Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA019542

[Submit comment/correction]

Sequence	AA019542
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA019542
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	GGGGAACAACTTGGAATCAAGCGCAGAAGTGCGACACGGCCAAAGCGGCC GTCCTCATCTTCCCCTGACTCGAGTGCAAGTCGCCCACCCCGTCCACGTC CGTCCCCTTCCTCCACCCTGCTCCCGAATGCTCCACCACCAAACCACCTC CACCGACGGCAGGCGATCCAGCAACAATGACAAACCCACGAGCCCCAGTA AAAGACCATACAGTCCCTGCCGTTCTTGACCGGCAAACCCACGCGCCTCT CGAGTCTTGACTAGGCTCGCGGGCAATTTGGTCCACCGCTAATCTAATCA AAACCTCCCAAACCCAACAACGCCAACAGGCTAGTCGCACCCGCTCCCCC TCCCTCCCTCCCTCCTCCTCCTCCCCATTCCGTCCGCCTGAAGTCTCCAC GCTTCCGTCCATTTAAAACCTTCGCTTCGTCTCGACTCCACTTGGCCATT TCCCCTCGCCCAATCTCCGCTCGCGTCAAACCCTAGGGCCCCGGCTGACT CCCAACGCGTCCCCACCGAGTCTGCTCAGATCCAATGGGCGCGGCGCCGT CGACGCCGAGGCTGGGCGAGGCGGGCGCGGCGTCGCCGGGGGCCGCGGAG CAGATGTTCGCGGCTCTCGTCGGCGGCAAGGCCTACCCTATCTCCTCCGA GTTCTGGAGGCAGCTGCTCGAGCTGCCCCTCACCCTGCAGTGGCCGCGGG ACCGCGTGCTGCAGGCGTGCCACGCCTTCGGTGAGGACCGCTCGAGATCC GTGCCCACACCCCCTGCTGCGGTTGCTCTGATCGCTTCCGTTTGAGACAG CCTCTCGCCGTTGCTGATTATTTCGTGTTTTGCGGGATTTGATCTGTGGG GGCAATGCGGATCATGTGATTTCTGCCTGCTTGCGTGCGCGGGTGTGGGG GTTTTATCTAGTGCTTTCAGGTGAGACGGTGAGATCGGCGTGATGTTGCC TGCACTTTCGGCGCATCTATTGGTGTCATTGAGATGCTCTGGGTGCCGAT TTCTGTCGATCGTGAGCTGCATTGGTGCTTAGGAGGGGAATTCGGGGGCT GCTCAGTGACCCTTCTGGCCGATTTGATGGGTGTTTGATATCATGGATGA GGCAATAAGGCATATTTTTGTATTGGCTGCTGATCATGGTTGACTGAGCT TAGTGTGTTGCAATTGCAAGATGTGCAAAGTTATCAGGGGAGCTTTAGAC CTTTTGCAAAAAAAACAAAAATCATGTGAGTTCTTGTGCTCCTGGGCTTG TTTTCATTAAGTATTAGACTACTTTTGGAACAAGAGAAAGACCCACAGTT TACTCTTTTCGTAAGAAAGAGTAACTGTGGTTTCTTTTCCTGATAATCGA TTCCTTTTGGAGGGGGAACATGCCAATGGAGGTTCTGGCTCATTGTAGTT AGGATGAAGGATTTAGGTGCTAGTTCTAATTAATGGAATGCTGCAATAAA TGTTTGCTTTCGGAATTCAACTACTGGGTGCAACGCTAATGTGTGAATTA GGGACTTGGGCCTGCATTTCCACTTTATTTTTGCCACCACTGAGGGACCT CGTTTGTGGATTGGTCCATGTGGTGGAATCTGTGATTTTTTCGACTCATT CTGGTTAATAATATAAAATACTAATAGGTAGTTACGTGAGGCTATTTTTT GAACCCATAATTTTGCCCCGCATATTTGATAAGGTTCAAATAATTCTGGG TTTCTGGATTTGGAACCTGGTTGGTCAAGTGGTTAAGCATGCCTTTTGCT