGATGTTGTGGCTGCGAAGGTAGTAGGGATGAATCATAGGA
GGACGAGTTCGTCCTCTGCGTCTTGGTGCCGTAGCTGGCGATTAGATGGG
ATAGCAGGGGATAGGTCGAGAGAATTCAGAGGGGTAGGGAATAGCACGTA
GAAGATAGATTGATTGTTATTGCTTGCCCTAAACAAACGGGATACAAATC
CTCTTATAGGCGGATCAGACGCTAGGGGACCTGGTGCCCAAAACTGACTC
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ATTTAGACTATTTTTAGTATGTAGGTCCACTCAAGTTTGGAATGAACCTA
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ATATTTTGAAACAGAGGGAGTAGGATTCTATTTAAACTAACTTGCGTTGT
CTAACTTTCCTAATTATTTAATCCTACAGTAATAACTGGACTGGACTCTT
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TTAGATTGTTGCCATGTGGCACAATCTAAACCCTACACCATATTTCTAGA
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AATCAGAACATTCAGAACATTGTATGTGTCCCTGTGGTGTTCAATTCTTA
ATCTGGTTAATAGTTCGTAATTCATCCTGGACAACACGTCATGCTATGCC
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TATGCACAATGCAGCAAGCTGGTGTTGACTGATTGTGGTGTGGCAGTGGC
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TATAGACTAACTGACAAAGGTTGGTGCATGGAGAACATCTGTGTCTGCGG
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AACATCAGGGAGTAACCGGCGGCTAACTGTGTACATGATTTTGCCATCAA
CCAGTGTGGTAGACACCATTGAGTTATCTGAATTGATTGTTTCCCTTGAC
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ACTCATATTTGTTTTGTAGACTTGTTTGAATTGATCTTTTTTTTAAATCT
TACTCACGCTGTTCCAAAATACAAGATGTTTTGGTAAACCAAATTGGCTT
AACAAAACATCTTATATTTAGGAAGGGAGGGAGTAATAAGTAGACTAAAT
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GAACATTGTCTAAGGAAGTAATCTTTTGAGGTTTTGATAAAAATCTTGTC
TAACAGGTCCAGTAACTAATGTTCTCATAATAACACCAAAAAGAGTAAAT
CTATCACCTCTACAATCATTGCGTAAAGTGTGTGCAGCAAGTGGCGAAGT
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CTGGAAATCTCAGCGCTAACCTTCTAGAGCACCTCTTGGATGCAAATCAG
GTCAGCTGCTCTTGTATTTCCTTACAATTGGTGCTTTAGATGATCACAGC
ACCTCTTGAAAAGAATGTTCACATTGCTTTAGATGTATTTCTTTCTGTTG
TCTTATTTGTTATATTTTGATCCAGCAGCATGGCAGTTCTAGGTTATTTG
ATACTGGGGTGAGCACTCTCAATGGCGAACCAACCGTACAGGGGGCAGAA
TGGAGAAGTAAATATCTTGAATTGCAGGATCTTTTTGTGCATGAGGTTTT
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CCTTGTGATCTCAAAGCAGGTCAGATGTCACCATTTGTAGATTTATGTGC
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ACATATGTATATCTTCTACTGCTGTTATTTGCTGTCCCTGGCAGTTTACT
TTTTGGATCATCGTGCAGGGTGCTTGTGGTGCAACAAATGAGTTGGTATT
CAACTATAAAACTTGGGAAATCCACTGATGCTGAAGATGGATTCTTGTTA
ACAATGAAGATCACCTCTTGATTTGCTGATAGCCTAATTGAAAAGATCAG
TTCTTTGAAACAATGAAGCGATGTGGAGGAGCAATATTAGAAATAGGAAA
AATATTTAAATGGAGCAAGGATTGGTGGTAGATGAGACATCTGAAACTGT
GATTTGGCTTAACTAATTAGAAATGACTTTTTGTTTAGAATAGGCTACTG
TATTAGTGAATGGATTTCCTGACACGTTTATGAAGCACTATATAACAAGT
AAAATGCCCCGTTCAGCATCATTAGTTTTGTTTTCTAGGTTTGGTTGCAG
TGTTGGTCTGATTTGAGACTAGTCACTCTACAAGATGTTTACCACTGAGC
CCGGTGCTATTTAGGCTGGCTGGATGGAACTTTTGGCCTTGGAGGGAATG
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TGGCAACATTTTTCCCTAGTTTGGATCAATTTCGTATAGTTTAGCATAAA
ATTAAACACAACATAGTTTGCCATAGAAGTAAACACAACATAGTTTAGCC
AGATCATGTTCGGCATAGCAGCCATGTGTTGCCTTTGTCTATCCATATGT
GCTCGATTAGATCATTCTACGGTTGTTGATGCACTGTCGGGTTTCGGATC
TCCTAATGCATGGTGACACTGTCGGGTTTTGGGTCTCTTAATGCATGGTG
ATGAAAGTTGTTGATTAGGTCTCAGATCTTCTAATGCACGATGCTAGCAC
CTGGTGAGCAGGCTTTGCAAGAGGCCCTTGTCTGTAGAGTGACTCCTTTT
GTTCGACCAAATCTACTGGATGCTTTCGTTTGTCCTTAATGATTATGTTG
TGCAATGTTATACAATAGTTTATCACTTTTCACATTCGATCTTTCTGACT
GATTATTTGGTTAGTGAGTTTTAGTGATCAGTTTTTAGAAAACGAGTTTT
AAGAGGATTATTAGGAAAATAGGTTTTACTAAGTTTTCTATTAGGAATAT
GTTTACATAAAAACAGTTTGGGTTACCAAAGTCTAAACCACGTTCTGTAC
TCATCCTTGTTTGGAACTTTTTGGACTCTAACAAATCAAGAAATCGATCG
TCTGGCATCTCGGGCACTTCCCGATTGACTCCGGTATCTTGTCGGCGAAC
TGGTTATCTTACAGGTACACCACCTCCAGGTTCATGATGTTCCAATGGTG
CCAAAGACGCCGCCGGTTGGTTTGTCGTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.