Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA031099

[Submit comment/correction]

Sequence	AA031099
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA031099
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGGCCGCGAAGGGCGGCGGGGGCGTGGGGACGCTCAAGTCCACATCCAT CAACGGGGTCAAGCTCTACTCCGTCACCGGCAAGAACTACGTTGCGCCCT GGGTCCTCGCCAAGAAAAAGCGCTCCCTCCGCAAGGACACAGGCACAACC CCCCCCGCGATTTCTCCATTTGTTTTCTTGCCTGCTGGTGTGCCGTAACA GTTTTATCGATGATGTATTGACGCTGTTGCTGTTTGTTTTTGGCTGTAGA ATACCAGCGGAGGCTGGAGCTGATCCATGACCTGAGGTTTGAGACTGCCA CCACCAGGATCAAGGTCACCCCCGACGGCCAGTATGTGATCGCCTCAGGT ATAGTCTTCCTTCTTTCGGCTGGTTTTTTGTGTTGCTATGATATAAAAAA CGACGCCAAAGTCAGTGGCGGAGCGTGGCGCAAAACAAAGGGAGGGCCAA TTGCCTGTATGTCAAACAATCACATGCAAGTCTTGCAACAAATGTAACCT TTAATCAACAAGAATTGCAACATAAAAATATACTGATAACATATATAAGA TGTTCACATATTACCATATTAGAGCACCGATTCACATTTAATGCTCTAAA GCAAAAGAGATATACCAAAATACAAGCAAACCAAGGTAGCTAGACTATGT GAGTTGCAGCGGTGTGGAGTTGGATACTAACTACAGAGTTGCTCTCCTGT TCTTGCGAGCCTTGAAGTCCGCCATTATATCTTCTTAGCTGTATTGGGCA GAAATTTCTCGTTCTACTTGTATCAGCAAGCTATTTGCAAGATAACCATC TTCCATCATGTTGCGCAATCTCATCTTGATAATTTTCAAGCTAGACAATG CACGCTCAGCACTAGCGGTCAAAACCGGGAGAGTAATGAGCAAGCGAAGC AATCTATCAAACTAATTGTAGATCATGTGACGTCCTGTAACAACAAGGCA TTGACAAAGTGCAGCCAGTGTTGAAATTTTCTTTAAATCCTCACTGTTGG AAGCATCATGAGCAAAATGGTTCAACTGACGCTCTAATCCAATCATATCT TGTTGTGTGAAATCTGCTGGATAGTACTTTCCAACCATTTTGCATATGTA TTTAGCATTGAAGGATGGAAATCCATGTTTTGGAATCATTGTACCACTTA TGGACAAAAGACCCATCACCTTCTCGTTAAGCTTCAGATTTAATTCATTA AGCTGGCTATCCAATGTTACTCGAAATATTTCCACTCGGAAATAACGCTC CTTAGTAAAATGATCAGGCTGACGACGAGCACGGCCACCACGTAGAATGT ATTTCTCATTCATGTCTGGAACATCAACGCCATGATCCGCGCAGAACTCG GCAACCTGGAGATAAAAATATTCCCAGCCCTCATCTGACCGCATTTCTTC TAGAAGAGCTTTAGTGGATAACACAAGACGAATTGCATTTACTATATCCT GTGATTTCTTTTGTAATGCTTTTCCAAGCACATCACTAATTCCCAAATTT CTCTCATCATGCATAGGAAAAATGCAAACTCATAAGAGGTTAAGTAATTT AAAGCACTATCTCCATAAGCACGGTTGGACCCAGCTGTTGCATCGGAGCC AATAGTTTGCAGAACTGAACTCACGACATTAAACATATCCATGAGACTAG AAATTGAAGCCAAATGAGACCCCCATCTTGTGTCTCCAGGTCGCTTTAGT GCCCTGATCTGATTAGCCCCTTTACCAGTCTCAGTTTGATCCATATCTAA CAAGCGTGCCAGCTGAAGAATTTGGGCATCATGCAGCTCATCATGTCGTT TGGAAGAGGAGTCAACCGTGTTTATGATAAATAGAAGTTGCTGAAAGAAT TGGCTAACAGGAACAACATCCCTAGAGTTAGCGCAGGGGAGCAAAGTGAG GGTGAAAGATAAGACGGTTTGGTGTGGGTCGCTGGTCCGAAGAGTTACAC