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GrainGenes Sequence Report: AA051013

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Sequence
AA051013
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA051013
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGCGGCGTCCAACGGGTGGGGCGACGACGACCCGACCGACGGAGAGTG
GACCACCGTCACCCGCTCAGGGCTATCCAACCACTCCGGCCCGGCCGGGC
GCTACCCCAACAACAACACCGCACCGGCCGCTCCCCGCCGCCCCGCGCAG
GCCGCCCCGACGGCCGGTGAGGTCGCCAAGGGCTTCTCCGGGCTCGAGAT
CGAGGACGGGAGCCGGAAGCTGGACAAGTACGACATCCCGGTCGAGGTGA
GCGGCGCCGGCGCGCTCGTGCCGGCGAATGGGTTCGAGGAGGCCGGGCTC
GTGGAGGCCGTGCTCCGGAACGTGGCGCGGTGCGGGTGCGACATCCCCAC
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TTGGTTTAGTCCTATGTTGCACTAATTTTCATCTTCATCTTCATCATGCT
TCATTCTTCATCGTGTCTCGTGCCTGGTTAGATTTGCATTGTTCCGATTT
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AATCAGGTAGCTATCTATGTCTTAGCATTTTCCTTTACAATTTGACTTCC
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TGCATCTTTGCTGCTGATGTAGAATAATGCAAGTTAGTAGCTCTTTTCTG
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GTATTAGTGCCAATACTTACAGGCATCGAAAAACTTTCCATTAGTTTCAA
ATGTCTAGAGCTTTTTCTATGTTCCAGTGACTAGCTTCTCTTTCCGCCCA
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AATTTGTTTTTGTTCGTTGGAACAGGTCTAGAGGGAAAGCTGGATTTTAT
TTATATGAGCAAAATGTTTGTCGTGCTAGTACCTACCGACTAACTTTACT
ATTTTGTGCATCATATAGTTCTGAATACTATTGTTCTTCTTTACTTCTGG
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TTTTTGCATTTCTCATCTAACATGCTCTTTATGTGCTTGCTTGTTTAGCA
GCTGCGTGATATAGAGAGAAGCGTTGACATTCTTGTTGCTGCACCTAGGC
GCCCTGTGGACATGATTGAAAGATCAAAGGTCTCTCTTGAAGCAATTAAG
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TCTGGTCAGAAAGATTGTTGATGGGATGGGTATGCCACAAAATTCTGTGA
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AATTATTTATTTACTTCCCATGCATAAAGATAAGTAGGATTAAGAATGAA
ACACCTGACTGTTTTCATGTTTCTGTTTACTGCGATAGCAGACCTTTTAA
CTCCCAACTTCCTGTAACACAATTTGCCACAAACACATTGACAAGTATAT
AGCACTTTTTGTACGAAAAAATGTGTAGTTCGTTGACATTATACCTCTCC
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TTACTGATGATACACTTGATTATGTCTGCTTTGAGAACAAGCTTAAACTT
CTAGGAACAAGCTATATTCTTGTTTGAGTTACAAATTCCATCCTACCTAT
TGAGAGGGCATATCTAGCTTATGCATATGTATGCCTCTTACTCTCCTGTC
ATGTTTTATGTCTCTGCTGACAATTTAACTAGGTTTCTCTGCCTCCTGTG
CTCACTTGTTTCATTTAACTGACTAAATAAACAAATAGTTTGTTTCTATC
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CAAACTGGAATCAAAATTAAGGTGGCCTATGGGGGAACTCTAATGTTTCA
GCAGGTGTTTGTTGACAGTATGCTTTTTGGCATGATGGCTTCTCTTAGCC
TTCAAGTATCTCACTAGAGCCAAAATTAGTTTACATGTTGGAGTAGAAAT
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CATATTAGGGTTCTCAATTTTGTCTAGATACGAATGCATCTAGTCTAAAT
TTTTAACTAGATACATACGAATCTAGACAAAGTTGAGAACATTAATATGG
ACCGGAGGGAGTAGTTGATCTAGCACTCAACTGTTACATGGGTCTTTTGT
TGCTTGGCCAATCAGTGTAACATTGATGGATGTTTATCTCATCTGTCTTT
