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GrainGenes Sequence Report: AA027197

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Sequence
AA027197
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA027197
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGACATTGTTTGACTCAAATGCTAATCCTCATGATCCCACTCCAAGTAT
CATGGTCCCTTGGATGAGTAGGCGGGATTGCTACAGGATTAGCGACATCC
CTCTTGGAACAAAGGATGGTTATATGTTCTATTATGGGGGCCCCGAAGGT
TGTAGTGGCTGATAATAAAAAAAAACAGGTGCTACTAATTGAATAAATAA
AATGAATATTCTTCTATATTGTCACATTTCACGAGTTTTTTAAAGCTTTG
TTCGCCGTGCACATTTCATTACGAGTACTACCATACTAGTTTTTAAGGAT
AAAATTCATCATATTCTCATTAATGTTTGATTGCGCCCATTTCACATCTC
CTGCCATGGAATTCCCCATCGTGCACGATGTGTATAGTTGCTTTGCCTAT
CACTAGTACATATCATGCCATTTAGTCTCCCATCTCCCCTCCAATTGTAC
ATGGAAGGAATAATCTATGTCTGTTGCCACTGATTGCTTATGGTATAATT
AAAAAACCACCGGTCGCCGACTCCCCCCGCCCCCGGTCCTCCTTCTCATC
TAACCCTTGAGAGTCGGCGCTCGTTCCCGAGATCTCCTCCGTACTTGCGG
TGACCCAACATACCACTGCATGATGTAGTACACTATAATCGTCGACATAA
CACCAATGAAACACCATTCAATAGTATTACATCCCTCAGAGTGGTACAAC
AGAAACACAGCGGGTCCAAGACATTACTTTAGATTACATATACCACATTA
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AGCTTCCGGTAAGGTCTTCGAATCCGTTGATCTCCCTCAGATATCTTCAA
CTCTTCAAGTAACTTATTTCCTGAGAACGCCATTGGTTTCTCTGAGATCT
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AAAGCTATGTCCATCAGCCTTCACGGTTTTATCAGAACTTTCATGGAGTT
CCTTTCCTGCAGCGTTCGCAGCTCCTTCCCGGAACAGGGAGTAACAAGTT
ACAGTTCTTACACTCTGCAGAGGTGCGTCACTTTACCCATGAGAGATCTT
AGCTTTGTTGCACATCCGAGTTATAGGCTCGTTGACACTTCCTTGGTATG
CGGCCCAGACTAAGATCCAAGCCAATCACTGTCCTTCTCCACGACCCCGC
ATACACCACAATTGTTGGATGTCCAAACTCAAAGTAGACTTTTCCCCGTA
TAAAACGGCTATACCTTAGTTGGATACACACAACAACCATTAACACTAGA
TATCTGTATTTTGTAAGCCCATATCCACGGTAGACTTCCCCCATATAAAA
CGGCTATACCCACGATCTGCAACTTACAAATGCCCAGAACAATGTCCAAT
GCATGCGAAAGGGAGCCGATCCAGCTGACTTCTCCGTCCCATTCCAATCT
CATGGTTAACGTGTAATATACGGCACAAGAATCACTGGCGACATTGGTTG
TTTAGTCCTAGATAATATGTTCCTTTACCACTGGAACTTTCATAGTAGAT
TATTACCTCATGGTAAATAACCTATAATCATATTATTATGAAAATAGTGT
TTTCTGACCTTTTTCAAATGCAGGTGATGACAATACTGGATTTGCAAAAT
