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GrainGenes Sequence Report: AA023058

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Sequence
AA023058
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA023058
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCCGCCTTCCCGCCCCTCTCATTCCCCAGTCCCCACCCCTTCGCTCTCCC
CATCTCCGGCGATGAGCTCAGGCGGCAAGCGACGGGCGGGCCCTCCCGCA
GCGCCCTCCGCGGCGGCGGCGAAGCGGGCCCACCCTATGCCGCCCGGCAC
CCCGCAGCCGCCTCCGCCGGCTGCCGCTTCGGCGGAGGAGGAGGATATGA
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CTAGTTGTCGTGGTCAGTGCTAGTTACATACAGTTTTTTTCATTGTTGTT
GATTGACCTCACTAACTCTATTTTCTAATGAATAACCTATATAGCCTAAA
GAACACTTTCAGTTGATTGGCAGTGAATTAGTGTTTGATTTATGATATTT
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GTGGCAATTGGCTTGAAGTTCCTGCTGGGAAGTATAGGAAAGCAACTCGC
ATCATGTCCTATTGTCAGCTGGAGTTGGATTGCCTGTATCCTCCATTCTG
AATTGAATGCCTTCATCCCTGTTTCTAAATCATGTTATTATATAGTATAT
TTCCTTAAGTCAACCAACAGATACTCAGATTTGGTAAGCCATGCTGCTGA
AGGGGAATACTCTAAGATGGCTCCCTTTCGCATACTAAGTTTTGACATCG
AATGTGCTGGTCGCAAAGGGCATTTCCCAGAACCAACACATGATCCTGTC
ATTCAGGTTTATTCCATTATCTTTGTATTCAAATGCTTTCACTTAGGTTC
AAATGCAAACTTCTTTATGTGCTTAATGTCGACTTGCTTTTTTGGATTAA
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TGCACTGATGCCTCATTTGGAGTTCACAACCTCAGTTCTTATTTGGTCAG
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GGATCCTGATATTATAATTGGATATAATATCTGCAAATTTGATCTTCCTT
ATCTTATTGAGGTATAAGAACTTCTGTAAAGCCTACAAATTCTTAATCTT
TGGCCAACCTGGCAATTTCTACATCTTAGCATAATATGGTTTCACACATT
TGCAGAGAGCTGAAGTTCTTAAGATAGTGGAGTTTCCGTTGCTTGGTCGA
ATCAGAAACAGTCGAGTCCGTGTCCGTGATACTACCTTCAACTCAAGGTT
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ATGCTAGTTTTGCCCATAGTGTGTTATGCCAACTAAAAGTGTTCAAAATC
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TGTGTGCTTGAATGCAGCCTATGTTTATTTGATTCTGGTGATGCATGATT
TCTGATTGCAGATTTAGTGATTTATAATCTGATTTAGCTGAAAGTATGCT
AATTATGCTCATTTGATGCAAACTAGGACATAGTGTTCATAGTTCAGAAG
TCTTAGTGTCCTATAACTAGTTTTAGCAGTTTCATTTCCAGATATGTTAT
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TGCCTTAATCATCCCATGCTAATGATACAAGATTTCATGACCCTGAAGGT
GCAATGACACACGATTTTGCTATGCAAAACATATCAATTACCAAATGATG
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GTGTCTGCACATTTTCTTGGGGAGCAAGTAAGTCCAATCATTTTAAGTGG
CTGTATTTTCTGTCAGCACACCCCAAAGTATTTACTCATAGCCACACCAT
TATCATTTAAACTCTTGCTGTGGTATGGACCAAGCCCATAGAAGGGCGTA
CGCTACTAGACCCATCTGGCCATTATTAGTCAGAAAACAATTCAGATTAG
AATGTAAAGATTATCTTATTAGGGGAAGAGTTAGGAATGGAGATTGATTT
AATTAAGGAAATGGAGATACATTTTATTGAAAGTGAAGATCCTAGTCTTG
TGGGACAAGCCAAACTGGGTAATCCTCTGAAGCAATAAAAATAATCAGGA
GTTCTCTAGCCTCAGAGCCTCTCTTCCATGTCAGTGACTGAGTCCTGCTA
GTTGTTGAGGGTCAGTGCCCTATCTCCGATCTTTGAACCCTTACACTACC
AAATTATTCCACAGTGGACCTAAGGTTTGGAACACCTTTTGAATTGGAAA
ATATTAAAATAACTCAAAAGTGCACTGCTCTGTAGTTGTGGTTTCTGCGG
CACTTGTTTCTTTGGAAAATTGTCTCTTTGCTGCAAAGTGCTTATCTGAT
GCATGGCTTTCTTTTAAATCTTTTGTTTATGAACGAGCCATTTCACTACT
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AAGAATTTCTTGTAGGTCCCCAGAAGGATTAATACCAGTTTGTCCAGAGG
