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GrainGenes Sequence Report: AA041143

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Sequence
AA041143
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA041143
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GTGCTCTCGCGTCACCACCACAGCCATCCCATCACATCCATCCACAGCGG
CCCGCCCACCGCCAGCAGTAACGGACGTCTCCTTCCCCCAAAAGGCCAAA
CCTTCCCCCTCTCCCGTCCACGGCTCCAATTCGGACGGTACCCCACGCCA
CACCCCGCGCCCCCTCCCTCCCTCCTACATGCCCATCCCCTCCTCCTTCC
CCCTCCCCGGAATCTCCCAGCCATAAACCCTAGACTAGAATTTCCCCTCT
CCCGCCCAATCCAAAGCGCGAATTGGAGGCGCACCAAGGTAAGAGATTCC
TCCCTTCCCGCTCTCCACTCCTCTGTGTTGCTCTCTGGTGCTGCTCTGGG
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TCTGTGGTTTTGGAAGCAAAATTCAGAGCAGACAACTTATGGAAAAGGCT
ACTACTAACTGTTTTCTTAGTTGTTACTGTTAGCTTTTACTGATCATTTA
ATAGCACTATGCTAGTCTTTCACCAGTGCTTGCTCAAATATGCGCCTTTC
TGAAATGTGTGCAAGTAGACCATTTTCTGTTGGTTTGTCTATTTTGTTAT
TAGCTCACTGCTCAGCCTGTCATTTTGCTAATAACTTATTTGTTATGCTT
AACAAAAAAAAGCTTTGTCACACTGGTGCGTCTTTCATCATCGTTGCTGC
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GAGAAAGATATCTTTGCTGTACCTTGCAAATGATATTATGCAGAATAGTA
AGAAGGACGGCATGAGATATATACATGAATTCTTCAAGGTCATTGCTGCT
GCCTTGGATGACTTGTTCACCAACGGTGATGAATATGGGCGGAACGTCAT
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GTATCTCACATCCTTCAAATCTACCATTTTAGCTATTATCTTATATCTTA
TATTGTTGTGTCTTTGGGGCAAGGCTGCTAAATTGCTGAGTTTAGCTATT
TCAGTACTTTTTTGTGCATATAATGATATGCATGCAATAGGCAACCACCA
GTTGCTTTCCTTTCGAAATTATAAATCTGAAGGCCAAGTAAAAGTGGGTG
GCTTTTTAGTCAATCCACTTTGCTATAAATCAGAAAGGTTCTTGGGTTCA
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GTAGATGGAGGACTTCAAGGCGAGGTTAACCCTTGCTTGACCACAATTGT
TTTTAGGACCTTAACATCTTTCATCCTATAGGTGCACTTCACAATATGAT
TTGTTTGGTGTGTCATGCTACTACAAAGTCTTTGATAATATGTCTTTGAG
ATGAGATCACTGGCACCAATGCTGTGATTACCATTGTGGTGAAGCATCAA
AGATCACCATATGGGTGCATCAAAACAGATCGATTAGTGGGAAGACTTAG
TGTTATATGTATGTAATGAAGACACAAAGGGAGTAGCAATTAAAGCACCT
ATGTTCAAGCGTGTGGTGGGTTTGGCTAGGCTATACTAATCACTTTTCTT
TTCTTTTCCTGTTTTGGACATTTCCCCAAATCATCATATGTTACTATATT
TAAGGGGTGTTGTTCTTCATATGCAAGTACTGGACGTGTAGATATACTCC
CATCGTTTCACTATATTTGTCCCTAACCTTGAGAAACTCTAACTCAATAT
GTCAACCATTGAGGGAATCGAGTGTGTACAGCAGTCTTTTCACTTTGTGC
CCTCATTTAATTGCTTTGGTAATTGTTGATTGGTTGCAGTATGTCATTGA
AGGTTGCCTTGTATTAGAATTCTTGTTAGATTTATGTATTCTCCCATCGT
GTCACTATATTTGTTCCTAACCTTGAGAAATTCTAATTCAATATGTCAAC
CATTGAGGGAATCGAGAGTGTACATATTGCAATCTTTTCACTTTGTGCCC
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GTTGCCTTGTATTAGAATTCTTCTTAGATTTATGTACACCCTGGAGTCCT
