Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA002109

[Submit comment/correction]

Sequence
AA002109
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA002109
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCTTGCCCCTTGCCCGGCAGATCTCTCCACTGGTCATCTGCTGGAAGGAA
ACCCTCGGCTCGCTCGAGCTCTCTCGCACGCGACAGGGAGGTGGCGGCGC
TGGGTGCGACGCCCCAGTCCCACCAAATCTCCGGCGACAGTATCCTCTCC
GCCGGTCTTCCTTCTCCCTCCTCTCTCCCCCCATCGCGCGACACGAGCCA
GCGACGAGCGACGCTAGGGTTCGACTCGCCCGCGCCGCCATCCCGCAGTA
GGCCGCCGCTCCGCCACTCCCGCCGGCGACCCTCCGCCTCCTCCGTCCTC
CGCCGTCCTCCCTCAGTCTCCGGCCGGAACCCACCGTCCTCGCCCGCCTC
CGCCTCTCCCGCCCGCTCCCGCAAGGTCGACGGCGCCAACAACCTCCGAG
CTGGCCTCGTCCCCGCCGACAGACGCCCTCCTCCGCCGACCTCGACTTCG
CCCGCTCCTCCCCAGACGACCTCCCGCAAGGTGAGCCTCCCGTCTTTTCA
GCTCCTGTGGGTTCTTGCTGCTGTACATGCTGTCATGCTGATTGCTGCTG
GTACTGATGTTGCTACTATGATCTTGATTGATGCTGTTATATTGATTGAT
GCTTGTGACAATGCTTGCTGCTGTTACTGATGTGATGATGCTTTTATGGA
GAAAAAATGATTTAGATACTTGTGCAGATTTTAGATACTTGTATGGAAAA
AGATTTATGCTATTGCTATGCTTGTTGCCGGTACTTATTTTAGATACTGA
ACTAAGTAGGAGGACCAAATAGCAAAAATGGACTTAGTTTAGTGCTAACG
ATGCTGAACCATACCATACTAATTCTATTTTCAACAGTAGGCTGAACCGT
ACCAATTCTATTTTCAACAGTAGATGCTCTAGTAGCACTGTTCCGGTGCC
AGGTAGTACAACAAATTCTGAAAACTAACTTCAGGTTGTGCAAAGGACCA
ATTAAACGTACTAGTGCCTTGACCAACTTTGTAGGCCATGTTAACTAATC
ACTTACGGCTTAATCTGATTGTTCCTCTGTAAGTAGCACGGACTGATTTT
TTTTTTTGTCATGTCCTTGTGGTGCAGTTGATACCATTAACTTTGTACTC
GAGAGGGGATTTTCTAGAACTTGCACCTACATACAATTGTTTCGGAAAAG
TGTCGCTGGACTAATTGTCTCGGAAGTCAGCTCAACGATCTTGGAGGAGG
AAGACCTCGGGTTGCAGGTATGCTTTTTGTAGCCTTGTCCCCTGCTATGC
AGTATGCCAGTAGACCTTCTGTAATTTCTTTGAGATAATCGAACCTCTGT
CGTATATATCCTGGGATGTGCTCATAAGATCTATGCCATGACTCTATCCT
GTGTGTTTGGCCTGCTTATGCTTATGTTGATAAGCAAATTACTGCTGTAG
TATTCGTTGTCCTTTCTCATTTAACGATGTTAACTAATCACTTTAACGAT
TACTCCCTCCGTTTCAAAATATAAGATGTTTTAGGTTTGTGAAGAAAGTG
TATGTAGACTTCTTTTAGTGTATAGATTCACTCTAAACATGAGTGAACCT
ACATACTAAAAGTAGTCTAGATACATTTGCTTCACAAAGCTAAAACATCT
TATATTTTGAAACGGAGGGAGTACTTGTTATTTTTTCTGCAAAATTCTCG
