Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA002816

[Submit comment/correction]

Sequence
AA002816
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA002816
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CGTCGCCAGCACACGAGCACGTCGGCAAGAGCTCACGGGGTGGAGCCCGA
AACCACTCAAGCCTCAAGGTTACACGATCACGAAAAAGAAGAACATTCCA
CCCATCTCTTCCTTCCTCTCTCTCGCTGGGCCCCACTTCGCCTCCACGCG
GTCCAGCGGGACTCGACGCTTCCGTCGTAACCGACGCCTTTCCCTTCCGT
TCCGCCAGCCCATCCCCCTTGCCCGCCGCGTCCCACCCATCCGAGGAACC
AGACGGCGGCGATGGTGGGCGCTGGAGGCGGAGAGGCAGAGGGGCTGAGG
ACGGAGGAGTCCCCGTCCGGCGGCGTCGACGTCTGGAGCGACGCCGTATC
CTCCCACGCCCCGGAACACCTCCTCGTCATGGTCCACGGCATCCTCGGCA
GGTGCGCGCTCACCGCCCCCCTTCCTTCCCTCGTGGGTTTTATAGACTAC
GTAGTATCCATTCAGGAACTTGATCGAACAGCTCCTGTGCGTAGCGGGGA
CGGGATTGAAATTTTTTTGTTTTCCCTATTAGAGGGCGCCGACGGTCGGA
ATTCTATCGGTAAGGAATACGGGGCATTGAGTGTGCCATTGGGCTTTGCT
AGAGCGGAGTTGTGGGAATGGGGTTCGGCGGAGTGAGTTGGGACTGTCAA
CAATGGGGTTCGGCGGAGTGAGTTGGGACTGTCAACAATGGGGTTCAGCG
GGTTGAGTCGGGTCTGTCTGAACTCTGAACTACTAGGTGCTGCGATCTGC
CTAATTGGATGGCTCAGCGCGTGTTTACGCCTCTGAGTGTTGTTGTTCAG
TTGCTCTTTTGGCGAAATGAGAGCATGAGACTGTCGTGTTCTGTTGGTTT
TGTTCGACACATGATGATCCAGCCAAATTAACCTTGTCCTCTGGAACTGA
AAGGATCTCATCGATCAGCATGGTATGTTAGTGGAAGGAGAAGGGTAAAT
ATAGCTCTGCGCTTCACGATCTGCCAAACCCCAATGCCGGCTATATATTT
CATGAGATGGAACTTCAAACTGCAGCATCTACAGAACTCAAATGTGATAC
CGTCGTAGAAAAGAGCATCATCCACCCATTCAGCTTCTCCAATGACCTGC
TGTTTCTTACTTACCTCACTTTAGGCTCACACCTCTCGGCTCCACATGGC
CTATCTAACTTCAGTATTTTGCAATGAATTTTAATGCTGCCAAAGTTGAA
GTTACTGCTCTCACTTATTGGAGTTATTCCTCAACCCTTTGAAGTTGGAA
TAGACAAGAAAAATCTAGTAGGTTATACGTATAAGACTGTTTGCATGCTT
TCTAATGACGCATTCCATTTCCAGTGACAGCTGGTGATTAATCTCTTCAA
TTATCAAATGGCATTACATTTCTGAAACCCCTTTCTTTGCTCAAATATTC
TCTTAGAGATCACTGATCAGTTTCTTGCGTTGAGCAGTACTACTGATTGG
CAATATGCAGCCAATGAATTCGTGAAGCAACTTCCCGATGATGTAATTGT
GCACTGTAAGTTGCTGCTTTTGTGCTTACCAACTATAGTGGCTAGTTTGT
AACTAGTTTTTTTTTTCTTTCATATCATCTGTTTGTTATCTTCTGGTCTT
TATTAAATTGATAATAAATAAAAATATATGTCTGCTTGACATGACGTAAA
TAAGAAACTGTTGGCCATTTTGTTGATTCTTACATTAACATACCTGAAAC
TTGAGTGAAGCCATCTCTTTTTTTATGAAGAGTGTGTCTCTTGTCTTTTC
TTGACATGTCACTGTTCAGAATGATGTCTCAATTCATACATCTGTTAGTT
TTGCTCTATTCTTAATTATGGATAAGGATTTTAGGGTAGCCACCCAGAAA
TAGTAAGCAAGAGTTCAATTAGTCGTCTATCATTATTGCAATCTTTTTGT
TAATGCTGCAATGAGATTTGTATATTCACAATGAACTATATAGATATCAA
CATGTTTTTTATGGGAGAACTTAAAATGACTAATATTTTCTACATGGTTC
GACTTCAATTTGAGTATTGTACCTGATTTATAGTGATTGCAATTTAAACA
