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GrainGenes Sequence Report: AA013287

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Sequence
AA013287
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA013287
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGTGGAGGCTAAGGACCGGCGAAGCGACCGCGGGCGGCGAGCCGTGGCT
GCGCACCACCAACGCGCACGCCGGCCGCCAGGTCTGAGAGTTCGACCGCA
CGGCTGACATGACCGTCGATGCCGACGACGCGCAGCGCGAGTTCTCCCGC
CAGCGGCACCAGCAGAAGCACAGCGCCGACCTCCTCATGCGCTTGCAGGT
TCCTATACCTTGTCTTGGTCTAGCTTTGCTTTTACCTTTTTTTTGGTGTC
TCTCGAACAGGAAGTCACTCAAGGCCGGACCTTGACCTGCTACCAAGTGC
ACGATAACAAAGAGGTCTTTTTCTTAGGGCATCCTCACCGGAGAGATGCA
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GCGTCTGCATTTAGACCAGCATGTGTTTGTGTCTATCCGAACAGACCTAT
TCGTCACTCAGATCTGGATCACAGATAGATCGGTTCGTCCAAAATAATAT
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ACCTCGGAAAACTTGTGTTACTTCCAAAAAAAAACTTGTGATTTCTTGAA
GCGGCACTTTTATAGGACATGTTTGCTAAGTCGGATCTTCGTTTCTCCTA
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ACCTCGCCGGAGAAATTGCCGGTGCCGGCCTTAGCAAAACCGACTTCGCT
GACTTTCGTCGAAAACATCGTAGCAAATACTTTGTGCTATATATTATAGC
AAAAACATAGAACAAAAATAGAAAAAAAATTACTACTATTATAGCATCGC
CCTATAGTAAAATCTCAAAACCCATTTATTGGTCGGTACCATCGCGACCC
TTCATCTCTAGCAACGATGACCACTTCCAGTAGCATCGTCGTCCTGCCTA
TGTAGCACCGTACGGTGTAGCAAAATTCACCGTCGAGATTGTAGCACACC
GGTGGTAGCGCTGCCCGTCGCCGATGATAGAGCCGCTTGTTGCCGGTGGT
AGCAACACCGGATGCCTTACTAGAGCCTCTCGTCGCCGGTTGCGGATTTG
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CTGGTGGCCCTTATCCGGCGGCGGAGCTTGGAGCGAGGAGGGCCATGGCC
TGCTGAACAAAGAGAGTGTCGTCCTCGATGCCAACAGAGAGCCGCTGGGG
GCGTGGAGGCGCTGGCGGCACGACCCGCAGGAGGGCTGGCGTGCAAAGGA
GGGGGCGAGCGGCGCGGCGGCGGGACCTGCAAGGGGGCGGCAGCCATGGA
AAAGTTTGATCCCCGGATCCGTGCGTTTTTGCTCTGTGCGTTGCGTTGAC
TGGGTGAAAGAACAGGAGGGTGGGCCTAGCGCGGACGCGAGTTACGAAGC
GACGTGGGGGGTCGTTTTGTTCGATCCCCTAGGGGAGTCCTATCATTTTC
CTTTATTTTGTTGGGTCATATGGATTTCTTGCATGACACGAGATGTAAGG
CAGCCCAAACATTGCCCTGCAGGAAATGCCAGTCACCTCCGACAACGATC
GCGGGCTCAGAAGGGGAAGGGCAATGGAGAAACACAGCGCATACGGCAAC
GTGCCCTGGGATGGCGGTGGAGAGGGCGGGCGAGGGTTTGGGGTAGGGAG
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CTATATGCGCTAACCTGATAGGATTGGCAAGACCAACTGTGTCCTCCTAT
CCTCGGTCGGCTCCCTACGATCTGGGGAAGGAAACCCTAACCCTCCCCGT
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GCGTGCGGAGGCCCGAGCGGGACAGAGCCCTCCCTGGCATCGGTGTGACT
CGGCGGGGGCGACCAAGACCTGGCATAGCGACAGCCCGCGAGCGAATTCA
GGGGCAACCTCGCGTGCAGATGGAGGCAGCGGCGACTATTGGGCTCGTGG
