Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA008177

[Submit comment/correction]

Sequence
AA008177
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA008177
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGCCAAAGATCTTACCACTGAAAGCAACAAGTCAGTTATGCTTGATGA
AGATCACAGTGATTGGCTCCATAGTAATTTAACTTACATGCGAGATGTGA
GATCCGTCAATGATCTGAATAACGTGTCCATATCTGCATGGTTGCATGGG
CAAGAGAGCTTTGCTGAAATATGTGCATATTCTGAGAAGAAACGACAAAG
TGAATCCTCTAAGCACAAACGACAACGTGAGAGGGAACGATACTCTTCAA
TGACAGCTGAACAAAAGGACATATGGTTGCAAAATAACCGTGAGCATAAG
AAATTGGCCCGGACGAACAAGTCACCCTTCATCAATTCACCTTGCACACC
TGTCATGCAACCAGAACAATCCAAAAATAACCGAACATGTATTGTTCACG
ACCGGTATATATTATGTCAATGTTCATATCATTTAGTATGCTCTTTGTTA
AATTTCAGTGTTTGCGATCTAATATTTAACTATTTTATGCTAATTTATGC
AGATCTAGGTGACACTAACATTGATGAAGACTTCGAAACTACAAGCATTT
TTGAGCCAATTGAACAAGAAGCTATATTCGAAGGTAAAATGGAATAATCA
GTCCACAATTTCATAAAGCCTTCATATATACTATTTTTACCAGTATCCAA
TAAGTTAAGCCAATTTAACATGTTGTGCATATAGATAACTTGGACAACAT
ACAAGAGGAACATACAATACATGATGATGACGAAGAGTGTAGGATTTTCA
GTGGTACGGGTAACTTATACAACTAATATCAGTATAGCAGTCGTTCGGAT
ATTAAGTTTTTGGCATCTACTTAGTTCCTACCTATTATATCGTCACAGGC
GATGTGTTTGATTCGTATCAAGTGACAAGTGGTGTTTCTTCAAGTAATCA
GAATGATGATCCTTATGATTATGTGTACCACAATCTACCAACCAAGCATC
ATGTTTTGAAGCCAGTAAAAGACCGTGTCTATTGTGGAGCAATGAGGCTC
CAATATGAGGGCCCCACGTTCTGTTGCAAAAAGGGAAAGGTCAAGATTGT
TACCCTCGAAGTTCCTTAGGAGTTGCGCCGTTTGTTCACAAGTCAGGTTG
ACGAGGATGCAAAATACTTTAGAAAGCACATACGATATTTCAACACCCAC
TTCTCCTTCACAAGCCTTGGAGTCACCCTGATAAGAATATCAGCAATGCG
GCGAGAACCGGTGTGTACACATTTCGTGCACAAGGGGCATTGTATTATAA
GATGGACGATCTGGTACCTGGTGGTCAAGGATCTAGACATCTCCAACTTT
ACATCTATGATACAGATGAAACCTTGGAACATAGAGTGAAGCAATCTCCG
GATCTTGATATAAATATCATACGGAAGATTCTAGAGAACAACCCCTATGT
GCAGACTTTTAAGAGCATTGGCTCTGTTCCAAATCTGGAGGAATATCGGA
TTTCACTTAATACAGATATAAGACTTGACCAACGAAGATACAATGCCCCC
ACAGCATCCCAGGTGGCTGCGATGTGGATTGAAGGGAGTGACCCACATAA
CACTTTTGATAGGCAAGTTGTCCTATACGGCAAAGGGGACCGACCTATAT
TTATTAGAGCTTACTATGGATGCTATGATCCATTGGCATATCCATTATTC
TTCCCAGGAGGGGAGACAGGATGGAACCGCTGGATGCCATATACCAAACC