ACTTTACACAAAATAATAAAAGGACATGAGCAAGTGTGAACTTGCCTATT
GTGATTGCAAGATTATGCACTCACGGTCTTCGAGACGATATAAGATCCAA
TATCTGAAATCATCATCTTTGGTCCGGTAAGGAATAATGTTTAAAGAAGC
AAGATGCCATTATGCATAAATAATGCTATGAAATTTTATAATTCCCAAAG
TGAAACCCCTAACATTTTAAATAAGTTGATCTTAGGTATCTTCTTTCAGA
TTGGGTTTATCTTTAAGTTTATTTCATAAGCGACGACATTGATAAGGAAC
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ATGATTAGTTGCTATCTGGTGACTAGGATAAAAAGTCCTTGGGTTGAGTT
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CGAATAACATTTGAAGAAATTAGTATTTAGTTAAGGTTAATTTGTCTTAA
GGGTTATTAAGTTTTACATTAGGGTTTGTGAGGGTTACAAATGATGTTGA
GTTATCTTATTTCAATTAATGATACAAGTGACTAAATTTAACTTTAAAAC
ATGAATAAACTTCAAATGAAATGTTTATAATTTTTTAGACCAAAGTTAAC
CATAAAAATGTAAGTGAATTTTATGATATAATGAGTTTTAGAATATCACC
TAGCTTTAGGGTTTTGACAAATATGATTATGAATGATCCTTTTTAATGTA
AGTGAAAGATGGGTTTAATAACATGCAATTTATTAATGGGAGCATAATTA
GATGACCTTATAAATTTATTAGAGTTTAGAGTTATTTTTAAGAGTGGTTA
AGAGATGGAGATTATTCACCATCTTATACATGAGTGATATGTAATATTTA
TTTAAAAGGAGTTTAATTTGAATTTAATATTTAGAAACATTTAAAGGCTA
ATAGTTATATTTAAGTTTTATTTTGATTATGGATTTAGACTTAGTAATTA
AACTTTAAAGGTTTTGGTGTTTTATAAGAAAATTTGATTATTTCTTACTT
AAGAAATAATTTTAAGAATTAACAAAGTGGTTGTTTTATTTGAGTAAAAT
AAGTAATGAATTTTATTTATCTCAAAATGTTTTTGAATAATATACATAGT
ATTTTTCTGGTGAAATATATTTATTGAAGATCTTAAAATGAATTTTATTT
ATTTTTAAGTATTACCTTTATTTTTATAAAATTCTTTAAAGAATTAAGTG
TCTTTAAATATTTGCTTTATATTTTATTTGTAAAACTCTAAATTAGTATT
TTTTATAAAATAGTAAAGTTATTTTTCTACATAAAAATGATTTTTATTTA
TTTTTAGGAGTTGTTCTTATTTTATGAAATTTTATTCAGGATTTATTGAT
GTTAATATTTATGTGTTCTGTATTTATTTTAAATCAGCAAGATTATATTT
TTATTAGATAGATCTTAATTTTATGATAATTTTAACATATTAAATGTATT
TTTATGATTTTTCTATAATTTTCTGTAGCTAAAAATGTTTAAAGGTTATT
TTCGTAATTTATTTGTTTTACTTCTATTCATTTCTTATTCTATTTAACTT
GGGCTATTTGGGTTGGGTACATGGGCTGGCCTGGCCGATCTAGGTTGGCC
TAGTTTGGGATCTGGCCGAACCACCTCACCCCTGGCCCTTCTCTCTTCCT
TGTCTCACACACAGACACACCACGCACGCCCCTGACCTTGACTCCCCTCT
CTGGTTCATCTGCCTCACCCGCTCATGCCGCCGCCGCTCTCACCGGCCAA
TCGCCGGCCAAGTCCGACGCCATCAGTTGCCGCCGTGTGATGGCGCTGGC
TAGATACTGCCCCACTTCCTTTCTCCTGGCCGTTTTGATTCAATCGCGGC