CTAGTGCGGCCTCTTGGCGGCAGCGTCCTGTCCGCTACTCCTGCAGCTCT
TAGGAGGCGGTGGCGACGTGGTCCATGGTGGCATGGTGGCGGTGTGGGCG
CTGAGCAGCGGGGCGACGCAGCAACGACGGCCAGGCAGTGCGCTGTCGAC
CCAAAACTAGGCTTGCGGGGCCCATCTAGACATGGTCGGGCCTGCTATGC
TAGCCTATCATCCTCTAGAGTTGGAGATGGTTGCACGGTTGGAGCAGGTT
GATAGCGGCGACGCAGCCTACATGCTACAACATGGTGGCGAAAACTTCGT
GCCAGGCCCGACCAAGCCTGTCTAGGCCTAGTGTGTCTGTGCAGCCTTAA
CCGGTTGGCAACCGCCTATGATGGTGGAGGACAGTTCTCCTCCAGGTGGC
CGTGCCGCTACCGCCCTCTGGTTTCAGACATGCCGTGGTCAAATGGATCG
GTTTACTCTTTTTTTTTAGTGGAAAATGGATCGGTTTACTCGAGATGCCC
AATCCATAATTTCCTGGAGGGGCCGAAGCTCCTATAAGAATCTCTGAATA
ATAAAGGCCATAAAAGGTCTCGGCCCATAGGCCATAGCCCAGTTAATCAA
CTTCTCTACCGCTGTCTCCTCCTTCCTCTCCGTACCGCTGCTACCTCCGG
CTCCGGCACACCTGCCGCTGCTCTGCAGTCTTGGCTCGGTCGTCCGCCCG
TCCCCTCACGCCTCTGCTCCACCATTTCGCCACGCCACCGATCTTCCTCA
GCCACATTCTTCCCAGCTTGATGAAATACACCCAGTCGCCGTTCTGCCGT
CGCGCCACCACGGGGTCGTCGCGGTGACCGACGGAGGCGACGAGAAGAAC
CTCCGTGAACGCCACCCTTCACGGATTCGAGTCCCTTGCTCTCAACCGCG
TAACTAACAACCTCTTTTCCGGCTTGCAATTTACCGTCTCGGCCAGTTTA
CTTTCAGCTTATATATATCCACTGGATGACTGGAACATGTAAACACATCG
ACAGTAGTTAACGAGTATTGAAGTAGTACGTAGTAGAATACAGATGCCCA
ATTACTGAGATATACTAGTTCCAAGTCGGGAATTTATCAAGTCAAGACGT
CCATAACTAAAATCGGTAGCAACTGAGGAAGGCCGGAAGGGCATATGCAC
ATCAAAATGCAACACTGAAGGGTGAAATTCAACCTGATTTGCTGGATAAG
AAAAGGAAAACAGTAAACTATTTACAAAGTATTCGCTTCTCCTAACTATT
TAGTAAATGATACCAACGGATTAGATCCTGAAAATTTGTACTATATATTT
GGAACATGAAATTCCCTAGTACAACAATTTATTGGAGATCTGTTTTCAAA
TTTCTACATATGATTCTCGCAGAGTCGCATTTTCAGCAGGTATGCCCTCT
CCTATGTGTATGCAATTTAAGTACTATCATCATGTAATACATGTAATTTC
TCACTTGTTCTCATTTTGCGTGGAGTTTGATATTGTCTTTTAATAACTGC
ACACTTGTACCCTTTGCAGTTTGCCAAGTTGAATCCTCCTAAGCTGGACA
TTCCTGTTATCAAACTCGAAGAGCACCAAGACGTATCAGAAGAAGCCGTT
TTGGCATCTTTGAAGAGGGTATTAGGACGCTACACTACTCTCCAAACACA
TGATGGACACTGGCCTGGGGATATCGCTGGTCCTATGTTCCTTCTGCCGG
GTTTGGTAGTTCTTTTCCCTCCCTCATCATGATTTTGTTGCATTATCTAT
CGGCTAACTTTGGAACAAGATGGCTTTGAATTCCGAGAAAATACAGAACA
TCACCGAAGAGGCTCTCAACTTGTTTCAAAAACAAAAGTGTCTCTCCTGG
GAGATGGTAGCACCCTTCTTTGGTTGCTCCAGCGGTGCTCGAGTCTACTT
GCTTGGCTAGTTGCTCTTGCTTCCATTCTAATTCTTGGGCTTTCAGATTT
CGCTTCATGTAGCTTTCAAATCATGACTTCCTTTCTTTAAACTTTTACCG
TCATCTATCATTTGATCCAGCAGAGTGTGTTCCTGTTTAAAGAAAAATGA
ATAGAAAAAAGATTTATCAGTTAACAGTTGCGCGTCACTTGGTATCAGAA
TTGCAGATAATTGTGCATCTCATTCTAGGTTATGTAAATAACATAACAAT
GCGTATGGGCATGGTGCATCCTTTGTTTAGTTCTGCTTCTATATTAAAAA
TCAGTCCGTTTTGTTTCTTCATCCTTTTTACCCAGGTTATAACACTGCAT
TCGACCGGTGCCCTAAATACTGTCCTATCATCACGGCATCATAAGGAGAT