ATCTATCGCCATTAAAGAGAATAATGAGGATGGCATTGAGGGTGAAGAGT
TCCAAGTTCAAGATCATACTTCAGATGTACATGTGGAACATAACACGGAT
GAGGTAGCAGGTAATTCTCTATACGCTTATGATGTGCTCCACAATTTTAT
TTAGTTCATTATTACTGCATAGCACCAATTAATCATTTTGTAACCACCTT
TCACCATTAAAGAGAACAATGAGGATGGCACAGAGGGTGAATATTTCCAA
GTTCAAGATCATACTTCAGATATACATGTGGAACAAAACACGGATGGGGT
AGCAGGTAATTCTCTAGACGCTTATGATGTGCTCCACATTTTTTTAGTTT
ATTATTACTTAATAGCACCTATTAATTATTTTGTAACCATGGCCTAGACG
ATGAAGATGACCAGGAGTTTGATGAAGTTGGATCTTCCAGAAAATTTGTC
AGTCGCAAGGGAGTATTATTGTTTCAAAATACAAGTCAGGAAAAAACTTT
TTAATATTATTATTTGGTGCTCGTGCGTTTCAGCAATGGGCCATCGACAT
GTATATCAAGATGGAGACTATGAGACTTGATTTCTACTCAAAGCCTTAGA
ATCAGAAGCTCATTCGTGCTGATCTATACCAGGTATCATTGTACTCTCAA
GTAATTAAAATTTGCATGCTATAAGAGTATAAGAGACATGCATCGCTTAC
TAGATAATGATGTTTTGATTCGTTTTTTCATAGGGTGTTGTTGATGTCTT
TGATGCTGGCGAGACATAGGGTTCTCAGGTTGGCAAAAGAATCGTGCTAC
CACGAACTTTTCCTGGAGGTGATCGATACATGCAGCGAAGATTTCTTGAC
GCGATGACAATAGTACAACGTTTTGGAAAGCCTGATTACTTCATCACGAT
GACTTGCAACCCTCACTGGGAGGAGATTACATCCAGACTTGAACCTGGGC
AGACACCACAAGACCGTCCAGACCTTGTGGCTAGAGTATATAGGGCCAAA
TTGCGAAGTATGAAAGAGCTCTTGGTTCAGAAAAAGTAATTTGGTGAGGT
AGCTGCATATGTCCATGTTACCGAGTTCCAAAAGAGGGGGTTGCCACATG
AGCACATGCTTCTGATCATGCGCTCGGATAGCAAGCTAACAAACCCAGAC
GAATACGACAAGGTGATATCAGCAGAAATCCCGGACAAGGACAAATACCC
AATATTGCATGATCTCGTGATCAAACATATGCTACACGGACCATGTGGTG
CTCTCAAGAAAAATTGTCCTTGCATGATAGATGGCGAATGTCGATTTCGC
TATCCTCGACAATTTTGTGATGCCACGCAACAAGGAAAGGACTCATATCC
TATCTATAGGAGGAGGGATGATGGTCGTCAAGTGAAGGTCAGAGGATCAG
AGTTGGATAATAGATGGGTTGTCCCATATAACCCCGGTCTTCTTATGATG
TACAATTGTCATATCAACGTTGAAGCTTGCTCTAGCATCAAAGCAGTTAA
GTATTTATTTAAGTACATATATAAAGGGCATGATCGTGCATCATTCTCAG
TTGATCCAACATCGGATAATGATGGTGGAGTAATCAATGAGATTAAACAG
TACAAGGATGCTAGGTTTGTGGGACCACAAGAGGCTATCTATAGGATTTG
TGCTTTTCCAATGTATAGTGTCTCTCCCGCTGTTCTCCAACTTCAGCTTC
ATTTGGAAAATATGCAAACTGTCGCTTTTAGAGAGGGTGATAATCTTCAG
GATGTCGTCAATCAGCCCTCTTCTTCTAGTACCATGTTCACTGAATATTT
CAAGATGAACCAGGTAGATCCTTATGCTAGGAACTTCTTATACAAAGAGT
TCCCAGAATTCTATAGGTGGATTAAGAGTACGAAGAAGAAGTGGCAGAGA
