Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA016009

[Submit comment/correction]

Sequence	AA016009
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA016009
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CTCAGAGCAACAGCCCGAAGGAAACACGTCGCTGCGGGCGCGCTACGTGG CCGCTGCTAGGGCACGGCGCGGTAGCGGTGGTCGTTTCGTTTCTCTCGGG AGCTGTACGCGAGCCTTCTAGTTCTAGTCGACGCGAGCGAGCGTCCACCA CCACCTCCTCCCCTGTTCCGTGCCGAATTTCTCCTCGGCGCCGCGATTTC TGGGTACGACCCTGAACCAACAGCAACGATAAGAATCAATTCGCCCGCCG TCCCCGCGCGGTCGGTCGCGCCGTATCCTCCCCTTCTCCTTTTCTCGCCA TGGCCACCACGGACCGTGCCCCGGAGCCCGCCTCTCCGCCGCCGCCGCCA CCGGCCGAGCGGGCCATGGGATTCGCCGAGCGCGCCGTCGCGGCGGCCGG CGCCGCCGTCGTCTCCGCGGTTCTCGTCAACCCCCTCGACGTCGCCAAGG TACGCGCCGCACCGCACCAATTGCCCATGCCCCGGACTCTCCGCCAGTTC ACCTGAACGAAGCGAACCCTCTTCCGCGAGTGCCGCCAATTTCCAGCGCC GTCGCGAGACTTCTGGTCTAGGTGAACATGGGCACTGTGGGTTCTGAAAA AATATAGAGGCCATACTTAAATTAAGGATCCTTTCTTGTTTTATAGTATG CAATTTCCATACTATTTTAATGTTTTGTGTCACCCACCTATTTAATTCCT GGCTTTGCTATCTATTTGTTATTATGCCCACTTATCAAAATACAGATCTT GTTCAAATTTTAGAGACCATATAGTATGATATTGCTATCTACTTCCTCCG ATGCTTCTTATAAAACGTTTTGGGAAGCTTAATTATCTTCCTGTAAAACG TCTTACAGAACGGTTCAGAGGGAGTATTTGTTATTCCCCATAAAATACAA TTGGTTAAAGTTTAGAGACGATGCAGTATGCACGCGGCGTTGGACCTATT TGTACATTACGGTGCTGCTATCTATTTGTTATTCCCACTTATCAAAATAC AAACATTGTTTAAATTTTAGAGCCTATATATTTATGTCATTGCTACTATT TGTTATTCCCCATAAAAATACAGATCTTGGTTAAATTTTAGAGACTATGC ATTGCGGTGTTGCTACCTATTTTTACATTATGGTGTTTCTATCTATTTGT TATTCCACTTACAAATATACGAATCTTGTTTAAATTTTAGAGACTTCACA TTTCGGCATTGCTATCTATTTGTTATGCATCAAAATACAAAACTTGTTTA AATTTTAGAGACTACATTGCGCAAGTGAGATGGAGATGCTTATGCCCATT GCAATGTCCTAAATATATTATACTAGTAGTTAAGCCAGCCATGTTCTTCT ACACTAGCTTTATTCTAGAGTCACTGTAATAGCACCCATCAATGTTTTGC CCGCAATTTCATCTACAATCAGTGTAATAGCAGAAAACGAATCGAACAAG TATATGTGAAACAGGCAAAGCTAAATACTTTTTACCATGCAAGGGGAGGT TGTCTATAGGGGCCCGAGGTGTTTTTTGATTCCGTTGTTAGTTTCAACTT GATTGAGGAAATTTCAAAAGTTCTCCGACCTGGTCAACACCTCTTCACTC