ACTATTTTCTGCTGTAGACTTCAGGCCACATGATATGAATCCTTAAATTT
GACAACTAGAACTATTTCTCGCTTTGACAGCAAGGACTGAACGTGGTTGT
CATGTTCTTGTGATGCAGGTGACACCATTACCTTGTCTGCAAGAGGATTT
TTTTCTACAAATTGCACCTGCATACAATTGCTGGATTAATTGTTTCAGGA
GTCAGCTCGATAATCTTGGAGGAATAAGGGTCCGCAGAAAGACCCTTGGG
AAATAAAAACCCTAAAACCCTAAAATGCTACTGTCAACCCTAAAACCCTG
GGAAATAAAATGCTACTGTCACTTCTAGACCCGCGGAAAGATTTAATCCG
CAAGAGACTGGGATGAATTGGAGCGTCTGTTTGTCCCAGGAAGAGGGATT
CCACTAGATTGCTCGCAGCGAAGGAACGGACACAAGAGAACTCCTAAAAG
GAAGCAAGCAAGTTAGGGTTGAATAGTTGATCCCTCTTCCTGGGACGAAC
GGCCACTCCAATCCATCCCAGTCTCTTGTGGATTAAATATTTCCGTGGGT
GCAGTGACAGTACCATTTTATTTCCCAAGGTTTTAGGGTTGAATAGCTGG
ACCCCCATTCCCATTTCCCACGTTGTGCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCG
CGCGCGCGCGCGCTTAGCGTAGCTTGCTGGAACCGATTCATGTCATTTTT
GTTTTCCTGGCCCGTCTGTTCTGGTCATTTCTGCAAGTTCTTAATAAAGA
TTTGATTTCATGGTCTAGTAATTTCTGTCCGTGATTGTGGAAGTGAATCA
ATGATAATCTCCTTTTTGGTGCTGTGGTGGTTTAGGGTTTTAAACTAGTT
CTGTTTTTGCTGGTACCACTGGAATCTTGCAAGCCGGCAATTGTTTGCAT
AATCCCCAACATTCTTGGTATGCTAAGCAGTAATTCTAGTCTAGCGCTGC
TGCTCCTATCCATTCCTGTCTGCAGATAGTGTTTTAAGTAATGTTTCTAA
TGCTCTCCTGCTGCAGTGAGCTTATGTTTCTGAAGTGATATGCAGGTCGT
ACTGAAGAATGGAAGAGGTGGAGAATGCCAGCAAGCGGAAAGTACCCGAG
CTGGATTCAGAAGACAATTCCACTGCTGCTATTACGGATGGGCAGCAGTC
GCTCCCTGGCTCGGCTGCCAAGCGTCCGAACCTCTCCCGGTCATGCATCC
ATGAGGTTGCTGTCCCTAACGGCTACGATTTGCCCAAGGATGAGGCTGTA
CATGGGACCCTTTCAAACCCTGCGTTTAATGGGGAGATGGCCAAGACGTA
CCCATTTCAGCTCGACCCCTTCCAGAGTGTCTCCATCGCATGCTTGGAGC
GGAATGAATCTGTCTTGGTCTCAGCTCACACCTCCGCGGGGAAGACAGCC
ATTGCTGAGTACGCCATTGCAATGTCATTCAGAGACAAGCAGAGGGTCAT
ATACACCTCTCCGTTGAAGGCTCTGAGCAATCAGAAGTACAGGGAGCTTA
GTCAGGAGTTCTCTGATGTTGGTTTGATGACTGGTGATGTCACGCTTCAG
CCAAATGCCACTTGCCTGGTCATGACGACGGAAATCCTGAGGGCGATGCT
TTATAGGGGCTCCGAGGTGATCAAGGAAGTTGGTTGGGTTATATTTGATG
AGATCCACTACATGAAGGATCGTGAGAGAGGCGTTGTCTGGGAAGAGAGT
ATAGTCTTCCTCCCCCCTGCCATCAAGATGGTCTTTCTGTCTGCTACCAT
GTCAAATGCGACCGAGTTTGCTGAGTGGATATGCAATCTGCACAAGCAGC
CTTGTCACGTGGTCTACACAGACTTCAGACCGACACCGTTACAGCACTAT