TTGCATTGCTCATCTAACATGCTCTTTCTGTGCTTGGTTGTTTAGCAGCT
ACGTGATATAGGCGTTGACATTCTTGTCGCTACACCTGGGCGCCATGTGG
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ATGGATGAGGCTGACAGGATGCTGGATATGGGGTTTGATCCTCAGGACAG
AAAGATTGTTGATGGGATGGGTATGCCACGAAATTCTGTGAGACAGACGA
TGCTTTTCAGCGCAACCTTTCTACCACAAATACAGGTATAACTTATTTAT
TTACTTCCCATGCATCAAAATAAGTAGTATTAAGAATGGAACAACTGACT
GTTTTCATGTTTCTGTTTACCGCAATAGCAGAATTCTAACATATTAACAA
TTAGACAGCGCATTAGCACTTGGATTTTCTGCGAAAAAATGTGTAATTCG
TTGACATGATACCTCTCCAGTGGATGATTACATAGTTATTAGCTTAGTAC
TATCTAGTTGGAAATGATTGAACTGATGATAGACTTGATTATGTCTGCTT
TGATACATTTGACTAGTAGTTGCTTTTATCCAGAGACTGGCTTCAAACTT
TTTTTCAAAGTACATATTTATCACTGTTGTGAGGGTGGGTTCAAGTACTG
ATCTGATTACCCAGAAAGTTGAGTTTGACTACAACGACTATAGCCGGATG
GCGAGGCTGCGCGCTCTCGTGCTTGTGCCCGCCAGAAAGTTTGCCACTCA
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TGTCCGTGGTTTGCCTAGACGATTGTGCCCACACAAGGGGTGGTGTGTTC
CCTTGTTCACGTCTCTCTTTACATGCATTGTGCGGGATTTGGGGCAGGTG
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TGTCCTCGGGGTTTGCATGGCTGATCTTGTGTTTGTAGTTTTTTTTTGCC
TTATTAGATGTATGCGTATTGTGCATAAGGTCTCTTAGATTATGTGAGTT
GCCTGTAATTTTTTTGGGGTTCTTAGTTGCTTCACTGGATATATTTTCAT
AGCTGTATTAGTTTGGGTACCGTTTTGGAAAGATTTTGTCGTTCGGTAGA
ACTTAGTTTCATTTCCCCCCTTCTGTTCTTTCATGTAAGTTTTATTTATT
CATCGTAGGAGTAACAGTTAGTCTGTTATGGAGTATGTTTGTATGTCCAT
TTGTCAATTTATGTATGCTTGTACTACTGCATGTTCTATGGTTTTGGTTT
CATTACATTCTTGACGAAACTTCTTTTACTAGTTGTATGTTGTGGAATTC
TGATGGATCTTTCACCTTTTTATGCATAACTTGGTTTATTAGTCCTATGT
TGCACTAATTTTCATCTAGCACACTGGCATACTTTGGTAATTTATCTCAA
GCATCACACTTCATTCTTCATTGTGTCTTGGTGCCTGGTTAGATTAGCGT
TGTTTTGATTTATGGATAACTTCATGAATTTTCTTTGCCATCATCTGGAT
AACTTCCAACTTTTGGCTTGCATTCATCTCTGTACTTTATTTGTAATCCG
AAGCTATCTATGTCTTAGCATTTTCCTTTATAATTCGACTTCCACAGTTA
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TGCTTCTGATGTTGAATAATGCAAGTTAGTAGATCTTTTCTGATGTTAGC
TGTCCTTGCTTTGAAACGTATATACACGGTTGATATGTGGTAGTATTAGT
GTCAATACTTGCAGGCCTCTAAAAACTTTCCATAAGTTTCAAATATCTGG
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CTTTACTTCTATTCTTCCATTCTGTCCAATGTTGATTGGGAGGTGAATGT
ATTTTGATCCATTTATGTTATGTGCTATGGTTTCACTGATAATAATATCA
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ATGTGTCATATGGGTCTTTTGTTGCTTAACCAATCCATATAACATTGATG
GATGTTTATCTCATCTGTCTTTTGGCATTGCTTATCTAACATCCTATTTC
TGTGCTTGCCTGTTTAGCAGGGCATTGACATTCTTGTCGCTACACCTGGG
CGCCTTGTGGACATGATTGAAAGATCAAAGGTCTCTCTCGAGGCAATTAA
ATACCTGGTAATGGACGAGGCTGACATGATGCTGGATATGGGGTTTGATC
CTCAGATAAGGAAGATTGTTGATGGGATGGGTATACCACGAAAGTCTGTG
AGACAGACGATGCTTTTTATTGCAACCTTTCCACCACAAATGCAGGTAAC
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GTGCATCAAGATAAGTAGGATTAAGAATGGAACAACTGACTGTTTTCATG
TTTCTGTTTACTGCAATGGAAGAATTCTAACTCCTAAGTTCCTGTAACAC
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TACACTTGATTATGTCTGCTTTGGTACATTTGGCTAATATTTGCTTTTGT
