Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA018230

[Submit comment/correction]

Sequence	AA018230
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA018230
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	TGGAGATGCCCTTATTACCTCTCGGAGCACGGATTCCTGAACTCCCCGGA TGTTAAAGTGAAATCGCCCTAGACGAGCCGCATCCATCTCTCTTTCCCTC TCGGTTGCCTGTGTCTCTCCGGACACAGCAACGCCAGCCACCCACCCGCG CACCTCGCCGGCCACCGCTCACCGGCGCAGCTCCGGCACCGTTTCCCGGT CGATTCTCGCTGCCGAATCCGGCAGTCCAAATCAACAGAACCCCTGCGCC GCCGTTGCAGCAGCAGCAAAAAAGCCGTACGTCAGGGCTCTCGCCGACGA GAGAGGGAAGAGGAGATGGACGTGGTGAAGGCAGCGCAGCTCTCGGGGCG GACGCTGGATCGGGTGGTGGTGCACCCGCTGGTGTTGCTCAGCATCGTCG ACCACTACAACCGCGTCGCCCGCGATACCCGGAAGCGCGTCGTCGGCGTG CTCCTTGGCACCTCCTCCCGCGGCACCGTCGACGTCACCAACTCCTACGC CGGTAAGCGAACCCAACCCCCCGTCTCTGGTCTACTAGGGTTTGCCCTTT AGGGGTCCGCCCGCCGGAGGATCCGGCGGACCTAGGGTTTCGCGGAATCG GCAGTGGGCGTGGACGTAGCAACGGCCTTGCGATATTAGATCTGTGCCAT TGCTGTTACGGTGGTAGTTTACTGAATTTGTAACTTGTGATTCTGCAGTG CCCTTCGAGGAGGATGACAAGGACCCCAGGATCTGGTTCCTCGACCATAA TTACCATGAGTCTATGTTCTCCATGTTCAAGAGGATCAATGGTATGCCGT TTTAGAATTCTCAGATGTGCTACTTCCTATGCAGTTGTTTCTGGTGCACT GATGACATGTTTTGGATGCAGCCAAGGAGCATGTTGTTGGCTGGTACAGC ACCGGTCCAAAGCTAAAGGAGAACGACTTGGATGTTCATGCGCTGTTTAA CAAGTATGATATGATTCTGCGCCTTGACCATATGTCCTGCAGTAGTTTAT AGCTCTGTTTTCCGTATATACGCAGTTACTCGATACAGGTACTTTATTTT ATACACGATTATTTGGTACATGCACTTTATTTTATACACGATTATTTGGT ACAGGTACTTATGACTTATATATACTCCCCCCGTTTAGAAATATAAGACG TTTTAGATTTGTGAATCGAATGTATCTAGATGTGTTTTAGTGTATAGGTT TGTAGAGGTTCGGAGTGAACCCATACACTAAAAGGCGTCTAGATACATTC ATTTCACAAAGCTAAAATGTCTTATATTTCTGAACGGAGGGAGTACCATC CAGTGTTGAAGTGTAAACTCTTCAAGGGGGTCTTGCTGTCTTTATGAAGT GTTACCATCCAGCCATAATTTAGTTTCAGTTGCTGTTTGATTTCGTACTG TTAATAACTCATGCAACTGGAGAAATATCACCTGTGCAAAAAACTTTGCT CTATCCATTAGCCGCAAAGTTCCCCAAAAAATGGATAGCTAGCTATTATT TTCCCTTGAATTGATGTGCTAATACCTGACCAATGGAAAAGTTTTGTTGG CCTGATAGAAAGTGTTTTTATGGAAGTATTGGCAATCTTAGGCGTTAGCC TAATTATATTTACATCCGATTGATCTGCTACTGTAAGTCTTCTCATTGTG TACTACATTGGTAAAACAATCAAATGAAAATAATCAACTTGTTTGCTTGA ACTGACTCATGATTTTAGTGAGCTGGTTTGACCTTTTGATGGTTTTGGGA CATAAAAGAAGTGTTAAAATCTTTAGTGTACGTACATACTTTGATGGTTT GCTTGAGTTTGTTTTTATGGAACTATCATTTGTTTCCCCCTTCTAAATTA ATGTTCTTGGTATCAGTCCCAGGATGCTTGTCTCGTATTTTCTTTGTAAC TTAGTCGTCATGGAGTTAATTTTGGTTCTTGCTTTACATTCTGCAGCTAT GTTCCTAATCCTGTCCTGGTGATTATCGATGTTCAGCCCAAGGAGTTGGG AATACCGACCAAAGCATACTATGCTGTGGAAGAGGTTAAAGAGGTGAGTG TATGCTCGGAGAAGTTGGAAATTTATGCTTGCTTATTTAGTTCCACTAAT