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GrainGenes Sequence Report: AA005908

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Sequence
AA005908
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA005908
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCCACCCTCGCCGCGCGCTAGTGGCGGCCGCGTGCTTTGGTTCCTGAAAG
GCGTCGAAAAGCTGAAGCCACTCTCGGACGCAATGACACGCGTTCGTGGC
GACCCACGTCTCAGTGGAGAGCCAGAGAGGTGCGAGGAAAGGTCTGCGCC
AAAAAACCCTCTCCCTCGACGGCGCACTTAAATGTGCGCGAGGAGGAGGA
CGATACGCTCGAGACTTCTCTCCTCCGTTCCACCCTCTCTGCAGCCTCCG
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AGATGTCCCGAATCACGAATCGTTGTTCAGATCCTCCCAGTTTCTTGCAT
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TTGCAATACACGCTTGCTGTAATAAAGGTATTCTCCATTGTACTTGCAAT
CTTGCCTTTTCCCCTTTCGCACCACGCTTCTTTGCTATGGATACCAATTA
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CCGCTCATTCCGAACAATGAAAATTCTGAGGTCGAAAATACAAACTTGGT
ATGCCGTTTTTTAGTAACCTTTTGGTTTTCGGTTGTCACTCATGATGTGT
GCATTTTACCCTATTTACACAAGAGCCAAGTCATAATTCTGTTTATGTTA
TTACTGCATATTTTTGCCTAATCATGTGAAGTTAACGTTAGTTCTATTGT
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GAAGTCCACTTGGCAATCCTAATGCTGTCAAAGCTTACAAGTTTTGGCTG
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TTTCGCCAACCTATAATACAGACCTGCAAATGACCATGCCAATATGTTAT
GCATACCTTTGATGAGGGAGCGAATATGCACCTGCTACTTTTGCGAAACT
TTCTCGAGCTACAGAGTGCCATATGCGCTTACTTTGGGTTGATTATTATA
ACCCGAACACTGGTATTTCCTTTATGTTAACAAAATTACATAGTCCATAT
TTTGAATTTCTCTATATGCTCTGCGTCCTGTACTCTCAGGTATATAGGCA
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TCTGAGCTCAGAGCTGCTTCCTGTTATGACAAACTTCTGTCTTCGTGGAC
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TTTAGTATGTATTCGGTTGACACTTTCTAACCTTTTGAATGAATGCTGGC
AAACTTATCATTTGGAATTAACCCTTATATGTTCATACATACTATTTGTC
TTCTAATGCATTATCATAATGTCTAATCATGCAGGTGATAAATGACAGTA
TCAGTTTTGTAAGCCCACTGCTACTAAACAAGTTCATAAGAGTTATTCAA
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GGATTCTGCTGGTAGTTCTTGTAGAAGCATTCTATAATATATTGGGAATA
AACTAGGATATCTTCTAAAACAACGGGACATTTGAGTAATGATTCGTATC
GAAGTAGCATCCACTTTACTGGGTTTTTTTTGTGTCTTTTTAGAAATGTA
AACAAACCAATTTTCTGGTGTTTCATACATTTCTTTCATCAGGTTCTGTT
GGGATGGATGGATATACTATTGCCATTTCCCTAGGACTGACTTCAATTAT
CAAGTAAGCATTCAGTTCTGTTTTGGACGAAATAAACTTAAAAATAAAAA
TTGAGAAAATTGCACAAACCGTTAGTCACAGACAGAAAGCAGCAGGTGAT
