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GrainGenes Sequence Report: AA005571

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Sequence
AA005571
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA005571
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ACTTGCTATATAAATTCCAGCTCCCTTTTAGCCCCCGATAATTAGCGTTA
ATAAAATCCTCGCCAGGGAGGGAAAAAGAAACCCGAGAGCGTAACAGACA
GACGCCTCTCTCTGTCTGCCGCTGCCGCCTGTGTATGGGCAGCGCCTCCC
TCCCACTCCCTCCCACTGGATCTGCAGTGGCCGCGTAGCAGCAGGAGGAG
GAGGAGGCGAATTCTAGAGATTTTTCGCAAAATCTCGCGTCCATTCCATG
TCAGGTTCGGCTCTCCTCGCTCTTCGCCCTCCTCCGATTTTCCTCTGGTT
TTTTCTCCGTGGCGGTTTCGGTTGGTTGGTTGGGGAGCGGCGGCGCTGGC
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AATGAACTTATATTCTGTTGCATCTTTTCGTGGTATTGATGCACTGAATC
TCAGGTTTATTTTGTGGACCTATGTTTGATTGACAATAGGATGCTTGTCA
TTGCCACAACTTTCTGTAACTGTCTTATTCCATCTCACCTTCTACGTATA
AATCCATGTCAGTTAAGTAATTTGACAAAATATAATATAGATAATTATTC
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TTCTACAGTGATTTCATAGGCATCTTTGAAACATTATTGTCATATTGTCT
ATATTTATTTTTGAACTATCTGTAACCATGTGATTTCCATCAAGAAGATA
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GAAACATGGGATTGATCTGACATCACGGTCATCATTATGAACACTCGACC
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CAATACTACGTTTGCATCTACTACTTATGGTGTTCAATGTTTTATGCAAT
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TATTGTTTTGTTCTTTTCCCTTTGTAGTTTTGAGGGTATATATCTGTTGC
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AAGACGGGACTACTAAAATATCTGTTTTATTCACTTGAGGAATAAGTTTC
TAGAACTCATTTCTATGACAACCAAATCATTAGGGGAAAGGAAATGAAAG
AGTCTATAACAACTGCCCCATACCTCAAGAAATTTGTGCTTCAAACAAAA
GCTTTCTCGATATCTCGGTTATTATTTGGATCTGTCTTGAAATTATGAAA
GCAAAATAAGCAACTAGACCTCCACATTTGAATACATGGTTGCTTCGATT
TATGATATTACAACTGTAACAAGATGCTATTGTACATGGAAACACGCACA
TGATTTTAGATTCAAAAGCAGGATTGCGAATTTTAAAATGTTATGGGCCT
TACTGCATGGGAGAGGTGAACTGAGCATCGCTCAGCTTGCTAGAGGCGCG
AGTGATTGCCTACCCTACCCGGGTTTGAGGCTTGGCTTCCACGGAGTGTG
CTCATTTGCTCAATATTCTTTTCTACGTAAAAATGCCATGGGTGCTAGTG
CCTGTTGGTCAAGTACAGGGCCCTTAGGCTCCTAAAATAGGAATCTAACA
TGATGGGTGACAAGGCAACCGGTTTATACAGAAGTTGGTCGAAGCACCAA
ACGGTTAGTTAGGCTCCTGGGTCTTTTTGATAGCTTTTCGCTTTTTTTTT
CCTTTAAGTTTGTACTTTGGATCTTCTTGATGATATCTCTCTAATAGGCC
