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GrainGenes Sequence Report: AA028575

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Sequence
AA028575
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA028575
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GGACAGTAATTTATTGTCATACTTCAAATTTGGATGGGTGAGACACTTAT
GTTGCTGATTATACAAGTTAAAACTACGTTTTTTCCTCTCTAAAAAGAGC
TAGCAGTATCTTTATTCTTATGGATAGCACCGCTTCTTATGCCATCGAAG
AGAGCAGTAGCGTCACTAAACCCCCTTTGATTCCTCAGCTCTACAGTTCA
TAATAGTAATACTATTCAACTACTATGTTCTGCTACAATTATAAGATGGT
TAAAACAATCTCATCTCAGCGCAACGCCTGCCTTCACCTTTTTACTGTCT
CGACTAAGCTAACAAACCAATACAGCAACACGGCAAACACACTGACTATC
GATTTTCATCTCTCCTGGAAGCTAAGACGACAATCAGTATATTAGTCTTC
CAAAGCTACTACCTCTTCCTGCGCTTCGAGGGCTTCGCCGACGACACCTT
CAGTTCTTCAGGCATCTTAGCCTCAACATGTTGCTCCTGCAGAGAGGCAA
AACACAGGTGAGAGATGGCTTGTGTGAAGAAATCAAGAAAGTGCATTGTC
AGGAGTAGGAAAAATCTACGCACAAAGAAATTATACTACATGCAGCCCTA
GATCAGAAAGGTTTTGAAGATTTCACTAACTGGTACAGCAGCTGTCATAC
CAGTGGAAGCCTGGAATCTGCTACTTAAGCAGAAGAAGGACTGCTGGACA
AGGAGCACTAAGAAAAAGGAAAAACTGAACAAGGGAGGAACTGACGGCAA
AAAACAGAGCAAATGCAGAGTAACTTCCGGAAATAGATCATTTGGTTTCA
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CGATTTCAAAATGCAGAACAAACAAACGGGAAAACGCAGCATATGTGGAA
ACGAGAGATACATACCTCCTCCCACTTTCTCTGTAGCTGCAGTAGCTCTT
TACAGCTTGCGACGCACTGGGCATGGTAAGCATCAGCTAGCTCTTTGATC
AGCGCCTTCCTTTTGATGATGCCCATCACTACTTGAAAGCATAGATATAA
ACTATTATCATGTGATGAAGATGTGGTAAATGTCTAGCGATAGAACCGAC
AGAGTAAGAAAAATCCTAAAGATGCTGCAGTATACAGTAGTACTATAATG
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CGAAGAGCGGTCTGGTGAATTCGATTTGGGGGGGGTGGTTGTAGGTAGCA
AAAAAGTAGTGTAGGTAATTTGTGAAAACATTGTCAATCACGGGAATGCA
TATACAGACTCTTTTAAGACAGCATCAAATGCGTTCGATTTGCTGTTGAA
CGACTTTAGGAACCTCAGGACTCATGAGGCAGGCACGCATGGTAGCTGCA
ATTCGAGAACACCCGATTCATCAACATACATAAGTAGGTAGGTAGTACTT
AGTTCCCAACCCAACCACGAATCAAATCGAACTAAGAGAACCCTTTGCCG
CGAATCGCAGGAACCCGTTGCCGCGAATCGCCGGGCACCTAACTAAGAGA
