Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA035555

[Submit comment/correction]

Sequence	AA035555
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA035555
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGATGTGATCATGTGTGCTGTTCCCCCCATGATCTAATGGGGATTTTGA ACATTTTTGCTTGATAACAACAGATCTAGGCATGGGTAACAACTGATGTA TGTATGGGTAACAGTGGGATATGATCCCTTGATAACCTCAAAAATATGCA TGGGTAACATTGGACATGATCTGTTGATAACAGCAGTACTAAACTGTTAT GTGATAAAATTTTGAATTATGTCTATTTTGAGAAAAATGCGTGATAATGT GTGTGTATTGACATGGATAACTAGTGTTATGTTGGTATGATAACATCATG GTCTAATGGGGATTTGAACATTATTGCTTGATAACAACAGATATAGCCAT GGGTAACAAATGATGTATGTATGGGTAACAGTGGGTTATGATCCCTTGAT AACCTCAAAAATATGCATGGGTAACATTGGACAGGATCTGTTGATAACAG CAGTACTGAACTGTTATGTGCTAATTTTTTGATTCATGTCTATTTTGAGC AAAATGCATGATAATGTGTATGTATTGACATGGATAACTAATGTTATGTT GGTATGATAACATCATGGTCTAATGGGATTTTGAACATTATTGCTTGATA ACAACAGATCTAGCCATGGGTAACAACTGATGTATCTATGGGTAACAGTG GTATATGATCCCTTGATAACCTCAGAAATATGCATAGGTAACATTGGACA GGATCTGTTGATAACAGCAATACAAAACTGTTATGTGCTAAATTTTTGAT TCATGTCTATTTTGAGCAAAATGCATGATAATGTGTGTGTATTGACATGG ATAACTAATGTTATGTTGGTATGATAACATTAGCTTATTATCATGGGTAA TTTGTGTTCTGTTGGCATGATAAGATTAATTTGTGATCATGGGTAACTTA TGTACTGATGTGTAGATAAAATTCATTGATTTCAATAATACTAAATTCTG TATAATGTTTTTGTCAAATTTTGTTTATGATCTGTTTGCTAATGCTAATT TTTGAGCAAAATGCATGATATTATGCGTGCACTAACATGGATAACTTTGT GTTCTGTTTGCATGATAACATTAGGTTATGATGATTGATAACTTATGTAC TGATGGTATTGTTTTATTTTTTTCTATGAATTCTTGTGTATCATTATGGT TTAGTTTTGTATTTATTTTTTCATTTTAAATTGTTTGTAGTTTCCACGAT GCTGAGGAAACGTAAGGCTGCTGATAATGTTGTTGAGGATGAAAAACAAC CTGCCCGTAAACGTAACATGGCATCTCCTCCTGCCGTGACCGGTTTACTG GATTTTCTATTGAATGATCAAAGGCAGCAATTGAATCAATGGAGTTTGAT AGTTTGCTAAATATCAAGTGTTCATCACTGCACGACGCAGTTATGACTTG GTTTGCTAGTTTATATGACAAGCATACACGTTAATTTGTTGTGTCGCGTT GAGGAAGGATACCCCTCAACGGGGATAGTGTATTCAGATGTTTGGGTTTG CCGCTTGGTGAAAAGCCGGTTCCTTATTATGCTGATGCAGAAATTCAGGG TTCTCTTGCCCCTGCTCTTTTTCCTGATGATTCTGGCACACCTTTGAGAA CTCGAGTTTTCAAAATCTTGAAGGATATGACTTCATATGGAGATAAGTTC AAGCAAGTATATGTGATGTACATTGTGTCTACACTTCTATCACCCACCAC