TTTAAGTTTGTACTTCGCATCTTCTTGACGCTATCTCTCTAATACAAATG
GCATGCAATTTGATGCTTGTTCGAGAAAAAAAAGTCTTGAGCATTGTCAA
TGTCCTAAAGAACTTAAATTTTGGATTGGAGGAAGTAGTATCATAGTTGT
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ATTGTGAATATTGAACACTATAACTAAGATGATTGTCTGTAACTGCAGGA
ACCGAGTCAATATGGAGGATGAGGAGACACTTTCAAGTGTTGCTCAGTGT
ATTGAGCAGTTGCGGCAGAGTTCTTCGTCCACTCAAGAAAAAGAAAGCTC
ATTGAAGCAGTTATTGGATCTTGTTCAAACACGTGATACTGCATTTGGAG
CTGTTGGATCACATTCACAGGCTGTTCCAATACTTGTTTCTCTGCTCAGG
TCTGGCTCATCTGGAGTTAAGATGCTGTCTGCTACTGTTCTGGGGTCTCT
TTGCAAGGAAGAGGAGCTAAGGGTGAAGGTTCTGCTTGGTGGTTGCATCC
CTCCATTGCTTGCTCTTCTCAGGTCCAAGTCAGCTGAAAGTCAGACTGCA
GCTGCCAAAACGATATATGCAGTTTCTCAAGGTGGGATAAGGGATCATGT
TGGATCAAAGATATTTTCAACGGAAAATGTTGTTCCAGTACTGTGGGAGC
AACTCAAAGTTAGCCTCAAGAATGAGAGTTTGGTGGATGGCCTGCTAACT
GGAGCACTGAAGAACTTGTCAAAAAACACAGAGAGGTTCTGGTCAGCAAC
CGTGCAATGTGGTGGAGTTGATATACTTATAAAGCTGGTTGGTTCTGGAC
AGACAAATACTCTAGCAAATGTGTGCAATCTTCTTGGGGCCTTAATGATG
GAAGACTCGTCAGTTTGTTCCAAAGTTTTATCAGGAGAAACAACAAAACA
GCTCCTAAAGTTACTTGGTCCTGGTAATGAAACTTCAATTAGAGCAGAAG
CCGCTGGTGCTCTCAAATCCCTTTCTGCACAGAGTAAAGAAGCTCGGCGT
GAGATAGCTAGTTCTAATGGGATTCCTGCTCTTATAAATGCCACTATTGC
TCCATCAAAAGAGTTCATGCAAGGAGAATCTGCCCAAGCACTGCAAGAAA
ATGCGATGTGTGCATTAGCAAATATTTCTGGTGGTTTATCTTATGTAATC
TCAAGCCTTGGTGACAGTCTTGAATCATGCTCTTCCGCTGCACAGATTGC
TGACACTCTTGGTGCATTAGCCTCAGCATTAATGATATATGACATAAATG
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AAACAGTTTAAGCCCAAGGCACCCTTCCTTGTACAGGAGCGTGTAATTGA
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ATTCTGATGCAAAACGCTTGCTTGTTGGTTTGATAACCATGGCAGGTACT
GAGGTGCAAGATGACCTAATGACATCACTTTTTGCTCTCTGCAAGAAGGA
GTGTGATTTATGGCAAGCTCTACAAGGTCGTGAGGGTGTTCAGCTATTGA
TTTCTTTACTTGGTCTATCCTCAGAACAGCAGCAGGAATGTGCTGTTGCT
CTGCTCGCTCTTCTGTCGAAGGAGAATGATGAATGCAAATGGGCTATCAC
TGCTGCTGGTGGCATACCTCCTCTTGTTCAAATATTAGAAACTGGGTCTC
CCAAAGCTAAAGAAGATTCAGCAACCATCATTGGCAATTTATGCAATCAC
AGTGAAGACATACGAGCATGTGTTGAAAGTGCTGATGCAGTTCCTGCTTT
ACTATGGCTTCTGAAGAACGGAAGTGACAATGGAAAAGAGATAGCATCCA
AAACACTGAATCATCTCATTCACAAGTCAGATACTGGAACTATTAGTCAG
TTATCTGCTCTGTTGACAAGTGAACAGCCTGAATCAAAAGTTTATGTTCT
TGATGCTTTGAAAAGCTTGCTTTCTGTTGCACCACTTAATGATATTCTGC