GAGGAGAGAGGAGAGAGGAGAGAGGAGCGGCCGGTTGCTTACTCCGGCTG
GGGTCGAACTCCTCCGCGGGCTTCTTCTTGTCCCCCCCGTTCGCCGCCAT
CGCGAGCACCTGCCAGGGTCGGGTCAGGGTCGGGTCGGGGTTAGGGTTAG
ATCCAGCCAGCCAGCCAGGAGGAACGCGAGCGCGCTTATGATCAGCTTCA
CCTTCTCAGAGGTCGGGGGATGGAGTATATTTCTGATTCGGACGGAGGTA
GCAGGCCGGCGGCGAGGGGGCTCGGCTCACCGGAGTCGGAGTCGGAGGCG
ACGATCGAACAGAAGAGAAGAGCAGAGCAGAGAGCCTTATGGGCCAGCCA
GTTCGGGGTCTGGCCCAGTTTCGCTTCCATCCCATCCCGACATTACAAGC
CCATTTACTGGGAAGGCCACTCACTCACTGTCTTCCCAACTCACTCATCA
TCGAAGCGTTGCGTTTGCGTTGCGTCTCTCTGCTCTCTCTCCCCCGACCC
GACCCGACCAGACCAGACCAGCTCTCGGCTGGCTTAGGGTTTTCATCCCC
GCCGTCGCCTCCCACATTCCTCCGCCGCTTCCCTCCATTCCCCACCACCG
GCCACGCCATCTGCCGCCCGCCGCGTCTACTGACCTCCTACTCAACCAGA
TCTACCCCGTCTCGCCGCCGCGCTGCTCGACCTCGGCCTCCGTCTCGCCG
CCGTCCAGGTCGCTTAAGGGCCCTAGGCAGGCGGGCAGGCGGACGGACTT
TCTGCCCAGAGCATAGCGCCGATACTGACGCCCTCCCCTGGAGCACGCCA
AGGAGGCGCATTCGGCCGCATCCGGTGTGGAGCTCGAGGACGCGCGCTCT
CCGTCAACGCGTGCCCTGAGGAGGCGCGCCACGGTGGCGGCAACGAGTCG
CCCTCCTACGCACAGCCACCTTCGTCCGTGCCGGCACCATCGGGCCAGAT
GCTCGGGGAGGACAGCGGTGCGGTTCCTGTCACCGCCTACCCCGAGGCGT
GCCTCGGCAGCGGGAACAGGAACAGGCCGTGTTCGGTTCCGGCACCTTCA
TCCATGGTGGCAGCGCCCACAGGAGCGCCGGCATTGGTCCAGGACTATGT
GGGCACGATTCCTGTCGCCGCCTACCCTGATCTGAGCCACGGCAGCGGGG
ACACGCTGTCCTCTCCTCCTGCACCCCTAACTTCGTGTGCGCCGGCATCA
GGTCTGATGCTCGAGGGCTATGCGAACAACGGTGCCTTTTCTGCCTCCAC
CTACCCCGAGGCGTGCCATGGCAGCGGGGACACGTCTCTGTCCGCTCCGG
CAGCACCAGCGCCAGGCCGGATGCTAGAGGAGTACAGCGGTGTGGTTTCT
TTCGACCTCTACAACAAGGTGTTCCACGGTAGCGGCCATCAGTCGACTCT
GGCACCTTCATCAGCGGTGGCATTGCCAGCACCGATGCTCAACGGCGCTG
TTTCTTTCACCGCTTACCCCAGGGTGTTCAACGACAGCGGGAACAAGTCA
TCTTCCGTTCCAGCGCCTTCATCTGTGGTGGCAGTGCCAGCACCGGCGCT
GGCACCGATGTTCAACGGTGCTGTTCCTTTCACCGCCTACCCCGAGGTAT
TCCACGACAACAGGAATAAGTCGTCTTCCATTCGGGCACCTTCATCCGTG
GTGGAAGTGCTAGCACCGGCGCTGGTACCAATGCTCAATGGTGCTGTTCC
TTTCACCGCCTACCCCGAGGTGTTCCACGACAACAGGAATAAGTCGTCTT
CCATTCGGGCACCTTCATCCGTGGTGGAAGTGCCGTCACAGGTGTCGGCA
CCAGGCGGGATGATCGAGGACAACAACGTTATGGTTTCTGTCACTGCCTA
