Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA033959

[Submit comment/correction]

Sequence
AA033959
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA033959
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGTTGGATTTCATGAGGTGGTCTGTTAACTGTTGTTATCTCGGTCGATC
TTGGGCGGGGTTCTATCTTGTGGCCGAATTGGGAGTTCTGAGTAAGCGTT
CTGGAGATGTAGGTTTGAGCTGGAATAGTTTCTCCGTAAGCATGGTTGTA
TATATCATTGTATGTCCGGTAATCATGGGCCATTTCTCGTTTATTGACGA
TAGATTTGCACGCCTAGAATGTGCTTATTCATGAGGGGATCAGACGAAGC
AGTACAGGTGTTTCGCTTATTTTATTCAATTATCTGAAGGAGGCACCTGC
TGGTACATTATCAGGTAATATGTGTTTCCATGAGGTGTTTTAATTGGCAC
CAATTCTCATTTGAACTGAGGTGCTAGATTTTGAAATGAATTATCATAGT
ATCTATTGTGATAATTATTGGCGGTTGTTGGCTAAAGTGTTCTAGTTTAT
ATGGTAGGTGTGGGGGTTAGGCTACATCTGCTGCCGAGCAGGGCATAATT
GGTATTTTGCAGCTGTCTCTTGTGACTTCTGATGTCTATGGTACAATTAT
TGGATTTCTTATATGGAGGTCTAGAAATGTGCTAATGATAAGCTGGTATT
AGGAGACTATATATCCTTGTTGCTGGTACATGGCATTTCTCGGATTGTAT
TAAGTTCTCGTTTCTACTGTTTTCATCCTGTTTCATCTCCATCGGTACTT
TTGTGCATATGTTATGTCGTAATTTGGGTAGTTGCGCTCTTGATTGTTTC
GCTTATCATGCTGATAAGTAATACACCTCGTTTGTTGTCATGTTTCAATT
TGAGTTCGTCGTATGTGGCTGCTTTTGCTCTTTAATTGATGATTATTCTT
GTAATCTTGATTTTCTTCAGGAACTTTCTAGCTTCCTACAGAGCTGTCGT
TGAAGCAGGTTTTGATGCACTGGAATGTTATTCAGAGGGTTCGGAGCTAC
TTGATATAACTGTGGTGTCCATCACCATCATACATCAGAGGTATATCATT
CATTGTTGATACGACCATCGGTGTAGGTGTCAATCAGTATGAGCTAATTA
ATTTCCAGTGTTCAACTGTTCTAATATATTTCCATTTGTTGATGATACAG
TGATCTCTTTTCTTGCCAAGATGGGAGTTTACCTCAGTACTCCAAAAACC
GATAAACTATCCGAAGACGGGGAAAATGATAAACTCAAATTTGGCCTTTC
ATCTATGCAAGGATGGCGTGCAACCATGGAAGATGCCGTGAGTTTCCACT
CCAAAGATACTCATCGTTTAATGTCTCTTAACAATATTAAACACTAGGTG
CCTAACGTGTGTCTTTGTGTATTTGCCAAGATGGCAAAAGTACAAACCAC
CAGCTGCAGGATCGACAAAACCAAAAGCAAACCAAAATAAAGACAGAAAA
AAGTTGAAAACCAAACAACATTGAGCTCATTTCTTCATAGAAACCTTGAT
GTCATGATCCAGCTTTCTTACCATGATCATACTTCCTAAAAATAATGCTG
ATACTGTTAGTCTGGTGGGCACACACATTCTTGTTTTGAACTTTGAGGTG
TGCTTCTATGCTGCCCCAAAAAGTGTAAAGCAAACACGGTATAGAACAGT
AAACTAAATGCCTGATTTGCAACCACCCACTACTCCACTAGTGATATAAT
GTTGCTTCAGGATTTTGTCCAATCTAGTTCCTGAGAGAGCATAGAAGCAG
AGATAACCATTTCCAATATCTGAAGTTGTTCATTTAGTGAACTGACAAAT
