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GrainGenes Sequence Report: AA044946

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Sequence
AA044946
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA044946
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTCGTCTCAAGTCTCAACGCGTCGAGTAGAACACGCCACTGTTGTGTTTC
TTTTCCGTTTCCGGCTTGATTCTCGCTTCACACACCCCAGAGTCCCAGCC
CCAGGCCCAACCCAACGCGCCATTGCCCCCCAACTCCCGTCCCCAACCAA
AACCCTCGTTTCATCCCCACCCTCTCGATTTCCCCAATCTCCTCCGCGTG
CCGGCGGCCGGGGAGCGCTCGATTCCGTCCGTAGCTGGGTACGCATTCTT
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ATTCATCGCGGTGTAGTTTTAATAATTTTTCGCTCGACTGCGGCGCGATA
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AGCTGGGTACGCATTCTTTTCTCGACCACAAATGCCCCTTGTTTTCCTTC
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TGGGTACTGTTTTCCCCCAGCTGCATGTGAGTTGGACGGTTGCGCCTTTT
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GGGTCGGAGGAAGTACTTAAATTGATTTCTCTAGGCAAATAATTGTACAA
GATGCCATCAGAATTTCACCTAGATTGTTGGTCCACAAAACCACAACATG
TAAATGGAAGTATTAGACATATTTTCACTAACTACTATGCCTGAAATGTG
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CTGTTTCATGGTCTTTAGCCAGCGAAAATTGAGCTATTTTTGTAGTTGTA
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TGTGTATTATGTTGTTTTGTATCATTTCGTTACTAATGATTCAATCGTGG
GTGTTCAAATGCATGACCTTGAAATGTCTCTCCTGATTGTTGTTAGGTCT
GCTTGCATCTATGACCCAGTTAACTGGTGCTTGGATATGAAGTGATCTTA
ACCAATTGCGCAGAAAACAACTGACTTAACTAAGGCGCAATTTCCATCTT
TGCAAGGAAAGTTCTGAGGAGTTTTTCTGTTAATGCAAACAACATAAAAT
TTTCACCTCAGTTAGATAGTCACCCAACTAAATTGAGATATTATGGATTA
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GAGATCAGAGAGGTGTATGAGCCACCTAGACTACAAAGCCTTGTCCAGAA
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CTTCACCACAAAGATCTTCTCATAAAGGAGAGAGTGCAGGTACTGTGGTT
TTGCAACAACAATCTATGTATGGAGCGATCCACAAAGACATGTCTGCAAG
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CAAGGCCATCAACTTCACCTGAAAGAGGTTCCCATCAAGGAAGGATCCCA
TGTATTATTTTTGTGCAAGAGTCTAAGTGTAGTGCAATCCAAGAGGACAT
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GCTGTGCAACAATCTAAGTATACTGCATCTGAGGATCGACATGTTAATGT
GAGACAGTCAACTTCACATAGAACATGTGTGAATCACCATCAAAGTTATT
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ACATATTTCATAAACATATGAAATCTCAGATGTTAAAATTTGTGAAACTA
CAAGTAAGTGACAGAAATAAGGAGAATAGAATAAAAGAGCGCTGGATATT