CCCTCATGTGGGCCATGGAACCGGGAACAATAAGTTGTCTTCGCCTTCGT
CCGTGGTGGCACTGGCACCGGCGTCGGGTCGGACGCTCGAGGACTATGCG
AAGGAGTGGGCGTCGAGGAAGGCAGCGTCAGGTGCCCCACCGTACCACTG
CGTGCTGCCATTCCTAACCGGAGCACCCAAAGCGGTAAGTAATGTTTCTG
GTCCTCCTAATGATTGATTCAATTTGCCGATTGTTGCTCCAGCATTGCTT
AGAATTGCTGTTTGACCCGAATGAACTGTCTGTTTGTGTGGGAGGGCTCT
GGGGTACTGGGATTACTCTGTGCATTATCAGACTCAAGTGTAAATATGTC
CACACCTGTATATCCTAGTAGCAAAATTCAACGCAGACATCTCAATTGGT
AATACATTGTTGCAGCTATGTATTGGTCAAGTAAGAATAAATAACACTCA
TACAACACAGAGAAAATAATGAATAGATTACAGGAGGGCTACTACCCACA
CACCCCACATCACCTCTCAAGCAAAAACACATTAAGTCATACATTAAATG
TAAATGTCCCCAGAACTGCATATTCTACCAAAATGCAACCCAGACATCTC
GTTTGTAATACATTGATGCAGCCAAGATCAACCAGTGCTCGAGCAGTTTG
ATGTAGACAAGTCAAACGTATAAAAGCCATCACGTTTACACATATTTTAC
CCCCTCTAGCCACAGCTCACAAATTCTTAATGCTCTTTAGATAGTATGCT
GTCGTCATTTCTCTATCTATTATTAGATCAACATCGGGGCCAGGTTTCAG
TTTTGATCATTTTTTATTGGCTTAGCATCTTTGGCTTCTTCATATGTGAA
CAGGTTGAATGTCGTCTGTGTTATAAGCTTATCCATCCCTTGGAGGAAAT
TAAATGTTCAGTTAGCCGTTGTGAACAAGCATTCCATCTGTCCTGTGTGG
TGGAAGATACTGCAAGTTTCACGGCTGAAAGCTTCAAATGTCCTCAACAT
GTAAGTTCGAATGTTATGAAATGGGTATATTTTATGTGGGAAATACATAA
GGCTTTCCTTAAATTGCAAGTTATGTAGCTTAAAAAATTTATGTTGTGAT
GTTGTTGGGCTTGTCAACCTGTCATACTTGAGTATGCCTATCCTGTCCTA
ATATGCAATGTATTGTCAACATGGATACTTTTTACATTCAGCATAGGTGC
TATACCAGATGGGTTGAAAAAGAAGATGCAATGTGCATTATAAGTAGACA
CACTTACATGTCATATTAAGATAAAATCTATTTCCAAATGACTCAAATGT
ATTTTAGTCTCATAGGCTGATAGTTATGTTTGTCGATGCATGACCAATTC
ATGACCGCCACATGGCTTACTATATGTAAATGAAGAAGTAAATAAATAAT
ACAGTATATCTTTTTGCAGCATGTATAAAGAAGATATTGTAAAAGGTCAA
TTCCTGTTGTAGTCCCAGTTTTTTTAATCCTATGTTGGTCCTTTTGATTG
AAAGATCTTCAAATTTAACAATGGCCTGGGTCGACATGTCATGAAATGAA
ACATTATGTTTCAGCTAAGGATACATTTTAGGCAACTATAGCATGCCTCA
GTTTTAGGTCCTACAGCAAACCAAAGCCCAGAGCTATTTGGCCAAATTGA
ATTCAGTAGTTAATAATATATGTATGTAAGACTTTCTGCACATTAATTTC
ACTTTCCTTCTCTATAATTAGGGTTGCATGGTTTGTAAGCAGAAGATGTT
TTTTTGGCGATGTGGACGTTGTACAGTTGCAGCACATACAAAATGTGCGC
CGTGGCCACTAATTCATCTAAAAAATGACCAAGGAAGCGCAATTTGCTGG
