Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA011807

[Submit comment/correction]

Sequence
AA011807
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA011807
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CGGACGTCCGCTACTGTGTCCCGGCCTGTCCGCTATTGCTTGAAATTCGT
AGCTGGTTCAATCAGTAGCTAACCAAATCGGCAAATCCTCTCCTAATCCT
GCATGTACTGATTAAGCGGACTGTCCGCAATGTCCGCCGGAACGTCCGTC
TGCATCCATAAGCTGAAGGACTAGCTGAAGCCAGCTGGCCTTGCAAAAAC
CTCCTCCACGCGAGTCATCGTCATTTCGAAACCCCACTAATTCCATCTGA
AAAAAAAAATCGCATCGCCTCGCCGCCGCCGGGGAATATGGCCGAGCGCC
GGTACACCGAGCAGGAGACGGCGCTCGAGATCAAGTCCCTCCGCCGTATC
ATCGCCGCCTACTTCAAGTACGCAAACCGCGACCCCCTTCCTCTCCTTCC
TCGTCCCCGAACGAATCCTCCAGTTCCCCGAACGAATCCCCCGTTCCATC
CTCACCGCGAGATTGATTGGTCGCGTAGAAGCGTAGCTCCGTTCCATCGG
AAGTTCCGGCGTGCTGCTCTGAGCTGTCGGCCGATTGGGTGGACTGGAGT
TCGGAGCTCTGTCCGAGTTCATGGTCCTTTCCGATTTGTTGGGTTTAGGG
ATGGTTGCCCCAGTTCGAAAGCACTGGCTGCTGACCGGAGTTGATTTGGT
GCTCGCTGGTGAATTAACCTGTGTTCGATGTCTGGGGGACTAGGCTTTGC
TGTTTGCTACTCTTGGGGTGTTCGCAAATAGCACCGCCCAATATGCTTCG
GCATAGTCAGTGTGGATAGAGAGATTCAGTGTCTTCATCATTTTAGTATT
TGAGCGGATAATGGATCGAAGTTGCGAGCAACCATGTTAGTCTGAAGGTT
ATGGATGTGAGTGGCCATTTTTTTGTCATGTTGTAGAGGGGGGAAATAGA
TCACTGCAAATAATCTGGAGTTTCCTGGCACACTTGCATTTGATTGTTGC
TGAATGAAGCTGTTAGAGGGTCTGTAAGATGGTCTAGTTGTATTTTGAGT
TCTCAAAATGTGGCCATATTGATCTGAGCGTTGACATGGCAAATCGAGTA
ACTGATATGGATACTTGGAGATGTAGTTGGTCTGTTGGATGTACTTAAAA
CATCATTTATCTCGACTTATTTTGATGTTTCATCATTGATGTTACGAAGT
TACGACGTTCTCTGCTTTTTAGTGGTTAGCGACTTAGCACAAAATGACAT
CTATACAATATTATAAATACATGGAAACAGTCTTTCAAAATATTGATATT
TTGCTTCCCAGGTCTTAGGTCTTTTCTTTTCTTCGAGTATAAAAATACTG
ATATTTTGCTTTTGCAATAGCTATCAAGATGCAGCAGAGAAAGATGTCAA
GAGATATGAACGGTCATTCAAAAAGCTTTCTCCTGCCCACAAGGTTTATT
TTTCTGAGAGTCATCTCACATCTAACCTTTTAATTGATCTAGGTTATCTA
TTGCTGTATGCTCCCTTATGTATTTCTCTGTGCAGGAACTTCTATTTCAC
CTTGGTCTGAAGTACCAAAGATTGAAATGGTAAGTAATGTTATGTGCTTA
ATGCTGGATCTATCTCTCATGCTCTAAATCATCTGAAACAGTGGTTTGTT
AACTGTAATACATGATTGATTCAGTTAGTCCATCTGGAATCACCTAACGC