AGAAAACTAAGGGGGCGGGGCAGGTTGGAAGAATTGTGTATGCGCATCCG
GCTGAAGGTGAGAGGTACTTTTTGAGAGTGCTCATGAATCATGTCAGAGG
TGCAACATCATATGAGGATTTGAAAACTATGAATGGCAAGGCTTGCTTGA
ATTTTAGAGAATCGTGTGAGAGAAGAGGTCTCATAGAGGCCGACATGTCC
CTTGATGATTGCCTAACTGAGGCTGCTACTTTCCAGATGACATATGCTCT
AAGAAGGCTATTCGCAACTATTCTGGTGTTCTGCGAGGTGACGAACATCC
GATCATTGTGGGAGAAGCACCTCGGTTCAATGTCCGAGGACTATCATCGT
AACCAGTCCAACCAGACCGCACTAGAGCAGATGGTCCTGAGAGACATTAG
GGATCTAGTGCATTCGATGGGGAAGGATATTAAAAGTTATGGCCTTCCAG
ATTTGGATCCTGTTGATGATGAGTGTTCCAAAGGTTACTCAAGAGAGGTT
CGAGAGGAGTTGTCGGTTATATTCGACAAAACCGAGGAAAATTTGTTTAC
ATCTCTTAACAAAGAGCAGTGTGCTGGTTTTGAAGAAATCCTCTCTCATG
TCATCGACAACAAGAGCCAAATTTTCTTTGTTGATGGTCCGGGTGGCACA
GGAAAGACATATCTGTACAAAGCACTACTTGCTAAGGTCCGTTCCCTAGG
ACACATAGCTATTGCAACGGCAACATCTGGTATAGCAGCATCGATTATGC
CTGGTGGACGCACCGCCCACTCCAGGTTCAAAATTCCGATTAGGCTCACA
GAGAGCAGCATGTGCAATTTCACCAAGCAGAGCGGTACTGTAGACCTGCT
CCGTAGGGCATCATTGATAATCTGGGATGAAGTTGCCATGACAAAACGCC
AAACAGTTGAGACACTTGATAGGTCCCTACAAGACATCATGGGGTGTGAT
TTTCCTTTTGGTGGGAAGGTCGTGGTATTTGGAGGAGATTTTAGGCAGGT
CCTTCCCGTGGTGACGCATGGGACAAGAGCGCAAATCACTGATGCTACGT
TACAGAGATCTTATTTATGGGAGAAGATTAGGAAGATACGCCTCAAACGT
AATATGAGGGCACAAACTGACCAGTGGTTCTCTAGTTACCTCCTGAGAAT
TGGCGATGGAACAGAAGAGACGATTGGTGGAGATTATGTGCGTCTTCCGG
ATGATATTGTTATTCCTTACTCTCCCATCGATGACCAGTGAACAAGCTTA
TTGAAGAAGTCTTCCCATTGCTTCATGATAATGCCGCATCTGGATCCTAT
ATGAGCGCACACGCCATTCTTTCAACCAAGAATGAACATGTGGACAATCT
AAATACTAAGATGATTGAAAGGTTTCCTGGCCAAGAAAAGATATATTATA
GCTTTGACTCTGTTGAGGATGATTCCCGCAATAACTACCCAATTGACTAT
CTAAACTCCATCACTCCAAATGGCCTAGCCCGCATGTTTTGAAACTCAAA
GTCAATTGTCCCGTCATCCTTCTCCGAAATCTTGATCCTAATAACGGGTT
GTGCAATGGAACAAGGTTGATGGTTAGAGCATTCCAGCATAATGCAATCG
ACACTGAGATTGTTGGTGGTCAACATGCTAGAAATAGAGTGTTTATACCG
AGGATCCCTTTATCACCCTCAGAGGACATTTCACTTCCTTTCAAATTCAA
GAGGAAGCAGTTCCCAATCCGGTTGAGTTTTGCAATGACCATCAACAAAG
CCCAAGGGCAAACCATTCCGACTGTTGGTATTTACCTCCCCGAGCCTGTA
TTCTCGCATGGCCAGCTTTATGTTGCACTTTCAAGGGGTGTGTCAAGGCA
AACCACTTGGATTTTGTCCAAGCCAAATAAAGACATCAATCCGACGGGGA
AAAGCACAAAGAACATTGTGTACAGGGATGTATTGGAGGGATGAAACAGG