CTCACACGCATCTGGCTGAAACCCTAATTCCGCCCTGGTGGTGGTGCTGT
TTGGCTACGACACTTGCCATGATGCAGAGGTTGCCGGGACGACTTGGCGC
AGTGCAGGTGCTTCGGTGCCCATCGTGTCGCCGTGCTGCTGCACCAGTGG
CCTCTGCTTCCTCTTCGGCGAGCTAGGACTCGCCACAGGTAGGTGTTCCT
GCTACCCCCTCTCTTCTATGTGACCAGCCTTTTTGCTAATGATTTTGGTT
GACAACTATGCTATGGTTGTGTGCTGTTGATCCATTGCTAGTTAAGGTTC
CTTTATTTGGATGAATAAATGTCCAGTTGGTACACTGTTTGATCTGTGGA
TAGGTTTGTGGTAATTGATTTGTTGGTTCACATCTGGTGAATATCTGTGA
CTTGTTGAGATATCTTAGCTCTGGTTTGATGCTCCATTGACATGCTTGGA
TATAATTTCTTTCGGATAAACCCCCCCCCCCCCAGATTGGAATCCAATTG
CTGTGAAACATTTATGTGTTCTCAATATGATATAGAATAACTTTTGAGTT
GATTCCTAGTATACTCTAGGAAGATGATATGAATTTATAAGTGAGATTGT
GGCTTTATTTGATAAGGTCATATACTGTATGTTTCCGTGATGAAAAGTAA
GGTGGATTATTGCATTGCCAATGATGTGGGAAAACTGAACTAATGTTGTG
ATGCTAGTTACTAGGCCTAAGATATCTAGCTTCTAAATGTGCTTCCTGTA
CTATGCAAGCTTTTGTTGGTAATACTTGTCTAGTGAAAACTAGAGAATGG
AATGATGATGCTATATCATGCAAGGCATGATCTTGGATTAATAAATTATG
GATGGGCTATAACTGGTAGTGCTCCATAGCTTAGTTTACTGAATCTTTGA
TTCGGTGACATAGCTAGACTGGTTTCAGTAAATTTGATAAGATAAAAGTG
GTCAAATATGATTCCTAAATTATTTACTAGGAAAATGATATGGACACATG
TTCTGCTTGCTAGCAGATGGTTACTTGTTTTGCTGATCCACTAATCTACT
GGGATCTTGCTTAGCAAGTTTCTTTCTATTGTCAACAATATAGTGGCTTC
TACTACTTGTTGGGTTACTACTGTGGTGCCTCCCTCTGGGAGTGTGCACA
GTGGGAGATCCCAAAGTAGTATGACTTGCTACTGTGAGATGCTCTGAGTG
TAGATTCATCCATCTTTATGACTTTAAAGTTTAAGGTGGATTTGTCCCTA
ACCTATGATGCTAAGTCTGAGGTGTATATTCATTAAGAACAGATGCTAAG
ATAGATTGGGAACTTCTCGATTATGATCTTGCATAGCATCTCTATGCAAG
ACAAAGAGAACTATTCTTCATTACTACTTTTGTTTGTTGTTTATAACAAA
TGAAAATATATAGGATGCTTGAATCTTAATGCTGTAACCTACTCTGGAAA
GGTAGCTGTTGTTGCTGCTGTAAATGATGATTTCTTGGTATTTGTGTGGT
TGATCTTCCTCCCAGACTTGTTCAAACTTCTCCTTAGCTTTGCTCCATAA
ACAACTGTGGCATGGCCTTGATTTCCTACTTGTCCTAGCTCTTGGATGGC
TCTAGAGGGCAACCAGAGCTGGAAATGGTGTGGTATATATTTTCTGCTGT
TTTGATCTGGTACAAGCTAGGACTACTTGTGGTGTTCTTGAGTGAGGATG
TGGATGTGATGAAACTGGTGAGGTTCTTGGGTGGTGTTCTTGGCTAAGTG
TGGTGGAAATGGAGTAGCTAGCTTTGCTACTATGGTTGGCTTCTTCCTTT
TCTATATCTGGTGCTCTCCCTGAGGTGTTGACAACACATCAACTGCATGT
GTTGTGTAAGCTGCTTACAGCTGGGCCCCATATGGTGCAGGTTTCCATCT
