Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA019879

[Submit comment/correction]

Sequence
AA019879
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA019879
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GCCATAACCATTCGGAAAACAAAAAACAAAAGAAAACCCTGGCCCTATAT
CCCCGCGCCGCCGCCGTTCCCATCTACAGTAGTCTCGAACCATGTCAGGC
GGCAGCAAGATAACCGGCGATGGCAAGATAACCGACGAAGGCGAGAAAAC
AATCGAGCACTTGGCCAAGGAGAAGATCAACGCCGTCCTGTCCCGTAAAG
ACATTACGGGTGAGGAAATGAACAGGCGCTTACAGGAGGTGCGTTTCAAT
TGCTTTTCTTGTCTACTCTTGTGTCTCGTTCAGATCTTATTAGTTTGTCG
ACTGAGCATCTGCTCTACATATTCTCCGGTGTGCACTGTCTAGATCTTTC
ACCTATGGTCGTGTTGACGAGAAATCGATCTATTATGTGCACGCTTCTGT
TTTCCATCCTCGGGTTGCGCTTATAATTGGAGAAGCTTCAAGACATGGTT
CGTTAACACATATTTACTGTTCAGGAACTGGACGCTTGCACACCTCCTTC
TCCAGAATTCGACAAGTTTGTGCCGGGGGACGACGAGGAGGAGGACATGG
ACGAGGACGAGGAGGAGGACATGGACGAGGAAGAAGAGGAATACGAGGAC
AGCGATGAGGACGACGAAATGGATGAGGAGGTAACAAACTCCACTCAATC
CATATATTCAAGATGAACAAGCTCAGCTTTGCAGTGTTAGACCAGTATCT
GTATATCTAATCTGTACCGTCTACTTAATAGCAACTGGCCCGCGAGATCA
AAGAAGCCAAGAAAGGCATCCAAAGGTGGTTTACCAAGGAAGATCCTTTG
CTCTACTTACGCTACGTGTTCAAGCACTTGGACCAGGAGAGGATCAAGGC
CATGTGTACCCGTAAAGGTATTACGCGTGAGGAAGAGAACAAGATCTTTG
AGGAGGTGCGTTCAGTTGCTTGTTTTGTCTACTCTTTTCTCTCGTTCATT
CATTCGTCGATTGAGCGATCTGCTATATATATATACGGTTTTGCTAATTC
TCAGGCGCCTGAGAATTAGTTAAGTCTCAGTCACCTAATACACCGATGGA
TTATTTACTTTACGATTAGTGCAAAATCAACAGCAGGTCGCGCTTACAGT
TGTTTCCGCGTTGTGTCTCTGCGCTCGCGCGTGTATGGTTTCTGTTTTTT
TTTTTACTTTGTTCTCTGTTTCCGGTGGGCTGTTTTCCTGTGGGCTATCA
CCAATCGGTGATTTTGTTTTTTTCCTGTATTCTTTTGTTTCTTTTTTGTT
GTTGTTTCTTTTTTGTAGGTAGTTTTTTATGTGAAATTAAGATTAGCTTA
AGTGTTTGAGCTCGTTGTTCAATCGAGTTTCATTTGAATTTTAATTTTCG
ATTTTTTGCTGGTTCTATTTTCTTTTTTTATTGTTTTTCGTCTCTAGATT
TTATAATTGTCATTGTTTTAATGCTAGGAAGACATTTAGACTGTAATTTT
TACTAGAGTGGTCTAACTTATATTAGTAACATGTACCCCCTCTCTTTCAT
AATATAAGATGCTTTTAGCTTTTTAAATTTGTAGATTCAAAGTGAACCCA
CACACACTAAAAGGGGTCTGAACACACCTCTTTTAGAAGCAAATTGCCAC
