Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA005941

[Submit comment/correction]

Sequence	AA005941
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA005941
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGTGGAGGCTGAAGATCGCGGAGGGCGGCGGCAACCCGCTGCTGCGCAC CACCAACGGCCACGTTGGGCGGCAGGTGTGGGAGTTCGATCCTGCCGCCT CCGACGATGACCCCGACGAGATCGCGGCCGTAGACGCCGCGCGCCGCGAG TTCACCGGCCGCCGCCATCAGATAAAGAACAGCTCCGACCTCCTCATGCG CATGCAGGTCTCCATCATCCCATCTCCTTTATTTGCACTGCTATCTTGGT TGGTTTCCCGCTCTTTCTTCAACTATACAAGGCACAACAAACACGGTTAT TACACATATATATACACGGTTAACATGTTTTTTGGAGTCACATCTACCGA GCAACTTATAGCAGGTATAATAATGGCCTTATGCTCTTATAGCGTTTTTT GCCTATACATAGATATCGGGTCAATTTTCTCTGAATTTTAGTTATGTATA TATATATACCGCTTTTTTGCCGCAATGACATTTTCCTCAGATTTTCAGGT AGCTTACAACTATATATAATTTATGTAGCAACTTCTAGTTCTCGGCTGTG AGAAAACAATAACATAACACCAGGAAAACAGTAAAACTATAGTTATGAAG CACATAATATAGAATACGTAATGAAGGAACGGCGCAACTATTAAAAGTTA TGAGGTAATAAAAGAACATTGAAAATAAGTTCTCTATGAAATCCATAAAC TAAAAACGGAGTTTTCTTGATTTTCCCTCTAATTGGACATAACCAGCATA ATACTGGGAAAAACTAGGGACTTTCCTACCAAAGCGGTACCAAGTTTTCC ATCATTTCTGAGCTTCATGGGCATTTCCACACGTTCCCTTTACCCCTTTT GAGAAAACATCACTTCCGGTCCTTTAACTCTTGAGGAAGTTCATATTTCA TCCTAAAAGTCCAGTGTAGTCTAAAATGTACCTAGAATTCTTGAAAATGT TCACACTACATATGATCAAAGAAAATATGCGCCGCCCAATGTCGCCACTT GAAGTTGATGGGCTAGTCGGGTATTCCAACTTGAAGAAAGGAGCATGGTA GCATGAATCGACCACTGAGTAAACATCAGTCTGCGAGAGCAAAGGAGATG CGAAGAAGTTCGGGCTTGGTCAAGTTGGGGCTATGGATGGGTCTGATAAA CTTGAGGATCAACGTGGAAGAGCTAGGTGACATGATGGACTAGCCGGACA GTGGCGGTGTGGGATTGCTTGTGGAGAGATTTTGGGATTTAGTATTCGTG TATGAATTTTAACTCGTTGGAACGGGCCAATCCAAATCTGGATCCTATTC GGTCAAATCTAACCTACTATTCTGGTGCCACAGGTTGTCCAGGTGAGCAT TTTCTCGGGTTAGATGTGATATGAACATCTCTAAGAGTTTGAGTTTTGAA TTTGACTAGACAAGTTTTAGGACAGAAACAACTTCATCGCGAGCTCAGGA ATGAATATTTCCCCTTTTTATTTCTGAAAATTCCTTATACGCCAGCCGTT CATTTCTCTCTTCAATTCCAAATTTCGTCCTGGGCCTGCCCGTGGGGCCG GCCATACGGCGCCTTCATTTTCATTTCACTTAATTCCAAAATTCTAAACC TTGTAATGTCAAAAAAATATCTAAACCTTATGGGCCAGCCCAATTGATGG