Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA001708

[Submit comment/correction]

Sequence	AA001708
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA001708
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CTGTCCCCTTCCCCCTTCCCCGCTCCTTCGCGTAGTTCCCCCGAGGCCAG CCAGCCTCACACTCGGCACCCTCACACACTCCATTGTTGTCTGTACCCAA TAAAACTCCCGTAGTACAATCAAACCCCAGGGATCCGGATCAAATCGATC CCTCGCCGATCCGCGCGATTCTTCTCCCGGATCTCCCCTTAGTTTTTTTC CCGATCGGGGCTAGGGTTAGGGCATCAGGGAGGACGCCGCATTTCAGGCC ACCGCCGGAGTCGACGAGCTAGGTTTTACCCCCGGGGAAGCGAACCGAAG GGGAGGGAGGAGAAATGGAGAAGAAGAAGGTGGCTGTGTCGAAGGTCTGC CACGGCCACTCGCGGCCGGTCGTCGACCTGTTCTACAGCCCCGTCACGCC CGACGGCTACTTCCTCATCAGCGCCAGCAAGGGTAAGCGATCCGCTCCAC TCGGCCGAGCTGGCCACCTCATCTCACTCATCGTTATATTTGGGGTTGCG CCCGTGTGGTTGCGATTCGTTCGGATCCTAAGCTGTGATTGTGATGTGGA CGGCAGCTGTATGATTCCCGAGATAGTGGGATTAGGATGTGACTGCGGTT TTCGAGCGCACTGTTCTGTCCTGAAATTTGCATGAAGGATTGGTCTTGAG TGTTCTATGCGTGAATTCAGTATCTGGTGGGCAGATAGTGGTCGCTTACT TTCTAACTGTTGTCTCATACACCTATAGGGATAGAATCGGTTATATAGGT CATGAAATACTTTGATGTTCTGTGATTTCACAATCTAGTCAAGTTTGTGC TACGTCAGTTATTAGATTTAAAATGATTTTTAGCAATGATTGCTTGCCAT GGTCAGAAGCAAAACCTTTTCCTTAACCTTAATTAAATCCGTCTAAGTTA GGAAGGTGTTCATTTCTTGCCACGTTTTTTTGTGCCAAGCTCCCTTAGCT AAATACTGTTTCACTTATGCTTTGTTTGGCATTGCGGTGGATTATGATAA TCCAACCTTTTTAATTAGCTTTTGGTATTTTACCTTTTGAAAAAGAAATT GTGTGCTTTTGTGGCTAATTTTCCGCAGCAGCACAACACAGTTCAGCAAA CATGGACTAAGCCTTATGCAAGCTAAGTTGTGGTGCTGTTTTTCTCCCCC TCAAACTAGATTAGATTAGGCTGTAAACAAAATCCAGAATACATGTACAC GTAGTTCATCTACCATGGCCTATTTTCCCTTTCGCCTAAATGGTATAAGC ATACCTTTTTAGTCACTCTATAGATGGTCTTAACTCAGAACTGGACATCA ATGTTTTGATTTTTGTTGTGCTGCTTTTGCACCTTCTTTTTTTTTCCTCC ACCATCCTTGCAAGTTCAGAAATTAGCTGTTGTTACAAATCAGGTCGGCT ATCTACTTCATTGATGTTTATAATGTTGAACGGAGTTGTCATGTTGCTGG ATTGCCTGGATATTTGCACGAAGCAGTTGTTTTATGTCTGCTCAATTCTA GGGATGTGAATAGATGATAACTGTGGGATATTGTCAAAAGTATTTTTCAT ACAACTAATATGTGTTCTTAGCTAGGTGTTTCAACAGCATTTCTCAGCCA TTAGATGTTACCCATTTTTATTAGAGTGGTGTTGGAGTGCATATTCTAGA TTTACCTTCATGACATAATTTTTTAACAAGTATTAAAGTTTTACCAATGA ATTATCCCCAGAGATAGACGTCTTAAATTGAACAAGAACTATCATATTTT GATGTACTCTTTGCTCTGAGTATCATAATGCTGAGTTGGCATGATACTAG TCTATCCGGTCACGGTGTTCACGTCTACATTAAAAAAGAAAAATGTTTTG TTTGGTGCGGTGCATTCAGTGATTACAGTTGTTGACGTAACTAACATTTT CAACTTTATTTTGTTTGGTCTATTGCTGCGATCAGTTCTAGTTATTAACA