CACTTTTCCAAAGATTTGATATGTACCAATGTTGCCTGGCCTAATCTGGG
TATCTGAGACTTGCTGACAATGCTCTATCTTCATGAGTTAGGAGTCTTCG
TTCACTTACTATGAAGAAACTACGTACACCACTTTGAAAATTAGTTTTGG
CCATATACTTGTTAAACATCTATCCTTTGTTCTGGCATTTGTGCATTACA
ATATGTTCAAAACATGTCCCAGATGTGGTAATGACATGTAGTAATAGGGA
TGGAGCTAGACAATTTGTACTAGATGGGGTAGTTAAACAAAGAACCTCAC
ATGTTTGGTATTGCAGAAATTGAGGTCAATTATACTTATATCTAGGGGCG
CTACACATTATTTACCATAGGTACCCATGACCCCTATGCCATGTGTAGTA
CTATTTGTACAGCAGACTTTGTGTGTACAGCGTACTGCTCAGTGATGATT
GAAACAGTTTTTTAATTACTGTGTGTTTTGATGCATTATTACTTCACAGG
TGTATATCCATGAATGCATCTTTTGTCATGAATATGCTTGAGGTATGGTG
TATTTGATACTATGTTGAAAACTGCAATGCACGTGGTGGTATTCTTAAAA
AAAAAGAACTGCAGGCATTTGATCCTCCTTTCGACATGAGTCAGAATGAG
GATGGTGATTGTCAGGATTGTGCTGAGCACATCCATGGACATGATCACGC
GGAGCACATGCATGGACATGATCATGCGGAGCACATGCATGGACATGATC
ATGCGTATTGCGCTCATTCTAGTGAGAGGGCTGATTGCTCAAGAAGTGTT
GTCACCATGAATAATTCCACATTACATGCCCAACATGATTGCCCTGGGGA
ATATGTGAAGAGTAATGAATGTTGTGGAGAAACTGGGAATAAGAAGGTAA
GTCCTCAGTCTCAATCCGTTTATTTCTGTAAACATAACCTGTCATTATAG
TGTATATAAAGTTTTCTTTGGAGCTTTTCAGAATAACATTGTTTCTAAAA
AAAACATAGGTTTTAATACTTTTACGCGTTTGGATCTAATAAATACTATA
GTTTAACAAACTGTGTTGTTCCAGATACTGTGGTAATTCTTAGAGTATTA
GAAAAATGTACCCCAAACCTCCTTTTCCTAAACATGCTGAATTGCGGTCT
TTCCCATACGTTGTGTCCTTGTGCTTAATCGCGTGTAGAGTAGCAGGCAA
GCACCCTCCATCTGTATATGCACATGCAGCTTTAAAAGCACTCTCGTCTA
TCTCCATGGAATGCATCTACCTCTAGCACCCTCCATACTGTATTTTGAAG
CTCTCACATAGAAGTTATAAAATTGATATGTGTGTTGGTAAACAAGCTAA
TGACCTAATTTGTGCCTGCGATCCCTATGAGAAATAGATTCAATTATTAC
TCCAATGACTAATAACCTAACAACATTCAAAATGAAAATAAAATACAGTA
CTAAATACTGCAATTGCCAAACATCCCTTGTTTTTTGCTAGTACTTCAAA
ATACGTATTATTCGTGAACTGTGGTATTTCGTGCCTACGAGTTCTAATAT
TCTAGTTTATAGAAACTGTGGTTTTAAAATACGTTGCATCCAGACATAAG
CATGATAATGAGTGTTTTCACGTATAACGATAGAAGGCTGTTACTATATT
TTAGATACAACATTGGATATGTCGCTGAATTATCCTTTGTGTTGCATGTA
TAGTCTGACTGATTTGTATCGAACAGGATGGGAAAGTTCACATGGTGGGT
TGCTCCCAGCATGCTGTCCCCAACTTGGGGGCGTCCCAGGATGTGGATAA
TCCATGTAATGGTGGTGAAGATGCAAACACAGCTGCTAACTATCAAGATA
CAGATTGCTTTGCATCATCTACTGATGAAAATGTAAGCCCCCCTTGCAAG