ATTTGCCTCACACCTATCATTCTTTCGCTCGATCTTGGACGGGCCGGAGC CTGCCCGGATCCCGACCAAGCTAGGCCCGCGCGTCTAGCCCGACCACTCG TGCCGACGGCGGCGCGGTGGTGTCCTACAGCGAGATGGCGGCGGCATAAC GCGGGGTGGCGCATCGCGTGTGCGCATGGACGGGTGCGCGACGTGCGGGT CGCGCGGCAGAGCGTTCTGGTCGTGGTACTGCGGCGCCTGCGGGCGCGGT AGCGTGACGGAGCGGCGGCGAACAGGCGGCGGTGCGCAGTACGTGTGGGC ACGAAAGCGATGGCGCGCGGCGGCGTGCAGACGGCCGTCGTGGTGCGTGC GGGCCCGTACGTATCCGCAGTTCCCTGCAATCCTTACATACATAGTTGGT CCAGTGATAAGAGTAATGGTAGATTGGTAGCAGTGAAGTAGTATATGTAA ATCATTCTCAGACGGTCAAGGCGGAAGTTCTGTATGATTTGTTTTTCCAT TTTTCTCATAGAAGAAACTTCACCCTTAGCATTTTGCTCTCTATAGCGAA AATCAGTACCTTGGATGTTAACTGCGACCGGCATGATCATGTTTTTCATT TTGTTTAGTTTATCTCCCTGAAAATTTGGTGTCTCCACAGCAATTTTCAC GAGCCATTTTCTGACATCTTTCATCTTTTGTCCTACAGTTCTCCAAGACA AACGCTCTCAAGATTAACCTTCCTCACTTCAAGCTGGCAGAGCATGAATA TGCAACGGAAGAGGATGTCCTGATATCTTTGAAGAGGGCAATTAGCCGCT ATTCCACTCTCCAGGCACATGATGGGCACTGGCCGGGGGATTATGCAGGC ACTTTATTTCTCTTGCCCAGCTTGGTACTTTTCTTTTGCATTTAATAAGA ACAATCTTTCAAACTCATCCTGCCATTAAGCATGAAATTCAAAATTAAGT AACATGTTTCCATCTGCATAATCTGTTTTCTCCTATTTTGATTCTCATCG ACCATTTTTTTTTAGATTGTAGCATTGCATGTGACTGGTGCACTGACTAC AGTCTTGACATCTGAACATCAGAAAGAGATCCGGCGATATCTCTACAATC ATCAGGCATGTGTATATATGCCTAAATGTAACCTGATGAAAGCAAACATG GATGCCCTGTTTTATCTGATATTGTTAGTTGACTGTAGAATGAAGATGGA GGCTGGGGACTGCACATTGAGGGAACAAGCACAATGTTCTGTTCTGTCAT GAACTATGTTGCTTTGAGATTGCTTGGGGAAGGGCTGGATTCAGGTGGAG CCATGCTGCAAGCTCGTAGTTGGATCTTGGACCATGGAGGAGCAACTTTA ACACCATCTTGGGGCAAATTCTTTCTATCGGTAGGGAACATAATTGAAAT GTTCAAGTAAATCATTTTATTTTGCACTTATTCTCCAAAGGGAAAAATAT ATATGGGTAGCCAATATTAATAGATTTTTTTTGACCTTTTGTACACATGT ATTTACACATGTGCTAGATTTTCAACCTAGATACATCCCTTGTGTGATAT TTCTCTAACTTTTTTCTTTAGGTCCTCGGGGTATATGACTGGTCTGGAAA CAACCCATTGCCACCAGAAATATGGATGCTTCCCTATTTCTTGCCTATTC ATCCAGGTATGCGCTTCCTACTTTAGTTCTTCATTTTTGTAGCTGATTAC ATTATTTTACTCCTCTCATATGTCATCACACAGTTTTACACTCCAGCCCG CACTTCTTACAAATGTTCTTACATCGTATTTTTTATGTAAAATTAGGTAT CTAGATTGGCTCTACCAGAACTATGTCTCTATTTTATCTATAAAATAACT