AATAATCATATACTGTTCTCACACTTAACATCATAAAAGATGTGCTTGTG
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ACAATAAAATGCATCAATGTATTCTATTTTCTAATAATCTATTTCACTTA
GGAAGTTACCTTTAATTCTTTGCCTGATCACATTATGGGGTATACTTCAA
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ATGGTCTGAAGAATGATTGTGGAACGAAACATTTGCTTTCTAACTCTGGC
AAGTAGGTCTGCCGGAAGCTTAGTTGTAAGCTAGGATGGTATTTTTGCTT
AGTGTCCTGTAAAATGTGTATATTTGAGTTGATTACTAGCCTTTCTCGAA
ACCTAATCCTAACATACTTTAACCTTTCCCATTAACGTACACACAGGATG
CTTATCTTCCGCAGCGACTGTTGGATAAATTGATGTACATCTACAACTAT
GTAGAGATGGCGAGGGTCACAGGAGTCCCCATTTCATTTCTGTTGTCAAG
GGGACAAAGCATTAAGGTGACAACAACAGCAAATCCCGCTAGTCAAAATA
TTTCACCCTAGCATTCTAACAAGAATTTGATTTGGTCTCTAGGTCCTCTC
GCAGCTACTCAGGAAAGCAAAACAGAGAAATCTTGTTATACCAAACATGA
AGGGCCAAGGTTCTGGACAAGATAGTTTTGAAGGTGCAACTGTAAGTTTA
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CAGGAGCTATTAAACTTATCGCGTATCTGTTTATCATGCCACAATACCTT
CATACTGCACATTAAGACCCTTTACATAGCTTACCTTGAAGTTACAGTAC
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TGTCAGCACTAATGCAAAAGTTGTTGTTGGTGCCTGCGTAATGCATCTTC
ATTGTTTTCTAGAAACATTTTTGCGTGCACCAATTATCTTTTTACATGGG
AAGGAAACATTCAGTTCTAAATTGGTCATGCAATGGACAATAGTTCCATT
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TCTAGGTTTTGGAGGCAAGGGCTGGATATTATGAGAAGCCCATTGCAACT
TTGGACTTTGCTTCTCTGTATCCATCCATCATGATGGCCCATAACCTATG
CTACTGCACTTTGGTAAACACAATTCTTCCAATTTTTATGCTAATATCTG
GGAAAACAGTTTTATCTGAAAACTGAATTAATGACTGTTTAAATGTCTTT
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CTACAAAACCCCATCCGGTGAAATATTTGTGAAACCAGAATTGCAAAAGG
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GGTTAAAGGTTTTCATGACAGAAGTAGTGTTTCCTAACCAATACTGTTCA
ATGTCAGGGAATACTTCCTGAAATCCTTGAAGAACTGTTAGCTGCTAGAA
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AGAAGATTGTAGTCAAGTTCCTCCTTGTAAAGCTAGATATTCATGCAATA
AATGTCTTTGATCCTATGTGAAAATCTGAAATAACGTTTTCAGGAAGCAA
AAGACCCATTCGAACGGGCAGTTCTAGATGGTCGTCAGCTTGCCCTAAAG
GTACTTCAATATCCTTTTCCTACCATTCTCAGTGCCCTCAAAGAGTGTTA
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TTACCCTGTTTAGAGATTTCTTCTAGCGTGACAAGCTATGGTGAGCAACT
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TCCATAGGTAGACAGATGATTGAGCATACAAAGAAGCTTGTTGAAGATAA
ATTCACAACAAATGAAGGCTATGCACATAATGCAGAGGTGAACTATCCTT
CTGCTTATATAAACTTAAAATGTTTCATGTTAATTATCTACTCGACATTA
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ATCAGATTTTAACTGAGTTATGTCTGCACACTCACTTCCTTAGCATTAAG
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GACATGCCTGCAAAGCTGGTGGTTTTGTAATACTTCATGTGTCAGTGATA
TGCGGGATCTGGACCCACACGTCATTCTCACAGCCGGTTGCAGTTACATG
GTTCCAATTTTTCCAAATTTTATATGTGGCAAGCTCAAGACCTTTTTCAT
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GAGCCTAGATACATGCAAATTTAGACAAATCTGTGACATCCTTTTTACGA
CGGAGGGGGTACTTATCATTCATTTTCGATGGTTGCGCAAATTCATTTGG
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TGTTTCTACTGTTGAAGATGCAATGAAATTGGGAAGAGAAGCTGCAGACT
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ATTGTTGACTTAGAAGTTAGAACCGTAGAATTGTTTTGTGGGAAAACGTT