AATAGGGTTTCGATTGTTTGATTTTTTTTGTCAATAGTTCCAGGCTTTCA
GTTTAATGACCATCAGTGTCGGGTGCATAAGCTCTCATTCATATCTTTCC
AAATTCTAATGAATCAGTATTAAAGTAGTATCAGAGATTCTTTTGGTTTA
TACTGGTGCTTTAGCAGTGATTTGAACTATTTCTCTGTTGCACAATAAAA
GTATTGTTGATGACTTCCAAATGCTGCACTTTTGTTGATAACAACAAACA
TTTTGTTTCCATATGAGGAAACTAGTCCCCGGGTTCCGCTATCTTTCGAT
AACGGAACAGATAGTCGTTTTTAGAGCACCTCAAATTTTAACCAAAGAAG
AAGGACAGAAAACAATATACCAGAACAAACAGAACACCTGCTAAAAGTCA
ACCACCCAGGCTAAGATTCTATTTGCAACCAACTAGAGAGAAATCCAGCA
CAGATTTTAACAGACATATTACAAAAACAGTTCCCAAGCCCCAGGTTCTT
CACCACCTCGAAGTTAACCAGATATTATACAAGCTTCCCCAAGATTGGGG
GTAGGAGTCGCCTCCAAGCTTCTTTCATTCCTTGATATCAACAGACATAT
TTCTGATATATTGTAAAAGAAAAACACATTTCTGAGATCTTTCTCTTATG
TATTACTAATGTCTTGTACGATTCTGCAGCATTCAGCGTTGCTAGATCTT
GACAACGAGACAGCGTTCTTTGGTGTTTTTGATGGCCACGGAGGTAAGCA
TTACTTGCAAAGATCAGTACTTTTCTTGTTTGTACTCACTTGGTCTGTCT
CAGTAAAAAAGTACCTTAGAATTAAATGCGTCATATATATACTGAATTAA
AGCACAAGTACATCTTCATATTTCTTATGTTTCTCAGGAAGGGTGGTTGC
CAAATTCTGTGCGAAATATCTACACTCTCAAGTTCTCAGAAGCGAAGCAT
ATTCTTCTGGTGACCTAGGAACTGCTGTTCATAGAGCTTTCTTTAGGTAT
ATGGGTCATTAAATCACTACATGAAATGATATAAGGCTTTAGCGTTTGTT
TCGAAGTTACGGACAGCATCAAGATGATAAAGACTAACTCTGTTGTTGTC
TTACTTCAGAATGGATGAAATGATGCGAGGACAGAGAGGTTGGCGAGAAC
TATCTGCACTAGGAGATAAGATGAACAAGTTTGGTGGCATGATAGAAGGG
TTGATTTGGTCTCCGAGAGGCAGTGATTCAAAAAATGGAGATGATGATTG
GGCTCTTGAGGAGGTATGTATGCATTGGGAGTACATCACCAATTTTTATT
TGCATGATTACGTGTGATCTTATTGAACTATGGATCTTATTTGTGTTCAA
TTCTTAAGAGTTTCCTAAGCTTTGCAAGGTGCAACAATTTCCAAACCTTT
ATGTTAAATTTTTTTACACTCTTGTGCAAACTCAAGGCTGTCTTGTCCAA
ATGCTTCTCAAATGCAACAGCGTGCTTAATCATTTGAGTACACTTATCAC
AATGCTATGCTTAATCATTGTGGTGTAGCATTTTATGGATATTGTGACTA
TCTCAGGGTACTATCGCCTGTTGCCCCCATTGTTTAAACTATATCATTGT
CCACAACGCATAACCCCAGACATTAAGAGATTTTCGGTCTCCTCGAATGA
AAATGAGTTTGATCAGCAACACCGGTCTCCGCAGCACCAGGATAAAGATC
TTTTTACAGATAACCTTTCTCTGCTAGAATTCTCGGTGAATGTTTTTTTA
CCATACATTGCCTCAAGAAGTGACCTCACTGCTTTAGAGAAAATACTTTG
TTCATATTGCTATCCCAACTGAAAGCGTAGAGTATTCAGCCGTTCTTGTT
CTGATTAATTGTATCTGGAGTTTCTTCTGTGCATGCTTTGTTCTCTTATT
TTGTTTATAGTTGGTACTGCATAATGCTATCCACGTTTTTGACAATATTT