TCATAATTTCACAGTCCATTGACAAGACAAATACTATTTAAATTCGTGCC AAATTTGTGTATCATAGAATCACCATGTTCTCATCACACAATCATGCAAT AAACCATATTTACATCGTCTTTATAGGTATACTCAGTGCTAAAACAGGCT ATCCTTGCGAACTCTTATAATACAGATTTTAAGCATTCAGAACAATCTCA GATAATTCGTACTTTTATATGAAAAGGAGGCAGGGGAGCTGCCCTGATCT ATTCATCGAGTGATGCACACAGCCCTTTTTATTGCGTGGATTATACACAT TACGTAATTTCTGAAATCTCAAAGCAACAGGAATCAAATGGTACAACTAG TGCATCACAGATCCTATTGCTAAGAAGTCACGCATATGCATATGGGTTGA ACAACTCCCGTCCTACCATCTCCAAGTGGCTGCACCCAAAGACTAGAGTA TCACGCGGCCCCACAATTTGCAGTCAGCACCACATAATAAATAAATTATT TAGGATCATAGTATATCTCATTTGTAAGAGAAACAGCAACATATACATGA TTGACTTTATCGCATAGTTATGTACTCAAGTAGTTCTCTATCATCAAAAA GAATCGTGCTATACACACGACACTTCCCAGACGATATTTGTACGACACCT AAGATCTAATCCTTCGTGGGTGGCAGCCCAATGTAGGAGACAACCGGATC CTTCGTCGTACTGGGATCGTTAGGGAAACATCGTGTGCTTAGTAGTTCCG CATCAAAAATCATCTTAGGACCGGTCTAAAAGACTATAGTTTGTTGAAAC TCAAATGCTTTTATTTAGTGCAGACATCTTACATGGATCTCATGGAATTT TATTTCAACAATTGCCAATGTTATAAGTTATTTACAATTAGGCCATTATA AACTAGAAAAATAAATGCATAGAGTACCAAGCACATACTAGGCTCATTCT TGTTATTTGATCTCTTTTGTTAATCATTTTGTTCTGTGTAAACAGGACGT ATGTGGTGTAATTGCCGACTAGTATATTTGCCAATGTCGTACTTATATGG GAAGAGGTTTGTGGGTTCTATGACATCAATTGTCCTAGACTTGAGGAAAG AGCTGTACAATGTCCCATACGATGAGATTGACTGGGACAAGGCTCGCAAT GGATGTGCCAAGGTGTCGCTTATATTCACTTTGCCTTTTATATCAACTAT TTCCTCTGTTTTTATCTGAGGTAATTTTGGGCCGACTCTAGGTACTAGTG TGAGTGGTTTGTCCAGTCAAGTTAATGTTTGATGTAGAGCACCCAAACTA GTCTTACAAGGCCACCTGTGGTCGAATCCAAAAGGGGTGCAGCAGCTCCA TGAGGAAGGGTCAAGAGACGGTATTGATAGCATGCACAATGTCGAGCTTA AGTGATACTGCCAGAGTTGGCTGCATGAAGGGACTTGGCGAGCTGTTTTT TTTTTACTATGACTTGGCAAGCTGTTGCACAAGCATGAAATTGTCATGAA TAGTGTGACACAACACACAAGGTTTTTAGTCTTCACGGTTTTATCTAGAA ATACGAAAAACACGAGAACCTTAATAACATAGTTAAACCGAAGTCTTTTT TCTTTGACCCTGCCCTTGTTCTTTGTATGTGCCTAATTGTTGTTGAATTC CAGCTTTTTCTACTAAATCATAAACCAAGTAACTGTTTCTTTTAACAAAG TGGACAAGTTGTGCCGACAATAAAAAAATTATTTTCATTTTTTATTAAAA GAAATTCTATCCTAATTAAGGATCCAGTCTTAACCATAGTTGTCCTTGTG TACAACTGTTGGTGAGACTTCAGCGAGAGGTTCTGACACAAGCTTCGCTT CATTATCAACCTTCTCCACCGATGTCTTCCATCACATCAATGACAAGATA