ACTCGTACACCAAGAGGAGACCTGCTTAGAAGGAAGGAGGACCCAAGACC
TCGTAGGGGGACTAACTTCTTCAGATCCACTGAAGCTCAAGCCTTCAAGT
CGCCAGAATCCAATATCGATCTAGAGCTCTCTGCCTAGTTCCGTCGTCAT
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CATTGTACTTTGTTCCCGATATATAATATAAATCAAAGGCAGGAGTAGGG
CTATTACCCACACAAGGGGGCCTGAATTGGGTAAAACTCGTGTCCTGTAG
ACACATGGTGCCGCAAGTGTATCTCCACGACTAAGAGATCACGTACAATC
ATTGTGCCCTTGCGAGGTTCCGATATTTAATCCTCGACACCTTTCCTTCT
TTGCGACAACTTTGGGGTCTTTGTCCAACCTATTGCTGATGGAGTTGGGT
TAGACTAGACATTGTTGAGGAGCAAATGATGGTCTAGACCTCTTGAGTCT
CTAGTGAAGACACAATCCTTGCGTAGGTGGGCCATGGTCTCAATGAATTG
CAAACATATTACAAAGTGACTAGTGCGATCAACCTCTTTAGCCTATATTA
GCCATCAATAGTCTTTTTCTATGAAGCATAATCCAAGCGAAGTTGCACTT
TGGCGCTGATTGTGCATCTGTTGGGATGTTTATCTCTGGTATGAGCCTCA
TTGTGCTAGCCAAGTACTGCCCCATTTTGTTACATTTTTATCTAGTTTTT
TCTGGTCGAGAGGTTGCAAGCGAATCTCGAGTAGGGAAAGTTAATGGTCC
ACAAGCTCCCTCAACTATTTGTGGTTGCTTAGCCTTGCCACCATTTTTAT
CCGGTTTTCGGTTGACATTTTCTAGCTCCTTTCATTCAATCCTCCCTGTC
TATGAGGCGACCTTGAAAAGTTTGAGAACTTGTCATGCCAAAACAATGGC
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TATCCACATTGTTGCAAGGGTAAGTCTGCTCATGGGAAGCCCGAAATTCC
TGGACTGGGCTGGGTTAGTCCACACTTCCGGGTCAACTACCGGGCCTGGC
TCGGGCCTAAATTGCAGCCCGAACATTGGCTGAGCCAGGCTGGGGCTTGC
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TTTTGGACAGGCTCGAGCCTAGAAAACGTGGATCTCCGTCGAGCCAGGCT
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CTTTCATTTGCCAAGTTGATTCTACTCATCTTGTTGCCTTCCTGCTCCAC
AAAAAGGGCCAATGCGTGTTCAATACTCCAACCTACTCTATTTGTCTACT
ACATGCACTTCTTGTGCCACTGATGGGGACTGAGATGTTCAACTGGTATT
AACAGTGTGCTTATTTTACTTCTAATTGGATCACAAGGCCTTTGATTGTG
GGCACACCACCTTTCTATAACTAATGTTGTAGTTTGGGACTGCTATTATG
AGCAAATGTTGGAGTAGCATTGATAGTTGGAAAGATGTTGCCGTCACTCT
CTCTAGTAGGTGTTCATAACTTCCTTAACAACAGACCAAATGCTGAATAA
CAGAGGAAGAGAAATGAGTGTGGGGAGGGGGAGGGGTGGTTTGTTGGGTT
TAGTCCCACATCAGTTGTGGAATGGGTTAGAGCATGACTTAGAAAGGTGA
GGGTGGCCCCTGGCTTAGAAGGGTGGGGGTGGTCTCTCTTACCAGGCTAG
TCTTTTAGGTGGAGAGGGCCCAAGACCTCTTATAAACCTATGATACTCTT
TGGTTGGGCCAAGATATTGGGGTTGGACCGCTGGTTTAGCGAGCCCACCA
GTGGCGGAGCGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGCAAAACACACAAAATTGGCC
AATTTAAGCTCTCCGCCCCAAAAAAATTCCTGCATGTGCAAATCATTGGG
GGGGGGGGGAGTGGCCCCCCCCTGACATTCAGTAAGCTCCGCCAGTGGAG
CCCACCATTGTGTATAAATCTCAATGGACTTACAGTTGCAGGTCATGCTT
TCGGGGTGTATATGCCGATAGTTGACCTACATGTGAGGGGTAGGTTTGTT
AGGTTTAGTCCCACATTGGTTGTCGGAGGAGGCAGAGCATGACTTGTAGG
GGTGATGGTGGCCCTTGCTATAACGCTAGTCTTGTACGGGTAGATGGCCC