GTCAAAAGCTGTTGAGGAAATGATGATCCATGGAATGCACAGTTTAGAAA TTTACTGCCTTGTTCATGTTTATGTTTTGCTTTGAGTATCAATGCCGTAA TTTTAGCCAGATCATTCAGATACTAACATACTGTTAGTTTCTGGTATTCT TACATTTATTGTTTTCCAGGTATTTACCCCCCACAAATGAAAGTCTTTGA GTTGAAGGAATTGTCAATGAAGTTCGAGAGGCACATGGTTTCAGAAATTG TAGATTTCGAGGTACTTACGTGGACCATTTATATTATCTAGCATTCCTCT GTTCCATAATTCTTGTCGTGGTTTTAGTTCAAAATGGTTTTAACCACGAC AAGAATTATTTTGATCTGAAACCACAACAAGAATTATGGGATGGATGAAG TACTGATCCACCTTCTCCTTCTTTAATATTCCATTCTAGAAAACAGAGGT CACAGACCTGTGTGGTACTTTCTAAGTCTGTGGTCTAATTGTCTGCTTAA CAAAATCAATAGATTATTATATTGTTTGTACCACCTTATAGTTTGTTGCA TATGTTGATCTCAAGCGACCACTTTATAGTTTTCTTATTTCTTACCTTTT GGACTTATATTAACTTTCTGTCTTTAGCTTTTCTCATGTGATCTGGGTAT ATCACCAGCACATTTTTATCCATGTGACATCCTCTAAGGCTCTAAGCAAA TGATTTGCCTCCAGTTCACCACTAGTATTAACTTCTATTTAGAGGATGGT TTCCTCTCCCTGGATGGAAAATAGTGAATAACTTGGGGAGAAGTGTCAAC GGAGTTGATTTTATACTCCCTCTGATCCATAATAAGTGTCGTTCATTTTG TACTAAGCTAGTACAAACTTTATACTAGATGAGCGACACTTATTATGGAC CGGAGGGAGTACAATTTAAAATCTTGCCTACTGTGCTAGTTGGAGCCAGC CTCAGTGTCTTTCTTTCTCTCTGACTTGAGCTGCTTTAATGTTTTCCACA TAACAAACTGGACTGCATCTCTCTTTAGGTCCTTGGTGATGACTACTCAA AACTCGCGTTCTTGTGTGCTGATCGTTCTGTGTGCTTGCATGCAAAGTAT GGAAGTCATTATAGCGTGAGAATTCCAAGGTTAGTTTGTCCTGGTATTTG TTTTCATTGGTTCATATTGCTTTTGAGATCTATATATACATCTTTTCTAG TTACACATGCAGTTTATTGTGTAGTAGAAATAGTAATCCCTCCATTTGTA GTTACTAGTCATTTGTCACTTTTGATTTAAGCTCAGTGAGGTTTATCCAC CAATATCTTTGCGAGTTTGTATTTACATATTTTAAATTTTTTACTTTGGT AATTTATGTTTATAGCTATATACATGTTTTTACTAATTATTAAGAAGTAA GAATCAAACCTTGCAGATGTTTTTCACCTTTTTGATTATAAGCAAATTAT TCTGTCTTAATTTTAGCACATCATGTACATCTGTTATTGTGCTGTTTGTT TAAACAGAGAACTTCTGTGTTGGATGATAAAAGCCAGTTATACAATAGCA ACAATGTTTATGTATAGTCCTTGCTTGTCCAAATATTAATTTTACATGTT GCTATAATCCTTATTGACAGAATGGGAAGGGACTTGGCCTACGACTGCTG GTCTTGTGACTTGCTATGTGCTGCTTCATCGCCAGATCTGTATAGAATCA ACTTAGAGCAGGTCAGATTTGAGTTCTTAAGTGTTCATGGTATATGAGTT ATTTGGTTACGGGTACTGTCTCACATAATTTACGTAGACTGCTACTATAG AATCAATATTATATAAATATGAGCACTTTATTTTGAGAGTCACTATAGCT GTGTCACATCATTATCAGTTTGATTTATGGCAGTATCCCTAAATATACTA ATCTTGCTAGTCAGTGTGTCACTAGTGCATAGAGGCACAATGATGCCGTT TCTTCTTATGCTTCCAGTCTTTCTAGAATAAACATTCGCACATTTTAAAA CTGTAAGTTCTGCAGGGACGATTCCTCGCATCTCTTTCTTCCCAATCACC AGCAATAAATGTTGTTACACAGAGGTATTCTATTTTACCAGCTTATCTCT TTGGAGAGACATTCTTATTTAGTATTGTTAACCTATCATTGTCTTTGGTG GTACTCCCAGTAACGTCCATGGGCTTGTTGCTTGTGGTGGTGAGGACGGT