ATGAAGGAAGTGCTGCAAATGATGCAGTTGAGACAATGATCAAAATTCTA
AGCTCCCCTAAAGAAGAAACTCAGGCTAACTCGGCATCTGCTCTTGCTAG
TCTGTTCCATTGCCGTAAAGATTTACGAGAAACACATATTGCAGTGAAGA
CACTATGGTCAGTCATGAAACTGATTGACACTCAGTCTGACAGAATACTA
ATGGATGCCTCATGTTGCCTTGCTGCCATTTTCCTTTCAGTCAAGCAAAA
TAAGGAGGTTGCTGCAGTTGGACGGGATGCATTAGCTCCACTAGTCTCAC
TAGCAAGTTCTACAGTCCTTGAAGTAGCAGAGCAAGCAACCCGAGCTTTG
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AGCTGGTCTCTTGGAAGCTGCTAATGGTGATGCTTCTGCAACATCAGAAG
TCCTCGATGCACTGGTGCTTTTATCAAGATCTAAGGTGTCAAGTGGGCAT
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TAGAAGTTCTGTCAAGGCTCTGTTTTGACCAACATGATGTTGTGGGTGGT
TTGGTTTCTGAAATCCCAGGTTGCATATCATCAGTGGCACGACGAGTCAT
TGGTTCCAACATGCTGAAAGTTAAAATTGGTGCATGTGCTCTTCTAGTTT
GTGCAGCTAAAGAGCATTGCCAAAAGCAGATAGAGATCCTGTGTGATTCA
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TTTCCAGACACTCCAAAGAAAATAACAGTGACGCTGAAATGGTGTGCCAT
ACTGCTGTAATCTCGGGTAACATGATTCCACTCTGGCTACTTGCTGTCTT
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TCGAAATGCTCACCGAGAAGATTTCACAAAATGCATTCCTATATGTGGTA
TGTTAATGCTAGTTATTGAATTTTTCATTTTCTTTGTATGTATGCTAATT
GGTATGTGAATATTAGTTTCTCTTACGCACTTCATTGTTCTTGCATCATA
TACCTTACAGTCAACAGCTACTAGCTTGTAGACTGAATAATCTTTATGTT
TGGGAAGACATAAAATCAATTTTAGAAAACAACACATGTAGATTTATGCC
GCAATGCCCTTCTAGATTGATCAAGTTGCCAATGAATCATCTGTTGAGGA
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GCATGAAAGATGTCCCCTGATGTCTACCAAAACTTTAATCACATTCCAGC
AACCACAAATTGAAGTGACACTCAAAGAAAAGATTCATGGTATCTTCCAT
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ATCTGAATAGATGTAATGTTGAATTTTCCATACAACATAAGCCATATGAA
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AGTTTGAAGCGCTTGAGGATATGTTATTGTCTTCTAAATTCCATCGATCT
GCATGATAAGTTCTGTTTAGTATTTTGGTTTTGAAACTTGTCTAATGCTA
CTTCTGGAGACCCATCATATATCTTACTCTAGCACTGTCCTCCAAATCCT
TATTGGATAGAAGACCTATTTCGCTATTCATATTGAAAGATAGTGTATAT
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TACTTCTGGAGACCCATCATATATCTTACTCTAGCACTGTCCTCCAAATC
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GAAGTTCTCATGGCATTCTCTTTTGTATGTGTTAATAATTAATAATTTGG
CATTCTTTTGGGCTGCAGCTGACAAGTTCATTTTCCTAAATTCTTAGTTT
TGATGAGGAAAGATCCATTGCGTAAATATCTACTTGAACTCAGATTTGCT
ATTTTCTTATGTACCCATCATGCATTATCTTTATACTTATAGCTATTCGA