TTCATTGTAACTAGCATTTTTTCTAAACTTTTGTTAGGCTTTTTTCTACC
TCGTCGAGCCATCTACATCTTGGTGTGTTACTTTTTTAATCCAGATGCAA
TATTTGTTGAAATAGAGTTGTATGTGAGCCCCCAGCGAGGGCCATATACA
ACTAGGCCCCCGCCGAGGTTAGTTACAACTTGCTTGTAACTAAGCTCCAC
AGGAGGCAGTTGCTTGTAACCGGCGAGAGGGGCCAGTCGCAACTTGATTG
CAACTAGGGAACCAGTTGGCGGGCCAGTTTGCAATTTGTTTGTAATTGAG
CACCCGTTGGGGGCATTTTGCAACTTTCTTGTAATTGAGCCCCCGCCGAG
GGCTAGTTGCAACTTGATTGCAACCGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGCGT
CGGTGGGCTAGTTTGCAATTTGCTTGTAACTGAGCTCCGCTGGGGGCTAG
TTGCAACTTGCTTGTAATTGAAGCTCTGTCGGGGGGAATTTGCAACTTGC
TTGTAATTGTGCCTCCTGCCGAGAGGGAAATTGCAACTTGATTGCAACCG
GGGGACCCCCATCGGTTTTGCAACTTGATTGTAACTGAGCTCCGCCGGGG
GCTAGTTGCAACTTGCTTTTATATGAGCTCCTCTAGGGGGCCAATTTGCA
ACTTGATTGCAACTTGGGGGCATCGGTTGCAAATTGCTTGTAACTGAGCT
CCGATAGGTCCTAGTTGCTCCTCCGGGTCTCAATTGCAACTTGCTTGTAG
TTGAGCTTCGTTAGGGGTCAGTTGCAACTTAATTGCAACTAGGGAGGACC
CATCGGTTGCAACTTGCTTGTAACTGAGCTCTGCTGGATTTGTAACTGAG
CTCTGTCGGGTTTGCAACTTTCTTATAACTGAGATCTTGTTGGTGGGGGG
CATTTTTTTGCAACTTTCTTGTAATTGAGCCCCCGCTGAGCGTCTGTTGC
AACTTGAGTGCAAATGAGCACCCGTCGGGAGGGGGGCCCTCCGAGAGCCA
GTTTCAACTTGATTGCAACTGGGGGGACCCATCGATTTTGCAACTTGATT
GTAATTAAGCTCCGCTGGGGGCCAGTTGCAACTTGCTTGTAACTAAGCCC
CGATGGGGCCAGTTACAACTTGATTATACTGGGGCCCCGCCGAGATCCAG
TTTCAACTTGATTGCAATCGGGGAGACCCCATCGATTTTGCAACTTGATT
GTAATTGAGCTCCGTTGGGGGCAGTTGCAACTTGCTTGTAACTGGGGCCC
TGCTGAGAGTCAGTTTCAACTTGATTGCAACCGGGGGTACCCCATCGATT
TTGCAACTTGATTGTAACCGAGCTCTGTTGGGGGGCCAATTGCAACTTGC
TTGTAACTGAGCCACGCCAGGGGCCAGTTGCAACTTAATTGTAACTGGGG
GCCCGCCGGGAGCCAGTTTCAACTTGATTGCAACCAGGGGGACCCCATCG
TTTTTTTGCAACTTGATTGTAATTGAGCTCTGCTGGGGCCAGTTGCAATT
TGCTTGTAACCGGGGTCCCGCCGAGAGCCAGTTTTAACATGATTGTAACT
GGGGCGCTGCCGAGAGTCAGTTTCAAGTTGATTGCAACCGGGGGACCCAT
TGATTTTTTTCACTTGATTGTAACTGAGCTCCGCTGGGGCCAGTTGCAAC
TTGCTTGTAACTAAGCCCCGCTGGAGGAGCCAGTTTCAACTTGATTGTAA
CTGGAGCCCCGCCGAGAACCAGTTTCAACTTGATTGCAACATTGTGTTGA