GTGGGACATGTGCCTATGGATGAGCTTGGTTGGAAGATATTTTCTATGGA
TCACTTTGGCAGGAAGTTTGGTATTATCTTGAATTGGTTTAATAATTTGA
TGTCGCCAAGTGGATTACTAGAGTTGGTAATGCCATCTAGCTCATCTTGG
GCTGAGGACCTTATTGTATTAAGCATAATCTGTTTAGTTGATTTAGTGCT
AAACATGGTTATTATTTTGTTTGTTATTGTTTCCTCTTTCTTTTTAATTG
ATTTTAGCTAGGCTTAAGAGGGTTCCATAGCATGCTAGTTGTTGCCTAAT
GATACAAATGATCAAATATGTGCTGGTTTCTTTGGACCTTAACTTTGCCT
CTCAAAATCAAGTGTATAGCTCACAGATCAAAATTTCTACTTATGGTCTA
GATTGGGTGCTACCCTCTTAGGTCATTAGTGGATTTTGGTAGTTCTTACC
AAAATCCCTAAGCTATTTCGTATATTAAATTGCCTCACCTATGGTGGGGC
AAACATTTTAACATTAAAACAATGTTTCTTTCTTAATTGTTTATTTTACA
GGAATGAAGATCAAGAAGAAGAAGAAGAGAAGCTTAGTTAGATTTTATTT
TTAATCTTGTTAAAATTTCCCTTTTATTCACATGTGTAAAGATTTTGTAT
TATTATTGTGTTTGTAAATAATAAACTATTTATTTATTAATTCTTCCATT
GTAAATCCTAATTGTAAAGACATTGTCATATATAAAGAATTCTTTTATTT
ATCTATTGTAAAATAATACTATATGCATATATATTTATATTAATAAAGAA
TCCTTTTTTATATTATTTATGTAATCATTTTAGTTTAAGTTATTAAATAT
TTCCAATTCCTATTTGTGAATTTTTATAAATTCATTTGAATTTCATATTT
GAAATTCAAATACATGTTTGAACAAATTTTCCCCGAAACAAATAATTCTA
CAAATATCATGTCGAAATCTATCGCACTTGCTCCGAAGTTTCCTTCAGTA
CAAGAGAGATCCCGATCCCTCTATAGCTCTTTTAGTTTTGCGCGAAAATT
CCCCGGATTTTCTTATGCATGAATGCAATGCACAAAACTGTGTCCTCTCT
ATTTCTAGGTGCTAATCCTGGGATGTTACAGACTCTCCCCCTTAAAATAA
ACTTCGTCCTCGAAGTTCGCACCCTCTTACGTTTCCGAAGATAAAATTGA
CTTCTTCAAATCCCGATGACTTTTTTAAAATCCAGGATGAAGATAATTGT
TGTATATTCATTCAAGCTTTTCCTTGGATCCTCTTCTGATTTTAAATGAG
CCAACTAAATCCATTTGATGTATAAACTTGTTTTGAATCTAGCACTTCTG
CCCTGATCAGATCCTTTTGAGTGTTTTCAGATTAGGACATCTATTCAAGA
AGTGTCTAAGTTTTTAGAAAGTCTCCTTAAGGTAAGATTCTGGTTTATAC
TTTGGCTAAATATAGCTTGACTCTATTATTCATCTATTTATGGTATACTT
AGTCCTGATGGCTTACTTTTTAAGAATGTTTTGGATTTCCCTAAACCTTA
CTCCGGATCTCAACTCTTGATACTTCATTATTCACTCTCCCCCTTGAGAT
TTTCTAATGGTCTTATGAGGAACAGATGGTACACCCACATACTTGGGAAA
TAGTGGTGCAAAATCTCTAACTCCTTAAATGCATGTATAAGCTAACTTAT
ATCATTAATAATTCTTTGACTTACCACTTGCTTTGTTGTGGTTGTTGCTG
TTATTGACTTCATTTATGGTTTCATACTTCCGTTTTCCTGAAGATGTACC
TTCTTCACCTACAACCTCCTTTGATGGTGATTTGGTGGATGTTGTGTCTC
ATCCCACTGATGTTCCATAAACCTCCTGATGTTCCGGACAACATGATTTC
