Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA010330

[Submit comment/correction]

Sequence	AA010330
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA010330
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	TTCTAGGCTTGGGCGGGCAAGCCAAGAACCCCCAAACTGCGCACGGCGTT ATCCTCCCCTCACACTTCCCACAGTCCATTCCAAGCAGCTAGCGGCTGGC TCCTCTCCTCTCCTTCCCCATGGCCACCTCCCACCTTCTCGCCGCCGCCG CCGCCACATCGTCCTCCTCGGCCACCTTCCGCCCTCCTCTCCGATTCCTG TCCTCACCGCCTTCTTCACTAACCCTCAACCGTACCCTCCCCTTCCCTGG CCTACTGATTTTTTGTGTGTAATATGTATGCAGCCGCGTGTCATATTGAT GCATGTGAGCTCCATTCGCAGGGCGGCGGTCATTCCCGGTGGTATGCGCG GCCGACGCGGACGCTAAAGAAAGTGAGCGCGCGCGTCCCCTGTGAAGTTT AGTTTGTTCGGTGATTAATTCCTAGGCGTTTGGGTTGGATTTTCTGATGT GTGCTTTGTTTTGGTGGGTTGGGCGCGGTAGCAACGAAGAAGCCAACTAT CCCAGATAAGGCGCCGGCGGCAGGGTCGAGCTTCAACCAGCTGCTCGGAA TCAAAGGTGCCAAGCAAGAGACTGTGAGTTCCTCAATCTGTTCACATGAG CTAGTTTCTCATCGCATTATATTTATGATTCCAAATCAGAGCTTTTTGTT ATTTTTTTTGGGAATGGAGGTGATACCCGGCCTCTGCATCAAAATGATGC ACATAGCCTTCTTTATTTCTTATTCAACGAAACCTACAAAGATAATACAA AGATCAACCCGAAGCCACCTCTCTAGCGAGACAAAGTCGCAACTCCTACA ACTTGATGAAGGGGATGGCCATGTTGGAGCCAACACTCTGAGCTTTTTGG TTAGTTGATTGGACATGTTCTGAATTGGGAATTTAGCATGCAGCCAATGG AGCGCTGTAGGTTTCGGCACCGGGTGTCCGGTTCTTATTGTATTCCCAGT AGGACTGCCGATTAGAAATGCTACCATTGCTTGTGTATAATAGCCATCTG CTTAGACTGATCTATTTAACTATTTCTGTACGGGAACCAGAAATTATATA TGTTGCTCACTAACACCTTCTTTGACACTGTATATAGAATATATGGAAGA TCCGTCTTCAACTTACTAAGCCAGTGACATGGCCTCCACTTGTCTGGGGA GTGCTTTGTGGAGCAGCTGCCTCCGGTATGCTTTATTGCCTATTATGATT TCTACTTGTCATATGAATAGCTTATACTTCTACCTTCAGAATAACCACTT CAACTCAAGTGGAGTTGGGCAACTATATTTTCACACTTGCAACACATCGT TATTACATTGTCCACAACAGGGGGCGGAGCCAGGATTTGAGTATAGGGGG GGCGAAATGATGTTCAGCTTAAATGGAATATAGTATATATCAGGATATCA AGTCCAAAATAAAATAGCATATCAAAGTATGTTTAGCAGTAAAATTACAT AAATATAAATTAATTCAAATATGGACACATATAATGGAAAACCGTAACTA AACAATGCTAGTACCACTTTATAAGTCCAAATAGTTCAGCAACGATCAGA TCTAATTTCAATATCAAGCCAGATTTGAGACTCAAGCAATATGCGCGGAA AAGCAATTCATATTATTCCCTCCGACCCATATTACTTGACTTAAATTTGT TAGATAGGATGTATATAGCACTAGAATTTGACTAGATTCATTCGTATTTA GATGAATCTAAGTCAACTAATATGGATCGGAGGGAGTATAATATTTCTGT CAGTTTGTTACTGAAGAAAACTGAACAAACAGATAGGTCGGATTAGCTAG TACATCTAGGGCATTGCCTACCTGCGAATTAGCTGGAGGGTAGTGTGAAA GCTCTGCAAGTGGGGCGGTGGTGTGGACTTCTGCAAGAAGGCAACGATGG GAACGATTGGCGTTCAGCGACAGGCAACTATTGACGATAAGCGGCCGCCA CCGTATTAACCATTGTTTTTTGCTGCATGTATAGCAGCGAGAGGCGGTAG GCAACATAACAAGATTTATCTTCGATCTGATTCAGAGGTTAGGTCATAGG