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CATGCTAACGATGAAATGACATAAAGGTTCTGACCTTATTAATGAGCAGT
TCTTTCAAAAAATGGTGCTCAACTTACTTGTTTCTTCTCGAATCTAATTA
CTCCCTCCGATCCAAATTAATGGACTCGGATTTATCTGGATTCGGATGTA
TCTAGTACTAAAACTTGACTAGATACATCCGAATCTAGACAAATCTGAGT
CTATTAATTTGTATCGGAGGGAGTAGTAACTAAATTTTATTCAATTTCGG
ATTCCCGTTCGCCAGGTCGTTTTTGGATACCCAGTACTCCTTTCGTCTAG
CAAAGCTGAAGTTGATGTTACGATCAAGCATCATGGGAATAGTTTACCGG
AAGGTATCCCCTTTTATAATTTGTCCCGTTTATTATCTTTCCATCAAAAA
GATTAAAAAACAAGCAAAGAACATTCAGCTAGCTTGCACTGTACAATACT
TATTTAAACTGGTCGTGACTCATTAGCACTTACTACTAAGATGTTCTCGT
GCATTGCTAACCTTGGCTGCTATGCACTTCCCAAGAACGATAGAAATCCT
CATCTAGGACCCTAGGTCACATAAGACACCTAGATTTCCTGCCGTTTAAT
ATGGAGCCGGCTAGTAGCTTGTATGATAGTGCATGCTTGTTTAGACCAAA
CATGTGGCAGTGTACCACTGATGTACTCCCTCCGTTTGGAAATATAAGAT
GTTTTAGGTTTGTGAATGAGATGTATCTAGACACCTTTTAGTGTCTAGAT
TCATTTGAACCTATACACTAAAAGATGTCTAGATACATCTCCTTTACAAA
TCTAAAACATCTTATATTTCTAAACGGAGGGCGTAGCATATCTTCTTCCA
TTGCTGGCTGTTGCTGGAGAATGCCTTCTTGCTCTTCCAATTCAACACCA
AATTTCCCAACAACTTCCATTCTAAGAAAAGCATTATCCAAACATTACTT
GACTTACCTTTGTTCTTTTACAATTTCGATGGACCTTGAAAACAGTGCCT
ATGTCTCAATATATCGGAGCGTTCTAGGTTTTCTGAAGGAGAGATTCAGA
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AATGTTTACTTCAAGGAATTTTGTTCACATTATATATCAACACTACCATA
TATCTTACAGTAAACAAATCGATTTCTACAAGGATTGCTACTGCCACAGA
AAAGATGATGAAGCAAAAAGATGAGAGGTGAGATAAACAATTCCCTCTAC
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TTCTTCCCATTGACATATTTGGGAACAGCATAAGACATCTAGCTGTAGTT
TGTTAGCACAAACTATTGTCTAAATTGATAATAGAAATCAAAAAGAAAGT
TTTGAGTTATTGTGCAAAAAATGCCGAGTTAGACACAATTTATGTTATAA
TTTAACTAGAACAATATCCATTGCTGTTTCTTTGTAAACAGGGTAAGTTG
TGCAGGAGAACTCTTAGCAAACATTAGAACAGTGAAGATGTACAGCTGGG
AGAAACTATTCACTCAACGCTTGAATAAAAGAAGAGAATTAGAAGTGAAG
CATCTTGCGGTGTGCAATTGCTCATTACCAATTTTCTCTTTTTAGTAATT
CCTATTTATGGTACTGGAACTCACAAGCTCTTCTTTTCCTGGTAGACTCG
AAAATATCTGGATGCATGGTGTGTCTATTTCTGGGCAACCACACCAACAC
TGTTCTCCCTTTTCACCTTTTCCATATTTGCAATAATGGGCCACTCACTG
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TCTCAGAGACATATCTCTGCAGCTACCAAAAGGCCTTCTTATTGCAATTG
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TTTTCTCGACACATACATAATGCTACTTTGTGTTCGATTTGGGTACTAAT
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TTATTTTCTGTTAATGCAAAATTGTTATGTCCATTTCCAGGTTGGTTCGG
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AAAGTGTCATTGATATTTTTTAGGTACCTTGGATATTATCTGGTTCTTTA