ATGTAAGCTGCATTAATTTTAAAATTAGCTTTGCTTTCACACATGAATTT
TATGTTTTTGGATTTCCACAGAAAAGTGATTTATATCGTGACTGTTTATA
CCTCTAAGGTACTTATTCAAAATTTCAAGGATTCACTTGGTAAACGGTGA
CCGTTTTAAGCCAAATTGGATTAGCCAGTGTGATTGAGCATTGGCTCCGC
GCCATAGCTTCCCTGCCAGAATTTAAGGATTGGACATAGGCAACTCGTCC
AGCTTTCCTAATTTCCAGGAAACTCTTCAATTCTCAATTTAACAGCAAAC
TTGTCATAAAGTTTAGGACATGGTATCGGCGTATTGCACAACATTTCACG
ACCCACTTTATGTATATCAAGCATCGATTCCTAGTCCGGAATATAATCTT
TTGGCACCTTCTACTTGTAGATAATAATGTGTTTAAATAACTGTGGATTA
TAGCAACCTTTTTTTTGTTATTTCAGGTAACTCCAGGGCACTGCATGCCT
CCATCTGTTCACTTGGATGTTCCTCCAGTTGACGTCGACAAAGTAATGGT
TCTTATCATTTACATTCTCCTGATAGGCTGATAGTGATAGCATAATGTTA
TAGGGGGATGCTAGGCAAGGGTGTATACATGTTGACAGCCCAAGAAGTTG
CACCGAAGCTAGCATCTCTCCTGAGATATGATATTAGTGCTTTGCATTTA
TGTTTTTTCATTGCCTAATTTTAATTCCTTAGTAATGCTATATTCTTGCT
GAAGTCGTCTGCGTGCACATGTTCAGGTGCTGGTCTCTTTGCCTGCATTT
GCATTTTTTCCCTTGAATTTTTGTAGCTTCTCTTGGATTTTTTCTGTTTT
ATTTCTTCGATCATTCAGTTTCTTCCTATTTATGTAGGTAAGATGCATCA
TAAGAAATATTGTGAGAGACTGGGCCCAGGAGGTAATATTCTGTAACTGT
AGATTGTTTTATAATGTACTTGAAGTAGAGCTTCTGTTTTCTTGCACAGG
CATAATTTTCATTGTTTTACCTTTTTTTGTTCAGGGTCAGATTGAACGTG
ATGAGTGCTATAAACCAATTCTTGAGGAACTTAATCGTCTTTTTCCTGAC
CGAAGCAGGTAAACATGCATTGTCCCTTGTTTCAGTAATTGAGAGCTACT
GTACATTTGATTATCATTTGAAGCCTGTAACATTTAAGATTAAGAATTGA
TCTTGGTTTTAATATTGACAAGAACTGTTTGTCGGTGTGCATCTTGTTTT
GTGTTTGTGTTCATTAGCTCGCTTGCATGGTGGTTGGGGCTGGGGCTTCT
AATGGAAACTGACTAGTCCTTTGAGATGGTATTGTTTTCCCAGTAATGTT
AGGAAATTGTTTTGAAGCTGCTCAGCCATCCCAGAACCCTGTGAGGTTGA
GCCTTCCTTTGTTTTCTAGTTATTCAACCAATCATCTTTAAAGTATGGGT
TGGGCGCAATGAACAAATTGACAAAGTTCCTGCAGATTCATGCTTTGTCT
TCATACTCATGATTGTTTGATTACGGGCATACTGGTAATACTATTTATGG
GAATATTTCCTTAAGGTTCAGTTATATCTGGCCTATCACCTTCTCCTAGC
CGCTATGGATGGTAGATCGAAGCATTTCTGTTGACATCACAAATAAACAG
AAGTTTCTTCCTGATTCATTTCTAGTTTTCCTTTATTGATTGTATGTCGT
GAAATTCACAGGCCTCCATCATGTTTAGTCCCTGGTGCTGGGCTTGGGAG
ATTGGCTCTGGAGATCTCTTCCCTCGGTATTGTATCGTGATGTTCGATTG
AAGATAAGCTACTAAAATATATTTATTGTAATTCTGTATTTTCCCTTGAA
CAGGTTTTGTAAGCCAGGGCAATGAGTTCTCATATTATATGATGATCTGT