TTGCTAACCGCATGATCGATGGCCTAAACATGGGTAGTCAGCCAGATGGG CTTCTCAGGCTTCGGTGAATGCATAATTAGATGGGTTACGGATTGCTACT AACCTTGGCTTAGGTACTATTAGTAAATATATGGCTATTAGTATGTATAT ATACAGAATACATGTACTATTACTTGCTGTAATTTGTTGGGGGGGACGAA TGATTAGGGGGGGTCTAGCCCTGCTCGCCCCCCTTGGCTCCGCCCCACAA TCCTTAGATTTTGCTAGTAAACTGTGTGAAATATGTGCATCATCCTGCAA GGAAGAGTTTACTGACCTGGAGATTAAAGTTGTGCGGGCAAGCGATGTTG TCTATGCTCTGTAGGTCCATTGTAGCTTTTCTCAGCATCCCTAGTCACAT TTAATTTGGTATAGTGGAATGGACCAAATAAGTGAGTTTTCATGGAAACC CAAAGATGCTTTCCTCCCTTAGGCCAGAAGTCCAGAAATACTAGGGTTTA GGATGAAAATACCATACCAGTGCAGCTTCTGTGCTCATGAATGTTGTTCC TCTTGGTATACAATACCTCTATTATGCTTATTTGCTTACGTTTCTTTGAA CTTCTCATATTTCAGGAAATTTCCACTGGACAGTTGAAGATGTCGCAAAA TCTATTGTTTGCATGCTAATGTCTGGTCCATGTCTTACAGGATACACACA GGTTCACTTTTGGATTTATTCCGTTTGCTTATTCATACATTTTATAACCT CATGTATTGCTTTGCTGAAAACTATTTGTACTAAAAAAATATGTCAGCTT CAAATATTATTGCTTGTAGACAATTAATGACTGGTACGATCGGGACATTG ATGCTATTAATGAGCCTTATCGTCCTATTCCTTCTGGAGCTATATCAGAA AATGAGGTATGTCTGTATGCTGTTTAAGCTTAAGTTTAGTACCGTGACTA TATTTCCATCCTCCTCTTTCTCACAATGTATTCCCATTAATGGATATTGT ATGTATATTTATGACTTAAACCTTTATATCTTCTGTATTATTCAATGATG GCACAATGTGAGGCATCGACTTTGTCTTCATGTTTCATCATCAGTAATAA GCAATGCATTTTTTTTTCATGTCTTAAGCCATTATCTAACTTATCAATGT CACGTTTCAAATATTGATGGATCATTCGATCTTATTTGTTCAACTACAGA ACTTGCCTGTCCAAATGGTTTCTTCTTCTGTTAAAAACATTGCTCCCCTT TTTTTAATCATGTGGTTTGTCATTAAAATCCATGGTTCACTTATATGGAG TATTATAGACACTATATATATGGACAGTTGATCGATGTTACAGTTTGCTT GGTATTTCTGTGCTGTTTGTTACTCTTTCAGTTAACAATTTCCAATATGG CCCTTTTTTATGCAAGGGGCTTTATTTCCCTTGAGAAGCATGTATTGCTA TAAACAACTGCGTGAATTTTCCAACCAAATTGTTTTCTTGATAATAACGA GCTTCTGATTATTGGAACTAACAATCATCAGCCATTCAATTTTCGTTTTC CATATCTTGCTAATGATGCTGATTTGATCCAGGTTATTACTCAGATCTGG GTATTATTGTTAGGTGGTCTTGGGTTGGGTGCTTTGTTAGACATATGGGT AAGTTGCCACAAGACTTGCTTTAGAATTCTAAGAGGGGTTGATATATGTT CCTTTTTTCTTATGGTCTTGCTTCATTTCAGGCAGGGCATGATTTTCCTA TTATTTTTTACCTTGCTCTGGGTGGGTCCTTGCTTTCTTACATATATTCA GCACCACCTCTCAAGGTACTTGAGTACTCAGTGCTCTATACACTCCGCAT CTTTTTTTTTTTGGCATAGCCGTGTGTCATGAATTATTCGATAAACGTCC ATATATTGTTACACATTTCAGCTCAAGCAGAATGGATGGATAGGCAATTT TGCTCTTGGTGCAAGTTATATTGGCTTGCCCTGGTACGATGGAAGCGGTG TATCTTCTCTTCATGTTTAATAAATAATGCTCCGTTGGATTCTGTCACCT GAGAATTTCTGAATTCCGTTGGGGCTTAATTTGAGAATTCACAAGTTCAC AAACCCTTCTTGTGAACGGCTATTTCTTATCTAATGGCCAAAGTAATTAG AAATTTATTATAATAAACTACCAAGTAAAACCGGGTGTATTTTCCTTAGT GGTAACATAGTGCCTTCAGTCTCATCACAACTTCCACTTCCCCAACCTCA