TGATGCCTCTCTCTTTGTGGGTGTTTCTTCCTACGGGGCACTGTAAGGAG
AGAGGGGAGATTGAGATAGAGACAATACAGAGAGGAGGGAAACACAAGGG
AGAGGGCGAGGAAGAGAGCGGGATGTGCGTTGTAGCGCGAACGCAACGGT
GGCAACCGCGACGGCCGCGGCCGCGGCAGAGCACTGCACACAGGACCATC
ACGCGCCGCTGAGCAGCCCCCGCTCTCCAGGTAAGCACCTTGTCGAAATC
CCCACCCATCTCAAAGCCCCCAACGTAGCGATGTTTCGACCTTCTTCAGT
CTTAGATTTTCTAGGATTTTGGTCTGCATCATGCTGACCGATTGGATTCG
TTGTTCTTCGGCGAAGCACAGTGTTTCAAAATTCCAAATCGAGCAGGTCA
AAGTACCTTCCGAGCACACCAAATTTCATGTCAATAGGGACATGTAATTC
GCATATTGTGGTTAAACACGAATCAGTCATTCTATTATTTGGATTTTCAT
GAGGCAAGGACTTATTACTTGCATATCTGGTCTGTTCTCTGTCCTGCTGT
TTTTTGTACAGCGAAAATTGATATGAAATTCACCGATTCCATATGTACAA
TAAAAGTTTTAACACAAAAATAAAGGGTGCCAGGTTTGCAACTTGCTTGT
AATTGAGCCCCATTGAGGGCCAGTTGCAACTTGATTGCAACCGGGGGACT
CCATTGGCGGGCCAGTTGCAACTTGCTTGTAACCGAGTCTCTGACAAGGG
CCCATTTGCAACTTGCTTGTAAGTGAGCTCCACCAACCCGTAGAGGGATA
GTTGTCTGAGCCCTTGGCGAGGGGGAGGGGGCAGTTGCAACTTGCATGTA
ATTCGGACCCCGCCGGGGGGCGGGGGGGGGGGGACATGTTTGGAACTTGC
TTGTAATTGAGTCCCCGTCGAAGGCCAGTTGCAACTTGATTGCAACCAGG
GGGCCCAATCGGCGGGCCAGTTGCAACTTGTTTGTAATTGAGTCTCCGAC
AAGGGCCCAGTTGCAACTTGCTTGTAACTGAGCTCCGCCGAGGGAGCCCC
TTCGAGGACCAGTTGTTTGAGCCTCCGGCGAGGGGGACGGGCAGTTGCAA
CTTGATTGTAATTGAGCCCCCGTGCGAGGGGGGCAGTTGCAACCTGCATG
TAATTGGGGCCTGCTGGGGGGCCAGGTTTTCAACTTGATTGCAACCGGGG
ACTCCATCGGCGGACTAGTTACAACTTGCATGTAACTAAGGTCCGACAAG
GGCCTAGTTGGTACTTTCTTGTAACTTTGCTCCACCGGGGGGAGCCTTGT
TGAGGGCAAATTGTCTGTTCCCCCGACAAGGGGTGCCAGTTGCAACTTGA
TTGTAATTGGGGCCCCGCCGGGGGGCAGGTTTGCAGCTTGTTTCTAATTG
AGCCCCCGTCGAGGGCCAATTGCAACTTGATTGCAACTGGGGGACCCCAT
AGGCGGGCCAACTGCAACTTTCTTGTAACTGAGCTCCGTCGGGGGGAGCC
CCATTGAGGGTCGATTGTCTGATCCCCCGGCGAGGGGGGTGCCAGTTGCA
ACTTGCTTGTAATTGAGCCTCCGTCGAGGGGGATGGGACAGTTGCAACTC
GATTGCAAATAAGCTTCGTCGGGGGGCTAGTCGCAACTTGATTGTATCCA
GTGATCTTCGTTGGCGGGCCAGTTTTGCAACTTCCATGTAACTGTGGCCC
CACCGAGGGCCACCGGGGGGACTGTTATATTTTTTTCATGATTTGTACTA
CATGTGTGTTTCAACCGTGATTTGCTTAGTTGCATGTGAGTTGTTAGTTG