TAATTTGGTTTTATTGGGGTTTAATGGAATATTATAACCATTTACAAATC CGGTTAAGTACAAATAGTATGAAACTGGAGACTTCCTATAACCATGACCT TATAATATAGGATTTTCCAGGAATCTTGTCATCTAAAATTTAAAACTTTG GTTACACTGTAGGAAGATCTCTATTATCCCCATTCACCACTGCAGAATAT CGTGTGGGCTACTCTCAAGAAAATTGGTGAACCAGTTCTCATGCACTGGC CTGGCAGCAAATTGCGGGAGAAAGCTCTGGACATTGTGATGAAACATATT GAGTACGAGGATGAAACAACACAATATATATGCATTGCTCCTATGAATAA GGTAGCGAATGGATTACTTTCATGAAACTTTGCATTATTGCTTTCCTTTG GTAGGTCATAAGCTTGTTCCCGTAAGCTATTTTAGCTTTACTTTATTAAA TTTGTTCACTGCTTATCAGGTACATTTATTTACTTTTTACCTTTTCCCAA CTAAAACTGCTTACTTGAAATATATAAGCAGATGTTGAATATGATTTGCC GTTGGGTAGAAGATCCGAACTCAGTGGCATTCAAACTCCATATTGAAAGA GTATATGATTTCTTATGGGTCGCTGAAGACGGCATGAAGATGAAGGTGTT AACAAGTTCTTCTGCATTTAGTTATGATTTTTCATGGGAGCATGTATTAT CTTTTCACTGAGGTGGAGGTAACAATAACAAAAATCATTAATTGTAAATC AAGTCTCTGTCTCTTTGTTTTTATTATCTAGTTCAATGTATGATAAAAAA TTTGTAAATCAAGGATACCGCGTCATTACCCAGCTAGTGAACCTATGAAG TGAGCCTATGAAGAATCCCACCAAGTTCAACTCCTATGAAGTGAGCCTGA CTTACTTTGTTGAGGGATTGGATGTAGAATCCCACCAAGTTCATCTCCTC TGAGGCTTAATATTGTCCTCTTTTTCCTCTATGAAAAATGTACTCCCTCC GTCTAAAAAGGATGTCTCGAATTTGTCTAACTTTGCATGCATCTATACAC TAAAATGTGTCTAGATACATGCAAATTTAGACAAATCTGCGACATCCTTT TCAGGACGGAGGAAGTATATAGTTTCTCTTCCATGTTAAAAAAATGTATT ATATGCACTATGCTTTTTTATATAGGACGTATTTTGACTTTGCGCAAAAA TTAAGGAGACGATCAAATTAGAAAGTTACTTTTATAAAAAAAATTGGCAT TTGGAAGGTATGATAACTTGCATGGCCCCGGATGAGTAATTGTGTATGTT GGCAAAACATTAAGTAGGCATGATGAAAACATCACAAATTGAAATGCACT CATTTAATGCACTTATGGAAATGGTTATTGTAACAGTGTGATTTACAATA ATCTGAGGATAATGTGTACTTGTTAATACTCGTGATCTTACATCCTTTGT AGTCTTATAATGGCAGCCAGCTGTGGGATACAGCTTTGACTGTTCAAGCT ATATTTGCTGCCGGACTCACAGAAGAGTTTGGCCAGACAGTTAAACTTGC GCATGACTATATCAAGCGTTCCCAGGTAAATACAGAAAATGTACTCCCTC CTTTTCAAAATATCCTTTTTCTAAAACGGATTATCTAGACGCTTTTTAGT GTGTAGGTTCAGAACAAAATAAGTGAACCTACACACTAAAATGGGTCTAG ATACATGTGTTACAGAAAAAGGCTAAAACGTCTTATATATCGGAACAGAG GGAGTACATGATAATCTGTTTGTGAAACACTAATCAATCTGGTATAATTA CTCAATAGTATTCTGACTATCTGATATTCTTGAAGATTCGTATGGACTGT