GTGTTCCCAATAGGTGGGTCTGGTCTCTACCTCGTAGTAGATGAAAGTGG
TCAGTTCAGGGAGGATAATTTTCTGAAGTTGCAAGACACATTTGCAAAGC
AACCTAGCCAACTAGATGGGAGAAAGGGTGGTGGACCTAAAGCCAGTGGT
CGAATTGCAAAAGGTGGAAATGCTTCTGGAACTTCTGACATATACAGAAT
AGTCAAGGTAGGGCAAGATGAATTCTGGCCTTACTGTGCTTTCTAAATTT
ACAAACAATAGATGGTTTATGGTTTCTTCAAGGTGCATGCAGTTTTTAAA
TTTACCACCTACTAGGTTAGGAAAGTAGTCCGTCTCACTTGTGGATGTTC
ACTTTTAGTTGATGTTTTATACCTTGGTTTAATTTGTTTCAGTCATATCT
CGCTTAATTTTGATTAATGCTAATCTGCAGATGATTATGGAGCGCAAGTT
TCAACCAGTCATAATTTTCAGCTTTAGTAGAAGAGAATGTGAGCACCATG
CGATGTCAATGTCAAAACTTGATTTCAACACTGAAGAAGAAAAGGATAAC
ATTGAGCAGGTTTTCCGTAGTGCCATTCTATGTTTAAGCGAGGAAGATAG
AGGTTTACCTGCTATAGAGTTGATGTTGCCTCTTCTTCAACGAGGTATTG
CAGTACACCATTCTGGGCTGCTTCCAATAATTAAGGAGCTGGTGGAATTG
CTCTTCCAAGAAGGTCTTGTGAAAGCCCTCTTTGCTACCGAGACGGTGTG
CCCTTTTACCTGATCATCCCGCTTGATATTAAACTTGTTTTATTCCCTTT
CCATGTAGCATAATTTGGAATTATGTCCCGCAAAGGGACTTCTAGTTGTC
AGAGAAGTATTTTTTTATACTATTGAGTATGCATCTTGTACTCTTTAGGA
GCAGCATTTGATTAATGCATGATTGTTTTTTCTCAGTTTGCCATGGGGCT
CAACATGCCTGCAAAAACAGTTGTCTTCACATCTGTCAAAAAATGGGACG
GTGATAGTAACCGTTATATTGGTTCTGGAGAATATATACAGGTAAACCTG
ATGTGAATATGAACTGAAGTCAGGCATATAGGTTTAGTGGGTGGAATAGA
ATGTACAGGCCCTTACTGTGTCTTTGTATTCATTTTTAGATGAGTGGAAG
AGCTGGTCGGCGTGGCAAGGATGATCGTGGCATTTGTGTTATAATGATAG
ATGAGAAGGTAAGGTTGCGCAGTCTTACACTCTTACCTTGCAACTATTAT
TGTTTTTCTTCATAAATTTTATAGAGAACAATGATCATGCAAGGTGGTTT
GGTTTGTTGTTGTTGACTCAAGAAATCTAGCGCACTCTTTAAAATAAATA
TAATAATTTGATCAAATGCATCCAGTCAATTTTCTCTGTTGAAGTTCTCC
CATGAGATATCGTTCCATCTCATGCTTAACTTTGCTTCTCAATAGTTGTC
AAAATTTAATTTGTTCCAACTTCTTATTAGTCGTGTTAATATTCATTTTT
ATGCCATTGAGGCTGTCTTCCAAGACTTCTGCTTTGTTCCAAATTCATGC
TTGAATTGGCTGACATAAAGATTTATTTTGTAAGCCGTGATTCTTATGCA
ACATAAATACACTTTAAGCGTTTGGTTTGTGTTCACGTGCTTCCTTTAGT
TTGACTTGTAACCATTCGTCTTAACATGAGTTAAGTTTGCAGATGGAAAT
GAGTGTTATTAAGGACATGGTGTTAGGTAAACCAGCACCTCTCATCAGTA
CTTTCCGACTGAGCTACTACACAATTCTGAATTTACTGAGTCGTGCTGAG
GGCCAATTTACTGCTGAACATGTTATCCGGAATTCTTTCCACCAGTTCCA