CAGAAACCGTGTTTGCCACAAGTGCTACCCTATCATGGTAAGTTTTGGTT GTAATGTCTGTTCATTTTCAATATATGAGTTTGGCTGGTAACTTATATGT TTTTGTGTTGATAACTTTCTGTTTGATGTGATGATGTAACACCCCGGTTC TGAAAAGACCGTGGCCTCTATGTGACATGTCAATCCTTGGATTGGTTCAT TGGCCCACAATAGAGTAAGATAGATAACATAGCAAAATATCCGTGTATCA TGAATAACGAAGGTCCAGAGTACCATTATTACAATAAAAGCTTAGCACAA AACTAGCTCAAATTATTCAGGTAGCAACATAAATAAAGTAAATCCTCCAT TCTTCAAATTGCCCACAAGTGAACAAGTGCCGAGTGGAGTACCGTGGCCT ATATCGATTACTCAGAATCGGAATAACCTGCAACATGAAACGTAGCAGCC CCGAAGGGTCAATACATGGAATGTATGGCAAGTAGAGCTAGTAAAGGAGA CAATAGTGCTAACATCTACATGCATATTTGGCAAGTGGAGCTATGTCTGG CTTGCATTTGCAATTACATTTGTCCTACTTTCATAAACAGTTTTTGATTT TCTTTGAAAGAATCCCAATTAAGTTAACCCAACAATATTAAAACAATTAT GAAATTAGAATGAGCGAGAAACATGTCATGGAATCAATATCTAGCAACTC AATTGTCCATAACCGGGGACACGGCTAATCGATTATATTATACACCCTGC AGAGGTTTGTACACTTTACCCATGTGACTTGGCCAGCCCAGCTTATACCA TCACTCTCATTTTGGTTGATGATAGGGAGAAGACCAAGAAGAGACTGTTC GGGAAGTAGCTCCTCAATCCCGACGCGCACCGGTCCAACCTACCAAAATT CTACATCTCTGGATACGCGGGTTCGAGTTACCACAACCTACTAAGTCCAA CCAACCGCCCATTCCATTATTGGCACATGGTTGTACACGTAAGCTACACA ATAAAGAATCCAATCATTCTCTCTTGATACCTGGGTGCCTTTCCGCAATG AAACCACCAAAAATTATCAATACCATCACACCCAGGAGATTCATTGATTA AGTTGTTTTAGTTTTCACAAACCAATACTTTTAGAAACAAGTCTCAATGA TGTAACCCAGCCCTCGTTCAACAAAGCATGTCTAAGCACATCTACCAACG GTGGTTCATCTACAAGGAAGGCTCTACCACATAATAGGACATAGCATAGC GATAGTATCATCCTACACATGCATCTACAAAATACACGACAATGCAATGA AAATAGTAGGACGATATCATGAAAAAAGTAGCATCTACTTGCCTTGGTTG TAGCGGTCGAAAGAACAATCCACACAGGAGCAAGCGTTGCACTCGTCACA ATCTACACGATACAATTGCAATCATAAACAAACAATCCACAAGCATATGC AACAAATATGATGCATGAAGGTATGCAAGGCAAGTGAATTGGTGCTACAG CTGCACCACATAATCCTAATCAATAATACTACTGATTGCATGCATGGAAA ATAGTTTTAGCGCAAGAAAAACTATTTATCAAAAGGTAGCGCTCAAAACT AGAGCTAGAACTCAAATAATTCACTACCAGTAGTAAACTATTTGTAAAAT CTTGGGAAAATTCTACCGCATAGGCATCGCTGATTAGAAACAGTACCAAT TGGAATTACTCAAAAAGGAATTATAAAACTCCCCGAGTAATTAAAACACT GCAGAAAGCCACTAGACAGTTTCTGCAGAAGTTTTTACTGTAAGCCTATC TTTTTAATTCACGATGAGATTCCTCTCTTTCCACTGAATCCAGGGACATA TCATACGCGATTTTTGGAGCTACGGATCTTTTTCTACGAATTTATTACTC