TATTCCGACATTTTCTACGAACTACGATGCGATTCACCCGCCAGGAGGAA TGAAGCGAAATGGAGAAGGTAGATCCGTGAAGTGGAATGGAGGATAGTGA TGAAGCGGAATGGAGATGAGAGCCAATGGAGCAGCTTTGCAGCACAAAGA GAGAAAAGTGAATGCTATTGGAGGCCCTGGATGCAGGGATTGGTGGTAGA TGTTAGTTATAATGTAGTAAAGGATGAAGTGATCTGTGGTGTACTCTCTA CTCTAGCTTGTAGCAGCTTCCCTTCTCTCAAGCTTCTATTGGTCCATTGC GTGTTGATTGCAAACTTGAATACCTCTTTCAGTCCTCGTCATAGTAGACT GTGCCACCCTGCCAACTTGATTACCTCTTTCAGTCCTCGTCGCCACCCTG CCAACTTGATTACCTCTTTCACCCTGCCATGATTGTTGCTAGAGCTTTTA CTGAGGGGTAGTGTTTACACGTGTTACTATCAATATCACCTTTCTTTAGA AACAACCATGGCAGGGTGGCGCAGTCTACCACGACGAGGACGAAAGCGGA TAATAAAGTTTCAGTCAACACGCATTAAACCATAGAAACTGAAGAGAAGA CAAGCCGCTACGAGCTAGAGTAGTGAGTACACAACCGGCCACTTCATCCT TTGCTACATTACACCTACCATCTTAGCGTGGGAGAATCTGCTGCTGCACT GGTTGTAGGTGACATCGCAGGAAGAACATTGCTAGGTGCTACAGTGACTT TATAATAAAGCTACAGTAGAAGAACATGGTTGGCTTAACTGCGAATACAA TACTTAGGACATTGCGATGGGCACACGTGCCTCCATCTCATTTGCTCAAT GTAGTCTCTAAAATTTAAGCAAGATTTGTATTTTGATAAGTGGGCATAAC AAATAGATAGCAACGCAGTAATGTTAACTCTCTAATTTAAGCAAGATTTG TATTTTGATAATTGGGAATTACAAATAGATAGCAACACCATAATGTACAA ATAGGTAGCAACGCCGCAGTGCATAGTCTCTAAAATTTAACCAAGATCTG TATTTTTATGAAGAATAATAAATAAATAGCAACGCCATAATATAGTCTCT AAAATAAGATTTGTATTTTGATAAGTGGAATAACAAATAGATAGCAACAG CTGTAATGCAATGCAACACCCAAGCGCATAGACTCCAAAATTTAACCAAG ATCTGTATTTTTATGGGGAATAACAAATAGATAGCAACACTATAGTATAG TCTTTAAACTCTAAACAAGATCTGTATTTTGATAAGTGGGCATAGCAAAG CCAGAAATTAAATAGATAGGTGGGCACAAAACATATAATAGTATGGAAAC TGTATACTACAAAGCAAGAATGCAATCCTTTGCTTTCAATAGGATCGCTG TATTGCTGTCAGGCAAATTGATCGGGACTTGTGAGAAAATCTTTGAGGCG TTGCTGCCTTACCTTACGACTCTGGATATTGGTGTTAATTCAAACCTTAT TCTGTCTTGCAGACGAGACTACAGGCACAAGCCGCTGGAGTAGTCTACAA TCCGGTAAGCTTGCCACTCTATCCCACATAGCTTTTGATTGAAAGCAAAG TACCAACGATGCCAACCTTTTTTTTACGGGTCTGCTTCCTTTTCATTAAG AGAGAACAACAAGTTACAGGTTACAATTTTAAAAGTTCAGTTAGCTGTAC TAAAGTTTAACAAAGAGGTCTACATCCCGATCCAGTGATCTCCCTTGATT CCATCCTGACCCCAGACCTTTATCCCGTTTCTTATCTTGTCACACACAGC AAAAAAGTTGAGCACGCATGCATTTAAAATCCGAGTGTTCCGTTCCTGCC