TGAGCCTCTTTCTTAATTTGTAAAACTAACTGGAAACATGCAAAATCTGT
AAGTCTTCATGAAGATCATGTTATTTAGACTTATTTGTTCAAATTTGCAG
GTAGTGAGAAAAACATGAACACGTTGACTCTAGACGGTGTCGATGTTATG
GGAGAACGCTTAGCAGATGAGGTAAGTACCATATGCAACAGATGACTTCC
ACTTGAGAAGCTAAATATTTAGAGGCTACTTCATCCACCATATTGATTGT
CCTATTAAAATGATTCTGTGGGCCAAAACACTTTTTCACACAATCTTAGA
AATACTACCGTCTCCTCACATTTTTCTTTTGATACTTAGGTTCTTGATGT
AATCAGTCGAAAGCCCGAACTCACCAAAATTTCGTTTCTTGCACACTCTG
TTGGAGGCTTAGTAGCAAGATATGCAATCGCAAAACTTTATAGACATCCA
GATAGCACGTTTGACAGCAAAGCGGAAGGAACCATATGCGGGTTGGAAGC
ATTGAACTTTATAACGGTGGCAACGCCTCACCTTGGTTCTCGAGGAAACA
AGCAGGTACTTTGTTGACTTGTTTTCCCGATGACCCCCTTTACTTTTCCA
ATGTATCTATATTTGATGAAATATTTTGGAACTTATGCATAATCATTCAC
CCATTTGTTCTAATAATTCAGTTTTCTGTATATCAAATATGTATATTTTT
GCCAACCTCGTATACTCATATATTTAGAGTCGTTGGAATATACAAGAAAT
GTTTTGATACTTGATTTCCATGCGTAGTTTGTATTTCTTGGCTTCGGATC
ATTTGATTCACATGAAATGGCCCCACACTAGACACCTAAATCTTCCAAAC
TTTCGGAGATAGAAAGAGAAAATGGATTTTAGATTTTTCTTATAAGAAAT
AAGAAACTTAATAAACTGTTGGCATGCCATTGCCTCTAAGCTCTGTCCCT
GGAAAAATATAAAAATACCTCTCAAAATGTCTGCAAGACTTCCTGTCATT
CTTCATAGATTCTTAACCTCCATAGTTTTGTTTTTGTTGCCTTAAAAACA
TGTGATGCACATAAAAGGCTCCACCTTGGGGCATCGTACGGACAGGGCCG
GACAAGCCAACCCATTTTGTCCGAGGGCGACCCTTTTCAGAAAAAAGGAC
ACTTGTCGTGTTCGAAATGGGTCTCCTCGCCGGAGATGCCCTTAGATATC
CAAAATGGGAAGCCATTGGAGATACCCTTAATAATAGGGTTTGCAACAGT
GAGGATTGTCTGATGTCGGGGTGCGTTGGTGCGTATGAACTAAAAACAGC
AGCACAAACACGGGGTTGACACGGGCACTGACTGGTGGGGACCAACATTT
CAGCTGGATCTTCGGCAGATTCCTTAATAATAGGGTTTGCAGCAGATGCC
AGGGTGCTTTGGTGCGTATGAACTGAAAACAGCAGCATGGACACGGGGTT
GACATGGGCACTGACTGGTGGGGACCAACATTTCAGCTGGATCATGTCCG
AGGGCGATGTGAGGTCGAGTCGACACGGAGCCACGGACTAGTTGCTCACA
TTTGGTTTCCTTGTAGCCTTTTTTTATATGGCATGTGTATCTTCGGCTGG
CCCAAACATCCTTCCTGACCAGTCCGCTCCGTTCCATGGGCCATGGCCGG
CGCTGGCGGCCTCCACCGCCTAGCCCAACCCCAGATGAAACGTTGGTCCC
CACCGGTCAGCGCTCGTGTCAACCCCGTGTCCATGCTGCTGTTTTCAGTT
CATACGCACCAAAGCACCCCGGCATCTGCTGCAAACCCTATTATTAAGGA
TATCTCCAATGGCTTCCTACTTCGGCTATCTAAGGGCATCTCCAGCGAGG
AGACCCTTTTTGAACACGAGAAGAGCCCGATTTTGTCCGAAATGGGTCGC
CCCCGGACAAAATGGATTGGCTTGTCCGGCCCTATCCACGAGAACCTAAT
ATTTTTGATGTGAATGTTTTTCACTGTTACAAATTAGGTTCCACTTCTCT
TTGGATTCATTACAATGGAGAAAGTTGCTTCGCGTGTCGTCCATTGGATA
TTTAGGAGAACTGGGAGACATCTTTTTCTCACTGATAATGACGAGGGAGA
ACCACCACTGTTGCAGCGTATGGTCGAAGATTATGGCGATCTTTACTTTA
TGTAAGGTTTATGTTATTTTGATTACTTCGCATCATGTCTATTCCAATTG
CATATATGTTTTGTTCATTCTGCCTCGTGTAGTGTACGTGATACTAATTC
TGGTTAAAAACACTCCATTTAGATCTGCTCTGCGAGCATTTAAACGGCGT