TTAGTGATTGTGATCCGTGGATAGTGGGTTATGATTAGCTGAATGGAGGT TGGTGTTTTAGTGCTTATAGGGGGTTAGACTGGGTATTTCTTGTTTCTCT TTTGTTTTTACAATACTGCTGTTTGTTGTGGACACTGCTAAAGTGGAAAG TAGGCATAAATCGTTTAAAGATTTACACTTCAATTTTCTTAGAGAGATGG ATATCAAATACAGAAGTGTGGTTATAGAAGGAAAACATGGTGGTTCCTAT GGGTGCCCTTTTGATGCACAGTTGCAAACTTGCAGTGCTTGGTATAGTGC CTCTTTTACTTCTTCTGTTGGACACATTCTATGTGTTCTCTTTGATAGAC ACAGTTGCAGACTTGCAGATGTAAATATTTTACTAGATTATATACCAGTT GTTAACTTGATGGCCCCAATGTTTTGGCTAATTTTCTATGATTGATTCCT CTAATTAATTCATAATCATCGTTTGCTCACTGGTCTGACTGTCAGAGTGA TGTGCATGTGCAGCCCAGAACAACTACACTACAAAGCATCTCGCGAAGAT CTTGATCCATTTGGTTTGGTGCTTGGATGAGTGCACATCCGCTTCTTCTG TATCTTATAGCACCTATAGAAAGGCTATCAATGCTGCCTATATATCATCC ATATTTCTCAAGTTCATTATTGAAAACGCCAAGGCAGATAACTGGCAAGA GCTATCCCTTGATATCGACAAGGATGAGAAGGGGATGGAAAATTTTCCTT CAGGTAATTGATTGTTCAAAATTCTAAATGCACTATTAATAGTTTCTGTA TCTCTGATATGCAAAACATGGTCATGCACTACACTACTACTAGACTATTG TTATCTTCATAAAATTCTTGCATTAAGCCGACTCTTATGATATCTTGTTT CCCTGCTTCTTCTAGACCAAAGTGTGGAGTATTTTCTGATGAAAGGGGTG CTGAACTACATTGGTAGTGTAGATGTAAGGTATCTTGATGGATGGCTTAT ATCTATCTACGGTTTCCTTTTTAGGAAGTTTTTTGTTCCCATTTGCATCT CACTCTTTTATTATTATTTTATATGAAGTCCGGAGTCATGCTACCTGCAT CACGAGCTTCTGAACCTGATGCTAGTTCTTATGTCGACCCAGTTATGTTC TGGACCATCTCCAGAACCCAAGGATGTGCATCCTTTCATTGATGCAGCTA TGCTGCAGGTAAAATGGAATCTCCTAATGCATTATGTATGATGGTTTATT TACTGTTACTATTGAGCTAAATTTGGGATGTGCTTCTTTGCCACATCTTT CTTCTGCAGGAAAGTTCCATTGTGACTTCAGTAGTTCAAAAGTTGCTGCT AACTTTTGTAAGGCGGCCACAAATTCCTGTAAATGGTTCACACGCTGTTT TCTCTGATGATGGTGGGCCTGGTGTTTTGCAACGAGTTGGCTCAGCAGCT GGTAATGCGGGTTCCTTTTTTCTGCATCAAAGTGCTTATAATTTACTGCA TTATCATCATGGTTTACTTCTTGGCAACTCATGTCATGTCAGTGCTTTGA ACATACCATCGTATAGGTACAATTTTTGTTTAGAATGTTCTAAATTTTTG TGTGCTTCCCACTATTATATTACTCAGAAAGTTGTCATATACACTTCAAT CATCCTTGTATGCCCTACTGAGAAAATATTTTCATTACCAATAATTTCTG ACTTCACTTATTTATCTGGTTTTGCAGCAAATTTTGTGCTACTGCCATAT TATACTTTTAACTATCTTGTAAGTGCAAATGCTGAAGGTGCAACTAGTCA GTTGGCAGATAATAGTTTACTTGTTTTGCTTGTTCTGATCCACTACCGAA AGTGCATCTCAACGAATGAGTCCATTCCAACCGACAGCGTCTACATGAGT GATTCAGATGCCAGTGTCAAGGATACACCAGCTTTTCATGAGAACCCTTA