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GGAGGGTGGGTTCAAATCTGATTACTACCCAGAAAGTTGAGTTTTTCACT
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ATTATTTGCAAATTTTATTTTGTGAGATTTGTTATAATGTTAGTTTTCTT
GTTGGTTTTGCCGCAGCAGCCTCTGACATTGGTTTTTGTGGAGACAAAAC
GAGATGTTGATTCGTCGAGGTATTTGCTGCTGTACAACAAAGGTTTCCCT
GCAACAGCGATCCATGGTGATAGAACACAAGAGGTTAATCAATATGTCTG
AACTCTTCCGTAGTTGCCTAACTTGTTCTTTACATCAATGTAAAACTGCA
ACGGCTACACATAATTTAATCAACATTTTAAGTCTGAAATATCTTCGATG
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CTATATTCTTGTTTGAGTTACAAATTCCATCCTACCTATTGAGAGGACAT
ATCTAGCTTATGCATATGTATGCCTCTTACTCTCCTGTCATGCTTTATGT
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AATGATGGCTGTATGTAGCTGCTCCAGATATGTGCTTCACTTTTTTTCAT
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TGATATGTCTAATCTATTAATATAGTTGATCTAGCACTCAACTGTTACAT
GGGTCTTTTGTTGCTTGACCAATCAGTATAACATTGATGGATGTTTATCT
CATCTGTCTTTTTGCATTGCTCTAACAAGCTCTTTCTGTGCTTGCTTGTT
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TGTGAGACAGACTATGCTTTTCAGTGCAACCTTTCTACCACAAATACAGG
TATAACTTATTTATTTACTTCCCATGCATCAAAATAAGTAGTATTAAGAA
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TAACATATTAACAAGTAGATAGCGCATTAGCACTTGGATTTTCTGCGAAA
AAATGCGTAATTCGTTGACATGCTACCTCTCCAGTGGATGATTGCATACT
TATTAGCTTAGTACTATCTAGTTGGAAATGATTGAACTGATGATAGACTT
GATTATGTCTGCTTTGATACATTTTACTAGTAGTTGCTTTTATCCAGAGA
CTGGCTTCAAACTTTTTGTCAAAGTACATATTTATCACTGTTGGGAGGGT
GGGTTCAAGTACCAATCTGTTTACCCGGAAAGTTGAGTTTGACTTCAATG
ACTATAGCCGCATGGTGAGGCTGTGCGCTCTCGTGCTCGGACCCACCAGA
AAGCTTGCCGCTCAGTTATGGGGATCACAGTTTCTCTCTCCTCCTTAGAT
GCTTTGTGCGCGATCGCTTGGACGCCGTGTTGTTTGTGGGGATGCATTTC
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ATGGCTGATCTTGTGTTTGTAGTTTTTTTGCCATACTAGATGTATGCGTA
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TTTGGTTTCATTGCATTCTTGACGAAACTTCTTTTACTAGTTTTATGTTG
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AGCGTTGTTCCGATTTATGGATAACCTTATGAATTTGCTTTGCCATCATC
TGGATAACTTCCAACTTTTGGCTTGCATTCATCTCTGTAGTTTATTTGTA
ATCAGGATACACTTGATTATGTCTGCTTTGGTACATTTGGCTAATATTTG
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ATCTATCTTTAACTTCATCTGATGGCAAGGTACTATTTGTTCGATCTTAA
ATGTGACGAATGGATTAGTTGCAAGTTTTGTTTCGTGAGATTTTTTCTAA
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GTGGAGACAAAACGAGATGCTGATTCGTTGAGGTATTGGCTGCTGTACAA
CAAAGGTTTCCCTGCAACAGCGATCCATGGTGATAGAACACAAGAGGTAA
ATCAATATGTCTGAACTCTTCTGTAATGGCCTAACTTGTTTACATCAATG
TAAAACTGCAATGGCTACACATATTTTAATCAATATTTTAGTCTGAAATA
TCTGCCATGCTATGTCAGCACTGCGAGCTTAAGAACAAGGTTAAACTTCT
AAGAACAAGTTATATTATTGTTTGAGTTACAAATTCCATTCTACCTATTG
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TCATTTAGCTCACCAAATGAACAGAGTGTTTGTTTCTATCATTACAATAT
CCATAATGACTGTATGTTGCTGTTCCAGATATGTGCTTCTCTTTTTTTCA