TCGTCGGTATCTCTATAATCATCAGGCAAGGGCATACTGTCTAAATAAAA
CGTTCTTTACTGTAATGTTTAACCTTACAGCTAACTATGACAACTCTACG
CAAAAAAAACTGGCTTTGCAATCCACATGTCCTGTGTGTTTTATGTCCTT
CTGTCCTCATTAGTCATTACAACCCATCATTGCTAGCCTAATGCATATGT
CATTATTAGCTCTGTTTATGATTCTCAAAAGAAGGGACCAAATCTATGTG
AATGTAATTGCAGAACAAAGATGGAGGTTGGGGATTGCACATTGAGGGTC
CAAGCACCATGTTCGCTTCTGTCTTGACCTATGTTACCTTGAGATTACTT
GGAGAAGGATCATATAGTGGAGATGGAGCCATGGAGATAGCTCGGAATTG
GATTTTGGGACATGGAGGAGCAACCTTTACACCTTCATGGGGAAAGTTTC
TGCTTTCGGTACGGAGCTTTTTGCATTTCCTCCTTTTATGTTCACTGGTT
TGGTCTTTTGATACAAATTTACTTGTTTCAAACCTAGAGGAGGTCCTTAT
GATGTCTTAACTTTCTTAAGGTCCTCGGTGTATTTGACTGGTCTGGTAAC
AATCCATTGCTTCCGGAACTATGGTTACTACCATACTGCCTCCCATTTCA
TCCAGGTTTGTTTTCGCTTTCTCCTTCAAGGATTAAACTTGTATTTGGTT
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GGCACCAGCCAGCGAAACTTCACTATATCGAGGAGTGTTTACAAACGCCG
GAGATTTCACAGATGCAACTCATCCCAACCGGCGGCTTACAAGGGGTTTA
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TTATTACAGATGATCGGTAGATCACACTGCAAGTATGGTTCTCATTTGGT
TGATAAAGCATTAAATACAGTATTTGTCCTGTATCCAACCTAGTTTATTT
GACCGATTGGCAACCGATCCATTTTTCATTGTCACAAATTTTAGAAGAGT
GCTATAGTAATTTATTATATCATCTTTTTGTTTAGTTAATCCTTACTTGA
TAAACATCTGTTTGATCTCTCTACAATTAGTAGTATATAAATAATAATAA
GCTGAATTTTCCTGACTTATTATCTCTCTTTCATAATGAAAATTTCCGGC
GTCACACACAGGGCGCATGTGGTCCCATTGCCGAATGGTATACTTTCCCA
TGTCTTACATATATGGAAACAGGTTTGTCGGCCCAATTACATCAACTGTA
CTGAACTTACGGAAGGAGCTCTATAAAGTACTGTATGACGAGATTGATTG
GTACAAGGTTCGCAACCAATGTGCTAAGGTCAGTTGGCTTCAATCTGCCT
TGACTTTTTTTTGATCGTGCATGTGCCAAACCAGCAAAAAGATATATAAT
GTAACTTCATCCTATGATGCCTTTGAGGACCCCTGATTCGTTTGAAAGTT
TGTGCCTTGCATAGTTAGTGATCTGTACACGGACATGGCTCCTATGTCAA
TCATTTAGTTGATACTTTACGTAGATATTTCTGTGCAAGATTAATATGAT
CTTTTTTGTCTGACATATTGTTATAATTGAACTGTCTGACAGATTGTTAT
AATTGAACTGTAGGAGGATCTGTACTGTCCTCATCCACTGGGACAAGATA
TCTTGTGGGCGGCTCTTCACAAATTTGTTGAACCAGTTCTGACACATTGG
CCTGGAAGCAAACTGAGGGAGAAAGCTTTGAAAAATGTCATGCAGCACAT
TCATTACGAAGACGAAAACACCCAATATACTTGCAGTGGTGCTGTAGGAA
AGGTAAATTTAAGATCATGATGATTTCTTCTAAAAGGGAACGCGATCCAT
TTATCCCTTTTGACAACCCATTGTGCAGCTGGCTGTGAAAACTGAAAATA
AATTAATTCTGCAGGTATTAAATATGCTTTCTTGCTGGATAGAAGATCCT
AACTCACAAGAATTCAAACTTCATATTCCAAGGATCTATGACTACTTGTG
GGTTGCTGAAGATGGCATGAAGATGCAGGTTATTTTTTGTGTTGTCCTGG
ACCCTGTTTATATTTACTTTCATTTGAGGTGACTACTCGAGCAGTATACA
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TGGATGGGATTGTGTCCCCTTGAACCACTACACCCTCTTATATATAGCTC
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CATCCAGGCATAACGACTTCCAACAAAGCGGTAATCTGGATCTTGGATAG