GCAGTTGAGTGCTTTGATATGAGGAGAAAGTCTTCTGTTGGCAGAATTAA TACAGCTTCATCTTCTGAAGATGTTGATCAGGTATCTTATTGTGCCTTAT CAGCAACTTGCTATTAATAATACACTAATTCTACAATTTCTTGACATTAT TTTGTGTATTCTCATGCTTCAAAACTGCAGGAGGTCACATCTTTGCAATT CGATGAAAATCAAGGGTACCTTATTGCAGTAGGAAGCAGCATAGGAAAGG TTTGGTTCATCCTCTGTTGTGTTCTTGTTTTATTTTCACTGCTAATTTAT AGATTATTGCATGTTATCTCCTCCATTATCCTTTCAGAACTGACAAGCAG GGATGTCACTGTGTTGCAACTTGCAATGCATAGTAAATCTGGCGTTATTT CTGTTTGTAGAACGATTCATGTAGTTAACTTTGTCTCAAGTTGATGCGGT AGACATCTAATATTTGCTCTTGTTTGATTTTCACTGCTAATTTATAGATT GTTGCATGTTTTTATTATTCCCTCCTCCATTATCCTGTCAGAACTGACAA GCAGGGACGTCACTGTGTTGCAATGCATAGTAAATCTGGCGTTATTTCTG TCGGTACGAACGATTCATGTAGTTAACTTTGTCTTAAGTTGATGTGCTGG TCATCTAATATTTGTTCAAGTTGTATACTTGCTCTGAAGGCTAGTTTGTA TGTATTTATTTATTTATTTCAAGAAACAATGATCTGCAATTGATTATCTT GCTGCTAGTTTACAACTTTACATGTAATTTTGCGTGGTTCTGACATCTTT GGTTGTTTTTCCTGGAGTAGTGTGATGTTTTTCTGATTTTGTTGTGTACT CATTGGCCGGATGACAGGATCATCCTGCCTAACGAATTAGTAATGCTAAT ACCTAACTCCTTTAGATTTTGAAGTTAATTTATTTGTTAGCTTGTTATTC AATACACTTCGGCTTTGTTTTGATTTCTGCAGGTAGCAATATATGACATA CGCATGTCTTCTCCTCTGCGAGTCAAGGATCACATGTAAGCTCTGCATCT TTTATTACATGAAAATATTTTTTGCTTGTTATTCATGATCAGTTTCAACC ATTTAAAAAATCTTCTTTAGACTCCTTTAGGATTGCGTGAAATCTATTGA ATTTATGAAAAGAAAACATCCACTCTCACTACATGCTGTGTTCCTGACGA GACTCATATGGGATCCTTCATTCCAAATGCGACCTTGAATTTTTTTTGCG GGATCTTGTATTTCTAATATAATTGTTATCCTGGCCATACATCAGGAAGA GCTGATATAAATACACTTCTATGCCTTCAAAACTATTTATGTTTCTACCT GAATCTTGCAACTCCACATAGAATAAGCTTTAGATGAAAGGAATATCAAG CTTGACTAAATCCTAACTGTAGTAAAAGATAGCCGATTTGTTTTTGTTAT TTGTGTAACCATTTTTTTATTAATTACAGGTATGGCAGCCCAATTTTAAA TATCAAATGGCACCAGTCACTTAATTCTACCGAACCTAAACTGATAACTG CTGATAAGCATATAGTGAGAGTTTGGGATCCTAATACAGTGAGTTTTTCC ATCCTTCTCTGAAAATTGGTGGCCTCATTTTTTTTAATGGATAGCGTTGA CTTCTTTGCTAAATGATGACCTGGTGCGGCTATTGTTTTAATAGGGAAAT AACATGACTAGCATTGAACCTGATGGTGGTTCTATCAATGATGTTTGCTT CTTCCCGAATAGTGGTTTAATGTTATTAGCTCTGGACAACAGCCAGATAC CTGCCCACTTTATTCCTGCACTTGGCCCTGCTCCAAAGTGGTGCTCACAT CTTGATAACTTGACTGTGAGTGAATTTCCTCACATTGGTTTTGTAGATAG TTTAGTAAAACTTCACCTTAACAATTCCTCCTATCGATTCCTTGAACAGG AGGAGATGGAAGAGAAACAAGAAAACACATTATATGATGATTACAAGTTT TTGACTGAAGAAGAGATGGAGCGATTGGGTCTCTCTGAGTACAAAAACAG CGATGCTGTCAGAGCACATTTACATGGATATGTGATACGATACGATCTAT ATAAGAAGGTAATTTGTTCTCTGTTCATCCATTTCTGGTGCTGTAATTTA TATGAGCAGTCCAGTCAGTGTTGAGGTCGATTACCCGCCTGAAGACATTT