CCTGGAGATCAAAGTAAATGGTATCGTCATATATCTAAAGGTGGATGGAC ACATTCAACAGCTGACGAAGGGTGGCCTGTATCAGACTGTACTGCGGAAG CACTGAAGGTAGTCCCCGTGCATGATGTTTGTATTCATCCAAAACTTTTG TGTAATACCATTTTGGTCTATCCGTCCATATCTCAACTTTGGTAGTCTAA AATTAGTACTCCCTCCGTTTTATAATATAAGATGTTTTGGCTTTGTGAAG ATAATGTATCTAGACATCTTCTAGTGTGTAGGTTCGAAGATGTCCACTCC GAATCACACTAAAAGTTGTCTAGATATATTATCTTTACAAACCTAAAACA TCTTATATATTGAAACAGAGGGAATAGAACACAAAGATCTCAAATAATAA AATTATCTTTCCTAGCATGCTTGCATGTAACCAAGCACACACTCCTTTCG TTCAATGCATAGTCCATGCATGTAGGCATAGCACCCCCCCCCCCCACACA CACACACACACCACCACACCCACCCACCCACACACGCACTTACTTTTTTC ATCGCCTGTGTGAAACGGTTGTGCGGAGTTGCTACTCTTGGGACACAACT TTTAGATAGGTTGGACTAATTCTATCTAAATTATCTATTTTTTAGGAGAT TCTAAATTCTTCTATTTTTTCTAGTGTAAGAGAATTTAAATTTTCTGTGT AACTGCACTCTCACGACATAAACTTTACAATAACAGGCCACATGGGTATT GGGGTAACTCAATCTCCCACGGATAATGTTTCCATGCAATCGATTCTAGC AATTAAGTCCTGCCTTAGAAACTTATTAGTACCTTGGGCACGGATTCTAT GATCTAAACTAAACCAACACCACACTGATATAAATTAACCTGGTCTTTCT GGCCAGTTTGCTGGGTAACCGAAGGCTGCCAAGAAATAGTGTAGTACAGT CAAGACATATAAACTATGACATGCTCTCTTCGTGGGATGGCACATTGTAC TTTTGTAATGCTGTGAGTTCCATGGTCATTACCACGAGCAAACTATTCAG TCATGTAATTGATTACATGTACGCTTCCATTTCTTTCTTCAGGTTTTATT GCTGTTAACTAAGTTTCCTCCTGAATTGGTTGGTGAATCTATAGAAGCAA GCAGGCTTGATGATACAGTCAACATTTTGCTGTCTTTGATGGTAAGCATC TTTCAGTTCAAACTGATTGTTTTCTGTTTCTCTTTTTCTTTTTTTTCTTT GCCAGAGCTAGTTTCAGTTCACTGTCATTTGATAATTAATAGTCTAATTT TCAACATACTGGGAGATGAACAACATCGATCATTGATTTAAAGTTTTACT CCATGCTCTTGTGCAGAACGACGATGGTAGTTTTGGTGCATATGAGCTAA CAAGATCTTATGAATGGCTTGAGGTGAGTTTTGATAGAAACCTAGGCATA TATTATTGCTTTGTTTAAAAATGCACAAGGAACTGTTTTATTTTAGTATG TGTGAGGAAGAAAAACTTTGTTCAATCAATCACATTGAGTCAATATATAA CATTCTTGATGCTACCAACTGTCGACTATTAAGTTTGCTAATGATGTCAT GCTCATTATTATTTTACTTCAGTTGCTCAATCCTTCTGAGAGCTTTGGGG GCATAATGATCGAGTATCCGTAAGATACAATAACCGTTAACTATTTATTT AGTTATTTACTCTGCTACTTTTCTGTTAATTCATCTACAATTGAAAATCT GAGAACTAGGTATCTTGATCTGCAGATATGTTGAGTGTACGTCATCAGTA ATTCAAGGTCTTGTGTTATTCAGAGAAACCTACCCTAAACATTATCGCAG