CAGTCAGCAACATATTTGCTACAAGATAATACCAAAGAAAATCAGCAGAC
TGCATATGAAGTCAACGTATTGACAGTGGCTTATATGGGTGGACTGACAC
ACATAATTCTATGGTTTATTAATTCGTGTGGTGTTTGTTTATGTTATGCG
CTGCATTGCAGTGCTAGCAACCTGAAAAAATGAGAGCAAAAAGGAATGAC
ACTGCTCCTGTAATTTTCATTGTCCTGAAAATGCAGTTATTATGGCACTA
TCGTTTTATGTATGCCTAGTTTAGTTTTGGTGCTACTAAGCCAGTTCACA
TCGATAATCTTATACCAGGGACCCCACTCTGACTTTGATGGTCCAACATG
TGGAAGTACAGCATGTGTAGCACTAGTAAGAAATAATCAACTCGTCGTGG
CAAATGCTGGCGATTCTCGTTGTGTTATTTCTAGGGGTGGCCAGGTATGA
TATTCTTGTGCCTCCTATTAGTCGTAATTAGTCATGTAGATATGTCAGGG
TGTTAAGAGTGTCCGTTCTGTGTCACATCTTGACAGGCATACAATTTGTC
CAGAGACCACAAGCCAGAGCTTGTGGCTGAGAGAGAAAGAATACTAAAAG
CAGGTGGATTCATACGTATGGGCCGGATAAATGGAAGTTTGAACTTATCA
AGAGCAATCGGTGCAAATTTCTTCCTTGCTTATTTGAGTGTTCCACCTCA
CTTGGTGTCTTACCTATATGAGTACCTTTTGTAGGTGATATGGAATTTAA
GCAGAATAAATTCTTGTCTCCTGAGAAGCAAATAGTGACTTCAAATCCTG
ACATCAACGTTGTAAGCCGTCTAAATGCTTGCACTACCTTGAATTCTTTA
CTTAATCATGATCTGCAATGACTCTGTTATGCTATCATTCTAAGATCACA
CAATCTGTTTTTTAGGTGGAGCTTTGCGATGATGATGACTTTCTTGTTGT
AGCATGTGATGGCATCTGGTACGGCCCTCCACCTGCAGTTCATAGCCATA
ATTTTCGTCTTTGTTCCCATGTTTTATATGCAGCTCAATTGCATAACTTA
GCAGCGAAGCACTTCGCTAGTTTGTTTTGTCTTACCTAGTGCTCTTAAGT
CCTAAAGGAAGCAATACATTTATTTAATGAACAGGGACTGTATGTCAAGC
CAACAGTTGGTGGATTTCATCCATGAACATATACACACAGTGAGTGCCAA
GTTACTTTCCAATCTCAACGATGTACATTGGGGTATTTGGCAGTTAATTA
AATACTGAAACAAAACAAAAATTGCAGGAGAGCAGCCTTTCTGCAGTGTG
TGAAAGAGTGCTTGATAGATGCCTGGCCCCATCAACAATTGGTGGAGACG
GATGCGACAACATGACTATGATCTTGGTGCAGTTCAAAAATCGAGGCAGT
GAGAAGAAAAAGGCCGACTTGGCAGAGCAATCTGGAAAAGGCGAGGAAGA
GTCTGAGGTTCGGTGAGTACACACCGTTAATGGAAGGCTCTGCGACAAGT
GATGCCGATGGCAAATGGTTCTTGATGCTCACGAGGATGCAAATGTGTCA
ATGTGAAATTGTGTGCATGCTCTGTGGATGGAGTATCAACCTTATGTCAG
TCGAATGCTGTGGCTGTGCACATTCTGCCTGAGAACCTGGGATAAAATAG
CATTGGTTGGTGCAACAGCAGAATACCGGTGTGCAGTTCTGTTCGTCCTC
ATGCCAAAGTGGACTTTCGATTTTGGTTTCGGTCATCGACGCTTCCCAGA
CTCGTCAATCTCACGACTGTGTTATGTTCAATGTATGTAGTAAACATGGC
TGGGGTATTTGTTCTTTTTTGTTGGTATATTCTTGTGTTCATACAGTTTA
ACAATTCCATGCCTCAGGGCTTGGCTGTTGTTCTGATCATGTAACGTATC
CAATATTTTTCTGTTCAATATATTTTGTTAATTTGCCAGG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.