TGAGGCCAAAGCTGGCTACCTCAAGAAGTTGTTTTATGCGACTTCACTGT
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TCGGAGGGTGGAGAGCCTCTCAAATATTTTGACATGCAATCTCTAACCAC
TCAAATTGAAGTGATTGCCTCTAATAAAGAACCTGAAGGCATCTTTGCCA
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GGGGGAAACATAGAAAGACCTTATGCTTACCAACTGGACACGAGTGCAGC
ACGAGAACCTGCTAATGCAGTGACAACAGCAAAGTCAAGTGATGTTTCTG
AGCCTATGCAAGAACACTCATCATTGCAACTCGTAACAAATGGAGCTACA
CAGCCTGGGTTTTCAGTTGGTGTATCTGAGGAAAGGGCTACCTTAGAATG
CAGTTCTCAGTTAACCTGTGCGCCTGGAATGGAGTTTGGTGAAAAAGATG
GTATGCAAATTGCCTTCTCAGTAGCAGAACAAAACGACGGCGCAAATATG
GAGAGTCCCTGTGCTTCTCGGTTTGTCACGAGTTCAACATCAGAGCTTGA
TATTGCAGTGACCAATGATACAGATAATGCTGCCTGGATTTCTAGAGAAA
AACGAAGGCGCATAAGTTCAGGCAATGATATGTCAGAAATTCCATGTTGT
ATGTCAGGGAGAAAGTTTGGCGAAAAAGATGGGACAGAAGAAATCGCCTT
ATCAACAACAGCACAAAATGAGGAGAGAGACATGGAGAGATCATGTGCTT
CTCACTCTGACAAGGATGCATCACTAGAACCTGCTATGACAGGGAACACT
GATTCGGAAAATACTCTGCCTGGTTCTAATGAAAAGCAAATGCGCATAAG
TTCAGGCAATAATATTTCAGAAGGTCCATGTTCTGGTTCACAGGTAAAGT
ACCCATACAAGCCTACCTCAAACCTTTGCAGAACAACATTGCATCAAGAC
GTATTTTAGCTCATATTTTTTGTTCTATTGAAGTATTATCTTAACCATTG
AGTCTTATGGTGGATTTGGTTTGCTGAAAATTGAAAATAGAAAAAGCTTA
TGTTAATGATAAGTTAAGTAGACATTAGCATGCTGAAAATAGAAAAAGCT
TATGTTAATGATAAGTTAAGTAGACATTAGCATGCTGAAAATAGAAAAAG
CTTATGTTAATGATAAGTTAAGTAGACATTAGCAAGAACAAACAAATTAG
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TGGAGCATTCATCTGTTTAGTTTATAAGTAATTCAATCACGATTGAATGG
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TTCTCGCGGTCATTACTAGTGGCAGCTCATAATGTGACATCCCTGGCAAT
ATTGCTCTGCAGGAACCTTCAGCTGCAAGGGCACCTCCACCTTTAGTTAA
TAACAGTCAAATGATTCAAGCTGAGGATACAGGTGGCGAGGAAGTACCTA
GTGGTCAAATATCTTCCTTTGCCCAAGTTACTGACCAGCCAAACGTACAC
TCTAATACCCAACGTGTGGTGAACATGAATCATTGCGGTTCGATTTCCCA
GGTTGCTAGTCATCCATATCAAGCACCTGGTGGGAATACTCATTCAGCAA
GAACTGAGGTTGGCAGTCTTGGTGCATCACATGCTCCAGCATCAGACAGT
CAGCTGCCAACAGGCTCCACTCCTGGGCAAATTCTGGCTGAAGATGGGCC
TAACTCAAATCTATTTACAATTGAGTTGAATCGATTACAAAAGTTGCATG
GACTGATAGCAAAGAGACATGAAGAGAAGGTCACTTTCTTGAATTGCTCT
TCTATTTCTGTATCTGTCTTATTTCAGTTCCTCCCTAGTTAGGTGTTGCT
CATCAGTCTCTGCTTGTGTTTTGCCAGAGAGAACAGCTTATTTTGGCATG
TCAAGTAGAGATGGCCCAAGCTAAAAGGAAGTATGATTCGCTGGTGTACA
ATTCAGAGGTGGAAGTATTAGAGCGAAGGAGAGAACTGAAGATAACATGT
GATAAAATTTACAAACAGCAGATACTAGCTGAGGTATTAGAGGTTATATA
TAAGGCCTCTGCTAAAGTTGTTCCAGACAGTTCGAGAGGTAAATTCTTTT