TTATTTTGTACACATACTAGTTTATTCTTTTTAAAGTCGTTTCTACGTAT TAGGTATCTGATGATATAGTTAAACTTAAACATGAATTTGGAGTTCCTAT ATCTATTTGTGTGTTGATGGATGGTTTGAACAAATGAACACTTCATGCGT GCTCTTTACTAGGATTTGTATTTTTTTTCAGCAACGGGCTAAACTTGATA TTGTTGATTATGAGACTCTTCAAAAAGAGATGAAGAAAAAGAAACTAGAC GCACAAAGGAAATCTCGTATTACGGTATATTTGCTCATCTGTTCCTAATG TCTATTACATCTGTCAGTCTATGTGATTCTTCCCCTAATGAGTGTCATTA TTTTTCTCTCATGCAGCAAGTTGTCAAAATACCAAAGGTTAACCGGCATA TTTTCGACGATATACGTGCAGAGGAAGAGGAATTGGATGCTGTGGATAAT GTTGATAAATCAAGCACTAGGAAGAAGATGAGAAGAATAGAATCGAAAAA GGCAATCATGACTGATCCGCGTTTCCAAAAAATGTTTGAAGATCCGGTAT GCATTCCAATTCCCAACTTGATTTTCGAATTAAATTTCTCTAAACACTTG CTCTTTTTGAAAACCATGACAGAATCTCATGTTTAGATTTTTTTGCTAAT CGGTCCTAAATCGGTAATCCTGTGTGATTTTCTAATCCCATAGTTCTTAT TGGCAGGACTATGAAATCGATGTAAACTCAAGAGAATACATTGCACTCCA TCCTCAAGTGGCTACAAAGGAGCCTGATCCAATTGAGGAACATTTTGAGA GTGTCAGTGAGGATGAAGACGAACAAGACGCTGGTTCTTCTGATGCGTCA GCAGAGTCTGACAGTGACGATGGCATGCATAATTCAAAGCGTCCAAGGTG AGATTTTATGTTATTTCGGTTGGGGTGAACTGCATACTTGCCACCAATAT TTTCTGTTTTGCTTGTGCAGATATGTGTGTTATACTCTCATTCGCTGAAT ATGATGTTCTGCTGTTGCATCGGAAATCTGCTAATTACTTTCTACCTTTC AGGCTGTATGAAATCAAGGATGACCGCCATGCTGAAGCATTCTTGAACAG TGTCTCCCTTGGCGGTGAGGATGCTTTGCCCCTTGCGGACAGGGTAGCTG CACTGGACAGGCAACAAAACTCCCGTGCACTTGACAAGGTGAAGTACGGA CCCGGTGGCTCACGGGAGATCTCATTTATGGCTAGAAACTCAAGAAGGCG CGACGAAGGAGATGAACACAGCGAAGAGGAGGCTACAGGCAACAAGAGGA GAAGCGTGCAGTCCCTGGGGTTGAAGCAGGGCAAAGCGGAGTTCTATTTG TTTGGTGGAAGCCGTGGCAGAGGCGGCGGCGGGGGTGGTCGTGGCAGAGG CGGAGGAGGTGATCGTGGTAGAAGAGGTGGAGGTGGTCGTGGAAGAGGAG GCGGGGGGAGAGGTGGCGGCAGAGGAGAATTTGGAGGTGGTGGAGGCGGA AGCGAATTCGGGGGCAGAGGCGGAGGGGGAGGCAGAGGCAGGGGTATGAG CAGGGGCAGGGGAAGGAGCAGAGGAAGGGGAAGGGGAAGGGACTGAGCAG TGAGCTCCCTCTGGTTTCAAGGTCGAAGAGACTGCCCTGCTGCCCATTTG CTGCTCTCCCATGGCTGTGGGAGCTTTTAAGATGGTGAATATTTCGCTGG GATTTCACTCAGTTACAGGTGGCTGTAAAATTTCAACCAGGGCTGTGAGA TGTAGTGCGATCTTTAAGTCAAATTCAACAGCTTCCTCGTACACGCGTTG TAGTTTATTGCGCTTGACGCAATAGCTAGGGTAACCAAGACAATTGCTTC AAATTTTGGCCGTGTGAGAAATTATAGCAATGAAAAGTGCTGCAATGAGC TTATGTTGTAATATCCAAAAGAGAAGATAACATTGCTTAGTTTTCTACAT TCTTATTTTGTTTGTGTTCTGAGTTCTAGGGTATACCAAATTCTAGCTGA GTCTCAGAAAACTAATTTCAGCATGACCTGAAAGCGCTGTGGCATCTGGC ATGCTTGTGTGTTAATGTTTGTTGGAACGCCAGGAAAAAACATTCAGCCA TCGATTAAATAGGCTGACTTTAACGTTGTACC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.