TCAAATTTCATTTTAAACCAGTATGCCAATCTATTAACTCGTTGCTGTAA
ATATTTATATGTGATCAAGCACCTTCATTAAGTTGTGTTCATAATGCTAC
TCTACTACATATTTCTATCAGCACACAAGAGGCCAATGAATGTACTATTT
ATCCTTGGATACACAGCAACTGCAATTCTCTCTCAGACAATGATCAACTC
CGGCCTGTTTCCTTTCCTGATATTCATCCCTCAAGGTACAGTTCACCATG
TTTTTAACATTTTATTATCAGTGTCAGCACTTCTGCAATGTTATATGTTT
CCAGGCTTCATTCTGTTGTACATTTGGTGCAAGCTGTATAAGTTTTTTCC
TGTTGGACACATTTGGACTCTAGGGTGTGTTTGGTTTGTGCCCAAGATTT
CCGCACCAAATATTTGGCTAGCCAAAATTTTGGTTGAGCCTTTGCCACAA
GTTGGCCAACATTGGCTAAAAAATTGAACTAGAGTTGGTAGTGGAGCATT
GGCATGCCAAAAAGTTGGCAACAATCCAAACAAGAGCCAACCTTTTGGTT
ATGACCAAAATAATGGCAGGTTACACTTTGGCCACAATCCAAACATACCC
CTAGTATTCTCATGGGCCAGTTATGTTGATTACATTTGTAGGTAATTTCT
GTTATAGGGTTCTGTATGTAAAACAGAATCGGATTATGGAATATTAGTGC
ATTATAGGTCCTTAAAATATTTCTTTGGTCTGCTGTCGGTCTTGGAACTT
TGGAAATTGCCATCCTGGTTGGATTGCACTTCCAGGTCCCATATGATGAT
TTTCATAGTTCGGGAACATATGTGAGACCAGGGAAACAGTTTGAGGACGC
ACGTTACTCATTTCAGAATGTCGTGTACCCTATTAAAAGTTTTTGCAAAG
CCTACAGAACAATTTGGATGTACAAATTTTGCATTTGGCACTAAAATGTG
TTGTCACATACTTACATTTTGACTCTCTGTTCTAAGCTTCATTTTATTTT
AGAATCGAGTTTACTGCTTGAGCTTGTTTCAGTGAGCTGGCATTATTTAT
ACTGTAGGTAAAAGCTGAATTTTATTTCTATTGAGTGTGGACTTTAATTA
AACGGGGATATACCATTTCTTATCTGTTTGTATGGTTCATGTTGGCATAT
TTAGCTCACATGTGTCTCCTCTTTTCTATTTATAGCGCTGGGATAACCGA
AGGATTTTCGATGTGTGCTGGAGATTTTGTAGAGGTCTATAGTGAGGAAA
GCCAAGAATGTAAGATCACCCACTTCTCTTACAAATGGGATTTTATTAAG
CAAAGCAGGAGTCAATATGATTTAAAATTTCTGGGCCCTTTGACTTATGA
GTTATGATGCACTATTTGAACTGATTGCGGTGCACATATTTGTCACGTGC
ATTATTGGGGTTACTGTTCACATATTTGTCACGTGCACTATTGGGTTGCT
GTGTTCTTGAAGGAATACTTAACCTTCTTGCATGGATCCAGAAAGCCTCT
CTAGATGCATTGACGAAAAATAGTATCCTTACATGACTTTCTAAATTAAA
GAGGTACTCCCTCCGTTTCAAAATATAAGATGTTTTAGGTTTGTGAAAAA
AATGTATCTAGACTTGTTTTAGTGTGTAGATTCACTCCAAACCTAAGTGA
ACCTACATACTAAAAGAAGTCTAGATACATTTGCTTCACAAAGCTAAAAC
ATCTTATATTTTGAAACGGAGGGAGTATGTGCTATTTCAGAATCAACTTA
ACTGAGCTTCTGCCTGCTACAATCCTAATGCGTGCCCATTGAATAGTTTA
TGGTTGGAAGTGGGCATGCAGGAGGCTGAAATTAGGTGGTTAGATTGTTA
GAAGTAGTGTGGTTAAATATTTATTGAAACATGGACACTCCTGCATCGAG