CGAAAAGGCCACTAACTAGATTGATTAAACTATACTAAACCTTGCTGCAA AAGCCTGAACCAAAGGTACAGCAAGATTCTACACGACTCACTGAATCTAC ACATATTTTATTTGCAATGTTTGGCCAAGCGGTTTAATTACTATGCAATT TACAAGATTCTACCGAAATCTGTTAACTAAAAGGATTAACGAAATTAACC AGTCAACTGTGTCTGTTGACTGGTCAAAGCGTCTGCTGACTGGGCGTTGA CTGGGCGTCTGACTAGTCAACGCCCGAGTCTGATCGGTCAACGAACGATC TAAGCCGCCGATCTGAGATCTGACGATGGCTGCAGTCTTACCTGAAACAA ACGGCGAAACGGACGACGGCGAGTTCCGGACGGCGGCGGCGATCGGTTCC GGCGTCGGGGTTTTTCCTGCACGGAGGGAGACAGTCAACGAGCGGTTCAA GATCGTCAACGAGGCGCGCAAGACGGCGCGCGTACGTGCGGGCGTGCGTG CATGCGTGCGTGCGCAACGCGTAGGCGCGCAGCGAGTAGCGCGCGCGTAG GGCAGCAGCTAGTGCGCAGCAGCGCATGTGGCAAGGGCGAGGCGGCGGTG CTGCAGCAGCGCGCAGCGCAGCAGCACGCAGGCGCAGCAGGGTGGCGGCG GCGTGCCCAGCGAGTGGAGGCGGCACTGGCGCGGAGTGCGGGGCGGCGGG GTCGCGGCTGCAGCGCAGCACGCGGGCACTGGCGCGGCGATGGCGGTAGG CGGCGCGGCGGGTGGTGGCGGCGCGATGGCGGCTGTGGTGCGAGGTGCGG GCGGTGGCGAGGTGGGGGATGGCGCCGGCGGCGTGTACCTGCGGTGGCGG CGGGGACCGGCGGCGAGGATCGGCGGCGAGGAGGGCGACCGGCGGCGGCG GCCGAAGGGAGGAGGGCGGCGCGCAGGAGGGCGATGGCGGCAGGGCGATC GCGAGGAGGCGGGGTCTCGGGAGTCGCGCGGGGTGGCGCGGTTATCGAGG GCAGGCGGGGTCGGCTGCCAGGTGGGGTCCTTTTTGTGGGCCTCACGCGA AATCCTAAACTGAATCGGTTCGGAGTTGGTTTCGGACTCGGAAATCGGTC CGGAAATTCGGACGGTTTTCCGACGATTCACTAAAACGGCCGCAACTTCT CCGTACGAGCTCCGAATCGAGCGATTCTTGCTCCTACGGGTTCGTATAGT CGAGGGGAACAATCTAGGCCCAAGGTTTGAGCGAAACCGCTAGGCTACAA GGGTGGACAACGCTAGTCCTACTAAAGCCTCCCGCAGGAGCCTCGTAGCA AAGTAGAATAGGGTTTTGCAAATGGCGTTTCGCCGAACCTTTTCACTCGA CGGTTTTGCATGGAAAAGCATGATGCAATGATATGAATGATATGCAAGAC CAAATCTAAAATTTGGAATGTGACAGATGATAACCTGTGTGTTATAGGGG TGGTAACATTTTTTTTATGTTTCTGTGGTGGTGTATAATATATGTGCACG TTTTAATGTTATGTTGATAGTTTCTTTTGGTTCCTATAATTTCAGCACAA CATTGAAAATGTGTCCAAGTTCCAGTGGTGCAAGTTTGTTGCTGACCAAC TGCATGAGGAGCTTTCTAGTGGTAGTCATACACAGGCTTGCCTTTTTCTA TTGCAGGTACACATTGCTGTTTTTATATTGTGTGAATACTACTTTCTATA TTGAATTTTTTTTATGTTTTAGTTAGTGTACTTATTGTTTTCTTTGTCTG GTTTTTAATTTTTTTTCTTGCAGCTGCTTTATGTTGACTCACTAGATGTT AGTGGTTTGGATATTGATTTGCTGGAAGGGCGTTATGCTGTGAACATATG ATCAAGAGAGTTAATTGATAAAGTGTTGATTGCTGATCTGCAGAATGATG