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GrainGenes Sequence Report: AA013321

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Sequence
AA013321
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA013321
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GGAAGATCGACGCAGCACACCGGATGACCCAAACCAGGTTCCGCCTATCC
CTCGCTCACTATATGTAGATTCATTCCCTGGCCGTGTGGGCGCTGCTGCT
GCTGCTGCTGCTTCGCTCCTCTTCTTCATCTTGCACTTCCAGCCTGTGAT
CGAACGAATCGTGGTGTGATGGCCAGCGCGGGCGCCAACAACATGCCTGC
TGGTCGCGGCGCCGGCGCCGGCGCTGACGGGGCAGACCACGCGGCTGCGT
CCGTCGGCTTCGAGCAGAGCGGTGCTGCCGTCGCCATCAACGTCGGGGCG
TCAATGCTACCCAATCAGCCTGGGGCGGCGGCCGCGTGGCCGGTGGCGTT
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AGCGCGTGCAGTACAGCTACTTCCGTCTTCACAGAGTTTCTATTGGCAGA
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GCTCTTATTGGTATGCGAGCGATTTGAGCTTGGGGAGGCCATCTTGGAAA
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CACCTGAGAGTTGCGCTTAGGCTCGAGGAGTGTACATGAGTAGGAGTAGG
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GTGTGTGGTCCTAGTGTTCGCACTAGTGATCCCTTTCTTGTATATTTTGT
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AATAACCCTCAGCTTTAGGTTATTCTCGGGTTGACCGGTCGTCTACCTCC
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GGATGGCCGGCCGGTCGGGACTTCGCTGGAGATGAGGACACCTCCGGCGG
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TCACGTGCTTGCGGCACGAGCGTGAGGTGTTGCGGAGCGGTGTTTAGCAC
GACCCAGAGAATCCTGGATGAGGTTGCCTTTAGGGCATCTCCACCATCCT
CGCCGAGGAGCTCGCCATCGCCGCGGAGCAATACCTTGCCCACCGCGACG
AGGAGCGGGCTTGGCGTGCGGCGCTCTCCCGTAGCTTCGCGCGCGTGGAC
GCACTGGCGCTGGCGGCGTGTGCGTGCGGCCGCGTGGGGGTGGTGCACGT
GCCTGTTGTCGTCTCGGCCGAGGAGCCCCATCGTTGGGTCCACGGCCGTG
GTGGCACTGCTGGTCTGCGACCGCATCATCATCGCCAACTGCGGCGACTC
CCGCGTCGTGCTGTCCCGCTCTCCATGGACCACAAGGTACAGACAACTTG
CGATGGTCAACTAGCGTTAACTGTATGTTCACTTGTTCTGCTGTTGAACG
TTAGCCACCGAAGTGTAGCTAGCGCGTACAGCTACTTCGATCTTCAAGAG
TTTCTAAAGGCAGAACGGTCTGGAACGACTGGATAGCACAAATGTTGAAG
CTGACCGTGTGCAGTGGTGTTGTCCCTGTAAATAACTCTCAACTTTAGGT
TCTTCTCAGGTTGACCGGCTGTCTGACTGCTATCGCCGGTGTGACGCAAC
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GGCGCGATGGCGGAGGTGAGGCGAGGACCTTGCTGGAGACGAGAATGACG
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GGGGTGTGTAGGTAGTCGCCGGACTTAGGGTTAGGGTTGGGGGTGTCGCA
GACGACTAGACTTATGGCTGGGGGTGCAGGTCGGGAGGGGGTAGAGGGTT
GGCCGGCCGATCTGGTGGACTGGCGCCACCTATGCTCTCTTTTTCTGAAC
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CTACCTTTGCAAAAAGGACCCTTAGGGCAAAGGAGGAGGAGGACGACAAG
GGCAACAAGAAAAAAAAAGCAATCAGGCCCTTGTCGTCCTCCTCCTTCAC
TCGCCAGCAACCTTAGGACGCGGGCATCGGAGCCACCACCGGGGACTACA
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GCCTCTCCAGCCATGGATAGAGTCGGTGTCGCGGCCTTCGCTTGGGGAAT
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GCCATGGGGGAACAGAAACACCATCCATCACACCACGATGCAGCTCCTCC
TTGCCTCCACGGTCGGCCAAGAGCAGCACCACCTCCACAGATCTGGTGAG
GTTCAGTGACCACCTTTGCTTTATTGACGAAGAAGAGCTCTGCCTCGCCC
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AAGGAGAAAGCTCGAGATCCTGCCGAAAGGATCTAATGAATTCTTCTCGG
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TTTCTAATTTGCCACCTGTGCATGGCTCTTGAGGAAAGAGAAGTCACGCT