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TATCAGGGTGAAGAAGATAACACTGCATGGGTCTGTGCCTTACTTCTTGC
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TACTTCGCCGCACAAGCTTTGGCAAGTCTGGTGAGCAATGGTAGCAGAGG
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TGCTTGGATGTGCTGATGTTGATATAGCTGATCTTGTGGAGTTATCAGAG
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CAGAGTTGATGATATCAGGGTTGGTTCAACTTCCAGAAAATCTATTCCTC
TTCTTGTTGATCTACTTAAACCCATTCCAGAAAGACCTGGTGCTCCTTTC
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ATTCTTTTTAGTAGTGCGGAAATAAGGCAACATGAATCAGCACTTGGTGC
TGTAAACCAGCTTGTGGCAGTCCTTCGTCTAGGAGGAAGAAATTCACGGT
ACAGTGCTGCAAAGGCATTAGAAAGCTTGTTTTGTGCTGACCATGTCAGG
AACAGTGAGGCAGCTCGACAAGCTATTCAGCCGCTTGTAGAAGTTCTGAG
TACTGGCATGGAGAGGGAGCAGCATGCAGCTATATCAGCACTTGTTAGGT
TGCTTTGTGACAATCCGTCAAGAGCACTTGCAGTTGCTGATGTTGAGATG
AACGCAGTGGAGGTTCTCTGCCGGATTCTGTCCTCGGATTGTTCAGCTGA
GTTAAAAGGTGATGCTGCTGAACTGTGCGGTGTTCTGTTTGCAAATACAA
GGATCCGTTCTACTATGGCTGCAGCCCGTTGTGTGGAACCTTTGGTCAGT
TTACTGGTTAGTGAAGCAAACCCGGCCCAGCTTTCTGTAGTTCGTGCACT
GGATAAGCTTCTGGATGATGAACAACTTGCCGAGTTAGTGGCAGCACATG
GGGCAGTCATTCCCCTTGTTGGGCTTTTGTTTGGAAAAAATTTCATGCTT
CATGAGGCAGTTGCCAGAGCTTTGGTAAAGATTGGAAAGGATAGACCGGC
TTGCAAATTGGAAATGGTTAAGGCTGGTGTAATTGAGAGTATTCTTGATA
TTCTTCATGACGCTCCAGATTTTCTTTGCATTGCATTGGCAGAAATGCTT
CGGATTTTGACAAACAATGCCAGCATAGCAAAGGGTCCATCTGCAGCCAA
AGTAGTACAGCCTCTTTTCTCTCTGCTATCTAAGGCAGACACTGGTCCTG
AGGGACAGTATAGCACTTTGCAGGTTCTTGTCAATGTTTTGGAGCATCCT
GAATGCCGTGCTGATTATAACTTGACACCCCGCCAAACCATTGAGCCAGT
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GAATCTACAGCAGAGAGCTATAAAAGCTCTTGCTAACCTTGCATTAGCCT
GGCCAAATACAATTGCAAAGGAGGGTGGTGTGTTTGAGTTGTCCAAGGTG
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AGCTGTCCTGTCTAGCATTTTGCAGTACAGTACCGAGTTTTTCCTTGAGG
TTCCTGTTGCGGTACTAGTGCAATTGCTCAGATCGGGGACTGAAAGTACT
GTTGTGGGCGCACTGAATGCTCTGCTTGTATTGGAGAGTGATGATTCAAC
AAGTGCAGAAGCAATGGCTGAAAGTGGTGCCGTAGAAGCTCTGCTGGATC
TCTTGAGGAGCCATCAGTGTGAGGAAGCTGCTGCCAGACTCATTGAGGCA
TTGCTGAACAATATAAGAATAAGGGAGGCGAAAGCTGCTAAAAATGCTAT
TGCACCTTTGTCCATGTACCTTCTGGATCCACAAACACAGTCTCAACAGG
GAAGGTTGCTTGCTGCTCTTGCTCTTGGAGATCTTTTCCAAAATGAAGGT