CTGCAAGGCGCTAAACAATGCTAACGACATTCAATGTAAGATGCAGCTTC CCTACAGAGAAATTGTGGCACTCGTATGCATCACTAACAGTTACAGAAAT GAATTATGCTGCAGTTGATCGTAATGATGTTGAGGGAAATGCTCAAAATG GACCTGTTGTCAGGTTGTCTTTTGCTTCGCTGTTTGATGCTCTCGGCACG TAAGTGATTCATCATCATTCTAATTTAGCAATATGCTCACAATTTTATGT ACTCCCTCCGGTCCAAATTAATGGACTCAACTTTGTCTAGATACACATGC ATCTAGTCTAAATACTCAACTAGATACATATGAATCTAGAAAAAGTTGAG TCCATTAATATGGATCAGAGGGAGTATTAAGATTCATGCAATTTCACCAA ATATAGTCGTTAGCCTTAGGAAGCAGTCGATTAATAGGTGAAGTAAAAGT GTTAGCTTCCTGGAGCCATTCACAGAAAACAATGAGATTATTTTCTTTTT CTTCATCACAACTGAAACCTATCAGTGATTTTGGTCGATTATCAGGTTTG TTGGATAGAAATAACACTGCTCTTAGGCTCTTAGCAATGATTTTGGTTTT CTGAAGATTATGAATAGCATTGAACACGACACTCCAGATGGACTCTGTAT CATAGTTTCAGGGCTTGATGGATAGAAACAACACTGCTCTTAGGCTCTTA GCAATGATTTTGGTGATCTGAAGATTATGAATAACATTGGACACGGCACT CCAGATGGACTCTGCATCATAGTGTCAGGGCTTGATGGTTAAAAGTGAGA CTGCAGTGTAGTATTTCAGAACTAATGTTTTGGTATTACTAGTTTTGGCA TCTTCTCTGAGTCCATTATATCTAGGACCTATCATTATTTATTTAAGATT GAGCATCATGTCTAAGCAGACCTTAGTGGTGTATTTCATTTGTTTCCATT ATCCATTCAGATGCTTAAAAGATGAAAGCTCAGTTCTATTGCTCTACTCT TTGGTCCATGGGAACTGCAACTTTCAGGAGTATGTTCTGGTTCGAACAGA TTTGGATACTTTGGTATGTTTTTTTTGCAACTATGTCTGTAAGCCTTCTT GTTGAAGCATGTGGGCACTTAATATTCAGACATAATATAGCTTTTAATTA ATTAAACAGTTGTCTTCAAAACACTTCCATTTTCATGAGATAATATGTTA GCATTTAATGTGTTCTCATCTATATCCCTCCACGAATTAGCTTACACTAA TTGTTGGTGAATTACATACATAAATCTAAGATCTGTGACTCCACGTCAAC ATGAAATATCGGAAACTATATTCCATATAAAATAAACATGTAATAAAACC AAAGAGTGGTAGCTAAAGTAATAGCCCAACAGACACTTCTTGTGTGAGGT AACATATCCTTTGTTTAGATTTATAGGAAAATGCCATTTATTGACTGACT GAGTTGTTTCTCCTGAAATGCTGGAATATTGTGAGTTCTCATAATTTGTT TCTTTTTTTGACAGTTAATGCCTATTTTAGAAATGCTCTACAACGCATCA AGGAAGACTTCCAATCAGATCTATATGTTATTGATAATTCTCCTGATACT CAGTCAAGATTCAACCTTCAATGCTAGTGTGCACAAATTGGTAAGATAAC TAACTAACTAACCTTTTGTTTATTTAAATGATTTGCTGATGATTTAACAT TACACTTTTAGGTCCTTCCTAGTGTTCCTTGGTACCAGGAGCGCCTCATG CATCAAACATCTCTGGGATCTTTGATGGTCGTAATACTAATCCGAACCAT CAAGTATAACCTCTCCAAGCTACGAGTATGCACCTGAATTTTTTGTTATT TCAGGAAGTCAACGCATGTCAAATCTCGCCCTATGTTATTGATCATACTT TATTAGAAGTTTCCTTTTGCAGTACTGTTATCCATTCTTACAGTTTACAA