ACATGTACGTGTAGTGATTTTTTTCCATGTTATGCTCAGACAAATGTTAA
GAAATGGTCCTGTCACTGCAGGGTTATAATGGCAGCCAGCTTTGGGACAC
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GTTATTATGTGAAAGGTTCTTCACGATTGCCCTGGAGCAGGGGCGGGCCC
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CTACATATATATAATACATGAGAGGTATATGTATGAAAAAACCCGAAAAT
AAGACACAGGGCAAAATATTCACATCAAATAGACACAGAAGCCCATCTAT
CTTTTTGTGGCCCAGCTAATTTTGGCCCAGTTGGCTATATCCACACCACA
CGTACGTTCCCGTAACTGCCTCTTCTCCTAATAGCCGCCTGATTCCCCGC
CAGCACCGCTGATCGATCCACCCTAAGCCTACAATAGAGTTTGCGGCGGC
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GCCTCTGGATTTGGCAACCAGCAGCTACGAGAACTAGGTTTGTAAGTTGT
AATTCAGACTCCACACATACACATGCTGCTCTAGTCTTCTCTGATATTTT
TGTTCAGTCGTTGAGATACACTAATAATTCAGAGCACCTTTAGTTCTTAA
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TATATTAAACAGTTGAAACTTATATACGTCGATAAATTTCATGCTATGTC
CCATTTTACTGCCTAGAAATACAAAATTGCCAGGCGTTAGTACAAATAGT
TTAACACCAGATTTCATATACAGTGTACACATGTTTATGGGCCGGCTTCA
AATCTTTAGTTTGTGGTGATCTATTCGATTATTCTATGAATAATTGATAT
TGGCCCCAACTTGTTTCATAAATTCTTTGTATTACATAGTTCTTTTTTAA
AGGATACGTTATTATTTAGTTAGAACTGTATGATTCTATGTATACACGCC
AAAAACTAGGCTTCAGACTGTCAAAAAAAAATTTGTGCCCTTTTAAATTT
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GTTACTGGTATCGTCATACATCTAAAGGTGCATGGACCTTCTCCACTGCC
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GAACTTTGACCACTAGTGAAGTAATTCCAGAACATTTTATTCTTCGTACT
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TAGAGGGAGTACATTATTTACTAATATATTATTAAAAGAAATGACCAAAG
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TCGGGCTGGCGTGGCGACGCGGGTCAACCGCGCTGACTGCTATTTTGCAT
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GAATATTTTGAATATAAAATTGGTTCACTATTTTCAGATACCTAAAATAT
ACAAACAATTAAAAATGCTTCTATTAATAATGCAAACTTTAAAAATTCAT
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TATAAAAATCCAACCAATCCATTGATGATATTGTGTGTGTGTGTACGTAC
AAAACAGTCTACCATTATAAACTTTAAATATTCATAACTTTTGTTATATA
ACTCGAAATAATATAAATAATATGTCTAAATTTATTTGAAAAATCAACCA
ATCCATTTCTGACATCCATTATGCATGAATTATACCCGTTTATTTTAGAT
GTTATGATTCATTGATATCGGTATATATAATATGTCTATACTTATTAAAA
AAATCCAACGGATCCATTTCTAACATCCTTAATGCATGTATCTGATCCAT
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TATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTA
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GTACTAGCACGTATAACATTATTATTGAATATGTATTTGAATCCGTAATT
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TTTAAAATGTGCGGGCTGCAAACTAAACAGGTGACGTGCGCAAAACGTCG