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AAAAATATTTCTTATATTTTTAAAAATATAGAAAAAACAGGTACTCAAAA
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AAAAATAAAAAATTATTAATCCGAGTATAGTGAACAAAGCATATTTTCAG
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AATTTAGTACTGATATTTTACATGCTTGTACTATACATCATTGACTACAT
CCTGATTTGCTTTGAAGTTATTTCAAAACCTGTAAATATAATTTTAAAAT
ATTTTAAAATAAAGAGATCGCTGGAGCTTAGGAGCCAAAGAGATTTTTCG
CTTTAGAGAGAGAGAGAGAGCCTTCGATGATCGATGCATTAGTATATCTA
AGTGTAGGAATTTTCTTGTGTATGGAGAGAGTGAGAAAGGGGTTTGGTTG
GTTTGGGTACACGCTTTGCTAGTGCACCGAAACTCGTGCTTATGAACTAA
TAGTAGTGTAGTTGTTTTTTCATTCCTTTAAACTCGCTTAATCTGTTACC
ATCCTAATCTACACCAATTGATGCTTTATGTACTAGTAGTGTGTTTCACT
AAGCTAGCTTGAGTTATTTGTACTGTAGTTGCCGGTGCTCATGGTAACTT
CTCCCTTACTAATCAATTGATGTGAATGATCGAAATGTGCAGCCTGACCG
CCCTGATGAGAGGGCACGCATTGAGGCGGTGGGCGGCCAGGTGATGTTTT
TGGACGGGCCACGTGTTAGAGGGATCCTCGCCATGTCTCGCGCAATAGGT
ATGTATTATGTACACTCTATGCCACCATCCTTTTGAATGCCGATGCAAAA
TGTTTTACATATGCCATAGAGAAATATCAGACTTTATATAGGAATTCCAA
GGGTGTGATAAAGTGTCATGGGGGCGTCTTGCTCATTTTTTTACTTGCTT
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GTGTTTTTGTTCCCACCACATCTGATGAGTAGAAAAGAAACAGAATAAAG
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GAACCCCAAGCTGACAAAAAACAATTACTCCATATGTTCCACAATATAAG
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CTTTATCAGTCTACTTTTGAGATAACTACATACATTTTGTTGCTATTTTT
ATCTTTTTATTACTAAACATTCTTCCTTCAGTGTGAATCGAGATATGTAT
GGAAAATATTTTGGTAGATCCGTATGTGTCAATGTTTCCTATCAATTTTT
TGGTATGTCCACTTTGGAAGTAGCTTCTTTGATGTGCAGAAGGCACTTCA
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CTTTGTCTACGACACCCATCTTCTCTTGTTTCATCACTCCCTTCTTTCTC
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TGAGTTGCGTCGACCATCCCTAGATCGTATTCATCTCACCTTCCATTTAT
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GCTCTTGTTGTCTAGGCATCTTGTTGGTGAGCTTGAGAAAATCTGTAGAC
CAGCCCGAGTGTCAAGCTAAGGGTGAGAGTTGATTAATTGACTGTCTCCC
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TGGTTGTATGAATGAATGTGAGACCTTATGTTTGTTGGTTCCAAAGGAGC
TAGATGGATGGATGGGGATGGCTATGATATGTGGAGGGAGAAAAACACGC
AAAGGGGAGGGATAAAAGTGGTGGAGATCATGTAAGGGATTGTGTAAGAC
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CTATTTTTGTCCGGACTGTCTCCAATTTTTTTGGCATGCCCATCCCATCC
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GTAGGCCCACCTGCAGTGGCCCAGCCGAGAGATTCCCCCATTTTTATCTC
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GATCCTGGTGTCGTGTGGGCTTGGAGGGCCTGCCGAGGTCGTTATTGCAG
GGGTGGGTGGCTGGGAGATGGGCATGCCTAGGATCGAGGGGGATGCAAGG
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GCATCCATGATGACCACATCCACATCACGCGGGGCAAGTATGTGGTTTAC
GAGGTCGGTGTCGGCTGGTACCCTCATTGTGCCCTATGTGTCATCATTCT
TCTAGTGGGAGGATGCCGAGGCTGATGGCGACAAGGTAGAATTCAAACAG
GCAACCTCAGCGACCACACTAAGCTTTCCTGAACTACCAAGCGAGCTCAG
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GAGCTTATTCAGACACGGTTTGAAAACCCCGGCCTTGAGTATGTATCTAT
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TATGTGGGAACTTTCTATTCTACAAACAATTATCACAATATACCACTTGT
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TCTCTACGTATTTTCCATTTTCCACTGAGAAACCAGTGGAGGGTTAAACA