TTGTGTCCTAGAACTCCACACATATTACATTTCCGTTGAAATGCTCCTAC
ATTCCTTTCTCCATTTGGATTGGGTGGAATACTTTGAGTAGATGATAACC
CAATTATTGGTTCTATTACTCCTGTTGTTGATCCATGAGTTAACTGCGAT
TTTAAGCAGATCCTTTTCATGTGTCCTGGTTCTCCACATTGGTAAAATAC
TATCTTAGGTTTTGGACACTCCTTCAAAACGTGGCCCCTAATTCCATAAT
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TTTGTCATATGTCCTTGGGCCTGACCTATTGTGGTATGTTTTTGAATTCT
CTTTTTCTTTCCTTCAGGTGCATCAATCTCACCACCTCCTGATAGATGTG
CATTATCCACCAATTCCTGGAACTCCTTTGCACGCACAATCCTGATCTGA
ATCTTCATAACTGCTTGTAGTCCTTTCATGAACTTCTTTTGTCGTTTCAC
CTCCTTGTTTACTTTCTCACTAATGTACTTGGATAAACGATTAAACTCTC
GTACATGTTTCAGGACTGGAAGATTATTTTTCTCTAAGTCTTCATTCTCC
TTCCTTTTTCCATTGTTCTGATGAACAAATTCTTCTTGAAACTTATTTTT
GAACTCAGCCCAGGTACTGACACCTCCTTTTGGAATCACAAACTTGGACT
TCTCCCAATACGTGGCTGCGGTTCCGGTCAACAGATAAGTTGCATAGCGC
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AGGGTTGGTTTCTAAGAATTCCACCAGTTTAACCCTTGGATGTAATTCCT
TAAATTCCTTCTCTTGACTAACCTTTAATGTCTCCCGATAGAACTGGTTC
TGCCTCTCCGTTTTAACCTTTCTTCCTTCTTCCATACTCCTTATATACTG
AAGAACTTCTTCATTGGTGGTTAGATACGGCTTTTGATTTGATCCTTCCT
TCAGAATTGCCTGGTTAGCCTCCTTTTGTTGTATCACCAACATCTCACGA
GCCTTCATCTTTCCAACATTAAGGTGATAATTCGCCTCTCCCTCACGTGA
ACCCATTTTCCCTTCTAGACATGTACATCAAGTAAGGACTCCATGAAACA
TCATGCATATGTCCATAAAGTTCAAACTTCATGCACAGACATAGTGACAC
AATAAAATCCAATAAAATCCAACAAATTCAAATATTACCTCTAGCAATCA
TACATCAAAAGCCTGTAGAAACAGTACTTTGAGTAAAACATCTCTTGTAC
TTAGGCTTTGATGTTATACACTATGATTTTTGATACATCTTAGTGTATGT
ACTTCTACCGTTATACACCTATTTGTGCGTCTCATAATGTTCTTTATCTC
TGAAATTACACCATTTGCCCATTTGCAAAGGGATAACTTTTGGTAAAATT
TGATCTGATTCTAGAGATGGTTGGGTTAATTCACTCTATGATTGGTCATA
ACCTAATTATCCTTGGAGTTATACTAAACATCATCCTCACATTTCTACCC
TTTGTTTCTAATCTTAACTTTTCTAAGCATATTTATTATAACAATGAATA
ATTCTCAAGTTTTAACCAGTTTCATAACCTATATATATCTACTTGTACTA
CAAGAATACTGCCTTTTTATTCATGCCACTATGGTTTTGGCATATTACAT
GGGTTTAGATAAGCATAACCCTATTTGTTACTCTTGATAAGATTCTATTC
TTCATATAATAGCTTTTAGTTAAACAAAACATTAGTTACTTCCCCTACAA
TAACATGTTGTTTAAGGTTTTGGGACATACTCCCCTGGTATTTACCACTA
G

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.