GTATGAAAAGGTTTGTTTCAGGACCTGTTGTAGATGCTTCTCCTAACATG
TCGTTGGCAATGTAACAGATTAGCTTCTCTTGCTTTTCAGGCATTACCTG
AAGTGATTCAGAAGATTACAAAGTTGGAAAATGAAGCTAGCTTGCTGGAC
TCTTCTGGAGAGGTATGCTATTTTAATTGCAGTATACATTACTGTGCTTC
TGTTTGATTAACAATCTTTACACTTCTCCCTGTACAGAATGATCTTGCTG
AATATCACAAATTAGTGCTTGATATATCTGAACTTGAGAAGAAAATCATG
TCTGAGATGATAAGACCAGAAAGAGCTTTGTTATATTTGGTTCCTGGAAG
ACTGGTATGTAACTCCATTTCTCATAAGGTTTGCTTGGATGAGATGTATG
TACACCTTCATCAGTTATCACCGTCATATTTGACTGATGAGAAACAGCAT
TACAACAGCAATACTGTATCTACTTCTGTTCACCATTCTGTTTTTTCATT
AACTGTTGCTTTGTTATGATTATGATGTGGATTTTGTAAAATTTACACAA
ACTCCCTTGCACTGAGCAATTTGCATCATGGCAGGTTAAGGTGAGAGATG
GTTCAACAGATTGGGGATGGGGTGTGGTTGTAAATGTTGTGAAGAAACCT
GCAGGATCTAGTAGTCTCCCCCCTGCATTAAGTGCATCTCGCAGTAATAA
CTATATAGTGGATACCTTGCTCCATTGTTCATCTAGTTTGAACGAGAATG
GATCACGTTCAAAGCCATGCCCACCTCGTCCTGGGGAGAAGGGAGAGATG
CATGTGGTGAGTTGAAGCTTGTGACAAAGGGTTTTATTTTGGTGGCATAT
CTTCAGTTTGCTGGACTATCATTTTATGATAGTCATTAAGCATGGCGCAA
AATTTGCTTTGGACCAATGTTGAGGTTTTTGCAGGTGCCTGTACCATTAC
CTCTAGTATCTGGTCTAAGCAGCGTTAGAATCAACATTCCATCTGATCTA
CGACCACCTGAAGCAAGACAAAACATACTTTTTGCAGTTCAAGAACTAGG
AAAGCGTTACCCCCAAGGGCTTCCGAAGCTACATCCAATCACGGTGAAAA
TTCTTACACAATGTATCTTTTTAATCTGTTGTTAATTTTGCATGGCAACT
ATCATTTTCTTCTTACATAATGTCTTTTTATAAGCTATTTTTAATTTTGC
ATGGCAAGTATCATTTTCGTTTACAGAAACTAAAAATTCAAAATATGAGA
ACTCAAATATATCTTGTCATGATTTAGATGTACTTGAGCCAGCTCTTCAG
ATGAGATATAGCATATCTGTTTTTCCTCAATACATCGTCCACCATGATAC
ACAGGCAGAGAAAACAAATGATATAGCTGAAATACTGATATGATCTTCAC
CTGTTTGTTTATTATATCACATGTTCCCAAAACCCTTTGATGTTCTCTCT
TGGTCTACCTTATGTTATGTTAGCATTTCTTCCGCAGAGCATCATTTCCT
AAAATATATCATCTGGCATCCTTAAGCAATCTTTCAGAATCCAGGTGTCA
TTTTTTACATTTTGAGAATCTGATATTATCTGGTATAATATAAATAATAG
GACATGGGTATTGAAGAACCTGAATTAGTTGACGTGGTTCATAAACTTGA
GGTTCTCGAGCAGAAACTATGTTCTCACCCACTTCATAAGGTATGCCTTG
TCATGACCTTTCAATTAAGAAATGCCCCCTGTCAAAAAGAAAAATCTAGT
GCCTTTTTTATGCCGACTCACTTTTTTTTGGGGGTATTCTTGTGTCTTAG
TCTGATCAAAGTGACCAGCAACTGTCATGGTACCAAAGAAAAGCGGAACT