AGGCACCCTTCCAATTGGCTCCTTCAAAACGAGGTCTATCCTTTTTTCCT
TATGATTGCTCAGTTTGTATTGCTAGGCGTGAATGAAGTAACTACGTCAC
CCTCTAATTTATTAGCCCCTCTTTCCATAAATTGATGAAGTTTTGGACAC
AGACACTCCCCACATACAACTTTGACCATTACGCTTAATTTTAATGTTTT
AGTAAAAGTGGTACAATCATAATATTTTGATAACCAATCTCGTGGTACTA
TTCTCACTTGACTGATCTAAATGTTCTTCATGTTAGCAATACACATTGTA
GATGTTTGACTGCACACTTTCTAGGACACCATCTATTTACGGCTGGAGGT
TGTATCATTTAGTATTTTCACAAGAAGAAGAAATCCAGTGCAAGTATTCT
TAGGCACTTTTGAGTTCTGTTGATGCAACTATGCTGAAAGCTGCAACCCT
TCTGATGCATTTCATTCAAATCAAGTCACTTTTTTCTCTCGTAGCCTCTT
CCATAAATGGTAGATGGTACAAGTATCCATGAACATATAACCGTGATAAA
TCGTATCAATGTGCCTCCAAAATTTGCTCATACTCTGTGTTGTCTTATAG
TTTTTTAATGTTTCACCATTATATCCATGAAACTATCATGGCTGTGTGGC
TCTTCCTTCTGTTAACGAAGTACAAAGCCACGTTCCAACAGAAATAGATC
AATTTATGGATTTCATTCTTAATAAAATCAAAAGTTTCTACAACAAGTGG
CATTTATTTTTCTGTTAGTTCTATTCCAACTATAGATAAGCTTGGTTCAT
GGTTTCGTGCTCACTTCTGATCATTACAGTACTTTTTTCAATCAGATCTA
TTTCACCTCTAGATTATTAATTAATATTACCAGAACGAGTTGGATGCCAC
TTTGAGTTTATGATTGGAGAGCTTCACCACAGATCATTTCCATATACCAT
TTTGTTAATATTTGTAATGGTTGAGGTGTCTGACAGGAATACTTTGTTTG
ATGGTGACAGAATGCTGACCTGACAAACAACATAGAGGTTAGTGCTGGCA
TTACAAATATTTGTCCTTAGAGTGATAATGCTCTTTAGGCTTTAGGATGC
TTTTATCTGGTGATCCTCCTGAATTCTCTTTAAGCAGAGCAAGATTGTTG
TCTTATGCTCAGTCCGCATGATAAATAGCTGATGTTTTGGGACGTGTTAG
GTCATTTGTTTAAGATTAGCTACATATAAAAAACATTTCCATATTATCTT
TTTGTTTAACTTTACATACTACTATGGCTGTAAATGTACATTGGAGACTG
AAATGAAATGAATATTACTACCTCCGTCCCAAAGCTTAAGGCTTATATTT
TTTTTCAAAAGTCAAACTATGTAAAGTACTAAAGTTTGACCAAGTTTTTA
GAAAAAAATATTAATATCTACAATATGAAATCCATAGCCTTTGATACATC
ATGAAACATATTTTTACATGATATCTATATAATATCATAGTTCTTAATAG
TTTTTTCTAAAAGTTTGGTCAAACTTTCCGTAACTTGACTTTTCAAAAAA
AAATATATGCCTTAACCTTTGGGACGGAGGTAGTATCACTTTATAATGAG
AGAGTTACAGTATTTTGGATCAATACAGATACGAGGGACCTATTTAGTCC
ATTAATTCTTGAATGCCCTAGAAATAAATTTATATTTTCTCATGAAGAAT
ACGTCTCTTGCCTACCTAAATTTTCTTTTCATAAGTAATGCTAACATGCT
TGTTTGATAGGAAGCCTTCTGTCGACTACCTCTTCCATATGTAAATGAAG
AATTCAATATTGATTCAACCATTCGGGATTTCTCGGCGATTGTATGTAAA