CATACATCCTAACTCTGCTTTATTAAGATACAGTTACTACCTTGACATTG
ATATACTATTTTTCTGTTATTTTTGTATCTATTACTATCATGGTACAATG
TTATCAATAAATAACATTTGAAGGGATTCCAATCTGCTTTGCTTAGAGTC
AACTACTAGGGAACTTGAAATCAGTCTTATACTTGGGAAGTTTATTGGTT
CAAATTAATTTTGGGTCCATATAAAATTCAGCCATTCTTGACATCTTGTA
ATTTGGTATTTTATGCACAGCTACCCATTCTATAAGGCCTTAATATGAGG
TTTTTCTTTGTGTGACTGTGATAAGAAGTTATAACAAGTTTGTTAGCAGC
AAAGGATTCCTTGAAAATATGCACATTTTCTTCATGGCATCGTGTGTCTT
GGTGAACCATTTAACATGCCATCTTGATATGGCAAATGTAAAACATGTTC
ATCATAGTCCATGGCATAAAGCTCCGCGTCACACTCCCACATAAAATAAA
GGCGCTTTGGGCATCATAGTGACTTCTGAAAGCATTTTTAGTATTACTCA
TCCACTCTTTTAGATATATTTACTCGGCCTGTTGGAGCTATAAACGAACA
TGGTTTTGAGATGCTCCAAAATCATTCTGGACCGCCGATTCCTTTTGATC
TGAATGCTCAGATCAAATATGGTGGCCTATTGCCCTCTAGGAGGTAGTAG
GTCAATCATGCCAATTAAAAAGGAAAAAATCGTCTTTGTTATTTAGATAT
TTAACAAATAGGGAAACCATACATTCGGAAAGTAATATTGCTATCTATTT
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GGACCGTTGTGTCCCCACAAACATTTGTCCTGAGTATGTGAAGAAAATAA
ATAATCTTGTATTGCATGACAACACATGATTACTTACATGCCATATATAT
CAATCATATCACCCAAATATAACTTGCATGCAGCAGCAGCTTAGATCTTG
ACATGGATGAGAAAATTTTCTTTCCAAGTGTGGCAACGCATGATATGTAG
AAGAAACCGACATAAGCCAATTAATCTGCGTATGATATGTAGAAGAAACA
GACATAAGCCAATTAATCTGCATATGTCGTCTTCAGTCTGTTTAGATATT
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ATCCGTCTCTTCTGCTAAATACCATCTCTTCACACAAGCCAGCATAGAGG
TCATTACATCTCATACTCATCACCCCAGTAGACACACATAATCTTTTTAA
AGTGGGGTGTACCATATTAAATACTTGGCCTATATAATACACAACCCATT
GGGATGTAAGTATCTATAAGTGACATGGCAAGCTTAAAAACGAGTACTAA
GACACGACTACTGGGACTGGCTCATAAGTAAGTATTTTGGCATTTAGCTG
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TATGATTTGGTTTGTTCATCCTCCTTCCAAACCGCATCATGCTTTTTTTT
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CGCCTCCCTCAGACAGCATCGTGTGACTGCACAGCACACTTATATGGACT
CTTCGGGTACCAACTTGATGAATTATCCAAGTGGTGGCATGGGACTTGCA
TACCGTAGGCAAGCATAAACTGGAAGCGTGTGGTGATCGCTCGCAGCGCC
TGATCGCTCATCTCCATTCGTTTGTAAACTCGCTGCCAGCATCTGTTGGT
GGTTAGGCTACGAGCTTGGAGAAATAGCTGCAGCAGCCGGTGCTCTTGGA
AGAATCATACTGCCTGTGACTGAGCCTATCATTGGAATTCAGTTGTATGT
ATGTTTACTATTTAGAAGTCAGGGCTTCCTTCTGAGTCTTGCTTAGTTGA
GAAGTAGGCCTGCACTTGTTCAGCTAGTATACTGATCTCTAGCTGGTGGC
AGATTCATGTATGTTCATGTTAAATTCTGCATTCGGAGAAGCGCCTGGCC
TCTGCACCTGCTTTATCTTATGGTTTCACCGCACAGTCCTCACCGTAAAT
TTCCTGCTGGACATTCTTCTTCCACTTCGTTTCATCTTCATGGAGGAAAC
CTGCTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.