AAATCATGAAATTCAACAACTAAAGTCAAAGATGCGGGATTCACAGGTTG
GTTTAATTTTTGTGTACTTGATCATCTTTAAACAGCTTGAATGTGTTCTT
ACATTCTCCTCCATTCAGCTACAAAAATTTAGAGATGAACTAAAGAACCG
GTCTCGTGTTCTGAAAATGCTTGGTCACATTGATGCGGATGGTGTTCTCC
AGTTAAAGGGACGTGCTGCCTGTTTAATAGACACTGGGGATGAGCTGCTT
ATCACTGAACTTATGTTTAATGGTACCTCTTTAATGTGATTATGTCTTCA
GTTTTTTGTTAAGTTTATATTCAGTGCTGCATTAATATGTTTATGTGACT
AGGTACATTTAATGATCTGGATCATCATCAAGTTGCTTCCGTTGTTAGCT
GCTTTGTACCGTGTGAGAAGTCTAGTGAGCAAATACGCCTGAGAAATGAG
CTTTCTAAGCCAATGACGCAACTCCAAGAGGCTGCAAGAAAAATAGCTGA
GGTGCATTCTTGTATCATCACTGTTTTGCCATCCCCCCAGTCTCTATACT
TGATTGGGGTCTCTGATGTCTTGTTCTTGTTTTAGGTACAACGAGAATGC
AAATTGGACGTAAATGTGGAGGAGTACGTTGAATCTACTTGTAAACCCTA
CCTGATGGACGTCATATACTGCTGGTCGAAGGTTAGTCAGACTATGCAGT
TCATGATGCTAGAGATCTCTTTTTTCCGTGTTTTATTGGGAATATCTTAT
TTCTGATTTTGACAGTTGATCTTATCATGTATAATCTTCCCATCAATTGC
AATTTGTTTACCCATATGCCAATTTGTGGTTGTCTTTTCCACACAGGGCT
CCACCTTCGGAGAGGTTATAGAAATGACTGATATTTTTGAAGGAAGCATC
ATAAGGCTAGTTAGGAGGCTGGATGAATTTCTGAACCAGGTAGACCAACT
GTACCCCCCTCCCTGGATAGGATCGTATTCCACCTGTTGCTTCCCACCAT
TAGTACCTAAATCACTTGGACAATCAGAATGTTTGTCTTTGATTATCCTG
TTTGGCTCATTGTGCTTTTGGATACGAAATTGTCTGTCTTTGATCGTCCT
GTTTGGCTTCTATGGAAATGTCCATTAAAGTTTCAAATGTGCATTTACTC
TTGTCGTGGCATGACAAAATCTTACGTGCAAGTTGAAAGTTGGTTTCTCA
AGAGTAGTTTAACTAACTTCACAATCGGTTTACTGCCTGATGACATGACT
TGCTTGGCATAGTAATCAAGTGGTATTTACTCACATGCAAGGCCCTGCTG
GTACGAGGAAATGTAGTTAGATATGTAAGAAACGTTTCCAACTCCTTTAT
CATCTCCATATATGAATTGTGATTGGCATCCACTTTTTTCTACGCCCTTT
TCTGCATGCCCACCACTTCATTTTCCTGTTGCAATGTCTGTAGATAGTCA
TTAGAAGAATCAGACTCTCCTTGTTTTCCTTTTCAAACCAACTGACTGTG
TGAATCTATTGCCAGCTAAAAGCTGCTGCTGAAGCTGTTGGGGAGGTCAA
CCTTGAGAACAAGTTCGGATCCGCAAGCGAGAGCCTGCGCCGGGGCATCA
TGTTTGCGAACTCATTGTATCTGTGATGAGTGGAGCTCCATCAGTTGTAA
CGTAGATGTTGTCAAACCAAATGTAGCCTGTCTCTTTTGTGTTTTTGACG
TAGCATGGAAATGTAGTTCCTAATCAGTTGGTGTCAACCTTCTACCATAG
TAACCCAGCAGTTGTTCCATCAGAAGATTGAAAGCCATCTGATATACATC
AGCTTACCTATGGTTCATACATGTACACGTT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.