ATCAGTCCACCTCTCCATCTTGTCTAAGCATATAAACATGTTAATAATTG
CACAATAGCATCTTGCCAAAATGAATTTATTCTTGTCGTATGCTAAAACG
AGACGAAAGTTTGTGCTGATTTTGTTTGTCAGGTTGTCTGACCTTTAAAT
TATGGTCAACAAGAACCTGCTGTGTTCTTGTTACTTCTACATGTGAAGTA
TGCTTTAGTGGGAAGCATTTTCGGTATTGTTTTTATTCTGCACCTTGTTT
GGTTTGATTTCATAGCCACGTAATAAATAATTTGCATTACGAGTTGTGCA
TAAACTGATTGGAAATCCCAAAACAGTTTTTTACTACTGAACAATGGTGA
GGAAATCATTAATCATAACTGCTTTGTTCAGCAGGGAAGCAGAGAGTAAT
CGGCCGATCAACTGATTTAATAGATCGACAACTAATCGACCAGATAACTA
GGACGAGACTAACATATAGCAAGTTTTTTGTGCGTAAATCCTTGGCTCCA
TGGAGACGGGCTCGAGCTCCTGGAGCAGGGGATTTTTTCGATAAAGGATT
CTTTATTAGACTCAAACATATTACATCAAGATGATACAAACTATGGAGTC
CTCATCTGGCCTTTGCACATTTAGGACATCTAGGATGCACACATCCGAAA
AAGAAAATAAATAAATAAAGACCCTGTCAAAGTAAACATCGCAGCAGCAG
CAACACCACCACCAGCGGGGGCGACACCTCGACTCCTAGAAAGCTTCTCC
AAAAACGATGCCTTAAAGAAGGAAACAGTGCACGAACACCGTCATTGTCT
GGTCTGACCTCAGATCCTGGGTTTTCACCCTGGAGAATGTCAATCGAGAC
AATGCCTTCAACAAGGAGACGACTCGGGAGCCACCATTGTCAGGTACAAC
CACTGAGGTTGGACCTTGGGTTTTCACCCCGGACATGGCAGCGGAGAGCA
GCTCCAGCTGGCAGAGCCCGTGCTCAGGGAGGAGGGGCATGAGGTGGAAG
TGGAATAGGGGAAGGTGGGTGAGGACTGGGTGCTGGCGCCAAGAATCTGC
ACACTGGCGATGGGAGCTCTCTAAGGCCTTGTTTGGATACAGTAGTTTAG
GAGAACTGGTTTTGCATAAGCTAAGATAATTGTGTAACAAACTAAAATTC
TGTTTGGGTGAACTAACTAAAACGTGAATAAGGAGAACCGAGTTTCCACA
AAGCCAGGAAAACGAGTGTTGGTAAAAACGACTAATAGGCGTTTTTGTGA
AAACGCGATTACACAAACCACAATCGCCGAAACTCGTCACTGCGACTTCT
CCCTCCTCGGCCGCTCCTTTCATGGTTACCACCGAAACGAAGGCAGCAAG
TGCTGCGGCCTGCTGGTCCGGCTGCCGCCTGCTCCTCGCTGTTGATACCG
CAGTGACGCTCCTGACTGCGGTCTCCAGCGTCGGGGTCTCCTTGCTGCTC
GCCGTCATAGATTCCCCTGTGGCGCTCCTCCGTTGGGGCCGACACCTTCT
TGTCGCGTCGGTCCTCCTCCCATGTCCGGCAGTAACAGTTCACGAGGTGC
GCGCGTGTGACCTAGTGCTCGTCCCTCCTCTCGTCAAGGAGGAGGTGGAC
ACCTGTGAGTCCGTGACTCGTATGTACGGTGTCTTATGCCTGCAAGTCTG
CAACCCAAGGCAGCCGACGTTCACCGTCATCTTCAGTTCTGTGTTGCAGA
TTCAAAACGGCCCTTTTGTTCACATGGAGTAGAGAGAGGCACTCGTCGAG
GTGAGGATGATGACGATTACAGAAAGAGAGAGTAATAATTTCAACATGTT
CAGTCTTTCTACCGAGTGCTCTGGTTGTAAATTGTACCGGCGATCCAATG