TAAGTAATATATACTAAAGAGATTGTTGGATGCCTGGACCAACTTTTAAT CTAGGCCATTGGATGGGATGAATGAAGGGCCATGACGATAATATTTAGGA CATCTATAAATCAAATAAGGACATAAAAAGGGGTGGATCTGGCAAAGAAC AATGCCCTTTATGTTATTATTATTATTATATATGGCACCATATTGTAGTT ACTCGCTTGGTAAACTTTTATTCGAGAACAGAGTGCTTTTACCAGAGAAG GGTGCAAATACTGGCACATGATAACTGTTACCTAGTAAGCTTAGTATTTA TAGTCCACATTGCATCTAAAACCTTCACTTTAAAATGCATAAAAAATTGT CCATGTCTTGTTATGAATGCTGACTATCACCAAACACTAAGATCTCATAT TCTGGTCTGCAGACTCGAATCCGATGCTTCGTAATGGTGATACAGGAGAT TGGATTGGAACTTTTGAAGGTCATAAAGGTGCTGTTTGGAGCTCTTGTCT AGACACAAATGCGCTCCGTGCTGCCTCCAGTTCTGCAGACTTCTCAGCGT ATGGCATTTGTTCTGCAAAGTTTCATTATTGCCCATTTCCTTTCCTTTTG AGAAATTGAAATATGCCTGGCTAGTGCACTGCTCCATCAGTTGATACTTA CTGGATATCTATGTATGTTCTTGTTCTTGCATTCCTTCAGGAGGCATGCC AAAATTGTGATTATTAGCAGCATATAGTACATTTTTTATTCTTATATTAG TTTATTTTGTCATTGTTATACACATTCTTAATTTACTTAACAATTATATG TTGTCATTATATCCTTATATTAGTTTTATTTGTACCCCTTTATTAGTACA TAACTCAGCCAGCCTTAAAAATGTTGGAACAGAGCAAAATTGCATTTGAT ATTTCTTCTGCTTGTGATTTAAATCAAGATTCACGAACGGGTTCAAATCA ATATATTGGTGCACCATGGGGTATTGGACCCATTGTGTTATTAACTTAGT TACATAACTTTCAGCTGTGGAGTTCTGCATAGTGGACCAATCTGATTTCC CTATGCTGGGACATCCACTTCACTGCACATGATTGGATTGTTTTGTTGGT TCCCTCCACTGATGGTTGCTCACCTGATGAACCATAACCTAATGCACTGA GGATTGAATATAAAAATCAGGCATAATAACAAGGCAACTATGGTGTATTC GTCTGCATAATTTTAATACACTATCACTCTATTTCTATAGATGTATGTCT GCCGATACTGTGTGCAAAGAAATAGCAAACATAATGTTAATGCTCAGAAA TGTTTAATTCTGAGTATAGTTTACGCTTTTGACAAACAGTTGACTCTTTT TTGCAGCAAAATATGGGATGCACTAACAGGAAATGAGCTACATTCGTTTG AGCACAAGCATATAGTCCGTGCATGTGCCTTTTCCGAGGTAATGCTCGTT GAAAGCTTGATTGCCCTTCTCTTCTGACATCTATATGCCAGAAGATTCAA CAAGTATAGTAGCCATGTCGCTCATTACATCCATCAGTGCATCTCACTGA ATAATGTAAAATTACTTAAATCATGTCTATGAAGCTTTATAATTTGCGTG CCTGTTTTCTTATCACTCTGTATGCTATAGTAGTCAGTTAGGACTGTCCT CCATGAGCAATTCTAAACCTAATCAAATCGGTGATGCAACTGCAGGATAC ACACATGTTGCTCACTGGAGGCATGGAAAAGATTTTGCGTGTATATGATA TGAATCGCCCAGATGCAGCTCCAAGAGAGCTTGACAAAGCACCTGGTTCT GTGCGAACTGTTGCTTGGCTTCATAGTGACCAATCTATTCTAAGTTCCTG CACTGATATAGGTGGAGTGAGGTTTGTCTCGAAATATCTTCAAAATTTGA AGCTATAATGGAAAACACCTGCCGCAAGTGGCCAATCTATTCTAAGTTCC TCTACTGATTAATTACTACTGATCTGCACAGATTGTGGGATGTGAGAAGT GGAAAAATCGTCCAAACTCTTGAAACCAAGGCACCTGTCACCAGTGCAGA AGTAAGCCAGGACGGCAGGTTCATTACTACAGCCGATGGTTCAAGTGTTA AATTTTGGGATGCGAATCAGTAAGTTAAATTCTTTCCTGTACGACCATTG