ATATGTGCCACCAGACGATCATGGCCACCCAAGAGAAATGGCTTCGTCTT CTGGCCTCATATATATTTTTCTTCTTCTAGCCTCATATATTTTTCTTGTG AGCTGTGTGTCCCTATCTATTTTCCCAAAAAATACATTAATAGTTGCATA CTTTTTGCGCTGGATAAACTGTCTGCCATACTCAGTTCTGACTTCTGATA ACAGTTACATGCTGGCAAGCAGATATATTTCTGTCTGGGTGGTTCATTAT TTTATTCCTTTTTCTTCTGAAAAAGTGTGTGGAATTTATTTTGCTAATTG CTTACATAAAAGTATGGCTTGCTTGTTTATTTGTTTTTCTTTGTAATACA TTGCTCAGATATGGTCAGATTTTAGGTGCTATCCATCGTGTAACCCTGGT GGACTAAAATTAAATGGTTTAGGGCCATCTTGCAGTCCTGAATGCTTTGA GTACAGAGGAACAGTTGATGTGTTCTCTAAGATCACTAGACAGGTAAATA CACTTGTTGATTTTTTCTTCATTGTGTTTTTCTGTTTTGGATTGATCATC TTATGTAACGATTTATGAGCCCCTGCAGGAAGGAATTTCTAAGCTATGGA GAGGTACTGGCGCTAGCTTAGCGTTAGCTGTACCAACGGTATATCCTTTC AGCTGACCAGGATTAGTATTCTGTTTGCACTAATAGATTATATTCCGTAG CTGTACAATTGCTTTTTATACCTTCATGAAAATCAGGACCAACTTACTGT CCTCCTGTGGAGTCTGGCATGATTTCTCTTGGTAAAATGTAAGAGTAATA AAAAATAATAATTGTGTAACTCATTTCGATGGAAAAATTATGGATCTGGA CATATATTGCTCTTTACAACCAAAACGGACGGAATGCCCTTGTCAAAAAA TAAACGACGACACGATAGCAGTAATGATCCCATACAGTATGAGGTGTTAA GATACTGGTCGAAATAAAGTGTGTAATAAAGATATTTTAATGGTTATTTG AGGTTTTGTTCTTTCTATAGGTATTAATGGAAACATGAAATACTTCAAAA TAAAATGCTTTAACCAAACACGTTAATGATTGGAGTCTAATGTATTTTTC CTTATCCTTGCGGATCTATACTTAATTATCAACATCATGGAATGATAGAA TTATACATTTAACATTTTATAGTACTTTGATTCGTATCTCAGTAGAAATT TATCGTCTTTCAGGTTGGGATATATCTGCCTTGTTATGACCTATTGCGCA ATTGGATTGAGGAATATTCTGATCACAGTTATCCCGAACTTAGGCCATAT GCCCCTCTCATTGCTGGCTCTGTTGCACGATCATTGGCATGCATAACTTG TTCCCCTATTGAGTTGGCAAGGACACGTATGCAGGTATTGAATCCTTTCT TCTCTACAAATACCATTATTAAAAACGAAAATGTATGTACTAACAAGTGA AAGGAGTGCCTGGTATGAAATTTCTCTTATATCCTGTCACCAACAGACCG TGTAGAGAAAAACTTTGTGAGAAATTATCAAAGCTGTATCATAAATGATG CTGTTAGAGAAGTAAAAGAAAAATATTTACTATCTTGTGATTCAACAGTA GTTCCCAGTACCTGCATATTACTAGCAACAGTTGAAAAGAAATTGAAACT TATTCTGGGTGCAACTTATTTCTATATGCCATTCTCTAGATATAATTATA TAATTTTATTGAATATACAGGCCTTCAAAGAATCAAGTGGTGGAGTGAAA TCCCCTGGAATGTGGAAGACTTGGCAAGGCATGCTTTCATCGAGGCAAAG