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TTATTTCTTCGTATATTCTTGCAACATTCATGCAGATATGAAGAAGCAAT
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TGTCACACATTGGAGAGAAAGGTCTCAACTTATCTGGTGGACAGAGAGCC
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TGACTCACAAGTTGCTTCATGGATCCTGGAAAAAGCCATTATGGGACCAC
AAATGAAGCGCAAAACACGACTATTAAGCACTCACAGTCTCCAGGTAATG
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ATTGGAATGTTTCTTGGCAACTCCATATTCAAGAATATCTAAGCTAGATA
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TGGTCAGGAGGAACAAAGAAATCAAACTGAAGCAGAGGCCAGGAAAGAAG
GCATGGTTGAGCTTATTGTGTACAAGTCAGTTGTTTTGCAGAATTGTTTA
TTTATTGCATTATAGAAGAAAGCTTCTTAATCTTCCTACTATACCTGATT
TAAAATGGTTACTTTTACAGAAAATATGCAACATTTGCAGGATGGTCAAT
GGTATTTCTAATATTTCTAAGCGCCTTCTTGATGCAAGCATCTCGTAATG
GAAATGATCTTTGGTTAACTTACTGGGTTGATACCAGCACAGGTACCAAA
AATACAAGATTTTATTTGGTAAGAATGCTCTCTATCTAAGTGAACTGAAT
TTGAACAGTTATCTATAACTGCTCGCGCAGAAGACCATGTGTATGAAATA
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TTGCCACACAGGTTACATTCCTACTCATCTTAGTTCCCCTCTGGCTTATC
TACAGAAAAGTGCAGGTACTGTAGCATCCGTTTCTTTTTTTCATTAGTGA
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TCTCTAGCATAGCATACCTTTCAGGAGACCCTTCCACAAAACTGAAAAGA
GAATGTAATGAGCTCATGTGTAGTAGCACAGCCCATTGTTGTCAGCCTAA
ATACATTTACAATGTGGCTTTATTTTATACAGTTCGTATGACTTGTCTCA
CTGCACACATGGTGTACTTCTGGAGAAACACACTAATGTTCTGTGCAGTT
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GCTCACCTATCTATTCATCTTTTACAGAGACACTTGATGGTTCATCAACG
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AAACTACACAGGGGTATTTCTTAGAGAGATTCATCCAACATCTGACACTG
TATCAGAAAACATCTTACTCTGAGCTTATGGCTGGTCTGTGGCTCTCGTT
AAGACTCCAGGTATCCTTTGTCACATGATAATAACTTTATCTTCTGTTAT
GAAATTATGAACCTTTCTCTATCAGTTAGGCCTACTGCACAGTCAATGCA
GTAACCAGCAAACCGCTTTAGTTGTTGGCAGGGTCGATTATTTTGTTCAT
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ACAGAGACAGAGAAGGAAATGATTTCTGTTGAGAGGGTTGTTGAGGTAAA
AATAAAACAAAACAAAATTGGTTGTTACTGCATAGTTTGCTTTGATAATT
CGACAAAAATGCTTGCAGTATGTTGGTATACCTCAAGAAGAACTCCAGGG
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ATCTCATTCCATGTTGCATCTGGCATGCAGGTATGGTACTGTTTGCACAT
TTTTGTTAAATCGTTCGCAAAACCACCATTAAACTGCCCTGGTTTACTAG
GTTGGAATAATAGGAAGGACCGGAGCTGGCAAATCCAGTATACTGAATGC
ACTTTTCCGTTTAGCTCCAATATGCAATGGCCGCATCTTAGTAGACGGCT