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CAGCACCGCTGGACACCGTTCGTGTTCTGAACACTGCACCACTACACATC
GCCGCATCCTTTGCCTGTCACAACATACACCAGCTATGTTCAGTCAATAC
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CCTGTGCCATCCACGACAGCCGCATTGACAAGAAGTGGGTGTACCTAGGA
TCTACCTGAGAGCGAAGGCGTGTGCCACCGGCCTGTGTGCCAACCTAGGG
TTAGGCCTCTAGGGAGGAAGTGATGTTGTCTGCTGTCGTCCGATCCAGGA
TCTTGGTTTTCACCTGGGGACTACACCACAGGGGATAGAGGTGAATTTGG
GCTCCTCAGCGACACCCCAAGGAGGCTTTGGCACTTCCTCCCTAGAGGAT
CCCATCAAAAGCAAAACTATAATGAATTAGGGGGCTTGAAAGGATCGGAG
GCTACGTTATTCGTTAGCATCATATATTCTTTAAAAATCTGACGGTTGCA
AAGGGTTCAAGAGGGTTGTGAAGGAGCCATAATGCCCTTTTGAGGTTTTG
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GTCGTGATTGTTTAGTCACCTGAATTTATCTGTGTACAATGTTCGTCTAC
TTTATTTGTGGTAGGAGCATGCTTTGTTCTGTATCTCAGAGTATCAGATC
AGATTCAGGAACTGCTGTGCGTAAAAACGGTGCCAGTGTAGCATGTTCCA
TATCTTCCTGCTCTAAGTATATGACCCAATTATCCAATTTTATTTAATTA
ATAGCTCCAAGTTGAAGAGGCTTTTCACTTGGAAGTTTAATGTATTTGCT
GATTTTTACATCTGTCTTGCAGCCCATCAAGCTAGAGTTTGAGAAAATAT
ATTTCCCGTATCTACTGATCAGCAAGAAGAGATATGCTGGTTTGTACTGG
ACAAATCCTGAGAAATTTGACAAAATGGATACAAAAGGTATTTTGTGTAT
TACTTGTCTGATGGGTCATCCTACTTTTCTGCTTTAACATGTGTTCTTCT
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TATTCCTGGTGCAGTTCAATATGTCAAGAACACCATATCTGATCTATTGA
TGAACCGTGTGGACTTGTCACTTCTAGTTATAACAAAGGTAAATTAGTGC
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TTCTTTGATGAATGGTGCTTATGTTTCTCCATTGTTGAGATGCCTGACAT
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GCAAAGGTTAACTCATGTGTACTTGTTGCAGAGTCGTTTGTCTTAATACT
GTAGTATCTGTTTTGATACATTTGTGTTTCTGCATACAGGCATATGAGAA
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AGTACTACCTTGAGAATCAAATTAGCAAAGTTTGTCCACAACACTTATCT
TGATATTCAAAGCTTCTCTTTCCCACTTCTAATGGATTACAAAATGTTTG
TTGTCAGCCACTATTGAGAATATTTGAACCAATTCTGAAGAACGCCAGCA
GAGAGCTGCTTCATGGAAGTCACACCAGAGCTGTTTCAATCTCAACTCCT
TCAAATAGCGGGATAATGAAGTTTGCAAAAAAACAATTGACTTGCCTTGG
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ATTCTATTTTTCTGTTGGACTAGTGAGCATTTGCTTTTCAATATTTAGTA
TTGCAGTGCAGATGCCGGCGTACTGTAAAAGATGAGCTTTCTTTCTAATA
TTCCCATTCCAGCAGTAAAACCGTATTTTTACTACCTTTCTTTAAGACCC
AGTTTCTTAACCGACCTATTCTTACCCTGCAGTGGTCCCAATCAAACACT
CTGCTCGCATTGCAAGGGAAGAGAAGCAGAGTTATACTGCAAAACCGTAG
CAAATGGTAGGATCTAAATCATCTGAAATGTTTCTCAGTGTTAAAAAGGT
ATTGTCTCCAGTGACTGACTAATTTATCTTTACCATTCACAGTTTCTGAT
CTAGAGATGCTCTTTGGGAAGCTATGGACACAGTGCCAGGAGTGTCAAGG
TTCCCTACACCAGGACGTTCTCTGCACAAGGTTTGCAAATGTTCCTTCCT
TTGACAATTTCTTATCAGCATATTCCAAACTTCAACGACCAGCTTAAAAC
TCTTGTTTGGCGCAATCATTTGCAGTCGGGACTGCCCCATCTTCTATCGG
CGAAGGAAAGCTCAGAAGGACATGGCTGAAGCTAGGGTGCAGCTTGATCG
CTGGGACTTCTGAGTCCTCTCAATGCACTGATAACTTGCAGGTTTTCGCT
CCGCCGATTCATTCTTATGCATTGCGAAGTGAGTTGCATGCTGCTGTCAT
ATCACATGATTGCATCATGATGCATGATGGGCCAGGGCCATGCAGAGATC
AGCGGGTTGCCCTCTGAGCTGGAATGGGTTTTGAAGTAGGCTTGTTGGTT
GTACTACTCAAGAACACGCTGCTTGTATGTTTCATCTGTGTGCCTGTTTA
GTCGGTAGGGACTCCTGGCATTAACAACTCTGACAGATGGTTGTTTGCTG
CCTAGTTCAGTAGTTGGACATGACTGCTGCTGCCTAGATGGTTTTGAAGT
AGGCTTCTTGAAGGTATTGTTTTGTGAGTGCGGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.