CATCAGCCACCCTGAAAGTTGTATGTACTAGACTGATATACTGCCTGTTA GTGTGTAACTGACGAAGCAGTCAAACCATTTGCATGATGTCAGCACAATA ATTAACCATAGCAGCTACATTATTCTCATAAATTTTTGTACAAAAAACTA ACAGTTGCAGCTTTATACTCTTATTTGTTATTATTAAGCCATGTACTTTT GACAATACAGCTCGTGGATACCACCTTCTGTGGACTGGCATGGGAGCACA ACTTGCACGTGATGTACCCTTTTCAGCTATATGTTGGGCAGTTCTTGAAC CAGTGAGTGCTCTACTGAGTTTTGGTATATTATATTCTGATTTAGATAAT TTGAATTCATCCAAACCTCTAGAGTTAACTATTATATTCTGTACAGACTA GAAGACACTTATTAGGATTGTTAGTTGGTGAGCAAAGCAATGCAGCAGTT ATACTGGGGGCAAATTTCTCCGCTGGCTTCGTTGCTGGAGTTATCTCTTC TGGCATGACCTGTCCTCTGGATGTTGCCAAGACACGCAGACAAATAGAGG TAAGCTGATGGCCATCGGCTTATCACTAGTTTCTTGTGACTTCTCTCTAC TAAATTTTACTTTGTTAGACTATCTGATTTCGCTCATTCTTGGTGCTCAA ATGCTAACGATAACATGAAGTACCTTTTTTTTCACAATATTCTGCACCTA CTAAATTTACCGTTCTCATTTCAGAAGGATCCTGCTAGAGTATTGAACAT GAACACACGGCGCATACTGCTTGAGGTTTGGAGGTATTTTACAATTTTCG TTCAGTGAGAAACATGCTTACTAAGCACACACAAGAATCAGGCTTACTGA GCTGTACAAGTATGGAGTAACACATGTACTCCCTCCGATCCATAATAAGT GTCGTTGATTTAGTATAAAGTTGTACTAAATCAGCAACACTTATTATGGG TCGGAGGGAGTACTAGAAATCATCTTTCAAGATCACATGCGCTAATGAAC TAGTAGGTAAGGATGGAAGTGGGTACCTTTAGGGTACCCTCTACCCTCTC TAGTACAAAGAAATGAACTAAATTTTACAAATCATAACTTTTTGAGAAAT CCAGTTCATTTGTTTGTACTAGACTAAAAAAGAAGGCACCCTAAAGGTTC CAAACTGCCATCTCTACTAGTAGGTCTTGAAAGCAATAGTTATAGTAGCA ACAAGCATGTATCATGTCAGCCATTTTAGGCATGCTTAATGATGTTTCAT TTTAGTGCAAGTTTTTCGTACTGCTGCCATTGCATATAGTCTCTTGCATA TAGCATGTTTTCTTCACAATGCAAAGCCCTTAACGCTCGTAACATGCCAA TTGTCGCAGGAATGAAGGTATGAAGGGCCTATTTAGAGGCGCAGGCCCTC GTATGGCACGAGCAGGGCCTTCAGTGGGCATTGTTGTCTCTTCGTATGAA GTTGTCAAGTACATCATCCACAAAAAACATGCAGAGCTTTGAGATTAGAT GAATCTTTTGTACTCCCTCCGTCTGGAAATAAGTGAGTTAGATTTGTCAA GATTCAAATGTATCTAGATTTAGTGTATAGATACATATGAGACAAATGCA AGTTACTTATTTCTGGACGGAGGGAATAGATCTCAACTTCAGTAGAGGAT TCTGACCGGACATGGTTTCACTCTCTTGAAAGCCAGTTTACGTTGCATGC CTTAGCAGAAGGGAGGTTTGAGTGTTTTTGTTCTAATAAAAAGTAGAATT ACCAAATGTTATCATTCTCGTGATAAGTTTTGGATCCATGCTGTC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.