GGGAAGACATGTACGAGGAAGATAGATGGGAGGAAGAAGGCGGCTGCCCT
GCGATACACCGCCCCAAAACGTTGTGTTGCCAAAACGAGTTCTACCATTT
TTCCATCCAAACAAAGGATTACACAAACTCTTTGTGACAGAATAACTAAC
TAAAACTCATTTTCCTAAAAATCCTCTTAAAACCTGTTTTATGAAAACCG
GAGTCTAATTCTCCTAATCCAAACAAGCACTAAGCGTGTCTGAGCTGACT
AATCGCCGACTAGCTCAACATACATATGTATTTGACACTGTGACCCTATG
AGCAGCGATTAACTGGCGGCCTAAAAGTTGAATCGGCCAGTTTTTTTGAG
CATTGCTTGTTAAGTAGTGGTTGCCTGGGTGGTTGCAAAGCAGGCCTCAA
TTTGCTCTGCACTTAACGCTAAATCATATAGGCTAGCAATGCATGCTATT
ACTCTGTTCATGGATGAAAGTAAATCAAAGTCTGTCTTGGAGGTAGTTGC
GTAATGGATAAATGCTGTTTTGACATTCTTACAATTCTTATATTGTTCTT
CCAGCTGCATGGGATGCTGTTGTAACTTGCTTCTTCCTGGATACGGCACA
CAATATTGTTGAATACATTGAGATCATATCAAAAATTCTCAAGGATGGTG
GGGTGAGGTCTCTTTGTTCTAAGATTTTGATTTCGATAGCTCTTCTTCAT
GAGAACCAGTACTGCCTATGTTATTTTGTGAGCTGATTTTTAGGGAAGTT
CATTATTTAGTAAAGTTGTTTCTCCAGTGCTATTATACCTGCTGTTTCTC
TATCTACTGTAAGCACTAAGTAATTTAATGTCAATTTGAGTCAACAGGTC
TGGGTAAACATGGGTCCACTTCTGTATCACTTCGCTGATTCCTATGGACC
AGATGATGTAATTACTCATTTGTTGACCCCCATTATTTATACTAATTGAA
GGTGGCATTATCAATTCCTTGACATGATTTGTCTCCTTGAACTCAGGATA
TGTCAATCGAACTTAGTTTGGAAGACGTGAAAAGGGTAGCTTACCACTAT
GGATTTGTGATGGAGGTGAGGGTCTATTCACTGTAAATAGACTATTGATG
TTTCGACAGATTATTATTGATATGCAATTTGCAGGTGGAGAAAATGATAG
ATACCACTTACACAGCAAATATGGCATCAATGATGCAGGTAAACTTATTA
ATCCTCAGGACACTTAAATCAATCTGTTCTTTTACATTCCAAGTGCAGTA
TCTCAAATAGCTAGTAGGCGATTGAATTCATGATGTATAATTCTGTTACA
TTTAATTGAATATGTAGCGTGATTAAATACAACCCTAGCCACCTCGGTTG
GAATCTGGGCCATTTTTACCTGCCCCACTTTCCCTTGTGGCTGGGTGTTG
ATATAAACTGGTTGGAATTACAGCCATGCTAGAGTTTGTTTATTGATACG
TACATTTTACTGCCCAAAATTATACTGCACCTTTCTGGTTTTTGAATTCA
ATCTATGTATGGTGACCAATCTTATTTCTTCTCTGTTGAGCTGCAGAACC
GATACCGTGCAGCATTTTGGACAATGAGGAAGGATGCATCCCGATCAAAA
GCGAAGAAGCACATGTGAGATGGAGATCCTCTGTTTGGTGGTGTTAGCAC
ACAAGCTGTTCAATGTTTAGAAGAACAGATTTCGGTCTGTCGATATCCAG
GGGCTGGAAACCTAGGGACAAATAAGGATGATCAGTCCGTGCCACCATTT
CTCATGATATTGAAACCTCATAGCAAAAATGTGTTGTCAATCCTGCGATA
GAATTTGTGTAGCACTACTGGTCCATCTGCGTGCTATAAGATTGAAAAAT
TGACTGGATTA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.