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ATACAAGATGTTGTAAGAGTTCAAATTGAACTCCCATAACGTATTATATC
AGGAACAGAGGGAGTAAAACAAATAATCAGACCATATTTAGATGCCATAG
TGGCAGACATGTGCTGGTAGTTGATTTCCTTGTAGCCATGCAAATAGATT
ATGTGTTACGTAGTACATTAGCAGTCCTTTGACATTTTTTGAACTCTTGA
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CATGCTTGTTATCTGAAGGAGAGGGAAAGGGCATTGAGATCTTTCAAGTC
TGGCTTGACTCCTATCATGGTCGCCACTGGTGTAGCCGCGCGTGGCCTGG
ATGTCCCGAGTGTCAGTCATGTGATCAACTACGACCTTCCCAAGAGCATA
GAGGATTATGTCCACGTGATTGGAAGAACTGGGAGAGCTGGAAATGCTGG
GTGTGCCACTGCCTTTTTCAATGAACAGAACCACCCCATCTCAAAGGGTC
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GATTACCCAGGACCTCTAGAAATTACTTCTTCTAGACCCATACAGGTATT
ATATTTCTATGGCATCTATATCCTATAATCTGTACTGCCTCAGTCTTAAA
AAGGATGTCAATATTTCTCTCAATTCGTATGTATCTAAACACTATTTAGT
ATATGGATATATCCAAATTTGCGACATCCTTTTCGGTATGGAGAGAGTAA
TATTTCTACATGGAAAATGCAGGGTTTAGTAGAAGTCATGGATCAGAAAA
TATGTCTCCAGTTTGATAGCAAATTAACTATTGAAGAAGTCGTATCAAAA
GTATTCAACAATATTGGCATTTCATTTGATTATTGGGTCAAAATAAATGG
CCGCCTTGCCCAGTTGGATTGTATATTATCAAGTTTGGTGCCAGAATCAG
ACCATGACTTCTCATTATACATCTCACCTAGGATGCGAGGAGGTGCTGTC
AGGTGCTTACATTTTTCCTCTTCTAATTGTATATCTTGCTTTATTATTTT
AAAAGCAATTATATCTGGTTTCTTAATTTTTTATTTGGTTTCTTAATTGT
TGCTGATGCATCGCTATTTGGTTAACTAGTGTTTGCAATTTTTTTATTCT
TATTGCAGAGTTCCCATCTTAGATCACATCATAACATTTGCAGAAAATGT
TTTTGATGTGGTCTTGTTTCCAAAAGAGCTTCACTATAGAGATATGACCC
CGTATTTCTTGGGTCTGTCCAGTCAATCTATAGAGATATCTGTTCTTTTA
ATAAACCTTGTACATAGAAAGTATCCTACTAGGTGTCCTAGCCATTTTAC
TAAAGAAGACATCTTGTACAATAGTAAAAGAAACACAGTGTCATTCCGTG
CTGACTTTGAGTATCTTGAGTACACTGATGAATTGTACTATCAAAATCTT
CTTGACGTTGCCACCGTTTTCTCGGAAATATTCATTTACGATGAAAATCT
CCTTCTTAGCAACTCTCCTGCAATACATGTCCACAGCCCAAATATCCTAC
CTACTCCATTACCTCATGGTTGGAGACGCCCAATGCTTTTTGAACTTTTG
ATCCATGACCTTAAACAAACTGTCTATCAGTTTGTTCCTCTGGACATTTC
AAAAAATAAAGACTACTTTCTCAGTCATTTAGGTATTCTCTCAGACATTG
CCAGATTCGCCTTCTTGTTATCTTGTGAGCTTGATCTTAGCTATGATGGG
AACGAGCACAATATAGAAATTTTTGTGGGGTTGAGGTCGGAAGAACAGCA
AGATGCTACAGTCCTAGAGGGTGGAGAACTACGAATGGAAGAAGATGCCG
AAGAATGGGCTGGAATGGAAGCAGATGCCGAAGAATGGGCTGGAATGGAA
GAAGATGCCGAAGAATGGGCTGAAATGGAAGATGTTGAAGAATGGGCTGA
AAATGAAGAAGATGCGGAAGAATGGGCTGAAATTAAAGAAGAAGAGGATA
GATCTGAATCACCACCAATGCTGAATCGACATACCAGATTTGGATCTGAT
GATGAAGAAGAAGATAATGAAGCTGAAAAAGAAGAAGTTGAAGAAGAAGC
TGATGAAGAAGCTGAAAAAGAAGTTGAAGAAGAAGCTGAGAAAGAAGTTG
AAGAAGAAGCTGAAAAAGAAGAAGCTAAAGGGAGTGGCAAGCGCAAGCGC
AAGCGTAAGCGCAAGGGAGGCAAACGAAAAAAGGTCCGACAAGAGCAAGG
ACTGCCATCCAACCATATAAGAGTTGATAACTGGTTTTTTAAAGCAGACC
AAAGTGATATATTCAATTTACTTCTTGATGGACGTTATGAATTTACAAGG
CTTGGCTCGCAGTGGCGGTACTCCAGAAACTGGGTGACGCATGGGTTTGG
CTACCTTGAGACGGTAAAAATATATTCTTTATCTTGGAAATTTATAATTT
TTTATTCTTTGCACATTATGGTTCTAAGTTTTCCTTTTTTTGTGTGTGTC
CAGATGGAGGCTAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.