CCGCCCTCATACACACATATCAGGCGCAGTATCCTAAAGTAATACTTGTT
ATTGACTCGAGCTTTTTGGATCTATTTACTTCCATTTCACGAGCTTCATG
TTCATCTGCATTCCACCTCTACACGTCGTCATTGTTTTCTTAATGTTTTA
AAAGATGTATATTTAGTCAAGAAGAAACGCGCTGATTCAAGTGCCGAGAC
TGGGTGCAGAAATTGCAGAGCAGATTCTGTTTGCAGTGATGATTGTGAAT
GCAGGTATTCTTCCTAATTTTTTTTATAATAATTCTTCCTAACTCCACTG
ATACATTTCAGGCGCATACATGAGTAATGAAGTTTTAACAAAACTACCTC
TAGTTTTATATATGTGGAATGTTTCATTGCGTTCTTAAGATGGAACCTGA
CATAGCTTTATGGCAAAAGAGCGCATATGCATTTATGGGTACTTAAAGTT
GCCTCGATACTCAAGTATATTGACCATACTAACCGAGATTGTGGATCAGG
AGCGATGCATTGAGAGAGCACTAGGAGAATGAGAGGAAAATGTTGCTGCC
AAAAGACCTCAGTATATATATTATAATTGGCTCCTAATTGGAATACCACC
ACTATAAAAAAAAATTGGAATACCACAGAACCCATGTTCGTTCACATTTG
CTGATTGTCAGTCCATGTCGGTTACATGGCAAAAACCAAGTACACTGTCA
TCTATGTTGATTAATATACCTTATTAAAATGGAGAAGTTTAAAATACTAT
CACAGAATTTTTTCCTTTTGTGACTTGATGCATGGATCGAATTTGGAATC
AAATGCTGCATTATAGATTCATGTATTGTCAATGCAATAGTATTGGATTC
TTTCTTTATACATGGGAGCATAGTGCCAAAAGGTGTGATAGTATTGGATT
CTTTCTTTATACAACAGAAATGGAGTGTGTTTTCTTGTTTTTATTCGAAT
ATTAATGCTGGACTACTGTTACGTGTGCATATTACAAATTGCTGAATAAC
CGATCTTGTATAAATTCTGTACATGTGTACACTGAACAAAAATGTTTACC
CAGCAACGCGTATTTATTTTAACATTGGAATTTGGCTGTCATTTATCAGG
GGTCTTTCTATGAGCTGTTCCAAGAATTGCCGCTGCTCAGACCTTTGTAG
CAACAAGCCATTCCGCAAGGATAAGAAATTTAAAATTGTCAAGGTAGTTC
TCTTTTGCAAATGATGAGCTCACTTGCCAATTATTCACTGCCGTTGTCTA
ATTTATCAAAACGCAGATGAAGTTGCATATTATACTTTTATTTCCATTAA
TTTATTCACTGCTAAACAATGCAATGCATATGCTAGTTCTGTTTTTCCTT
GGTAGCTGCCAAAGTACCCACTGCGGCACTGCCCCAGAAATCCCTCTTTC
TAGATTATTGGATGCAAAATGACATGTGGCCATGATAGGGTTGTTTTTGA
GAATCGGTTGGTTTTCATGCTTGCTAAAATATGTTTATTTTACTACTTCG
ACTACAATCACAACAGTATTTTTCCTTACAGTCAGAAGGCTGTGGATGGG
GTGCTGTTGCATTGGAGCCATTGGAGAAAGGCGATTTTATAATCGAGTAT
GTTGGTGAAGGTACAAGTTTTGTGGCCATGTTAAATATTTCTAATAGAAA
TAACAAGCAGTTGGTATATGGCTGCACATAATCTCAACAGACGTGTTGTC
CAATGCATTATGAGGCTGAAAAGTGGCATTATTTTGATGAGAAATAGAAA
TTCTTCAGTCAGTCTGGCAATTGGAGAGTGAGGAATTTTCGTTTTGATTT
AATCTTTTAGCTTAAAAAAATGGTGTATTGTTTTCAGTTAGTCTAACTAG