CAACCCTAACCCGTGACTGAGAATCTGCAAATCCATGATCAGATCTCTTG GTGGCAGGAGCTGGCCCATGATGCCCAAGGTTGAGTTCATGTTCTTCAAT GTTGATGATAGCCTGGAAAGTTTGTGCATGAATGCATGGATTACCTCAAA TCTCTTGTTAGTTAATGAATGATTAACAAAGTTATTTAATCACGATCATC AACTACCTGAGCAAATGTCGCACCGTGTGTGCAGCAGCCAATCCACTTGG CTCCAACAGCAACAGCATGATAGTGATCCATAGCCGCCACCATTACTACT TTCCAACTGAAATGCTCATGCGACATGAAGCTTGCTGCAGTGTCTGGCTG TCACCTGAGAATTTGTGAATTCTGTTGCGACTTATTAGTTTAGGTTAAAC AATGTAAAAAGGGTCCTTCTTCAAGTTTCATTTTTACTAAACTTGAAGTT GCACTTTTCAGAAATCAATTTAGACATAAAAAAATCTCAGTCGACTTAGG ATTAGCAAAGCCTGGATACATTTATCCCGAGGAATAATTAGGAAGATAAC TTCCATCTCAGAATTCAATGGCCAGAATTACTCTATACTAGCGTACCGTA AGATTTCCATATCTTTTGTGCAGGTGGGCTGGCCAGGCGTTATTTGGAAC TCTCACTCCTGATATCGTTGTCCTAACTTGCTTGTACAGCATAGCTGGGG TTTGTATATTTCATGATATGTTCCCTTGTTTGTAATCATGCATGCCCATC ATGGTTGTTGGTTGCTGACTGTTTTCTTGTTTTTTCTAGCTCGGGATTGC TATTGTAAATGATTTTAAGAGTATTGAGGGGGATAGAACTCTGGGACTTC AGGTTACTATTATTTCTATCTTTGTTATAGATTTATTGTCAAAGCACCTC TCTTATCATTGCACCTTTTTGTAGTCACTTCCTGTTGCTTTTGGTATGGA AACCGCCAAATGGATATGTGTTGGAGCAATTGACATCACCCAATTATCTG TTGCAGGTATAGACACTTTTTTTCTTCTCTTTCTTCCTTCAAGGCTTACT ATGCTTAACATATGATTAAGTGGTTCATGGATTCATGCAACCATCTACCA TACCATAATCTCACGAGCCAGTTATAAAAATAGATTGCACTTTGGTTTAG CCTGATGATGGAAGCTTTCAAGGAACTTTGCAGGGAAGTTACTGTAAATT ATTATAACGCAAGATGTGTTGTAGAAAAACCAGCAGTACCAGAAAGTCTC TGATGTTGGCAAACTACACCTAAAGCTTGCTGCAGATAACTATTCCGTAT TATTATTTGGCAGAATGGGAACTGTACTACATCTACCAGTATAAATCAGG ACCAGAGGAAACTTCTGTTGATTCAACAATCTATCCTGAAATTACGTAGT AGTGAACTTATACTAATCTTGAAGCTCCATCTTTCAGCTTACCTCTTGAG CACCGGCAAGCTGTATTATGCCCTGGCACTACTTGGACTAACAATTCCCC AGGTGATCTTGCAGGTAAGCTGGTCAATCTACTTGGACCTTTGGATATTA AATTTTGTTTTACATTCCATATATTTCCATTGTTTAAGTTTTCGTGTTCA CGCTACCAAACCAAATACTTATATCAAATCATTAAGACGTACCAACAACA GTATTATCTGCAAGGCTTGTCACATTGTCCTCTAGGCCTTCTGGTTATCT CCAGAGCATAGCTACTCAAATATGAAAACAAGTGAATAGTTCTGCCTGCT TAGCGAACCGTTCGCTCTTGCTTTTGCACATTCTAATCCTCCATTTCCTG GAGCAGTTCCAGTACTTCCTGAAGGACCCTGTGAAGTACGATGTGAAATA CCAGGTACTTCTGTTTTCTTCAGTTGTGTGTCTCCCATTATTTTTTTTCT CCGCGAGCAGCAGACACCTTACCGGCATGACGCATGCCATCTTTATACCC TTCTTGAATACAGGCGAGCGCGCAACCGTTCTTCGTCTTCGGCCTGCTGG TTACCGCCCTGGCGACCAGCCACTGACGACTAACCTTAAGCGAACCTGGG ATATTTTGGTCGAAGAGGCAGGTGGTGGCTTTGTACAACAGTTAGTGGAA TAAGATCACAGCAACACTTATATGTATAAGCTGTTGGTGTTGCCGGTAGG GTACTAGAATCAAAAATGCCTCCTCGAATGCAGAATGGTAGACTGTAGAT GCACAGTACCACATTGTTCCGATATTGTCAGGGGCTGTTTTGTAT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.