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GACAAGAAGCAAGCATATATGACGACGAGTAGTGGAATTTATATCTTGAC
ATGGATTAGCGGTGTTTGATGATGTAGTTGTTGAGATTGGTTGTGTAATT
TTTTCCGAACTTTGTGAGCGGTGGACACAGTGCTCATGACTATGTAAAAT
TCCGGTGTGAACATGTCGATATAGAAGTATAAATGCAATGATCTAAGTGG
AAGAGAGATTATTATCTACGTCCAATAATACCCATGTGAAGGATGTAGGG
AGATATTATCTATATCCTAGAGCATATTTCATCTTAGTGGACAGTTGCGA
TTTGATATTTTTGTTTCCACGGGCGTGCCCCTCCATTTAGTTTGTCAATG
AGGAGCATCTCCATCTTTGTCGGCACTCTAACTATCATAAAGCAATCATG
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ACACACATCCTGATGACACATAATGTGTTTTGGGATCAAGTACTGCTCAC
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GCATATGCACTACTTCAAAGCCCACAACTAGGATATGCCCATGTGATAGT
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CATCGTGCTTGCCTGGCCTAGCCCGGGATATGGCTAGGTCTAAATTATGG
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TGGACATTGACATGGCTTCCGATTATATCTTTAACATTTGATTAAAGTAA
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AATGATACCATTTTCATCTAACCAACTTAAACATTATGTATATGTGAGTA
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AAAAATGGAATGAATATAATCTGGCAAATGGGTCAGGTAATCCTTCCTAA
GACCAAAAGGGTATTCCTTAAGAGAGAATTATATGACCATCTTGCTATAG
TAGTTTTATGTGTTGGCCTTCCTATGTGTGTAAGTAACCTGCTATTTTAT
GGAATTTTGATGTTACCATTTCTATTTCAGCGTGTCTAGTTTTATAAGGC
AAATGTGCAATGGAATTTTGGAATGTTATATTCATCATTTAATTCATGAC
ATGATTGGAAAATAGCTAAACAAGAATGGTTTATTTTTCTGCTGCTAATC
CAGATGTTTTCAGTAAATCGGGTGAAGCAATGTTTCTTATAGGGTCGTAC
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CTTAAGTACATGGTTCACTATATTTACATGTAAACTCATGTACTTAACAT
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AAATATTTCTAAATTCTGAAGGTGCTTCCATATTTTCATGAATGAATCAT
CTTATATTTTACCCCTAAATTGAATGCAACTAAATGGATGTTTGATCTAA
TCCTGTGTGGAAGTATTTAGTTTAGTGTACATCTCAAGTTTTCCAATTTC
CCCCTTATATCAATTAAATAGTGGTGAACTTAATGAGACCATAGGTGTTG
AACTTAGCTCTTATGTAGCTAGCGATATTAATTGCAATATGTTGTTTCAT
TCAGTATTTCTAAAGATACAATTTATAGGACCCTGAATATTTAGCATGGA
AACTATATTTATGAAGACTTTCTAATCTTCCAAGGCCCTACTTATGTGAA
ATCTCTAATTTTCACAAATAGTTACTTCCTCCGATCCATATTACTTGTCT
TAACTTTGTCTAGATACTCATGTATCTAGACATGTTTTAGTGTACAGATA
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CTTTATTTGGTTAACCAAGAACGTGAACATGTTAACAATTTTACCTTTAG
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TGGCTGCCATAATGATAGGACGTACATATACGTAGGATATGGTTGTTTGT
TTCTAAAATATATCGTATGCAAGCTTTGTCTTGATCATTGTGTCGTAGTT
TTTTATCTGAATGATATCGTAAGACAACAAAACACTAATATCTCGTGCTT
TTGCTTTCTAACAAACAAAATCAATTAAGCTCCTCTTTTTTATTTTTCAA
AATTATGTTCCTAACTAAAAAATCTTCTTTCACTTCCGTATATATTATCA
TTCTTACAAGTATTAAAGTATTATATCTGATTTTGATATTTAACTAATAT
ACTTGCAGGGCATGAGATCTTGAAGCCTGAAGTGATATGTGAGCCAGAAA
TCATGATAACCATAAGGTCGGACGACGATGACTTTCTAATCCTTGCGAGC
GACGGGCTTTGGGACGTAATCTCGAACAATATGGCATGTGGTGTCGCCAT
GGAATGCAAGAAATATGGAAGCCCGGCGAGTTTTCGTGCAGTTGGCAGCG
GACAAGCCGAGCACAACAGCAACTATGGCACACTGGTCGGACAACAGCTA
GAGCCTCGATGCTATGAAGCCGCCACTCTCCTTGGGAGGCTCGCCCTCAG
TAGGAAAAGTTCCGACAACATAAGCGTGGTTGTTATTGATCTGAAAGTGA
GGGTTTAGGCAGATGATATGAGAGCATCTTCTTTGGTGCTTTGTTATTTG
GTTATTTTAGCTCCTAGTCCTTTGGTGGATGGTTGGTTGGTTATATTTGG
CGAAAAGAGTCCGAGAAACAAACTTACTAAGTTGAGTTGTTGAAACATTG
CCATGGATAAATAAAAGGACAAGAAAGATAGAGTGAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.