TTGATGTGACCAAAGTTGCTGTCCGAGATCTTCGTGGACATTTTGCAGTA
GTACCCCAGAGTCCGTTTCTGTTTGATGGTTCTTTGAGGTAATCTATTAG
TTGCTCTTATTTATCATTTCTGGCTTCTACTTTCATGGTTGGATTTGTTG
GAGATTTGGAGAAAAACAACAGAAACCTATGTCCAGCATTCTAACTTTTA
GTTGACATTGTCACTACAGGGAAAACCTAGACCCTTTCAGTATAACAACA
GATGTCATGATATGGGAAGCTCTTGAAAAATGCCATATGAAGGTAGAGGT
CCAATCAATTGGAGGACTTAGTATCCATGTGAAAGAAAGTGGTGGATCCT
TCTCAGTAGGCCAGCGACAACTCCTATGTCTCGCCCGCGCCATCCTAAAA
TCTTCGAAGGTATACTGATTTACGGGTGCGATTTTACCTGTACTACGCTG
GTGTTTCAAAACCTTCTGCAATTTTCATCAGCAGTAAAAGATTATGGTAG
ATACCAAGTTGTGGTGCCTTGTAGATGCTCAAAGAAGTTAAACTTGTGCT
AATATTTCTACAGGTTCTTTGCCTCGATGAGTGCACAGCCAACGTTGATA
ATCAGACAGCAATCCTGTTACAGAACACTATCTCTGCTGAGTGCAAAGGC
ATGACAGTCCTCACCATAGCCCATCGCATTTCAACGGTGATGAAGATGGA
CAATATTCTAGTTCTTGATCAAGGCAAACTGGTAAATTCATGCTATTTAT
GTTCTTGTAACTTCTTGGTAATGAGATTACTCAAAAAAGTCAAATCTAGA
TGCAAATTAGAAAATTCCACGGAAAAGAAGTAGCTGTACCACAAATCAGA
CACCCACCTGCAGTTCAAATCACTAGACGCCCTTCACTCATGAAGTTAGC
ATGTTTTCTAACTCCATTGCCTCTAAATTTAGGTTGAAGAAGGAAACCCA
GAGGTTCTCATGAACGACAGCTGCTCAAGATTCTCCCGATTCGCGAAGGC
ATCTACGATGTGATTCCATGAAAGATCATGTGCTACTCTGTTATACCAGG
GGAAAACGCTAGGGCTTAGTTATAACTCAATTTGATCATTCCCCCGATGA
GCGCGCTAGGGCAGCTACTATAGCCAATAGCTGTCTAACAGAATGTGTGA
TCCTCCAGGTTTTCTTGGAGACCTTGTGATTCTTTAGCCTATGATGAACT
GGTTGAGCATTTGTCGTTAATACAAACGTTTCCTGATATGGAACTAGGAT
GGGATCTACTACTGTAGTACTACATTACTTGTTCAAAGTTAGTAGAAATG
AACCAGGCTAATTACTCACAAAAGCAGCAATCAATTCGGCACTGAGCCAG
GCAAGTAATAAGCAGGTAATAAACGAAACCCAAGCCATGGTACCAGCAAA
TCTTGATCCAGTTCAAGTAGTAGTAGTATGTAAACCCGTCTAAACTGAAG
ATATACAAGGGGAAGAAACAGGCCTGACATTCTACTAACCTATTTATAAC
CCCATAGAGAGGACCAGCACACGGCAGGGGAGGGAGGGAGGATGCGCGCA
CGGCTTGACCGCAGGGTGGATCATCAGGCGACGTAGATGTAGTCGTCGGG
GTCGCCGCGGCGGACGCGTTCGGGGTCGACGGAGAGGATGACGTAGGCGG
CGTAGAGGACGCCCGGCAGGTAGCCGAGGATGGTGAGCAGAACGCTGATC
CAGAACTCCATCTGACGGAAGGAGTGAATTAGGTGGTGGATAAAGGGGTA
GGGGAGATTAGAGAGGGGACATGGGGAATTAGTACGTACGGAGCAGCAGC
CGTGGCGGAGGCAGACGCCGAGGGGCGGGAGGAGGATGGCGCAGAGGATC
TCCAGGCACCGGCAGCAGCACGAGCACAGCCCCATCTCCCTCCCTTCCCC
GCGCGCCGCGGTTGCTTGCTTGCTGCCCCTGGCTGCTCGCTCGCGGTCGC
CGGACTCGGAAGCGGAGGTGGTTCTCGACGGGCCAACGATGGGTGCGTGC
GTGGCTCTGTTTTCCCGACTCGGCTAGGGGGCTATGGCCACAGCCGGACA
CGCGGACTCAACAGGCGAAGGTTTGCGCGAACACGGCAGTGTCGGCAGCG
CCAGTTGACTTCGCCCCGTCAAAACCCAAGTTTCACACGGCAGC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.