GGAATGCATATGGAAAGCTGGAGGTGTGTAATATATTTTTTAGCATTTGT GTTTTTATGTTGTTGATAACTTTTTATGTTTAAGTGTTGGTAACATGTTG TATATCTGTTTGATTACATTGAGTATAAATAGTGGGTAACTTATGTGTTT ATTGGGTGGTAACATGTAGGTTATAATGTGATTAAGTTGGATAATATGTA GAAAACTAGTTGATCACATTTGCTAATTATATATCTGTTTCTTTGTATAG TTGAAGCCTCAGTATGGCATGAGCTTTGGACTTTTTGGTGGCGCGCAAGG GTTTAACAAATGGTTTGACACTTGTGCAAACCCTAGTTGTTCAAATGAGG TGATATTTTTAGCATTTTGATATTGTACTTATCTTTTTATTGTCATGTTA CTTTTGTTTGTTTCTTGTTTTGGTAATGTTCTTGTTGTTTCCTTTCTTTT TATTTGTGCAGCAAAAGTCGGAGATAGCAAATCTTGTTGGCAGTTTTGCA TCTGATATTTTTGGGTTAATGAGTACCCTTTTGCAAGGCTTGACGGCTGT GCAAGGCAATGGCAACCCATTGGAGGAATATTCATGGGTGGAGCTAGATC AAGTGGTGCTCGTGGTGGTAGCTCAGGTGGTGCCTGTGGTGCTACCTCAA GTGGTGTCCGTGGATCTAGGCTTACTCGTTCTATCACTCGTGGAAGGAAT GTTCCACACACTAATGAAGTCTTGTCTCCTATTCTTCCTAGTGATAATAC AATTCCGAGGGATTTCAGTCAGCAGCAGTTCTGATAGCAGTGGAGATGAT GATGCTGAACGGTATGTCCGTGCTGACAGGAAGGGTAAGGGTGTTGTTGG TGGTCGTGCTGGTGGTTCTTCAAATGTCCAGCTATCTTTGACTTTCCCAG ATTCCAATGAAGATAAAATAATAGTCCAGGAGCAAGATCACCTGATTATC GTCATATGTCACCACCGGAAGCTAGGTCACCTGTTGTAGATCCTGTCTTA CCTGTAAACCGGGTGACTGATACTCCTGTTGTGGAAAAAACCCCTATTCG TGTGTATGAAAGGTCTAGGAAGAAGTCACGTCCGGTTGAGGATGTTGATA ATGTGATCAATTCTCGTATTGTTGAAGAGATTGATAATGAGATCAAGTCT CTTGTCTGCAAAGATTTGGGCCTTACTCCTGCCATGATGCGGGCTGCTAT TTCTGATAGATATGAGTGGGCATAATTATTTATCTCAGTCATTGGATAAC TTTACTATCTTAGTGTTGATAACTGTATCATTTTCATCTGATAACTTGTT TATGTTAATGTGGGTAACCTTTCTGTTTTATGTTTATTATGTTTATATAT ATTGATAACTGTATCATTTGTCATCTGATAACTTTTTTATGTTTATTATG ATAACTGTATCATTTTTCATCTGATAACTTCTTTATGTATATACTGATAA CTGTATCATTTCTCTCATGATAACTTCTTTATGTTATTATTGATAGTTGT ATCATTTTTCATCTTTTAACTTCTTTATGTTTATACTGATAACTGTAGCA TTTCTCTCATGATAACTTCTTTATGTTATTGTTGATAACTGTAGCATTTC TCACATGATAACTTCTTTATGTTAGTGTTTATAACTGTAGCATTTCTCAC TGGGTAACTGTAGTATATTTCATCTGATAACTTGTTTCTGTTCATGTTGG TAACTTTTCTGTTTTTTTGTTTATTATGTTTTGATTTTTTGTTTTTTGTT GGCAATTATTTATTACAGCAAGAAATTACCGAAGAAGACATCGGTGCCTG CTACAAGGTCTTCACCACGGTTGGCAAAACAGCGTTCTGCAGATGAAGGC ACATCTGTTATAGATGTTGATGCATCCTCTCATATTCCTTCACCTACTCA TGTTGAAGGACATTCTAATGTTGTTGCAACTCCTGATGTCGTGGATGCGC