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CAATAGCACAGAGGGCGGCACAACAAGGGCTTGGATACTGATTTGGGTTG
CGTAACAGGGTCGCCAATTAATAAGTTCCGAGCAAACCCCAGCTGCCAGG
TGCCAGCGTCTAGGCCTTGGCATTTGGTTCCACCGAACAAATCGGTTTGG
TGTCTCGGGTTTTAAAGAATTTCAGTTTCTAGATTTTACTGACCGATTGG
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GGGCATGTCCATGTGCTCAGGTATCACCGTTGTTGCGTCCATGGAGCTAC
AGCCTTGCCAAGTTACTAGTGCAACCAGAACAGAGTGCGTCCATGGAGCT
ACAGCCTTGCCAAGTTACTAGTGGAACCAGAACAGGGTGTAGATGCAAGG
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TCGTCTGTCGCCGGAAGGAAGCCGTTGTCAGCCACCAGAAAAGAGCCGCC
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TCGGCCAGGATGGGGATCGATTGGGGGTGCATGGTTTGATTAGTGAGACT
GTGAGAGAGCCCAGTTCGTGACTTTGTGTAATGGGCTGGGCTGATATTTG
GGCAACTCTAGGAATTACTCGGTTCCCTGGTCAGTTCGGTTGTCCCATGC
GAAATAGCTGAAGTAATTTTGGTTTTCCCAAACTGGGAACCAAGAAAGCG
ACCGAAATAGTCAGTTTCGGTTATTTCGGTCTCGGTCCCGGTTAATTTGG
GGCAGGTTTTTGGTCCTCGTTTTATTTGCCCACCCCTACCAGCGTCCTGC
GCTAGTCCTATTCATCCCCGGCTACCTTCTAGCTGCCAGGAGGTCGGGGA
ACGCCTGATCTTTGCATTGCATGTAGTTTTGCCTTTTTTGTCTTGGTTTT
GTGTCTTTAGCGGCAGTGTCTCGGTGGGGGAGACGATGTTGTGTGGAATA
GTGGTCTCTCCGTATGGCCTTTGGCCTTCGTGGCTGATGTCGGGGAGCTA
GTGTATCTTATTTTTTCCCACTTCATCCTATCGCCAACACGGTCTTATGC
TTCAGCAGTTTGGTGATGACGCAGCAGTTCGACAACCTGTCTTGCCAGGG
GTGTATCTTCGGCCACGGTGCGTTCAACTGTCAGTTTCTCACACCTTGTG
GTGGGCAGCTAATGCGGCTATTAAAACCTCCGAAATTAGTCAAGTTTGTG
TAGGTATGGTCTTCTGGGACTTATTTGACGGGTGCATGGAAGAACATCGA
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ATTTAGAGTTTGCCAATGTTCTATGTTGATCACTTTACGTCTTCAATTGA
TTAATGAAGTCAGATCATTGATCTAAAAAGACGTGGTTATTTAAGATAAC
TCGGACTGAAAAAAAAATCTTTGGGTGTATATACTGAATGTGAAATACAT
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TTTGTTGTGCCATTAGGTCATGCGGACAATAGGAAAGTGCCATAGTGCTG
TGAATGAAACAAAATCTGTCTATCGAAAACCTTCCCAAGGATGCAGTGTT
GTCTATGGGCCCTTGCTCATCGTTTCTGTTTAGCCACCATCTCTTTGGCA
ACAAATGGACCTACCAAATATAATGGTAAACAGGACGAGTTGATCAACAT
ATTGACATGTCTCCAGGGAACAAAAATATCTGGCATCTGCAAAATGCCAA
AATATGACCCAGGTGTTCCTTTTTTAGTAGCTCATATATCACGTGCACGG
GTATTTGGTAGTGGAGGTTCAAGGAAGGTGTGAATTGGGGTTTGATCTGG
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ATTTATCTCATTGCACACCATCTCTTTGTATGTTTCTAAATTTCTTGCTT
CTGCTCATTCAATTTTGGTCATGTATCTTTTTGCATGTTGATGTATGGTC
GAGGCATCCCTTCAGAAGTTTCTAATTTTTTCTTGCTTCTGTCCATTCTC
CTTTTCACCTGTGCTTGCCTGCTATAACCACCATTTCATAATTATCTTTA
CTCATTCTTGCTTGGACCACTTATGCTTAAGCTTATTGAAAAGCACCGTG
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TCAGGTCTTAGGAAATTCACTCACTTTTGAAATTATTGGGTTTGCATTTA