CATGTGATTTGTAACCGAGATTTTTCATTTGCACATGGGTTAGAACCCAG
GTACTTCAGTTACACGCAAGATGCAACTCAAGTTTTTTTTTCAGTTACAC
CTAAATTGTAACTATTATATTTCTCATTTTGTATGTGGGTTGTAACTACT
CCCTCCGACCTATATTAGTTGACTTGAATTTGTCTAGATTTGGATGAATC
TAGACACTATTAGTATATATGTTTATCCCAAATTTTGACAAATCCAAGTC
AACTAGTATGAACTGGAGGGAGTACAAAAACTTTGAACCGTTAAATTTTC
GGCATGATTTCTTGCCGGTTGTCAGTTGAACATGTAAATGGTTAAAAAAA
CTTGTCATTGTATGCTGTCCTCCAACCGTATCAAATACAATACAAAGGGC
CAAGGACTAGAAGGACCCAAAAAACAAACAATGATGCCAGATGGCCCGAT
GTGAGACTACCTGGCTTAGCTCCCACGTTAAAGCCCATGTCACATTGACT
AAAATGGAATTAACAGCGCTATGTATCGATCGGAAGCCATGGGTGATCGT
CAACAATGATAACGCCACGCGACTGAGATATAACTAAATCTCAGTCGCCT
GATACCTAGATGCGCCCATATATATATACATATTCTCCCATCTGCGCTAT
CTACATGCACTCTTTTCTTTTACATCCTCAAGCTGTACTGCTTATAATTA
GAGAAACTTCAAGACATGCTACCCTAACATTTACTTATATTCAGGAAGTG
AACAGATGCACACCTCCTTATCCAGAGTTTGACTGTTAGATCAGAAACTT
TAGGCCTGCCACAAGATTGATACAAGCAGCAACTAGGACGCCTGATCAAC
ATAATAAGGAGTAGTAGATTAGTGCTTTACGGGGGTGCCGGAGTCGAGGA
AGACGCCATTGCTACTAGATTGATGCAGGCTTGTGCTGTAGTCGAGGAAG
ATGATGCGGGTAAGGTACGGATACCCTCCGGCCTCCGCACTCTAGGCTGG
TCTTCCCGTCGCTGCTGCACCTCCCTAGATCGGTAGGGTTTGGGGGATAT
AGGAGAGTAGGGAAAACAGATCGTGACTCGCGTACCAGATCGCTGCCAGA
CCCCCTTCTTTATATAGCGCAGGCGACATGGGACCAAACCATCGAGTTGG
TTTTGGTGCCCCCGATCAGGACACGTTAGATACATACGAGGTGCTAAAAA
CGTTGGCTTTTGTGGGGCCCTCTTTGACTTAACATTAGTTTATCCTTATT
CTTTTATTTGACTCTGTCTTTTGCCTATTAAACGTGACAGATCAACACCA
ACATTGACAAGTTTTTGACCACGAAAAATCAGAAGGAGAACATGGACAGC
GAGGAGGACAAGGGCATGGATGATGTCGAAGAGGATGGAGAGATGAGGAA
AGCGGTAACAAACTTCATTCAATCCATATAGTATTCAAGATCTATGTTAG
GTTGGCTGAATTCAGCTTTGCGGTCTTAGATTAGTACCTTTATCTTATCC
GTACATTATTTACGTTATTATTCAGGTGCAGCTGGGTGATGAGGAGAAAC
CTGGTATCATGAAACGGCCACAGTCATCCCTTCTTGAAAGCGAATAATCG
GAACTCAAGAAGCCAAGGGTAGCAGAAGGTTTAGGCTGCCAGCGAGAAGA
ACCTGAGGCTGCAGAGATGTAGAATTCCTCTTGGTTTACTCACTTATCTT
TGAACCTCTACATCAGTTTTCGGAATACACAAAAAACC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.