GGAAGAGATAGACCATTGTATCCGAAAGGCTGCAGACTACATTGAGAGCA TCCAACGAAGTGATGGATCATGGTTAGTGCCCACCACGAAAATAAATACT ACTCACTTGTTTAATTACTATGTTCAATACATATGTTTTGTTAAATCGCC ATTGAATATTTGGTTCTTTCATCTTGCACTAAGTCATCCCTTTACTAACT AACAATGTGCAACATTAACGTTTTCCCATGGTCAGATGGATCAAAAGTAG CATGGTTTGCATTCTATTTAACTTGTTCTAGAAGTTCCTCGTCATTTCCC CCCTTAAATAATGGAAGAGTAAACTCCCGGTCTATGTATCATAAGATGTG CATAGCCTTAGTCCTCATTTGAATTTCTGTTGTTAATTTACAAATATAGG TATGGCTGTTGGGCAATTTGTTTCACCTATGGTACGTGGTTCGGGGTGAG AGGATTGGTTGCTGCCGGTAGGACGTACAAAAACAGCCAAGCAATCAGAA AAGCGTGTGAATTTCTGCTATCTAAGGAGCTTCTTCCGTCAGGAGGATGG GGAGAAAGCTACCTCTCTAGTCAAGACAAGGTAATATATCTTCGTCTTCT TGTTTCCGTATCTTAGTCCAATTAACTTTGTTATGTGCTTAATTAAACTT GCAATTGACAATGCAACATAGGTTTACACCAATCTTGAAGGCAGCAAGGC TCATGCAGTTAACACCAGTTGGGCCATGTTGGCCCTGATTGATGCTGGGC AGGTCATTTCCTTTCAAGCTCCTAGTTATATCCAGTGGATGTCCTATATT CATTAGTCACGTCACTTGCGGACTGTAAAGTGTCATATAATATACTTGCA CAACTGCATAGGAAACTACAGTAATTCGTAGAACAAACATATCATCATGT ATTGACTTGGCTCTATGCTGACAATAAAATACACATGTTTTCCGAGTGAG CAGGGTAAAAGAGACCCTGCATGTCTACATAGAGCAGCCAAGGTTCTGAT CAATTTCCAATCCGTGGATGGAGAGTTCCCTCAGCAAGTAAGTCATATAT ATAGGTTATCTCTCCCCATTTTACTTTATTTGCAAGGAACTCATGTACCT GTAAGTGAAAATAGTCGTACGATGATGCATCTACAGAGAAATAGTGGTGA ACTTATATAAACTCCAATGAAAAGAGGCAACCTGCGCTCAGTATTTCAGT ATAACAAGATCCAAGATAATTAGGAGTAACTTTGGTACGTTTACTCACTT GACACTTGACAGGACATTATCGGAGCTACCAACCACAACCTCATGCTCAC TTACGCCCAGTTCAGGAACATCTTCCCTATCTGGGCTCTTGGGGAGTATT ATCGCAGAGTGTTGGTAGCACAAAGGCTCTAACCATTGCATACAATGGTT GAGAAGGCATCTCTTTCTTGTGATCTACATATCATCCTGGGATGACTATC AATGTAATGTAGAGCATGCTGTTCTTTCTTGTATCTAGTGTTGATGGGCA TAAGCATTCCTTTAGCTACCCTACATCATCAAAAGGTCTATTTGGCATGA CCAAAGATAACGTTGACGCCACATCGCTATACATGCAAGAACTAACTTAG TAGATACTCCCTCCATTCCACAATGTAAGCCTTTTTAGAAGGCTAACCGA GTGAGAAATATAATCCTTCTCATGTTATGGGGTTTAGGTTATAGGCTAAT CAAGATTGCTACGAGGATTTTTTTAACAGTGAACATGCCACGCTTGTTTG TAATCAAATGGTGTGTTCTACACTCATCGCTTCAAATATTGGCCACACCT GTTGCAAGTCATGCACGATTACTCTAGTGCAATAGGGGCG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.