CTTGCTCGTTCGACTGATGCCGTTGCAGCATGCCGTGCTCTGGTCAATCT
TCTTGAAGACCAGCCAACTGAAGAGATGAAAGTGGTTGCCATTTGTGCCT
TGCAGAATCTAGTCATGTATAGCCGAGCAAACAAAAGAGCAGTTGCAGAA
TCTGGTGGCGTCCAGGTCTTGCTGGACCTTATCAGCTCAAGCAATCCGGA
CACTTCTGTTCAGGCAGCAATGTTTGTCAAACTTCTATTCAACAATCACA
CTATCCAAGAATATGCGACGAGTGAAACAGTCAGAGTTATAACTGGTAAA
ATAATACTAGCACTTTCTTCTTTCTGCTGGATCACTTCAAATTATCACTT
CTCATGTTTCAGTGCCTTCCATGCTATACAAATCAAAATCTGTCTTTAAT
ATTAGCAAGTCAAACTTAACGATATACGGCAAAGAGAAGAATCAAGGTGT
TTACATTTGCGCGAAGTTTGTAATTCACATGTTCTCATATGATATTATGT
TTTAGTTTTAATACCAATTAGTACTCTATTTTAGTGCTTGTCTACTCAAG
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TTCTGGCATTCTGGAATGTGGTTATTTTCTACCTGGAGTTTACTTTGTGT
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GCATCTGGGAGTGCTAACGAGGAGTATCTTAAAGCGCTTAATGCTCTACT
TAGCAACTTCCCTCGTCTGAGAGTCACTGAACCTGCTACAATATGCATTC
CACATCTTGTAACGTCCCTTAAAACTGGTTCTGAAGCAACTCAAGAAGCA
GCACTGGATTCGCTATATCTGCTCAGGCAAGCGTGGACGGCTTGCCCAGC
TGAAGTATTTAAAGCTCAATCAGTTGCTGCATCAGAGGCTATTCCTCTAC
TTCAGTACTTGATACAGTCTGGCCCACCGCGGTTTCAAGAAAAGGCAGAG
CTGCTACTTCAGTGCTTGCCTGGCACACTTACAGTTACTATAAAGCGTGG
CAACAATCTGAGGCAGTCTGTGGGAAATGCTAGTGCATTCTGCAAGCTTA
CTCTTGGAAATAATCCTGCAAGGTTGACAAAGGTATATCTACTTTTTTGC
GCTTCTCATTTCAGGAATATAGGCCTGTAGCATAATTTAGTACTTCCATG
CTGACAAAATAAACTTGCTATGTCTCGATGATGATAATTGATACTGATGA
ATATAGATTTATTCGACCTGGAGTGTTTTTTCTTCTGCACCCATTTTAAC
AAAGTTTGGTTCACCTAACTGACATGATGCTATACACAGATTGTCTCGAC
TGGTGAGGCACCTGAATGGGATGAAGCCTTTGCATGGGCTTTTGATAGCC
CTCCCAAAGGCCAGAAGCTCCATATCTCTTGCAAAAACAACAGCAAATTC
GGAAAGGTACTGGAATGGGATACATGCATTATATTTACCACTTCATGTTC
TCTTGCTGTTTCATGCCATTGTATTTCCATACTCAAGCGCTCCAACTGTC
GTTGCAGAAATCGTTTGGTAAGGTGACGATCCAGATCGATCGGGTCGTCA
TGCTGGGTTCAGTTGCCGGAGAGTACACCTTGCTACCGGAGAGCAAAAGT
GGCGCAAATAGGAACCTGGAAATCGAATTCCAATGGTCAAACAAATGAAG
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AAGAGTGGTTTTCTTGTTTATTCCTCTGCTAAATGCTACCATGTTTGTGC
ATCAGTGTAAATAGGCGGCAGAGAAAGTTGTCCTTTTGTTGTACTTTTTC
TGAGAGATAAAAACAGATTGAGATCAGATTTTTTGTATACTGATTGTAAT
GGACCGATTCATTATTTGTTACACGCGGATTTTGTTTTGTAATCTTTGTA
AAGCATTTTCTCGGAAGCAGGAGAACTTTGCCTATTTGGTTGATGAACCT
GGTTCAATTTTTTGGTAATCG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.