TTGTGCATCATGCGCTGATCAGTTCTTTAACACTTTTCTGGTAATTCGGC AGTTTTGGGCTTGTTAAAAGCTATGATATGTCATGCACTGTGGAGTCAGC TTCACTTGAACCAAAGTCTGGGAGTAAGTTCATTACCGGAGGGGAAGATA TGTGGGTTCATGTATATGATTTCTTCACTGGTGAAGAAATAGGTAAGTGT GTCATCATATTAAATCAAGTGACTACTGACTACTGCAAGACTGAAACTTC GGTGCAGTTATTCATTCCCAGAATGGAGCATTAGAATAATATGTTCATAT AGCTTTAACTATTGTGAGTTCTAGAGCATTTTGGTTTACCCAGGGAACCA GTCAGAAAAAATTAATTTGAAATTTACAGAGACTAACACCTGTGGATTAC TATAAATCATGGAAAAAAATAGCGTGCTATTTCGGCGCAAATAGCGTGCT ATAGCATATCTGGAGAGGTCATGCTAAATTTTAGCAATTTTGCTCGCCAT GGCGCTATTCGCGAAATAGCATGCTATATCGTGCTATTTTTTTTCTAGCC TGTTGAAATGTGATGTTATGCTTCTAGACGTTAATGCTATGTTGTTACCT CGTGGGATGTTGACGGCTTCTATAAGATTGGAAAACTATTTTTGTATGTA TGTATTGTTCTAACATTTTTTGGAATATATCTTTTATTCTTGCTGAAATC TTTTATTTTTAGCCTATATCTTGTATTATTTTTAAAACGCTACTTTGAAA TATAGCACATTATAACATGTATAGCATTTGGAGGAGGCCGTCGCTATTTC TTTCAGCGCGCTATTTTTTCATTGCTATAAATATAAACAAGCTTCTAGCC CAAGGGTAGGTATGTGATAGTGGTACAGGGTTCAAATCCCATTTTTGCAG TCATTTTTTCCTATTTGCACCTATGACATGTGGGTCGTGATGCTGCAATA CAAAATTAGTTGGTAAATACAAAACTGAATTGTAGCCATGTGATTCTACC CATGGTGAATGAGATGGCCTGAACCTCAACAAAGTAATATCTCCTCACTG ACTCCAGAATTGTGCTCTATTGCAATTATGTGTCCACTTTTTGGCTGGAG CTTTCTTTATCCTTTTTGAAAATTAATTCAAATAAAAATTTCATGTGAAC GTTTTTCTGAAAATTTTGTTAACTAGAAATCCCACTGTGTTCACTTTATT TAGGTTTCAATTCCTGATTCTGTTGACATTATTTCACAACCAACCTTGAA AAAAAACATTATTTCACAACTGGTTATTATTCTCTAGCGCAATTTATAAT GTGAAGCTGAAACCTAGTGTTCAAGTCAAAGCTTGATTCGTCCCAACCTT GTCTTGAGTATTTGTGTAGTCTACTGCTTGCTAATCTAAAGTTACTATTT TGCTATTGCTGGAATATGGTCATCATGATGACCATGAGCTCCTGTGAGCT ACTGATGTGAACAAACAACTATGTCTATGCTTCATAATCCCACATTCCAT ATCGAAATAAGTACTTTCTTTTTCATTACCTTATGCCGGATTTTTATTTG CAGCCTGCAACAAAGGCCATCATGGTCCAGTCCACTGTGTCCGGTTTGCG CCTGTTGGAGAATCATATGCATCAGGATCAGAAGATGGCACCATCCGGAT CTGGCCGCTGAACCCAGCTAATACTGATGACACTGAGGCGCCCAATGCAA ATGGTAAACCAAAGGCCGCGGCGGTAAATGATGTTGCGCGTAAAATCGAA GGCTTCCACATTTCCAAGGAGGGGCAGACCGAGGCGTAAGATTACATCGC CACCAAACCTGGCAGTGGTCAGCGCTTATTGGGAGATTGCGTCACTCCCG TCAGATCCCTGGTCTCTCGGTGTCACCCTCGACTCCATCATGTTGAAGCT TCTTTGTCGACCAAGGGTGGTTGTATCTGTCACTCCGGGGGGAAAACTTG TCCGCCGTGAGCGAGCACGGTGGTGGACTTCTTTATGGGGCCCTCTTAAG TAGACTATATTCTACGGTAGCTTCTAAAGAGCCAGAATAAACCAAGGGGA AAGGCAGTCAGCTAGCTGTTAGTGTCGTGATGCATTAGCAGAAAGTTAAG TTTATGTATGGCAATAGCAGTCCTTATGCAGATGTCAGTTGTGT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.