CACGCTAGCTAAAAACTACTTTGGTTCATAACTGTCTAATGGCAAGCTTA TCTGTACTTGCAGGATGTTTACCTTCACACAAATTGTCTCGCAATTCTAG CGAATATGGGCCCTCATGTCCATAGGCTGAGCGCATATGCTTCTCAAAGG CTGGTTAGCCTCTTCGACATGCTTTCTCGCAAGTATGTTATCTTAATCTC CCTCTCTCTGGTTTTAACTTCTTGCACGTAAAGTTAACTGGTTATTTTAC TTTGCATGTTCCATCATCCAGGTATGCCAAATTAGCTGAGTTAAAAAATG ACAAAGCTCTCAAAGTTATATCTGATCAAATTGAAACAGACATCATCTCA GATGATATGGTACTCAAAAGTTATCTTGCATCGTAATAGCACCATTGTTT ATGTTTTCCTTTATAATTGTAAACAGTGGCTGTACTTTTGCAGTCAACAG AGCTTCACATATACACTGACTTCTTAAGAATCGTTCTGGAAATCATCAAT GCAATCCTGACATATGCATTGCCCAGAAATCCCGAGGTTTGTTAGTTACT GATGCAGTTTACCTGATAAGGCAGAACCAAACTGCTTCTAACATGCTCAT AAACAGGTTGTGTATGCTATATTGCACCGTCAAGAGGTTTTTGAGCCCTT TAAGAACCATCCTCGTTTCAATGAATTGCTTGAGAATATTTACACGGTAT GTCTTAAAGTACAACACTTCATAATCTTCTCTTCTCTAGACTCTGACCAC ATTCCATTTTCCTGAATTTGTCTGTCAGGTATTGGATTTCTTCAACAGTA GAATGGACATGCAACAGTTAGAGGGGGAATGGTCCGTGGACAAGGTTCTT GAGCTCATTAACAAAAATTGCCGTTCATGGCGCGGAGAAGGAATGAAGGT GAGAAACATATTCTGGCATCATTGTAATTTAACATAATTATATGGCTATG AGTTTGTGTGATCATATCTGGCATTTATTACCTCTACACCTAAAGTTCTT CTGGTATTAAGTCAGTGTCATAACAATATATGATTACACATTTTCCAGAT GTTTACGCAGTTACGATTTACATATGAGCAAGAAAGTCATCCTGAGGAAT TCTTCATTCCATATGCATGGCGGCTTATCCTATCACGAGGGTAAATACTT TCTGTTTGTGTATGCTGATTTTCGCATAAGATGCTTATTATCCTTATGCA AGTGATGTTCATAAAGACACCTAACTCATGCAGCTTGTTATACCGTAGAA CTGGCTTGGAACTGTTACTTTAGTTTATGGCATATTGGCTTGCAAGCTTG TCATAAGATTTTCACATATCGAATGCAATTTCGTAGTTAGTCCCCATTTG AATGTTGGCTTTGTCAGGGTTGTGGGACGAGTAAATCAACTAGAAATGAT ACTATAACTTTCTCCATCTCTCATGTCAATTAGACATTTTGCACGTTCGG AAAAGGATGTCACATATTTGTCTATTGGCATGTCTAGATACATGCGAATC TAGAGAGATGTGCGACATCCTTTTTCTGACGGAGGTAGTATAATAACTTG CTATATTGTCCTCATCTCACTGTGATATTTCCTCAACTGTTCCCTGCATT TAACAGATTCTCTTTCAATCCTGGTGCCATAAATCTGTTCCCGGTGGAGA TTCATGTTGATGTAAGTTGCTCTATTTTGTTTGCAAATCAATCAGGTTTC ATGCTTAGGCTCAATTTCAGCACAGTACCCAGAGTATCAAATGAGTACAT ATTACATATTCTTAGTTTCTGTTTCATTTGTTGTATTTGTAATAACGACG TCTCTGTTTATCAAAATGGATCGCTACCAGGATGCACCATCAGGCGTGCA AAAGGTTTAGAGATGATGTGGAACCTTTGGGATTCTGACAACACAGAGAA AAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.