TATGTTCTTCCTTTAGGCCGGTATTTCATATTGTTTAATTTCTTAGTGTG
CATATATTGTTCATCTCCTTTTGATATTGCTCATTTCTGTTTTTTTTTAT
TTGCGCTTTGTCATGTTATATGCAGCACCTTCAGCGGTTCAGGACCTATT
ATGAATTTAGGAGCTTTCCAACATATAGATTGATGATGATGGAGTTGATA
TCCACTTTCTTGGTTTATTTTCTGTAGTCTTGTTATTTTGTGATGTAAGT
ATGCTGCTGTAGCCAGCCAGGAACAAACTGTTTTTCTGGAATAACAAGAA
TTGCATTCTTCACACATGAGATATTTGTATGTTAGTGAAAAAAGCATTCT
AGACTTTTATTATTTGAAAATGCTGATATGTTCTGTTTGTTAAGTCCTAA
TAGTTTTTAAAGTGAGATTAAGCCAAACAATTCAGGTTCTTGTCCATCTA
ACAAGAATGACACTTTTGATTTCTTCCTAAATAATGCCCTCGCGTCCATG
ATCTACTGTCATGGGAATCATAATATCATTCCAGTGAAGTGAAGTACGAT
GGAATTTTCTGGATGCGATTCAGGTGAATATATATATGATAGTATTTTGG
TACGACAACAAGGCCAAGAAGCTGTCATTTTGAATATATATTAATTATTA
TAATATATTAACGTTTTAACCCATAGAAGCTGAGGGGTACTATATGACAC
ACCTTGTTGTTTAACTTCTTTTATTGTGAGCAATGTTATTCAACAAATAC
AATAAAAAAATCAACGGGTAGTTTTGATAGCTGTCATCTCAAATTATTTT
TGCATTGCTGTATATTTAAGAAAAAATACCTGAGCATTCGATGTAGCCAT
AATTAGCACGTCGTGGGCTCCTAAAACAATAATGCTACGAGAGAAATCAA
AGGGATTAAATGCCTTTAATCACACCCGCAAAAAAATCCTTTAATCACGG
GAGGTAAATGGATTTATTTCCGTTACAATCAACCCCTTAATGCTGAAAGT
TTATTTCAGTCATAATAAGCCCGTAAATCTTGCTATAGTCAGAGGAAACT
CCTGAGACATTTAATCCCTAGACTTTATATATCCGGACATACTGAGCTTT
CTTCTACCTATCGATTGATTCCTCCATCGCCGTGGGTCGCCGCTGCCCTA
TAGCCGCCAGCAGACAAAATTACTGTCCTGTTTCTAGCCAGGCCACCACT
CTCTACCTCTGAATTGCCCCATGTATTGCACTCCTATACATTTTTTGACA
AAGTGCACTGCGATACGATAGACTCCGGTAGTAATTAGTGATTTTTCTTG
ATAGATCAAAGCCTGTGTGCCTTATTTTCTTCCGAATTACAATATACCAG
TCTTATTTAGTTTTTTTCCCCCTAAAAACACAATTCTGAAGTACATAGGT
GAATAAGGTTGGATGATTAATCTGCTATGTTCATATAGTAATATTTCTTA
TATATAATTTTGTCTGATTTGTATGACTAATCTGCTATTTCTTATAGATC
TATATTTAATTCAATAGCACTCACACTGTATATTGGCTAAAGTTAAAAGG
TACATATGTTTTCCTAATTAATCGTATATGTTTTTCTCTTCACATGAACA
GATATGGCTGACGTGTTTGATTCCCCAAAGGTCTCAACCACTGGTATAGC
TGGATTCATATCAGACAAGATTACACTCAAGGGTGAAGATGGCTCGAGTT
CTTCCCGAACTTCCTCGGTCAAATACATCTTCAACTACCTAATACATAGT
GTACCACTGCATCCTAGCGTGGATGTTATATATAACCCGTCCTCAGCAGA
GGTTATATACAACCCGTCCTCGGCAGAGTCACTTAAGAAAATGGACCAAC
TTGATTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.