TTTGGAATGTTACTCCATTAGACAGTTTGGATATCTCATTAACCTGAACT
GACCTCACTAATGAATCTTTTAGACCACTGAAAGAGTGGCATACTATCAT
CTGATGAAAAATTCCATAAGTTGTCTGATTAGTGAAAAAAGGGAAAAATT
TGCACCAATAGTTGTGAAAATATGGCATAGCTACAATTAAGAGCACATGC
ACTAATTTATTATTTGTACCACATTATCTTCAGGCTGTGACATGTTCTTT
TTATTCATTTATGCATTTGCTGTACCATATATGGAATCCATATTGCCAAC
AATTGTCTTGAACCTATTATACCCTTTGTGTTTTTTTTTGAGAACATTTC
ATTGCATAGGTAGAGTTAAAGGTACCCTTTGTGTTTTTAACTGAGTGATA
TTTGCATGCCATTGAATGTAGAGGTCATATTTTCTAAATCAAGGGAATAG
TTAACTTGTGGTTTTAGTCCTGAGTTATCCTCTGTAAATCTGCTGTGATG
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ATGACGCAACATGTGAACAACGGCTTTGGGAGATGAAACGGCGTGGTGAC
AAGAATTTCTACATGTGTGAAATCAGTAAAGACTGTACAATAGACGCGAC
ATTTAAAGGAAACACTTCACGTTTCCTAAACCATAGTTGTGATCCCAACT
GTAAACTAGAAAAATGGTAATAATTTCTGAATCAGAAAGCTTGTTCCATT
CAGTAATGTTAAGGTTTCTTTTAAATGGCGATGTTCTTGAATGTCTATAT
GCATGGTTTATTAGGCAAGTTGAGGGCGAGACAAGAGTTGGTGTTTTTGC
CTCTCGTTCCATTCAAGTTGGAGAACCCTTAACCTATGACTACAGGTATT
TACAGACATTTTTATTATTTAAAAATAGTGATATATTTCGTAATCTATTA
ATGCAAAGTGTCAAATTTGTTTTTATTCACTTGACCTGATAGATGTCATG
TTTTTCTTAGACCCACGCAACAGTTTGGTTGTTCCTATTGTTCCCTAGTC
TGAACTAGTCTTTTGGTAGATAGATTTGGATGTTATTCAGAGAGGATATA
GTCGTTCTGCATGGTTTAATGTATGGTAATCAGGGGAGCATATTAAATGA
GATTTATTCCACTTTACATCCACCTTCCACCTTTGAGTGAACCGAGTACT
TGAATTACACCGCTGGACCCTGATTTAACGATTTTTTTCGCATGACCAAA
TATTTTGTACGGGAAAATGATAATTTACCACGTTCTTACAGGTTTGTGCA
TTTTGGGGAGAAGGTCAAGTGCAATTGTGGAGCAAAGAGCTGCCAAGGAT
ACCTGGGCATCCAACTAAAGAATCCAACACAGGGCGCCCAAACAGCCGCC
GCAGCGCTCGAGAACGAGGGTGACTGCTCCCCTTCGAGGCTCAAACCGGA
GACCCACTTGTTACCCTGGACCAATTGTATAGAGGTTCCTTTTAACTTGA
GGAGCAAAACTAAGATCGACCGGCTATGCTGGGGACGCAAACGGCAGCGA
ACGTCCATCATAGATCCATCTCCATCTTCAGCTAGTGGGCAGCTATCGGT
TATCGAAGCTGCTGCATCTATTCCAAAGGGCTTTTCGGCTGAACTGGCAT
GAGCCGAAGTCGTGAGCCCTTCTGTATAATAATCATGATGATACATTAGT
TCATTTGAAACGATTCTTTCATATTTACTGATTTCATCGCCACCGGATTT
CTCACTGTTCTAGGCTGAAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.