CTATTGTGAATCTTGAAGAGGTTATATCTGGTAGAGAAACATGTGGCAAT GGTGGTGCTTCTGAAGATCTTGCTGTGACGAGTGCACCTGCTACAATTGT AGTAGGATTATCTGTTGATGTGGCAATGGATGTAGCTCAACCAGTCTCGA GAGCTGCAGTGATTATGCATACCATTGATCAGCCTGTTAGCAGCAGCATT GTAAATATCATGGCAAACGAGATGGAGAACATCACGGAAGTTGCTGCTAC CACTAGAGATGCCCCTCATGTTGATGCCAATGTTGATGATTCCCCTTAGG TTGATGCCAATGTTGATGCAGGTGGTTTTGTTTGTCCTGATGGTGCTGTT CTTGTTCCTGCATCATCGCTGTTCACCAACTTGTAGCAGGTGCTACTTCT GTTGATGTTGCTGCAAGTCCTGCTGTTTGCTCGCTTGGAGATCCATCAAC CCAGGGTGAGAGTGAAAATGAGCCTTCTGTCTTGGATGATAGTACCCAAG AAGATGTACAACCTGTTTTATCCGCTCCTTTGGTTCCTGCGTCTAGTCTT TTTGACCCCCTATTAGGAGGCAGTCCAGTGTGCTCGAGACATCTGCTGGT CCTTCAAGTGGTGATGGAAGTTCTAAAGCTGAAGTCACCGTTATCAAGAA AGAAAAATTGGTTGCTCATGATGGAAAGATGAGTCTTGCTGTTGGGATAC CATTACATGTTTATAGGGATGTTATGTCGTATTTTGTGCCTGATGCGGAT CCTCCTGTTTCTCCTACTGCCGGTGCCCATGCGGAGCCTGCTCCTACTGT TGGTGTCTCTGTGCAGGCTGCTGCTACTGCTAGTGCACCTGCGCAGCCTG CTCCTGCTCAGCCTGATCTTCGTATTGTTGCACAAGGTGATTCTAGTGAT GTGCCTGTTTGTCATCACATTTCTGCTGATGCGGGTGATTTATTCCATGT TTTTGAAGCAGAAGATGTTCTTCCTTTGTCTTGGGCACCTTCTCCCAGCA CTGGTACACACCTTCACCCTAATAACTATATATATATGCCCTGGATCACT TTTATATATTAGTGCTGATAACTGTGTCTTATTTATGTTGGTAACCAACA CTGTTTTTTATTTTTCAAAGGTTTAAAATGCCTGCAACTTGATTATATGT TTGTCTTATATGCTTTTTTTATAATGTAAAACTTTATTCTTTTAATTATG ATTTATTTCATAGTTTATGATGTGTCTTTATCATTTTGTGCATTTTTGGT TTGTATTGATAACTTTATTTATATGCCCTTGATCACTTTTATATACCAGT GATGATAACTTTAGTTCATTTATGTTGGTAACCAACACTATTTTTATGCT GATAACTTTAGTAATAGATTATATGACATTAACAATTTGTTTTGTTTTGT CCCTTTTTCTTCTTGTCTTTCTTTTGGGACATATTCTATGCAGCTGTTAA CATATTGAACTTACTGAAAACGGGTGGTGATAAAAATGAGGGTGCGGACG GATCTAGTTAATTGTCCCTTTTGGATGACAAAATTGAAGATCATCGTTGT GATGGCTGTTTGGGGCTTGGGTTTCAAACTTGAAGATCATGATTCGGTTT CATGGCTGTTTGGTTCTGTTTTCTGACAGCCGTAGTTAAAATTAGGTTTC AATTTATGGGAACTTTTATTTTGTGATATGTTGTTGATGGAACAATTTGT TCTGTAATTTATATGACTCTATGTTTGTGTGATGTAATTAAACTACCTTT TATTGTTTAATATATGTTATGTTTATTAAATTTTTTCTTTATGGTGATAA ACATGTGGTTTTATTTTTCCACGTGGGGTCTGCCATTTCTATCCTTTTTC ATTTGGACATTTCCTTTGTCCGTTCTTTATTATTTTTGTAGTGTATCAAC