GTATACGGCTTTCCATTACAGAATGCTACTCAGAAAAGTCAAAAGGTGTT TGTGCATGTGCCTTCAGAAATTGCTGCTCATGAAGTCGAGGAAATTGGTA AGACTTGTTAGTTTCAAATTGCATGTGAAATGGCAGCATGTGTGGCAGTT ACAGGTTATAGATGCAGTTGTTCAGTCATGGTCTTTGTGATACTAGTTCA CTTTGAGCAAATAAAATAAAATATAAGTATGTTTGTGAGGTTTTTGAATT CACTTCTGAATGTTAGCTGATGTACGCTTTATGCTCTCTTCAGGAGTTGA GCACCTTCTGAGGGATGTGAAAGACACAACAATAAGCACACTTGCAACAG AGGTAATGCTCATAAGAATTAAGACGGGAAGGTACAATTTGCAGGCTGCT TTGTGTATACCATGCCCCTAATTTATCATTTGCTAATGAAGGTCAGCAGC AAGCTTGCAGCCCTGAAAGGACTTGATGCAAGGCTTAGGGAGATCCGGGG CTATCTAGATCTTGTAATTGACGCGAAGCTCCCACTGAATCATGAGATTT TGTACCACTTGCAGGTTTGGCTATCTCTTGCTATTTGCACATGTTATGTT ATTCACTTTTTTTTGGGTGTGTGTGGGTGGGGGGGGGGGGGGGGGCAGAC TTGAGAAATGGAAATATCTGTCCATTTTAGTTTCCATTTCTTCCTAACAG GAAACTCAAATGTCACTGTGCGTAACACATCTAATTGGAAGTGGAATGAA GATAATGCGCTTTACTCTTTCATTTGTAGCTGGATTACCCCTGGGCTAAC TTGAATCTGTGTGTGTGTGTGTGGGGGGGGGGGGGGGGGGAGTATATATT CATCTCCCGCTTGCGTCTCAGTAATCCCCCATTATACTTCGTCCTCACCA GGAATAATTTTCATGCCCCACAATCCTTGGTTGTTTGGAATGTATTCCTA TTCTTAAAGGTTATCAGGATGAACTAGGTAATTAGTGATTTCTTTAGGCA TTATACGAATGTTGAGCAATTAGTGAGAAATTGAATGTACCGCCATTTTT AGTTCCCTGTGATACTACCACACAGTAGCGGACCCAGCAAGATTTTGAAG CCCGGGCAAACTGTGAATTTAAATGTCAAAAATACAATTTTTGGTCAAAT TTGCATCAAGATAGGCTGAAGGGGCGTTGGATCCGCCACTGCTACCACAT TTCTTAGCAGAAGTTAAGGCACATGGGATGCAAATAATGATTCAAGCCTT CAATACACACTTGGATTTGGGAATATACTCCCTCTATCCAGAAATAAGTG ACTTGAATTTGTCTAGATTTGCATGTATCTAGACGTGTTTTAGTGTGTAG ATGCATGCGAATCTAGACAAATCAAAATCATTTATTTCCGGACGGAGGGT GTATTATTTTTGGGTTGCTAGATCATGCTTTATGTATGTCTGTTATGGTG TCCTCAGAATACTAATTTGTCTAATCATAATGTTGCTCCACCAGTTGGGT TGCTAGATCATGCTTTATGTATGTCTGTTATGGTGTCCTCAGAATACTAA TTTGTCTAATCATAATGTTGCTCCACCAGTTGCTAATTGCATAGTATGGT AAGTCCATGATAATTGATTATATATGCATGTGTTACCACATTTGGTAATG CTTGATCTTTTATCCAGCGCCCAGATCTGCGGATAAATTCAAATTAATCC TAAGTTTTGTTACCGAAGCAACTTAACATTAACACTCATGGAGTCCATGA CCTATTTGTTCTGAAATTTTCTTGCAGGATGTGTTTAATCTGCTCCCCAA TCTCAATGTAAATGAGCTTATTAAAGCCTTTGCAGGTAATCATACATGTT GCCACCAATTTGGCAGAGCTGACTTATTTTTCCCCTCCATTTTTTTGGTT TAATAGTTGCAGCAACTTTATGATTTATCCTCTCCTGCAGTGAAAACAAA TGATATGATGCTGGTCATATACCTGTCTTCTCTCATCCGAAGTGTCATCG CACTCCACAACTTGATCAACAACAAGGTAAGCTATTTTGACCCGCTAGTA TCTTCACGCTGATCACAGCTATGAAGTCACCCCCTTGTTCTTTTTTCCAC ACCTTGTGGGAAGGTGTCTAATTTTTTTTTTACGATCACAGATGCTAAAC AAGGAACACGAGAAGGCTGAGGATTTGAAGCCATCAGGCGGCGAGCTCTT CTCCCGGTCCAGCAGGTAATCCATCCCCTTGACCCCATGCCTTTGATGCA TCTCCTCCTATTTTAAAATCTGTTTGTTCTTGTACAGTATGTCATCCCAC