AGGGCATGACTCCGGTGATAAATTCTTTGTTTACATGTACACGCATGATG
GCTTATTTAGACCGTACGAACGTGCTCTAACTACGCAAATCGATAGTTTG
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GTCTATCGATCTATATGTACCTGCCGGCCTCAACATATATACACGTACAT
ATCAGTCACGTATGACGTAGCATGCAAAAAAAATAGAAAGAGGCTCTAAG
ATAGATTGTATTTGTACGTACATATATACCGATATCAATGGATCATAACA
TCTAAAATAAACGGATGTGATTCATGCATAATGGATGTTAAAAATGGATT
GGTTGATTTTTTCTAATAATTTAGACATATTATTTATATTATTTTGAGTT
ATATAACAAAAGTTATGAATATTTAAAGTTTATAATGATAGACTGTTTTG
TACGTACATATATATATATATATATATCAATACCAATCCGATTATAACAT
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GTTGGATTTTTATAGTAAATTTAGACATATTATTTATATTATTCCGAGTC
ATATAACTAAAGTTATGAATTTTTAAAGTTTGCATTATTAATAGAAGCAT
TTTTAATTGTTTGCATATTTTAGGTATCTGAAAATAGTGAACCAATTTTA
TATTCAAAATATTCAGACATTTCTGAGCAATTTTCATATTAAAAGTTTTT
TCAATTGAATCGTATTCAAAAGTTATGAACGTTTCAAATAAACAGGTTTT
AAAAAAAAAGTGAGGTTCCAGTGACCCTTAATAATTTTTTTGCGGAACTC
AAGGACCTGCATGCAAAATAGTAGTCAGCGCGGTTGACCCGCGTCGCCAC
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TTTTGTGATTTTTTTGTAAAGTGGTGGTTATGCGAATTTTCGGCCGAAAT
GTGGTAGTTTTATGCTATTAACTCGCTAGGAGTAGATATCTTCTGATCAG
TTTTCTTGGGTTTATCTATGGATCTATTTTTTTCCGCATAATATTTTTAT
ATGTATGTTTCTTTAAAGTGGGTGGAACTACCTAGTGTCCAACAGTTTGT
TTTTTCTACAGAACGAGAATGGTGGTTTTGCGTCCTATGAACTCACGAGG
TCTTATGCCTGGCTGGAGGTGAGCAACGAATGCAAGGATGGCACTACATA
TTCATCTTTTTCGCAAGAGTGTTTTAGATTCTGACATGCTTTTATAACTA
TTCAGTATCTCAATCCTTCTGAGATCTTTGGGGACATAATGATCGATCAT
CCGTAAGATGTGATAACCCTATTGTTTTCACTATGCCGATTTGTCATGTT
TAAGAGAAGCTAAGCATGTAAACTCGACTGGTAGTGTTGTTGAGTGTACT
TCAGCAGTGATCGACGCCCTGACATCATTCAGAAAGCACTACCCTGGACA
TCGAAGGGAAGAGATAGACAAATGCATCCATAAAGCGGATAATTTCATTC
AGAGTATCCAAAGAAGTGACGGCGCGTGGTTAGTGTCAAAAGTTTATTTC
GAAAGAAGCAAATATATCTGATACACATACAACTTACTATTGTTTTGTTG
TCTCTACTCAAACATAGAAATTGCTGCTATTCTGACACATTGCTCTGTCA
ATTCACAACAGGTACGGCTCCTGGGGTGTTTGTTTTACCAACGCAACAGG
GAGATGAGTTCTCATTTGATCTTGACCAAACAGGGCAGCAAAATAAGTTA
TGCTTCGAAAGATCAGTCAACCAGCAGTAGCAAAGTGAACATTACTTTAC
TTTGTTATGCTGAAGAGAATGTCTATGACCTGAATATTTCGTAATTTCTG
TAAATAGGTTTATACAGAACTTGAAGGAAGGCGCCCCCATGTAGTCAATA
CTAGTTGGGCCATGTTGGCCCTAATTGATGCTGGTCAGGTCTCTGCATTT
TTTCCTTCTGTCTTCAATTTGGCATTGTTCAATTTGGCCCTAATTGGAGT
TGGAACTGCCATCTATAGCTTCCTGTGATGTTTCACTCTTCCATATCGGT
TGAATGGTTTTCTGTGCCACACATATAACAGGAGATCATGGGTATCTTCG
CCAGAAACTGCACCATCACCTACTCCAATTACAGGAACATCTTCCCTATC
TGGGCGCTTGGAGAGTACCGCTGCCGG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.