AAAAAGTTGATTGTAATTACAAAAAGGCGCTAAATGATGAAAATGTAGTT ATTTCTCTTGATGATCTGTTGGGTGAAAAGATTGAGTATCAAGCTGTTCG GAGTTTTACGAAAGATACCAAACAGTTAAACCAGACTAGTTGTTCCATTC CAGCTAACTAAACAAAATTATTTAGTTATTATTTATGTATTTGAATGTAT ATTTTTTACGAGATGTACTATTTTTTTTGTTTTGTTGTAGTTGTTCCTGA TTATTCTACTCCTGGTATCAGTTCTTCTCTTCCAGTTGCTATCGCTGGTA GTGTTACACCTGTGACGTGGCTGCATACTGTTAGACTTATTCATCCTGCG AAGTCTCTTCTTCCTCCGTTCTCCTATATTAAGACAACTGCAGAAGAAGA TACATTGTATAAGAATATTATCATACACACGCGTGATGCGAATAAGTCGA AGATTAAAAAGTATGTACATGTTCTTTTTTTATAATATTCAATCCTTTTT AGTATTCTCTTTTGGTAACGTTTAAATGCTACCATTGGTCACTTCTAATG TTCCATGCTTGATAACTTGACTTATTATGTTATCTAGTTGATAAGTTGTA GTATTTCTGGTGGGTCACTTGTAGTATTTTAGTAGATAACTCTTAGTTTA ACAGTGTATAACTTGGACCTTTTCTTTGTTGTTAGTTGTTTGCTAACCTG TATTACTACTTGTGTATCATTTTGTTATTCTAGTTGCTGAACTTTATGGT TTTCATTGTGGATTATTTTTAATATTTAGGGTTGATAACTTTACCTTTTT ATTTGTACCTTGATGATAAGTTGTACTAATATTGGTTGGTCAGTACTAGT TTTGGTTAATAACTCTTTTGTTGTTATTTCAGTGGATAAGTTGAACTTTT TTTGTACTGGTTTGATAACTTGTATTACTACAGGTTGATTACTTGCACTG TTTGTTGGTGATAACTACTGGTTTTCATAGTGGATAACTTGAATTCTAAT CATTAATTTTTTTTGTAGCACATCAATTTGTAACATTGATCCAATGTGGG TGACACCTAGTGATTTTGCTGAAAGTGTGATGCCATATGGCGAGCTTTCT AACAATATGTGTGATCTTGCTATTTCTGCAATGCAAGATAATTGCCCATC CAACAAGATAATTTTTCCTTATATCGTTACTAAATATCTGTTGGAGGGAA GATTTACTGCAAATCTTGTTCGGAGGTCGTTCAAGAGAGATTACAACTAT AAACTGAGCCACAAACATATGGTATGCTGTCTAATTTGATTTTTTTTATT CTACAGTATGCAGTTGATAAGTTCAGGCATAGTGTATGATAACCATTGCT TATGTTGTGTTGATAACTCTTTCATTTCTGCCTAGATAACCACTGTTTTT TCTACACGTGCATTTACTTATCTTATGTTCATTTTTTCTGTAACTTTGCT TTGCTGTCCTTCAGGAGCTAGGGACTAAAAGGGGCCCTTTGGGCCATTGG TACATGCTTTCTGTTAATATGCCTGCAAAAAGGTTTGAAATTCTTGACTC GCTCAGTGGTGAAGCTAATATAGAAATGATTGAACATAAAACCAAACTAA TGGAAGCAATAAAGAAAATGTATATCTTCAATTGTTCTAATTCTAGAAGA CGGATTGAAGATTTTGAGTTGATACATGTCCCTGTTCCGAGTCAAGTTGA CAGGTTAGTTGGCCGGTGCGATTTGTACGCATGTAATTTTATTTTGTTTT TGTATAATCATTAATACTATGTTTGTTTATTCACTATTTATTTTTTGTTT TTCAGCACTGATTATGGGCTCTTCATGCTTAAGAACCTTGAATTGTGGAA TGGAAGCGTT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.