AAATGTAGAACGTACACCTGAGTTGACTATTTTTCTATTTGTACACATAC TCCTACTGATGAACTAAGAATAGTATCTGAGAAAAAGTAAGAGATCAGTA CATCAGCCTGGCTGTCTATGAACATGACTGGCCATAGTCCACGTAAGTGC ATTGTATGTATGGCTCATGGTAGCAAGCATGGGAAATGGCTTTCAGCTGC AGCTATTCTCTGAACCTTCCAAGTTCCAACTGTACAAAGTGTGAGGATCT GTTTCTAGTGTTCTGAGAATATGATATGGCAGACCAAGTTGACCTCTTCT TAAGCCCACCTCAGACGATTAATACTAATGGCTAATGTTGAAACTATTCC TTCGTCCGTCTATGGTTGAATCTGCATCTTCAAATACCAACCGGGGTCTA AAGTACAAACAAGCTCTATTTCAACTTTTCAAGTTCCCCCGGGGTATAAA CTACAAACAAGCTCTATTTTCTCCTCGGCCACTCAAGTAGAAATAATCAT GGCCGGCCACGGTCCAGGCAAGCATCTTGTATGTACGTCTCGACGGGAGC AAGCATGAGAAATGGCTTCCAGTTTTAGCTATTTCTTTAATCTTTCAAGT TCTAACTGCACAAAATGTAAGGATCTGTTTCTGTTGTTCCAACACCGTCT TTAGCCCATCACGGATGATTAATGCTGATGTCTAATGTTTTCACTGTTCT TTCGTCCATACATGTCTGTTCCACTGATATCTTCATTAAACACCAACGAT TGCTCGAGTCATATGGTTTAGGAGTTAGGACTCAGAATTTTTCCTAGGAG AGCAAAGGAGCAATTTAATCCGAAAGTTTTGGGCTTGTTATGACTTCGAA AAATTAACTTGTCCGAGTTGTATTACTGTAGTGGAAGCATTTCTGAAATG AAAGGTGCTCCATTTGCCATATGGCATGGGCAGTTACAGTTGGATCAAAT TCTCCCTCCGTTCTGCAGCTTGTCTAGATACACATGTATCTAGACGTGTT TTAGTGTGTAGATGCATGTGTATCTAGACAAAGTTGCGTCAATTAATTTG GAACGGAGGGAATAACAGAAAATTTTAAACTGTATGGTGTAGGAGAGGGA AATGTTTGATGCTGATGGCTAATGTTTACACTATTCCATTGTCCATGTAT GGTTAAATCTCCACTGGTAACTTCGCCAAACACCAACCATTGCTTGAGTC ATATGGCTTAGGAATTAGTATCAAGAATTTTTCCTAGGAAAACAACAGAA AATACCATTGCTTGAGTCATATGGCTTAGGAATTAGTATCAAGATTTTTT CCTAGGAAAACAACAGAAAATAGCTCCTTCCTGTTACCATGACTGTTAGC CTGTACGTCATTGGTAACATGTTAGTCTGATGTAGGTAACCACCATAGGG TTTCTAGGGAGTTTGTCAGTGATGTTTGTTTTGTTTAAGAGTGTGTCAGA GAAGAATTTTTTGGTCATGTCTCTGGCTCGCAACTAGTGGTCTCCTGCTC TGATTCATGTGAATAAATGATAAAATGACAATCAACAGAGGGTCTGAGAG AGTATATTTACTACTTTTTCAAGAGGGGTAATTGTTATGCAATGATGGGC AACAGTTATTGCAAACTGATAGACTACTTAGCATTATATCTGTTGCAGTG GTCTGTGTTTTGGCTCAACCATTCCTTGTAGAAAAAATATACTCCCTCCG TCCCAAAATAAGTGACTTCAGGCTGACTAGATTCACATGTATGTATATAT ACTAAAACACAACTAGATACATGCGAATTTAAACAAACCCAAGTCACTTA TTTTGGGACGGAGGGAGTACATAAGTACAACAAGCTGTGCTAGAGTACAT ACTAAAACAATGAGAGTGGTGGCAGCTGCACAAGAAAAATAGAGGGGCTG TGTCATGACTGATTATGTATCTTCCTGCACGAGGAATACTACTACTATTA CTACTACGTAGTATATATAATTAAAAACAAAAATACCAAAGATAGGTCTA GAGCTGCGGTTCTTGTGCCCAACAGAAATATTTGTCGCACTACTATTATA TGTAGCAGCATCCTAACGGTAGTCCCTTTCCTTGCAGCGAATGAAGAAGA GAGCTTGAGTTGGCTCCACGTTGCAAAGTTCGTCGAAGCAAACATTTCAC CAGCAGAGCCTATATCTGTCGTCCGATTCATCGTTTAATGTTTTTAAAGT CCTTTATCTAGGGCAGTTTATTGGTAAAGCAGTGGGGTTTGCATCTGCGC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.