GTGGTATATGCCAATGCTGATTGTGACCGTATCCTATGTATTCGAAATGT
AGTACTTGAACTATTCCTTTTTATTTGGACTTTTAGCTTTTACTCGCCAG
TTCCTTAATTCATGACATTCAGACATTGTTGGCTGGAGAACATCATCTAT
TAGAAGAAACACCGAGCTGCCTAAGGTACTTTTTTATTGGTTTCTGATTG
TTCAAGCCTACTGGGCCTTTCTCTAAAAGGACAACATGATTTTCTCATAT
CACAGTTCTTATTGTTTTTTTTTCTTGATGATTTGCAGTGGGAGGAATCC
TTATCTGAGAAGTATCCCCACATTGTACATGAGGAACACTCAGAAGCAAT
CGACCGTGAGAAGTGTCAGGCATTGGCAACAGACTGCGACTTGGACTTAT
TGGAAGGTTTGTTTAGCTTGTTGCATGCAGAATTTATTTTGTCTTCCGTT
TTTAACAATTGTATGGAATCCATTCCTGTTCCATTTTGTTCATACTATAT
CGATGTTCTTGCATGCTTAATCTTCACTACGCATAATATTTGCAACATTA
CATAGTTGATAAATCAATCCAACACTTTTGAGCTCAGTTATACCAGTTTA
ATCGTAAAACAACAAGATGCTGTTTTCCATTAACTTTTTAGTGTGTCATT
TTAGTCTTACCACTGGACACTCGTTAATATTTTGAATGGAACCATCACAC
CAGTGCCCCCTAATAATAATTAAGAAGACTAAATGATTTGGGAGGATCTA
TGCAGTTCCACATCCAAAGGTCTCACTTTTGACATTAGAGGTTCATGTAA
ATCCCAGGGACTGTTGTCCTTTGAAGTTCCATACAGGAGCATGACCTAAC
ATAATATGGCAACTCGGTGATGTAGTCTAGCTGTTTTATTTATGTGTGGA
TGGCTAACATAGTAAAGTCCACAAATATCTTACTCATAAGGAGGATTGTT
AAAAGACTTGCATGTTGTCAGTGCCACCCAGGGATCTACTGGTTAGCACC
TCAAAACTAGATTGGCGTGTGCTACTTGGCAGTCAACACATGGAGTCTAT
ATGGATCATACGATAATTTTTTTCTTCAACACCGCTCCTTAACAGTATAG
TCTCAGATCTGTTCCTGCGTGGAAGTTACCCCGCTGTTCCATGTTGACTC
ATTCATGTGATGCCATACGCCTTCAGCGATTCTGATCTTTCCTGAGATAG
ATCCAGACATAATATCTGCAAAGTAGTCTGGATAGTGATATTCAAATACC
TATAACATTTTGGCACACAGGTGTCCTTTCTTACGTATGTGCACAGGTAT
TCCTGTCATGATGGTTTTGTTGTGTAGACACCTGATTTGTTGACTTGATG
ACGTGGAAGTTAAGACTTTTTCAAGTTTGCCATAACTAATTGTCAAGCAA
GTTTTTGTTCAAAGTTGATTTCTGGCGTTCAACATTCCAACTAGATGACT
GCAATCTTGGTGGGGCACTATACAAGGCTATTTTGTCTTATGTTTCTCAT
TGCGCTACTGGTTACAATGACGTAGGTCTGTATTGTAAAAAAAGTTGCAA
GAAACATAAGATAAAGTACCTTCATTGTTCATTAGTAAAGTCTGAAGTAC
ACTTGATCTGTTTTTTTTAAATCCCCATCCTGGAAGATTGTGAGAACACC
TTTCGTAAACTGACATTAGTGTTCCTTTTCCGGTTATGCTATTGTGTAGA
AAAAATGGTGACAGGGCTTAGAAGCGTTTCGTGGGATAAGGTAGACGTTA
GCTTCCGCACCAGCATGGGGAGTTTCGCAGCACACAGCATTATCCAGGTA
TCTCACCTGCTTTCTCCCTGTATTGTACTATATAAGACTTGGTATATTCT
TGGACAAGTAAAAATTCATGACTAAGTAATCCCTTATCCGGATTGCAGGT
CAAGTATACGTTTATGAACGAAGGAGCTGACGTCATACAACACATAATCG
ACCACTTCCAGGTCTGAGAGTTTTTTTGTGGAACACGCATGTGGGTTGAC
ACTGCTGACTCGGGATCTTGGCCAGCATCCCAACCCGGCCCTGCAGAATG
CAGAGCAAATGTACTTTGCACAGATTAGTTGAAGGAAAACCACATGGGAG
GTCTTGTACTGTATTATTGCTTAGTTACAAAGAAATGCGTTTGTAGTAAC
TGTATGTAATGATCGTTACCATCGCATATATTGAGAAAACATGGTCCCTA
TATATCTGTCAGCAATGCAATGTGGCTATTCGCAGAGGATGTA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.