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ATTGGGGCCCTGTGGTGTTACATTATGTCGCCCTTTCCTCTGTTCAGTTT
CATGATTTTGTGTAAGCGTTGCAGGTTGACATATGGGAAGATCGCAAGTT
GTTTGGCACCCAAGGACAACTTCTAAAGGAAAAATACACACGCAAATTTA
AGGAGCTAAAGTCGGAAGTAATATGAATTATGTCTTTTGATATTCATATC
ATTCCTGTATGCCTGTTGTATGTACTGTGCACAACTTATTATGGTTCCAC
GTATTTACAGAAAAAACCTGGTGGGGAGCTAATGGAGAAGGTCATATCGA
GCTACAAGCATATGCTACATGCACCTATAGATGAGGACAAGTTAATGAGA
AAATGCAACAGTGCTCTAAGCTTTGTTGACAACCTCAACAAAGAGTATGG
AAACTCACACTTAGGTAAGATGTATGTCTATTAAATATTATTTTACTTCA
CATCTGGTATTATGTATTATTCCGTCGCTGCGCAAGCCGGTTTCAGTATT
ATTTTAGATATTATCCAGCTTTTTGTATTATCTGGAGCTTCAGCGTTATT
CTGTCGCTGTGCGTATTATTAACTAATGGCCTGCTTCACATGTGGGTTGA
AGAATGAGACTTTTGTCTCTTTAATAAGGTGGTACTATATGTATAGCAAT
CTGCTGTTCTTTGGATATCATTATTCATTACAGTATTTGTCTCCTACCTT
GGAAAAATGTAGCTTCATAGGTGGTGTTTGGTTCTTTTCCTATTATTCAA
CCCGTCAAAATTTTGCTGGCACGACAGAACACACTGGCCAGTTCTTGCGT
GCCAATCCATCTAAGCCAGCCAACCTGGGTGTATCCAGCTGTGTATGACT
GAACACCCCTAAACATCAGTAGTTACGTTGTAAGGCCACAGTGATCATAG
CTTTGTATTGTCCTTTCCATAGACTGCCCTCTATTATCAGTATTGTACGT
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ATTTGAAGGAAGCACTCCATGAACAGGTATGTAGAAGTAAATGCATATAC
TAAAGTTTAAGATCTATTTGTTCGAACAATTTATTTGTTTCATGGATATT
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GCATGGCTGGGTCCTCAGGTGTTCTGTGCACTAGACTAGTACCTCCTGGT
TCCTAAAACCTGGTAGCCTGCTTCCCTCTAAAAAATGGATATAATACGTC
GTTTTAGGGCTGAAACGGGAGTCCCGAAATGGGCTAATACCTCCTTTCTG
TGACTTGTATAACTGGAATATTCGTTTACAAGCATCTGACACCTTTTTTA
TAAGCATGTTTCTTCTAAGAAAAGAATTAAAGCTTCTTAATTCCTGATCT
TGGGTCAAATTGGTATCTTTTGTGCTAGGGCTGTACATAATGGTTTATGC
CTAATCTGTTCAAAATCAGGCTGGTAAGCAGCTGAGCTGCGTTCTCTCAG
CAAGACAGCCAGTTATGCATGGGTTCTTAAAACCTGGTTTGAATAGCCGT
ACTTTGTACTAATGTTTCCATTATTTACCAGGCAGCTCAGGTCCGGTATA
AGAAAGCTGACGACCTCTGCCAGAAGCTTGGAATAGATGTAGCAAGGCAG
GAGCCATCTACAGGGCTTGAGAACTCCAGTTTCTCTGAAGTGCCTGTTAC
TTCTTTCCCAGTTTCAGCTAATGGTGATTCTTTTGAGAAGAGACAATCGA
ATGGAGTGATGTATTCACAGGAAAGAGATGGAAGCGAGCACGAGACCCTC
AACGGTGTTTTTTCTTCACGAGCCACCAGTGACAACATTGAGCTGAAAAT
AGAAGAGCACTCTTCTGGTAATAAGAGGCAGAAGCTAGAGAACGGTGTAT
CTGTTCCTCAGCCTCAAGCACCACCACCACCACCACCGCCACCCCCATTC
CCGTATCCTGATTTTGAACAGCCACCACCACCGCCTCAGTACCCTCCATC
GCCAGAGTCTAACCCACCACCACTTCCACCTTCAATGCCGCCCCTGATCC
CACCACCACCACCACCTACAACAGATGTATTTATGCCAGTTCCTGTTGCT
CCAATGGGAGGAATGCCATACAGCGTTTTCCCACCATTTCCTCCGACTGT
AAACTACCCCATGATCAGCATGCCGCCGCCTTTCCCTGGTGCTCCAAACC
CTCCTCATCTGAGTTTCCCTGGATTTGGGGGTCCCTTCTATGGCCCGCCT
TTCCCCTCGGCACCCCACCAATAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.